BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg339169
Length=4044
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G69350.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like s... 3530 0.0
AT1G69340.1 | Symbols: | appr-1-p processing enzyme family pro... 2804 0.0
> AT1G69350.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like
superfamily protein | chr1:26069882-26072245 FORWARD LENGTH=2364
Length=2364
Score = 3530 bits (1911), Expect = 0.0
Identities = 2209/2354 (94%), Gaps = 16/2354 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1675 ATGACGCAGTACATGCCATTGTTTAGATCATGTTCGAGCTTACGATTAGTAAGTCAGCTT 1734
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACGCAGTACATGCCATTGTTTAGATCATGCTCGAGCTTACGATTAGTAAGTCAGCTT 60
Query 1735 CATGCTCACCTCCTCGTCACCGGCCGTCTCCGTCGTGATCCTCTTCCTGTGACGAAGCTC 1794
||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 61 CATGCTCACCTACTTGTCACCGGTCGTCTCCGTCGTGACCCTCTTCCAGTGACGAAGCTC 120
Query 1795 ATTGAATCATACGCTTTCATGGGTTCTCCAGATTCGTCTAGGCTCGTCTTTGAAGCTTTT 1854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ATTGAATCATACGCTTTCATGGGTTCTCCAGATTCGTCTAGGCTCGTCTTTGAAGCTTTT 180
Query 1855 CCTTACCCTGATTCCTTCATGTACGGTGTTCTCATCAAATGCAACGTCTGGTGTCATTTA 1914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CCTTACCCTGATTCCTTCATGTACGGTGTTCTCATCAAATGCAACGTCTGGTGTCATTTA 240
Query 1915 CTCGACGCTGCCATTGATCTGTACCATAGGTTGGTTTCGGAGAAGACCCAGATCAGTAAG 1974
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 241 CTCGACGCCGCCATTGATCTGTACCATAGGTTGGTTTCGGAGACGACCCAAATCAGTAAG 300
Query 1975 TTTGTGTTTCCGTCTGTTTTAAGGGCTTGTGCGGGTTCGAGGGAGCATCTGAGTGTTGGT 2034
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TTTGTGTTTCCGTCTGTTTTGAGGGCTTGTGCGGGTTCGAGGGAGCATCTGAGTGTTGGT 360
Query 2035 AGGAAAGTCCATGGGAGGATTATTAAGAGCGGTGTAGACGACGACGCTGTGATAGAGACG 2094
|||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GGGAAAGTCCATGGGAGAATTATCAAGGGCGGTGTAGACGACGACGCTGTGATAGAGACG 420
Query 2095 TCTCTGTTGTGTATGTATGGTCAAACGGGGAATTTAAGTGATGCAGAGAAGGTGTTCGAT 2154
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TCTCTGTTGTGTATGTATGGTCAAACTGGGAATTTAAGTGATGCAGAGAAGGTGTTCGAT 480
Query 2155 GGAATGCCTGTGAGAGATCTTGTGGCTTGGAGTACTCTTGTTTCTAGCTGTCTCGAGAAT 2214
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GGAATGCCTGTGAGAGACCTTGTGGCTTGGAGTACTCTTGTTTCTAGCTGTCTCGAGAAT 540
Query 2215 GGTGAGGTGTTGAAAGCATTGCGGATGTTTAAGTGTATGGTGGATGATGGTGTTGAGCCC 2274
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GGTGAGGTGGTGAAAGCATTGAGGATGTTTAAGTGTATGGTGGATGATGGTGTTGAGCCC 600
Query 2275 GATGCTGTGACGATGATCAGCATTGTAGAAGGATGTGCTGAGCTTGGATGTTTGAGGATT 2334
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GATGCTGTGACGATGATCAGCGTTGTAGAAGGATGTGCTGAGCTTGGATGTTTGAGGATC 660
Query 2335 GCTAGGTCAGTCCATGGACAGATAACGAGGAAAATGTTTGATTTTGATGAAACACTGTGT 2394
||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||
