BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg330519
Length=1044
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
ATCG01000.1 | Symbols: YCF1.1 | Ycf1 protein | chrC:109405-1104... 1866 0.0
ATCG01130.1 | Symbols: YCF1.2 | Ycf1 protein | chrC:123884-1292... 1862 0.0
ATMG00370.1 | Symbols: ORF199 | Ycf1 protein | chrM:104954-1055... 926 0.0
AT2G07739.1 | Symbols: | Ycf1 protein | chr2:3495511-3496110 R... 920 0.0
AT5G24065.1 | Symbols: | Pseudogene of AT5G24065 | chr5:813346... 773 0.0
AT3G32895.1 | Symbols: | transposable element gene | chr3:1343... 104 2e-21
AT3G07230.1 | Symbols: | wound-responsive protein-related | ch... 73.1 5e-12
> ATCG01000.1 | Symbols: YCF1.1 | Ycf1 protein | chrC:109405-110436
FORWARD LENGTH=1032
Length=1032
Score = 1866 bits (1010), Expect = 0.0
Identities = 1023/1029 (99%), Gaps = 1/1029 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGTTTTTCAATCTTTTATACTAGGTAATCTAGTATCCTTATGCATGAAGATAATCAAT 60
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Sbjct 4 ATGGTTTTTCAATCTTTTATACTAGGTAATCTAGTATCCTTATGCATGAAGATAATAAAT 63
Query 61 TCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGGCCCTCT 120
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Sbjct 64 TCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTTTCCATAGGGCCCTCT 123
Query 121 TATCTCTTCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATGGACGAAGGAGAAGAAGGAACCGAGAAGAAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 124 TATCTCTTCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATGGACGAAGGAGAAGAAGGAACCGAGAAGAAA 183
Query 181 GTATCAGCAACAACAGGTTTTATTGCGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTAT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 GTATCAGCAACAACAGGTTTTATTGCGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTAT 243
Query 241 GCGCCTCTGCATTTAGCATTGGGTAGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCGTAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 244 GCGCCTCTGCATTTAGCATTGGGTAGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCGTAT 303
Query 301 CTTTTGTTTCATTTCTTCTGGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTACTACC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 304 CTTTTGTTTCATTTCTTCTGGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTACTACC 363
Query 361 AGAAATGAAATGCGTAATCTTCGCATTCAATGTGTATTCCTGAATAATCTCATTTTTCAA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 AGAAATGAAATGCGTAATCTTCGCATTCAATGTGTATTCCTGAATAATCTCATTTTTCAA 423
Query 421 TTATTCAACCATTTCATTTTACCAAGTTCAATGTTAGCCAGATTAGTCAACATTTATATG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 424 TTATTCAACCATTTCATTTTACCAAGTTCAATGTTAGCCAGATTAGTCAACATTTATATG 483
Query 481 TTTCGATGCAACAACAAGATGTTATTTGTAACAAGTAGTTTTGTTGGTTGGTTAATTGGT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484 TTTCGATGCAACAACAAGATGTTATTTGTAACAAGTAGTTTTGTTGGTTGGTTAATTGGT 543
Query 541 CACATTTTATTCATGAAATGGGTTGGATTGGTATTAGTCTGGATACAGCAAAATAATTCT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 544 CACATTTTATTCATGAAATGGGTTGGATTGGTATTAGTCTGGATACAGCAAAATAATTCT 603
Query 601 ATTAGGTCTAATGTACTTATTAGATCTAATAAGTATAAGTTCCTTGTGTCAGAATTGAGA 660
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 604 ATTAGGTCTAATGTAGTTATTAGATCTAATAAGTATAAGTTCCTTGTGTCAGAATTGAGA 663
Query 661 AATTCTATGGCTCGAATCTTTAGTATTCTCTTATTTATTACCTGTGTCTACTATTTAGGC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 AATTCTATGGCTCGAATCTTTAGTATTCTCTTATTTATTACCTGTGTCTACTATTTAGGC 723
Query 721 AGAATACCATCACCCATTTTTACTAAGAAACTAAAAGGAACCTCAGAAACGGGTGGGACT 780
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 724 AGAATACCATCACCCATTTTTACTAAGAAACTTAAAGGAACCTCAGAAACGGGTGGGACT 783
Query 781 AAACAGGACCAAGAGGTATCCACCGAAGAAGCTCCTTTTCCTTCTCTTTTTTCGGAAGAA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 AAACAGGACCAAGAGGTATCCACCGAAGAAGCTCCTTTTCCTTCTCTTTTTTCGGAAGAA 843
Query 841 GGGGAAGATCTGGACAAAATCGATGAAATGGAAGAAATCCGAGTGAATGGAAAAGACAAA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 844 GGGGAAGATCTGGACAAAATCGATGAAATGGAAGAAATCCGAGTGAATGGAAAAGACAAA 903
