BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg337635 Length=5478 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G55540.2 | Symbols: | Nuclear pore complex protein | chr1:2... 8283 0.0 > AT1G55540.2 | Symbols: | Nuclear pore complex protein | chr1:20734608-20743174 REVERSE LENGTH=5736 Length=5736 Score = 8283 bits (4485), Expect = 0.0 Identities = 5173/5501 (94%), Gaps = 64/5501 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGAGCAAAGTTGAGATTGAAGAAGATATGGAAGGAGATCGCATCTCAACGAACGATTAC 60 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 126 ATGAGCAGAGTTGAGATTGAAGAAGATACGGAAGGAGATCGCATCTCAACGAACGATTAC 185 Query 61 TACTTCGAGAAG-ATCGGCGTACCTATCAGTATCAAAGAGGATGACGCTCAATACGATAT 119 ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | Sbjct 186 TACTTCGAG-AGAATCGGCGAACCTATCAGTATCAAAGAAGATGATGCTCAATACGATCT 244 Query 120 CGAAAACCCTCCGTCACAGCCTCTCGCTATCTCCGAACGTCACGGCGTCGTCTTCGTCGC 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||| Sbjct 245 CGAAAACCCTCCGTCACAGCCTCTCGCTATCTCAGAACGCCACGCCGTCCTCTTTGTCGC 304 Query 180 CCATTCCTCCGGGTTTTTCGTTGGGAGGACTAAGGATGTAATTTCTGCATCGAAGAACAG 239 ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 305 ACATTCCTCCGGGTTTTTTGTTGGGAGGACTAATGATGTAATTTCTGCATCGAAGAACAG 364 Query 240 TAACGGGAACGGTGATAAGGTTTATATCCAGGATTTGAGCCTCGTTGATGTTCCTGTTGG 299 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 365 TAACGGGAACGGTGATAAGGTTTTTATCCAGGATTTGAGCCTCGTCGATGTTCCTGTTGG 424 Query 300 GGACGTTCGTATATTGTCTCTCTCGGCGGATGATTCGATTCTGGCTGTCACCGTTGCTGC 359 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 425 GGACGTTCGTATATTGTCTCTCTCAGCGGATGATTCGATTCTCGCTGTCACCGTTGCTGC 484 Query 360 CGATATTCATTTCTTCTCTGTGGATTCACTTCTTAAGAAGGATGCAAAACCTTCTTTTTC 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 485 TGATATTCATTTCTTCTCTGTGGATTCACTTCTTAAGAAGGATGCAAAACCTTCTTTTTC 544 Query 420 TTATTCACCTGATGAGTCAGGCTTTGTTAAGGATTTTCGGTGGATAAGGAAAGATAAGCA 479 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| Sbjct 545 TTATTCACCTGATGAGTCAGGCTTCGTTAAGGATTTTCGGTGGAGAAGGAATGATAAGCA 604 Query 480 TTCTTATCTTGTTCTTTCGAATACTGGGAAGCTCTTTCATGGAATTGACAATGCACCCCC 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 605 TTCTTATCTTGTTCTTTCGAATACTGGGAAGCTCTTTCATGGAATTGATAATGCACCCCC 664 Query 540 TAGACATGTTATGGATGCTGTTGACGCCGTTGAATGGAGTTCAAAAGGGAGTTATATCGC 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 665 TAGACATGTTATGGATGCTGTTGACGCCGTTGAATGGAGTTCAAAAGGGAGTTATATCGC 724 Query 600 TGTGGCCCAAGATAACAGCCTGCGGATTTTATCGTCAAAATTTAACGAGAAGCGGTGCAT 659 ||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 725 TGTAGCTCAAGATAACAGCCTTCGGATTTTTTCGTCAAAATTTAATGAGAAGCGGTGCAT 784 Query 660 AGCACTATCATTTGACGCCTGGATTGGTGATTCTGATGAAGACTG-TTCAGTGAAAGTTG 718 |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| Sbjct 