BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg351167 Length=2481 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G20710.1 | Symbols: BGAL7 | beta-galactosidase 7 | chr5:7010... 3984 0.0 > AT5G20710.1 | Symbols: BGAL7 | beta-galactosidase 7 | chr5:7010522-7014249 FORWARD LENGTH=2750 Length=2750 Score = 3984 bits (2157), Expect = 0.0 Identities = 2375/2483 (96%), Gaps = 4/2483 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGAAAATGAAACACTTCACTCGTCTCTTATCATTGTTCTTCATCCTCATTACTTCATTC 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 15 ATGAAAATGAAACACTTCACTCGTCTCTTATCATTGTTCTTCATCCTCATTACTTCATTA 74 Query 61 TCTTTGGCTAACTCAACCATCGTCTCTCATGATGAACGAGCCATCACCATTAATGGAAAA 120 ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 75 TCTTTGGCTAAATCAACCATTGTCTCTCATGATGAACGAGCCATCACAATTAATGGAAAA 134 Query 121 CGTCGAATCCTACTTTCAGGCTCCATTCATTACCCACGAAGCACTGCTGATATGTGGCCT 180 || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 135 CGCCGGATCCTACTTTCAGGCTCCATTCATTACCCACGAAGCACTGCTGATATGTGGCCT 194 Query 181 GATCTGATCAACAAAGCCAAAGATGGTGGCTTAGACGCAATCGAGACGTACGTTTTTTGG 240 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 195 GATCTGATCAACAAAGCCAAAGATGGTGGCTTAGATGCAATCGAGACGTACGTTTTTTGG 254 Query 241 AACGCACATGAACCAAAACGTAGGGAATACGATTTCTCGGGGAATCTCGACGTTGTTCGC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 255 AACGCACATGAACCAAAACGTAGGGAATACGATTTCTCGGGGAATCTCGATGTTGTTCGT 314 Query 301 TTCATCAAGACCATTCAAGACGCTGGTCTCTACTCCGTTCTTCGCATTGGACCTTATGTT 360 || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 315 TTTATCAAAACCATTCAAGACGCAGGTCTCTACTCCGTTCTTCGCATCGGACCTTATGTT 374 Query 361 TGCGCAGAATGGAATTATGGAGGCTTTCCGGTGTGGCTGCACAATATGCCAAACATGAAA 420 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 375 TGCGCAGAATGGAATTATGGAGGCTTTCCCGTGTGGCTGCACAATATGCCCAACATGAAA 434 Query 421 TTTAGAACAGTCAACCCTAGTTTCATGAATGAAATGCAAAATTTCACTACAAAGATCGTA 480 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 435 TTCAGAACAGTTAACCCTAGTTTCATGAATGAAATGCAAAATTTCACTACAAAGATAGT- 493 Query 481 G-AGATGATGAAGGAAGAGAAGCTCTTTGCGTCACAAGGCGGTCCAATTATCCTAGCTCA 539 | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 494 GAAGATGATGAAGGAAGAGAAGCTCTTTGCTTCACAAGGCGGTCCAATTATCCTAGCTCA 553 Query 540 GATCGAGAACGAGTACGGGAATGTGATCTCATCGTATGGAGCAGCGGGTAAGGCCTACAT 599 ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 554 GATCGAGAATGAATACGGGAATGTGATCTCGTCGTATGGAGCAGAGGGTAAGGCCTACAT 613 Query 600 TGATTGGTGTGCCAACATGGCTAACTCTCTAGACATCGGTGTTCCATGGCTTATGTGCCA 659 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 614 TGATTGGTGTGCCAACATGGCCAACTCTCTAGACATTGGTGTTCCATGGCTTATGTGCCA 673 Query 660 ACAACCAAACGCTCCTCAGCCTATGCTCGAGACGTGCAATGGATTCTACTGTGACCAGTA 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 674 ACAACCAAACGCTCCTCAGCCTATGCTCGAGACGTGCAATGGATTCTACTGTGACCAGTA 733 Query 720 CGAACCGACCAACCCGAGCACCCCAAAGATGTGGACAGAGAATTGGACCGGCTGGTTCAA 779 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 734 CGAACCAACCAACCCGAGCACCCCAAAGATGTGGACAGAGAATTGGACCGGCTGGTTCAA 