BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg344116 Length=4200 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT2G25170.1 | Symbols: PKL, GYM, CHD3, CHR6, SSL2 | chromatin r... 3644 0.0 > AT2G25170.1 | Symbols: PKL, GYM, CHD3, CHR6, SSL2 | chromatin remodeling factor CHD3 (PICKLE) | chr2:10713807-10723986 FORWARD LENGTH=4402 Length=4402 Score = 3644 bits (1973), Expect = 0.0 Identities = 2195/2304 (95%), Gaps = 8/2304 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1901 AGTTTCAGCACATGCTGGATC-TACTTGAAGACTACTGTTCTTATAAGAAATGGAACTAC 1959 |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| Sbjct 1880 AGTTTCAGCATATGCTGGA-CTTACTTGAAGACTACTGTACCCATAAGAAATGGCAGTAC 1938 Query 1960 GAGCGAATTGATGGAAAGGTTGGCGGAGCTGAGCGGCAAATACGCATAGATCGGTTCAAT 2019 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1939 GAGCGAATTGATGGAAAGGTTGGCGGAGCTGAGCGGCAAATACGCATAGATCGGTTCAAT 1998 Query 2020 GCCAAAAACTCTAACAAATTTTGTTTTTTGCTCTCCACAAGAGCTGGTGGCTTAGGAATA 2079 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1999 GCCAAAAATTCTAACAAGTTTTGTTTTTTGCTCTCCACAAGAGCTGGTGGCTTAGGAATA 2058 Query 2080 AATCTTGCAACGGCTGATACAGTAATAATTTATGACAGTGACTGGAATCCTCATGCTGAT 2139 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2059 AATCTTGCAACGGCTGATACAGTAATCATTTATGACAGTGACTGGAATCCTCATGCTGAT 2118 Query 2140 CTTCAGGCAATGGCTAGAGCTCATCGACTTGGCCAAACAAATAAGGTGATGATTTACCGA 2199 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2119 CTTCAAGCAATGGCTAGAGCTCATCGACTTGGCCAAACAAATAAGGTGATGATTTATAGG 2178 Query 2200 CTCATAAACCGAGGCACCATTGAAGAAAGGATGATGCAATTAACTAAAAAGAAAATGGTT 2259 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2179 CTCATAAACCGAGGCACCATTGAAGAAAGGATGATGCAATTGACTAAAAAGAAAATGGTT 2238 Query 2260 CTAGAGCATCTTGTCGTCGGGAAACTAAAAACACAAAACATTAATCAGGAAGAGTTAGAT 2319 |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2239 CTAGAGCATCTTGTTGTTGGGAAACTCAAAACACAAAACATTAATCAGGAAGAGTTAGAT 2298 Query 2320 GACATCATCAGGTATGGATCAAAGGAGCTTTTTGCTAGTGAAGATGACGAAGCAGGAAAG 2379 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2299 GACATCATCAGGTATGGATCAAAGGAGCTTTTTGCTAGTGAAGATGATGAAGCAGGAAAG 2358 Query 2380 TCTGGAAAAATTCATTATGATGATGCGGCTATAGACAAATTGCTTGATCGTGATCTCGTG 2439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2359 TCTGGAAAAATTCATTATGATGATGCGGCTATAGACAAATTGCTTGATCGTGATCTCGTG 2418 Query 2440 GAGGCTGAGGAGGTCTCAGTGGATGATGAAGAGGAGAATGGATTCTTAAAGGCTTTCAAG 2499 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2419 GAGGCAGAGGAAGTCTCAGTGGATGATGAAGAGGAGAATGGATTCTTAAAGGCTTTCAAG 2478 Query 2500 GTGGCAAATTTTGAGTATATTGATGAAAACGAGGCAGCAGCATTAGAGGCACAGAGAGTC 2559 ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2479 GTGGCTAATTTTGAATATATAGATGAAAATGAGGCAGCAGCATTAGAGGCACAGAGAGTC 2538 Query 2560 GCTGCTGAAAGCAAATCTTCAGCAGGCAGTTCTGATAGAGCAAGTTATTGGGAAGAGTTG 2619 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2539 GCTGCTGAAAGCAAATCTTCAGCAGGCAATTCTGATAGAGCAAGTTATTGGGAAGAGTTG 2598 Query 2620 TTAAAAGATAAATTTGAGCTGCACCAGGCTGAGGAGCTTAATGCTCTTGGAAAAAGGAAG 