BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg334149

Length=3630
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT1G08620.1 | Symbols: PKDM7D | Transcription factor jumonji (j...  5795    0.0  


> AT1G08620.1 | Symbols: PKDM7D | Transcription factor jumonji 
(jmj) family protein / zinc finger (C5HC2 type) family protein 
| chr1:2737031-2743724 FORWARD LENGTH=4288
Length=4288

 Score = 5795 bits (3138),  Expect = 0.0
 Identities = 3477/3641 (95%), Gaps = 22/3641 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ATGGGGACAGAGCTAATGAGAATCTGTGTGAAAGAAGATAGTGATGATTTGCCATCTGTT  60
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  305   ATGGGGACAGAGCTAATGAGAATCTGTGTGAAAGAAGATAGTGATGATTTGCCATCTGTT  364

Query  61    CCTCCTGGGTTTGAATCTTATGCTACTTTTACCTTAAAAAGAGTAGTCCC--C-GGTACT  117
             |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   ||||
Sbjct  365   CCTCCTGGTTTTGAATCATATGCAACTTTTACCTTAAAAAGAGTAGTCCCTGCTACTACT  424

Query  118   TCTGATCAAGCCAAGACTGCTGCAATTGAAAGTGTTTCTGCAACCGAACAAGCTAAGATG  177
             |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  425   TCTGATAAAGCCAAGACTCCTGCAATTGAAAGTGTTTCTGCAACCGAACAAGCTAAGATG  484

Query  178   GAAGTTGAATCCGATGAAGCCAAAGCTGCTCGGGCTGTACGCCGTAGGCCTTGGATTAAT  237
             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct  485   GAAGTTGAATCTGATGAAGCCAAAGCTGCTCGGGCTCTACGCCGTAGACCTTGGATTAAT  544

Query  238   CATAGCGgatgtgatgatgatgatga-tgatgGTGCAAAAAACGACAATGCTGCATCTCA  296
             |||||||||||||||||||||| ||| || || |||||| || |||||||||||||||||
Sbjct  545   CATAGCGGATGTGATGATGATGGTGATTG-TGCTGCAAACAATGACAATGCTGCATCTCA  603

Query  297   AAATCCTGATCAAAGTTGT-ACTGCGAAGCC-GTCTCTTCCAAAGGGTGTGGTCAGGGGA  354
             |||||||||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  604   AAATCCTGATCAAAATTGTGA-TGTGAAGCCAG-CTCTTCCAAAGGGTGTGGTCAGGGGA  661

Query  355   TGTGAAGAATGTAAAGATTGCCAGAAGGTAACTGCGACATGGCATCCAGATGAAGCTCGT  414
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  662   TGTGAAGAATGTAAAGATTGTCAGAAGGTAACTGCGAGATGGCATCCAGATGAAGCTCGT  721

Query  415   AGGCCTGACCTTGAAGACGCCCCTGTATTCTACCCGACCGAAGAGGAGTTTGAAGACACT  474
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  722   AGGCCTGACCTTGAGGACGCCCCTGTATTCTACCCGAGCGAAGAGGAGTTTGAAGACACT  781

Query  475   TTGAATTATATAGCTAAAATAAGACCGGAGGCTGAAAAGTATGGAATCTGTCGCATTGTT  534
             || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  782   TTAAATTATATCGCTAAAATAAGACCGGAGGCTGAAAAGTATGGAATCTGTCGCATTGTT  841

Query  535   CCTCCTCCTTCCTGGAAACCGCCGTGCCCACTGAAAGAAAAGCAATTATGGGAGGGTTCT  594
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  842   CCTCCTCCTTCCTGGAAACCGCCGTGCCCACTGAAAGAAAAGCAAGTATGGGAGGGTTCT  901

Query  595   AAATTTACGACGCGTGTCCAAAGAGTTGATAAACTTCAGAATCGTAGTTCAATGAAGAAG  654
             |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  902   AAATTTACAACACGTGTCCAAAGAGTTGATAAACTTCAGAATCGGAGTTCAATGAAGAAG  961

