BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg340908
Length=5616
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G07160.1 | Symbols: ATGSL10, gsl10, CALS9 | glucan synthase-... 8495 0.0
> AT3G07160.1 | Symbols: ATGSL10, gsl10, CALS9 | glucan synthase-like
10 | chr3:2264945-2279383 REVERSE LENGTH=5870
Length=5870
Score = 8495 bits (4600), Expect = 0.0
Identities = 4937/5100 (97%), Gaps = 22/5100 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTCTCGAGCTGAGTCATCGTGGGAGAGGCTAGTGAGTGCTGCTTTACGGAGAGATAGA 60
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTCGAGCTGAGTCATCTTGGGAGAGGCTGGTGAATGCTGCTTTACGGAGAGATAGA 60
Query 61 ACAGGAGGAGTTGCTGGTGGTAACCAAAGCAGTATTGTTGGCTATGTCCCTTCGTCACTA 120
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 61 ACAGGAGGAGTTGCTGGTGGTAATCAAAGCAGTATTGTTGGTTATGTCCCTTCCTCACTA 120
Query 121 TCGAACAATAGGGACATAGATGCCATTCTCAGAGCTGCAGATGAGATCCAGGATGAGGAT 180
|| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 121 TCCAACAATAGGGACATCGATGCAATTCTTAGAGCTGCCGATGAGATTCAGGATGAGGAT 180
Query 181 CCAAACATTGCAAGGATCTTATGTGAGCATGGTTACTCACTTGCACAAAATCTCGATCCT 240
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CCCAACATTGCAAGAATCTTATGTGAGCATGGTTACTCACTTGCACAAAATCTCGATCCT 240
Query 241 AATAGTGAAGGCAGAGGTGTTTTACAGTTCAAAACTGGATTGATGTCTGTTATTAAGCAA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AATAGTGAAGGCAGAGGTGTTTTACAGTTCAAAACTGGATTGATGTCTGTTATTAAGCAA 300
Query 301 AAATTAGCAAAAAGAGAGGTTGGGAACATAGACAGAAGTCAGGATATTCTCCGACTACAA 360
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 301 AAATTAGCAAAAAGAGAGGTTGGGACCATAGACAGAAGTCAGGATATTCTTCGACTACAA 360
Query 361 GAATTTTACAGGCTATACAGAGAAAAGAACAATGTTGACACGTTGAAGGAGGAGGA-AAA 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 361 GAATTTTACAGGCTATACAGAGAAAAGAACAATGTTGACACGTTGAAGGAGGAAGAGAAA 420
Query 420 GCAGCTCCGTGAGTCGGGGGCTTTCACTGACGAGCTGGAACGGAAAACAGTAAAAAGGAA 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 -CAGCTCCGTGAGTCGGGGGCTTTCACTGACGAGCTGGAACGGAAAACAGTAAAAAGGAA 479
Query 480 AAGAGTTTTTGCCACCCTGAAAGTTCTGGGAAGTGTGTTGGAGCAATTGTCAAAAGAGAT 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 480 AAGAGTTTTTGCCACCCTGAAAGTTCTGGGAAGTGTGTTGGAGCAGTTGGCAAAAGAGAT 539
Query 540 TCCTGAAGAGCTGAAGCATGTTATTGATTCAGATGCTGCAATGAGTGAAGACACAATTGC 599
|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 TCCTGAAGAGCTTAAGCATGTTATTGATTCAGACGCTGCAATGAGTGAAGACACAATTGC 599
Query 600 TTATAACATAATTCCTCTTGATGCTCCTGTCACGACAAATGCCACTACGACTTTCCCTGA 659
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 600 TTATAACATTATTCCTCTTGATGCTCCTGTCACGACAAATGCCACTACAACTTTCCCTGA 659
Query 660 GGTTCAAGCTGCAGTTGCAGCATTGAAGTATTTTCCAGGCTTGCCTAAATTGCCTGCTGA 719
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 660 GGTTCAAGCGGCAGTTGCAGCATTGAAGTATTTTCCAGGCTTGCCTAAATTGCCTCCTGA 719
