BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg352131
Length=2742
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G10590.2 | Symbols: UBP10 | ubiquitin-specific protease 10 |... 3980 0.0
AT4G10570.1 | Symbols: UBP9 | ubiquitin-specific protease 9 | c... 3971 0.0
> AT4G10590.2 | Symbols: UBP10 | ubiquitin-specific protease 10
| chr4:6538541-6543448 REVERSE LENGTH=3287
Length=3287
Score = 3980 bits (2155), Expect = 0.0
Identities = 2564/2758 (93%), Gaps = 41/2758 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGACGATCCCTAATTCCGATTTCATGATTGAAAACGGAGTCTGTGATTTTCCGACTACT 60
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 177 ATGACGATCCCTAATTCCGATTTCATGATCGAGAACGGAGTCTGTGATTTTCCGACTACT 236
Query 61 CCTGCCGAAGAGAAACGTATTGTATCGGAGCTGATTACCGAATCGGAAGATAATTTGAAA 120
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 237 CCTGAAGAAGAGAAACGGATTGTATCGGAGCTGATTACCGAATCGGAGGATAATTTGAAG 296
Query 121 GAAGGAAACTTGTATTTTGTCATCTCTAAAAGGTGGTATGCAAGCTGGCAGAAATATGTT 180
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 297 GAAGGGAACTTGTATTTTGTCATCTCTAAAAGGTGGTATACAAGCTGGGAGAAATATGTT 356
Query 181 GAGCAATCGACAGATGAATGTATAAGTGGGGAGTCCTC----G-----AGGCCTGGAGCG 231
|||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||
Sbjct 357 GAGCAATCGACAAAAGAATATATAAGTGGAGAGTCCTCTGAAGCTTCAAGGCCAGGACCG 416
Query 232 ATTGATAACCATGATATTATCGAAAGTGAAAGCGACGCGAATGATCCACAGCTTCGTAGA 291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 417 ATTGATAACCATGATATTATCGAAAGTGAAAGCGACGTTAATGATCCACAACTTCGTAGA 476
Query 292 TTGTTGGTGGAAGGGGTTGACTACGTTTTAGTTCCTCAAGAAGTCTGGAAAAGACTTGTT 351
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 477 TTGTTGATGGAACGGGTTGACTACGTTTTAGTTCCTCAAGAAGTTTGGAAAAGACTTGTT 536
Query 352 GAATGGTATAGCGGAGGTCCTCCGATAGAAAGGAAGTTGATCTGTCAAGGCTTTTATAGT 411
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 537 GAATGGTATAGCGGAGGTCCTCCGATAGAAAGGAAGTTGATCTGTCAAGGATTTTATACT 596
Query 412 AGGAGTTATAGTGTAGAGGTTTACCCACTCTGCCTTATGTTGACAGACGGACGAGATGAG 471
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 597 AGGAGTTATAGTGTAGAGGTTTACCCACTCTGCCTTATGTTGACGGACGGACGAGATGAA 656
Query 472 AGTAGAACTACAATACGGTTGGGAAAACAAACCTCTATAAGGGAACTTTGTGAGAAGGTT 531
||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 657 AGTAGAACTGTAATACGGTTGGGAAAACAGGCCTCTATAAGGGAACTTTATGAGAAGGTT 716
Query 532 TGCACTATGACAGGGGTAGCGCAAGAAAAGGCTCACATATGGGATTATTTCCATAAGAGG 591
|| || ||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||
Sbjct 717 TGTGCTTTGACAGGGGTACCACAAGAAAAGGCTCATATCTGGGATTACTTCGATAAGAGG 776
Query 592 AAAAACGGACTCTTGGATCCTTCATCTAACAAGAGCCTGGAAGAGTCTAGCCTTCAGATG 651
|||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 777 AAAAACGGACTCTTGGATTCTTTATCTTACAAGAGCCTGGAAGAGTCAAGCCTTCATATG 836
Query 652 GACCAAGATATTCTTCTTGAAGTTGATGGGTCGTCTTCCTCTCAATATGCTATGAGCTCG 711
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 837 GACCAAGATATTCTACTTGAAGTTGATGGGTCGTCTTCCTCTCAGTCTGCTATGAGCTCG 896
Query 712 GCAGGAAATGAGTTAGCTCTGGTACCTCTGGAACCTTCAAGGTCGCGTGTTACAATTGCT 771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 897 ACAGGAAATGAGTTAGCTCTGGTACCTCTGGAACCTTCCAGGTCGAGTGTTACAATTGCT 956
Query 772 GGGGGGCCTACCCTATCAAATGGTCATTCCACTACGTCCAAGTTTAGTCTCTTTCCGAGA 831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 957 GGGGGGCCTACCCTATCAAATGGTCATTCCACTACGTCCAACTTTAGTCTCTTTCCGAGA 1016
