BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg331392 Length=2871 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G49900.1 | Symbols: | Beta-glucosidase, GBA2 type family pr... 4440 0.0 > AT5G49900.1 | Symbols: | Beta-glucosidase, GBA2 type family protein | chr5:20296518-20302346 REVERSE LENGTH=3301 Length=3301 Score = 4440 bits (2404), Expect = 0.0 Identities = 2726/2882 (95%), Gaps = 19/2882 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTTTGAGGAAAAGATCAT-AACTATTGGTGAAGATGTAAAATCTTTCAACTCTTCTGA 59 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| Sbjct 68 ATGTTTGAGGAAAAGATCATGGA-TATTGGTGAAGATGTAAAACCTTTAAACTCTTCTGA 126 Query 60 TCA-TAAAGTTGATCCAGCAGTACCTGCATCTTTGACATGGCAAAGAAAGATAGACAGTG 118 | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 127 T-ACTAAAGTTGATCCGGCAGTACCTGCATCTTTGACATGGCAAAGAAAGATAGATAGTG 185 Query 119 ACG-GAAAGCCTCCCCGGGAATTCAATCTGACTGCTAAAGAGATTTTTCAGCTGGCTCCT 177 ||| |||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| Sbjct 186 ACGTAAAAG-CTCCACGGGAATTCAATCTGAGTGTTAAAGAGATTTTCCAGCTGGCTCCT 244 Query 178 GTTGGCATTCGGTTATGGTTTCTTTGCAGAGAAGAAGCTGCTAAAGGAAGGTTGGCCTTC 237 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 245 GTTGGCATTCGGTTATGGTTTCTTTGCAGAGAAGAAGCTGCTAAAGGAAGGTTGGCCTTC 304 Query 238 ATAGATCCATTCTCTAGGCACTCTGTAACGTCTTCCCATGGTGTTCCACTTGGGGGTATT 297 |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 305 ATAGATCCATTCTCCAAGCACTCTGTAACGTCTTCCCATGGTGTTCCACTTGGAGGTATT 364 Query 298 GGTGCTGGTAGCATAGGAAGGAGTTTTCAAGGTGAATTCCAGCGATGGCAGCTATTCCCT 357 || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 365 GGAGCTGGAAGCATAGGAAGGAGTTTTAAAGGTGAATTCCAGAGATGGCAGCTATTCCCT 424 Query 358 CCAAAATGTGAATATGAACCTGT-TCTAGCAAATCAATTCTCAGCGTTTGTTTCACGCGC 416 |||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 425 CCAAAATGTGAAGATGAACCAGTGT-TAGCAAATCAATTCTCAGCATTTGTTTCACGTGC 483 Query 417 CAATGGTAAAAAGTACTCGACG-GTGTTATGTCCTAGGAATCCAAAGATGGGA-AAACAA 474 ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | | | |||||| Sbjct 484 TAATGGTAAAAAGTACTCGA-GTGTGTTATGTCCTAGGAACCCAAAGCTTG-ACAAACAA 541 Query 475 GATTCGGAATCAGGAATTGGTTCTTGGGACTGGAATCTGAAAGGAGACAAGTCTACATAT 534 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 542 GATTCGGAATCAGGTATTGGTTCTTGGGACTGGAATCTGAAAGGAGACAAGTCTACATAC 601 Query 535 CATGCTTTATATCCGAGGTCTTGGACAATGTATGAGGGTGAACCTGATCCAGAGCTTAGG 594 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 602 CATGCTTTATATCCGAGGTCTTGGACAATGTATGAGGGTGAACCTGATCCAGAGCTTAGG 661 Query 595 ATCATTTGTCGTCAAGTTTCACCCTTTATACCTCACAACTACAAAGAGAGCAGCTTTCCT 654 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 