BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg332862
Length=4479
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G67100.1 | Symbols: ICU2 | DNA-directed DNA polymerases | ch... 6266 0.0
> AT5G67100.1 | Symbols: ICU2 | DNA-directed DNA polymerases |
chr5:26776994-26785104 FORWARD LENGTH=4575
Length=4575
Score = 6266 bits (3393), Expect = 0.0
Identities = 3788/3980 (95%), Gaps = 22/3980 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGACCGGCGATAATTCAACGGATATTGGGCGAAGACGTAGCCGAGGGGCGGAGGCGGCG 60
||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 1 ATGTCCGGCGATAATTCAACGGAAACTGGACGAAGACGTAGCCGAGGCGCGGAGGCGTCG 60
Query 61 AGTCGGAAAGACACACTCGAGCGGCTGAAGGCGATTCGACAAGGAGGAATTCGGTCTGCG 120
||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 61 AGTAGGAAAGACACACTCGAGCGTCTGAAGGCGATTCGACAAGGAGGAATCCGTTCTGCG 120
Query 121 TCAGGTGGTGGGTACGATATTAGGCTACAGAAGCCAATCTTCGATACGGTTGATGATGAC 180
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 121 TCAGGTGGTGGGTACGATATTAGGCTGCAGAAGCCAATCTTCGATACCGTTGATGACGAA 180
Query 181 GAGTACGATGCACTTGTTTCCCGGCGGCGCGAGGAGGCTCGCGGGTTTGTAGTTGAAGAT 240
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GAGTACGACGCACTTGTTTCCCGGCGGCGCGAGGAGGCTCGCGGGTTTGTAGTTGAAGAT 240
Query 241 GGGGAAGGTGGCGATTTGGGATATCTCGACGAAGGTGAGGAGGAGGATTGGTCGAAGCCC 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GGGGAAGGTGGCGATTTGGGATATCTCGACGAAGGTGAGGAGGAGGATTGGTCGAAGCCA 300
Query 301 AGTGGACCTGAATCGACTGATGAATCGGACGACGGTGGTAGGTTTAGCGGGAGACTTAAG 360
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 301 AGTGGACCAGAATCGACTGATGAATCAGACGACGGTGGTAGGTTTAGTGGGAGACTTAAG 360
Query 361 AAGAAGAAGAAAGGGAAAGAACAAATGCAGCAACCTCAGGTTAAGAAGGTGAATCCAGCG 420
|||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 361 AAGAAGAAGAAAGGGAAAGAGCAAACGCAGCAACCTCAGGTTAAGAAGGTGAATCCGGCG 420
Query 421 CTAAAGGCTGCGGCTACTATCACTGGTGAAGGTAGACTTTCGTCTATGTTCACATCTTCG 480
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TTAAAAGCTGCGGCTACTATCACTGGTGAAGGTAGACTTTCGTCTATGTTCACATCTTCG 480
Query 481 AGTTTCAAGAAGGTCAAAGAGACTGATAAGGCACAATATGAGGGTATTCTTGACGAGGTA 540
||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 481 AGTTTCAAGAAAGTTAAGGAGACTGATAAGGCACAGTATGAGGGTATTCTTGACGAGATA 540
Query 541 ATAGCTCAGGTTACTCCGGACGAGTCGGATAGAAGAAAGCATACGAGAAGAAAGCAACCA 600
||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||
Sbjct 541 ATAGCTCAGGTTACTCCAGATGAGTCGGATAGAAAAAAGCATACGAGGAGAAAACTACCA 600
Query 601 GGTACTGTTCCAGTTACCATCTCCAGGAACAAAAAACTGGTTTCTGTTACTTCGAGTATG 660
|||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||
Sbjct 601 GGTACTGTTCCAGTTACCATCTTCAAGAATAAAAAACTGTTTTCTGTTGCCTCGAGTATG 660