Query 720 TTTCCCCATTCCCGTTACAAGGATTGCTGATATGCTTGATTTTCTCCACTATATATTTGG 779
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 720 TTTCCCCATTCCCGCTACAAGGACTGCTGATATGCTTGATTTTCTCCACTATATTTTTGG 779
Query 780 GTTTCAGAAAGACAGTGTCTCGAATCAGCGTGAACATATAGTTCTTCTTCTGGCTAATGA 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 GTTTCAGAAAGACAGTGTCTCGAATCAGCGTGAACATATAGTTCTTCTTCTGGCTAATGA 839
Query 840 GCAATCCCGTCTTAATATTCCAGAAGAAACAGAACCTAAACTGGATGACGCTGCAGTGCA 899
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 GCAATCCCGTCTTAATATTCCAGAAGAAACAGAACCTAAACTGGATGACGCTGCAGTGCG 899
Query 900 TAAGGTGTTCTTAAAGTCCCTGGAAAACTACATCAAGTGGTGTGATTACCTCTGTATTCA 959
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 900 TAAGGTGTTCTTGAAGTCCCTGGAAAACTACATCAAGTGGTGTGATTACCTTTGTATTCA 959
Query 960 ACCTGCGTGGAGCAATTTAGAAGCCATCAGTGGAGAGAAGAAACTGCTATTCCTCTCTTT 1019
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 ACCTGCGTGGAGCAATTTAGAAGCCATCAATGGAGATAAGAAACTGCTATTCCTCTCTTT 1019
Query 1020 GTACTTCCTGATTTGGGGAGAAGCTGCCAACATACGGTTTCTTCCAGAATGTTTGTGCTA 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GTACTTCCTGATTTGGGGAGAAGCTGCCAACATACGGTTTCTTCCAGAATGTTTGTGCTA 1079
Query 1080 CATATTCCACCATATGGTTAGAGAAATGGATGAGATCCTACGCCAGCAGGTTGCTCGCCC 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 CATATTCCACCATATGGTTAGAGAAATGGATGAGATCTTACGCCAGCAGGTTGCTCGCCC 1139
Query 1140 AGCTGAGAGTTGTATGCCAGCCGATAGTCGTGGCTCTGATGATGGTGTATCATTCCTTGA 1199
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 AGCTGAGAGTTGTATGCCAGTCGATAGTCGTGGCTCTGATGATGGTGTATCATTCCTTGA 1199
Query 1200 TCATGTCATTGCTCCGCTGTATGGAGTGGTTTCAGCGGAAGCTTTTAACAATGACAATGG 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 TCATGTCATTGCTCCGCTGTATGGAGTGGTTTCAGCGGAAGCTTTTAACAATGACAATGG 1259
Query 1260 CCGAGCACCTCATTCAGCTTGGAGAAACTATGATGATTTCAATGAATATTTTTGGTCACT 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1260 CCGAGCACCTCATTCAGCTTGGAGAAACTATGATGATTTCAATGAATATTTTTGGTCTCT 1319
Query 1320 TCATTCCTTTGAGCTTGGTTGGCCGTGGCGTACCAGTTCATCTTTCTTTCAGAAACCTAT 1379
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1320 TCACTCCTTTGAGCTTGGTTGGCCGTGGCGTACCAGTTCATCTTTTTTTCAGAAACCTAT 1379
Query 1380 ACCGAGAAAAAAGTATGAGCTTAAAACCGGCAGGGCAAAACATCGAGGAAAAACTTCCTT 1439
||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 ACCGAGAAAAAAGC-T---C--AAAACCGGCAGGGCAAAACATCGAGGAAAAACTTCCTT 1433
Query 1440 TGTTGAGCACCGGACATTTTTGCATCTCTACCACAGTTTCCATCGGTTATGGATATTTCT 1499
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1434 TGTTGAGCACCGGACATTTTTGCATCTGTACCACAGTTTCCATCGGTTATGGATATTTCT 1493
Query 1500 TGCTATGATGTTTCAGGCATTAGCCATAATTGCGTTCAATAAAGATGACCTTACGTCCAC 1559
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1494 TGCTATGATGTTTCAGGCATTAGCCATAATTGCGTTCAATAAAGATGACCTTACTTCCAG 1553