662 ATTGTTTGTCGTCAAGTTTCACCCTTTATACCTCACAACTACAAAGAAAGCAGCTTTCCA 721 Query 655 GTGTCTGTTTTCACTTTCACACTTCATAATCTCGGAAACACTACTGCGAATGTGACATTG 714 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| Sbjct 722 GTGTCTGTTTTCACTTTCACACTTCATAATCTCGGAAACACTACCGCGGATGTGACATTG 781 Query 715 CTCTTCACTTGGGCGAATTCTGTTGGAGGAGACTCAGAGTTCTCAGGTGGCCACTACAAC 774 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 782 CTCTTCACTTGGGCGAATTCTGTTGGAGGAGACTCTGAGTTCTCAGGTGGCCACTACAAC 841 Query 775 TCCAAAATAATGATGAATGATGGAGTCCAGGGTGTGCTCTTACATCATAAAACCGCAAAT 834 ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 842 TCCAAGATAACGATGAATGATGGAGTTCAGGGTGTGCTCTTACATCATAAAACAGCAAAC 901 Query 835 GGGTTACCATCATTGTCATATGCGATTTCAGCTCAGGCGACCGATGGTGTTAGTGTCTCA 894 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 902 GGATTACCATCATTGTCATATGCAATTTCAGCTCAGGCCACCGATGGTGTTAGTGTCTCA 961 Query 895 GCCTGCCCATTTTTCATAATATCTGGAAAGCAGAACGGAATCACAGCAAAAGATATGTGG 954 || ||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| Sbjct 962 GCTTGCCCATTTTTCATAGTGTCTGGAAAGCAGGATGGAATCACAGCAAAAGATATGTGG 1021 Query 955 CAAGCTGTCAAAGAGAATGGTTCTTTTGATCACTTCAAAG-CTTCTGAGGCGTCAATGCA 1013 || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1022 CAGGCTGTCAAAGAGAATGGTTCTTTCGATCACTT-AAAGGCTTCTGAGGCGTCAATGCA 1080 Query 1014 GTCAGAGAACGGGTCATCGATTGGGGCAGCAGTAGCAGCTTCTTTAACAGTCCTACCAGG 1073 |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || Sbjct 1081 GTCAGATCACGGTTCATCCATTGGGGCAGCAGTAGCAGCCTCTGTAACAGTCCTACCGGG 1140 Query 1074 AGAGTCACGCATTGTCACATTTTCTCTGGCTTGGGACTGTCCTGAAGTGCAGTTTCCTAG 1133 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1141 AGAGTCACGCATTGTCACATTTTCTCTGGCTTGGGACTGCCCTGAAGTGCAGTTTCCTAG 1200 Query 1134 TGGTAAAATATATTCTAGGCGTTACACAAAGTTTTATGGCAATCATGGTGATGCTGCAGC 1193 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1201 TGGTAAAATATATTCTAGGCGTTACACAAAGTTTTATGGCAATAATGGTGATGCTGCAGC 1260 Query 1194 ACAAATTGCATATGATGCTATTCTTGGACATAGTCAGTGGGAGTCCTGGATAGAAGATTG 1253 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 ACAAATTGCACATGATGCTATTCTTGGACATAGTCAATGGGAGTCCTGGATAGAAGATTG 1320 Query 1254 GCAAAGACCAATACTTGAAGACAAAAGACTTCCTGCATGGTACCCTGTCACTCTCTTCAA 1313 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 GCAAAGACCAATACTTGAAGACAAAAGACTGCCTGCATGGTACCCTGTCACTCTCTTCAA 1380 Query 1314 CGAGCTTTATTACCTTAATTCAGGAGGAACTCTTTGGACAGATGGATCATCACCAGTACA 1373 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1381 CGAGCTTTATTACCTTAATTCAGGAGGAACTCTTTGGACAGATGGATCATCCCCAGTACA 1440 Query 1374 TAGCTTGGCAGGAGTCAGAGAAAAGAAGTTCTCACTTGATAAATCCCAACTCGGTCTGAA 