BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg351066 Length=3087 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G19660.1 | Symbols: ATSBT6.1, S1P, ATS1P | SITE-1 protease |... 4874 0.0 > AT5G19660.1 | Symbols: ATSBT6.1, S1P, ATS1P | SITE-1 protease | chr5:6642004-6646530 REVERSE LENGTH=3343 Length=3343 Score = 4874 bits (2639), Expect = 0.0 Identities = 2909/3038 (96%), Gaps = 24/3038 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGAAGGTGCTCGGAGGAGCTTCTTCATATGCTTACAGATCCTGTATCCTCGTCAGT-TT 59 |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || Sbjct 113 ATGAAGGTGCTCGGAGAAGCTTCTTCATATCCTTACAGATCCTGTATCATCGTC-GTATT 171 Query 60 CCTCTCCGTTTCTCTCTTCTGGCTCTGTCCCAGCACTTACCGTCCCCAGCACCAAAATCT 119 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct 172 TCTCTCCGTTTCTCTCTTCTGGCTCCGTCCCAGCACTTACCATCCCCAGCAACAAAATCT 231 Query 120 CAATCC-GCAGAACGTAACT-GATTCGGAGTCTGAGACGGCAACGAAGACTAACTATATA 177 |||||| | ||||||||||| | || ||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct 232 CAATCCAG-AGAACGTAACTCG-TTTGGAGTCTGAGAATGAAACGAAGACTAACTATATA 289 Query 178 ATCCGATTTAAGCAGTATAAGCCGGCGAAAGATCATCGAATTTACCTCAAATCGAAGGTC 237 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 290 ATCCGATTTAAGCAGTATAAGCCGGCGAAAGATCATCGAATTTACCTCGAATCGAAGGTC 349 Query 238 CGATCTAGCGGTTGGGGTTGGATCGAGAGGATCAATCCGGCGGCGAAGTATCCGACTGAC 297 ||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| Sbjct 350 CGATCCGGTGGTTGGGGTTGGATCGAGAGGATTAACCCGGCGACGAAGTATCCGACTGAC 409 Query 298 TTCGGTGTTCTATGGATCGAGGAAAGCGAGAAAGATGCTGTTGTTGGAGAGATTGAGAGG 357 |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| Sbjct 410 TTCGGTGTTCTATGGATCGAGGAAAGCGGGAAAGAGGCCGTGGTTGGAGAGATTGAGAGG 469 Query 358 CTGGAGATGGTGAAAGACGTGAACGTTGAGTTTAAGTACCAAAGATTTTTGCTTGGAGGA 417 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct 470 CTGGAGATGGTGAAAGACGTGAACGTTGAGTTTAAGTACCAGAGAGTTTTGCTTGGAGGA 529 Query 418 TCTTTTCTCGACGAGAAGAAACGTCCGGGGAAGATCTTCACTTCTATGTCTTTCGAAGAA 477 ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 530 TCTTTTCCCGACGGGAAGAAACGTCCGGGGAAGATCTTCACTTCTATGTCTTTCGAAGAA 589 Query 478 GGAACCGATTCTTCGCCTATGGCGGATACAAGTAACACCACGTTAAACTGGAGTCGACAT 537 ||||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 590 GGAACTGAGTCCTCTCCTATGGCCGATACAAGTAACACCACGTTAAACTGGAGTCGACAT 649 Query 538 CTTCTTGCTCAGAAGACTCAAGTAACGTCCATGTTTGGAGCAGATCATCTCTGGAAGAAG 597 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 650 CTTCTCGCTCAGAAGACTCAAGTCACGTCCATGTTTGGAGCAGATCATCTCTGGAAGAAG 709 Query 598 GGGTACACTGGTGCTAAAGTTAAAATGGCTATATTTGATACCGGAATAAGAGCTGACCAC 657 || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct 710 GGTTACACCGGCGCTAAAGTTAAAATGGCTATATTTGATACTGGAATAAGAGCTGATCAC 769 Query 658 