793 Query 780 GAATTGGGGAGGCAAACACCCTTATAGAACCGCTGAGGATCTTGCTTTTTCAGTTGCTAG 839 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 794 GAATTGGGGAGGCAAACATCCTTACAGAACCGCTGAGGATCTTGCTTTTTCAGTTGCTAG 853 Query 840 ATTCTTCCAAACCGGAGGAACTTTCCAGAACTATTACATGTACCATGGTGGTACTAACTT 899 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 854 ATTCTTCCAAACCGGAGGAACTTTCCAAAACTATTACATGTACCATGGTGGTACTAACTT 913 Query 900 TGGTAGAGTCGCTGGAGGTCCATACATCACCACTTCATATGATTACCATGCTCCTATTGA 959 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 914 TGGAAGAGTCGCTGGAGGTCCATACATCACCACTTCATATGATTACCATGCTCCTCTTGA 973 Query 960 TGAATTCGGTAACTTGAACCAGCCTAAATGGGGTCACTTGAAACAGTTACACAGAGTGTT 1019 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || Sbjct 974 TGAATTCGGTAACTTGAACCAGCCTAAATGGGGTCACTTGAAACAGCTCCACACAGTCTT 1033 Query 1020 AAAATCCATGGAGAAATCGCTGACTTACGGCAACATATCAAGAATCGATCTTGGCAACTC 1079 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1034 AAAATCCATGGAGAAATCGCTGACTTACGGAAACATATCAAGAATCGATCTTGGCAACTC 1093 Query 1080 CATCAAGGCGACGATTTACACAACAAAAGAGGGATCGAGCTGCTTCATCGGTAATGTGAA 1139 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1094 AATCAAGGCGACGATTTACACAACAAAGGAGGGATCAAGCTGCTTCATCGGTAATGTGAA 1153 Query 1140 CGCAACTGCAAATGCTTTAGTCAACTTCAAAGGAAAAGACTACCACGTACCGGCTTGGTC 1199 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1154 CGCAACTGCGGATGCTTTAGTCAACTTCAAAGGAAAAGACTACCACGTACCGGCTTGGTC 1213 Query 1200 CGTGAGTGTTCTTCCCGAATGCGATAAAGAGGCTTACAACACTGCAAAAGTGAACACTCA 1259 || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1214 TGTAAGTGTTCTTCCGGACTGCGATAAAGAGGCTTACAACACTGCAAAAGTGAACACTCA 1273 Query 1260 AACATCAATTATGACCGAGGACTCTAGTAAGCCAGAGAAGCTGGAATGGACCTGGAGACC 1319 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1274 AACATCAATCATGACCGAGGACTCTAGTAAGCCAGAGAGGCTGGAATGGACCTGGAGACC 1333 Query 1320 GGAGTCCGCTCAGAAGATGATTCTTAAAAGCAGTGGAGATCTCATTGCCAAGGGTCTTGT 1379 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1334 GGAGTCCGCTCAGAAGATGATTCTTAAAGGCAGTGGAGATCTCATTGCCAAGGGTCTTGT 1393 Query 1380 AGACCAAAAAGACGTCACAAATGATGCTAGTGACTATCTTTGGTACATGACTAGGGTTCA 1439 |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1394 AGACCAAAAAGATGTTACAAACGATGCTAGTGACTATCTTTGGTACATGACTAGGCTTCA 1453 Query 1440 TCTCGACAAGAAAGATCCACTTTGGAGCAGAAACATGACACTACGGGTTCACAGCAATGC 1499 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1454 TCTCGACAAGAAAGATCCACTTTGGAGCCGAAACATGACGTTACGGGTTCACAGCAATGC 1513 Query 1500 CCATGTTCTACACGCTTACGTCAATGGAAAATACGTTGGTAACCAATTTGTAAAGGACGG 1559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1514 CCATGTTCTACACGCTTACGTCAATGGAAAATACGTCGGTAACCAATTCGTAAAGGACGG 1573 Query 1560 GAAATTCGATTACAGATTTGAGAAGAAGGTCAATCATCTCGTTCATGGGACTAACCACAT 1619 |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1574 GAAATTTGATTACAGATTTGAGAGGAAGGTCAATCATCTCGTTCATGGGACTAATCACAT 1633 Query 1620 TTCACTTCTCAGTGTTTCCGTTGGACTACAGAATTACGGAGCTTTCTTTGAGAGCGGTCC 1679 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || Sbjct 