BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg331786
Length=3780
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G54440.1 | Symbols: CLUB, AtTRS130 | CLUB | chr5:22099936-22... 6427 0.0
> AT5G54440.1 | Symbols: CLUB, AtTRS130 | CLUB | chr5:22099936-22107833
FORWARD LENGTH=4038
Length=4038
Score = 6427 bits (3480), Expect = 0.0
Identities = 3681/3781 (97%), Gaps = 2/3781 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGAACTACTTGGCTCAGTTCCAGTCGATTAAAAATTCCTGCGATCGTCTCGTCACC 60
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 121 ATGGCGAACTACTTGGCTCAGTTCCAGACGATTAAGAATTCCTGCGATCGTCTCGTCGCC 180
Query 61 GCCGTGGAAGATGTGTGTGATTTGTGGCCTACAGTGAAAGGTTTATTTGAAGAACATCAG 120
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GCCGTGGAAGATGTGTGTGATCTGTGGCCTACAGTGAAAGGTTTATTTGAAGAACATCAG 240
Query 121 CCATTAAAAAGAGCATTCTTGACAAACAAGACTCGAAATCCGGTTTTTGTTGAGAACTTG 180
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CCATTAAAAAGAGCATTCTTGACTAACAAGACTCGAAATCCGGTTTTTGTTGAGAACTTG 300
Query 181 CCGGTTGAATTCATATTAACTACAGACGCGAGACTTCGTAGTCGATTCCCGCAGGAGCAA 240
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 CCGGTTGAATTCATATTAACTACAGACGCGAGGCTTCGTAGTCGATTCCCGCAGGAGCAG 360
Query 241 TATTTGTTCTGGTTTCGAGAACCATATGCAACTATTGTTCTTGTCACGTGTGAGGATCTT 300
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 361 TATTTGTTCTGGTTTCGAGAACCATACGCAACTATAGTTCTTGTCACATGTGAGGATCTT 420
Query 301 GATGAGTTTAAAAACATTCTCAAACCACGTCTGAAATTAATTGTTCAGAATGATGAGAGG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GATGAGTTTAAAAACATTCTCAAACCACGTCTGAAATTAATTGTTCAGAATGATGAGAGG 480
Query 361 GAATGGTTTATTGTATTTGTATCTAAAGCTCATCCAAGTAATGATCAAGCAACTAAATCT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 481 GAATGGTTTATTGTATTTGTATCTAAAGCTCATCCAAGTAATGATCAAGCAACTAAAAAT 540
Query 421 GTCAAGAAAGTATATGCGAAGCTTGAAGTTGAGTTCAGTTCAAAAAAGAGAGAAAGGTGC 480
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GTCAAGAAAGTATATGCGAAGCTTGAAGTTGACTTCAGTTCAAAAAAGAGAGAAAGGTGC 600
Query 481 TGTAAGCTGGATGTACATGGCCCTGACGGAAATTTTTGGGAGGATCTGGAATTAAAGATT 540
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 601 TGTAAGCTGGATGTACATGGCCCTGAAGGAAATTTTTGGGAGGACCTTGAATTAAAGATT 660
Query 541 ACCGAGTGCATCAGGAATACCTTGGATAGGCGTGCCCAATTCTACGAGGATGAGATACGC 600
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 ACCGAGTGCATCAGGAATACCTTGGATAGGCGCGCACAATTCTACGAGGATGAGATACGC 720
Query 601 AAGCTCAGTGAGCAGCGGTTTATGCCAATATGGAACTTTTGTAACTTTTTTATCCTGAAG 660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 721 AAGCTCAGTGAGCAGCGGTTTATGCCAATATGGAACTTTTGTAACTTTTTCATCCTGAAG 780