Sbjct 661 GCTAGATCAGTTCATGGCCAGATAACGAGGAAAATGTTTGATTTAGATGAAACATTATGC 720
Query 2395 AATTCTTTGCTTACAATGTACAGTAAGTGTGGGGATTTGCTTAGCTCGGAGAAAATCTTT 2454
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 721 AATTCTCTGCTTACAATGTACAGTAAGTGTGGGGATTTGCTTAGCTCGGAGAGAATCTTT 780
Query 2455 GAGAAGATCGCCAAGAAGAACGCTGTTTCGTGGACAGCTATGATTTCTAGTTACAATCGT 2514
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 781 GAGAAGATCGCCAAGAAGAATGCTGTTTCGTGGACAGCCATGATTTCTAGTTACAACCGT 840
Query 2515 GGCGAGTTCTCTGAAAAGGCATTGAGAAGTTTCAGTGAGATGTTAAAATCTGGAATTGAG 2574
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 841 GGCGAGTTCTCTGAAAAGGCATTGAGAAGTTTCAGTGAGATGATAAAGTCTGGAATTGAG 900
Query 2575 CCGAATTTGGTTACGCTTTATAGCATTTTGAGCTCTTGTGGATTGA-ACGGGTTGATTAG 2633
|| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||
Sbjct 901 CCTAATTTGGTTACCCTTTATAGTGTTTTGAGCTCTTGTGGTTTGATA-GGGTTGATTAG 959
Query 2634 AGAAGGCAAGTCGGTCCATGGTTTTGCAATTAGACGAGAGCTGGATCCGAACTACGAGTC 2693
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 960 AGAAGGTAAGTCGGTCCATGGTTTTGCAGTTAGACGAGAGCTGGATCCGAATTACGAGTC 1019
Query 2694 GCTTTCTCCGGCCTTAGTTGAGCTGTACGCTGAATGCGGGAGACTCAGTGACTGTGAGAC 2753
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||
Sbjct 1020 GCTTTCTCTGGCCTTAGTTGAGCTGTACGCTGAATGCGGGAAACTAAGCGACTGTGAGAC 1079
Query 2754 AATTCTACATGTGGTTGGTGATAGAAATATTGT-GTTATGGAACTCTCATATATCTCTAT 2812
| || ||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1080 AGTTTTACGTGTGGTTAGTGATAGAAATATTGTCGC-ATGGAACTCTCTTATATCTCTAT 1138
Query 2813 ATGCACACAGAGGTATGGTGATTGAGGCATTGTACTTGTTTAGACAGATGGTGACATGGC 2872
||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1139 ATGCACACAGAGGTATGGTGATTCAAGCATTGGGCTTGTTTAGACAGATGGTGACACAGA 1198
Query 2873 GAATAAAACCGGACTCATTCACTTTGGCAAGCAT-AATCTCTGCATGCGAGAATACTGGT 2931
|||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 1199 GAATAAAACCAGACGCATTCACTTTGGCCAGC-TCAATCTCAGCATGCGAGAATGCTGGT 1257
Query 2932 TTAGT-CCGGCTAGGGAAACAGATTCACGGACATGTTATAAGGACGGATGTTTCGGATGA 2990
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 1258 TTAGTTCCG-CTAGGGAAACAGATTCACGGACATGTTATAAGGACAGATGTTTCAGATGA 1316
Query 2991 GTTTGTGCAAAACTCGGTGATAGACATGTATTCTAAAAGCGGATTTGTAAATTTAGCATG 3050
||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| |
Sbjct 1317 GTTTGTGCAGAACTCGTTGATAGACATGTACTCTAAAAGCGGATCTGTGGATTCAGCAAG 1376
Query 3051 CACAGTGTTTGATCAAATCAAGCATAGGAGCATTGTGACATGGAACTCAATGCTCTGCGG 3110
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377 CACAGTGTTTAATCAAATCAAGCATAGGAGCGTTGTGACATGGAACTCAATGCTCTGCGG 1436
Query 3111 GTTTTCTCAGAATGGTAACTCCT-TAGAGGCGATTAATCTCTTCGACTATTTGTATCATA 3169
||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 1437 GTTTTCTCAGAATGGTAACTC-TGTAGAGGCAATTAGCCTCTTCGACTATATGTATCATA 1495
Query 3170 GCTGCCTCGAGATAAATGAGGTTACATTTTTGGCGGTTATTCAAGCGTGCTCAAGCATAG 3229
||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1496 GCTATCTCGAGATGAATGAAGTTACATTTTTGGCGGTTATTCAAGCATGCTCAAGCATAG 1555
