BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg350453
Length=2583
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G12960.1 | Symbols: | Putative glycosyl hydrolase of unknow... 4152 0.0
AT5G12950.1 | Symbols: | Putative glycosyl hydrolase of unknow... 4032 0.0
> AT5G12960.1 | Symbols: | Putative glycosyl hydrolase of unknown
function (DUF1680) | chr5:4097701-4101668 FORWARD LENGTH=2835
Length=2835
Score = 4152 bits (2248), Expect = 0.0
Identities = 2475/2586 (96%), Gaps = 10/2586 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAAGTCTGGTGTCATCATAACCATTGCTCTGTTATTATTCACAAGCTTTGTTCTTGTT 60
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 103 ATGAAGTCTGGTGTGATCATAACCATTGCTCTGTTATTATACACAAGCTTTCTTCTTGTT 162
Query 61 TGTGTAGCGAAAGAGTGTACAGACATTCCTACCAAGCTCTCATCGCATACTTTGCGCAGC 120
||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 163 TGTCTGGCGAAAGAGTGTACAGACATTCCTACGAAGCTCTCATCGCATACTCTCCGCAGC 222
Query 121 GAGCTTCTGCAATCACAGAACG-AAACTTTGAAGACAGAGTTGTCCTCTCATTACCATTT 179
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||
Sbjct 223 GAGCTTCTGCAATCACAGAACGCAAA-TTTGAAGTCAGAGGAGTTCTCTCATTACCATTT 281
Query 180 AACTCCAACTGATGACGCCGCTTGGTCTACTTTGTTGCCAAGGAAGATGTTGAAAGAAGA 239
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282 AACTCCAACTGATGACTCTGCTTGGTCTACTTTGTTGCCAAGGAAGATGTTGAAAGAAGA 341
Query 240 GACGGATGATTTCGCTTGGACTATGTTGTATAGGAAGTTCAAGGACTCTAATTCCTCTGG 299
||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 342 GACTGATGATTTTGCTTGGACTATGTTGTATAGAAAGTTCAAGGACTCTAATTCCTCTGG 401
Query 300 TAACTTTCTCAAGGACGTCTCTTTGCACGACGTTAGGCTCGACCCCAGCTCCTTT-CATT 358
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||
Sbjct 402 TAACTTTCTCAAGGATGTCTCTTTGCACGACGTTAGGCTGGACCCGAGCT-CTTTCCATT 460
Query 359 GGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGAATGTTGATGGTTTGGCCT 418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 461 GGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGGATGTTGATGGTTTGGCCT 520
Query 419 ATAGCTTCCGTAAAGTTGCTGGTCTTGATGCTCCTGGAGTTCCCTATGGAGGATGGGAGA 478
||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 521 ATAACTTCCGTAAAGAAGCTGGTCTTAATGCTCCTGGAGTTCCCTATGGAGGATGGGAGA 580
Query 479 AACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAACAGCTTATA 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 AACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAACAGCTTATA 640
Query 539 TGTGGGCAAGTACTCATAATGATACTCTCAAGACGAAAATGTCAGCTCTTGTCTCTGCTT 598
||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 641 TGTGGGCAAGTACTCATAACGAAACTCTCAAGGCGAAAATGACAGCTCTTGTCTCAGCTC 700
Query 599 TAGCGGAATGCCAGCAAAAATCTGGCACAGGATATCTCTCTGCTTTTCCTTCCAGTTTTT 658
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 701 TAGCGGAATGCCAGCAGAAATATGGCACAGGATATCTCTCAGCTTTCCCTTCCAGTTTTT 760
Query 659 TCGACCGGTTTGAAGCTATAACACATGTTTGGGCTCCTTACTACACCATTCACAAGATTT 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 761 TCGACCGGTTTGAAGCTATAACACATGTTTGGGCTCCTTACTATACCATTCACAAGATTT 820
Query 719 TGGCCGGCCTGGTGGATCAATATAAGTTGGCTGGGAATACTCAAGCTTTAAAGATGGCAA 778
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 TGGCCGGCCTGGTGGATCAATACAAGTTGGCTGGGAATACTCAAGCTTTAAAGATGGCAA 880