2679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2599 TTAAAAGATAAATTTGAGCTGCACCAGGCTGAGGAGCTTAATGCTCTTGGAAAAAGGAAG 2658 Query 2680 AGAAGTCGCAAGCAGTTGGTATCCATTAAAGAAGATGATCTTGCTGGTTTGGAAGATGTG 2739 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2659 AGAAGTCGCAAGCAGTTGGTATCCATTGAAGAAGATGATCTTGCTGGTTTGGAAGATGTG 2718 Query 2740 AGCTCTGATGGAGATGAAAGTTATGAAGCCGAGTCAACAGATGCTGAAACAGCGGGACAA 2799 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||| Sbjct 2719 AGCTCTGATGGAGATGAAAGTTATGAAGCTGAGTCAACAGATGGTGAAGCAGCAGGACAA 2778 Query 2800 GAAGTTCAGACGGGTCGACGGCCATATAGAAGAAAGGGTCGCGATAACTCGGAGCCAATT 2859 | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| |||| | Sbjct 2779 GGAGTTCAGACGGGTCGACGGCCGTACAGAAGAAAGGGTCGCGATAATTTGGAACCAACT 2838 Query 2860 CCTTTGATGGAAGGCGAGGGGAGATCTTTCAGAGTACTGGGTTTCAACCAGAGTCAAAGG 2919 || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2839 CCGTTGATGGAAGGTGAGGGGAGATCTTTCAGAGTACTGGGTTTCAACCAGAGTCAAAGG 2898 Query 2920 GCCATTTTTGTACAGACGTTGATGAGGTATGGAGCTGGTAATTTCGATTGGAAGGAGTTT 2979 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct 2899 GCCATTTTTGTACAGACTTTGATGAGGTATGGAGCTGGCAATTTTGATTGGAAGGAGTTT 2958 Query 2980 GTTCCTCGCTTAAAGCAGAAGACCTATGACGAAATAAATGAATATGGAATACTCTTCTTG 3039 ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2959 GTTCCTCGCTTAAAGCAGAAGACCTTTGAAGAAATAAATGAATATGGAATACTCTTCTTG 3018 Query 3040 AAGCACATTGCTGAAGATATTGACGAGAACTCTCCAACATTTTCAGATGGTGTGCCAAAG 3099 ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct 3019 AAGCACATTGCTGAAGAAATAGACGAGAATTCTCCAACCTTTTCAGATGGTGTGCCCAAG 3078 Query 3100 GAAGGACTTAGAATAGAAGATGTTCTAGTCAGAATTGCTCTTCTGATACTAGTACAGGAG 3159 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3079 GAAGGACTTAGAATAGAAGATGTTCTAGTCAGAATTGCTCTTCTGATACTAGTTCAGGAG 3138 Query 3160 AAGACGAAATTTGTAGAAGATCATCCAGCGAAACCTGTTTTCACGTCCCGCATTCTTGAA 3219 ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| Sbjct 3139 AAGGTGAAATTTGTAGAAGATCATCCAGGGAAACCTGTTTTCCCCTCTCGCATTCTTGAA 3198 Query 3220 AGATTCCCCGGATTGAGAAGTGGAAAAGTTTGGAAGGAGGAACATGACAAGATAATGATA 3279 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3199 AGATTCCCCGGACTGAGAAGTGGAAAAATTTGGAAGGAGGAACATGACAAGATAATGATA 3258 Query 3280 CGTGCTGTTTTAAAGCATGGGTATGGGCGATGGCAAGCTATTGTTGATGACAAAGAGTTA 3339 ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3259 CGTGCTGTTTTAAAGCATGGGTACGGACGGTGGCAAGCTATTGTTGATGACAAAGAGTTG 3318 Query 3340 GGGATCCAAGAGCTTATCTGCAAGGAATTGAACTTCCCTCACATAAGTTTGTCTGCTGCT 3399 ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3319 GGGATCCAAGAGCTTATCTGCAAAGAATTGAATTTCCCTCACATAAGTTTGTCTGCTGCT 3378 Query 3400 GAACAAGCTGGCTTGCAGGGGCAGAATGGTAGTGGGGGCTCCAATTTGGGAGCACAGACT 3459 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| Sbjct 3379 GAACAAGCTGGTTTGCAGGGGCAGAATGGTAGTGGGGGCTCTAATCCGGGAGCACAGACT 3438 Query 3460 AACCAGAATTCTGGAAGTGGTATTACTGGGAACAATAATGCTTCTGGTGATGGGG-TCCA 3518 ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | Sbjct 3439 AACCAGAATCCTGGAAGCGTTATTACTGGGAACAATAATGCTTCTGCTGATGGGGCTC-A 3497 Query 