CCACATTTCCGTAGGATCAAGGAGCGTACGAATTGGACAAATGAGGACACTTTGAATGAC 717 || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 770 CCTCATTTTCGTAAGATCAAGGAGCGTACGAATTGGACAAATGAGGACACTTTGAATGAC 829 Query 718 AACCTGGGCCATGGGACATTTGTTGCTGGTGTTATTGCTGGTCAAAATTCAGAATGTCTT 777 |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| Sbjct 830 AACCTGGGTCATGGGACGTTTGTTGCTGGTGTTATTGCTGGTCGAAATCCAGAATGTCTT 889 Query 778 GGTTTTGCCTCAGACACGGAAATCTATGCTTTTCGAGTGTTCACAGATGCCCAGGTATCA 837 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 890 GGTTTTGCCTCAGACACGGAAATCTATGCTTTTCGAGTGTTCACAGATGCCCAGGTATCA 949 Query 838 TACACCTCATGGTTTCTTGATGCTTTCAATTATGCTATAGCAACAGATATGGATGTATTA 897 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 950 TACACCTCATGGTTTCTTGATGCTTTCAATTATGCTATAGCAACAGATATGGATGTATTA 1009 Query 898 AATTTGAGCATTGGGGGACCGGATTACTTGGATCTGCCTTTTGTAGAGAAGGTTTGGGAA 957 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1010 AATTTGAGCATTGGGGGACCGGATTACTTGGATCTGCCTTTTGTAGAGAAGGTTTGGGAA 1069 Query 958 ATAACAGCCAGCAATATCATTATGGTGTCTGCAATTGGAAATGATGGGCCACTTTACGGA 1017 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1070 ATAACAGCCAGCAATATCATTATGGTGTCTGCAATTGGAAATGATGGGCCACTTTACGGA 1129 Query 1018 ACGTTAAATAATCCAGCTGACCAGAGTGATGTCATAGGTGTCGGTGGTATTGACTATGAT 1077 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct 1130 ACGTTAAATAATCCAGCTGACCAGAGTGATGTAATAGGTGTCGGAGGTATTGACAATGAT 1189 Query 1078 GATCACATAGCTTCATTTTCATCTCGTGGCATGAGCACCTGGGAACTTCCTCATGGATAT 1137 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1190 GATCACATAGCTTCATTCTCATCTCGTGGCATGAGCACCTGGGAACTTCCTCATGGATAT 1249 Query 1138 GGCCGTGTGAAACCAGATGTGGTTGCATATGGCCGTGACATTATGGGCTCCAAGATCAGC 1197 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1250 GGCCGTGTGAAACCAGATGTGGTTGCATATGGCCGCGACATTATGGGGTCCAAGATCAGC 1309 Query 1198 ACTGGTTGTAAAAGCTTGTCTGGAACAAGTGTGGCTAGTCCTGTTGTTGCTGGTATTGTT 1257 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1310 ACTGGTTGTAAAAGCCTGTCTGGAACAAGTGTGGCTAGTCCTGTTGTTGCTGGTATTGTT 1369 Query 1258 TGCCTGCTTGTAAGTGTTATTCCTGAAGCTAGAAGGAAAGATCTGCTCAATCCAGCAAGC 1317 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1370 TGCCTACTTGTAAGTGTTATTCCTGAAGCTAGAAGGAAGGATCTGCTCAATCCAGCAAGC 1429 Query 1318 ATGAAGCAGGCGTTAGTTGAAGGTGCTGCTAAGCTTTCAGGTCCTAATATGTATGAGCAG 1377 ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1430 ATGAAGCAGGCATTGGTCGAAGGTGCTGCTAAGCTTTCAGGTCCTAATATGTATGAACAG 1489 Query 1378 GGTGCAGGAAGAGTTGATCTATTAGAATCATATGAAATTCTAAAGAGCTACCACCCCCGG 1437 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1490 GGTGCTGGAAGAGTTGATCTATTAGAATCATATGAAATTCTAAAGAGCTACCACCCCCGG 1549 Query 1438 GCGAGCATTTTCCCGAGCATTCTTGATTATAGTGATTGTCCATATTCCTGGCCCTTTTGT 1497 || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1550 