Query 661 GAAATGAAGGAGTCAGAACCAACACCCTT-AATTTATGAGGATGATTGTGTTTTCATGGA 719
| |||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||
Sbjct 661 GGAATGAAAGAGTCTGAACCAACA-CCTTCAACTTATGAGGGTGATTCTGTTTCCATGGA 719
Query 720 GAATGAGTTGATGAAAGAGGAAGATATGAAAGAATCTGAAGTCACTCCTTCGCATAATGT 779
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |
Sbjct 720 TAATGAATTGATGAAAGAGGAAGATATGAAAGAATCTGAAGTCA----TTC-C-T--T-C 770
Query 780 TGAGAGTATGGAAGTACCTGGAAGTGATAGTGTTATAGAGGAT-GA--AAACAATATAAG 836
||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||| || |||||| |||||
Sbjct 771 TGAGACTATGGAATTACTTGGAAGTGATATTGTCAAAGAGGATGGATCAAACAAGATAAG 830
Query 837 GAAAGCTGAGGTGAAGACG-GAGTTAGGTGTTAAGGCGGTATTTACATTGAATGCAACTA 895
|||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 831 GAAAACTGAAGTGAAGA-GTGAGTTAGGTGTCAAGGAGGTATTTACATTGAATGCAACGA 889
Query 896 TTGATATGAAAGAGAAGGATTCGGCTTTAAGCGCCACTGCTGGTTGGAAGGAAGCAATGG 955
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 890 TTGATATGAAAGAGAAGGATTCGGCTTTAAGTGCCACTGCTGGTTGGAAGGAAGCGATGG 949
Query 956 GAAGAGGTGGAACTGAGAATGGGGCTTTACTTGGTTCTAGTTGTGAAGGGAAAACGGAAT 1015
||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 950 GAAAAGTTGGAACTGAGAATGGGGCTTTGCTTGGTTCTAGTTCTGAAGGGAAAACGGAAT 1009
Query 1016 TTGATTTGGATGCTGATGGATCACTTCGTTTCTACATTCTTGACGCTTATGAGGAGGCTT 1075
|||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010 TTGATTTGGATGCTGACGGATCACTTCGTTTCTTCATTCTTGACGCTTATGAGGAGGCTT 1069
Query 1076 TTGGCGCGAGCATGGGCACAATATATCTGTTTGGGAAGGTTAAAATCGGAGATACTTACA 1135
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1070 TTGGTGCGAGCATGGGCACAATATATCTGTTTGGGAAGGTTAAAATGGGAGATACTTACA 1129
Query 1136 AGAGTTGCTGTGTGGTAGTTAAGAATATCCAGAGGTGTGTTTATGCTATTCCAAATGATT 1195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130 AGAGTTGCTGTGTGGTAGTTAAGAATATCCAGAGGTGTGTTTATGCTATTCCAAATGATT 1189
Query 1196 CCATATTTCCTTCTCATGAACTAATCATGCTCGAGCAAGAGGTGAAAGACTCTCAACTTT 1255
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1190 CCATATTTCCTTCCCATGAACTAATCATGCTCGAGCAAGAGGTGAAAGACTCTCGACTTT 1249
Query 1256 CTCCTGAATCCTTTCGT-GGAAAGTTGCATGAAATGGCATCAAAACTGAAAAACGAAATT 1314
||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250 CTCCTGAATCCTTCCGTGGGAAA-TTGCATGAAATGGCATCAAAACTGAAAAACGAAATT 1308
Query 1315 GCTCAGGAATTGCTACAACTCAATGTTTCAAATTTTAGCATGGCGCCTGTCAAGAGAAAC 1374
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309 GCTCAGGAATTGTTACAGCTCAATGTTTCAAATTTTAGCATGGCGCCTGTCAAGAGAAAC 1368
Query 1375 TATGCTTTTGAGAGGCCTGATGTGCCTACTGGCGAACAATATGTTATGAAGATAAATTAT 1434
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1369 TATGCTTTTGAGAGGCCTGATGTGCCTGCTGGCGAACAATATGTTTTGAAGATAAATTAT 1428