Query  655   ATTTCAAAGCTTTCTAATCAAATGAGAAAGAAGAAAAGAAAGTGCATGAAAATGGGAATG  714
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962   ATTTCAAAGCTTCCTAATCAAATGAGAAAGAAGAAAAGAAAGTGCATGAAAATGGGAATG  1021

Query  715   GATTCTGTCACTAATGGCGTGAGCGATCCCTGTTCTGTAAGCACTGGAATGAGTGAACTT  774
             |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct  1022  GATTCTGTCACTAATGGTATGGGCGATCCCTGTTCTGCAAGCACTGGAATGAATGAACTT  1081

Query  775   GAGACGTTTGGGTTTGAACCTGGTCCAGGGTTTACACTAAAAGACTTCCAAAAATATGCT  834
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1082  GAGACGTTTGGGTTTGAACCTGGTCCAGGGTTCACACTAAAAGACTTCCAAAAATATGCT  1141

Query  835   GATGAGTTCAAGGCTCAGTACTTTAAAAAGAGTGAAACTTCTACAGACGATAAATGTAAA  894
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1142  GATGAGTTCAAGGCTCAGTACTTTAAAAAGAGTGAAACTTCTACAGACGATAAATGTAAA  1201

Query  895   GTTGATAATTCAATAGACTGCTGGGAGCCAGCACTTGAGGATGTTGAAGGTGAATATTGG  954
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1202  GTTGATAATTCAATAGACTGCTGGGAGCCAGCACTTGAGGATGTTGAAGGTGAATATTGG  1261

Query  955   CGTATAGTAGATAAAGCAACTGAAGAGATAGAGGTGCTTTATGGTGCTGATCTTGAAACT  1014
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct  1262  CGGATAGTAGATAAAGCAACTGAAGAGATAGAGGTGCTATATGGTGCTGACCTTGAAACT  1321

Query  1015  GGTGTATTTGGTAGCGGATTCCCCAAGACATCATCAAGTCACAATGCTTCTTCTTCCGAA  1074
             || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  1322  GGGGTATTTGGTAGCGGATTCCCCAAGATATCATCAAGTCACAATGCTTCTTCTTCAGAA  1381

Query  1075  GAAAAATATGCAAAATCAGGCTGGAACTTAAATAACTTTCCAAGGCTTCCGGGATCCCTC  1134
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1382  GATAAATATGCAAAATCAGGCTGGAACTTAAATAACTTTCCAAGGCTTCCGGGATCCCTC  1441

Query  1135  CTTAAGTATGAGGGCAGTGATATTTCCGGTGTCCTTGTGCCATGGCTGTATATTGGGATG  1194
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1442  CTTAAGTACGAGGGCAGTGATATTTCCGGTGTCCTTGTGCCGTGGCTGTATATTGGGATG  1501

Query  1195  TGCTTTTCTTCTTTCTGTTGGCATGTTGAAGATCACCACTTGTATTCGTTGAATTATATG  1254
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1502  TGCTTTTCTTCTTTCTGCTGGCATGTTGAAGATCACCACTTGTATTCGTTGAATTATATG  1561

Query  1255  CACTGGGGTGCACCAAAATTGTGGTATGGTGTTGGGGGGAAGGATGCTGTTAAACTCGAG  1314
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1562  CACTGGGGTGCACCGAAATTGTGGTATGGTGTTGGGGGGAAGGATGCTGTTAAACTCGAG  1621

Query  1315  GAGGCGATGAGAAAGCATTTGCCTGACCTTTTTGAAGAACAGCCTGACTTACTTCATAAG  1374
             ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1622  GAGGCAATGAGGAAGCATTTGCCTGACCTTTTTGAAGAACAGCCTGACTTACTTCATAAG  1681

Query  1375  CTAGTTACACAACTCTCCCCGTCAAAACTGAAAACCGCAGGAGTACCTGTGCACCGTTGC  1434
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1682  CTAGTTACACAACTCTCCCCGTCAAAACTGAAAACCGCAGGAGTACCTGTGCACCGTTGC  1741

