BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg337635

Length=5478
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT1G55540.2 | Symbols:  | Nuclear pore complex protein | chr1:2...  8283    0.0  


> AT1G55540.2 | Symbols:  | Nuclear pore complex protein | chr1:20734608-20743174 
REVERSE LENGTH=5736
Length=5736

 Score = 8283 bits (4485),  Expect = 0.0
 Identities = 5173/5501 (94%), Gaps = 64/5501 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ATGAGCAAAGTTGAGATTGAAGAAGATATGGAAGGAGATCGCATCTCAACGAACGATTAC  60
             ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  126   ATGAGCAGAGTTGAGATTGAAGAAGATACGGAAGGAGATCGCATCTCAACGAACGATTAC  185

Query  61    TACTTCGAGAAG-ATCGGCGTACCTATCAGTATCAAAGAGGATGACGCTCAATACGATAT  119
             ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
Sbjct  186   TACTTCGAG-AGAATCGGCGAACCTATCAGTATCAAAGAAGATGATGCTCAATACGATCT  244

Query  120   CGAAAACCCTCCGTCACAGCCTCTCGCTATCTCCGAACGTCACGGCGTCGTCTTCGTCGC  179
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||||
Sbjct  245   CGAAAACCCTCCGTCACAGCCTCTCGCTATCTCAGAACGCCACGCCGTCCTCTTTGTCGC  304

Query  180   CCATTCCTCCGGGTTTTTCGTTGGGAGGACTAAGGATGTAATTTCTGCATCGAAGAACAG  239
              ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  305   ACATTCCTCCGGGTTTTTTGTTGGGAGGACTAATGATGTAATTTCTGCATCGAAGAACAG  364

Query  240   TAACGGGAACGGTGATAAGGTTTATATCCAGGATTTGAGCCTCGTTGATGTTCCTGTTGG  299
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  365   TAACGGGAACGGTGATAAGGTTTTTATCCAGGATTTGAGCCTCGTCGATGTTCCTGTTGG  424

Query  300   GGACGTTCGTATATTGTCTCTCTCGGCGGATGATTCGATTCTGGCTGTCACCGTTGCTGC  359
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  425   GGACGTTCGTATATTGTCTCTCTCAGCGGATGATTCGATTCTCGCTGTCACCGTTGCTGC  484

Query  360   CGATATTCATTTCTTCTCTGTGGATTCACTTCTTAAGAAGGATGCAAAACCTTCTTTTTC  419
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  485   TGATATTCATTTCTTCTCTGTGGATTCACTTCTTAAGAAGGATGCAAAACCTTCTTTTTC  544

Query  420   TTATTCACCTGATGAGTCAGGCTTTGTTAAGGATTTTCGGTGGATAAGGAAAGATAAGCA  479
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct  545   TTATTCACCTGATGAGTCAGGCTTCGTTAAGGATTTTCGGTGGAGAAGGAATGATAAGCA  604

Query  480   TTCTTATCTTGTTCTTTCGAATACTGGGAAGCTCTTTCATGGAATTGACAATGCACCCCC  539
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  605   TTCTTATCTTGTTCTTTCGAATACTGGGAAGCTCTTTCATGGAATTGATAATGCACCCCC  664

Query  540   TAGACATGTTATGGATGCTGTTGACGCCGTTGAATGGAGTTCAAAAGGGAGTTATATCGC  599
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665   TAGACATGTTATGGATGCTGTTGACGCCGTTGAATGGAGTTCAAAAGGGAGTTATATCGC  724

Query  600   TGTGGCCCAAGATAACAGCCTGCGGATTTTATCGTCAAAATTTAACGAGAAGCGGTGCAT  659
             ||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  725   TGTAGCTCAAGATAACAGCCTTCGGATTTTTTCGTCAAAATTTAATGAGAAGCGGTGCAT  784

Query  660   AGCACTATCATTTGACGCCTGGATTGGTGATTCTGATGAAGACTG-TTCAGTGAAAGTTG  718
             |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct  785   AGCACTATCATTTGACTCTTGGATTGGTGATTCCGATGAAGACTGTTTC-GTGAAAGTTG  843

Query  719   ATTCTATCAGATGGGTACGCAACAACTGTATCCTTCTCGGATTCTTTCAGCTGATTGATG  778
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |
Sbjct  844   ATTCTATCAGATGGGTACGCAACAACTGTATTCTTCTTGGATGCTTTCAGCTGATTGAAG  903

