BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg332324 Length=3330 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G60740.1 | Symbols: | ABC transporter family protein | chr5... 5635 0.0 > AT5G60740.1 | Symbols: | ABC transporter family protein | chr5:24425810-24430269 REVERSE LENGTH=3344 Length=3344 Score = 5635 bits (3051), Expect = 0.0 Identities = 3240/3333 (97%), Gaps = 6/3333 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGGAAGGAGAAATTCATAttttcgagggaattttgttccgttgtttttcgtttttatc 60 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| Sbjct 1 ATGGGAAGGAGAAATTCATATTTTCCAGGGAATTTTGTTCCATTGTTCTTCGTGTTTATC 60 Query 61 gtgttgatttttcAGCAAGAAATAGTGATTTGTCAAGAAGATAGAAGCTTGGATAATCCC 120 ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GTGTTGATTCTTCAGCAAGAAAGAGTGATTTGTCAAGAAGATAGAAGCTTGGATAATCCC 120 Query 121 GCGGCTAATCGTCTCTATAACCAATTCGTCTTCGACAAAATATCGAATCTCACCGAAGTT 180 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GCGGCTAATCGTCTCTATAACCAATTCGTTTTCGACAAAATATCGAATCTCACCGAAGTT 180 Query 181 TTTGAGGATGACATCAAAAGAGAGCTCGGATTTTGCATTACCAATGTAAAAGAAGATTAT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TTTGAGGATGACATCAAAAGAGAGCTCGGATTCTGCATTACCAATGTAAAAGAAGATTAT 240 Query 241 AACGAAGCCTTTAATTTTTCTACAAAGCCAGATTTCTTAAACGCATGTGGTAAAACCACA 300 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 AACGAAGCCTTTAATTTCTCTACAAAGCCAGATTTCTTAAACGCATGTGGTAAAACCACA 300 Query 301 AAAGGTGACATGATGCAGAGGATATGTACGGCTGCAGAAGTGAGGATATACTTCAATGGA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 301 AAAGGTGACATGATGCAGAGGATATGTACGGCTGCAGAAGTGAGAATATACTTCAATGGA 360 Query 361 TTATTAGGAGGTGCAAAGAGAGCTACGAATTACTTGAAACCGAACAAGAACTGCAATCTA 420 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TTATTAGGAGGTGCAAAGAGAGCTACTAATTACTTGAAACCGAACAAGAACTGCAATCTA 420 Query 421 TCTTCATGGATGTCTGGATGTGAGCCTGGATGGGCTTGTCGTACTGCTAAAGATGTGAAA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TCTTCATGGATGTCTGGATGTGAGCCTGGATGGGCTTGTCGTACTGCTAAAGATGTGAAA 480 Query 481 GTTGACCTTAAAGACGATAAGAATGTTCCCGTAAGAACTCAGCAATGCGCGCCTTGTTGC 540 ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 481 GTTGACCTTAAAGACGACAAGAATGTTCCTGTTAGAACTCAGCAATGTGCGCCTTGTTGC 540 Query 541 GCAGGTTTCTTCTGCCCTCGTGGTATCACATGCATGATCCCTTGTCCTTTGGGAGCTTAT 600 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GCAGGTTTCTTCTGCCCTCGTGGTATCACCTGCATGATCCCTTGTCCTTTGGGAGCTTAT 600 Query 601 TGTCCAGAAGCTACGCTGAACAGAACAACAGGATTATGCGACCCATATCATTACCAGCTT 660 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TGTCCAGAAGCTAATCTGAACAGAACAACAGGATTATGCGACCCATATCATTACCAGCTT 660 Query 661 CCTTCTGGACAGCCAAATCATACTTGTGGTGGAGCTGATATTTGGGCTGATATTGGTAGT 720 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 CCTTCTGGTCAGCCAAATCATACTTGTGGTGGAGCTGATATTTGGGCTGATATTGGTAGT 720 Query 721 AGCAGTGAAGTCTTCTGTTCAGCTGGATCCTTTTGTCCTTCCACTATCGACAAGCTTCCT 780 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 AGTAGTGAAGTTTTCTGTTCAGCTGGATCCTTTTGTCCTTCCACTATCGACAAGCTTCCT 