BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg337919
Length=3774
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G64570.1 | Symbols: DUO3 | Homeodomain-like superfamily prot... 5395 0.0
> AT1G64570.1 | Symbols: DUO3 | Homeodomain-like superfamily protein
| chr1:23978868-23983925 FORWARD LENGTH=3720
Length=3720
Score = 5395 bits (2921), Expect = 0.0
Identities = 3255/3415 (95%), Gaps = 27/3415 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 373 TCCGCTGATGAGAGGACAGTTGAGGCCTCAAATGAAAACGGAGAACAATTGGGGGACATG 432
||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 320 TCC-CTGATGAGAGGACAGTTGGGGCCGCAAATGAAAACGGAGAACAATT----G----G 370
Query 433 ATGATCCAAACTCAGAAGCAAGATTTGATGTCAACTGAGGAAGATGATGCAATCTGCAAG 492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 -TGATCCAAACTCAGAAGCAAGATTTGATGTCAACTGAGGAAGATGATGCAATCTGCAAA 429
Query 493 CGGACTAGAGCTCGGTATTCGCTTGCGAGTTTCACCCTTGATGATCTTGAGGCTTTTCTC 552
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430 CGGACTAGAGCTCGCTATTCGCTTGCGAGTTTCACCCTTGATGATCTTGAGGCTTTTCTC 489
Query 553 CAGGAGACTGATGATGAGGATGATATTCCTAATGTCGATGATGAGGAAGAATACCGCAAG 612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 490 CAGGAGACTGATGATGAGGATGATATTCCTAATGTCGATGATGAGGAAGAATACCGCAAG 549
Query 613 TTTCTGGCTGCTGTTTTACATAGTGGTGATACTGAGGTTCCCTTGGCACAGACTGGAACT 672
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 550 TTTCTCGCTGCTGTTTTACATAGTGGTGATACTGAGGTTCCCTTGGCACAGACTGGAACT 609
Query 673 Aatgatgacgatgatgatgatga-G-G-ATAACGATTTAGACTTCGAGATAGAACTTGAG 729
||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 610 AATGATGACGATGATGATGATGATGAGGATAACGATTTAGACTTCGAGATAGAACTTGAG 669
Query 730 GAAGCACTGGAGACTGATGACGAGGAAATTATACCGGAAAAGGTCACAACAGGTGACAAC 789
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 670 GAAGCGCTGGAGACTGATGACGAGGAAATTATACCTGAAAAGGTCACTACAGGTGACAAC 729
Query 790 ATAAGCACTAAGCGACGTCCCGTGACTAGGCAGAAGAGACGGCAAAACATCTCCATTCAT 849
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 730 ATAAGCACTAAGCGACGTCCTGTGACTAGGCAGAAGAGACGGCAAAATATCTCCATTCAT 789
Query 850 CACAAAAACAATTCTCCTGAACAGGCTGGCAGATTGTTACGCCCTCTTGTACCTATCTTA 909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 790 CACAAAAACAATTCTCCTGAACAGGCTGGCAGATTGTTACGCCCTCTTGTACCTATCTTA 849
Query 910 CCCATTGCACCACCTGGGAGAAGCTTTTCTGCTACTGAAGCAGTTGCTTCATCAGAGAAC 969
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 850 CCCATTGCACCACCTGGGAGAAGGGTTTCTGCTACTGAAGCAGTTGCTTCGTCAGAAAAC 909
Query 970 AGGACAATAAATGGCTTCACTCAAGCCCAAATGGGAGAACTGCATTGTTTGATTCATGAT 1029
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 910 AGGACAATAAATGGCTTCACTCAAGCCCAAATGGGAGAACTGCATTCTTTGATTCATGAT 969