Query  779   GCAGGGAAGAAAATTACCTTGTTCAGGTTATTAGGAGTCCAGATGGGAAGATTTCTGATG  838
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  904   GCAGGGAAGAAAATTACCTTGTTCAGGTTATCAGGAGTCCAGATGGGAAGATTTCTGATG  963

Query  839   GTTCATCCAATCTGGTTGCTTTATCCTTCTCCGATTTGTTTCCATGTTCTATGGATGATA  898
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  964   GTTCAACCAATCTGGTTGCTTTATCCTTCTCCGATTTGTTTCCATGTTCTATGGATGATC  1023

Query  899   TTGTTCCAGTTGGTGTTGGACCTCATTTGCTCTTTAGCTACATAGACCAATGCAAACTGG  958
             |||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1024  TTGTCCCGGTCGGTGTTGGACCTCATTTACTCTTTAGCTACATAGACCAATGCAAACTGG  1083

Query  959   CGGTCACAGCAAACAGAAAGAGCATAGATGAGCATATTGTTTTGCTGGATTGGTCACCTG  1018
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct  1084  CGGTCACAGCAAACAGAAAGAGCATAGATGAGCATATTGTTTTACTGGATTGGTCATCTG  1143

Query  1019  GTGATAATAAAACTGCAGTTTCCGTTGTTGATATTGACCGAGAGACCTTTTTGCCAAGGA  1078
             ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct  1144  GTGATGATAAAAGTGCAGTTTCCGTTGTTGATATTGATCGTGAGACCTTTTTGCCAAGGA  1203

Query  1079  TTGGGCTCCAAGAAAATGGCGATGACAATACGATCATGGGACTCTGTATCGATAGGGTTT  1138
             ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1204  TTGGGCTCCAAGAAAACAACGATGACAATACGGTCATGGGACTCTGTATCGATAGGGTTT  1263

Query  1139  CTGTTGCA-GGGACTGTTAATGTCCGTTCCGGAAG-TGATGAACTTAAAGAACTCCTGCC  1196
             || | | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |  ||
Sbjct  1264  CTATAG-AGGGGACTGTTAATGTCCGTTCCGG-AGATGATGAACTTAAAGAACTTCAACC  1321

Query  1197  ATATTTTGTTCTTGTGTGCCTCACTTTGGAAGGAAAGCTGGTCATGTTTAATGTCGCTAG  1256
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1322  ATATTTTGTTCTTGTGTGCCTCACTTTGGAAGGGAAGCTGGTCATGTTTAATGTTGCTAG  1381

Query  1257  TGTTGCAGGACCCCCAGCTTCATCTGATGCTGATTTGGCCTCTTCTTCTGATATAGAAGA  1316
             |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1382  TGTTGCAGGACGGCCAGCTTCATCTGATACTGATTTGGCCTCTTCTTCTGATATAGAAGA  1441

Query  1317  TGCTTATACCCCTTTGATTGAAGATGACCTTTCTAAACAATCTTCTGAAGAGCCTGAAGA  1376
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||     || |
Sbjct  1442  TGCTTATACCCCTTTGATTGAAGATGACCTTTCTAAACAATCTTCT---GA-----AA-A  1492

Query  1377  ACATCAGCAGTTGAATGTTTCAGTACAAAATGAACAGAAGCACCTCAACGCAGAGAAGTT  1436
             |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct  1493  ACATCAACAGTTGAATATTGCAGTACAAAATGATCAGAAACACCTCAACACAGAGAAGTT  1552

Query  1437  CTCTACTGAACAAAGTTTCCCAAATGAAAACATTTTTAGTAAGGAATTTGAGTCTGTAAA  1496
             ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||
Sbjct  1553  CTCTACTGAACAAAGGTTGCCAAATGAAAACATTTTTAGCAAGGAATTCGAGTCTGTGAA  1612

Query  1497  AAGTTCAGTGTCTGAAGACAACAAGAAGAAGCAAGAACCATATGCTGAAAAACCGTTACA  1556
             ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  1613  AAGCTCAGTGTCTGGGGACAACAACAAGAAGCAAGAACCGTATGCTGAAAAACCGTTACA  1672