Query 1435 CCATTTAAGGATCGTCCACTTCCAGAAGATCTTAAAGGCGAGTCTTTCTGCGCTTTGCTC 1494
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1429 TCATTTAAGGATCGTCCACTTCCAGAAGATCTTAAAGGCGAGTCTTTCTCCGCTTTGCTC 1488
Query 1495 GGGTCTCATACCAGTGCTTTGGAGCATTTTATCCTTAAGAGGAAGATCATGGGACCTTCT 1554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1489 GGGTCTCATACCAGTGCTTTGGAGCATTTTATCCTTAAGAGGAAGATCATGGGACCTTGT 1548
Query 1555 TGGCTCAAAATTTTAAACTTCTCTACTTGCTCACCTTCTGTAGGAGTGAGCTGGTGCAAG 1614
||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||
Sbjct 1549 TGGCTCAAAATTTCAAGCTTCTCTACTTGCTCTCCTTCGGAAGGAGTGAGTTGGTGCAAG 1608
Query 1615 TTTGAGGTTACTGTTGAATCTCCCAAGGATATCACTGTTTTAGTTTCGGAGGAAAAGATG 1674
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 1609 TTTGAGGTTACTGTTCAATCTCCCAAGGATATCACTATTTTAGTTTCAGAGGAAAAGGTG 1668
Query 1675 GTTCACCCTCCTGCTGTCGTTACAGCCATAAATTTAAAGACCATAGTCAATGACAAA-CA 1733
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||
Sbjct 1669 GTTCACCCTCCTGCTGTTGTTACAGCCATAAATTTAAAGACTATAGTCAATGA-AAAGCA 1727
Query 1734 GAACATAAGCGAAATCGTTTCTGCATCTGTTCTCTGCTTTCACAACGCCAAGATTGAGGT 1793
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1728 GAACATAAGCGAAATTGTTTCTGCATCTGTTCTCTGCTTTCACAACGCCAAGATTGATGT 1787
Query 1794 TCCAATGCCAGCTCCAGAAAGGAAGAGATCTGGTATTCTGAGTCATTTCACAGTTGTTAG 1853
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1788 TCCAATGCCAGCTCCAGAAAGAAAGAGATCTGGTATTCTGAGTCATTTCACTGTTGTTAG 1847
Query 1854 AAATCCTGAAGGAACCAGTTACCCAATTGGTTGGAAAAAAGAAGTGGCTGACAGAAATTC 1913
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1848 GAATCCTGAAGGAACCGGTTACCCAATTGGTTGGAAAAAAGAAGTGTCTGACAGAAATTC 1907
Query 1914 AAAGAATGGCTGCATTGCT-TTAAGTATTGAAAACAGTGAAAGAGCATTGCTGAACCGAT 1972
|||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1908 AAAGAACGGCTGCAATG-TATTAAGTATTGAAAACAGTGAAAGAGCATTGCTGAACCGAT 1966
Query 1973 TGTTTTTGGAGTTGAACAAATTGGACAGTGATGTTCTTGTGGGACATAATATATCAGGTT 2032
||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1967 TGTTTTTGGAGTTAAACAAATTGGACAGTGATATTCTTGTGGGACATAATATTTCAGGTT 2026
Query 2033 TTGATCTGGATGTTCTTCTTCAAAGAGCCCAGGCTTGCAAAGTTCAGAGTAGCATGTGGT 2092
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2027 TTGATCTGGATGTTCTTCTTCAAAGGGCCCAGGCTTGCAAAGTTCAGAGTAGCATGTGGT 2086
Query 2093 CCAAAATTGGCCGACTCAAACGCTCTTTCATGCCTAAGCTTAAAGGAAACACTAATTTTG 2152
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 2087 CCAAAATTGGCCGACTCAAACGCTCTTTTATGCCTAAGCTTAAAGGAAACAGTAATTATG 2146
Query 2153 GGTCAGGAGCTACACCAGGACTCATGTCTTGTATTGCTGGAAGGCTCTTGTGTGATATAG 2212
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2147 GGTCAGGAGCTACACCAGGGCTCATGTCTTGTATTGCTGGAAGGCTCTTGTGTGATACAG 2206