Query 1030 CACCTTCAACTTCTTATCCAAGTGTACTCTCTTTGTGCACTTGATCATTCACGGCAGCGC 1089
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 970 CACCTTCAACTTCTTATCCAAGTGTACTCTCTTTGTGCACTTGATCATTCACGGCAAAGC 1029
Query 1090 ATTGGAACCCACGTACAAGGACTTCTATCTGAGATGCTCAAACAACACCAAGGATATATC 1149
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 ATTGGAACCCACGTCCAAGGACTTCTATCTGAGATGCTCAAACAACACCAAGGATATATC 1089
Query 1150 TCACGCCGAAGTCATCTTCTTGTCACTGGTTCAGCATCATCAGTTCTGGATGTTGTGGGT 1209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1090 TCACGCCGAAGTCATCTTCTTGTCACTGGTTCAGCATCATCGGTTCTTGATGTTGTGGGT 1149
Query 1210 CTAGCTGGAAGATATCTAGTTGATGTTTCTGACGCTGTTCAAGATTATCGACGGTGTCAA 1269
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1150 CTAGCTGGAAGATATCTAGTTGATGTTTCTGACGCTGTGCAAGATTATCGACGGTGTCAA 1209
Query 1270 GTGGAATCCGGTTTTGATACTTCGTCTCAAAGAGTGCCATTATTTACACTTCCTCACCAA 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210 GTGGAATCCGGTTTTGATACTTCGTCTCAAAGAGTGCCATTATTTACACTTCCTCACCAA 1269
Query 1330 GAAGTTGGCGGTGAGATTGTAAACAATCCTCTTTCATCCCCTAGTTCAAGTAAGTCACCA 1389
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1270 GAAGTTGGCGGTGAGATTGTAAACTATCCTCTTTCATCCCCTAGTTCAAGTAAGTCACCA 1329
Query 1390 TCAGGTCAGCAGCAATCTAAGAAGACGTTAGCTGCTATACTGGTTGAATCAGCCCAGAAG 1449
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 TCAGGTCAGCAGCAGGCTAAGAAGACGTTAGCTGCTACACTGGTTGAATCAGCCCAGAAG 1389
Query 1450 CAATCTGTTGCCTTGGTCCATAAGGATATCGCCAAGTTAGCTAAAAGATTTTTGCCGTTG 1509
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 1390 CAATCTGTTGCCTTGGTCCATAAGGATATTGCCAAGTTAGCTAAAAGATTTATGCCATTG 1449
Query 1510 TTCAAAGTATCGCTATATCCCCACAAGCCACCTCATGCAGCTGTCGCCAATCGGGTCCTT 1569
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1450 TTCAAAGTATCGCTATATCCCCACAAGCCACCTCATGCAGCTGTCGCCAATCGGGTCCTT 1509
Query 1570 TTCACTGACGCTGAGGATGAATTACTGGCTCTTGGAATAATGGAATATAACTCAGACTGG 1629
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1510 TTCACTGATGCTGAGGATGAATTACTAGCTCTTGGAATAATGGAATATAACTCAGACTGG 1569
Query 1630 AAGGCAATAAAGCAGCGGTTTCTTCC-ATGTAAAGGGGAGCATCAGATTTATGTTAGGCa 1688
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1570 AAGGCAATAAAGCAGCGGTTTCTTCCTA-GTAAAGGCGAGCATCAGATTTATGTTAGGCA 1628
Query 1689 aaaaaaCCGAAGATCATCTAAAGCCCCAGAAAATCCAATTAAGGCAGTTCTGAGGATGAA 1748
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AAAAAACCGGAGATCATCTAAAGCCCCAGAAAATCCAATTAAGGCAGTTCTGAGGATGAA 1688
Query 1749 AAGCTCTCCCCTGACTCCACAAGAGATAGTACGTATACAAGAGGGACTTAAGTACTTCAA 1808
||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1689 AAGCTCTCCCCTGACACCACAAGAGATACTACGAATACAAGAGGGACTTAAGTACTTCAA 1748
Query 1809 ATATGATTGGACGTCTGTGTGGAAATTCGTTGTGCCTTACCGAGACCCGTCCTCACTGCC 1868