Query  1435  GTCCAGCATGCTGGAGAGTTTGTCTTGACTTTTCCTCGGGCATATCATGCTGGATTTAAT  1494
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1742  GTCCAGCATGCTGGAGAGTTTGTCTTGACTTTTCCTCGGGCATATCATGCTGGATTTAAT  1801

Query  1495  TCTGGTTTCAATTGTGCTGAAGCTGTGAATGTAGCACCAGTTGACTGGTTGCCTCATGGG  1554
             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct  1802  TCTGGTTTCAACTGTGCTGAAGCTGTGAATGTAGCACCCGTTGACTGGTTACCTCATGGG  1861

Query  1555  CAGATTGCCATAGAGTTATACTGTCAACAGGGTAGAAAAACGTCCATCTCGCATGATAAA  1614
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1862  CAGATTGCCATAGAGTTATACTGTCAACAGGGTAGAAAAACGTCCATCTCGCATGATAAA  1921

Query  1615  TTGTTGCTTGGGGCAGCAAGAGAAGTAGTGAAAGCCGACTGGGAGCTGAACTTACTAAAG  1674
             |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  1922  TTGTTGCTTGGGGCAGCAAGGGAAGTAGTGAAAGCCGACTGGGAGCTGAACTTACTAAGG  1981

Query  1675  AAAGATACTGTAGATAACTTAAGGTGGAAAGCATTCAGTG-GAAAGGATGGAATTTTGGC  1733
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct  1982  AAAAATACTGTAGATAACTTAAGGTGGAAAGCATTCAGTGCGAA-GGATGGAATTTTGGC  2040

Query  1734  AAAAACACTAAAGGCACGCATTGACATGGAACGTACAAGAAGAGAATTTCTGTGCAACTC  1793
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  2041  AAAAACATTAAAGGCACGCATTGACATGGAACGTACGAGAAGAGAATTTCTGTGCAACTC  2100

Query  1794  TTCACTTGCATT-AAAGATGCACAGTAATTTCGATGCTACCAACGAGAGAGAGTGCTGTA  1852
             |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2101  TTCACTTGCATTGAAA-ATGCACAGTAATTTCGATGCTACCAACGAGAGAGAGTGCTGTA  2159

Query  1853  TATGCTTCTTTGATTTGCACCTGTCTGCTGCTGGTTGCCGTTGTTCCCCAGAGAAGTATT  1912
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||
Sbjct  2160  TATGCTTCTTTGATTTGCACCTGTCTGCTGCTGGCTGTCGTTGTTCCCCGGAGAAGTATT  2219

Query  1913  CATGTTTGACTCATGTGAAGCAGTTGTGTTCATGTCCATGGGTTACTAAATATTTTCTAT  1972
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2220  CATGTTTGACTCATGTGAAGGAGTTGTGTTCATGTCCATGGGTTACTAAATATTTTCTAT  2279

Query  1973  TTCGCTATGATATCGATGAACTGAATGTTCTTGTTGAGGCAGTGGCAGGAAAACTGAGTT  2032
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  2280  TTCGCTATGATATCGATGAACTGAATGTTCTTGTTGAGGCAGTGGAAGGAAAACTGAGTT  2339

Query  2033  CTGTATATAGATGGGCGCGTCAAGATTTAGGATTGGCATTAAGTGCACAGGTCTCAGGAA  2092
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||
Sbjct  2340  CTGTATATAGATGGGCGCGTCAAGATTTAGGATTGGCATTAAGTACAGACGTCTCAGGAA  2399

Query  2093  GCAAGATGGAGATAGATGAGGAAGAAAAAGTCCACAAGGACCTGAGTCCACAAGTAGCTG  2152
             ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||  | |||
Sbjct  2400  GCAAGATGGAGATAGATGAAGAAGGAAAAGTCCACAAGGACCCGACTCCACAAACAACTG  2459

