BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg347608
Length=2379
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G45190.1 | Symbols: | SIT4 phosphatase-associated family pr... 3836 0.0
> AT3G45190.1 | Symbols: | SIT4 phosphatase-associated family
protein | chr3:16541673-16548278 REVERSE LENGTH=2808
Length=2808
Score = 3836 bits (2077), Expect = 0.0
Identities = 2286/2385 (96%), Gaps = 21/2385 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTTTTGGAAGTTGACTGCTCTCTCTGCTGCTTCACCGGTCGAATCGATATTAGACAAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 118 ATGTTTTGGAAGTTGACTGCTCTCTCTGCTGCTTCACCGGTTGAATCCATATTAGACAAG 177
Query 61 GAAGATTTCACTTTGGAAGAACTATTGGATGAGGAAGATATAATCCAAGAATGCAGAGCT 120
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 178 GAAGATTTCACTTTGGAAGAACTTTTGGATGAGGAAGACATAATCCAAGAATGCAGAGCT 237
Query 121 TTGAACAGCCGTCTCATAAATTTTCTGAGAGAAAGAGCCCAAGTGGAACAGTTGTTACGT 180
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 238 TTGAACAGCCGGCTCATAAATTTTCTGAGAGAAAGAGCCCAAGTGGAACAGTTATTACGT 297
Query 181 TTTATTGTTGAAGAATCTCCTGAAGATGCTGATAGCAAGCGCGCTTTCAAGTTTCCTTTC 240
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 TTTATTGTTGAAGAATCTCCTGAAGATGCAGACAGCAAGCGCGCTTTCAAGTTTCCTTTC 357
Query 241 ATCTCCTCTGAAGTCTTGACCTGTGAAATTGATGTTATTCTTAAGACTTTGGTAGACGAG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||
Sbjct 358 ATCTCCTCTGAAGTCTTGACCTGTGAAATTGATGTAATTCTCAAGACTTTAGTGGACGAG 417
Query 301 GAGGAGCTAATGAACCTACTTTTCTCCTTTTTGGAACCCAACCGTTCCCACAGTGTAATG 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 418 GAGGAGCTAATGAACCTACTTTTCTCCTTTTTGGAACCCAACCGTTCCCACAGTGTAATG 477
Query 361 CTAGCTGGGTATTTCAGCAAGGTTGTCATATGCCTCATGTTGAGGAAGACGGTCCCGCTG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478 CTAGCTGGGTATTTCAGCAAGGTTGTCATATGCCTCATGTTGAGGAAGACGGTCCCGCTG 537
Query 421 ATGAACTATGTAAAAGCTCATCAGAATGTTTTCCAGCAACTGGTTGATTTGATAGGGATC 480
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 ATGAACTATGTAAAAGCCCATCAGAATGTTTTCCAGCAACTGGTTGATTTGATAGGGATC 597
Query 481 ACGTCCATTATGGAGGTTCTAATCCGGTTGGTTGGTGCGGATGATCATGTGTATCCCAAC 540
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 598 ACGTCCATTATGGAGGTTCTTATCCGGTTGGTTGGTGCGGATGATCATGTGTATCCTAAC 657
Query 541 CACCTAGATGTGATGCAATGGTTAGCTGATAGCAATCTGCTTGAAATGATTGTGGATAAG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 CACCTAGATGTGATGCAATGGTTAGCTGATAGCAATCTGCTTGAAATGATTGTGGATAAG 717
Query 601 CTTAGCCCATCAAACTCTCTTGAAGTTCATGCAAATGCTGCCGAAACACTGTGCACTATC 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 718 CTTAGCCCATCAAACTCTCTTGAAGTTCATGCAAATGCTGCTGAAACACTGTGCACTATC 777
Query 661 GCTCAAAATGCACCGTCACCGTTGGCTACCAAACTCTCTAGTTCAAGTTTTGTTGGAAGG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 778 GCTCAAAATGCACCGTCACCGTTGGCTACCAAACTTTCTAGTTCAAGTTTTGTTGCAAGG 837