GCAAGCATTTTCCCGAGCATTCTTGATTATAATGATTGTCCATATTCCTGGCCCTTTTGT 1609 Query 1498 CGTCAACCACTATATGC-GGGTGCTATGCCTGTTATTTTCAACACGACAATTCTTAATGG 1556 ||||| || |||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1610 CGTCAGCCGCTATATGCCGGG-GCTATGCCCATCATTTTCAACACGACAATTCTTAATGG 1668 Query 1557 TATGGGTGTTATTGGCTATATTGAAAGTCCACCAACATGGCATCCTGCAAACGAGGAAGG 1616 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1669 TATGGGTGTCATTGGCTATATTGAAAGTCCACCAACATGGCACCCTGCAAACGAGGAAGG 1728 Query 1617 AAATCTTCTGAGCATCCACTTTAAGTACACAGATGTCATATGGCCGTGGACTGGTTATCT 1676 ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1729 AAATCTTCTGAGCATTCACTTTAAGTACCCGGATGTTATATGGCCGTGGACTGGTTATCT 1788 Query 1677 AGCTTTACACATGCAGATCAAGGAAGAAGGTGCACAGTTCACAGGTGAGATAGAAGGTAA 1736 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 1789 AGCTCTACACATGCAGATCAAGGAAGAAGGTGCACAGTTCACAGGTGAAATAGAGGGTAA 1848 Query 1737 TGTAACTGTGAAAGTCTATAGCCCATCAGCCCCTGGAGAAAGTGGGCGTAGAAGGAGTAC 1796 ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1849 TGTAACTGTGAAAGTCTATAGCCCACCAGCCTCTGGAGAAAGTGGGCCTAGAAGGAGTAC 1908 Query 1797 TTGTTCTCTTCAGTTAAAACTGAAAGTGATTCCCACTCCACCACGAGCGAAACGTATTTT 1856 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1909 TTGTTCTCTTCAGTTGAAACTGAAAGTGATTCCCACTCCACCACGAGCGAAACGTATTTT 1968 Query 1857 GTGGGATCAATTTCACAGCATTAAATATCCTCCTGGTTATATTCCAAGAGACTCTTTGGA 1916 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1969 GTGGGATCAATTTCACAGCATTAAATATCCTCCTGGTTATATTCCAAGAGACTCTTTGGA 2028 Query 1917 TGTCCGCAATGACATACTTGATTGGCATGGTGATCACCTGCATACAAACTTTCACATCAT 1976 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2029 TGTCCGCAATGACATACTTGATTGGCATGGTGATCACCTGCATACAAACTTTCACATCAT 2088 Query 1977 GTACAACATGTTACGCGATGCTGGGTACTATATCGAGACTCTTGGTTCGCCCCTTACATG 2036 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2089 GTACAACATGTTACGTGATGCTGGGTACTATATCGAGACTCTTGGTTCGCCCCTTACATG 2148 Query 2037 TTTTGATGCTCAGCAATATGGAACCCTTTTGATGGTTGACCTTGAAGATGATTACTTTCC 2096 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2149 TTTTGATGCTCAGCAATATGGAACCCTTTTGATGGTTGACCTTGAAGATGATTACTTTCC 2208 Query 2097 AGAAGAAATTGAAAAACTCAGAGATGACGTTATCAATACTGGACTGGGTCTGGTTGTGTT 2156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2209 AGAAGAAATTGAAAAACTCAGAGATGACGTTATCAATACTGGACTGGGTCTGGTTGTGTT 2268 Query 2157 TGCTGAGTGGTATAATGTCGATACCATGGTGAAGATGAGATTCTTCGATGATAACACACG 2216 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2269 TGCTGAGTGGTATAATGTCGATACCATGGTGAAGATGAGATTCTTCGATGATAACACACG 2328 Query 2217 CAGTTGGTGGACTCCAGTCACTGGAGGTGCAAATATCCCCGCACTTAATAACCTTCTTGC 2276 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2329 CAGTTGGTGGACTCCAGTCACTGGAGGTGCAAATATCCCAGCACTTAATAACCTTCTTGC 