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||
Sbjct 1749 ATATGATTGGACGTCTGTGTGGAAATTCGTCGTGCCTTACCGAGACCCATCATTACTGCC 1808
Query 1869 ACGACAATGGCGCACTGCCCTTGGAATTCAGAAATCATATAAGCTAGATGCTGTAAAAAA 1928
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1809 TCGGCAATGGCGCACTGCCCTTGGAATTCAGAAATCATATAAGCTAGATGCTGTAAAAAA 1868
Query 1929 GGAGAAGCGGAGATTATATGATACAAAAAGAAAATTCAGAGAGCAGCAGGCATCTGCAAA 1988
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1869 GGAGAAACGGAGATTATATGATACAAATAGAAAATTCAGAGAGCAGCAGGCATCTGCAAA 1928
Query 1989 AGAGGATCGACATGGGGCTTCTAAAGCCAATGAATATCATGTTGGTGATGAATTGGTCGA 2048
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1929 AGAGGATCGTTATGGGGCTTCTAAAGCCAATGAATATCATGTTGGTGGTGAATTGGTCGA 1988
Query 2049 GAGTTCAGGTGAGGCATACCTACATGAAGGATTTTTAGCAGACTGGAGGCCTGGCATGCC 2108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989 GAGTTCAGGTGAGGCATACCTACATGAAGGATTTTTAGCAGACTGGAGGCCTGGCATGCC 2048
Query 2109 AACCCTCTTTTATTCTACATCTATGCACTCCTTTGACAAGGCAAAGGATGTTCCCGGTGA 2168
|||| | |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2049 AACCTTTTTTTCTTCTGCACCTATGCACTCCTTTGACAAGGCAAAGGATGTTCCCGGTGA 2108
Query 2169 TCGACATGAGTCAGTACAAACATGTATAGTTGAAGGATCTAAAAATCCTGAACTTTGTGG 2228
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2109 TCGACATGAGTCAGTGCAAACATGTATCGTTGAAGGATCTAAAAATCCTGAACTCTGTGG 2168
Query 2229 TGCCCAAATTCTGACATGTACGCAGAGGCTTGCACCTTCATTCATTCCTCTGTACCACCA 2288
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 2169 TGCCCAAATCCTGACATGTACGCAGAGGCTTGCACCTTCATTCATTCCTATGTACCGCCA 2228
Query 2289 CACATCTGGTACAGCACCCGGTGCCTCAAAAGCATCGATAATTACGCGGCCATATCGTTC 2348
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2229 CACATCTGGTACAGCACCCGGTGCCTCAAAAGCACCGATAATTGCGCGGCCATATCGTTC 2288
Query 2349 TCGTAAACTATTCAACAGAAGTGTTGTGAGACTAGCCCCTGATTTGCCTCCCCTTAACCT 2408
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 2289 TCGTAAAGTATTCAACAGAAGTGTTGTGAGACTAGCCCCTGATTTACCTCCCGTTAACCT 2348
Query 2409 TCCATCTTCTGTCCGTGTTATCTCACAATCGGTTTTTGCGAAGAATCAGTCTGAAACATC 2468
|||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2349 TCCATCGTCGGTCCGTGTTATCTCGCAGTCTGTTTTTGCGAAGAATCAGTCTGAAACATC 2408
Query 2469 CTCCAAAACTTGTATCATTAAAGGTGGCATGTCGGATGTTTCTGGGAGGGGAAATTTGGG 2528
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2409 CTCCAAAACTTGTATCATTAATGGTGGCATGTCGGATGTTTCTGGGAGGGGAAATTTCGG 2468
Query 2529 TATTGAAACTCCTTGCTTTTCAGCTGACGGAGATAACAACGTTCCTCCTAACGAGAAAGT 2588
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||
Sbjct 2469 TATTGAAACTCCTTGTTTTTCAGCTGACAGAGATAACAACGGTCCTCCTAGCGAAAAAGT 2528
Query 2589 GGTAGATTTGCAGGAAGATGTGCCTGCAGAGAGCTCCTCTGGGATGGGCGAGCGGAGCAA 2648
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||