Query 779 CAGGGATGGCTGATTACTTTTATGGCCGTGTTCAAAATGTGATAAGGAAGTACAGTGTTG 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 881 CAGGGATGGCTGATTACTTTTATGGCCGTGTTCAAAATGTGATAAAGAAGTACAGTGTTG 940
Query 839 AACGACATTGGCTATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCTTTATCAGC 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 AACGACATTGGCTATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCTTTATCAGC 1000
Query 899 TATACAGCATCACTCGAGATTCCAAGTATTTGTTTCTCGCACATCTCTTTGACAAGCCTT 958
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 TATACAGCATCACTAGAGATTCCAAGTATTTGTTTCTCGCACATCTCTTTGACAAGCCTT 1060
Query 959 GCTTTCTCGGGGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATTAGTGGATTCCACGCTAATACAC 1018
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1061 GCTTTCTCGGAGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATTAGTGGATTCCACGCTAATACAC 1120
Query 1019 ATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGATATGAAATCACTGGTGATCTACTCCATA 1078
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1121 ATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGGTATGAAATCACTGGTGATCTACTCCATA 1180
Query 1079 AGGAAATCTCGATGTTCTTTATGGACATAGTTAATGCTTCTCACAGCTATGCAACTGGAG 1138
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1181 AGGAAATCCCGATGTTCTTTATGGACATAGTTAATGCTTCACACAGCTATGCAACTGGAG 1240
Query 1139 GAACATCAGTCAAAGAGTTCTGGCAAGATCCAAAGAGAATGGCGACTACACTGCAAACTG 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1241 GAACATCAGTCAAAGAGTTCTGGCAAGATCCAAAGAGAATGGCGACTACGTTGCAAACTG 1300
Query 1199 AAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCTGTTCAGAT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301 AAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCTGTTCAGAT 1360
Query 1259 GGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGCGCTTTGACCAACGGTGTGCTTG 1318
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1361 GGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGCGCTTTGACCAACGGTGTGCTCG 1420
Query 1319 GAATTCAAAGAGGAACCCAACCCGGACGGATGATCTACATGCTCCCATTAGGTCAAGGTG 1378
||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 1421 GAATTCAAAGAGGAACCGATCCCGGACGGATGATCTACATGCTCCCATTGGGTAAAGGTG 1480
Query 1379 TTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTCTGGTGTTGCT 1438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1481 TTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTTTGGTGTTGCT 1540
Query 1439 ATGGCACTGGAATTGAATCCTTTTCAAAACTGGGAGATTCCATATATTTTCAAGAAGATG 1498
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1541 ATGGCACTGGAATTGAATCCTTCTCAAAACTGGGAGATTCCATATATTTTCAAGAAGATG 1600
Query 1499 GTGCATCTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATTGGAAATCTG 1558
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601 GTGCAACTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATTGGAAATCTG 1660
Query 1559 CTGGTCTTTTGCTATCTCAGAAAGTTAATCCTGTTGTGTCGTGGGATCCGTACATGCGTG 1618
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1661 CTGGTCTTTCAATATCTCAGAAAGTTAATCCTGTTGTGTCGTGGGATCCGTACATGCGTG 1720
Query 1619 TGACATTCACTCTTTCTTCTTCCAAAGTGGGAGTGGCGAAGAAGTCGACTTTGAATCTAA 1678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1721 TGACATTCACTCTTTCTTCTTCCAAAGTGGGAGTGGCGAAGGAGTCGACTTTGAATCTAA 1780
Query 1679 GAATTCCTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCCAAAGTATCTTTGAATGGGAAACCCTTAA 1738