Query  1557  AGTAGAAGATGGTCAACAAAGCATGATTCCTAGGCAGTTCGGAACAAGTTTTGGGCAATC  1616
             ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |
Sbjct  1673  AGTTGAAGATGCTCAACAAAGCATGATTCCTAGGTTGTCCGGAACAAGTTTTGGGCAA-C  1731

Query  1617  -ACCTGTGTCCTTAGGATATGACACCAACAAATTTTCAGGTTTCGGTCCTGCCCTCTCTG  1675
              |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||
Sbjct  1732  TACCCATGTCCTTAGGATATGACACCAACAAATTTGCAGGATTCGGTCCTGCTCTCCCTG  1791

Query  1676  TTTCCGATAAGCTTCAGAAAGATGTATCTGCGCAGTCCAAGTCTATGCATTTGCAGGCCA  1735
             ||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  1792  TTTCCGAAAAGCTTCAAAAAGACATATTTGCGCAGTCCAATTCTATGCATTTGCAGGCCA  1851

Query  1736  ATGTTGAGTCAAAGAGTACACCAGCTTTATTTGGATCTCCTGGCCTGCAGAACTCAATTT  1795
             |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1852  ATGTGGAGTCAAAGAGTACAGCAGCTTTTTTTGGATCTCCTGGCCTGCAGAACGCAATTT  1911

Query  1796  TTCAGTCACCACTAAATACGTCATCTCAGCCATGGTCAAGTGGGAAAGGCGTCTCACCTC  1855
             | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  1912  TGCAGTCACCGCAAAATACGTCATCTCAGCCATGGTCAAGTGGGAAAAGCGTCTCACCTC  1971

Query  1856  CAGATTTTGTACCTGGTCCCTTTCCTTCTGTGAAAGATACTCAGCATAAGCAATCTGTAC  1915
             ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1972  CAGATTTTGTATCTGGTCCCTTTCCTTCTATGAGAGATACTCAGCATAAGCAATCTGTAC  2031

Query  1916  AGTCTGGAACTGGTTATGTGAATCCTCCTATGAGCACT-AAAGA-AACACCTGTTCAAGT  1973
             ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| || | |||| |||||
Sbjct  2032  AGTCTGGAACTGGTTATGTAAACCCTCCTATGAGCA-TCAAAGATAA-ATCTGTACAAGT  2089

Query  1974  TATTGAGACTGGTAGAGCATCAGCTCTGAGCAATTTAAGTCCTCCGCTAGGCCAAAATTG  2033
             ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  
Sbjct  2090  TATTGAGACTGGTAGAGTATCAGCGCTGAGCAATTTAAGTCCTCTGCTAGGCCAAAATCA  2149

Query  2034  GGACACTAATGAAGGGGTGGAGAAAATTGAGCCAATACCTTCTATCCGTGCCTCTCAATT  2093
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2150  GGACACTAATGAAGGGGTAGAGAAAATTGAGCCAATACCTTCTATCCGTGCCTCTCAATT  2209

Query  2094  GTCACAACAGGTGAAATCTTCCTTCGAAAAATCGGCTAGTCATCAGCAGCACAAAACTCC  2153
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct  2210  GTCACAACAGGTGAAATCTTCCTTCGAAAAATCAGCCAGTCATCAGCAGCACAAAACTCC  2269

Query  2154  GCTCAGTGCTGGACCTCTGAGACTTGAGCATAACATGTCAAAGCAACCCAGTAATATAAA  2213
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  2270  GCTCAGTACTGGACCTCTGAGACTTGAGCATAACATGTCAAACCAACCCAGTAATATAAA  2329

Query  2214  TGAGATGGCCAGAGAAATGAATACACTTTTACAGTCCATTGAAGGACCGGGTGGTTTCAA  2273
             |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2330  TGAGATGGCCCGAGAAATGGATACACTTTTACAGTCCATTGAAGGACCGGGTGGTTTCAA  2389

Query  2274  GGATTCTTGCGAAGTTT-TACTGAAAAGCCATGTTGAAGAACTGGAGCAAGGACTTGAAA  2332
             |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2390  GGATTCTTGCG-CGTTTATACTGAAAAGCAATGTTGAAGAACTGGAGCAAGGACTTGAAA  2448