Query 661 GAAAGTTTGGCTTTCATATTTGAGATGGCTCATCTTCATGAAGATGCATTACGTGAATAT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GAAAGTTTGGCTTTCATATTTGAGATGGCTCATCTTCATGAAGATGCATTACGTGAATAT 840
Query 721 GATGAACTAGAGCTCTGTTATTTGGAAACAGTTAATATGCCTGGGAAACAGAGGGATTTT 780
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GATGAACTAGAGCTCTGCTATTTGGAAACAGTTAATATGCCTGGGAAACAGAGGGATTTT 900
Query 781 GGAGGATTCGACAGTGAAGATGACCAAGCTGTGCTGCTGAAACCAGGAAGCAAACCATTG 840
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GGAGGATTCGACGGTGAAGATGACCAAGCTGTGCTGCTGAAACCAGGAAGCAAACCATTG 960
Query 841 ACACAGATTGTGCAAGATGATTCTTTTAGAGAATTCGAGTTTAGGCAGTATCTCTTTGCC 900
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 961 ACACAGATTGTGCAAGATGATTCTTTTAGAGAATTCGAGTTTAGACAGTATCTCTTTGCC 1020
Query 901 TGTCAATCTAGGCTGTTGTTCAAGTTGAATCGTCCTTTTGAAGTTGCATCTAGGGGCTAT 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1021 TGTCAATCTAGGCTGTTGTTCAAGTTGAATCGTCCATTTGAAGTTGCATCTAGGGGATAT 1080
Query 961 TCTTTTGTTATTAGTTTTGCAAAGGCCTTGACCCTCCATGAGAGTGTACTGCCCTTCTGT 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 TCTTTTGTTATTAGTTTTGCAAAGGCCTTGACCCTTCATGAGAGTGTACTGCCCTTCTGT 1140
Query 1021 ATGCGGGAAGTTTGGGTAATTACTGCATGTTTAGCGCTGATCGAAGCAACTGCTTCTCAT 1080
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 ATGCGAGAAGTTTGGGTAATTACTGCATGTTTAGCGCTGATCGAAGCAACTGCTTCTCAT 1200
Query 1081 CACCATGATGGAGTTGTTGCACCTGATATTGAGAAGGAATTCTTCCGTCTTCAGGGTGAT 1140
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1201 CACCATGATGGCGTTGTTGCACCTGATATTGAGAAGGAATTTTTCCGTCTTCAGGGTGAT 1260
Query 1141 CTCTATTCACTTTCACGGGTTAAGTTCATGAGACTTGGATATCTGATAGGATATGGAACT 1200
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 CTCTATTCACTTTCACGGGTTAAGTTCATGAGACTTGGATATCTGATAGGATATGGAACA 1320
Query 1201 GACATAGAAAAGAGTCCACTGAACAGTGCTTGTCTCAGTATGCTGCCTTGGCCAAAACCG 1260
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GACATCGAAAAGAGTCCACTGAACAGTGCTTGTCTCAGTATGCTGCCTTGGCCAAAACCG 1380
Query 1261 GCTGTCTGGCCATCTCTTCCACAAGACGCTTCCTCTGAGGTGCTTGAAAAAGAAAAGACT 1320
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 GCTGTCTGGCCATCTCTTCCACAAGATGCTTCCTCGGAGGTGCTTGAAAAAGAAAAGACT 1440
Query 1321 ATTCTTCAAGCAACTACAAAGACCAAGCACTTTGGTATTCAACGGAAAGCTTTACCTCTT 1380
||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1441 ATTCTTCAAGCAACTTCAAGGACCAAGCACTTTGGTATTCAACGGAAAGCCTTACCTCTT 1500
Query 1381 GAACCATCTGTCCTTTTACGTGTGGCTAACAGAAGAAGGGCTTCTCTGTCTACCGGAAAT 1440
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1501 GAACCATCTGTCCTTCTACGTGTGGCTAACAGAAGAAGGGCTTCTCTTTCAACCGGAAAT 1560
Query 1441 ATTCCTGAAATATTTGATGGCCGCCCAAGTTTTACTGAAGGATCAGGTTTAGAAGCGTCT 1500
