BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg332278
Length=1434
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G60160.1 | Symbols: | Zn-dependent exopeptidases superfamil... 2427 0.0
> AT5G60160.1 | Symbols: | Zn-dependent exopeptidases superfamily
protein | chr5:24223716-24226883 REVERSE LENGTH=1705
Length=1705
Score = 2427 bits (1314), Expect = 0.0
Identities = 1394/1434 (97%), Gaps = 0/1434 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGATAAGAGCTCCCTTGTCTCTGATTTCCTCTCCTTTCTCAATGCTTCTCCCACCGCT 60
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 101 ATGGATAAGAGCTCCCTCGTCTCTGATTTCCTCTCCTTTCTCAATGCTTCTCCCACCGCT 160
Query 61 TTTCACGCCGTCGACGAGTCAAAGAGGCAGCTTGTAAAAGCTGGGTATGAACAGATTTCA 120
||||| |||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||||||||
Sbjct 161 TTTCATGCCGTCGACGAGTCAAAGAGACGGCTTTTGAAGGCTGGGTATGAACAGATTTCA 220
Query 121 GAGAGAGATGATTGGAAACTCGAAGCCGGCAAAAAATACTTCTTCACCAGAAATTACTCC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 GAGAGAGATGATTGGAAACTCGAAGCCGGCAAAAAATACTTCTTCACCAGAAATTACTCC 280
Query 181 ACTATTGTTGCTTTTGCCATTGGTCAAAAATACGTAGCTGGAAACGGGTTCCATATTATT 240
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 281 ACTATTGTTGCTTTTGCCATTGGTCACAAATACGTAGCTGGAAACGGGTTCCATATTATT 340
Query 241 GGAGCTCACACTGATAGTCCTTGCCTCAAATTGAAACCTGTATCCAAGATAACTAAAGGT 300
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 341 GGAGCTCATACTGATAGTCCGTGCCTCAAATTGAAACCTGTATCCAAGATAACTAAAGGT 400
Query 301 GGATGCTTGGAGGTTGGTGTTCAAACATATGGAGGTGGACTCTGGTACACCTGGTTTGAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 401 GGATGCTTGGAGGTTGGTGTTCAAACATATGGAGGTGGACTGTGGTACACCTGGTTTGAT 460
Query 361 CGTGACTTGACTGTTGCAGGACGTGTTATTCTAAAAGAGGAGAAAGCAGGTTCTGTCTCG 420
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 461 CGTGACTTGACTGTTGCAGGACGTGTGATTCTTAAAGAAGAGAAAGCAGGTTCTGTCTCG 520
Query 421 TATTCTCATCGCCTTGTCAGGATTGAGGATCCTATCATGAGGATCCCTACCTTGGCCATT 480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 521 TATTCTCATCGCCTTGTCAGGATTGAGGATCCTATCATGAGGATTCCTACCTTGGCCATT 580
Query 481 CACTTGGACAGGAATGTGAACAGTGAAGGTTTTAAGCCAAACACTCAGACACACCTCGTT 540
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 CACTTGGACAGGAATGTGAACACTGAAGGTTTTAAGCCAAACACTCAGACACACCTCGTT 640
Query 541 CCATTACTGGCAACAGCTATCAAGGCGGAGCTCAATAAAACGCCAGCAGAAGGTGGTGAA 600
||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 641 CCAGTACTGGCAACAGCTATTAAGGCGGAGCTCAATAAAACGCCAGCTGAAAGTGGTGAA 700
Query 601 CATGACGGAGGAAAGAAGTGTGCTGAAACTAGTTCAAAATCAAAGCATCATCCGCTTCTA 660
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 701 CATGACGAAGGAAAGAAGTGTGCTGAAACTAGTTCTAAATCAAAGCATCATCCGCTTCTA 760
Query 661 ATGGAGATCATAGCAAACGCACTGGGTTGTAAACCTGAGGAGATATGCGACTTTGAGCTG 720
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 761 ATGGAGATCATTGCAAACGCACTGGGTTGTAAACCTGAGGAGATATGCGACTTTGAGCTG 820
Query 721 CAAGCATGTGACACTCAGCCAAGTATACTAGCTGGTGCAGCTAAAGAATTTATTTTCTCG 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 CAAGCATGTGACACTCAGCCAAGTATACTAGCTGGTGCAGCTAAAGAATTTATTTTCTCG 880
Query 781 GGAAGGCTAGATAATCTCTGCATGTCATTTTGCTCTCTGAAGGCACTTATAGATGCAACG 840
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 GGAAGACTAGATAATCTCTGCATGTCATTTTGCTCTCTGAAGGCACTTATAGATGCAACG 940
Query 841 TCTTCTGGAAGTGACTTAGAGGAAGAAAGCGGAATAAGAATGGTGGCACTATTTGATCAT 900
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 TCATCTGGAAGTGACTTAGAGGATGAAAGCGGAATAAGAATGGTGGCACTATTTGATCAT 1000
Query 901 GAAGAAGTTGGCTCCAATTCAGCGCAAGGAGCTGGATCCCCTGTCATGATTGATGCTATG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 GAAGAAGTTGGCTCCAATTCAGCGCAAGGAGCTGGATCCCCTGTCATGATTGATGCTATG 1060
Query 961 TCACACATCACAAGTTGCTTCAGCTCTGACACTAAGGTGCTCAAGAAAGCGATTCAAAAA 1020
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1061 TCACACATCACAAGTTGCTTCAGCTCTGACACTAAGGTGCTCAAAAAAGCGATTCAGAAA 1120
Query 1021 AGTTTGCTCGTCTCTGCTGATATGGCACATGCTTTACATCCAAACTTTATGGATAAACAC 1080
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1121 AGTTTGCTTGTCTCTGCTGACATGGCACATGCTTTACATCCAAACTTTATGGACAAACAC 1180
Query 1081 GAAGAGAATCATCAGCCGAAGATGCACGGAGGACTTGTCATCAAACACAATGCAAATCAA 1140
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181 GAAGAGAATCATCAGCCAAAGATGCACGGAGGACTTGTCATCAAACACAATGCAAATCAA 1240
Query 1141 CGTTACGCTACCAATGCCGTAACTTCCTTTGTATTCAGAGAGATAGCAGAGAAGCATAAT 1200
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1241 CGTTACGCCACTAATGCCGTAACTTCCTTTGTATTCAGAGAGATAGCAGAGAAGCATAAT 1300
Query 1201 CTGCCTGTTCAGGATTTTGTGGTACGTAATGATATGGGTTGCGGATCGACCATTGGTCCA 1260
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301 CTGCCTGTTCAGGATTTTGTGGTGCGTAATGATATGGGTTGCGGATCGACCATTGGTCCA 1360
Query 1261 ATCCTAGCAAGCAGTGTGGGGATAAGGACGGTTGATGTTGGAGCTCCTCAGCTCTCGATG 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1361 ATCCTAGCAAGCAGTGTGGGGATAAGGACGGTTGATGTTGGAGCTCCTCAGCTCTCAATG 1420
Query 1321 CATAGCATCCGTGAGATGTGTGCTGCAGATGACGTGAAGCATTCATATGACCACTTTAAA 1380
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1421 CATAGCATCCGTGAGATGTGTGCTGCAGATGACGTGAAGCATTCATATGAACACTTTAAA 1480
Query 1381 GCTTTCTTTCAAGAGTTCACTCACCTTGACGCTAAACTCACTGTCGACGTTTGA 1434
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 1481 GCTTTCTTCCAAGAGTTCACTCACCTTGACGCCAAACTCACTATCGACGTTTGA 1534
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 70682367360
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5