BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg341017 Length=1815 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G08790.1 | Symbols: | ENTH/VHS/GAT family protein | chr3:26... 2828 0.0 > AT3G08790.1 | Symbols: | ENTH/VHS/GAT family protein | chr3:2667881-2671001 FORWARD LENGTH=1824 Length=1824 Score = 2828 bits (1531), Expect = 0.0 Identities = 1739/1835 (95%), Gaps = 31/1835 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGTGCATCCTTTGGTTGATAGAGCCACAAGCGATATGCTCATTGGTCCTGATTGGGCC 60 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1 ATGGTGCATCCTTTGGTTGATAGAGCTACAAGCGATATGCTCATTGGTCCTGACTGGGCC 60 Query 61 ATGAACCTCGAGATATGTGACATGCTTAATCATGAGCCTGGGCAAACGAGAGAGGTAGTG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ATGAACCTCGAGATATGTGACATGCTTAATCATGAGCCTGGGCAAACGAGAGAGGTAGTG 120 Query 121 AGTGGCATAAAGAAGAGGCTTACCAGTAGGACTTCCAAGGTCCAGCTTTTGGCTCTTACA 180 ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| Sbjct 121 AGTGGCATAAAGAAGAGGCTTACTAGTAGAACTTCCAAGGTTCAGCTTCTGGCTCTTACA 180 Query 181 TTACTAGAGACAATAATAAACAATTGTGGGGAACTTATTCATATGCAAGTTGCAGAGAAG 240 ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TTACTAGAGACAATAATAACCAATTGTGGAGAACTTATTCATATGCAAGTTGCAGAGAAG 240 Query 241 GATATACTTCATAAGATGGTGAAGATGGCCAAAAGGAAGCCTAACATCCAAGTGAAGGAG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GATATACTTCATAAGATGGTGAAGATGGCCAAAAGGAAGCCTAACATCCAAGTGAAGGAG 300 Query 301 AAGATATTGATACTTATAGATACTTGGCAAGAGAGCTTTTCAGGTCCACAAGGAAGGCAT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 301 AAGATATTGATACTTATAGATACTTGGCAAGAGAGCTTTTCAGGTCCACAAGGAAGACAT 360 Query 361 CCACAATATTACGCAGCATACCAAGAATTGTTGCGTGCAGGAATTGCATTCCCTCAAAGA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 361 CCACAATATTACGCAGCATACCAAGAATTGTTGCGTGCAGGAATTGTATTCCCTCAAAGA 420 Query 421 CCTCAAACCACACCCAGTTCAGGACAAACTGGTCCTTCGACAACGTATCCTCAGAATTCT 480 ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 421 CCTCAAATCACACCCAGTTCAGGACAAAATGGTCCTTCGACAAGGTATCCTCAGAATTCT 480 Query 481 CGTAACACTAGACAAGAAGCTATTGATACTTCAACAGAATCAGAATTTCCAACTTTGAGT 540 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct 481 CGTAACGCTAGACAAGAAGCTATTGATACTTCAACAGAGTCAGAATTTCCAACTCTGAGT 540 Query 541 TTGACAGAAATTCAAAACGCAAGAGGAATTATGGATGTCTTAGCTGAAATGATGAACGCA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TTGACAGAAATTCAAAACGCAAGAGGAATTATGGATGTCTTAGCTGAAATGATGAACGCA 600 Query 601 ATAGATGGAAACAACAAAGAGGGACTTAAACAAGAGGTTGTTGTAGATCTTGTTAGCCAA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 ATAGATGGAAACAACAAAGAGGGACTTAAACAAGAGGTTGTTGTAGATCTTGTTAGCCAA 660 Query 661 TGTCGCACCTATAAACAAAGAGTAGTACACCTTGTAAACTCGACATCAGATGAATCTATG 720 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 TGTCGCACCTATAAACAAAGAGTAGTGCACCTTGTAAACTCGACATCAGATGAATCTATG 720 Query 721 CTTTGCCAAGGCCTAGCCTTAAATGACGATTTGCAGCGATTACTTGCAAAGCACGAAGTC 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 721 CTTTGCCAAGGCCTAGCCTTAAATGACGATTTGCAGCGATTACTTGCAAAGCACGAAGCC 780 Query 781 ATCGCCTCTGGAAACAGTATGAT-AATAAAGGAAGACAAATCTAAAAAAGAAGTTCCCAA 839 ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||| || Sbjct 781 ATCGCCTCTGGAAACAGTATGATTAAAAAAG-AAGAAAAATCTAAAAAAGAAGTTCCTAA 839 Query 840 GCACACAACTCAGATCATAGATGTTGGTTCAAGTGAGACCAAAGATGGTAGTGTTGTGGC 899 | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 840 GGACACAACTCAAATCATAGATGTTGGTTCAAGTGAGACCAAAAATGGTAGTGTTGTGGC 