BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg344958
Length=3705
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G31970.1 | Symbols: RAD50, ATRAD50 | DNA repair-recombinatio... 2769 0.0
> AT2G31970.1 | Symbols: RAD50, ATRAD50 | DNA repair-recombination
protein (RAD50) | chr2:13600491-13609069 FORWARD LENGTH=4371
Length=4371
Score = 2769 bits (1499), Expect = 0.0
Identities = 1615/1673 (97%), Gaps = 0/1673 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAGTACGGTCGATAAAATGCTGATCAAGGGCATCAGAAGCTTCGACCCAGAAAATAAG 60
||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 167 ATGAGTACGGTCGATAAAATGTTGATCAAGGGTATAAGAAGCTTCGACCCAGAAAATAAG 226
Query 61 AACGTTGTTACCTTCTTCAGACCTTTAACCCTAATCGTCGGTGCCAACGGAGCCGGAAAA 120
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 227 AACGTTGTTACTTTCTTCAGACCTTTAACCCTAATCGTCGGCGCTAACGGAGCCGGAAAA 286
Query 121 ACTACGATTATAGAGTGTTTAAAGGTCTCTTGCACTGGAGAGTTGCCACCGAACGCAAGG 180
|||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 287 ACTACGATTATAGAGTGTTTAAAGGTGTCTTGTACCGGAGAGTTGCCACCGAACGCGAGG 346
Query 181 TCTGGTCATAGCTTCATTCATGACCCCAAGGTTGCCGGGGAAACGGAGACAAAAGCACAA 240
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 347 TCTGGTCATAGCTTCATTCATGACCCTAAGGTTGCTGGAGAAACGGAGACAAAAGCACAA 406
Query 241 ATTAAGCTGAGATTCAAGACAGCTGCAGGGAAGGATGTGGTATGCATAAGGTCATTTCAG 300
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 407 ATAAAGCTGAGATTCAAGACAGCTGCAGGGAAGGATGTGGTATGTATAAGGTCATTTCAG 466
Query 301 TTGACGCAAAAGGCTTCAAAGATGGAGTACAAGGCTATTGAGAGTGTGCTTCAAACCATT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 467 TTGACGCAAAAGGCTTCAAAGATGGAGTACAAGGCTATTGAGAGTGTGCTTCAAACCATT 526
Query 361 AATCCTCACACTGGAGAGAAAGTATGTCTCAGCTACAGATGCGCTGACATGGATAGGGAG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527 AATCCTCACACTGGAGAGAAAGTATGTCTCAGCTACAGATGCGCTGACATGGATAGGGAG 586
Query 421 ATACCAGCTTTGATGGGTGTGTCAAAAGCTATTTTAGAAAACGTCATCTTTGTGCATCAG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 587 ATACCAGCTTTGATGGGTGTGTCAAAAGCTATTTTAGAAAACGTCATATTTGTGCATCAG 646
Query 481 GATGAGTCTAACTGGCCACTGCAAGATCCTTCTACTTTGAAAAAGAAGTTTGATGATATT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 647 GATGAGTCTAACTGGCCACTGCAAGATCCTTCTACTTTGAAAAAGAAGTTTGATGATATT 706
Query 541 TTTTCAGCCACCAGATATACAAAGGCTCTGGAAGTTATTAAGAAACTTCACAAGGATCAA 600
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 707 TTCTCAGCCACCAGATATACAAAGGCTCTGGAAGTTATTAAGAAACTTCACAAGGATCAA 766
Query 601 GCTCAGGAAATAAAAACTTTTAAGTTAAAGTTGGAAAACCTGCAGACCTTGAAAGATGCA 660
|||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 767 GCTCAGGAGATAAAAACTTTCAAGTTAAAATTGGAAAATCTGCAGACCTTGAAAGACGCA 826
Query 661 GCTTATAAGCTTCGGGAGAGCATTGCGCAAGATCAAGAAAGGACAGAATCTTCAAAAGTG 720