Query 1560 AAAGACTTTACGTGAAATTCTCAGCCTGGGTCCGACTTTTGTAGTGATGAAGTTTTCTGA 1619
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 AAAGACTTTACTTCAAATTCTCAGCCTGGGTCCGACTTTTGTAGTGATGAAGTTTTCTGA 1613
Query 1620 GAGTGTTCTGGATGTTATCATGATGTATGGTGCCTATTCTACAACAAGACGTCTGGCTGT 1679
||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614 GAGTGTTTTGGAAGTTATCATGATGTACGGTGCCTATTCTACAACAAGACGTCTGGCTGT 1673
Query 1680 TTCTCGCATTTTTCTTCGTTTCATTTGGTTTGGCCTTGCTTCCGTCTTCATCTCTTTCCT 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1674 TTCTCGCATTTTTCTTCGTTTCATTTGGTTTGGCCTTGCTTCCGTCTTCATCTCTTTCCT 1733
Query 1740 CTATGTGAAAGCACTTAAAGAACCAAATTCTGACTCACCCATATTTAAGCTTTATTTGAT 1799
|||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||
Sbjct 1734 CTATGTGAAATCACTTAAAGCACCAAATTCTGATTCACCTATAGTTCAGCTTTATTTGAT 1793
Query 1800 CGTCATAGCCATCTATGGTGGTGTTCAGTTCTTCTTTAGTATCCTGATGCGTATCCCAAC 1859
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1794 CGTCATAGCCATCTATGGAGGTGTTCAGTTCTTTTTTAGTATCCTGATGCGTATCCCAAC 1853
Query 1860 TTGTCACAACATTGCTAATAAATGTGATCGGTGGCCCGTTATTCGATTCTTTAAGTGGAT 1919
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 1854 TTGTCACAACATTGCTAATAAATGTGATCGGTGGCCTGTGATTCGATTCTTTAAGTGGAT 1913
Query 1920 GCGCCAGGAGAGACACTATGTTGGGCGTGGCATGTATGAAAGGACATCTGATTTTATAAA 1979
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1914 GCGCCAGGAGAGACACTATGTTGGCCGTGGCATGTATGAAAGGACATCTGATTTTATAAA 1973
Query 1980 GTACTTGCTATTTTGGCTTGTCGTTCTGTCTGCAAAGTTTTCGTTTGCGTACTTTCTTCA 2039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1974 GTACTTGCTATTTTGGCTTGTCGTTCTGTCTGCAAAGTTTTCGTTTGCGTACTTTCTTCA 2033
Query 2040 GATTGAGCCGCTCGTTGGCCCCACAAGGATGATAGTGAAACAGAACAATATTCCGTACTC 2099
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2034 GATTAAGCCGCTCGTTGGCCCCACAAGGATGATAGTGAAACAGAACAATATTCCGTACTC 2093
Query 2100 GTGGCATGATTTTGTGTCAAGAAAAAACTACAATGCGCTGACTGTTGCCAGTTTATGGGC 2159
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2094 CTGGCATGATTTTGTGTCGAGAAAAAACTACAATGCTCTGACTGTTGCCAGTTTATGGGC 2153
Query 2160 TCCTGTGGTAGCTATATACCTGTTAGACATCCATATATTCTACACCATTGTCTCTGCTTT 2219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2154 TCCTGTGGTAGCTATATACCTGTTAGACATCCATATATTCTACACCATTTTCTCTGCTTT 2213
Query 2220 TTTGGGGTTCTTGCTTGGTGCAAGAGATCGTTTGGGGGAGATAAGATCTTTGGAAGCAAT 2279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2214 TTTGGGGTTCTTGCTTGGTGCAAGAGATCGTTTGGGGGAGATAAGATCTTTGGAAGCGAT 2273
Query 2280 TCACAAACTCTTTGAGGAGTTTCCAGGGGCCTTTATGAGGGCTCTTCATGTTCCTCTTAC 2339
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2274 TCATAAACTCTTTGAGGAGTTTCCAGGGGCTTTTATGAGGGCTCTTCATGTTCCTCTTAC 2333
Query 2340 CAATCGGACGTCTGATACTTCTCATCAGGCTGTGGATAAGAA---CAAAGTAGATGCAGC 2396
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2334 CAATCGGACGTCTGATACTTCTCATCAGACTGTGGATAAGAAGAACAAAGTAGATGCAGC 2393
