BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg351066
Length=3087
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G19660.1 | Symbols: ATSBT6.1, S1P, ATS1P | SITE-1 protease |... 4874 0.0
> AT5G19660.1 | Symbols: ATSBT6.1, S1P, ATS1P | SITE-1 protease
| chr5:6642004-6646530 REVERSE LENGTH=3343
Length=3343
Score = 4874 bits (2639), Expect = 0.0
Identities = 2909/3038 (96%), Gaps = 24/3038 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAAGGTGCTCGGAGGAGCTTCTTCATATGCTTACAGATCCTGTATCCTCGTCAGT-TT 59
|||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||
Sbjct 113 ATGAAGGTGCTCGGAGAAGCTTCTTCATATCCTTACAGATCCTGTATCATCGTC-GTATT 171
Query 60 CCTCTCCGTTTCTCTCTTCTGGCTCTGTCCCAGCACTTACCGTCCCCAGCACCAAAATCT 119
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 172 TCTCTCCGTTTCTCTCTTCTGGCTCCGTCCCAGCACTTACCATCCCCAGCAACAAAATCT 231
Query 120 CAATCC-GCAGAACGTAACT-GATTCGGAGTCTGAGACGGCAACGAAGACTAACTATATA 177
|||||| | ||||||||||| | || ||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 232 CAATCCAG-AGAACGTAACTCG-TTTGGAGTCTGAGAATGAAACGAAGACTAACTATATA 289
Query 178 ATCCGATTTAAGCAGTATAAGCCGGCGAAAGATCATCGAATTTACCTCAAATCGAAGGTC 237
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 290 ATCCGATTTAAGCAGTATAAGCCGGCGAAAGATCATCGAATTTACCTCGAATCGAAGGTC 349
Query 238 CGATCTAGCGGTTGGGGTTGGATCGAGAGGATCAATCCGGCGGCGAAGTATCCGACTGAC 297
||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 350 CGATCCGGTGGTTGGGGTTGGATCGAGAGGATTAACCCGGCGACGAAGTATCCGACTGAC 409
Query 298 TTCGGTGTTCTATGGATCGAGGAAAGCGAGAAAGATGCTGTTGTTGGAGAGATTGAGAGG 357
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||
Sbjct 410 TTCGGTGTTCTATGGATCGAGGAAAGCGGGAAAGAGGCCGTGGTTGGAGAGATTGAGAGG 469
Query 358 CTGGAGATGGTGAAAGACGTGAACGTTGAGTTTAAGTACCAAAGATTTTTGCTTGGAGGA 417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 470 CTGGAGATGGTGAAAGACGTGAACGTTGAGTTTAAGTACCAGAGAGTTTTGCTTGGAGGA 529
Query 418 TCTTTTCTCGACGAGAAGAAACGTCCGGGGAAGATCTTCACTTCTATGTCTTTCGAAGAA 477
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 530 TCTTTTCCCGACGGGAAGAAACGTCCGGGGAAGATCTTCACTTCTATGTCTTTCGAAGAA 589
Query 478 GGAACCGATTCTTCGCCTATGGCGGATACAAGTAACACCACGTTAAACTGGAGTCGACAT 537
||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 GGAACTGAGTCCTCTCCTATGGCCGATACAAGTAACACCACGTTAAACTGGAGTCGACAT 649
Query 538 CTTCTTGCTCAGAAGACTCAAGTAACGTCCATGTTTGGAGCAGATCATCTCTGGAAGAAG 597
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 650 CTTCTCGCTCAGAAGACTCAAGTCACGTCCATGTTTGGAGCAGATCATCTCTGGAAGAAG 709
Query 598 GGGTACACTGGTGCTAAAGTTAAAATGGCTATATTTGATACCGGAATAAGAGCTGACCAC 657
|| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 710 GGTTACACCGGCGCTAAAGTTAAAATGGCTATATTTGATACTGGAATAAGAGCTGATCAC 769