Query  2333  GTCTTGCTGGCAGGTGCCAAACGTGGAAGAGCACAATTCACGAGCAGCAAGCAGAGATCC  2392
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2449  GTCTTGCTGGCAAGTGCCAAACGTGGAAGAGCACAATTCACGAGCAGCAAGCAGAGATCC  2508

Query  2393  AACATCTTCTTGACAAAACAATTCAAGTTTTGGCAAAAAAGACATACATGGAAGGTATGT  2452
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2509  AACATCTTCTTGACAAAACAATTCAAGTTTTGGCAAAAAAGACATACATGGAAGGTATGT  2568

Query  2453  ATAAGCAAACTGCTGATAACCAGTACTGGCAACTTTGGAACCGCCAGAAGTTGAATCCTG  2512
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2569  ATAAGCAAACTGCTGATAACCAGTACTGGCAACTTTGGAACCGCCAGAAGTTGAATCCTG  2628

Query  2513  AGCTTGAGGCCAAGCGGCAGCATATTATGAAACTAAACAAGGATTTGACTCATCAACTGA  2572
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  2629  AGCTTGAGGCCAAGCGGCAGCATATAATGAAACTAAATAAGGATTTGACTCATCAACTGA  2688

Query  2573  TTGAACTAGAGAGATATTTTAATCGGCTTGAACTCGATCGCTACCATGAGGATGGTGGAC  2632
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  2689  TTGAACTAGAGAGATATTTTAATCGGCTTGAACTCGATCGCTACAATGAGGATGGTGGAC  2748

Query  2633  ATCCTGTGGCACGAAGAGGCGTGCCAAGTAGGTCTGCTCCTTCAAGACGTGTGCAATCCC  2692
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2749  ATCCTGTGGCACGAAGAGGCGTGCCAAATAGGTCTGCTCCTTCAAGACGTGTGCAATCCC  2808

Query  2693  TTCACAGCCTTCATAACACAATGAGTTCCCAATTGGCAGCTTCTGAGCAACTCTCTGAGT  2752
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct  2809  TTCACAGCCTTCATAACACAATGAGTTCCCAATTGGCTGCTGCTGAGCAACTCTCTGAGT  2868

Query  2753  GTCTCTCAAAACAAATGACATATTTGAAAATCGATTCACCTGTAAAAAAGAATGTGAAGC  2812
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2869  GTCTCTCAAAACAAATGACATATTTGAAAATCGATTCACCTGTAAAAAAGAATGTGAAGC  2928

Query  2813  AGGAGTTGTTTGAGACAATTGGGATCCCTTACGATGCTTCTTTCAGCTCACCAGATGCGG  2872
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2929  AGGAGTTGTTCGAGACAATTGGGATCCCTTACGATGCTTCTTTCAGCTCACCAGATGCGG  2988

Query  2873  TAAAAGCTAAAAATGCATCTTCAGCAAAAAACCTATTACTGTCTTCTATTCCCGCAAGTA  2932
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct  2989  TAAAAGCTAAAAATGCATCTTCAGCAAAAAACCTATTACTCTCTTCTATCCCCGCAAGTA  3048

Query  2933  TAAATGC-ACAGTCAAGACAACGTCAGTCATCTGCTATGAAAAATTCTGACCCTGAAACT  2991
             ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3049  TAAAT-CAACAGTCAAGACAACGTCAGTCATCTGCTATGAAAAATTCTGACCCTGAAACT  3107

Query  2992  GCCAGGAGGAGAAGAGAATCACTAGACA-GG--------AATTGGGCTGCTTTTGAGCCT  3042
             || ||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||
Sbjct  3108  GCTAGGAGGAGAAGAGAATCACTAGACAGGGTAATTTTTAATTGGGCTGCTTTTGAGCCT  3167

Query  3043  CCAAAAACAACTGTCAAAAGGATGCTTCTGCAGGAGCAACAGAAGACGGGTATGAACCAA  3102
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3168  CCAAAAACAACTGTCAAAAGGATGCTTCTGCAGGAGCAACAGAAGACGGGTATGAACCAA  3227

Query  3103  CAGATTGTCTTAAGTGAGAGACTACGGTCTGTGAATAATACACAAGAGCGATCACTGCTT  3162
             |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  3228  CAGACTGTCTTGAGTGAGAGACTACGGTCTGCGAATAATACACAAGATCGATCACTGCTT  3287