Query 2397 ACACTTTGCTCCTTTTTGGAACCAAATAATTAAAAGTTTACGAGAGGAAGACTACATCAC 2456
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2394 ACACTTTGCTCCATTTTGGAACCAAATAATAAAAAGTTTACGAGAGGAAGACTACATCAC 2453
Query 2457 TGATTTTGAGATGGAGTTGCTCTTGATGCCCAAGAATTCTGGTAGGCTCGAATTGGTTCA 2516
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2454 TGATTTTGAGATGGAATTGCTCCTGATGCCCAAGAATTCTGGTAGGCTCGAATTGGTTCA 2513
Query 2517 ATGGCCACTTTTTCTTCTTTCCAGCAAGATATTATTGGCCAAAGAGATTGCTGCTGAGAG 2576
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2514 GTGGCCACTTTTTCTTCTTTCCAGCAAGATATTATTGGCCAAAGAGATTGCAGCTGAGAG 2573
Query 2577 TAATTCGCAAGAGGAGATTCTGGAGAGAATTGAAAGGGATGAATATATGAAGTATGCTGT 2636
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2574 TAATTCGCAAGAGGAGATTCTGGAGAGGATTGAAAGGGATGACTATATGAAGTATGCTGT 2633
Query 2637 TGAGGAAGTCTATCACACTCTCAAACTTGTCCTAACAGAAACTCTGGAAGCCGAAGGGAG 2696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2634 TGAGGAAGTCTATCACACTCTCAAACTTGTCCTAACAGAAACTCTGGAAGCCGAAGGAAG 2693
Query 2697 GATGTGGGTGGAGAGAATCTTTGATGATATC-AAGGCCAGCTTAAAGGAGAGAAATATAC 2755
| |||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2694 GCTGTGGGTGGAGAGAATCTATGAAGATATCCAAA-CCAGCTTAAAGGAGAGAAATATAC 2752
Query 2756 ATCATGATTTTCAGTTGAACAAGCTCTCCCTTGTTATCACGAGAGTGACTGCATTCTTGG 2815
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2753 ATCATGATTTTCAGTTGAACAAGCTCTCCCTTGTTATCACGAGAGTGACTGCACTCTTGG 2812
Query 2816 GAATCCTGAAAGAAAATGAAACACCGGAGCATGAAAAAGGGGCCATCAAAGCACTTCAGG 2875
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2813 GAATCCTGAAAGAAAATGAAACACCGGAGCATGCAAAAGGGGCTATCAAAGCACTTCAGG 2872
Query 2876 ATCTCTACGATGTTATGCGGCTTGACATATTGACTTTTAATATGAGGGGTCATTATGAAA 2935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2873 ATCTCTACGATGTTATGCGGCTTGACATATTGACTTTTAATATGAGGGGTCATTATGAAA 2932
Query 2936 CGTGGAACCTATTAACTCAAGCCTGGAATGAAGGTCGGCTTTTTACAAAATTGAAATGGC 2995
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2933 CGTGGAACCTGTTAACTCAAGCCTGGAATGAAGGTCGGCTTTTTACAAAGTTGAAATGGC 2992
Query 2996 CTAAAGATCCTGAGATGAAAGCTCTCGTCAAAAGATTGTACTCTTTATTTACTATCAAAG 3055
||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2993 CTAAAGACCCTGAGCTGAAAGCACTCGTCAAAAGATTGTACTCTCTATTTACTATCAAAG 3052
Query 3056 ATTCTGCAGCGCATGTTCCTAGAAATCTTGAGGCCAGACGCAGACTGCAATTCTTCACCA 3115
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 3053 ATTCTGCAGCGCATGTTCCTAGAAATCTTGAGGCCAGACGTAGACTTCAATTCTTCACCA 3112
Query 3116 ATTCTCTTTTCATGGATGTGCCACCACCTAAGTCTGTCCGCAAGATGTTATCCTTCAGTG 3175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3113 ATTCTCTTTTCATGGATGTGCCACCACCTAAGTCTGTCCGCAAGATGTTATCCTTCAGTG 3172
Query 3176 TCTTCACTCCATACTATTCCGAGGTTGTGCTATACAGCATGGCTGAACTCACCAAGAGAA 3235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3173 TCTTCACTCCATACTATTCCGAGGTTGTGCTATACAGCATGGCTGAACTCACCAAGAGAA 3232