Query 721 ATATTTGGTCATGCTTTCGAAGATCCCCAGTCCAAATCTAGCCTTGTCCACACACTTTCA 780
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 ATATTTGGTCATGCTTTCGAAGATCCTCAGTCCAAATCTAGCCTTGTCCACACACTTTCG 897
Query 781 GTGTGCATTTCATTGTTGAGCCCAAGAAGATCTGTAGTTTCTTCCCCCTTTATGTATTCA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 GTGTGCATTTCATTGTTGAGCCCAAGAAGATCTGTAGTTTCTTCCCCCTTTATGTATTCA 957
Query 841 TTCAGGGGCCAACAAATCTTCGAGTCTCCAATTTCTGTGAATCCGGAGACTATTGCCACC 900
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 TTCAGGGGACAACAAATCTTCGAGTCTCCAATTTCTGTGAATCCGGAGACTATTGCCACC 1017
Query 901 ATGCTGCCTAGACTTGGTGACTTTGTCGCGCTTTTAAATGTGACCTCTGATGAAAAGATT 960
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 ATGCTGCCTAGACTTGGTGACTTTGTCGCACTTTTAAATGTGACCTCTGATGAAAAGATT 1077
Query 961 TTACCTACAACCTATGGGCAGTTGAGGCCTCCTCTTGGCAGTCATCGGCTAAAGATTGTG 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1078 TTACCTACAACCTATGGGCAGTTGAGGCCTCCTCTTGGCAGTCATCGTCTGAAGATTGTG 1137
Query 1021 GAGTTCATTGCTGTCTTGCTGAAAACTCGGAGTGAAGTGACAGGAAAAGAACTAGCCAAC 1080
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |
Sbjct 1138 GAGTTCATTGCTGTCTTGCTGAAAACTCGAAGTGAAGCAACAGGAAAAGAACTAGCTAGC 1197
Query 1081 TCAGGAGCTATTAGAAGAGTCCTTGATCTGTTTTTTGAGTACCCGTATAATAATGCACTG 1140
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1198 TCAGGAGCTATTAGAAGAGTCCTTGATCTGTTCTTTGAGTACCCGTATAATAATGCTCTG 1257
Query 1141 CACCATCAGGTGGAGAGTATAATAGTATCGTGTTTGGAAAGCAAAAACGATGAGATTGTT 1200
|| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1258 CATCATCAGGTGGAGAGTATAATTTTATCGTGTTTAGAAAGCAAGAACGATGAGATAGTT 1317
Query 1201 GACCATCTTCTCCGAGAGTGTGATTTGATTGGAAAAATTATTAAAACAGAGAAACAGCCA 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 GACCATCTTCTCCGAGAGTGTGATTTGATTGGAAAAATTATTAAAACAGAGAAACAGCCA 1377
Query 1261 ATTCTTTCTGGTGATAAGCAGCCAACATTAGCTGCTGCTGGAAAGCAGGCTCCACGGGTG 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1378 ATTCTTTCTGGTGATAAGCAGCCAACATTAGCTGCTGCTGGAAAGCAGGCTCCACGGGTG 1437
Query 1321 GGAAATGTTGGTCATATCTCAAGAATTTCAAACAAGCTTGTTCAGCTGTCAACTAACAGT 1380
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 GGGAATGTTGGTCATATCTCAAGAATCTCAAACAAGCTTGTTCAGCTGTCAACTAACAGT 1497
Query 1381 AACCAGATAAAGACTTTACTTGAGGAAAATAACGATTGGGGTGAGTGGGAAGCAAATACG 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1498 AACCAGATAAAGACTTTACTTGAGGAAAATAACGATTGGGGTGAGTGGGAAGCTAATACG 1557
Query 1441 TTGCATGATCGAAATGCAGTTGAGAATGTGTATCGCTGGGTTTGCGGACGCCCGACTGCA 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558 TTGCATGATCGAAATGCAGTTGAGAATGTGTATCGCTGGGTTTGCGGACGCCCGACTGCA 1617
Query 1501 TTACATGATAGAACTAGGGACAGTGACGATGATGAAGTTCATGATAGGGATTATGATCTT 1560
||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 TTACATGATAGGACTAGGGACAGTGATGATGACGAAGTCCATGATAGGGATTATGATCTT 1677
Query 1561 GCTGGGTTGGCTAATAACTTGAACCAGTTCAGATACAACATGCAAGAGAACAATGGTGCT 1620