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1781 GAATTCCTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCCAAAGTATCTTTGAATGGGCGACCCTTAA 1840
Query 1739 AAGTACCAACTTCAGGTAATTTCCTATCGATCAAACAGAACTGGAAATCTGGCGATCAAG 1798
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 1841 ACGTACCAACTTCAGGTAATTTCCTATCAATCAAACAGAAATGGAAATCTGGTGATCAAG 1900
Query 1799 TAACCATGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAGATGATCGTCCGGAGT 1858
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1901 TAACCATGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAGATGATCGGCCGGAGT 1960
Query 1859 ACGCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCCGGACACACGAGCAGGG 1918
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1961 ACGCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCTTACTTGTTAGCCGGACACACGAGCATGG 2020
Query 1919 ACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGAAATTGGATAACCCCTATACCTGAAACT- 1977
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2021 ACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGAAACTGGATAACCCCTATACCTGAAACTC 2080
Query 1978 TATAACAGTCACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACATATCTTACGTGTTGTCA 2037
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2081 T-TAACAGTCACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACATATCTTACGTGTTGTCA 2139
Query 2038 AATACCAACCAAACCATCACAATGAGGGTATCACCCGAGCTAGGGACACAAGATGCCGTT 2097
|| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||
Sbjct 2140 AACAGCAACCAAACCATCATAATGAAAGTATCACCCGAGCCAGGGACACAAGACGCTGTT 2199
Query 2098 GCAGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTCTAAACCA-CGGATATCGGGTCCAGAGGC 2156
| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| ||| |||||||||
Sbjct 2200 TCGGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATGATTCTAAAC-ATCCGATTTCGAGTCCAGAGGG 2258
Query 2157 ACTAATTGGAAGCCTGGTCATGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCTGGCATGATTGTAAAGCA 2216
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2259 ACTAATTGGAAGCCTTGTCATGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCTGGCATGATCGTAAAGCA 2318
Query 2217 AGCAACTGATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGACAAAGGAGCTTCTAG 2276
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2319 AGCAACTGATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGACAAAGGATCTTCTAG 2378
Query 2277 CTTTCGGTTAGTATCTGGAGTTGATGGGAAGCCAGGAAGCGTGTCGTTAAGACTAGAGAG 2336
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2379 CTTTCGGTTAGTATCTGGACTTGACGGGAAGCCAGGAAGCGTGTCGTTAAGCCTAGAGAG 2438
Query 2337 CAACAATGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACACTAAAGCAGGGGACGAAACTAAAGCT 2396
||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 2439 CAAAAAGGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACATTAAAGCAAGGGACGAAACTAAGGCT 2498
Query 2397 TGAATGTGGTCCGGTTGCGACTGATGAGAAGTTTAAACAGGCAGCAAGCTTTAAGTT-AA 2455
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 2499 TGAATGTGGTTCGGCTGCGACTGATGAGAAGTTTAAACAGGCAGCAAGCTTTA-GTTTAA 2557
Query 2456 ACACAGGAATAAATCAATACAATCCAATGAGTTTTGTGATGAGCGGAACACAGAGGAACT 2515
| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2558 AGACAGGAATGAATCAATACAATCCAATGAGTTTCGTGATGAGCGGAACACAGAGGAACT 2617
Query 2516 TTGTGTTATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGTGTACTTCAGTGTGC 2575
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2618 TTGTGCTATCGCCATTGTTTAGCCTAAGAGATGAAACATACAATGTGTACTTCAGTGTGC 2677
Query 2576 AAACTT 2581
|| |||
Sbjct 2678 AAGCTT 2683
> AT5G12950.1 | Symbols: | Putative glycosyl hydrolase of unknown
function (DUF1680) | chr5:4092953-4096975 FORWARD LENGTH=2919
Length=2919
Score = 4032 bits (2183), Expect = 0.0
Identities = 2461/2594 (95%), Gaps = 23/2594 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAAGTCTGGTGTCATCATAACCATTGCTCTGTTATTATTCAC-A--AGCTTTGTTCTT 57
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||
Sbjct 165 ATGAAGTCTGGTCTCATCATAACCATTGCTCTGTTACTATACACAAGCAGCTTTGTTCTT 224
Query 58 GTTTGTGTAGCGAAAGAGTGTA-CAGACATTCCTAC-CAAGCTCTCATCGCATACTTTGC 115
|||| ||||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||||||| |||||||| |
Sbjct 225 GTTTCTGTAGCGAAAGAGTGTACCA-ACACTCCTACGC-AGCTCTCATCCCATACTTTCC 282
Query 116 GCAGCGAGCTTCTGCAATCACAGAACGAAACTTTGAAGACAGAGTTGTCCTCTCATTACC 175
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 283 GCAGCGAGCTTCTGCAATCAAAGAACGAAACTTTGAAGACAGAGTTGTTCTCTCATTACC 342
Query 176 ATTTAACTCCAACTGATGACGCCGCTTGGTCTACTTTGTTGCCAAGGAAGATGTTGAAAG 235
||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 ATTTAACTCCAGCTGATGACTCTGCTTGGTCTAGTTTATTGCCAAGGAAGATGTTGAAAG 402
Query 236 AAGAGACGGATG-ATTTCGCTTGGACTATGTTGTATAGGAAGTTCAAGGACTCTAATTCC 294
||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 403 AAGAGGCAGATGAATTT-GCTTGGACTATGTTGTATAGGAAGTTCAAGGACTCTAATTCC 461
Query 295 TCTGGTAACTTTCTCAAGGACGTCTCTTTGCACGACGTTAGGCTCGACCCCAG-CTCCTT 353
|||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 462 TCTGGTAACTTTCTTAAAGATGTCTCTTTGCACGACGTTAGGCTCGA-CCCAGACTCCTT 520
Query 354 TCATTGGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGAATGTTGATGGTTT 413
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 521 TCATTGGAGGGCTCAGCAGACAAACCTTGAGTATCTATTGATGTTGGATGTTGATGGTTT 580
Query 414 GGCCTATAGCTTCCGTAAAGTTGCTGGTCTTGATGCTCCTGGAG-TTCCCTATGGAGGAT 472
||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||
Sbjct 581 GGCCTGGAGCTTCCGTAAAGAAGCTGGTCTTGATGCACCTGGAGATT-ACTATGGAGGAT 639
Query 473 GGGAGAAACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAACAG 532
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 640 GGGAGAGACCAGATAGTGAACTCCGTGGCCATTTTGTCGGTCACTATTTGAGTGCAACAG 699
Query 533 CTTATATGTGGGCAAGTACTCATAATGATACTCTCAA-GACGAAAATGTCAGCTCTTGTC 591
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 700 CTTATATGTGGGCTAGTACTCATAATGATACTCTCAAGGA-GAAAATGTCAGCTCTTGTC 758
Query 592 TCTGCTTTAGCGGAATGCCAGCAAAAATCTGGCACAGGATATCTCTCTGCTTTTCCTTCC 651
|| ||| || |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 759 TCAGCTCTATCGGAATGCCAACAGAAGTCTGGCACAGGATATCTCTCTGCTTTTCCTTCC 818
Query 652 AGTTTTTTCGACCGGTTTGAAGCTATAACACATGTTTGGGCTCCTTACTACACCATTCAC 711
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 819 AGTTTTTTCGACCGCTTTGAAGCTATAACACCTGTTTGGGCTCCTTACTACACCATTCAC 878
Query 712 AAGATTTTGGCCGGCCTGGTGGATCAATATAAGTTGGCTGGGAATACTCAAGCTTTAAAG 771
|||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 879 AAGATTTTAGCTGGTCTGGTTGATCAATACAAGTTGGCTGGGAACAGTCAAGCTTTAAAG 938
Query 772 ATGGCAACAGGGATGGCTGATTACTTT-TATGGCCGTGTTCAAAATGTGATAAGGAAGTA 830