Query 3236 ATGAGGATGGAATATCAATCCTGTTTTACCTTCAGAAAATATATCCAGATGAGTGGAAAA 3295
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3233 ATGAGGATGGAATATCAATACTGTTTTATCTTCAGAAAATATATCCAGATGAGTGGAAAA 3292
Query 3296 ATTTTCTTGCACGCATAGGAAGGGATGAAAATGCGTTAGAAGGCGATCTAGATAATGAAA 3355
|||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3293 ATTTTCTTGCACGCATAGGACGAGACGAAAATGCGTTAGAAGGCGATCTAGATAATGAAA 3352
Query 3356 GAGACATACTTGAACTTCGATTTTGGGCCTCTTACCGTGGACAAACGTTAGCTAGAACAG 3415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3353 GAGACATACTTGAACTTCGATTTTGGGCCTCTTACCGTGGACAAACGTTAGCTAGAACAG 3412
Query 3416 TTCGCGGGATGATGTATTATAGGAAAGCCCTCATGCTTCAGTCTTATCTGGAGAGAAAGG 3475
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 3413 TTCGTGGGATGATGTATTATAGGAAAGCCCTCATGCTTCAGTCTTATCTGGAAAGAAAAG 3472
Query 3476 CTGGAAGAGACGATGAGGACGCAACAGACGCTGAAGGCTTTGAGTTATCTCCAGAAGCAA 3535
|||| | | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3473 CTGGCA-A-----TGA---CGCTACAGACGCTGAAGGATTTGAGTTATCTCCAGAAGCAA 3523
Query 3536 GGGCCCAGGCAGATCTGAAGTTTACATATGTCGTCACATGCCAGATATATGGAAGACAGA 3595
||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3524 GGGCCCAAGCAGATCTCAAGTTCACATATGTTGTCACATGCCAGATATATGGAAGACAAA 3583
Query 3596 AAGAAGATCAAAAACCTGAAGCTGTTGACATTGCCTTGCTAATGCAAAGAAATGAAGCCC 3655
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3584 AAGAAGATCAAAAACCTGAAGCTGTTGACATTGCATTGCTAATGCAAAGAAATGAAGCCC 3643
Query 3656 TTCGCATTGCTTATATTGATGTTGTTGATACTCCAAAAGAGGGTAAATCTTATACGGAAT 3715
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3644 TTCGCATTGCTTATATTGATGTTGTTGATAGTCCAAAAGAGGGTAAATCTCATACGGAAT 3703
Query 3716 ATTATTCAAAACTTGTGAAGGCCGACATCAGTGGAAAAGATAAGGAAATTTACTCCATAA 3775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3704 ATTATTCAAAACTTGTGAAGGCCGACATCAGTGGAAAGGATAAGGAAATTTACTCCATAA 3763
Query 3776 AGTTGCCTGGGGACCCAAAACTTGGCGAAGGCAAACCTGAGAATCAAAACCATGCTATTG 3835
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 3764 AGTTGCCTGGGGACCCGAAACTTGGCGAAGGCAAACCTGAGAATCAAAACCACGCCATTG 3823
Query 3836 TGTTTACTCGTGGAAATGCTATCCAAACTATTGATATGAATCAGGATAATTATTTTGAAG 3895
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3824 TGTTTACTCGCGGAAATGCTATCCAAACTATTGATATGAATCAGGATAATTATTTTGAAG 3883
Query 3896 AAGCCTTAAAGATGAGAAATCTTTTGGAGGAATTTGACCGGGACCATGGAATTCGACCAC 3955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3884 AAGCCTTAAAGATGAGAAATCTTTTGGAGGAATTTGACCGGGACCATGGAATTCGACCAC 3943
Query 3956 CTACCATTCTTGGAGTTAGGGAACACGTCTTTACTGGAAGTGTCTCCTCATTGGCCTCTT 4015
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 3944 CTACTATTCTTGGAGTTAGGGAACATGTCTTTACTGGAAGTGTCTCCTCCTTGGCATCTT 4003
Query 4016 TCATGTCCAATCAAGAAACCAGCTTTGTAACTCTAGGTCAACGAGTATTGGCAAAACCCT 4075