Query 658 CCACATTTCCGTAGGATCAAGGAGCGTACGAATTGGACAAATGAGGACACTTTGAATGAC 717
|| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 770 CCTCATTTTCGTAAGATCAAGGAGCGTACGAATTGGACAAATGAGGACACTTTGAATGAC 829
Query 718 AACCTGGGCCATGGGACATTTGTTGCTGGTGTTATTGCTGGTCAAAATTCAGAATGTCTT 777
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 830 AACCTGGGTCATGGGACGTTTGTTGCTGGTGTTATTGCTGGTCGAAATCCAGAATGTCTT 889
Query 778 GGTTTTGCCTCAGACACGGAAATCTATGCTTTTCGAGTGTTCACAGATGCCCAGGTATCA 837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 890 GGTTTTGCCTCAGACACGGAAATCTATGCTTTTCGAGTGTTCACAGATGCCCAGGTATCA 949
Query 838 TACACCTCATGGTTTCTTGATGCTTTCAATTATGCTATAGCAACAGATATGGATGTATTA 897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 950 TACACCTCATGGTTTCTTGATGCTTTCAATTATGCTATAGCAACAGATATGGATGTATTA 1009
Query 898 AATTTGAGCATTGGGGGACCGGATTACTTGGATCTGCCTTTTGTAGAGAAGGTTTGGGAA 957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010 AATTTGAGCATTGGGGGACCGGATTACTTGGATCTGCCTTTTGTAGAGAAGGTTTGGGAA 1069
Query 958 ATAACAGCCAGCAATATCATTATGGTGTCTGCAATTGGAAATGATGGGCCACTTTACGGA 1017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1070 ATAACAGCCAGCAATATCATTATGGTGTCTGCAATTGGAAATGATGGGCCACTTTACGGA 1129
Query 1018 ACGTTAAATAATCCAGCTGACCAGAGTGATGTCATAGGTGTCGGTGGTATTGACTATGAT 1077
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 1130 ACGTTAAATAATCCAGCTGACCAGAGTGATGTAATAGGTGTCGGAGGTATTGACAATGAT 1189
Query 1078 GATCACATAGCTTCATTTTCATCTCGTGGCATGAGCACCTGGGAACTTCCTCATGGATAT 1137
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1190 GATCACATAGCTTCATTCTCATCTCGTGGCATGAGCACCTGGGAACTTCCTCATGGATAT 1249
Query 1138 GGCCGTGTGAAACCAGATGTGGTTGCATATGGCCGTGACATTATGGGCTCCAAGATCAGC 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1250 GGCCGTGTGAAACCAGATGTGGTTGCATATGGCCGCGACATTATGGGGTCCAAGATCAGC 1309
Query 1198 ACTGGTTGTAAAAGCTTGTCTGGAACAAGTGTGGCTAGTCCTGTTGTTGCTGGTATTGTT 1257
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1310 ACTGGTTGTAAAAGCCTGTCTGGAACAAGTGTGGCTAGTCCTGTTGTTGCTGGTATTGTT 1369
Query 1258 TGCCTGCTTGTAAGTGTTATTCCTGAAGCTAGAAGGAAAGATCTGCTCAATCCAGCAAGC 1317
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1370 TGCCTACTTGTAAGTGTTATTCCTGAAGCTAGAAGGAAGGATCTGCTCAATCCAGCAAGC 1429
Query 1318 ATGAAGCAGGCGTTAGTTGAAGGTGCTGCTAAGCTTTCAGGTCCTAATATGTATGAGCAG 1377
||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1430 ATGAAGCAGGCATTGGTCGAAGGTGCTGCTAAGCTTTCAGGTCCTAATATGTATGAACAG 1489
Query 1378 GGTGCAGGAAGAGTTGATCTATTAGAATCATATGAAATTCTAAAGAGCTACCACCCCCGG 1437
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1490 GGTGCTGGAAGAGTTGATCTATTAGAATCATATGAAATTCTAAAGAGCTACCACCCCCGG 1549
Query 1438 GCGAGCATTTTCCCGAGCATTCTTGATTATAGTGATTGTCCATATTCCTGGCCCTTTTGT 1497
|| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550 GCAAGCATTTTCCCGAGCATTCTTGATTATAATGATTGTCCATATTCCTGGCCCTTTTGT 1609
Query 1498 CGTCAACCACTATATGC-GGGTGCTATGCCTGTTATTTTCAACACGACAATTCTTAATGG 1556
||||| || |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1610 CGTCAGCCGCTATATGCCGGG-GCTATGCCCATCATTTTCAACACGACAATTCTTAATGG 1668
Query 1557 TATGGGTGTTATTGGCTATATTGAAAGTCCACCAACATGGCATCCTGCAAACGAGGAAGG 1616
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1669 TATGGGTGTCATTGGCTATATTGAAAGTCCACCAACATGGCACCCTGCAAACGAGGAAGG 1728
Query 1617 AAATCTTCTGAGCATCCACTTTAAGTACACAGATGTCATATGGCCGTGGACTGGTTATCT 1676
||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1729 AAATCTTCTGAGCATTCACTTTAAGTACCCGGATGTTATATGGCCGTGGACTGGTTATCT 1788
Query 1677 AGCTTTACACATGCAGATCAAGGAAGAAGGTGCACAGTTCACAGGTGAGATAGAAGGTAA 1736
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1789 AGCTCTACACATGCAGATCAAGGAAGAAGGTGCACAGTTCACAGGTGAAATAGAGGGTAA 1848
Query 1737 TGTAACTGTGAAAGTCTATAGCCCATCAGCCCCTGGAGAAAGTGGGCGTAGAAGGAGTAC 1796
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1849 TGTAACTGTGAAAGTCTATAGCCCACCAGCCTCTGGAGAAAGTGGGCCTAGAAGGAGTAC 1908
Query 1797 TTGTTCTCTTCAGTTAAAACTGAAAGTGATTCCCACTCCACCACGAGCGAAACGTATTTT 1856
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1909 TTGTTCTCTTCAGTTGAAACTGAAAGTGATTCCCACTCCACCACGAGCGAAACGTATTTT 1968
Query 1857 GTGGGATCAATTTCACAGCATTAAATATCCTCCTGGTTATATTCCAAGAGACTCTTTGGA 1916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1969 GTGGGATCAATTTCACAGCATTAAATATCCTCCTGGTTATATTCCAAGAGACTCTTTGGA 2028
Query 1917 TGTCCGCAATGACATACTTGATTGGCATGGTGATCACCTGCATACAAACTTTCACATCAT 1976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2029 TGTCCGCAATGACATACTTGATTGGCATGGTGATCACCTGCATACAAACTTTCACATCAT 2088
Query 1977 GTACAACATGTTACGCGATGCTGGGTACTATATCGAGACTCTTGGTTCGCCCCTTACATG 2036
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2089 GTACAACATGTTACGTGATGCTGGGTACTATATCGAGACTCTTGGTTCGCCCCTTACATG 2148
Query 2037 TTTTGATGCTCAGCAATATGGAACCCTTTTGATGGTTGACCTTGAAGATGATTACTTTCC 2096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2149 TTTTGATGCTCAGCAATATGGAACCCTTTTGATGGTTGACCTTGAAGATGATTACTTTCC 2208
Query 2097 AGAAGAAATTGAAAAACTCAGAGATGACGTTATCAATACTGGACTGGGTCTGGTTGTGTT 2156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 AGAAGAAATTGAAAAACTCAGAGATGACGTTATCAATACTGGACTGGGTCTGGTTGTGTT 2268
Query 2157 TGCTGAGTGGTATAATGTCGATACCATGGTGAAGATGAGATTCTTCGATGATAACACACG 2216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2269 TGCTGAGTGGTATAATGTCGATACCATGGTGAAGATGAGATTCTTCGATGATAACACACG 2328
Query 2217 CAGTTGGTGGACTCCAGTCACTGGAGGTGCAAATATCCCCGCACTTAATAACCTTCTTGC 2276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2329 CAGTTGGTGGACTCCAGTCACTGGAGGTGCAAATATCCCAGCACTTAATAACCTTCTTGC 2388