Query  3163  CGCCTGAAAAATCATGCATCACCTGTAGTCTCCTCAAATAAGGGCATTATGGAATCATTC  3222
             | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct  3288  CACGTGAAAGATCATGCATCACCTGTAGTCTCCTCGAATAAGGGTATTATGGAATCATTC  3347

Query  3223  CAACAAGACACATCTGAAGCTCAATCAACCCTATTCAAAACGAGGCCACCTATGCCCCAA  3282
             ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  3348  CAACAAGACACATCTGAAGCTCAATCAACCCCATTCAAAACGAGGCCACCTATGCCACAA  3407

Query  3283  TCTAACAGTCCCTTTACCATCTCTCCAATCTCTGCCTCAAAACCAAGTTTCAATTGGTCT  3342
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3408  TCTAACAGTCCCTTTACCATCTCTCCAATCTCTGCGTCAAAACCAAGTTTCAATTGGTCT  3467

Query  3343  GGAAATAAGTCTAGCAGTACAACTTCTTATGCTGAGGAGTCTGCCCCGTCGCAGAATAAG  3402
             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||
Sbjct  3468  GGAAATAAGTCTAGCAATACAACTTCTTATGCTGAGGAATCTGCCCCATCGCAGATTAAG  3527

Query  3403  GATACAAGGACAGTTTCACAACCAGGAGGATCAAATTTTCTTCTGAAACGACCAGTGGCC  3462
             |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  3528  GATACAAGGACAGTTTCACAACCAGGGGGATCAAGTTTTCTTCCGAAACGACCAGTGGCC  3587

Query  3463  TCGACTGTATTTGAACAGACAGAAAAGAAGGCTGGAGAATTCAAATTTTCTGAAGCTAAG  3522
             ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  3588  TCGACTGTACTTGAACAGACAGAAAAGAAGGCTGGAGAATTCAAATTTTCCGAAGCTAAG  3647

Query  3523  GCCAATGCTTTTGTTGAAACAGCTGCTGGAAGTGTGCAGCATCTTTCTACCACATCATCA  3582
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||
Sbjct  3648  GCCAATGCGTTTGTTGAAACAGCTGCTGGAAGTGTGCAGCGGCTTTCTACCACATCATCA  3707

Query  3583  GGATCTGATTATGAATTTAGCAAAGGTTTTGGCGCTCAACTTTCACCCATGTCTTCTGGT  3642
             |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||
Sbjct  3708  GGATCTGATTTTGAATCTAGCAAAGGTTTTGGTGCTCAATTTTCAACCATGTCGTCTGGT  3767

Query  3643  GGACCAGCATCTAGTTTCCCTTCCAAATCGTTGTTTGGTTTCAAAACCAGTAGCAGTATC  3702
             | |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||
Sbjct  3768  GCACCAGCATCTAGTTTTTCTTCAAAATCGTTGTTTGGTTTCAATTCCAGTAGCAGTATC  3827

Query  3703  TATGGTGATAAAGTTACTTTTCCTGCTGCAACGGTATCAGTTTCTTCTTCACCTTTGTCT  3762
               |||||||||| ||||||||||||||| ||| |     |         |||||||||||
Sbjct  3828  CCTGGTGATAAATTTACTTTTCCTGCTGTAAC-G-----G---------CACCTTTGTCT  3872

Query  3763  AGCACGCCACTTGATTCCACTTCCACTTTATCTACACCATCATCACCTCCAATGTCATCC  3822
              | || || ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||
Sbjct  3873  GGTACTCCGCTTGATTCCACTTCCACCTTATTTACAGCATCATCAGCTCCAGTGTCATCC  3932

Query  3823  TCTACACAAGATTCAGTTCCAGCATCTATTCCCATTAGCTCAGCACCAGTCATGCAAACG  3882
             ||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||
Sbjct  3933  TCTTCCCAAGATCCAGTTCCAGCATCTATACCCATTAGCTCAGCACCAGTCCCGCAAACG  3992

Query  3883  TTTTCAGTCGCATCTACATCTACAGTTTCTGCTACGGGGTTCAATGTTCCATTTGGTAAA  3942
             ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3993  TTTTCAGTCACATCTACATCCACTGTTTCAGCTACGGGGTTCAATGTTCCATTTGGTAAA  4052