Query 901 ATTAATAAGGATGATGAATTCCACGTTCGAACATACTATAACTATAAAACTGTTTCTgaa 960
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Sbjct 904 ATTAATAAGGATGATGAATTCCACGTTCGAACATACTATAACTATAAAACTGTTTCTGAA 963
Query 961 aatctagatggaaataaagaaaattcgaatttagaatttttcaaaataaaaaaaaa-GAG 1019
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 964 AATCTATATGGAAATAAAGAAAATTCGAATTTAGAATTTTTCAAAATAAAAAAAAAAGAG 1023
Query 1020 GATCATTaa 1028
|||||||||
Sbjct 1024 GATCATTAA 1032
> ATCG01130.1 | Symbols: YCF1.2 | Ycf1 protein | chrC:123884-129244
REVERSE LENGTH=5361
Length=5361
Score = 1862 bits (1008), Expect = 0.0
Identities = 1021/1027 (99%), Gaps = 1/1027 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGTTTTTCAATCTTTTATACTAGGTAATCTAGTATCCTTATGCATGAAGATAATCAAT 60
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Sbjct 4 ATGGTTTTTCAATCTTTTATACTAGGTAATCTAGTATCCTTATGCATGAAGATAATAAAT 63
Query 61 TCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGGCCCTCT 120
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Sbjct 64 TCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTTTCCATAGGGCCCTCT 123
Query 121 TATCTCTTCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATGGACGAAGGAGAAGAAGGAACCGAGAAGAAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 124 TATCTCTTCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATGGACGAAGGAGAAGAAGGAACCGAGAAGAAA 183
Query 181 GTATCAGCAACAACAGGTTTTATTGCGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTAT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 GTATCAGCAACAACAGGTTTTATTGCGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTAT 243
Query 241 GCGCCTCTGCATTTAGCATTGGGTAGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCGTAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 244 GCGCCTCTGCATTTAGCATTGGGTAGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCGTAT 303
Query 301 CTTTTGTTTCATTTCTTCTGGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTACTACC 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 304 CTTTTGTTTCATTTCTTCTGGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTACTACC 363
Query 361 AGAAATGAAATGCGTAATCTTCGCATTCAATGTGTATTCCTGAATAATCTCATTTTTCAA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 AGAAATGAAATGCGTAATCTTCGCATTCAATGTGTATTCCTGAATAATCTCATTTTTCAA 423
Query 421 TTATTCAACCATTTCATTTTACCAAGTTCAATGTTAGCCAGATTAGTCAACATTTATATG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 424 TTATTCAACCATTTCATTTTACCAAGTTCAATGTTAGCCAGATTAGTCAACATTTATATG 483
Query 481 TTTCGATGCAACAACAAGATGTTATTTGTAACAAGTAGTTTTGTTGGTTGGTTAATTGGT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484 TTTCGATGCAACAACAAGATGTTATTTGTAACAAGTAGTTTTGTTGGTTGGTTAATTGGT 543
Query 541 CACATTTTATTCATGAAATGGGTTGGATTGGTATTAGTCTGGATACAGCAAAATAATTCT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 544 CACATTTTATTCATGAAATGGGTTGGATTGGTATTAGTCTGGATACAGCAAAATAATTCT 603
Query 601 ATTAGGTCTAATGTACTTATTAGATCTAATAAGTATAAGTTCCTTGTGTCAGAATTGAGA 660
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 604 ATTAGGTCTAATGTAGTTATTAGATCTAATAAGTATAAGTTCCTTGTGTCAGAATTGAGA 663
Query 661 AATTCTATGGCTCGAATCTTTAGTATTCTCTTATTTATTACCTGTGTCTACTATTTAGGC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 AATTCTATGGCTCGAATCTTTAGTATTCTCTTATTTATTACCTGTGTCTACTATTTAGGC 723
Query 721 AGAATACCATCACCCATTTTTACTAAGAAACTAAAAGGAACCTCAGAAACGGGTGGGACT 780
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 724 AGAATACCATCACCCATTTTTACTAAGAAACTTAAAGGAACCTCAGAAACGGGTGGGACT 783
Query 781 AAACAGGACCAAGAGGTATCCACCGAAGAAGCTCCTTTTCCTTCTCTTTTTTCGGAAGAA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 AAACAGGACCAAGAGGTATCCACCGAAGAAGCTCCTTTTCCTTCTCTTTTTTCGGAAGAA 843
Query 841 GGGGAAGATCTGGACAAAATCGATGAAATGGAAGAAATCCGAGTGAATGGAAAAGACAAA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 844 GGGGAAGATCTGGACAAAATCGATGAAATGGAAGAAATCCGAGTGAATGGAAAAGACAAA 903
Query 901 ATTAATAAGGATGATGAATTCCACGTTCGAACATACTATAACTATAAAACTGTTTCTgaa 960