2388 Query 2277 ATCATTTGGGATTGCGTTTGGAGACAAAATTCTGAATGGGGATTTCAGTATTGACGGTGA 2336 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2389 ATCATTTGGGATTGCGTTTGGGGACAAAATTCTGAATGGGGATTTCAGTATTGACGGTGA 2448 Query 2337 GCAGAGTCGATATGCTTCTGGAACAAACATAGTCCGGTTTCCTGCTGGTGGGTTTTTGCA 2396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2449 GCAGAGTCGATATGCTTCTGGAACAAACATAGTCCGGTTTCCTGCTGGTGGGTTTTTGCA 2508 Query 2397 CACTTTTCCTTTACTAGACAGCTCTGAGAGTGGCGCTACACAAAATCTACTGCTAACTG- 2455 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2509 CACTTTTCCTTTATTAGACAGCTCTGAGAGTGGCGCTACCCAAAATCTACTGCTAACTGA 2568 Query 2456 GGTCATCAAAGGAAGACCCTGCTGTTCTTGGGCTTTTGGAGATTGGTGAAGGTCGGGTTG 2515 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2569 GG-CATCAAAGGAAGACCCTGCTGTTCTTGGGCTTTTGGAGATTGGTGAAGGTCGGGTTG 2627 Query 2516 GTGTTTATGGAGACTCAAACTGCCTGGACAGTAGCCACATGGTCACCAACTGCTACTGGC 2575 |||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2628 GTGTATATGGAGACTCAAATTGTTTGGATAGTAGCCACATGGTCACCAACTGCTACTGGC 2687 Query 2576 TCCTGAAGAAAATGCTAGATTTTAGCAGTTCAAAAATCAAAGATCCTGTACTTTTCTCAA 2635 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2688 TCCTGAAGAAAATGCTAGATTTTAGCAGTTCAAATATCAAAGACCCTGTACTTTTCTCAA 2747 Query 2636 AATTTGCTAAGAGATATTCACCCGTAATCATAGACGAGAAGCAACTGCCATCCCGAAGAA 2695 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2748 AATTTGCTAAGAGATATTCACCAGTAATCATAGACGAGAAGCAACTGCCATCCCGAAGAA 2807 Query 2696 CTGATGTAAATTTTTCAACATACTCTTCTGTGATCGGAAAGGAGCTAATCTGTGAGAGTG 2755 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2808 CTGATGTAAATTTTTCAACATACTCTTCTGTGATCGGAAAGGAGCTAATCTGTGAGAGTG 2867 Query 2756 ACTCCAGATTTGAAGTATGGGGGACTAAAGGATATAACTTACATGTCAGAGGAAGGAACC 2815 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2868 ACTCCAGATTTGAAGTATGGGGGACTAAAGGATATAACTTACATGTCAGAGGAAGGAATC 2927 Query 2816 GTAGATTACCCGGTTATCATGGCATTGATTTGGGTCGAGGCTTGAATTTCACATTGGAGA 2875 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2928 GTAGATTACCCGGTTATCATGGCATTGATTTGGGTAGAGGCTTGAATTTCACAGTGGAGA 2987 Query 2876 A-AACAAGACCAACTCGTTGGAGATCAG----G--------TGAGCTTAGTTCTTCCAGG 2922 || ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct 2988 GTAA-AAGACCAACGCGTTGGAGATCAGCCAAGGAAGGAGGTGAGCTTAGTTCTTCCAGG 3046 Query 2923 AGCAAGTATCTGGGAGGCTTTTTCAGCAAAGACGAGATTGACATGCCATTTCTCGTTGCT 2982 ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct 3047 AGCAAGTCTCTGGGAGGCCTTTTCAATAGAGACGAGATTGACATGCCATTTCTTGTTCCT 3106 Query 2983 ACTCGCTGGATTGTACTTGCTGGTGTTGTAGCTAGTGG 3020 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3107 ACTCGCTGGATCGTACTTGCTGGTGTTGTAGCTAGTGG 3144 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 153510845580 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5