Query  2153  CACTTTCAGGGAAAGATTTGCAGTTGAAAATAACATCGAGAGAAGATCTAAGTAAAGAGT  2212
             ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||||
Sbjct  2460  CACTTTCAGGGAAGGATTTGCAGTTGAAAGTAACATCGAAAGAAG-T--AAGTAAAGAGT  2516

Query  2213  TAGAAAAGACTAGTAAATTATCAGATATTAATTTACTTCTGAAAGACAAGGAGGAGCAAT  2272
             ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||| 
Sbjct  2517  TAGAAAAGACTAGTAAATTATCTCATGTTAATTTACTTCTGAAAGAAAAGGAGGAGCAAA  2576

Query  2273  TAACGTCAAGTCACTGTATGAAGCCTGTCAAAGAAGAAACTGTTTATGATTCTTCTGATC  2332
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  2577  TAACGTCAAGTCACTGTATGAAGCCTGTCAAAGAAGAAACTGTTTGTGATTCTTCTGATC  2636

Query  2333  CAAACGTTTCAGGTTGCCAACCATCTGAAGAAGGCATAATCTCTGTGACAGCTGCTAAGT  2392
             |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||
Sbjct  2637  CAAACGTTTCAGCTTGCCAACCATCTGAAGGAGGCATAATCTGTATGACAGCTGTTAAGT  2696

Query  2393  CTGCAAGTGGTAAAAAGAATTCACAGAGTCTACCCAATGATGTGATACTCCTCAGTGATG  2452
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  2697  CCGCAAGTGGTAAAAAGAATTCACAGAGTCTACCCAATGATGTGATACTCCTCAGCGATG  2756

Query  2453  ATGAGCATGACATACCTAGGAAACGAGGTTCTGTGAGAAGAGATGCAATTTCTTCTGGCA  2512
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2757  ATGAGTATGACATACCTAGGAAACGAGGTTCTGTGAGAAGAGATGCAATTTCTTCTGGCA  2816

Query  2513  AGCAATTAGAAGTACGAGACAGACCAACCCACGTTTTAGCGTTAGAAGCTTCTGTTAAAA  2572
             || |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||
Sbjct  2817  AGAAATTAGAAATACGAGAGAGACCGACCCACGTTTTGGCGTTAGAAGCTTCTGCCAAAA  2876

Query  2573  TTGCTGCTCCAATTTGTCATAGGAAAGGAGATTCACTGCGTGATACACGAACCACTATAT  2632
             |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  2877  TTGCTGCTCCAATTTGCCAAAGGGAAGGAGATTCGCTGCGTGATACACGAAACACTATAT  2936

Query  2633  CATTGCCTACTAATGACCAAAGAAA-AATGAGTAGGGATGTACCGAGTTCTACATCGCAC  2691
             ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  2937  CATTGCCTACTAATGACCAAA-AAACAATGAGAAGGGATGTACCGAGTTCTACTTCGCAC  2995

Query  2692  GCGGAAGTTAAGGCTGAGGCTGCTGGGCTTGCTCAGGATATATGTAATAGAATGGACA-C  2750
             ||||||||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| || |
Sbjct  2996  GCGGAAGTTAATGCGGAGGCTACTGGGCTTACTCAAGATATATGTAACAGAATGG-CAAC  3054

Query  2751  TAACAGCCACGGTGGTGGAAAACCTACTAGTTGTAAATCCAAAAACTCTGGAGGTGTGGC  2810
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  3055  TAACAGCCACGGTGGTGGAAAACCTACTAGTTGTAAATCCAAAAACTCTGGAGGTTTGGC  3114

Query  2811  TATAGTGGATGTTGTTGATGGGACAAGAAGTAATTCAGGTACACCGTCTTGCTCGCAAAA  2870
             ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  3115  TATAGTGGATGTTGTGGATGGGACAAGAAGTAGTTCAGGTACACCGTCTTGTTCGCAAAA  3174