785 AGCACTATCATTTGACTCTTGGATTGGTGATTCCGATGAAGACTGTTTC-GTGAAAGTTG 843 Query 719 ATTCTATCAGATGGGTACGCAACAACTGTATCCTTCTCGGATTCTTTCAGCTGATTGATG 778 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| | Sbjct 844 ATTCTATCAGATGGGTACGCAACAACTGTATTCTTCTTGGATGCTTTCAGCTGATTGAAG 903 Query 779 GCAGGGAAGAAAATTACCTTGTTCAGGTTATTAGGAGTCCAGATGGGAAGATTTCTGATG 838 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 904 GCAGGGAAGAAAATTACCTTGTTCAGGTTATCAGGAGTCCAGATGGGAAGATTTCTGATG 963 Query 839 GTTCATCCAATCTGGTTGCTTTATCCTTCTCCGATTTGTTTCCATGTTCTATGGATGATA 898 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 964 GTTCAACCAATCTGGTTGCTTTATCCTTCTCCGATTTGTTTCCATGTTCTATGGATGATC 1023 Query 899 TTGTTCCAGTTGGTGTTGGACCTCATTTGCTCTTTAGCTACATAGACCAATGCAAACTGG 958 |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1024 TTGTCCCGGTCGGTGTTGGACCTCATTTACTCTTTAGCTACATAGACCAATGCAAACTGG 1083 Query 959 CGGTCACAGCAAACAGAAAGAGCATAGATGAGCATATTGTTTTGCTGGATTGGTCACCTG 1018 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| Sbjct 1084 CGGTCACAGCAAACAGAAAGAGCATAGATGAGCATATTGTTTTACTGGATTGGTCATCTG 1143 Query 1019 GTGATAATAAAACTGCAGTTTCCGTTGTTGATATTGACCGAGAGACCTTTTTGCCAAGGA 1078 ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 1144 GTGATGATAAAAGTGCAGTTTCCGTTGTTGATATTGATCGTGAGACCTTTTTGCCAAGGA 1203 Query 1079 TTGGGCTCCAAGAAAATGGCGATGACAATACGATCATGGGACTCTGTATCGATAGGGTTT 1138 |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1204 TTGGGCTCCAAGAAAACAACGATGACAATACGGTCATGGGACTCTGTATCGATAGGGTTT 1263 Query 1139 CTGTTGCA-GGGACTGTTAATGTCCGTTCCGGAAG-TGATGAACTTAAAGAACTCCTGCC 1196 || | | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | || Sbjct 1264 CTATAG-AGGGGACTGTTAATGTCCGTTCCGG-AGATGATGAACTTAAAGAACTTCAACC 1321 Query 1197 ATATTTTGTTCTTGTGTGCCTCACTTTGGAAGGAAAGCTGGTCATGTTTAATGTCGCTAG 1256 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1322 ATATTTTGTTCTTGTGTGCCTCACTTTGGAAGGGAAGCTGGTCATGTTTAATGTTGCTAG 1381 Query 1257 TGTTGCAGGACCCCCAGCTTCATCTGATGCTGATTTGGCCTCTTCTTCTGATATAGAAGA 1316 ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1382 TGTTGCAGGACGGCCAGCTTCATCTGATACTGATTTGGCCTCTTCTTCTGATATAGAAGA 1441 Query 1317 TGCTTATACCCCTTTGATTGAAGATGACCTTTCTAAACAATCTTCTGAAGAGCCTGAAGA 1376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | Sbjct 1442 TGCTTATACCCCTTTGATTGAAGATGACCTTTCTAAACAATCTTCT---GA-----AA-A 1492 Query 1377 ACATCAGCAGTTGAATGTTTCAGTACAAAATGAACAGAAGCACCTCAACGCAGAGAAGTT 1436 |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| Sbjct 1493 ACATCAACAGTTGAATATTGCAGTACAAAATGATCAGAAACACCTCAACACAGAGAAGTT 1552 Query 1437 CTCTACTGAACAAAGTTTCCCAAATGAAAACATTTTTAGTAAGGAATTTGAGTCTGTAAA 1496 ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || Sbjct 1553 CTCTACTGAACAAAGGTTGCCAAATGAAAACATTTTTAGCAAGGAATTCGAGTCTGTGAA 1612 Query 