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 ATTCCTGAAATGTTTGATGGGCGCCCAAGTTTTACTGAAGGATCAGGTTTAGAAGCGTCT 1620
Query 1501 CCGAGAACCCCTTCATCACTTAAAGTACAAGCACCTCCCATGTCGAGAACAAATTCTTCA 1560
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1621 CCGAGAACACCTTCATCACTTAAAGTACAAGCACCTCCCATGTCAAGAACAAATTCTTCA 1680
Query 1561 CCTGGAAATTTTGAGAGTCCCCTAGATAGACCTATGAGGCTTGCTGAAATTTTTGTTGCA 1620
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 CCAGGAAATTTTGAGAGTCCCCTAGATAGGCCTATGAGGCTTGCTGAAATTTTTGTTGCA 1740
Query 1621 GCTGAGCATGCTCTGCGACTTACCATTTCAGATCATGATTTGTTGAAGACATTGTCATCT 1680
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GCTGAGCACGCTCTACGACTTACCATTTCAGATCATGATTTGTTGAAGACATTGTCATCT 1800
Query 1681 ATTCAGGATTTTGAGAATAAATATCTTAATCTAACCAAAGGTGCTGCCGAAAACTATCAC 1740
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 ATTCAGGATTTCGAGAATAAATATCTTAACCTAACCAAAGGTGCTGCCGAAAACTATCAC 1860
Query 1741 CGTTCTTGGTGGAAGAGACATGGAGTCGTTCTTGATGGGGAAATTGCAGCTGTCTGCTTC 1800
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 CGTTCCTGGTGGAAGAGACATGGAGTCGTTCTCGATGGGGAAATTGCAGCTGTCTGCTTC 1920
Query 1801 AAGCACGGAAAATATGATTTGGCTGCAAACTCTTATGAAAAAGTTTGTGCCCTTTATGCG 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 AAGCACGGAAAATATGATTTGGCTGCAAACTCTTATGAAAAAGTTTGTGCCCTTTATGCG 1980
Query 1861 GGTGAAGGATGGCAAGATTTACTGGCAGAAGTCTTGCCTAATTTAGCTGAGTGTCAAAAG 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1981 GGTGAAGGATGGCAAGATTTACTGGCAGAAGTCTTGCCTAATTTAGCACAGTGTCAAAAG 2040
Query 1921 ATTCTTAATGATCAAGCGGGGTACATGTCATCTTGTGTTAGACTACTTTCGTTGGATAAA 1980
|||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 ATTCTTGATGATCAAGCTGGGTACATGTCATCTTGTGTTAGACTACTTTCGTTGGATAAA 2100
Query 1981 GGTTTATTCTCGTCCAAGGAGCGGCAAGCTTTTCAGTCCGAGGTTGTTACTCTTGCACAC 2040
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 GGATTATTCTCGTCCAAGGAGCGGCAAGCTTTTCAGTCCGAGGTTGTTACTCTTGCACAC 2160
Query 2041 AGTGAAATGAAGAACCCAGTTCCCTTAGATGTGTCATCATTGATTACGTTTTCTGGAAAT 2100
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 2161 AGTGAAATGAAGAACCCAGTTCCCTTAGATGTGTCATCATTGATCACATTTTCTGGAAAT 2220
Query 2101 ACTGGCCCTCCACTTCAGTTATGTGATGGAGACCCTGGGAATCTATCTGTTACTGTGTGG 2160
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 ACTGGCCCTCCACTTCAGTTGTGTGATGGAGACCCTGGGAATCTATCTGTTACTGTGTGG 2280
Query 2161 AGTGGCTTTCCTGATGATATCACCCTTGATTCGCTTAGTCTTACCTTGGTAGCCACCAAC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2281 AGTGGCTTTCCTGATGATATCACCCTTGATTCGCTTAGTCTTACCTTGGTAGCCACCAAC 2340
Query 2221 AACACTGACGAAGGCGGCCAGGCTTTAAAGAGTTCCGCTGCAACTGTGCTAAAGCCTGGA 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 2341 AACACTGACGAAGGCGGCCAGGCTTTAAAGAGTTCCGCTGCAACTGTGCTAAACCCCGGA 2400