|||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 939 ATGGCAACCGGGATGGCTGATTA-TTTCTATGGCCGTGTTCGTAATGTGATAAGGAAGTA 997
Query 831 CAGTGTTGAACGACATTGGCTATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCT 890
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 CAGTGTTGAACGACATTGGCAATCACTAAACGAAGAGACTGGTGGCATGAATGATGTTCT 1057
Query 891 TTATCAGCTATACAGCATCACTCGAGATTCCAAGTATTTGTTTCTCGCACATCTCTTTGA 950
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 1058 TTATCAGCTATACAGCATCACTGGAGATTCCAAGTATTTGCTGCTCGCACATCTCTTTGA 1117
Query 951 CAAGCCTTGCTTTCTCGGGGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATTAGTGGATTCCACGC 1010
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1118 CAAGCCTTGCTTTCTCGGAGTCCTCGCAATTCAGGCCGATGATATTAGTGGATTCCACGC 1177
Query 1011 TAATACACATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGATATGAAATCACTGGTGATCT 1070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 TAATACACATATTCCCATCGTCGTTGGATCCCAACAACGGTATGAAATCACTGGTGATCT 1237
Query 1071 ACTCCATAAGGAAATCTCGATGTTCTTTATGGACATAGTTAATGCTTCTCACAGCTATGC 1130
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238 ACTCCATAAGGAAATCTCGATGTTCTTTATGGACATTTTTAATGCTTCTCACAGCTATGC 1297
Query 1131 AACTGGAGGAACATCAGTCAAAGAGTTCTGGCAAGATCCAAAGAGAATGGCGACTACACT 1190
||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct 1298 AACAGGAGGAACATCAGTCAGTGAGTTCTGGCAAGATCCCAAGAGAATGGCGACTGCACT 1357
Query 1191 GCAAACTGAAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCT 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358 GCAAACTGAAAACGAGGAATCATGTACTACTTATAACATGCTCAAGGTCTCTAGGAATCT 1417
Query 1251 GTTCAGATGGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGCGCTTTGACCAACGG 1310
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1418 GTTCAGATGGACAAAAGAGGTTAGCTATGCAGACTATTACGAGCGCGCCTTGACCAACGG 1477
Query 1311 TGTGCTTGG-AATTCAAAGAGGAACCCAACCCGGACGGATGATCTACATGCTCCCATTAG 1369
||| |||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 CGTG-TTGGGAATTCAAAGAGGAACCCAGCCTGGACTGATGATCTACATGCTCCCATTAG 1536
Query 1370 GTCAAGGTGTTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTCT 1429
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1537 GTAAAGGTGTTTCTAAGGCTGTGACTTATCACGGTTGGGGAACACCTTATGATTCCTTCT 1596
Query 1430 GGTGTTGCTATGGCACTGGAATTGAATCCTTTTCAAAACTGGGAGATTCCATATATTTTC 1489
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1597 GGTGTTGCTATGGCACTGGAATTGAATCCTTCTCAAAACTGGGAGATTCCATATATTTTC 1656
Query 1490 AAGAAGATGGTGCATCTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATT 1549
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1657 AAGAAGATGGTGCAACTCCAGCTCTTTATGTCACCCAATATATATCAAGCTCACTTGATT 1716
Query 1550 GGAAATCTGCTGGTCTTTTGCTATCTCAGAAAGTTAATCCTGTTGTGTCGTGGGATCCGT 1609
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1717 GGAAATCTGCTGGTCTTTCAATATCTCAGAAAGTTAATCCTGTTGTGTCGTGGGATCCGT 1776
Query 1610 ACATGCGTGTGACATTCACTCTTTCTTCTTCCAAAGTGGGAGTGGCGAAGAAGTCGACTT 1669
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1777 ACATGCGTGTGACATTCACTCTTTCTTCTTCCAAAGTGGGAGTGGCGAAGGAGTCGACTT 1836
Query 1670 TGAATCTAAGAATTCCTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCCAAAGTATCTTTGAATGGGA 1729
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1837 TGAATCTAAGAATTCCTGTTTGGACTAACTCTATAGGTGCCAAAGTATCTTTGAATGGGC 1896