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 827 GCTTATAAGCTTCGTGAGAGCATTGCTCAAGATCAAGAAAGGACAGAATCTTCAAAAGTT 886
Query 721 CAGATGTTGGAACTGGAAACCAGCATTCAGAAAGTTGATGCTGAAGTTCATAATAAGGAA 780
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 CAGATGTTGGAACTGGAAACCAGTGTTCAGAAAGTTGATGCTGAAGTTCATAATAAGGAA 946
Query 781 ATGATGTTAAAAGATCTGAGAAAGCTACAAGACCAAGTATCAAGAAAAACTGCGGAAAGG 840
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 947 ATGATGTTAAAAGATCTGAGAAAGCTCCAGGACCAAGTATCAATAAAAACTGCGGAAAGG 1006
Query 841 AGCACCTTGTTTAAGGAGCAGCAGAGACAGTATGCAGCATTACCTGAGGAAAATGAAGAT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007 AGCACCTTGTTTAAGGAGCAGCAGAGACAGTATGCAGCATTACCTGAGGAAAATGAAGAT 1066
Query 901 ACTATTGAAGAACTGAAAGAATGGAAAAGCAAGTTTGAAGAAAGAATTGCTCTTTTGGAG 960
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 1067 ACTATTGAAGAATTGAAAGAATGGAAAAGCAAGTTTGAAGAAAGACTTGCTCTTTTGGGG 1126
Query 961 ACCAAAATTCGAAAAATGGAGAGAGAGATGGATGACACAGCAACTACAATTTATTCGCTT 1020
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 1127 ACCAAAATTCGAAAAATGGAGAGAGAGATGGTTGACACAGAAACTACAATTTCTTCGCTT 1186
Query 1021 AACAATGCAAAAACTAACTATATGCTGGAGATCAGCAAGCTACAAACAGAAGCTGAAGCT 1080
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187 CACAATGCAAAAACTAACTATATGCTGGAGATCAGCAAGCTACAAACAGAAGCTGAAGCT 1246
Query 1081 CATATGCTGCTGAAGAATGAAAGAGATTCTACCATTCAGAAAATTTTTTCCCATCACAAT 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||
Sbjct 1247 CATATGCTGCTGAAGAATGAAAGAGATTCTACCATCCAGAACATTTTTTTCCATTACAAT 1306
Query 1141 TTAGGAAATGTTCCTAGTACTCCCTTCGGTACTGAGGTAGTTTTGAATCTCACAAATCGA 1200
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1307 TTAGGAAATGTTCCTAGTACCCCCTTCAGTACTGAGGTAGTTTTGAATCTCACAAATCGA 1366
Query 1201 ATAAAATCAAGACTGGGTGAACTTGAGATGGACTTGCTCGATAAGAAGAAATCAAATGAA 1260
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1367 ATAAAATCAAGACTGGGTGAACTTGAGATGGATTTGCTCGATAAGAAGAAATCAAATGAA 1426
Query 1261 ACTGCTCTAAGTACAGCTTGGGATTGCTATATGGATGCTAATGATCGTTGGAAAAGCATT 1320
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1427 ACTGCTCTAAGTACGGCTTGGGATTGCTATATGGATGCTAATGACCGTTGGAAAAGCATC 1486
Query 1321 GAAGCTCAGAAACGAGCTAAAGACGAAATCAAGATGGGCATATCAAAACGCATAGAAGAG 1380
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1487 GAAGCTCAGAAACGAGCTAAAGATGAAATCAAGATGGGCATATCAAAACGCATAGAAGAG 1546
Query 1381 AAAGAAATTGAGCGTGATTCATTTGAATTCGAAATTTCCACTGTGAATGTTAAACAAACT 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1547 AAAGAAATTGAGCGTGATTCATTTGAATTCGAAATTTCCACTGTGGATGTTAAACAAACT 1606
Query 1441 GATGAAAGAGAGAAACAAGTGCAAATTGAGCTTGAGAGAAAGACAACACAGAATTCTGAA 1500