Query 2281 AGGAATACTATCACTTTTGCTTTGCCTCCACAAAAACCCGGTTCCTATGTCTTGGGAGTT 2340
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401 AGGAATACTATCACTTTTGCTCTGCCTCCACAAAAACCCGGTTCCTATGTCTTGGGAGTT 2460
Query 2341 GTTACTGGCCAGATTGGGCGCTTGAGATTCAGATCTCACAGCTTTTCGAAGGGTGGTCCT 2400
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2461 GTTACTGGCCAGATTGGGCGCTTGAGATTCAGGTCTCATAGCTTTTCGAAGGGTGGTCCT 2520
Query 2401 GCAGATAGTGATGACTTCATGAGTTATGAAAAGCCAACCAGACCTATCCTAAAGGTTTCC 2460
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2521 GCAGATAGTGACGACTTCATGAGTTATGAGAAGCCAACCAGACCTATCCTGAAGGTTTCC 2580
Query 2461 AAACCAAGAGCTCTGGTTGATCTTGCTGCAGCTGTATCTTCTGCGCTGCTAATAAATGAA 2520
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2581 AAACCAAGAGCTCTGGTTGATCTTGCTGCAGCTGTATCTTCTGCTCTGCTAATAAATGAA 2640
Query 2521 GCCCAGTGGATTGGTATCATAGTACGTCCTATTGCTTACTCACTTAAAGGCGCCATCTTG 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2641 GCCCAGTGGATTGGTATCATAGTACGTCCTATTGCTTACTCACTTAAAGGCGCGATCTTG 2700
Query 2581 CACATTGATACTGGTCCAGGGTTAAAGATTGAAGACTCGTATGGCATTGAGATGGAGAGA 2640
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2701 CACATTGATACTGGTCCAGGGCTAAAGATTGAAGACTCGTATGGAATTGAGATGGAGAGA 2760
Query 2641 TACATGGACACAGATTGTGATGCTGGTGCATCAAAAGCTGATGTTTTTGTAGAAGATAGA 2700
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 2761 TACATGGACGCAGATTGTGATACTGGTGCATCAAAAGCTGAGGTTTTTGTTGAAGATAGT 2820
Query 2701 CCTGTCTCTCCAAAACGGGATTCAGAGGTGCTTAATCTTTGCGAAGGTAAAATAGTGTTC 2760
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2821 CCTGTCTCTTCAAAACGGGATTCAGAGGTGCTTAATCTTTGCGATGGTAAAATAGTGTTC 2880
Query 2761 TCAGATTGGGCAAGCAATGTGAGTTCTATTCTGTGGGTCCCTGTTCGTGCATTGAGTGAG 2820
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2881 TCAGATTGGGCTAGCAATGTGAGTTCTATTCTTTGGGTCCCTGTTCGTGCCTTGAGTGAG 2940
Query 2821 AAGCTTGCTAGAGGGTCATCTTCAGTCACTCCGCTGAAACAAGATATTTTAGAGGGAATG 2880
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2941 AAGCTTGCTAGAGGGTCATCATCAGTCACTCCGCTGAAACAAGATATTTTAGAGGGAATG 3000
Query 2881 AGAACTGTAGCTTTGAAACTTGAATTTGGGGTGCATCATAACCAGATATTTGAGAGAACC 2940
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3001 AGAACTGTAGCTTTGAAACTTGAATTTGGGGTTCATCATAACCAGATATTTGAGAGAACC 3060
Query 2941 ATAGCTGCACATTTTACCGA-CCCTTTTGATGTGACCACAAGGGTGGCAAACAAATGCAA 2999
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3061 ATAGCTGCACATTTTACCGATCCC-TTTGATGTGACCACAAGGGTGGCAAACAAATGCAA 3119
Query 3000 TGATGGCACTTTGGTCTTGCAGGTTATGCTACACTCCCTAGTCAAGGCGAACTTGATAGT 3059
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 TGATGGCACTTTGGTCTTGCAGGTTATGTTACACTCCCTCGTCAAGGCGAACTTGATAGT 3179