780 Query 781 TGTACTAAAGGACATTACTGCAGGACAGGTTCTACTGCAGAACTAG-ATTGTTTTAAGCT 839 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | Sbjct 781 TGTACTAAAGGACATTACTGCAGGACAGGTTCTACTGCAGAACT-GAATTGTTTTAAGTT 839 Query 840 GGCAACGTGCAATCCAAGATCAACAAATCAAAATATCACAGCATATGGAATCATGCTTTT 899 ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 GGCAACGTGTAATCCAAGATCAACAAATCAGAATATCACAGCATATGGAATCATGCTTTT 899 Query 900 TGCCGGCCTAGGTTTCTTGCTCATAATCTTATATAACTGTTCTGATCAAGTGCTTGCGAC 959 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || Sbjct 900 CGCCGGGCTAGGTTTCTTGCTCATAATCTTATACAACTGCTCTGATCAAGTGCTTGCAAC 959 Query 960 GAGAGAAAGAAGGCAGGCAAAATCCAGAGAAAAAGCAGTGCAGAGTGTGCGTGATTCGCA 1019 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 960 GAGAGAAAGAAGGCAGGCAAAATCCAGAGAAAAAGCAGTGCAGAGTGTGCGTGATTCGCA 1019 Query 1020 ATCGCGAGAGAAATGGAAATCTGCCAAAGATATTGCAAAGAAGCATGCAACCGAGCTGCA 1079 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1020 ATCGCGAGAGAAATGGAAATCTGCCAAAGATATTGCAAAGAAGCATGCAACCGAGCTGCA 1079 Query 1080 ACAATCGTTTTCCCGAACATTTTCTAGGAGGAAATCTATGAAACAGCCTGATTTGATGAG 1139 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1080 ACAATCGTTTTCTCGAACATTTTCGAGGAGGAAATCTATGAAACAGCCTGATTTGATGAG 1139 Query 1140 AGGTTTAAGCCAAGCAAAACCTGGATCAGATGCTGCCTTACCACCAATGCCAGGAAGCAG 1199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1140 AGGTTTAAGCCAAGCAAAACCTGGATCAGATGCTGCTTTACCACCAATGCTAGGAAGCAG 1199 Query 1200 CTCAGACA-TgaaaaagggaaagaaaaaggaaaagaaCAAACTAACAGAGATGTTACATG 1258 |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1200 CTCAGACACT-AAAAAGGGAAAGAAAAAGGAGAAGAACAAACTAACAGAGATGTTACATG 1258 Query 1259 ACATTGAACAAAACCCTGAAGATCCTGAAGGGTTTAATCTGGAGATTGGTGATAAAAACA 1318 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1259 ACATTGAACAAAACCCTGAAGATCCTGAAGGGTTTAATCTTGAGATTGGTGATAAAAACA 1318 Query 1319 TTAAAAAGCATGCTCCAAAAGGCAAGGCCTTGCATACACAGAGCCAGATGTTCAGGTATG 1378 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1319 TTAAAAAACATGCTCCAAAAGGCAAGGCCTTGCATACACAGAGCCAGATGTTCAGGTACG 1378 Query 1379 CTTATGGCCAGATTGAAAAGGAAAAAGCAATGCAGGAGCAGAACAAGAACTTGACTTTCT 1438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1379 CTTATGGCCAGATTGAAAAGGAAAAAGCAATGCAGGAGCAGAACAAGAACTTGACTTTCT 1438 Query 1439 CTGGAGTTATCTCTATGGCTAATGATATTGATATAAGAAAGAGACCTACGATTGAAGTTG 1498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1439 CTGGAGTTATCTCTATGGCTAATGATATTGATATAAGAAAGAGACCTATGATTGAAGTTG 1498 Query 1499 CTTTTAAAGATCTTTCAATTACTTTAAAAGGAAAAAACAAACATCTAATGAGATGTGTGA 1558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1499 CTTTTAAAGATCTTTCAATTACTTTAAAAGGAAAAAACAAACATCTTATGAGATGTGTGA 1558 Query 1559 CCGGAAAACTATCACCTGGACGTGTTTCTGCTGTGATGGGTCCTTCTGGAGCCGGGAAAA 1618 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1559 CCGGAAAACTATCACCTGGACGTGTTTCTGCTGTGATGGGTCCTTCTGGAGCCGGGAAAA 1618 Query 1619 CAACTTTCCTAACAGCTTTGACAGGCAAAGCACCAGGTTGCACCATGAGTGGAATGATTC 