Query  2871  TAATAGTCCTGATAAGTTCATCCGCCAAAAGGGTCCCCGTATTGCAAAGGTCGTGAGGAG  2930
             ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3175  TAATAGTCCGGATAGGTTCATCCGCCAAAAGGGTCCCCGCATTGCAAAGGTCGTGAGGAG  3234

Query  2931  AATCAATTGCAATGTAGAGCCTTTAAGTTATGGATGTGTGCTTTCTGGAAAATCATGGTG  2990
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  3235  AATCAATTGCAATGTAGAGCCTTTAAGTTATGGATGTGTGCTGTCTGGAAAATCATGGTG  3294

Query  2991  CAACCGGCGAGCAATATTTCCTAAAGGATTTCGTAGCCGGGTTAGGTACATGAACATTTT  3050
             || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct  3295  CAGCCGGCGAGCAATTTTTCCTAAAGGATTTCGTAGCCGGGTTAAGTACATAAACATTTT  3354

Query  3051  GGATCCAACAAATATGTGCTTCTACATTTCAGAAATTCTGGATGCTGGACGCAACAGTCC  3110
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3355  GGATCCAACAAATATGTGCTTCTACATTTCAGAAATTCTGGATGCTGGACGCAACAGTCC  3414

Query  3111  ATTGTTCATGGTTTACTTGGAGAGTAATCCCGGTGAGGTTTTCGTTCATTTGTCACCTAC  3170
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||
Sbjct  3415  ATTGTTCATGGTTTACTTGGAGAGTAATCCCAGTGAGGTGTTCGTTCATATGTCGCCTAC  3474

Query  3171  AAGATGCTGGGAGATGGTAAAAGATAGAGTAAATCAAGAGATAAGTAAGCAGCACAAAGC  3230
             |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  3475  AAGATGCTGGGAGATGGTAAGAGAGAGAGTAAATCAAGAGATAACTAAGCAGCACAAAGC  3534

Query  3231  TGGAAAATCAGATCTTCCTCCTTTGCAACCCTCTGGGAGTCCTGACGGTTTTGAAATGTT  3290
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  3535  TGGAAAATCAGATCTTCCTCCTTTGCAACCCTCTGGGAGTCCCGACGGTTTTGAAATGTT  3594

Query  3291  TGGATATTCGTCACCCGCAATCGTTCAGGCTATCGAAGCATTAGACGTGAATCGAGTTTG  3350
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3595  TGGATATTCGTCACCCGCAATCGTACAGGCTATCGAAGCATTAGACGTGAATCGAGTTTG  3654

Query  3351  CACAGACTATTGGGATTCCAGGCCTTATTCACGGCCACAAGTTCAGTTCCCTGCAAATCC  3410
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3655  CACAGACTATTGGGATTCCAGGCCTTATTCCCGGCCACAAGTTCAGTTCCCTGCAAATCC  3714

Query  3411  TCTTCTCAGAGAAGCCAACACAAGTGTCAGATCGGATGTGGCAAAACTCCAGCTAAATCC  3470
             |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||
Sbjct  3715  TCTTCTCAGAGAAGCCAACACAAGTGGCAGATCGAATGTGGGAAATCTCCAGCTAAACCC  3774

Query  3471  TGGACACCAT-TCATTGCCTACTGGAATAAACTCTATTCTCAAAGTTCTGTTCAAGAAAG  3529
             |||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  3775  TGGACACCATAT-ATCGCCTACTGGAATAAATTCTATTCTTAAAGTTCTGTTCAAGAAAG  3833

Query  3530  CTAACCTGGAGGAACTAAGCTCACTTCAACAGGTTTTAAGTGAGACTAACTCAAATTTGG  3589
             ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct  3834  CTAGCATGGAGGAACTAAGCTCACTTCAAGAGGTTTTAAGTGAGACTAACTCAGATATGG  3893

Query  3590  TGACCGAAATTGTGAAGGAAGAGATCCAGAACCGTCGCTGA  3630
             |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3894  TGACCGAACTTGTGAAGGAAGAGATCCAGAACCGTCGCTGA  3934



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 180751495629


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5