Query  3943  CCGTTGACCAGTGCCAATGTAGATCTCAGTCAAGCAGCTCCGTCAACACCTTCTCCATCA  4002
             || |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4053  CCTTTGACCAGTGTCAAAGTAGATCTCAATCAAGCAGCTCCGTCAACACCTTCTCCATCA  4112

Query  4003  CCTGGTCCCACAACTGGTTTCTCTTTTATTTTACCAGCTTTATCTCCATCATCCCCTGAA  4062
             |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| 
Sbjct  4113  CCTGGTCCCACAGCTGGTTTCACTTTTAATTTACCAGCTTTGTCTCCATCATCCCCTGAG  4172

Query  4063  ATGGTCTCATCCTCAACAGGCCAATCTTCATTATTTCCACTATCTTCTCCAGCGTCGCAA  4122
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||
Sbjct  4173  ATGGTCTCATCCTCAACAGGCCAGTCTTCATTATTTCCACCATCTGCTCCAACATCGCAA  4232

Query  4123  GTGTCATCTGATCAGGCCTCTGCAACCAGTTCCCTAACAGATAGTAGTCGTTTGTTCTCA  4182
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4233  GTGTCATCTGATCAGGCCTCTGCAACCAGTTCCCTAACAGATAGTAGTCGTTTGTTCTCA  4292

Query  4183  TCAAATTCCTTATCTTCGACTCCTATTACTTCAACCCCTCCTGATGCGTTTCAGTCTCCT  4242
             |||| ||||||||||||||||||   || ||  || |||||||||||||||||||| |||
Sbjct  4293  TCAACTTCCTTATCTTCGACTCCCCCTA-TT--ACTCCTCCTGATGCGTTTCAGTCACCT  4349

Query  4243  CAAGCTTT-CACCCCATCCTCTGCTGTGCCCATTACAGAGCCAGTCTCGGAACCCAAAAA  4301
             |||| ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct  4350  CAAG-TTTCCACCCCGTCATCTGCTGTCCCCATTACAGAGCCAGTCTCAGAACCTAAAAA  4408

Query  4302  ACCAGAGGTTCAAAGTTCATCAATTCTGAGTACGCAAAGTACTGTAGATTCTGTAGCAAA  4361
             |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4409  ACCAGAGGCTCAAAGTTCGTCAATTCTAAGTACGCAAAGTACTGTAGATTCTGTAGCAAA  4468

Query  4362  TGCAACAAAAACACAGAATGAGCCACGGCCGGTGAAAAGTGAAATTTCAAA-CCTGGAGA  4420
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||
Sbjct  4469  TGCAACAAAAACACAGAATGAGCCACTGCCGGTGAAAAGTGAAATTTCAAACCCAGG-GA  4527

Query  4421  CTACAGTAACCCCTGTCAGTTCATCTGGGTTCCTGTCTGGATTTTCATCAGGAACAGAGT  4480
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  4528  CTACAGTAACCCCTGTCAGTTCATCTGGGTTCCTGTCTGGATTTTCATCAGGAACACAGT  4587

Query  4481  CTAGTCTTGCAAGCATGGCGGCTCCTTCATTCAGCTGGCCAGGTAGTTCTCAGCCACAAC  4540
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  4588  CTAGTCTTGCAAGCATGGCGGCTCCTTCATTCAGTTGGCCAGGGAGTTCTCAGCCACAAC  4647

Query  4541  AGCAATCGTCTACACCTGTCCCTTTCCCTGCATCCTTACCAACTTCGGCGAGTCCATTTG  4600
             ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||
Sbjct  4648  AGCTATCTTCTACACCTGCCCCTTTCCCTGCATCCTCACCAACTTCAGCAAGTCCATTTG  4707

Query  4601  GTGAGAAAAAAGATACTGTAGATACACAGGAAGATGAAATGGACGAAGAAGCTCCAGAGG  4660
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4708  GTGAGAAAAAAGATATTGTAGATACACAGGAAGATGAAATGGACGAAGAAGCTCCAGAGG  4767

Query  4661  CTAGCCAGACAACTGAACTTAGTATGGGAAGTTTTGGAGGTTTCGGGCTTGGGTCAACTC  4720
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4768  CTAGTCAGACAACTGAACTTAGTATGGGAAGTTTTGGAGGTTTCGGGCTTGGGTCAACTC  4827