3519 AGTAAACTCGATGTTCTACTATCGGGACATGCAGAGACGACTTGTTGAGTTTGTGAAAAA 3578 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3498 AGTAAACTCGATGTTCTATTATCGGGACATGCAGAGACGACTTGTTGAGTTTGTGAAAAA 3557 Query 3579 GCGAGTTCTGCTTTTGGAGAAAGCGTTGAATTATGAATATGCAGAGGATTATTATGGACT 3638 ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 3558 GCGAGTTCTGCTTTTGGAGAAGGCGATGAATTATGAATACGCAGAGGAATATTATGGACT 3617 Query 3639 TGGTGGCTCGTCATCTATCCCTACTGAAGAACCAGAAGCTGAACCAAAGATCGCTGACAC 3698 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3618 TGGTGGCTCATCATCTATCCCTACTGAAGAACCAGAAGCTGAACCAAAGATCGCTGACAC 3677 Query 3699 AGTGGGAGTGAGCTTTATTGAGGTCGATGATGAAATGCTTGATGGACTTCCTAAGACTGA 3758 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3678 AGTGGGAGTGAGCTTTATTGAGGTTGATGATGAAATGCTTGATGGACTTCCTAAGACTGA 3737 Query 3759 TCCCATCACTTCAGAAGAAATTATGGTGGCTGCTGTTGACAACAACCAAGCGCGGGTCGA 3818 ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3738 TCCTATCACTTCAGAAGAAATTATGGGGGCTGCTGTTGACAACAACCAAGCGCGGGTCGA 3797 Query 3819 AATAGCTCAGCATTATAACCAGATGTGCAAAGTTTTTAATGAGAACGCTCGTGAATCACT 3878 ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||| | Sbjct 3798 AATAGCTCAACATTATAACCAGATGTGCAAACTTCTTGATGAGAACGCTCGGGAATCAGT 3857 Query 3879 CCAAGCATATGTAAACAACCAACCACCAAGTACCAAGGTGAATGAGAGCTTCCGTGCACT 3938 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3858 CCAAGCATATGTAAACAACCAACCACCGAGTACCAAGGTGAATGAGAGCTTCCGTGCACT 3917 Query 3939 CGAATCTATCAATGGTAACATTAGA-ACGATCCTTTCGACTCCA-CTTGACCAATCAAAG 3996 | ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| | || || || ||||| ||| Sbjct 3918 CAAATCTATCAATGGTAACATTA-ACACAATCCTTTCGATTACATCT-GATCAATCCAAG 3975 Query 3997 TCACATGAAAACGACACCAAGCCAAACCTAAACAATGTTGACATGAAGGACACGGCCGAA 4056 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3976 TCACATGAAGACGACACCAAGCCAGACCTAAACAATGTTGAGATGAAGGACACGGCCGAA 4035 Query 4057 GAAACAAAACCGTTAAGAGGTGGCGTCGTCGATCTGAATGTGATGGAGGGAGAGGAGAAC 4116 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 4036 GAAACAAAACCGTTAAGAGGTGGCGTCGTCGATCTGAATGTGGTGGAGGGAGAGGAGAAC 4095 Query 4117 ATTTCTGAAGCTAGTGGAAGTGTTGATGTGAAAATGGAAGAAGCCAAAGAAGAAGAGAAG 4176 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4096 ATTGCTGAAGCTAGTGGAAGTGTTGATGTAAAAATGGAAGAAGCCAAAGAAGAAGAGAAG 4155 Query 4177 CCAAAGAACATGGTCGTGGATTGA 4200 ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 4156 CCAAAGAACATGGTCGTTGATTGA 4179 Score = 3186 bits (1725), Expect = 0.0 Identities = 1844/1903 (97%), Gaps = 2/1903 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGAGTAGTTTGGTGGAGCGGCTTCGTATACGATCAGATAGGAAACCGGTTTATAATCTA 60 |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 25 ATGAGTAGTTTGGTGGAGAGGCTTCGCATACGATCTGATAGGAAACCAGTTTATAACCTA 84 Query 61 GATGATTCTGATGATGACGACTTCGTTCCTAAAAAAGATCGGACCTTGGAGCAAGTCGAG 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 85 GATGATTCTGATGATGACGACTTCGTTCCTAAAAAAGATCGAACCTTTGAGCAAGTCGAG 144 Query 121 GCTATTGTCAGAACTGATGCGAAAGAAAATGCATGCCAGGCTTGTGGAGAAAGTGCAAAT 