Query 2213 ATCTGTGTTCTCGTGAATTGTTGAAGCAGGTCAGTTATTCATTAACAGACCTTTCAAAGA 2272
|||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||
Sbjct 2207 ATCTGTGTTCTCGTGACTTGTTGAAGGAGGTCAGTTATTCTTTAACGGACCTCTCAAAGA 2266
Query 2273 CACAGCTGAACCGGGACAGGAAAGAGATAGCGCCTAATGATATTCCCAAAATGTTTCAGT 2332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2267 CACAGCTGAACCGGGACAGGAAAGAGATAGCGCCTAATGATATTCCCAAAATGTTTCAGT 2326
Query 2333 CATCCAAAACACTTGTGGAACTTATTGAATGTGGTGAAACGGATGCATGGCTGTCCATGG 2392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||
Sbjct 2327 CATCCAAAACACTTGTGGAACTTATTGAATGTGGTGAGACGGATGCATGGTTATCCATGG 2386
Query 2393 AGCTCATGTTTCATCTAAGTGTTCTTCCTCTCACACTCCAGCTTACTAACATAAGTGGCA 2452
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2387 AGCTCATGTTTCATCTAAGTGTTCTTCCTCTCACTCTCCAGCTTACTAACATAAGTGGCA 2446
Query 2453 ATCTTTGGGGGAAAACACTTCAAGGAGCCAGGTCGCAGAGAATCGAATACTACTTACTAC 2512
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2447 ATCTTTGGGGGAAAACACTTCAAGGAGCCAGGGCACAGAGAATCGAATACTACTTACTAC 2506
Query 2513 ATACATTCCACTCGAAAAAGTACATTCTCCCAGACAAAATTTCACAACGTATGAAGGAAA 2572
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2507 ATACATTCCACTCGAAAAAGTTCATTCTCCCTGACAAAATTTCACAACGTATGAAGGAAA 2566
Query 2573 TAAAGTCATCAAAAAGAAGAATGAATTATGGTCCAGAGGACCGCAATGTAGAGGAATTGG 2632
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 2567 TAAAGTCATCAAAAAGAAGAATGGATTATGCTCCAGAAGACCGCAATGTAGATGAATTGG 2626
Query 2633 ATGCTGACCTGGCTTCGGAGAATGATCCGTCTAAGGGCAGCAAAACaaaaaaaGGTCCAG 2692
||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2627 ATGCTGACCTGACTTTGGAGAATGATCCGTCTAAGGGCAGCAAAACAAAAAAAGGTCCAG 2686
Query 2693 CCTACGCTGGTGGACTGGTCTTGGAGCCAAAGAGAGGCTTATATGATAAATATGTGTTGC 2752
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 2687 CCTACGCTGGTGGACTGGTCTTGGAGCCAAAGAGAGGCTTATATGACAAATATGTCTTGC 2746
Query 2753 TTCTGGATTTCAATAGTCTTTACCCTTCTATTATACAGGAATACAATATCTGTTTTACGA 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2747 TTCTGGATTTCAATAGTCTTTACCCTTCTATTATACAGGAATACAATATCTGTTTTACGA 2806
Query 2813 CTATACAACGATCAGAAGATGGAGTTCCTCATTTACCTTCGAGTCAAACACCTGGAGTTC 2872
|||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 2807 CTATACCACGATCAGAAGATGGAGTTCCTCGTTTACCTTCGAGTCAGACACCTGGAATTC 2866
Query 2873 TTCCAAAGTTGATGGAACATTTGGTCAGTATAAGGAAAAGCGTCAAATTAAAGATGAAGA 2932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2867 TTCCAAAGTTGATGGAACATTTGGTCAGTATAAGGAAAAGCGTCAAATTAAAGATGAAGA 2926
Query 2933 AGGAAACAGGTCTCAAGTACTGGGAGCTTGACATTCGGCAGCACGCATTAAAGCTCACAG 2992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 2927 AGGAAACAGGTCTCAAGTACTGGGAGCTTGACATTCGACAGCAGGCATTGAAGCTCACAG 2986