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1678 GCTGGTTTAGCTAATAACTTGAACCAGTTCAGATACAACATGCAAGAGAACAATGGTGCT 1737
Query 1621 GGAGAGGAGCATGGTTCCAATGACAGAGATGAAGAGGATGTCTATTTTGATGATGAATCT 1680
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1738 GGAGAGGAGCATGGTTCTAATGACAGAGATGAAGAGGATGTCTATTTTGATGATGAATCT 1797
Query 1681 GCTGAAGTTGTTATATCATCTCTAAGGCTTGGTGATGAACAGGCAAACAATTTATTCACA 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 1798 GCTGAAGTTGTTATATCATCTCTAAGGCTTGGTGATGAACAAGCGAACAATTTATTCACC 1857
Query 1741 AACTCGAACTGGTTCACGTTCCAAGGAGATGAATTGGGCGAAAACACAGGAACAGGAGCG 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1858 AACTCGAACTGGTTCACGTTCCAAGGAGATGAATTAGGCGAAAACACAGGAACAGGAGCG 1917
Query 1801 ATATCTTCGGAGGAAGCAATGGAAGATGTAAGCTTGAATGAAACTTCCGGTGGTGGAGAT 1860
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 1918 ATTTCTTCCGAGGAAGCAATGGAAGATGTAAGCTTGAATGAAACTTCCGATGGCGGAGAT 1977
Query 1861 GAAGAAGATGAAGAC------TGTTTGATTACAGAAAGCAAGAACCCTTTTGTTGACTCG 1914
|||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1978 GAAGAAGACGAAGACGAAGACTGTTTGATTACAGAAAGCAAGAACCCTTTTGTTGACTCA 2037
Query 1915 GCTGCAGCCACAGCCTCAACCTCAGAAGCAGTCTCTGTAGACGCTGATATCGAGATTGAC 1974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2038 ACTGCAGCCACAGCCTCAACCTCAGAAGCAGTCTCTGTAGACGCTGATATCGAGATTGAT 2097
Query 1975 GAAGATGTGGGTACAGATGAATTGTCACCGGAATGGATTGAACGTGGTGATTCATCTTCA 2034
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 2098 GAAGATGTGGGTACAGATGAATTGTCACCTGAATGGGTTGAACGTAATGATTCATCTTCA 2157
Query 2035 TCCGTTCCACCGGTCACTACAGATCCGTTCCCGGAAGATGATGTGAAGATGCCTGATGTG 2094
|| || |||||| | | | | | | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2158 GCCATTGCACCGGG-A--A--G-TAC--------A-GATGATGTGAAGATGCCTGATGTG 2202
Query 2095 AGAATCCCGAACGGTTCTTCATCCTCGGAAGGTGAGATTAGCCCAAGATCACCGCCCGTA 2154
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 2203 AGAATCCCAAACGGTTCTTCATCCTCAGAAGGTGAGATTAGCCCGAGATCACCGCCTGTA 2262
Query 2155 CCTTCATTGTTTGGAAAGGACGTTGAGTTTGTGGGAGTTGAGCCAGAAGGAACAGAAAGG 2214
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2263 CCTTCATTGTTTGGAAAAGATGTTGAGTTTGTGGGAGTTGAGCCAGAAGGAACTGAAAGG 2322
Query 2215 GCAATGGATCAAGCTCTCAAGGAAGGCATAGTGGGAGAAGCAGGGCCGATGAAGAGGAAC 2274
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2323 GCAATGGATCAAGCTCTCAAGGAAGGCATAGTGGGAGAAGCAGGACCGATGAAGAGGAAC 2382
Query 2275 ACCACCACAGCCTCACCGGGAAAGGATAGCCCCGATGATAGTATGCAGGAGTACAACGAC 2334
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2383 ACCACCACAGCCTCACCGGGAAAGGAGAGCCCTGATGATAGTATGCAGGAGTACAACGAC 2442
Query 2335 ACTAACTACTGGAAGGTTGATCAGGAGGTGACTGTAGTTGAATGA 2379
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ACTAACTACTGGAAGGTTGATCAGGAGGTGACTGTAGTTGAATGA 2487
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 118121882385
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5