Sbjct 2529 GGTAGATTTGCAGGAAGATGTGCCTGCCGAGAGCTCCTCTGGGATGGACAAGCAGAGCAA 2588
Query 2649 TGACTCAGATCTTCAAATGCATCCTTTATTGTTCCGGACCCCTGAGCATGGACAGATTAC 2708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2589 TGACTCAGATCTTCAAATGCATCCTTTATTGTTCCGGACCCCTGAGCATGGACAGATTAC 2648
Query 2709 ATGTTACCCTGCAAGCAGAGACCCAGGGGGTTCTAGTTTTAGTTTCTTTCCTGACAATCG 2768
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 2649 ATGTTACCCTGCAAACAGAGACCCAGGGGGTTCTAGTTTTAGTTTCTTTTCTGAAAATCG 2708
Query 2769 ACCTCAACTGCTTAGTCTTTTCAACAGTCCAAAGCAAATCAATCACTCAGCTGATCAATT 2828
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2709 ACCTCAGCTGCTAAGTCTTTTCAACAGTCCAAAGCAAATCAATCACTCAGCTGATCAATT 2768
Query 2829 GCACAAAAATTCATCATCAAACGAACATGAGACAGCACAGGGCGACAGCTGTTTTCATCC 2888
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2769 GCACAGAAATTCATCATCAAACGAATATGAGACAGCACAGGGCGACATCTGTTTTCATCC 2828
Query 2889 TCTTCTTCAAAGAACTGAGCATGAAACGAGTTATCTTATTAGTAGACGTGGGAACTTAGA 2948
||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2829 TCTTCTTCAAAGAACCGAGTATGAAACGAGTTATGTTATTAGTAGACGTGGGAACTTAGA 2888
Query 2949 CCCAGGCATTGGTAAGAAAGACAAATTATGTCAACTTCAGGATTCTTCTTGTGCTGTTGA 3008
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 2889 CCCAGATATTGGTAAGAAAGACAAATTATGTCAACTTCAGGATACTTCTGGTGCTGTTGA 2948
Query 3009 GAAGACTTTGATCCCTG-----G-TCGTAATGATGTCAGTTTGAAACCTTTTAGTTCTAG 3062
||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 2949 GAAGACTGCGATCCCTGTTACTGGTCGTAATGATGTCAGCTTGGAACCTTTTAGTTCTAG 3008
Query 3063 CAAACATAGTAAAAATGTGAACTTAGATATCTATCTAAGTTCGAGCTCTTCTAAGGTAAA 3122
|| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 3009 CACACCTGGTAAAAATGTGAACTTAGATATCTATCTAAGTACAAGCTCTTCTAAGGTAAA 3068
Query 3123 CAATTGTGGTAGGGTCTCAGCAGCAAATATTTCAGAAGCTCCAGACATCTGCATGACTCA 3182
||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3069 TAATGGTGGTAGTGTCTCAGCAGCAAATATTTCAGAAGCTCCAGACATCTGCATGGCTCA 3128
Query 3183 A-TGTAATGATGGCTCTGAAGTGCCTGGATCAACTGCACCAAGTGATACTATAAGTAGAT 3241
| | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 3129 ACT-TAATGATGGCTCTGAAGTACCTGGATCAGCTCCACCAAGTGATAATATTAGTAGAT 3187
Query 3242 GCATTGACGAGATGGCTGATCAATCGAATCTAGGTATTGTGATGGAGCAGGAGGAATTAA 3301
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3188 GCATTGAAGAGATGGCTGATCAATCTAATCTAGGTATAGTGATGGAGCAGGAGGAATTAA 3247
Query 3302 GTGACTCTGACGAAGAGATGATGGAAGAAGAACATGTTGAGTTTGAGTGTGAAGAGATGG 3361
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3248 GTGACTCTGACGATGAGATGATGGAAGAAGAACATGTTGAGTTTGAGTGTGAAGAGATGG 3307
Query 3362 CTGATTCTGAAGGAGAAGAAGGCTCAGAATGCGAAGAAA-CAATTGAAATGCAAGATAAG 3420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 3308 CTGATTCTGAAGGAGAAGAAGGCTCAGAATGCGAAGAAAACA-TTGAAATGCAAGATAAG 3366