899 Query 900 TTCTACAACCAATGGTCCAAAAATAGACCTTCTAAGTGGTGATGACTTCGAGACTCCGGA 959 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 900 TTATACAACCAATGGTCCAAAAATAGACCTTCTAAGTGGTGATGACTTCGAGACTCCGAA 959 Query 960 TGCGGACATCTCATTAGCTCTTGTTCCCCTCGGACCTCCACAACCAAGTAGTCCCATAGC 1019 |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct 960 TGCGGATAACTCATTAGCTCTTGTTCCTCTCGGACCTCCACAACCAAGTAGCCCCGTAGC 1019 Query 1020 AAAGCCAGACAATTCCATCGTCTTAATTGATATGTTATCAGATAATAACTGTGAAAGCTC 1079 ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct 1020 AAAGCCAGATAATTCCATCGTCTTAATCGATATGTTGTCAGATAATAACTGCGAAAGCTC 1079 Query 1080 TACTCCAACTTCGAATCCACACGCAAATCATCAGATGGTGCAACAACATTACTCGAATGG 1139 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1080 TACTCCAACTTCGAATCCTCACGCAAATCATCAGAAGGTGCAACAAAATTACTCGAATGG 1139 Query 1140 ATTTGGACCTGGCCATCAAGAGCAATCTTATTATGGACAAGGGTCATCTGCTCCTGTTTG 1199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1140 ATTTGGACCTGGCCATCAAGAGCAATCTTATTATGGTCAAGGGTCATCTGCTCCTGTTTG 1199 Query 1200 GAATCTCCAAATTACTCAACAACACCAACAACCATCTTCTCCTGCGTATGGAAACCAACC 1259 ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 1200 GAATCTCCAAATTACTCAACAAC-C-A-------TCTTCTCCTGCCTACGGAAACCAACC 1250 Query 1260 CTTTTCGCCTAACTTTAGCCCGCCTGCCTCTCCTCACTATGGTGGACAAAACAACAATGT 1319 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1251 ATTTTCGCCTAACTTTAGCCCGCCCGCCTCTCCTCACTATGGTGGACAAAACAACAACGT 1310 Query 1320 TCTAGCATTACCTCCACCACCATGGGAAGCTCAATCTCCAAGCTCTAGCCCTCAATACTC 1379 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1311 TCTGGCATTACCTCCACCACCATGGGAAGCTCAATCTCCAAGCTCTAGCCCTCAATACTC 1370 Query 1380 TCCAACTCATCCAATGCAAGTGACTCAAGTGGTCATCACCACACACACTCATCAACCCCT 1439 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1371 TCCTACACATCCAATGCAAGTGACTCAAGTGGTCATCACCACACACACACATCAACCCCT 1430 Query 1440 CGGTTACAACCCTCAAGGCGGCTCTCCTCATGCTACGAACAACAACAATAACT---TGTT 1496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| Sbjct 1431 CGGTTACAACCCTCAAGGCGGCTCTCCTCATGCTACCAACAACAACAACAACAACATGTT 1490 Query 1497 CGGAATGTTCCTCCCTCCAAT-AGCAGGAGGCCATATGCC---ACCCTTTGGCCACAACC 1552 ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct 1491 CGGGATGTTCCTCCCTCCAATGA-CAGGAGGCCACATGCCGCCACCCTTTGGCCACAACG 1549 Query 1553 CAAACGTCACAAACAACAATTACAATCCCATTATGTACGGAGGCTATGGAGGACATGCTC 1612 | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1550 GACACGTCACAAACAACAATTATAATCCCAACATGTACGGAGGCTATGGAGGACAAGCTC 1609 Query 1613 AGCCACCACAACAGTATCTTGTAGAACAACAAATGTACGGAATGTCTCTTCAAGAGAATG 1672 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1610 AGCCACCACAACAGTATCTTGTAGAACAACAAATGTACGGAATGTCTCTTCAAGACAATG 1669 Query 1673 GAAACAACAACACTAATCCCTACCAAGTTTCTTCTCATCAGCCTCCACCAATGA--A--- 1727 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1670 GAAACAACAATACTAATCCCTACCAAGTTTCTTCTCATCAGCCTCCACCAATGATGAAGC 1729 Query 1728 -TA--A----GAAACCAGAAGACATGTTGTTTGGTGATCTTGTTGAACTCTCCAAGTTCA 1780 || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1730 CTATGAATAAGAAACCAGAAGACAAGTTGTTTGGTGATCTTGTTGAACTCTCCAAGTTCA 1789 Query 1781 AGAAACCCACTTCCGGACGAGCCGGTAGTATGTAA 1815 ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct 1790 AGAAACCCACTTCAGGACGAGCTGGTAGTATGTAA 1824 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 89808775005 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5