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4004 TCATGTCCAATCAAGAAACCAGCTTTGTAACTCTAGGTCAACGAGTATTGGCAAAACCCT 4063
Query 4076 TAAAGATCCGCATGCATTATGGTCATCCAGATGTCTTTGACAGAGTTTTTCATATTACAC 4135
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4064 TAAAGATCCGCATGCATTATGGTCATCCAGATGTCTTTGACAGAGTATTTCATATTACAC 4123
Query 4136 GTGGTGGTATCAGCAAGGCCTCTCGAGTCATCAATATTAGTGAAGATATTTTTGCTGGTT 4195
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4124 GTGGTGGTATCAGCAAGGCCTCTCGGGTCATCAATATTAGTGAAGATATATTTGCTGGTT 4183
Query 4196 TCAACACAACTCTACGTCAAGGGAATGTTACTCATCATGAGTATATTCAGGTGGGCAAAG 4255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4184 TCAACACAACTCTACGTCAAGGGAATGTTACTCATCATGAGTATATTCAGGTGGGCAAAG 4243
Query 4256 GGCGAGATGTTGGGCTCAATCAAATAGCTCTGTTTGAAGGGAAGGTTGCTGGTGGCAATG 4315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4244 GGCGAGATGTTGGGCTCAATCAAATAGCTCTGTTTGAAGGGAAGGTTGCTGGTGGGAATG 4303
Query 4316 GTGAACAGGTTCTTAGTCGAGATGTATACAGACTTGGCCAGCTCCTTGATTTCTTCCGAA 4375
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4304 GTGAACAGGTTCTTAGTCGAGATGTATACAGACTTGGCCAGCTCCTTGATTTCTTCCGTA 4363
Query 4376 TGATGTCATTCTTCTTTACAACCGTTGGCTTCTATTTATGTACAATGTTGACGGTGCTTA 4435
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4364 TGATGTCATTCTTCTTTACAACCGTTGGCTTCTATCTATGTACAATGTTGACGGTGCTTA 4423
Query 4436 CTGTGTATATTTTCTTATATGGGAGGGCATATCTGGCACTTTCTGGAGTTGGAGCTACTA 4495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4424 CTGTGTATATTTTCTTATATGGGAGGGCATATCTGGCACTTTCTGGAGTTGGAGCTACTA 4483
Query 4496 TTCGAGAAAGAGCTATTCTTCTGGATGACACTGCACTTAGCGCCGCCTTGAATGCTCAGT 4555
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4484 TTCGAGAAAGAGCTATTCTTCTGGACGATACTGCACTTAGCGCCGCCTTGAATGCTCAGT 4543
Query 4556 TTCTGTTTCAGATTGGTGTCTTCACTGCTGTGCCAATGGTTTTGGGGTTTATTTTGGAAC 4615
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4544 TTCTGTTTCAGATTGGTGTCTTCACTGCTGTGCCAATGGTTTTGGGATTTATTTTGGAAC 4603
Query 4616 AGGGTTTTCTCCAGGCCATCGTCAGTTTCATAACAATGCAATTTCAGCTATGTACTGTCT 4675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4604 AGGGTTTTCTCCAGGCCATCGTCAGTTTCATAACAATGCAATTTCAGCTATGTACTGTCT 4663
Query 4676 TCTTCACATTTTCCCTTGGCACAAGAACCCATTATTTTGGACGGACAATTCTCCATGGTG 4735
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4664 TCTTCACATTTTCCCTTGGTACAAGAACCCATTATTTTGGACGGACAATTCTCCATGGTG 4723
Query 4736 GTGCAAGGTACCAAGCCACTGGAAGAGGCTTCGTCGTGAAGCATATCAAATTTTCTGAAA 4795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4724 GTGCAAGGTACCAAGCCACTGGAAGAGGCTTCGTCGTGAAGCATATCAAATTTTCTGAAA 4783
Query 4796 ACTACCGTCTTTATTCCAGAAGTCATTTTGTCAAAGGGATGGAAGTTATTCTCTTATTGG 4855
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 4784 ACTACCGTCTTTATTCCAGAAGTCATTTTGTCAAAGCAATGGAAGTTATTCTTTTATTGG 4843
Query 4856 TTGTCTACCTTGCATATGGCAATGATGAAGCTGGTGCGGTTTCCTACATTCTTCTGACTG 4915