Query  4721  CAAACCCGGCTGCCCCCAAATCTAATCCATTTGGTGGTCCCTTCGGTAATGCTACAACAA  4780
             ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||
Sbjct  4828  CAAACCCGGGTGCCCCCAAAACAAATCCATTTGGTGGTCCCTTTGGTAATGCT---ACAA  4884

Query  4781  CAACAACAAGTAATCCATTCAATATGACAGTCCCGAGTGGCGAGCTATTCAAACCTGCAT  4840
             ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  4885  CAACAACAAGTAATCCATTCAATATGACAGTTCCTAGTGGCGAGCTATTCAAACCTGCCT  4944

Query  4841  CGTTCAACTTTCAAAATCCTCAACCATCTCAACCGGCAGGTTTTGGTGCGTTCTCTGTAA  4900
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  4945  CGTTCAATTTTCAAAATCCTCAACCATCTCAACCAGCAGGTTTTGGTTCGTTCTCTGTAA  5004

Query  4901  CACCTTCGCAGACACCTGCTCAGAGTGGATTTGGCCAACCGTCACAGATTGGTGGGGGAC  4960
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5005  CACCTTCTCAGACACCTGCTCAGAGTGGATTTGGCCAACCGTCACAGATTGGTGGGGGAC  5064

Query  4961  AGCAAGCTCTAGGGTCGGTTCTTGGCTCCTTTGGGCAGTCGAGACAGATTGGTGCTGGTC  5020
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  5065  AGCAAGCTCTAGGGTCGGTTCTTGGCTCCTTTGGGCAGTCGAGACAGATTGGTGCTGGGC  5124

Query  5021  TCCCAGGGGCTACGTTTGGTTCTCCTACAGGATTTGGTGGCTCTAACCCAGGAAGTGGTC  5080
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5125  TCCCAGGAGCTACGTTTGGTTCTCCTACAGGATTTGGTGGCTCTAACCCAGGAAGTGGTC  5184

Query  5081  TGCCAAATGCACCAACATCCGGTGGTTTTGCTGCTGCTGGTTCTAGTGCCACTGGTGGCT  5140
             |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5185  TGCCAAATGCACCAGCATCTGGTGGTTTTGCTGCTGCTGGTTCTAGTGCCACTGGTGGCT  5244

Query  5141  TTGCCGCCATGGCTTCAGCAGGTCGAGGCTTTGCTGGTGCTTCTTCTACTCCCACTGGTG  5200
             |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5245  TTGCGGCCATGGCTTCAGCTGGTAGAGGCTTTGCTGGTGCTTCTTCTACTCCCACTGGTG  5304

Query  5201  GCTTTGCTGCCTTGGCCTCAGGTAGTGGAGGCTTTGCTGGTGCTGCTCCAGGAGGAGGAG  5260
             |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5305  GCTTCGCTGCGTTAGCCTCAGGTAGTGGAGGCTTTGCTGGTGCTGCTCCAGGAGGAGGAG  5364

Query  5261  GCGGTGGATTTGGTGGACTTGGTTCAGGCACCGGAGGTTTCGGAGGCTTTGCTCCTCAGG  5320
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5365  GCGGTGGATTTGGTGGACTTGGTTCAGGCACCGGAGGTTTCGGAGGCTTTGCTCCTCAGG  5424

Query  5321  GTAGT-G-G-AGGTTTCGCCGGAGCAGGAGGAGGTGGTGGTTTTGGTGGTTTCGGCGGCC  5377
             ||||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct  5425  GTAGTAGTGGAGGTTTCGCGGGAGCAGCAGGAGGTGGCGGTTTTGGTGGTTTCGGCGGAC  5484

Query  5378  AAGCGCAAGGCCAAGCAGGTGGTGGTGGATTCTCAGCCTTTGGCGGCAACTCCGGAGCAA  5437
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct  5485  AAGCGCAAGGCCAAGCGGGTGGTGGTGGATTCTCAGCCTTTGGTGGCAACTCGGGAGCAA  5544

Query  5438  CAGGAAAGCCATCGGAACTCTTCACACAGATGAGAAAATGA  5478
             |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5545  CAGGAAAGCCCTCGGAACTCTTCACACAGATGAGAAAATGA  5585



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 273460006293


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5