Query 3230 GTTCACTGGAGAAAGGGAGATGGGTTCATCACAAGCTCATCGTTTGCGGTATAAAGGATC 3289
|||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||
Sbjct 1556 GTTCACTGGAGAAAGGGAAATGGGTTCACCACAAGCTCATTATTTCCGGTTTAAAGGATC 1615
Query 3290 TTTTTACTGATACAGCTCTAATCGACATGTATGCCAAATGTGGAGATCTCAACACAGCGG 3349
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 1616 TTTTCACTGATACAGCTCTAATCGACATGTATGCCAAATGTGGAGATCTCAACGCAGCTG 1675
Query 3350 AAACCGTCTTCAGGGCCATGTCGAATAGGAGCATTGTGTCATGGAGTAGTATGATAAACG 3409
|||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 1676 AAACAGTCTTCAGGGCCATGTCGAGTAGAAGCATTGTGTCATGGAGTAGTATGATCAATG 1735
Query 3410 CGTATGGAATGCACGGACGGATAGGATCCACCATATCTACATTCAATCAAATGGTGGAAT 3469
| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736 CCTATGGAATGCACGGACGGATAGGATCCGCCATATCTACATTCAATCAAATGGTGGAAT 1795
Query 3470 CCGGAACCAAACCTAACGAGGTTGTCTTCATGAACGTTCTCTCTGCTTGTGGTCACTCTG 3529
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796 CCGGAACGAAACCTAACGAAGTTGTCTTCATGAACGTTCTCTCTGCTTGTGGTCACTCTG 1855
Query 3530 GTTCCGTTGAAGAAGGCAAGTACTACTTTAACTTGATGAAAT-TATTTGGCGTATCACCA 3588
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 1856 GTTCCGTTGAAGAAGGTAAGTACTACTTTAACTTGATGAAAAGT-TTTGGCGTATCACCA 1914
Query 3589 AACTCGGAGCATTTCGCCTGTTTCATCGACCTTTTGAGCCGTTCTGGTGATCTCAAAGAA 3648
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915 AACTCAGAGCATTTCGCCTGTTTCATCGACCTTTTGAGCCGTTCTGGTGATCTCAAAGAA 1974
Query 3649 GCATATAGAACCATCAAGGAGATGCCTTTCCTAGCTGATGCTTCCGTTTGGGGTTCTCTG 3708
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1975 GCATATAGAACCATCAAGGAGATGCCTTTTCTAGCTGATGCTTCAGTTTGGGGTTCTCTG 2034
Query 3709 GTCAATGGATGCAGAATCCATCAGAAAATGGATATCATCAAAGCCATTAAAAATGA-CAT 3767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
Sbjct 2035 GTCAATGGATGCAGAATCCATCAGAAAATGGATATCATCAAAGCCATTAAAAACGATC-T 2093
Query 3768 TTCGGATATTGTTACCGACGATACGGGATACTACACTCTTTTGTCCAATATATATGCTGA 3827
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2094 TTCGGATATTGTTACAGATGATACGGGATACTACACTCTCTTGTCCAATATATATGCTGA 2153
Query 3828 AGAAGGGGAATGGGAAGAATTCAGGAGAATGAGATCGGCTATGAAGAGTTTGAATCTCAA 3887
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 2154 AGAAGGGGAATGGGAAGAATTCAGGAGACTGAGATCAGCTATGAAGAGTTCGAATCTTAA 2213
Query 3888 GAAAGTTCCTGGGTACAGCGCGATTGAGATTGATAAAAAAGTTTTCAGATTTGGAGCTGG 3947
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214 GAAAGTTCCTGGGTACAGCGCGATTGAGATTGATCAAAAAGTTTTCAGATTTGGAGCTGG 2273
Query 3948 GGAAGAAAC-CTGTTTCCAAACAGAAGATATCTACATGTTTCTTGGGAATTTACAGAATC 4006
||||||| | || |||||||||| || ||||| | ||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 2274 TGAAGAAAATC-GTATCCAAACAGATGAAATCTATAGGTTTCTTGGAAATTTGCAGAATC 2332
Query 4007 TAACTCTTGAAGAA 4020
|||| |||||||
Sbjct 2333 TAACGAATGAAGAA 2346
> AT1G69340.1 | Symbols: | appr-1-p processing enzyme family protein
| chr1:26065724-26069821 FORWARD LENGTH=2101