Query 3421 GATAACAGAAGCTCTGTGGTAGAAATAGCTTCAACAGATGTAGATTCTGGCAAAGAACTA 3480
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3367 GATAACAGAAACTCTGTGGTAGAAATAACTTCAACAGATGTCGATTCTGGCAAAGAACTA 3426
Query 3481 GGCAAGGATTCTCCAAACAGTCCTTGGTTGAGTCTGGATCCGAGTAGCCGTCGCTTAAGC 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3427 GGCAAGGATTCTCCAAACAGTCCTTGGTTGAGTCTGGATCCGAGTAGCCGTCGCTTAAGC 3486
Query 3541 AGTAATGTTAAGGACATAGAGAAGATAGAGGTAGA-AAATGAAACGACTATGTCACAATT 3599
|||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| || ||||| ||
Sbjct 3487 AGTAATGTTAAGGACAGAGAGAAGATAGAGGCA-ACAAATGAAACGACCATCTCACAGTT 3545
Query 3600 TGGTCCTAGTAGATCACGCTAAAAAGGGACACCAGTGAAGAGCAGAGATGCAGAATTAAA 3659
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3546 TGGTCCTAGTAGATCACGCAAAAAAGGGACACCAGTGAAGAGCAGAGATGCAGAATCAAA 3605
Query 3660 GGAAGAAGCAGGTGTTGCTCGGTTGAGACTGGGTCCTGTCGCCCTCCCTCCAATGAAGAA 3719
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 3606 GGAAGAAGCAGGAGTTGCTCGGTTGAGACTGGGTCCTCTCGCCCTCCCCCCAATGAAGAA 3665
Query 3720 ACCCAGGATTTGTGGTGGGCAGGTGGAAACAAGTCCAAGTACTGAGACAACCTGA 3774
|||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3666 ACCCAGAAAATGTGGTGGGCAGGCGGAAACAAGTCCAAGTATTGAGACAACCTGA 3720
Score = 453 bits (245), Expect = 6e-126
Identities = 303/328 (92%), Gaps = 16/328 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAAATCGT-TGGATCAAATAGAAACCCTAATTCCAGGGCCTCCCTCTGAACCGTC-TT 58
|||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1 ATGAAATC-TCTGGATCAAGTAGAAACCCTAATTTCAGGGCCTCCCTCTGAACCGTCGTC 59
Query 59 CCCTCAATAGAGACCTAGATGAAGA-G--GAAGAGGAAGAAGAGTGCGAGTATGATGACG 115
|||| ||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 CCCT-AATAGAGACCTAGATAAAGATGAAGAAGAAGAAGAAGAGTGCGAGTATGATGACG 118
Query 116 AGGAAGAAGATGTTGATTTCAATCCTTTTCTTAAGGATTCTCCTTCTCGTGAAGCTTCTT 175
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119 AGGAAGAAGATGTTGATTTCAATCCCTTTCTTAAGGATTCTCCTTCTCGTGAAGCTTCTT 178
Query 176 CCAGTTTGAGCTCTGAAGTTGAGACTCTTGATGGTGAAATTGTTAATAGCATTACT--G- 232
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 179 CCAGTTTGAGCTCTGAAGTTGAGACTCTTGATGGTGAAATTGTTAATAGCATTACTACGG 238
Query 233 TTCCTCAAACCTTAGAGGGCAGAGAAGGAAAGGAGGAAATTGCAATGCCAAGTAATG-T- 290
|||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 239 TTCCCCAAACCTTAGAGGGCAGACAAGGAAAGGAGGATATTGCAATGCCAAGTAATGATG 298
Query 291 -CTCGTGCCAAGAACCA--A-TCCCTGA 314
|||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 299 TCTCGTGCCAAGAACCACCAATCCCTGA 326
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 187975535421
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5