1678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 1619 CAACTTTCCTAACAGCTTTGACAGGCAAAGCACCAGGTTGCATCATGACTGGAATGATTC 1678 Query 1679 TCGTAAACGGAAAAGTTGAATCAATTCAATCCTACAAGAAAATCATAGGTTTTGTACCTC 1738 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct 1679 TCGTAAACGGCAAGGTTGAATCAATTCAATCCTACAAGAAGATTATAGGTTTTGTACCTC 1738 Query 1739 AGGATGACATAGTCCATGGAAACTTGACAGTGGAGGAGAATCTCTGGTTCAGTGCAAGAT 1798 | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| Sbjct 1739 AAGATGACATAGTCCATGGAAACTTAACAGTGGAGGAAAATCTTTGGTTCAGCGCAAGAT 1798 Query 1799 GCAGGTTGCCTGCAGATCTCCCAAAGCCGGA-AAAGGTTTTAGTTGTAGAAAGAGTCATT 1857 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| Sbjct 1799 GCAGGTTGCCTGCAGATCTCCCAAAGCCGGAGAAAG-TTTTAGTTGTGGAAAGAGTCATT 1857 Query 1858 GAGTCACTTGGTCTGCAACATGTTCGAGACTCTCTTGTTGGGACTGTGGAAAAAAGAGGA 1917 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct 1858 GAGTCACTTGGCCTGCAACATGTTCGAGACTCTCTTGTAGGGACTGTGGAAAAGAGAGGA 1917 Query 1918 ATCTCTGGAGGTCAGAGGAAAAGAGTCAATGTGGGTCTTGAAATGGTTATGGAACCATCA 1977 || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1918 ATATCAGGAGGTCAGAGGAAAAGAGTCAATGTGGGTCTTGAAATGGTGATGGAACCATCA 1977 Query 1978 CTTCTGATATTAGATGAACCAACTTCAGGTCTTGACAGTTCATCTTCTCAGTTACTTCTC 2037 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1978 CTTCTGATATTAGATGAACCAACTTCAGGCCTTGACAGTTCATCTTCTCAGTTACTTCTC 2037 Query 2038 AGAGCTTTACGTCGTGAAGCTCTTGAAGGAGTAAACATATGTATGGTTGTCCACCAACCC 2097 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2038 AGAGCTTTACGTCGTGAAGCTCTTGAAGGAGTAAACATATGTATGGTTGTCCACCAACCC 2097 Query 2098 AGCTATACTCTTTTTCGGATGTTTGATGATCTAATACTTCTAGCAAAAGGGGGACTAATA 2157 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2098 AGCTATACTCTTTTTCGGATGTTTGACGATCTGATACTTCTAGCAAAAGGTGGACTAATA 2157 Query 2158 TGTTATCAAGGACCAGTCAAGAAAGTTGAAGAATACTTCTCGAGTCTTGGGATCGTTGTT 2217 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 2158 TGTTATCAAGGACCAGTCAAGAAAGTTGAAGAATACTTCTCAAGTCTCGGGATCGTTGTC 2217 Query 2218 CCTGAACGTGTGAATCCGCCTGATTACTACATTGACATATTGGAAGGTATACTAAAGCCA 2277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2218 CCTGAACGTGTGAATCCGCCTGATTACTACATTGACATATTGGAAGGTATACTAAAGCCA 2277 Query 2278 AGCACAAGCTCAGGAGTTACTTATAAGCAGCTTCCAGTTAGATGGATGCTTCATAATGGG 2337 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2278 AGCACAAGTTCAGGAGTTACTTATAAGCAGCTTCCAGTTAGATGGATGCTTCATAATGGG 2337 Query 2338 TATCCAGTTCCTATGGACATGCTTAAAAGCATTGAAGGGATGGCTTCTTCTGCTTCCGCT 2397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2338 TATCCAGTTCCTATGGACATGCTTAAAAGCATTGAAGGGATGGCTTCTTCTGCTTCCGGT 2397 Query 2398 GAGAACTCTGCTCACGGAGGAAGCGCTCATGGGAGCGTTGTAGGAGAAGACGGAACATCT 2457 |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2398 GAGAACTCTGCTCATGGAGGAAGCGCTCACGGGAGCGTTGTAGGAGATGACGGAACATCT 2457 Query 2458 TTCGCTGGAGAGTTCTGGCAAGATGTCAAAGCAAATGTTGAAATCAAGAAAGATAACTTG 2517 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2458 