Length=2101
Score = 2804 bits (1518), Expect = 0.0
Identities = 1619/1669 (97%), Gaps = 2/1669 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTATCAAG-CCATTCCCACGGCGGCAACCATTCGTGGTGGAACTCCAACAGAGAGTGG 59
||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 ATGTATC-AGACAATTCCCACGGCACCAACCATTCGTGGTGGAACTCCAACAGAGAGTGG 297
Query 60 TGATTACGTTGTTACTTTGGATCAGATTCCACGGTGGAGTGATGTTGAGCAGAGGTCATC 119
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 298 TGATTACGTTGTGACTTTGGATCAGATTCCACGGTGGAGTGATGTTGAGCAGAGATCATC 357
Query 120 TTTGGAGGGTGAAACAGGAGATCCTGCACATTCGAATCCACGGTATGCAAACCCTTTGGC 179
|||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||
Sbjct 358 TTTGGAGGATGAGACAGGAGATCCAGAACATTCGAATCCGCGCTACGCAAACCCTTTGGC 417
Query 180 TTCGTCTTCTGAAGCAGGGAGCAGCGGGAATGGGATGGTATCTAAGTTTCCTGTTGACCA 239
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 418 TTCGTCTTCCGAAGCAGGGAGCAGCGGGAATGGGATGGTATCTAAGTTTCCTGTTGATCA 477
Query 240 CGAGATAAACTCTAGAATATACCTGTGGAGAGGGGAACCTTGGAACCTTGAGGTTGATGC 299
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478 CGAGATAAACTCTAGAATATACCTTTGGAGAGGGGAACCTTGGAACCTTGAGGTTGATGC 537
Query 300 TGTTGTGAATTCGACAAATGAGAACTTGGATGAGGCACATAGCAGTCCTGGTCTACATGT 359
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 TGTTGTAAATTCGACAAATGAGAACTTGGATGAGGCACATAGCAGTCCTGGTCTACATGT 597
Query 360 GGCTGCTGGACCTGGCCTTGCAGAGCAATGTGCTACATTGGGTGGATGCAGGACAGGGAT 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 GGCTGCTGGACCTGGCCTTGCAGAGCAATGTGCTACATTGGGTGGATGCAGGACAGGGAT 657
Query 420 GGCAAAAGTAACAAATGCCTATGATCTACCAGCGAGGCGGGTTATCCACACAGTAGGACC 479
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 658 GGCGAAAGTAACAAATGCCTATGATCTACCAGCGAGGAGGGTTATCCATACAGTAGGACC 717
Query 480 CAAGTATGCAGTAAAGTATCATACAGCTGCTGAGAATGCTCTAAGTCACTGCTATAGATC 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 CAAGTATGCAGTAAAGTATCATACAGCTGCTGAGAATGCTCTAAGTCACTGCTATAGATC 777
Query 540 TTGTCTGGAGCTTCTCATAGACAGTGGCCTTCAAAGTATCGCTATGGGCTGTATATACAC 599
||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 778 TTGTCTGGAACTTCTCATAGATAGTGGGCTACAAAGTATCGCTCTGGGCTGTATATACAC 837
Query 600 AGAAGCCAAAAACTATCCCCGAGAACCAGCTGCTCATGTTGCCATAAGAACTGTTCGCCG 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 AGAAGCCAAAAACTATCCCCGAGAACCAGCTGCTCATGTTGCCATAAGAACTGTTCGCCG 897
Query 660 CTTTCTAGAAAAGCAAAAGGATAAAATCAGTGCCGTTGTTTTCTGTACCACCACATCCTC 719
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 CTTTCTAGAGAAGCAAAAGGATAAAATCAGTGCCGTTGTTTTCTGTACCACCACATCCTC 957
Query 720 TGATACAGAGATATACAAACGATTACTTCCACTTTACTTTCCTCGAGATGAACATGAGGA 779
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 TGATACGGAGATATACAAACGATTACTTCCACTTTACTTTCCTCGAGATGAACATGAGGA 1017
Query 780 AGAGGTTGCCATCTCAAAGCTTCCAGCTGATGTTGGAGATGAAAATGGTGAGACGGTTAT 839
|||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 AGAGGTTGCCATATCAAAGCTCCCGGCTGATGTTGGAGATGAAAATGGTGAGACGGTTAT 1077