1497 AAGTTCAGTGTCTGAAGACAACAAGAAGAAGCAAGAACCATATGCTGAAAAACCGTTACA 1556 ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1613 AAGCTCAGTGTCTGGGGACAACAACAAGAAGCAAGAACCGTATGCTGAAAAACCGTTACA 1672 Query 1557 AGTAGAAGATGGTCAACAAAGCATGATTCCTAGGCAGTTCGGAACAAGTTTTGGGCAATC 1616 ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | Sbjct 1673 AGTTGAAGATGCTCAACAAAGCATGATTCCTAGGTTGTCCGGAACAAGTTTTGGGCAA-C 1731 Query 1617 -ACCTGTGTCCTTAGGATATGACACCAACAAATTTTCAGGTTTCGGTCCTGCCCTCTCTG 1675 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| Sbjct 1732 TACCCATGTCCTTAGGATATGACACCAACAAATTTGCAGGATTCGGTCCTGCTCTCCCTG 1791 Query 1676 TTTCCGATAAGCTTCAGAAAGATGTATCTGCGCAGTCCAAGTCTATGCATTTGCAGGCCA 1735 ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1792 TTTCCGAAAAGCTTCAAAAAGACATATTTGCGCAGTCCAATTCTATGCATTTGCAGGCCA 1851 Query 1736 ATGTTGAGTCAAAGAGTACACCAGCTTTATTTGGATCTCCTGGCCTGCAGAACTCAATTT 1795 |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1852 ATGTGGAGTCAAAGAGTACAGCAGCTTTTTTTGGATCTCCTGGCCTGCAGAACGCAATTT 1911 Query 1796 TTCAGTCACCACTAAATACGTCATCTCAGCCATGGTCAAGTGGGAAAGGCGTCTCACCTC 1855 | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1912 TGCAGTCACCGCAAAATACGTCATCTCAGCCATGGTCAAGTGGGAAAAGCGTCTCACCTC 1971 Query 1856 CAGATTTTGTACCTGGTCCCTTTCCTTCTGTGAAAGATACTCAGCATAAGCAATCTGTAC 1915 ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1972 CAGATTTTGTATCTGGTCCCTTTCCTTCTATGAGAGATACTCAGCATAAGCAATCTGTAC 2031 Query 1916 AGTCTGGAACTGGTTATGTGAATCCTCCTATGAGCACT-AAAGA-AACACCTGTTCAAGT 1973 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| || | |||| ||||| Sbjct 2032 AGTCTGGAACTGGTTATGTAAACCCTCCTATGAGCA-TCAAAGATAA-ATCTGTACAAGT 2089 Query 1974 TATTGAGACTGGTAGAGCATCAGCTCTGAGCAATTTAAGTCCTCCGCTAGGCCAAAATTG 2033 ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2090 TATTGAGACTGGTAGAGTATCAGCGCTGAGCAATTTAAGTCCTCTGCTAGGCCAAAATCA 2149 Query 2034 GGACACTAATGAAGGGGTGGAGAAAATTGAGCCAATACCTTCTATCCGTGCCTCTCAATT 2093 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2150 GGACACTAATGAAGGGGTAGAGAAAATTGAGCCAATACCTTCTATCCGTGCCTCTCAATT 2209 Query 2094 GTCACAACAGGTGAAATCTTCCTTCGAAAAATCGGCTAGTCATCAGCAGCACAAAACTCC 2153 ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2210 GTCACAACAGGTGAAATCTTCCTTCGAAAAATCAGCCAGTCATCAGCAGCACAAAACTCC 2269 Query 2154 GCTCAGTGCTGGACCTCTGAGACTTGAGCATAACATGTCAAAGCAACCCAGTAATATAAA 2213 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2270 GCTCAGTACTGGACCTCTGAGACTTGAGCATAACATGTCAAACCAACCCAGTAATATAAA 2329 Query 2214 TGAGATGGCCAGAGAAATGAATACACTTTTACAGTCCATTGAAGGACCGGGTGGTTTCAA 2273 |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2330 TGAGATGGCCCGAGAAATGGATACACTTTTACAGTCCATTGAAGGACCGGGTGGTTTCAA 2389 Query 2274 GGATTCTTGCGAAGTTT-TACTGAAAAGCCATGTTGAAGAACTGGAGCAAGGACTTGAAA 2332 ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2390 GGATTCTTGCG-CGTTTATACTGAAAAGCAATGTTGAAGAACTGGAGCAAGGACTTGAAA 2448 Query 2333 GTCTTGCTGGCAGGTGCCAAACGTGGAAGAGCACAATTCACGAGCAGCAAGCAGAGATCC 2392 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2449 GTCTTGCTGGCAAGTGCCAAACGTGGAAGAGCACAATTCACGAGCAGCAAGCAGAGATCC 2508 Query 2393 AACATCTTCTTGACAAAACAATTCAAGTTTTGGCAAAAAAGACATACATGGAAGGTATGT 2452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2509 AACATCTTCTTGACAAAACAATTCAAGTTTTGGCAAAAAAGACATACATGGAAGGTATGT 2568 Query 2453 ATAAGCAAACTGCTGATAACCAGTACTGGCAACTTTGGAACCGCCAGAAGTTGAATCCTG 2512 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2569 ATAAGCAAACTGCTGATAACCAGTACTGGCAACTTTGGAACCGCCAGAAGTTGAATCCTG 2628 Query 2513 AGCTTGAGGCCAAGCGGCAGCATATTATGAAACTAAACAAGGATTTGACTCATCAACTGA 2572 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2629 AGCTTGAGGCCAAGCGGCAGCATATAATGAAACTAAATAAGGATTTGACTCATCAACTGA 2688 Query 2573 TTGAACTAGAGAGATATTTTAATCGGCTTGAACTCGATCGCTACCATGAGGATGGTGGAC 2632 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2689 TTGAACTAGAGAGATATTTTAATCGGCTTGAACTCGATCGCTACAATGAGGATGGTGGAC 2748 Query 2633 ATCCTGTGGCACGAAGAGGCGTGCCAAGTAGGTCTGCTCCTTCAAGACGTGTGCAATCCC 2692 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2749 ATCCTGTGGCACGAAGAGGCGTGCCAAATAGGTCTGCTCCTTCAAGACGTGTGCAATCCC 2808 Query 2693 TTCACAGCCTTCATAACACAATGAGTTCCCAATTGGCAGCTTCTGAGCAACTCTCTGAGT 2752 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| Sbjct 2809 TTCACAGCCTTCATAACACAATGAGTTCCCAATTGGCTGCTGCTGAGCAACTCTCTGAGT 2868 Query 2753 GTCTCTCAAAACAAATGACATATTTGAAAATCGATTCACCTGTAAAAAAGAATGTGAAGC 2812 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2869 GTCTCTCAAAACAAATGACATATTTGAAAATCGATTCACCTGTAAAAAAGAATGTGAAGC 2928 Query 2813 AGGAGTTGTTTGAGACAATTGGGATCCCTTACGATGCTTCTTTCAGCTCACCAGATGCGG 2872 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2929 AGGAGTTGTTCGAGACAATTGGGATCCCTTACGATGCTTCTTTCAGCTCACCAGATGCGG 2988 Query 2873 TAAAAGCTAAAAATGCATCTTCAGCAAAAAACCTATTACTGTCTTCTATTCCCGCAAGTA 2932 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct 2989 TAAAAGCTAAAAATGCATCTTCAGCAAAAAACCTATTACTCTCTTCTATCCCCGCAAGTA 3048 Query 2933 TAAATGC-ACAGTCAAGACAACGTCAGTCATCTGCTATGAAAAATTCTGACCCTGAAACT 2991 ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3049 TAAAT-CAACAGTCAAGACAACGTCAGTCATCTGCTATGAAAAATTCTGACCCTGAAACT 3107 Query 2992 GCCAGGAGGAGAAGAGAATCACTAGACA-GG--------AATTGGGCTGCTTTTGAGCCT 3042 || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct 3108 GCTAGGAGGAGAAGAGAATCACTAGACAGGGTAATTTTTAATTGGGCTGCTTTTGAGCCT 3167 Query 3043 CCAAAAACAACTGTCAAAAGGATGCTTCTGCAGGAGCAACAGAAGACGGGTATGAACCAA 3102 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3168 CCAAAAACAACTGTCAAAAGGATGCTTCTGCAGGAGCAACAGAAGACGGGTATGAACCAA 3227 Query 3103 