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| Sbjct 145 GCTATTGTCAGAACTGATGCGAAAGAAAATGCATGTCAGGCTTGTGGGGAAAGTACTAAT 204 Query 181 CTTGTAAGCTGCAATACATGTACGTATGCGTTCCATGCTAAATGCTTAGTTCCGCCTCTT 240 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 205 CTTGTAAGCTGCAATACATGCACTTATGCGTTCCATGCTAAATGCTTAGTTCCACCTCTT 264 Query 241 AAAGACGCGTCAGTGGAAAATTGGAGATGCCCTGAATGCGTTAGTCCTCTTAATGAGATA 300 ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct 265 AAAGATGCTTCCGTGGAAAATTGGAGATGCCCTGAATGTGTTAGTCCTCTTAACGAGATA 324 Query 301 GATAAGATATTGGACTGTGAAATGCGTCCTACAAAATCTAGTGAACAAGGTTCCTCCGAT 360 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 325 GATAAGATATTGGATTGTGAAATGCGTCCTACAAAATCTAGTGAACAAGGTTCCTCCGAT 384 Query 361 GCGGCACCAAAGCCAATTTTTGTGAAACAGTATCTCGTGAAGTGGAAGGGATTATCATAC 420 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 385 GCGGAACCGAAGCCAATTTTTGTGAAACAGTATCTCGTGAAGTGGAAGGGATTATCATAC 444 Query 421 CTTCACTGCTCTTGGGTGCCTGAGAAGGAGTTCCAGAAGGCTTATAAGTCAAATCATCGT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 445 CTTCACTGCTCTTGGGTGCCTGAGAAGGAGTTCCAGAAGGCTTATAAGTCAAATCATCGT 504 Query 481 TTAAAAACCAGGGTGAACAATTTTCACCGTCAAATGGAATC-TGTCAATAACAGCGAAGA 539 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| Sbjct 505 TTAAAAACCAGAGTGAACAATTTTCACCGTCAAATGGAGTCAT-TCAATAACAGCGAAGA 563 Query 540 TGATTTTGTTGCCATTCGTCCTGAGTGGACCACTGTTGATCGGATTCTTGCCTGCAGAGA 599 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 564 TGATTTTGTTGCCATACGTCCTGAGTGGACCACTGTTGATCGGATTCTTGCCTGCAGAGA 623 Query 600 GGAAGATGGTGAGCTGGAATATCTTGTGAAATATAAAGAGCTATCTTATGATGAATGTTA 659 ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 624 GGAAGATGGGGAGCTGGAATATCTTGTCAAATATAAAGAGCTATCCTATGATGAATGTTA 683 Query 660 TTGGGAGTCAGAATCAGACATCTCAACCTTCCAGAATGAAATTCAAAGGTTCAAGGATGT 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 684 TTGGGAGTCAGAATCAGACATCTCAACCTTCCAGAATGAAATTCAAAGGTTCAAGGATGT 743 Query 720 AAATTCTAGAACTCGCAGGGGTAAAGATGTTGACCATAAAAGAAATCCCAGAGACTTTCA 779 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 744 AAATTCTAGAACTCGCAGAAGTAAAGATGTTGACCATAAAAGAAATCCCAGAGACTTTCA 803 Query 780 ACAGTTTGATCATACTCCTGAATTCCTCAAAGGCTTGTTGCATCCATACCAGCTTGAGGG 839 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 804 ACAGTTTGATCATACTCCTGAATTCCTCAAAGGCTTGTTACATCCATACCAGCTTGAGGG 863 Query 840 ACTTAATTTTTTGCGGTTCTCGTGGTCAAAACAGACGCATGTAATCCTTGCTGATGAAAT 899 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 864 ACTTAATTTTTTGCGGTTCTCGTGGTCAAAACAGACGCATGTAATCCTTGCTGATGAAAT 923 Query 900 GGGACTAGGCAAAACAATTCAAAGCATTGCCCTTTTAGCTTCACTTTTTGAGGAGAACCT 959 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 924 GGGACTAGGCAAGACAATTCAAAGCATTGCCCTTTTAGCTTCACTTTTTGAGGAGAACCT 983 Query 960 CATTCCGCATTTGGTAATTGCTCCTCTATCGACTCTGCGTAACTGGGAGAGAGAGTTTGC 1019 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 984 CATTCCGCATTTGGTAATTGCTCCTCTATCGACTCTGCGTAACTGGGAGAGAGAGTTTGC 1043 Query 1020 CACATGGGCCCCACAGATGAATGTGGTTATGTATTTTGGCACTTCGCAAGCTCGAGCAGT 1079 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1044 