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1607 GATGAAAGAGAGAAACAAGTGCAAGTTGAGCTTGAGAGAAAGACAAAACAGAATTCTGAA 1666
Query 1501 TTGGGATTTGAATCCAAAATAGAACAGAAACAGCATGAAATCTACAGCATGGAGCATAAA 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 1667 AGGGGATTTGAATCCAAAATAGAACAGAAACAGCATGAAATATACAGCTTGGAGCATAAA 1726
Query 1561 ATTAAGACACTGAATCGAGAAAGAGATGTTATGGCTGGTGATGCTGAGGATAGAGTGAAA 1620
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1727 ATCAAGACACTGAATCGAGAAAGAGACGTTATGGCTGGTGATGCTGAGGATAGAGTGAAA 1786
Query 1621 TTGTCTTTAAAGAAGACGGAACAGGAGAATCTTAGGAAGAAACACAAAAAGAT 1673
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1787 TTGTCTTTAAAGAAGACGGAACAGGAGAATCTTAAGAAGAAACACAAAAAGAT 1839
Score = 2193 bits (1187), Expect = 0.0
Identities = 1339/1408 (95%), Gaps = 28/1408 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1674 GTCAATTGAAAGGGAATATGATGACCTGAGTTTGAAATCCCGACAAGCAGAAAAGGAGGT 1733
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1933 GTCAATTGAAAGGGAATATGATGACCTCAGTTTGAAATCCCGAGAAGCAGAAAAGGAGGT 1992
Query 1734 CAACATGTTGCAGATGAAGATACAAGAAGTAAACAATAGCCTATTCAAGCACAACAAGGA 1793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1993 CAACATGTTGCAGATGAAGATACAAGAAGTAAACAATAGCCTATTCAAGCATAACAAGGA 2052
Query 1794 TACAGAATCAAGAAAGAAATACATTGAGTCCAAGCTTCAGGCCTTAAAACAGGAATCAGT 1853
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2053 TACAGAATCAAGAAAGAGATACATTGAGTCCAAGCTTCAGGCCTTAAAACAGGAATCAGT 2112
Query 1854 TACCATTGATGCTTATCCCAAATTGTTGGAGTCGGCTAAGGACGAAAGAGATGACCGTAA 1913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2113 TACCATTGATGCTTATCCCAAATTGTTGGAGTCGGCTAAGGACAAAAGAGATGACCGTAA 2172
Query 1914 AAGC-AAGTATAACATGGCAAATGGTATGCG-CAAGATGTTTGAACCTTTTGAGGATTTA 1971
| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |
Sbjct 2173 ACGCGAA-TATAACATGGCAAATGGTATGCGTC-AGATGTTTGAACCTTTTGAGAAACGA 2230
Query 1972 GCACGTCAACATCATTATTGTCCTTGCTGTGAGCGCTCTTTTACAACTGATGAAGAGGAT 2031
||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 2231 GCACGTCAAGAGCATTCTTGTCCTTGCTGCGAGCGCTCTTTTACAGCTGATGAAGAGGCT 2290
Query 2032 AGCTTTGTTAAGAAGCAAAGGGTAAAGGCTTCAACCACGGGGGAGCATCTTAAAGAATTA 2091
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 2291 AGCTTTATTAAGAAGCAAAGGGTAAAGGCTTCAAGCACAGGGGAGCATCTTAAAGCATTA 2350
Query 2092 GCAGTGGAGTCTTCCAATGCTGACTCTGTATTTCAGCAGCTAGACAAACTACGGGCAGTT 2151
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2351 GCAGTGGAGTCTTCCAATGCTGACTCTGTATTTCAACAGCTAGACAAACTACGGGCAGTT 2410
Query 2152 TTTGAAGAATACTCGAAACTAACTAGTGAAATTATTCCTCTCGCTGAGAAAACTTTGCAA 2211
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2411 TTTGAAGAATACTCGAAACTAACTACTGAAATTATTCCTCTCGCTGAGAAAACTTTGCAA 2470
Query 2212 GAGCATACAGAAGAGCTGGGTCAGAAGTCTCAAGCTCTTGATGATGTATTAGGAATCTCT 2271