Query 1730 AACCCTTAAAAGTACCAACTTCAGGTAATTTCCTATCGATCAAACAGAACTGGAAATCTG 1789
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1897 GACCCTTAAACGTACCAACTTCAGGTAATTTCCTATCAATCAAACAGAAATGGAAATCTG 1956
Query 1790 GCGATCAAGTAACCATGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAGATGATC 1849
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1957 GTGATCAAGTAACCATGGAGCTACCAATGAGTATCAGAACCGAAGCTATAAAAGATGATC 2016
Query 1850 GTCCGGAGTACGCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCCGGACACA 1909
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2017 GGCCAGAGTACGCATCTCTTCAAGCCATACTCTATGGCCCCTACTTGTTAGCCGGACACA 2076
Query 1910 CGAGCAGGGACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAAGCTGGAAATTGGATAACCCCTATAC 1969
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2077 CGAGCAGGGACTGGAGCATCACAACTCAGGCTAAACCTGGAAAATGGATAACCCCTATAC 2136
Query 1970 CTGAAACTTATAACAGTCACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACATATCTTACG 2029
|||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2137 CTGAAACTCAAAACAGTTACCTTGTCACACTCTCACAACAATCTGGAAACGTATCTTACG 2196
Query 2030 TGTTGTCAAATACCAACCAAACCATCACAATGAGGGTATCACCCGAGCTAGGGACACAAG 2089
|||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2197 TGTTTTCAAATAGCAACCAAACCATCACAATGAGAGTATCACCCGAGCCAGGGACACAAG 2256
Query 2090 ATGCCGTTGCAGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTCTAAACCACGGATATCGGGTC 2149
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2257 ATGCCGTTGCAGCGACTTTCAGGCTCGTGACTGATAATTCTAAACCACGGATTTCGGGTC 2316
Query 2150 CAGA-GGCACTAATTGGAAGCCTGGTCATGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCTGGCATGATT 2208
|||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2317 CAGAAGG-ACTAATTGGAAGGCTGGTCATGCTTGAGCCGTTTGATTTCCCTGGCATGATT 2375
Query 2209 GTAAAGCAAGCAACTGATAGCTCCCTCACGGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGACAAAGGA 2268
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2376 GTAAAGCAAGCAACTGATAGCTCCCTCACAGTTCAAGCTTCTTCTCCTAGTGACAAAGGA 2435
Query 2269 GCTTCTAGCTTTCGGTTAGTATCTGGAGTTGATGGGAAGCCAGGAAGCGTGTCGTTAAGA 2328
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 2436 GCTTCTAGCTTTCGGTTAGTATCTGGACTTGACGGGAAGCTAGGAAGCGTTTCGTTAAGA 2495
Query 2329 CTAGAGAGCAACAATGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACACTAAAGCAGGGGACGAAA 2388
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||
Sbjct 2496 CTAGAGAGCAAAAAAGGTTGTTTTGTGTACAGCGATCAAACCCTAAAGCAAGGGACAAAA 2555
Query 2389 CTAAAGCTTGAATGTGGTCCGGTTGCGACTGATGAGAAGTTTAAACAGGCAGCAAGCTTT 2448
|||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2556 CTAAGGCTAGAATGTGGTTCGGATGCGACTGATGAGAAGTTTAAAGAGGCAGCAAGCTTT 2615
Query 2449 AAGTT-AAACACAGGAATAAATCAATACAATCCAATGAGTTTTGTGATGAGCGGAACACA 2507
| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2616 A-GTTTAAAGACAGGAATGCATCAATACAATCCAATGAGTTTCGTGATGAGCGGAACACA 2674
Query 2508 GAGGAACTTTGTGTTATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGTGTACTT 2567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2675 GAGGAACTTTGTGTTATCGCCATTGTTTAGCTTAAGAGATGAAACATACAATGTGTACTT 2734
Query 2568 CAGTGTGCAAACTT 2581
||||||||||||||
Sbjct 2735 CAGTGTGCAAACTT 2748
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 128226706308
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5