Query 3060 TCTTGATGCTTGGCTTGATCTTCAAGATGGATTTGTTCATGGACAAAATGATGGAAGACC 3119
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3180 TCTTGATGTTTGGCTTGATCTTCAAGATGGATTTATTCATGGACAAAATGATGGAAGACC 3239
Query 3120 GACTTCAACGTTCTTTCCGCTTGTTGTGTCTCCAGGATCTAGAGCAGCAGTCGTGTTCAG 3179
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3240 GACTTCAACGTTCTTTCCGCTTGTCGTGTCTCCAGGATCTAGAGCAGCAGTCGTGTTCAG 3299
Query 3180 TATATGTCTAGACAAGACTATGTCATCAGAAGGGAAAGATTTGCAGCTACCAGAGAGCAT 3239
|||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3300 TATATGCCTAGACAAGAGTATGTCATCAGAAGGGAAAGATTTGCAGCTACCAGAAAGCAT 3359
Query 3240 TCTGAATATCAAATATGGAATCCATGGGGATAGGGCAGCTGGAGCACACAAGCCAGTGGA 3299
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3360 TCTGAATATCAAATATGGAATCCATGGGGATAGAGCAGCTGGAGCACACAGGCCAGTGGA 3419
Query 3300 TGCAGATCACACTGGAACTGATACTGAAGGGAGAGATTTGGTGTTCAAGAGTGCTATTGT 3359
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3420 TGCAGATCACTCTGAAACTGATACTGAAGGGAGAGATTTGGTGTTCAAGAGTGCTATTGT 3479
Query 3360 TTTGCAGCGTCCAGTGCTTGATCCTTGCCTCACAGTTGGATTCCTCCCACTTCCTTCTGA 3419
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3480 TTTGCAGCGTCCAGTACTTGATCCTTGCCTCACAGTTGGATTCCTCCCACTTCCTTCTGA 3539
Query 3420 TGGGCTTAGGGTTGGGAAACTTATCACCATGCAGTGGAGAGTGGAAAGGCTTAAAGATCT 3479
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3540 TGGGCTTAGGGTCGGGAAACTTATCACCATGCAGTGGAGAGTGGAAAGGCTTAAAGAACT 3599
Query 3480 CAAAGAAAGTGAAGCCGTGGAACAACAACATGATGAGGTGTTATATGAAGTCAATGCAAA 3539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3600 CAAAGAAAGTGAAGCCGTGGAACAACAACATGATGAGGTGTTATATGAAGTCAATGCAAA 3659
Query 3540 TTCGGAGAATTGGATGATCGCTGGTAGGAAGAGAGGCCATGTCTCTCTCTCAGAGGAGCA 3599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3660 TTCGGAGAATTGGATGATCGCTGGTAGGAAGAGAGGCCATGTCTCTCTCTCAGAGGAGCA 3719
Query 3600 AGGTTCAAGAGTAGTAATCTCGATACTATGTGTCCCGTTAGTTGCGGGTTATGTCCGTCC 3659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3720 AGGTTCAAGAGTAGTAATCTCGATACTATGTGTCCCGTTAGTTGCGGGTTATGTCCGTCC 3779
Query 3660 TCCTCAACTCGGGTTGCCAAACGTAGAAGAAGCAAATGTAAGCAGCAATCCATCGGGTCC 3719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3780 TCCTCAACTCGGGTTGCCAAACGTAGAAGAAGCAAATGTAAGCAGCAATCCATCGGGTCC 3839
Query 3720 TCACTTAGTATGTGTCTTGCCTCCACTTCTCAGTTCTTCCTACTGCGTACCTGTCAAGTA 3779
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3840 TCACTTAGTATGTGTCTTGCCTCCACTTCTCAGTTCTTCCTACTGCTTACCTGTCAAGTA 3899
Query 3780 A 3780
|
Sbjct 3900 A 3900
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 188276537079
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5