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2471 GAGCATACAGAAGAGCTGGGTCAGAAGTCTGAAGCTCTTGATGATGTATTAGGAATCTCT 2530
Query 2272 GCCCAGATAAAAGCTGACAAAGACTCAATTGAAGCACTGGTGCATCCCCTGGAAAATGCT 2331
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 2531 GCACAGATAAAAGCTGACAAAGACTCGATTGAAGCACTGGTGCAGCCCCTCGAAAATGCT 2590
Query 2332 GACAGGACCTTTCAGGAAATCGTATCCTACCAAAAGCAAATTGAAGATCTTGAATATAAG 2391
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GACAGGATCTTTCAGGAAATCGTATCCTACCAAAAGCAAATTGAAGATCTTGAATATAAG 2650
Query 2392 CTTGATTTCAGGGGTCTTGGGGTTAAAACTATGGAAGAAATCCAATCAGAATTAAGTAGC 2451
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2651 CTTGATTTTAGGGGTCTTGGGGTTAAAACTATGGAAGAAATCCAATCAGAATTAAGTAGC 2710
Query 2452 CTCCAAAGCAGCAAGGATAAATTGCACGGTGAGCTGGAGAAACTTAGAGATGACCAGATT 2511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2711 CTCCAAAGCAGCAAGGATAAATTGCACGGTGAGCTGGAGAAACTTAGAGATGACCAGATT 2770
Query 2512 TACATGGAACGTGATATATCATGCCTCCAGGCCAGATGGCATGCAGTAAGGGAAGAGAAG 2571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2771 TACATGGAACGTGATATATCATGCCTCCAGGCCAGATGGCATGCAGTAAGGGAGGAGAAG 2830
Query 2572 GCTAAGGCAGCCAATTTGTTACGCGACGTTACAAAGGCAGAAGAAGACCTGGAGCGTTTA 2631
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2831 GCCAAGGCAGCCAATTTGTTACGGGACGTTACAAAGGCAGAAGAAGACCTGGAGCGTTTA 2890
Query 2632 ACCGAGGAGAAAAGTCAACTTGACCTCGACGTGAAGTATTTGACCGAGGCACTGGGCCCG 2691
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2891 GCCGAGGAGAAAAGTCAACTTGACCTCGATGTGAAGTATTTGACCGAGGCCCTGGGCCCT 2950
Query 2692 TTATCCAAGGAAAAAGAGCAGTTACTGAGTGACTACAATGATATGAAGATTAGACGTAAT 2751
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2951 TTATCCAAGGAAAAAGAGCAATTACTGAGTGACTACAATGATATGAAGATTAGACGTAAT 3010
Query 2752 CAAGAGTATGAAGAACTGGCTGACAAAAAGAGAAACTACCAACAGGAAGTTGAGGCATTA 2811
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3011 CAAGAGTATGAAGAACTGGCTGAGAAAAAGAGAAACTACCAACAGGAAGTTGAGGCATTA 3070
Query 2812 CTCAAGGCCAGTTCTAAGATAAATGAATATGCTTACAGCTGCTTCACCAGGTATCATGAT 2871
||||||||||||| | |||| | || | | || | | |||||||||
Sbjct 3071 CTCAAGGCCAGTT--A---TAAA--A-TA-----A-A--TG----A---G-TATCATGAT 3106
Query 2872 CTGAAGAAAGGGGAGCGCTTAAATGATATTCAAGAAAAGCAGCGGTTATCCGAATCTCAG 2931
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 3107 CTGAAGAAAGGGGAGCGCTTAGATGATATTCAAGAAAAGCAGCGGTTATCTGATTCTCAG 3166
Query 2932 CTTCAGAGCTGTGAAGCTAGAAAGAATGAACTTGCAGGTGAACTGAACAGAAATAAAGAC 2991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3167 CTTCAGAGCTGTGAAGCTAGAAAGAATGAACTTGCAGGTGAACTGAACAGAAATAAAGAC 3226
Query 2992 TTGATGCGGAATCAAGATCAACTGAGAAGAAATATAGAGGATAACTTGAACTACCGGACA 3051