CAGATTGTCTTAAGTGAGAGACTACGGTCTGTGAATAATACACAAGAGCGATCACTGCTT 3162 |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3228 CAGACTGTCTTGAGTGAGAGACTACGGTCTGCGAATAATACACAAGATCGATCACTGCTT 3287 Query 3163 CGCCTGAAAAATCATGCATCACCTGTAGTCTCCTCAAATAAGGGCATTATGGAATCATTC 3222 | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3288 CACGTGAAAGATCATGCATCACCTGTAGTCTCCTCGAATAAGGGTATTATGGAATCATTC 3347 Query 3223 CAACAAGACACATCTGAAGCTCAATCAACCCTATTCAAAACGAGGCCACCTATGCCCCAA 3282 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3348 CAACAAGACACATCTGAAGCTCAATCAACCCCATTCAAAACGAGGCCACCTATGCCACAA 3407 Query 3283 TCTAACAGTCCCTTTACCATCTCTCCAATCTCTGCCTCAAAACCAAGTTTCAATTGGTCT 3342 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3408 TCTAACAGTCCCTTTACCATCTCTCCAATCTCTGCGTCAAAACCAAGTTTCAATTGGTCT 3467 Query 3343 GGAAATAAGTCTAGCAGTACAACTTCTTATGCTGAGGAGTCTGCCCCGTCGCAGAATAAG 3402 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| Sbjct 3468 GGAAATAAGTCTAGCAATACAACTTCTTATGCTGAGGAATCTGCCCCATCGCAGATTAAG 3527 Query 3403 GATACAAGGACAGTTTCACAACCAGGAGGATCAAATTTTCTTCTGAAACGACCAGTGGCC 3462 |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3528 GATACAAGGACAGTTTCACAACCAGGGGGATCAAGTTTTCTTCCGAAACGACCAGTGGCC 3587 Query 3463 TCGACTGTATTTGAACAGACAGAAAAGAAGGCTGGAGAATTCAAATTTTCTGAAGCTAAG 3522 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3588 TCGACTGTACTTGAACAGACAGAAAAGAAGGCTGGAGAATTCAAATTTTCCGAAGCTAAG 3647 Query 3523 GCCAATGCTTTTGTTGAAACAGCTGCTGGAAGTGTGCAGCATCTTTCTACCACATCATCA 3582 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3648 GCCAATGCGTTTGTTGAAACAGCTGCTGGAAGTGTGCAGCGGCTTTCTACCACATCATCA 3707 Query 3583 GGATCTGATTATGAATTTAGCAAAGGTTTTGGCGCTCAACTTTCACCCATGTCTTCTGGT 3642 |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| Sbjct 3708 GGATCTGATTTTGAATCTAGCAAAGGTTTTGGTGCTCAATTTTCAACCATGTCGTCTGGT 3767 Query 3643 GGACCAGCATCTAGTTTCCCTTCCAAATCGTTGTTTGGTTTCAAAACCAGTAGCAGTATC 3702 | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3768 GCACCAGCATCTAGTTTTTCTTCAAAATCGTTGTTTGGTTTCAATTCCAGTAGCAGTATC 3827 Query 3703 TATGGTGATAAAGTTACTTTTCCTGCTGCAACGGTATCAGTTTCTTCTTCACCTTTGTCT 3762 |||||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| Sbjct 3828 CCTGGTGATAAATTTACTTTTCCTGCTGTAAC-G-----G---------CACCTTTGTCT 3872 Query 3763 AGCACGCCACTTGATTCCACTTCCACTTTATCTACACCATCATCACCTCCAATGTCATCC 3822 | || || ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| |||||||| Sbjct 3873 GGTACTCCGCTTGATTCCACTTCCACCTTATTTACAGCATCATCAGCTCCAGTGTCATCC 3932 Query 3823 TCTACACAAGATTCAGTTCCAGCATCTATTCCCATTAGCTCAGCACCAGTCATGCAAACG 3882 ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3933 TCTTCCCAAGATCCAGTTCCAGCATCTATACCCATTAGCTCAGCACCAGTCCCGCAAACG 3992 Query 3883 TTTTCAGTCGCATCTACATCTACAGTTTCTGCTACGGGGTTCAATGTTCCATTTGGTAAA 3942 ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3993 TTTTCAGTCACATCTACATCCACTGTTTCAGCTACGGGGTTCAATGTTCCATTTGGTAAA 4052 Query 3943 CCGTTGACCAGTGCCAATGTAGATCTCAGTCAAGCAGCTCCGTCAACACCTTCTCCATCA 4002 || |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4053 CCTTTGACCAGTGTCAAAGTAGATCTCAATCAAGCAGCTCCGTCAACACCTTCTCCATCA 4112 Query 4003 CCTGGTCCCACAACTGGTTTCTCTTTTATTTTACCAGCTTTATCTCCATCATCCCCTGAA 4062 |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 4113 CCTGGTCCCACAGCTGGTTTCACTTTTAATTTACCAGCTTTGTCTCCATCATCCCCTGAG 4172 Query 4063 ATGGTCTCATCCTCAACAGGCCAATCTTCATTATTTCCACTATCTTCTCCAGCGTCGCAA 4122 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| Sbjct 4173 ATGGTCTCATCCTCAACAGGCCAGTCTTCATTATTTCCACCATCTGCTCCAACATCGCAA 4232 Query 4123 GTGTCATCTGATCAGGCCTCTGCAACCAGTTCCCTAACAGATAGTAGTCGTTTGTTCTCA 4182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4233 GTGTCATCTGATCAGGCCTCTGCAACCAGTTCCCTAACAGATAGTAGTCGTTTGTTCTCA 4292 Query 4183 TCAAATTCCTTATCTTCGACTCCTATTACTTCAACCCCTCCTGATGCGTTTCAGTCTCCT 4242 |||| |||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 4293 TCAACTTCCTTATCTTCGACTCCCCCTA-TT--ACTCCTCCTGATGCGTTTCAGTCACCT 4349 Query 4243 CAAGCTTT-CACCCCATCCTCTGCTGTGCCCATTACAGAGCCAGTCTCGGAACCCAAAAA 4301 |||| ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 4350 CAAG-TTTCCACCCCGTCATCTGCTGTCCCCATTACAGAGCCAGTCTCAGAACCTAAAAA 4408 Query 4302 ACCAGAGGTTCAAAGTTCATCAATTCTGAGTACGCAAAGTACTGTAGATTCTGTAGCAAA 4361 |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4409 ACCAGAGGCTCAAAGTTCGTCAATTCTAAGTACGCAAAGTACTGTAGATTCTGTAGCAAA 4468 Query 4362 TGCAACAAAAACACAGAATGAGCCACGGCCGGTGAAAAGTGAAATTTCAAA-CCTGGAGA 4420 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || || Sbjct 4469 TGCAACAAAAACACAGAATGAGCCACTGCCGGTGAAAAGTGAAATTTCAAACCCAGG-GA 4527 Query 4421 CTACAGTAACCCCTGTCAGTTCATCTGGGTTCCTGTCTGGATTTTCATCAGGAACAGAGT 4480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 4528 CTACAGTAACCCCTGTCAGTTCATCTGGGTTCCTGTCTGGATTTTCATCAGGAACACAGT 4587 Query 4481 CTAGTCTTGCAAGCATGGCGGCTCCTTCATTCAGCTGGCCAGGTAGTTCTCAGCCACAAC 4540 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct 4588 CTAGTCTTGCAAGCATGGCGGCTCCTTCATTCAGTTGGCCAGGGAGTTCTCAGCCACAAC 4647 Query 4541 AGCAATCGTCTACACCTGTCCCTTTCCCTGCATCCTTACCAACTTCGGCGAGTCCATTTG 4600 ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| Sbjct 4648 AGCTATCTTCTACACCTGCCCCTTTCCCTGCATCCTCACCAACTTCAGCAAGTCCATTTG 4707 Query 4601 GTGAGAAAAAAGATACTGTAGATACACAGGAAGATGAAATGGACGAAGAAGCTCCAGAGG 4660 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4708 GTGAGAAAAAAGATATTGTAGATACACAGGAAGATGAAATGGACGAAGAAGCTCCAGAGG 4767 Query 4661 CTAGCCAGACAACTGAACTTAGTATGGGAAGTTTTGGAGGTTTCGGGCTTGGGTCAACTC 4720 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4768 CTAGTCAGACAACTGAACTTAGTATGGGAAGTTTTGGAGGTTTCGGGCTTGGGTCAACTC 