Query 2993 CTAATAGTATGTATGGATGTCTGGGGTTTCCTAATTCAAGATTCTATGCTAAGCCTTTAG 3052
| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2987 CCAATAGTATGTATGGCTGTCTGGGGTTTTCTAATTCAAGATTCTATGCTAAGCCTTTAG 3046
Query 3053 CAGAGCTCATAACACTACAGGGAAGGGAGATCCTGCAAAGAACTGTGGATCTTGTCCAGA 3112
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3047 CAGAGCTCATAACACTACAGGGAAGGGATATCCTGCAAAGAACCGTGGATCTTGTCCAGA 3106
Query 3113 ACCATTTAAACCTAGAGGTAATATACGGTGACACAGATTCAATCATGATTCACAGCGGAC 3172
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3107 ACCATTTAAATCTAGAGGTAATATACGGTGACACAGATTCAATCATGATTCACAGCGGAC 3166
Query 3173 TAGATGATATCGAAGAGGTGAATGCCATTAAATCAAAAGTCATCCAAGAGGTCAATAAGA 3232
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3167 TAGATGATATTGAAGAGGTGAAAGCCATTAAATCAAAAGTCATCCAAGAGGTCAATAAGA 3226
Query 3233 AGTATAGATGTCTAAAAATTGACTGTGATGGCATATACAAGAGAATGCTTCTTCTTCGAA 3292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3227 AGTATAGATGTCTAAAAATTGACTGTGATGGCATATACAAGAGAATGCTTCTTCTTCGAA 3286
Query 3293 AAAAGAAGTATGCTGCTGTCAAGTTGGAGTTTAAGGATGGGAAGCCTTGCGAGGACATTG 3352
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3287 AAAAGAAGTATGCTGCTGTCAAGTTGCAGTTTAAGGATGGGAAGCCTTGCGAGGACATTG 3346
Query 3353 AAAGAAAAGGTGTGGATATGGTTCGTCGAGATTGGAGCTTACTCTCTAAGGAAATAGGAG 3412
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3347 AAAGAAAAGGTGTGGATATGGTTCGTCGAGATTGGAGCTTACTCTCGAAGGAAATAGGAG 3406
Query 3413 ATTTATGCCTGAGTAAAATCTTGTATGGAGGGTCGTGTGAGGATGTTGTTGAAGCAATTC 3472
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3407 ATTTATGCCTGAGTAAAATCTTGTATGGAGGATCCTGTGAGGATGTTGTTGAAGCAATTC 3466
Query 3473 ATAACGAACTAATGAAGATAAAGGAGGAAATGAGAAATGGGCAAGTTGCGCTTGAGAAGT 3532
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3467 ATAACGAACTAATGAAGATAAAAGAGGAAATGAGAAATGGGCAAGTTGCTCTTGAGAAGT 3526
Query 3533 ATGTCATCACCAAGACATTGACTAAACCGCCTGCAGCTTATCCAGATTCCAAAAGCCAAC 3592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3527 ATGTCATCACCAAGACATTGACTAAACCGCCTGCAGCTTATCCAGATTCCAAAAGCCAAC 3586
Query 3593 CACATGTTCAAGTTGCACTCAGAATGAGGCAACGTGGTTATAAAGAAGGTTTCAACGCTA 3652
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3587 CACACGTTCAAGTTGCACTCAGAATGAGGCAACGTGGTTATAAAGAAGGTTTCAATGCTA 3646
Query 3653 AGGATACTGTACCGTATATAATCTGCTATGAACAGGGTAATGCTAGCTCTGCTAGTTCAG 3712
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3647 AGGATACTGTACCGTATATAATCTGCTATGAGCAGGGTAATGCTAGCTCTGCTAGTTCAG 3706
Query 3713 CAGGAATTGCCGAACGCGCTAGGCATCCTGATGAGGTGAAATCAGACGGCAGCAGATGGT 3772
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3707 CAGGAATTGCCGAACGTGCTAGGCATCCTGATGAGGTGAAATCAGAAGGCAGCAGATGGT 3766
Query 3773 TGGTTGACATAGATTACTACCTGGCACAACAGATTCATCCGGTGGTGTCTCGTCTATGCG 3832