Query 2277 ATCATTTGGGATTGCGTTTGGAGACAAAATTCTGAATGGGGATTTCAGTATTGACGGTGA 2336
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2389 ATCATTTGGGATTGCGTTTGGGGACAAAATTCTGAATGGGGATTTCAGTATTGACGGTGA 2448
Query 2337 GCAGAGTCGATATGCTTCTGGAACAAACATAGTCCGGTTTCCTGCTGGTGGGTTTTTGCA 2396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2449 GCAGAGTCGATATGCTTCTGGAACAAACATAGTCCGGTTTCCTGCTGGTGGGTTTTTGCA 2508
Query 2397 CACTTTTCCTTTACTAGACAGCTCTGAGAGTGGCGCTACACAAAATCTACTGCTAACTG- 2455
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2509 CACTTTTCCTTTATTAGACAGCTCTGAGAGTGGCGCTACCCAAAATCTACTGCTAACTGA 2568
Query 2456 GGTCATCAAAGGAAGACCCTGCTGTTCTTGGGCTTTTGGAGATTGGTGAAGGTCGGGTTG 2515
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2569 GG-CATCAAAGGAAGACCCTGCTGTTCTTGGGCTTTTGGAGATTGGTGAAGGTCGGGTTG 2627
Query 2516 GTGTTTATGGAGACTCAAACTGCCTGGACAGTAGCCACATGGTCACCAACTGCTACTGGC 2575
|||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2628 GTGTATATGGAGACTCAAATTGTTTGGATAGTAGCCACATGGTCACCAACTGCTACTGGC 2687
Query 2576 TCCTGAAGAAAATGCTAGATTTTAGCAGTTCAAAAATCAAAGATCCTGTACTTTTCTCAA 2635
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2688 TCCTGAAGAAAATGCTAGATTTTAGCAGTTCAAATATCAAAGACCCTGTACTTTTCTCAA 2747
Query 2636 AATTTGCTAAGAGATATTCACCCGTAATCATAGACGAGAAGCAACTGCCATCCCGAAGAA 2695
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2748 AATTTGCTAAGAGATATTCACCAGTAATCATAGACGAGAAGCAACTGCCATCCCGAAGAA 2807
Query 2696 CTGATGTAAATTTTTCAACATACTCTTCTGTGATCGGAAAGGAGCTAATCTGTGAGAGTG 2755
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2808 CTGATGTAAATTTTTCAACATACTCTTCTGTGATCGGAAAGGAGCTAATCTGTGAGAGTG 2867
Query 2756 ACTCCAGATTTGAAGTATGGGGGACTAAAGGATATAACTTACATGTCAGAGGAAGGAACC 2815
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2868 ACTCCAGATTTGAAGTATGGGGGACTAAAGGATATAACTTACATGTCAGAGGAAGGAATC 2927
Query 2816 GTAGATTACCCGGTTATCATGGCATTGATTTGGGTCGAGGCTTGAATTTCACATTGGAGA 2875
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2928 GTAGATTACCCGGTTATCATGGCATTGATTTGGGTAGAGGCTTGAATTTCACAGTGGAGA 2987
Query 2876 A-AACAAGACCAACTCGTTGGAGATCAG----G--------TGAGCTTAGTTCTTCCAGG 2922
|| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 2988 GTAA-AAGACCAACGCGTTGGAGATCAGCCAAGGAAGGAGGTGAGCTTAGTTCTTCCAGG 3046
Query 2923 AGCAAGTATCTGGGAGGCTTTTTCAGCAAAGACGAGATTGACATGCCATTTCTCGTTGCT 2982
||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 3047 AGCAAGTCTCTGGGAGGCCTTTTCAATAGAGACGAGATTGACATGCCATTTCTTGTTCCT 3106
Query 2983 ACTCGCTGGATTGTACTTGCTGGTGTTGTAGCTAGTGG 3020
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3107 ACTCGCTGGATCGTACTTGCTGGTGTTGTAGCTAGTGG 3144
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 153510845580
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5