1433 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1441 TAGCTTGGCAGGAGTCAGAGAAAAGAAGTTCTCACTTGATAAATCCCAACTCGGTCTAAA 1500 Query 1434 TAATGATATCGAGGTACCACATCAGAATGATACAGCTATCTCTGTCCTTGGAAAGATGGC 1493 || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| Sbjct 1501 GAACGATATCGATGTACCGCATCAGAATGATACAGCTGTCTCTGTCCTTGAAAAGATGGC 1560 Query 1494 TTCTACACTTGAGCAACTTCATGCATCAACAGCATCAAACTCTGCATTTGGTACAAAGTT 1553 |||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 1561 TTCTACGCTTGAGGAACTTCATGCATCAACAACGTCAAACTCTGCATTTGGCACAAAATT 1620 Query 1554 ACTTGAAGAAGGAGAAGAGAACATTGGACACTTCCTTTACTTAGAAGGCATTGAATATCG 1613 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1621 ACTTGAAGAAGGAGAAGAGAACATTGGGCACTTCCTTTACTTAGAAGGGATTGAATATCG 1680 Query 1614 TATGTGGAACACTTATGATGTTCATTTCTATGCATCTTTTGCACTGGTGATGCTGTTTCC 1673 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1681 TATGTGGAACACTTACGATGTTCATTTCTATGCATCTTTTGCACTGGTGATGCTGTTTCC 1740 Query 1674 AAAACTGGAACTTAGTATCCAGAGAGACTTTGCTGCTGCGGTGATGCTACACGATCCCAC 1733 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct 1741 AAAACTGGAACTTAGTATCCAAAGAGACTTTGCTGCTGCAGTGATGCTACACGATCCTAC 1800 Query 1734 TAAAGTGAAGACGCTTAGCGAGGGACAATGGGTTCAAAGGAAGGTTCTTGGTGCAGTTCC 1793 ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1801 TAAAGTGAAAACTCTTAGTGAGGGACAATGGGTTCAGAGGAAGGTTCTTGGTGCAGTTCC 1860 Query 1794 TCATGACTTAGGCATCAATGACCCTTGGTTTGAAGTCAATGGATATACACTTCACAATAC 1853 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1861 TCATGACTTAGGCATTAATGACCCTTGGTTTGAAGTTAATGGATATACTCTTCACAATAC 1920 Query 1854 AGATCGTTGGAAAGATTTGAACCCCAAATTCGTCCTCCAAGTGTACCGGGATGTAGTTGC 1913 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1921 GGATCGTTGGAAAGATTTGAACCCCAAATTTGTCCTCCAGGTGTACCGGGATGTAGTTGC 1980 Query 1914 CACAGGCGACAAAAAGTTTGCATCAGCGGTCTGGCCCTCAGTGTATGTTGCAATGGCATA 1973 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1981 CACAGGCGATAAGAAGTTTGCATCAGCGGTCTGGCCCTCAGTGTATGTTGCAATGGCATA 2040 Query 1974 TATGGCTCAGTTTGACAAAGATGGCGATGGAATGATTGAGAACGAAGGATTTCCAGATCA 2033 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2041 TATGGCTCAGTTTGACAAAGATGGCGACGGAATGATTGAGAACGAAGGATTTCCAGATCA 2100 Query 2034 GACTTACGATACATGGTCCGCGTCTGGTGTAAGCGCATACTGTGGTGGACTTTGGGTGGC 2093 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2101 GACTTACGATACATGGTCGGCGTCTGGTGTAAGCGCTTACTGTGGTGGACTTTGGGTGGC 2160 Query 2094 TGCACTGCAAGCTGCATCCGCATTGGCACGCGTAGTTGGTGACAAGAACTCACAGGACTA 2153 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || Sbjct 2161 TGCACTGCAAGCTGCATCTGCATTGGCACGCGTAGTGGGTGACAAGAACTCTCAGGATTA 2220 Query 2154 