|||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3767 TGGTTGACATAGATTACTACTTAGCACAACAGATTCATCCGGTGGTGTCTCGTCTATGCG 3826
Query 3833 CAGAAATTCAAGGAACAAGTCCTGAACGTCTAGCTGAGTGTTTAGGACTTGACCCATCAA 3892
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3827 CAGAGATTCAAGGAACAAGTCCTGAACGTCTAGCTGAATGTTTAGGACTTGACCCATCAA 3886
Query 3893 AGTACCGAAGCAAATCAAACGATGCTGCGAGCAGTGATCCTTCTACCTCCCTCTTATTTG 3952
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 3887 AGTACCGAAGCAAATCAAACGATGCTACAAGCAGTGATCCCTCTACCTCCCTCTTATTCG 3946
Query 3953 CTGCAAGCGATGAAGAAAGA 3972
| |||||||||||||||||
Sbjct 3947 CAACAAGCGATGAAGAAAGA 3966
Score = 811 bits (439), Expect = 0.0
Identities = 485/508 (95%), Gaps = 0/508 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3972 ACCTGCAACACCTGAAACAGAGGATTCTGATTCCACATTCTGGCTTAAACTGCATTGCCC 4031
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4068 ACCTGCAACACCTGAAACAGAGGAATCTGATTCCACATTCTGGCTTAAACTGCATTGCCC 4127
Query 4032 GAAATGTCAGCAGGAAGATAGCACGGGAAAAATATCCCCTGCAATGATAGCTAACCAGGT 4091
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4128 GAAATGTCAGCAGGAAGATAGCACGGGAATAATATCCCCTGCAATGATAGCTAACCAGGT 4187
Query 4092 GAAAAGACAGATTGATGGATTTGTGTCAATGTATTACAAAGGCATAATGGTGTGTGACGA 4151
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4188 AAAAAGACAGATCGATGGATTTGTGTCAATGTACTACAAAGGCATAATGGTGTGTGAAGA 4247
Query 4152 TGAGTCTTGCAAGCACACGACCCGCTCCCCCAACTTTCGCCTGCTTGGTGAACGTGAACG 4211
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||
Sbjct 4248 CGAGTCATGCAAGCACACAACCCGCTCCCCCAACTTTCGTCTACTCGGTGAACGTGAACG 4307
Query 4212 GGGGACAGTTTGCCCAAACTATCCTAACTGTAACGGAACCCTGTTACGAAAGTACACTGA 4271
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4308 GGGGACAGTTTGCCCAAACTATCCTAACTGTAACGGAACCCTCTTACGAAAGTACACTGA 4367
Query 4272 AGCAGACTTGTACAAGCAACTGTCATACTTCTGCCACATCTTAGACACACAACACTCTCT 4331
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 4368 AGCAGACTTGTACAAGCAACTGTCATACTTCTGCCACATCTTAGACACACAATGCTCTTT 4427
Query 4332 AGAAAAGATGGATGTTGGCATGAAAATTCAAGTAGAGAAAGCAATGACGAAGATAAGACC 4391
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4428 AGAAAAGATGGATGTTGGCGTGAGAATTCAAGTAGAGAAAGCAATGACGAAGATAAGACC 4487
Query 4392 TGCGGTTGAGTCAGCAGCAGCCATCACTCGAAGTAATAGAGACCGGTGTGCTTATGGATG 4451
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4488 TGCGGTTAAGTCAGCAGCAGCAATCACTCGAAGTAGTAGAGACCGGTGTGCTTATGGATG 4547
Query 4452 GCTGCAACTCACAGACATAGCCATTTGA 4479
| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4548 GATGCAACTCACAGACATAGTCATTTGA 4575
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 223343230236
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5