4827 Query 4721 CAAACCCGGCTGCCCCCAAATCTAATCCATTTGGTGGTCCCTTCGGTAATGCTACAACAA 4780 ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct 4828 CAAACCCGGGTGCCCCCAAAACAAATCCATTTGGTGGTCCCTTTGGTAATGCT---ACAA 4884 Query 4781 CAACAACAAGTAATCCATTCAATATGACAGTCCCGAGTGGCGAGCTATTCAAACCTGCAT 4840 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | Sbjct 4885 CAACAACAAGTAATCCATTCAATATGACAGTTCCTAGTGGCGAGCTATTCAAACCTGCCT 4944 Query 4841 CGTTCAACTTTCAAAATCCTCAACCATCTCAACCGGCAGGTTTTGGTGCGTTCTCTGTAA 4900 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| Sbjct 4945 CGTTCAATTTTCAAAATCCTCAACCATCTCAACCAGCAGGTTTTGGTTCGTTCTCTGTAA 5004 Query 4901 CACCTTCGCAGACACCTGCTCAGAGTGGATTTGGCCAACCGTCACAGATTGGTGGGGGAC 4960 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5005 CACCTTCTCAGACACCTGCTCAGAGTGGATTTGGCCAACCGTCACAGATTGGTGGGGGAC 5064 Query 4961 AGCAAGCTCTAGGGTCGGTTCTTGGCTCCTTTGGGCAGTCGAGACAGATTGGTGCTGGTC 5020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 5065 AGCAAGCTCTAGGGTCGGTTCTTGGCTCCTTTGGGCAGTCGAGACAGATTGGTGCTGGGC 5124 Query 5021 TCCCAGGGGCTACGTTTGGTTCTCCTACAGGATTTGGTGGCTCTAACCCAGGAAGTGGTC 5080 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5125 TCCCAGGAGCTACGTTTGGTTCTCCTACAGGATTTGGTGGCTCTAACCCAGGAAGTGGTC 5184 Query 5081 TGCCAAATGCACCAACATCCGGTGGTTTTGCTGCTGCTGGTTCTAGTGCCACTGGTGGCT 5140 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5185 TGCCAAATGCACCAGCATCTGGTGGTTTTGCTGCTGCTGGTTCTAGTGCCACTGGTGGCT 5244 Query 5141 TTGCCGCCATGGCTTCAGCAGGTCGAGGCTTTGCTGGTGCTTCTTCTACTCCCACTGGTG 5200 |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5245 TTGCGGCCATGGCTTCAGCTGGTAGAGGCTTTGCTGGTGCTTCTTCTACTCCCACTGGTG 5304 Query 5201 GCTTTGCTGCCTTGGCCTCAGGTAGTGGAGGCTTTGCTGGTGCTGCTCCAGGAGGAGGAG 5260 |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5305 GCTTCGCTGCGTTAGCCTCAGGTAGTGGAGGCTTTGCTGGTGCTGCTCCAGGAGGAGGAG 5364 Query 5261 GCGGTGGATTTGGTGGACTTGGTTCAGGCACCGGAGGTTTCGGAGGCTTTGCTCCTCAGG 5320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5365 GCGGTGGATTTGGTGGACTTGGTTCAGGCACCGGAGGTTTCGGAGGCTTTGCTCCTCAGG 5424 Query 5321 GTAGT-G-G-AGGTTTCGCCGGAGCAGGAGGAGGTGGTGGTTTTGGTGGTTTCGGCGGCC 5377 ||||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct 5425 GTAGTAGTGGAGGTTTCGCGGGAGCAGCAGGAGGTGGCGGTTTTGGTGGTTTCGGCGGAC 5484 Query 5378 AAGCGCAAGGCCAAGCAGGTGGTGGTGGATTCTCAGCCTTTGGCGGCAACTCCGGAGCAA 5437 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct 5485 AAGCGCAAGGCCAAGCGGGTGGTGGTGGATTCTCAGCCTTTGGTGGCAACTCGGGAGCAA 5544 Query 5438 CAGGAAAGCCATCGGAACTCTTCACACAGATGAGAAAATGA 5478 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5545 CAGGAAAGCCCTCGGAACTCTTCACACAGATGAGAAAATGA 5585 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 273460006293 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5