TTCGCTGGAGAGTTCTGGCAAGATGTCAAGGCAAATGTTGAAATCAAGAAAGATAACTTG 2517 Query 2518 CAGAATAACTTCAGTAGTTCAGGTGACTTATCCGAAAGAGAAGTTCCCGGTGTGTATCAG 2577 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2518 CAGAATAACTTCAGTAGTTCAGGTGACTTATCCGAAAGAGAAGTTCCTGGTGTGTATCAG 2577 Query 2578 CAATACAGATACTTCTTAGGAAGGTTAGGTAAACAAAGACTGCGAGAAGCAAGGACACTA 2637 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2578 CAATACAGATACTTCTTAGGAAGGTTAGGTAAACAAAGACTACGAGAAGCAAGGACACTA 2637 Query 2638 GCTGTAGACTACCTAATACTTTTACTTGCTGGTATCTGCTTAGGAACGCTTGCTAAAGTG 2697 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2638 GCTGTAGATTACCTAATACTTTTACTTGCTGGTATCTGCTTAGGAACGCTTGCTAAAGTG 2697 Query 2698 AGCGATGAAACATTTGGTGCCATGGGATATACATATACAGTCATTGCTGTTTCTCTCTTG 2757 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2698 AGCGATGAAACGTTTGGTGCCATGGGATATACATATACAGTTATTGCTGTTTCTCTCTTG 2757 Query 2758 TGTAAGATTACTGCATTAAGATCTTTCTCTCTGGATAAACTACACTATTGGAGAGAAAGC 2817 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2758 TGTAAGATTACTGCATTAAGATCTTTCTCTCTGGATAAACTACACTATTGGAGAGAAAGC 2817 Query 2818 CGAGCCGGAATGAGTAGCCTGGCTTACTTCCTAGCGAAAGACACAGTTGATCACTTCAAC 2877 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2818 CGAGCCGGAATGAGCAGCCTGGCTTACTTCCTAGCGAAAGACACAGTTGATCACTTCAAC 2877 Query 2878 ACCATTGTTAAGCCGCTTGTTTATCTATCCATGTTCTACTTCTTCAACAATCCAAGATCA 2937 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2878 ACCATCGTTAAGCCGCTTGTTTATCTATCCATGTTCTACTTCTTCAACAATCCAAGATCA 2937 Query 2938 ACAGTTACAGACAATTATGTTGTCCTAATCTGTCTTGTATACTGTGTGACTGGCATAGCT 2997 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2938 ACAGTTACAGACAATTATGTTGTCCTCATCTGTCTTGTATACTGTGTGACTGGTATAGCT 2997 Query 2998 TATGCCCTGGCCATACTTTTCGAACCTGGTCCAGCTCAACTATGGTCAGTGTTACTTCCA 3057 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2998 TATACCCTGGCCATACTTTTCGAACCTGGTCCAGCTCAACTATGGTCAGTGTTACTTCCA 3057 Query 3058 GTGGTGCTGACTCTAATTGCCACCAGTACAAACGACAACAAAATCGTAGATTCAATCTCA 3117 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3058 GTGGTTCTGACTCTAATTGCCACCAGTACAAACGACAACAAAATCGTAGATTCAATCTCA 3117 Query 3118 GAGTTGTGCTACACGAGATGGGCTCTAGAAGCATTTGTGGTATCAAACGCTCAAAGATAT 3177 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3118 GAGTTGTGCTACACGAGATGGGCTCTAGAAGCATTTGTGGTATCAAACGCTCAAAGATAT 3177 Query 3178 AAAGGAGTGTGGCTTATCACTCGATGTGGATCGCTGATGGAGAATGGATACAACATCAAG 3237 |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3178 AAAGGAGTTTGGCTTATCACTCGGTGTGGATCACTGATGGAGAATGGATATAACATCAAG 3237 Query 3238 CACTTCCCTCGTTGCCTCATCTTCCTGACATTAACCGGTATCTTGAGCCGCTGTGCAGCT 3297 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3238 CACTTCCCTCGTTGCCTCGTCTTCCTGACATTAACCGGTATCTTGAGCCGCTGTGCAGCT 3297 Query 3298 TTCTTTTGTATGGTAACCTTCCAAAAGAAGTAG 3330 ||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3298 TTCTTTTGTATGGTAACTTTCCAAAAGAAGTAG 3330 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 165701412729 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5