CACATGGGCCCCACAGATGAACGTGGTTATGTATTTTGGCACTGCGCAAGCTCGAGCAGT 1103 Query 1080 TATCAGAGAACATGAGTTTTACTTTTCGAAAGATaaaaaaaaaatcaagaaaaagaaatc 1139 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1104 TATCAGAGAACATGAGTTTTACTTATCGAAAGATCAAAAAAAGATCAAGAAAAAGAAATC 1163 Query 1140 tggacaaatcagtagcgaaagcaagcaaaaaagaatcaagTTTGACGTCCTCCTCACATC 1199 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1164 TGGACAAATAAGTAGCGAAAGCAAGCAAAAAAGAATCAAGTTTGATGTCCTCCTCACATC 1223 Query 1200 GTATGAGATGATCAACCTAGATACAGCAGTTCTGAAACCAATTAAGTGGGAGTGCATGAT 1259 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1224 GTATGAGATGATCAACCTAGATTCAGCAGTTCTAAAACCAATTAAGTGGGAGTGCATGAT 1283 Query 1260 TGTTGATGAAGGTCATCGACTGAAAAATAAGGATTCAAAGCTGTTCTCTTCATTGACACA 1319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1284 TGTTGATGAAGGTCATCGACTGAAAAATAAGGATTCAAAGCTGTTCTCTTCATTGACACA 1343 Query 1320 GTATTTAAGTAATCATCGTATTCTTCTGACAGGAACACCACTTCAGAACAACTTGGATGA 1379 ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1344 GTATTCAAGTAACCACCGTATTCTTCTGACAGGAACACCACTTCAGAACAACTTGGATGA 1403 Query 1380 ACTTTTCATGCTAATGCATTTTCTTGATGCGGGGAAGTTTGGAAGTTTGGAGGAGTTCCA 1439 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1404 ACTTTTCATGCTCATGCATTTTCTTGATGCGGGGAAGTTTGGAAGTTTGGAGGAGTTCCA 1463 Query 1440 GGAGGAGTTCAAAGATATTAATCAAGAGGAACAGATCTCAAGATTGCACAAAATGTTGGC 1499 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1464 GGAGGAGTTCAAAGATATTAATCAAGAGGAGCAGATCTCAAGGTTGCACAAAATGTTGGC 1523 Query 1500 TCCACATTTGCTCAGAAGGGTaaaaaaaGACGTAATGAAAGACATGCCCCCCAAAAAGGA 1559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1524 TCCACATTTGCTCAGAAGGGTAAAAAAAGACGTAATGAAAGACATGCCCCCCAAAAAGGA 1583 Query 1560 ACTCATTTTGCGTGTTGATCTGAGCAGCCTGCAGAAAGAATATTACAAAGCTATTTTTAC 1619 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1584 GCTCATTTTGCGTGTTGATCTGAGCAGTCTGCAGAAAGAATATTACAAAGCTATTTTTAC 1643 Query 1620 CCGTAATTATCAAGTATTGACTAAAAAGGGAGGTGCTCAAATTTCCCTTAATAACATTAT 1679 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1644 CCGTAATTATCAAGTATTGACAAAAAAGGGAGGTGCTCAAATTTCCCTTAATAACATTAT 1703 Query 1680 GATGGAATTACGAAAAGTATGCTGCCATCCTTATATGCTGGAGGGTGTTGAGCCAGCTAT 1739 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| Sbjct 1704 GATGGAATTACGAAAAGTATGCTGCCATCCTTATATGCTAGAGGGTGTTGAGCCAGTTAT 1763 Query 1740 TCACGACGCTAATGAAGCTTTCAAACAACTTTTGGAATCTTGTGGAAAGCTGCAACTTCT 1799 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1764 TCACGACGCAAATGAAGCTTTCAAACAACTTTTGGAGTCTTGTGGAAAGCTGCAACTTCT 1823 Query 1800 AGATAAAATGATGGTCAAACTGAAAGAGCAAGGACACAGAGTCCTAATATACACACAGTT 1859 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1824 AGATAAAATGATGGTCAAACTGAAAGAGCAAGGACACAGAGTCCTAATATACACACAGTT 1883 Query 1860 TCAGCACATGCTGGACTTACTTGAAGACTACTGTTCCTATAAG 1902 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct 1884 TCAGCATATGCTGGACTTACTTGAAGACTACTGTACCCATAAG 1926 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 209346653139 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5