Query 840 AGACGAACGTAAAATCAGAATACAGGCGCTGCCAAATAAACCTTCACCCAGATCTTTTCC 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1078 AGACGAACGTAAAATCAGAATACAGGCGCTGCCAAATAAACCTCCACCCAGATCTTTTCC 1137
Query 900 AACTCCACTCGAGCGCCCTTCTACTGATCTTACTTTGTTACGCAGGAACTCGAATCATCT 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 AACTCCACTCGAGCGCCCTTCTACTGATCTTACTTTGTTACGCAGGAACTCGAATCATCT 1197
Query 960 TGATTCGTATCTGGATCCTGCCTTCATGTCCTTGATTAAGGATCCAGATGAAAGGCGCAA 1019
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 TGATTCGTATTTGGATCCTGCCTTCATGTCCTTGATTAAGGATCCAGATGAAAGGCGCAA 1257
Query 1020 AGAACAATGGGAGAAGACTGCACAAGCACAAAGTGGATTCAATTTTGTTAAATTGCTAGG 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 AGAACAATGGGAGAAGACTGCACAAGCACAAAGTGGATTCAATTTTGTTAAATTGCTAGG 1317
Query 1080 ATTTGGTGATCTAGGAGGACCCCCTCTCTCTGCTGCAGAGGAATACTCACTTCATTCGCG 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 ATTTGGTGATCTAGGAGGACCCCCTCTCTCTGCTGCAGAGGAATACTCACTTCATTCGCG 1377
Query 1140 ATACCTAGCGAAAGCTAATTCTCTCAACCTTTCCGAGATTGCAGAGATGAAAATTGTCTA 1199
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1378 ATACCTAGCGAAAGCTAATTCAATCAACCTTTCCGAGATTGCAGAGATGAAAATTGTCTA 1437
Query 1200 CCGTGGTGGTGTTGACACCGAGGGTCATCCTGTAATGGTTGTTGTAGGAGCTCACTTTTT 1259
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 TCGTGGTGGTGTTGACACCGAGGGTCATCCTGTAATGGTTGTTGTAGGAGCTCACTTTTT 1497
Query 1260 GCTGCGTTGTCTTGATCTGGAGCGTTTTGTGCTTTATGTTATAAAGGAATTTGAACCTGT 1319
|||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1498 GCTGCGATGTCTTGATCTGGAGCGTTTTGTACTTTATGTTATTAAGGAATTTGAACCTGT 1557
Query 1320 GATACAAAAGCCTTACTCGATTGTCTATTTTCATTCTGCAGCATCTTTACAAGTCCAACC 1379
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1558 GATACAAAAGCCTTATTCGATTGTCTACTTTCATTCTGCAGCATCGTTACAAGTCCAACC 1617
Query 1380 AGATTTGGGATGGATGAAAAGATTACAACAGATACTTGGTCGAAAACACCAGCGTAACCT 1439
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 AGATTTGGGATGGATGAAAAGATTAGAACAGATACTTGGTCGAAAACACCAGCGTAACCT 1677
Query 1440 TCAGGCAATCTATGTTCTTCATCCAACTTTTCACTTGAAGGCTACAATTTTAACTATGCA 1499
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1678 TCAGGCAATCTATGTTCTTCATCCAACTTTCCACTTGAAGGCTACAATCTTAACGATGCA 1737
Query 1500 ATTCTTCGTGGATAATGTGGTTTGGAAGAAAGTTGTATATGCAGACCGACTTCTGCAGCT 1559
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1738 ATTTTTCGTGGATAATGTGGTATGGAAGAAAGTTGTATATGCAGACCGACTTCTGCAGCT 1797
Query 1560 GTTCAAATATGTTCCTCGTGAGCAGCTGACAATCCCAGACTTTGTTTTCCAGCATGATCT 1619
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1798 GTTCAAATACGTTCCTCGTGAGCAGCTGACAATCCCAGACTTTGTTTTCCAGCATGATCT 1857
Query 1620 TGAAGTTAACGGAGGAAAAGGTCTAATCGTTGATCCAAGAACAAAATAC 1668
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1858 TGAAGTTAACGGAGGAAAAGGTCTAATCGTTGACCCAAGAACAAAATAC 1906
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 201520610031
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5