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3227 TTGATGCGGAATCAAGATCAACTGAGAAGAAATATAGAGGATAACTTGAACTACCGGACA 3286
Query 3052 ACAAAAGCAAAAGTTGAGGAGCTTACAC 3079
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3287 ACAAAAGCAAAAGTTGAGGAGCTTACAC 3314
Score = 612 bits (331), Expect = 8e-174
Identities = 336/338 (99%), Gaps = 2/338 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3108 GCTGAACCGGTGTCGTGGAACAGTGTCTGTTTACGAGAGCAGTATTTCAAAGAACAGAGT 3167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3421 GCTGAACCGGTGTCGTGGAACAGTGTCTGTTTACGAGAGCAGTATTTCAAAGAACAGAGT 3480
Query 3168 GGAGCTAAAAGC-GGCACAATACAAGGACATAGATAAGCGGCACTTTGATCAACTGATCC 3226
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3481 GGAGCTAAAA-CAGGCACAATACAAGGACATAGATAAGCGGCACTTTGATCAACTGATCC 3539
Query 3227 AGCTAAAGACAACTGAAATGGCAAATAAAGACTTGGATAGATACTACAATGCCCTTGACA 3286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3540 AGCTAAAGACAACTGAAATGGCAAATAAAGACTTGGATAGATACTACAATGCCCTTGACA 3599
Query 3287 AAGCACTAATGCGCTTCCACACAATGAAAATGGAGGAAATAAATAAGATTATAAGGGAAC 3346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3600 AAGCACTAATGCGCTTCCACACAATGAAAATGGAGGAAATAAATAAGATTATAAGGGAAC 3659
Query 3347 TGTGGCAGCAGACATACAGAGGTCAAGATATGGATTACATACGAATACACTCAGATTCCG 3406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3660 TGTGGCAGCAGACATACAGAGGTCAAGATATGGATTACATACGAATACACTCAGATTCCG 3719
Query 3407 AAGGTGCAGGCACCCGCTCTTACAGCTACAAGGTTCTT 3444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3720 AAGGTGCAGGCACCCGCTCTTACAGCTACAAGGTTCTT 3757
Score = 472 bits (255), Expect = 1e-131
Identities = 263/267 (99%), Gaps = 0/267 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3436 AAGGTTCTTGCTTCATTGATAATTAGGCTGGCTTTAGCTGAGACATTTTGCTTAAACTGT 3495
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3812 AAGGTTCTTGCTTCATTGATAATTAGGTTGGCTTTAGCCGAGACATTTTGCTTAAACTGT 3871
Query 3496 GGAATATTAGCCCTCGATGAGCCAACTACAAACCTGGATGGGCCCAATTCAGAATCTCTT 3555
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3872 GGAATATTAGCCCTTGATGAGCCAACTACAAACCTGGATGGGCCCAATTCAGAATCTCTT 3931
Query 3556 GCAGGAGCTCTTCTTAGGATCATGGAAGACAGAAAGGGCCAAGAGAATTTCCAACTCATA 3615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3932 GCAGGAGCTCTTCTTAGGATCATGGAAGACAGAAAGGGCCAAGAGAATTTCCAACTCATA 3991
Query 3616 GTCATTACCCACGATGAACGCTTTGCTCAAATGATTGGCCAACGGCAACATGCTGAAAAA 3675
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3992 GTCATTACCCACGATGAACGCTTTGCTCAAATGATTGGCCAAAGGCAACATGCTGAAAAA 4051
Query 3676 TATTACCGGGTCGCAAAAGATGATATG 3702
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4052 TATTACCGGGTCGCAAAAGATGATATG 4078
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 184514016354
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5