1634 TTCACTTCTCAGCGTTTCCGTTGGACTACAGAATTATGGACCTTTCTTTGAGAGCGGACC 1693 Query 1680 CACTGGAATCAATGGTCCTGTGTCCTTAGTCGGATACAAAGGAGAGGAAACAATCGAGAA 1739 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1694 AACTGGAATCAATGGTCCTGTGTCCTTAGTCGGATACAAAGGAGAGGAAACAATCGAGAA 1753 Query 1740 GGATCTATCGGAGCATCAATGGGACTACAAGATTGGTTTGAATGGATACAAAAACAAACT 1799 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1754 GGATCTCTCGCAGCATCAATGGGACTACAAGATTGGTTTGAATGGATACAACGACAAACT 1813 Query 1800 TTTCAGCACAAAATCCGTTGGTCAC-ATCAAATGGGCAAACGAAATGTTTCCTACTAGTC 1858 |||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| | | |||||| ||| Sbjct 1814 TTTCAGCATAAAATCTGTTGGTCACCAA-AAATGGGCAAACGAAAAGCTACCTACTGGTC 1872 Query 1859 GGATGTTGACATGGTACAAGGCAAAGTTCAAGGCTCCTCTTGGTAAAGAGCCAGTGATTG 1918 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1873 GGATGTTGACATGGTACAAGGCAAAGTTCAAGGCTCCTCTTGGTAAGGAGCCAGTGATTG 1932 Query 1919 TGGACTTTAATGGTCTCGGGAAAGGTGAGGCTTGGATCAACGGTCAGAGCATTGGACGTT 1978 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1933 TGGACTTAAATGGTCTCGGGAAAGGTGAGGCTTGGATCAACGGTCAGAGCATTGGTCGTT 1992 Query 1979 ACTGGCCCAGCTTTAACTCTAGTGATGACGGTTGCAAAGACGAATGTGACTACCGCGGGG 2038 ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1993 ACTGGCCGAGCTTTAACTCTAGCGATGATGGTTGCAAAGACGAATGTGACTACCGTGGGG 2052 Query 2039 AGTATGGTAGCGACAAATGCGCTTTTATGTGTGGCGAACCAACTCAAAGATGGTACCATG 2098 |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2053 CGTATGGTAGCGACAAATGCGCTTTTATGTGCGGCAAACCAACTCAAAGATGGTACCATG 2112 Query 2099 TTCCAAGATCGTTCTTGAAAGCGAGCGGACACAACACTATCACACTATTCGAAGAAATGG 2158 ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2113 TTCCACGATCGTTCTTGAATGCGAGCGGACATAACACTATCACACTATTCGAAGAAATGG 2172 Query 2159 GCGGTAACCCGTCAATGGTGAACTTCAAGACAGTTGTGGTCGGAACTGTTTGTGCCAGGG 2218 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct 2173 GCGGTAACCCGTCAATGGTGAACTTCAAGACAGTAGTGGTTGGAACAGTTTGTGCCAGGG 2232 Query 2219 CTCATGAACACAACAAAGTGGAGTTGTCCTGCCATAACCATCCGATCTCAGCCGTTAAAT 2278 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct 2233 CTCATGAACACAACAAAGTGGAGTTGTCCTGCCATAACCGGCCGATTTCAGCCGTTAAAT 2292 Query 2279 TCGCAAGCTTTGGAAATCCGGTGGGGCATTGTGGGACATTCGCGGTTGGTACGTGCCAAG 2338 | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2293 TTGCAAGCTTTGGAAATCCGTTGGGGCATTGTGGGTCATTCGCGGTTGGTACGTGCCAAG 2352 Query 2339 GAGACAAGGATGCTGTGAAGACCGTGGCTAAAGAGTGTGTTGGGAAACTTAACTGCACTA 2398 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 2353 GAGACAAGGATGCTGCGAAGACCGTGGCTAAAGAGTGTGTTGGCAAACTCAACTGCACTG 2412 Query 2399 TCAATGTGTCGTCCGACACGTTTGGCTCTACTTTGGACTGTGGAGATTCACCTAAAAAAT 2458 |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2413 TCAATGTGTCTTCCGACACGTTTGGTTCTACTTTGGACTGTGGAGATTCACCTAAAAAAT 2472 Query 2459 TGGCCGTGGAATTGGAGTGCTAG 2481 ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2473 TGGCCGTGGAATTGGAGTGCTAG 2495 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 123109678122 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5