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Sbjct 904 ATTAATAAGGATGATGAATTCCACGTTCGAACATACTATAACTATAAAACTGTTTCTGAA 963
Query 961 aatctagatggaaataaagaaaattcgaatttagaatttttcaaaataaaaaaaaa-GAG 1019
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 964 AATCTATATGGAAATAAAGAAAATTCGAATTTAGAATTTTTCAAAATAAAAAAAAAAGAG 1023
Query 1020 GATCATT 1026
|||||||
Sbjct 1024 GATCATT 1030
> ATMG00370.1 | Symbols: ORF199 | Ycf1 protein | chrM:104954-105553
REVERSE LENGTH=600
Length=600
Score = 926 bits (501), Expect = 0.0
Identities = 523/533 (98%), Gaps = 3/533 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGTTTTTCAATCTTTTATACTAGGTAATCTAGTATCCTTATGCATGAAGATAATCAAT 60
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Sbjct 1 ATGGTTTTTCAATCTTTTATACTAGGTAATCTAGTATACTTATGCATGAAGATAATCAAT 60
Query 61 TCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGGCCCTCT 120
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Sbjct 61 TCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGGCCCTCT 120
Query 121 TATCTCTTCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATGGACGAAGGAGAAGAAGGAACCGAGAAGAAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TATCTCTTCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATGGACGAAGGAGAAGAAGGAACCGAGAAGAAA 180
Query 181 GTATCAGCAACAACAGGTTTTATTGCGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTAT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GTATCAGCAACAACAGGTTTTATTGCGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTAT 240
Query 241 GCGCCTCTGCATTTAGCATTGGGTAGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCGTAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GCGCCTCTGCATTTAGCATTGGGTAGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCGTAT 300
Query 301 CTTTTGTTTCATTTCTTCT---GGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTACT 357
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CTTTTGTTTCATTTCTTCTTCTGGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTACT 360
Query 358 ACCAGAAATGAAATGCGTAATCTTCGCATTCAATGTGTATTCCTGAATAATCTCATTTTT 417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 361 ACCAGAAATGAAATGCGTAATCTTCGCATTCAATGTGTATTCCCGAATAATCTAATTTTT 420
Query 418 CAATTATTCAACCATTTCATTTTACCAAGTTCAATGTTAGCCAGATTAGTCAACATTTAT 477
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 421 AAATTATTCAACCATTTAATTTTACCAAGTTCAATGTTAGCCAGATTAGTAAACATTTAT 480
Query 478 ATGTTTCGATGCAACAACAAGATGTTATTTGTAACAAGTAGTTTTGTTGGTTG 530
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Sbjct 481 ATGTTTCGATGCAACAACAAGATGTTATTTGTAACAAGTAGTTTTGTTGTTTG 533
> AT2G07739.1 | Symbols: | Ycf1 protein | chr2:3495511-3496110
REVERSE LENGTH=600
Length=600
Score = 920 bits (498), Expect = 0.0
Identities = 522/533 (98%), Gaps = 3/533 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGTTTTTCAATCTTTTATACTAGGTAATCTAGTATCCTTATGCATGAAGATAATCAAT 60
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Sbjct 1 ATGGTTTTTCAATCTTTTATACTAGGTAATCTAGTATACTTATGCATGAAGATAATCAAT 60
Query 61 TCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGGCCCTCT 120
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Sbjct 61 TCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGGCCCTTT 120
Query 121 TATCTCTTCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATGGACGAAGGAGAAGAAGGAACCGAGAAGAAA 180
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Sbjct 121 TATCTCTTCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATGGACGAAGGAGAAGAAGGAACCGAGAAGAAA 180
Query 181 GTATCAGCAACAACAGGTTTTATTGCGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTAT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GTATCAGCAACAACAGGTTTTATTGCGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTAT 240
Query 241 GCGCCTCTGCATTTAGCATTGGGTAGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCGTAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GCGCCTCTGCATTTAGCATTGGGTAGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCGTAT 300