TTTCTGGTCAAAGTTTCAGAAAGCAAAAGTTGTATATGAGAAGAAGTTGTGGAATGGATC 2213 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2221 TTTCTGGTCTAAGTTTCAGAAAGCAAAAGTTGTATATGAGAAGAAGTTATGGAATGGATC 2280 Query 2214 TTATTTTAACTATGACAACAGTGGAAGTCAGTATAGCTCGTCTATCCAAGCTGATCAACT 2273 ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2281 TTACTTTAACTATGATAATAGTGGAAGTCAGTATAGCTCAACTATCCAAGCTGATCAACT 2340 Query 2274 AGCTGGTCAATGGTACGCGAGAGCATCAGGCCTTTTGCCTATTGTAGATGAAGACAAGGC 2333 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct 2341 AGCTGGTCAATGGTACGCGAGAGCATCAGGGCTTTTGCCTATAGTAGATGAAGACAAAGC 2400 Query 2334 AAGAACTGCTTTGGAGAAAGTTTATAACTTTAATGTGATGAAGATTAAAGATGGGAAACG 2393 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2401 AAGAACTGCTTTGGAGAAAGTTTATAACTATAATGTGATGAAGATTAAAGATGGGAAACG 2460 Query 2394 TGGGGCTGTAAATGGGATGCATCCCAATGGAAAAGTTGATACAGCATCGATGCAATCACG 2453 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 2461 TGGAGCTGTAAATGGGATGCATCCCAATGGGAAAGTTGATACAGCGTCAATGCAATCACG 2520 Query 2454 AGAGATATGGTCCGGTGTTACATATGCGTTGTCTGCAACAATGATTCAAGAAGGTCTAGT 2513 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2521 AGAGATATGGTCCGGTGTTACATATGCACTGTCTGCAACAATGATCCAAGAAGGTCTAGT 2580 Query 2514 CGAAATGGCGTTTCAGACTGCAAGTGGTGTCTATGAAGCTGCCTGGTCTGAAGCCGGACT 2573 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2581 TGAAATGGCGTTTCAGACTGCAAGTGGTATCTATGAAGCTGCCTGGTCTGAAACCGGACT 2640 Query 2574 CGGGTACTCCTTTCAGACGCCTGAAGCTTGGAACACAAATGATGAGTATAGATCACTGAC 2633 |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| Sbjct 2641 CGGGTATTCCTTTCAGACGCCTGAATCTTGGAACACGGTTGATGAGTATAGATCATTGAC 2700 Query 2634 TTACATGCGTCCCCTTGCAATATGGGCTATGCAATGGGCACTGACAAAAACCAGTCAAAA 2693 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2701 TTACATGCGTCCCCTTGCAATATGGGCTATGCAATGGGCACTGACAAAAACCAGTCAAAA 2760 Query 2694 ACAGCAACAACTTGGTCTTGAACCAGA--A-CAAGAACCAGAACTAGAGACTAACTCTTT 2750 |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct 2761 ACAGGAACAACTTGGTCTTGAACCAGAGCAACAAGAACCAGAACTAGAGCCTAGTTCTTC 2820 Query 2751 AATGAAACATGATATCGGGTTTTCTCGGGTTTCTAGGCTTCTGAATCT-ACCTAATGAAG 2809 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 2821 AATGAAACATGATATTGGGTTTTCTCGGGTTTCTAGGCTTCTGAG-CTTACCTAATGAAG 2879 Query 2810 CATCAGCTAAAAGCACACTGCAGACTTTGTTCGACTATACTTGCAGGAGACTGATGTCAT 2869 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2880 CATCAGCCAAAAGCACACTCCAGACTTTGTTCGACTATACTTGCAGGAGAATGATGTCAT 2939 Query 2870 AG 2871 || Sbjct 2940 AG 2941 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 142674785892 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5