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
Sbjct 4844 TTGTGTACCTTGCGTATGGCAATGATGAAGCTGGTGCGGTTTCCTACATCCTGCTGACAG 4903
Query 4916 TGAGCAGCTGGTTTTTGGCTGTTTCCTGGCTGTTTGCTCCGTACCTGTTCAACCCTGCCG 4975
| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4904 TTAGCAGCTGGTTTTTGGCTGTTTCTTGGCTGTTTGCTCCGTACCTATTCAACCCTGCCG 4963
Query 4976 GATTTGAGTGGCAGAAAGTCGTGGAGGACTTCAAAGAATGGACAAATTGGCTCTTTTACA 5035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4964 GATTTGAGTGGCAGAAAGTCGTGGAGGACTTCAAAGAATGGACAAATTGGCTCTTTTACA 5023
Query 5036 GAGGTGGAATTGGTGTGAAAGGAGCTGAAAGCTGGGAAGCATGGTGGGAAGAAGAATTGT 5095
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5024 GAGGTGGAATTGGTGTGAAAGGAGCTGAAAGCTGGGAAGCATGGTGGGAAGAAGAACTGT 5083
Score = 867 bits (469), Expect = 0.0
Identities = 505/523 (97%), Gaps = 0/523 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5094 GTATGGTATTGTCTACAAACTGCAGCTACAAGGATCAGATACATCATTTGCGGTGTACGG 5153
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5151 GTATGGTATTGTCTACAAACTGAAGCTACAAGGATCAGATACATCATTTGCGGTGTACGG 5210
Query 5154 TTGGTCATGGGTTGCATTTGCGATGAGTATAGTACTTTTCAAGGTCTTTACCTTCAGCCA 5213
||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5211 TTGGTCATGGGTTGCATTTGCAATGATTATAGTTCTTTTCAAGGTCTTTACCTTCAGCCA 5270
Query 5214 GAAGATTTCTGTCAATTTCCAGCTTTTGCTGAGGTTTATACAAGGTCTATCCTTATTGAT 5273
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5271 GAAGATTTCTGTCAATTTCCAGCTTTTACTGAGGTTTATACAAGGTCTATCCTTATTGAT 5330
Query 5274 GGCTCTAGCTGGCATAATCGTAGCAGTTGTGCTCAAAAAGTTGTCAGTGACAGACATATT 5333
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 5331 GGCTCTAGCTGGCATAATCGTAGCAGTTGTGCTCACACCCTTGTCAGTGACAGACATATT 5390
Query 5334 TGCATGCGTATTGGCTTTTATACCGACAGGATGGGGCATTCTTTCTATTGCGTGTGCTTG 5393
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5391 TGCATGCGTATTGGCTTTTATACCGACAGGATGGGGAATTCTTTCTATTGCGTGTGCTTG 5450
Query 5394 GAAGCCAGTTTTAAAGCGAATGGGGATGTGGAAATCGATCCGTTCCCTAGCAAGGCTATA 5453
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5451 GAAGCCAGTCCTAAAGCGAATGGGGATGTGGAAATCGATTCGTTCCCTAGCAAGGCTATA 5510
Query 5454 TGATGCATTAATGGGAATGCTCATATTTCTTCCCGTTGCTCTCTGCTCGTGGTTCCCTTT 5513
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5511 TGATGCGTTAATGGGAATGCTCATATTTCTTCCCGTTGCTCTCTGCTCCTGGTTCCCTTT 5570
Query 5514 TGTGTCGACCTTCCAGACACGTATGATGTTTAACCAAGCTTTCAGCCGCGGTCTGGAGAT 5573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 5571 TGTGTCGACCTTCCAGACACGTATGATGTTTAACCAAGCCTTCAGCCGCGGTCTCGAGAT 5630
Query 5574 CTCTCTTATCCTTGCAGGAGACAATCCCAATTCTGGTCTTTAA 5616
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5631 CTCTCTTATTCTTGCAGGAGACAATCCCAATTCTGGTCTTTAA 5673
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 280383044427
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5