Query 301 CTTTTGTTTCATTTCTTCT---GGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTACT 357
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CTTTTGTTTCATTTCTTCTTCTGGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTACT 360
Query 358 ACCAGAAATGAAATGCGTAATCTTCGCATTCAATGTGTATTCCTGAATAATCTCATTTTT 417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 361 ACCAGAAATGAAATGCGTAATCTTCGCATTCAATGTGTATTCCCGAATAATCTAATTTTT 420
Query 418 CAATTATTCAACCATTTCATTTTACCAAGTTCAATGTTAGCCAGATTAGTCAACATTTAT 477
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 421 AAATTATTCAACCATTTAATTTTACCAAGTTCAATGTTAGCCAGATTAGTAAACATTTAT 480
Query 478 ATGTTTCGATGCAACAACAAGATGTTATTTGTAACAAGTAGTTTTGTTGGTTG 530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 481 ATGTTTCGATGCAACAACAAGATGTTATTTGTAACAAGTAGTTTTGTTGTTTG 533
> AT5G24065.1 | Symbols: | Pseudogene of AT5G24065 | chr5:8133460-8134077
FORWARD LENGTH=618
Length=618
Score = 773 bits (418), Expect = 0.0
Identities = 509/552 (92%), Gaps = 10/552 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGTTTTTCAATCTTTTATACTAGGTAATCTAGTATCCTTATGCATGAAGATAATCAAT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 43 ATGGTTTTTCAATCTTTTATACTAGGTAATCTAGTATCCTTATACATGAAGATAATAAAT 102
Query 61 TCGGTCGTTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCTGACCACATTCTCCATAGGGCCCTCT 120
|||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||
Sbjct 103 TCGGTCATTGTGGTCGGACTTTATTATGAATTTCTGACCATATTTTCTATAGGACCCTCT 162
Query 121 TATCTCTTCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATGGACGAAGGAGAAGAAGGAACCGAGAAGAAA 180
|||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| || || | |||| |||||||
Sbjct 163 TATCTCTTTCTTCTCCGA------GTT-TGGACGAAGGAAAACAAAG-ACCGGGAAGAAA 214
Query 181 GTATCAGCAACAACAGGTTTTATTGCGGGACAGCTCATGATGTTCATATCGATCTATTAT 240
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 215 GTATC-GCAACAACATGTTTTATTGCGGGACAGCTTATGATGTTCATATCAATCTATTAT 273
Query 241 GCGCCTCTGCATTTAGCATTGGGTAGACCTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCGTAT 300
|||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 274 GCGCTTCTGCTTTTAGTATTGGGTAAACCTCATACAATAACTCTTCTAGCTCTACCGTAT 333
Query 301 CTTTTGTTTCATTTCTTCTGGAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATGGATCTACTACC 360
||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 334 CTTTTATTTCATTTCTTTTGAAACAATCACAAACACTTTTTTGATTATAGATCTACTACC 393
Query 361 AGAAATGAAATGCGTAATCTTCGCATTCAATGTGTATTCCTGAATAATCTCATTTTTCAA 420
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 394 AGAAATGAAATGCGTAATCTTTGCATTCAATGTGTATTCCTGAATAATCTCATTTTTCAA 453
Query 421 TTATTCAACCATTTCATTTTACCAAGTTCAATGTTAGCCAGATTAGTCAACATTTATATG 480
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 454 TTATTCAACCATTTCATTTTACCAATTTCAATGTTAGCCAGATTAGTCAATATTTATATG 513
Query 481 TTTCGATGCAACAACAAGATGTTATTTGTAACAAGTAGTTTTGTTGGTTGGTTAATT-GG 539
|||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 514 TTTCGATGTAACAATAAAATGTTATTTGTAACAAGTAGTTTTGTTGGTTGGTTAATTTGG 573
Query 540 TCACATTTTATT 551
||||||||||||
Sbjct 574 TCACATTTTATT 585
> AT3G32895.1 | Symbols: | transposable element gene | chr3:13431016-13435542
FORWARD LENGTH=4527
Length=4527
Score = 104 bits (56), Expect = 2e-21
Identities = 56/56 (100%), Gaps = 0/56 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 279 AACTGTCCTAGCTCTACCGTATCTTTTGTTTCATTTCTTCTGGAACAATCACAAAC 334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3152 AACTGTCCTAGCTCTACCGTATCTTTTGTTTCATTTCTTCTGGAACAATCACAAAC 3207
> AT3G07230.1 | Symbols: | wound-responsive protein-related |
chr3:2299774-2300267 FORWARD LENGTH=371
Length=371
Score = 73.1 bits (39), Expect = 5e-12
Identities = 41/42 (98%), Gaps = 0/42 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 833 CGGAAGAAGGGGAAGATCTGGACAAAATCGATGAAATGGAAG 874
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 114 CGGAAGAAGGGGAAGATCTGGACAAAATCGATGAAACGGAAG 73
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 51188595793
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5