Query 832 ATAACTTCTGAAGACGACGGCTGCAATTCTTTGAGTATTCTTGGAAAAGGAGAAAAGGGA 891
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 ATAACTTCTGAAGACGACGGCAGCAATTCTTTGAGTATTCTTGGAAAAGGAGAAAAGGGA 1076
Query 892 GGATTAGCAGGATTGAGTAATTTGGGAAATACCTGCTTTATGAATAGCGCTCTTCAGTGT 951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 GGATTAGCAGGATTGAGTAATTTGGGAAATACCTGCTTTATGAATAGCGCTCTTCAGTGT 1136
Query 952 TTGGCCCACACACCTCCAATTGTTGAATACTTCTTGCAAGATTACAGTGATGACATAAAT 1011
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1137 TTGGCCCACACACCTCCAATTGTTGAATACTTCTTGCAAGATTACAGTGACGACATAAAT 1196
Query 1012 AGAGATAATCCTTTGGGAATGTGTGGTGAGCTTGCTATCGCATTTGGTGATTTGTTGAAG 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1197 AGAGATAATCCTTTGGGAATGTGTGGTGAGCTTGCTATCGCGTTTGGTGATTTGTTGAAG 1256
Query 1072 AAATTATGGTCATC---AAGGAACGCAGTTGCACCACGCTCTTTTAAGACAAAGTTGGCT 1128
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||
Sbjct 1257 AAATTATGGTCATCAGGAAGGAACTCAGTTGCACCACGCGCATTTAAGACAAAATTGGCT 1316
Query 1129 AGATTTGCTCCACAGTTTAGTGGTTACAATCAGCATGATTCTCAAGAACTGCTTGCTTTC 1188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 AGATTTGCTCCACAGTTTAGTGGTTACAATCAGCATGATTCTCAAGAACTGCTTGCTTTC 1376
Query 1189 TTATTGGATGGGCTGCATGAAGATTTGAATAAGGTCAAACGAAAACCTTACATCGAACTT 1248
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377 TTATTGGATGGGCTGCATGAAGATCTGAATAAGGTCAAACGAAAACCTTACATCGAACTT 1436
Query 1249 AAAGATTCTGACAGTCGTCCGGATGATGAAGTTGCTGAAGAGCTTTGGAATTATCATAAG 1308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1437 AAAGATTCTGACAGTCGTCCGGATGATGAAGTTGCTGAAGAGCTTTGGAATTATCATAAG 1496
Query 1309 GCCCGAAATGATTCTGTAATAGTTAACGTCTGTCAAGTATTCGATTTCTGTCAAGGCCAA 1368
||||||||||||||||| | | | | | | | | | | | || ||||||||||||
Sbjct 1497 GCCCGAAATGATTCTGT-A-A--T-A-G--T-T---G-A-T-G--TT-TGTCAAGGCCAA 1538
Query 1369 TACAAGTCAACTCTGGTTTGTCCAGTTTGCGGAAAAATATCAATCACTTTTGATCCCTTC 1428
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1539 TACAAGTCCACTCTGGTTTGTCCAGCTTGCGGAAAAATATCAATCACTTTTGATCCCTTC 1598
Query 1429 ATGTACTTGTCTGTACCTTTGCCATCAACACTTACGCGATCCATGACAGTTACGGTGTTT 1488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1599 ATGTACTTGTCTGTACCTTTGCCATCAACACTTACGCGATCCATGACAGTTACGGTGTTT 1658
Query 1489 TATTGCGATGGAAGTCGTCTTCCGATGCCGTATACTGTAACAGTGCCTAAACATGGATCT 1548
|||||||||||||||| |||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 1659 TATTGCGATGGAAGTCATCTTCCGATGCCATACACAGTAATAGTGCCTAAAAATGGATCT 1718
Query 1549 ATTAGAGATCTCATTACCGCATTAGGTACTGCTTGCTGTCT-AGCCGATGATGAGAGCCT 1607
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||| ||
Sbjct 1719 ATTAGAGATCTCATTACCGCATTAGGTACTGCTTGTT-TATTAGCCGAAGATGAGAGTCT 1777
Query 1608 ATTACTTGCAGAGGTATATGATCACAAGATCTTTAGATATTTTGAGAATCCCCTGGAGTC 1667
|||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1778 TTTACTTGCAGAGGTATATGACCACAAGATTTTTAAATATTTTGAGAATCCCCTGGATTC 1837
Query 1668 ACTGAGTGT-GATAAAAGATGATGAGCATATTGTGGCGTATCGGTTAAATCAGATGCCGA 1726
||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838 ACTGAGT-TCGATAAAAGATGATGAGCATATTGTAGCCTATCGGTTAAATCAGATGCCGA 1896
Query 1727 AAGGATCAGGAAAAGCAAAACTCGAGATTCTTCATGGAGGGCTGGAAAGGGATGTTCTGG 1786
|||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||
Sbjct 1897 AAGGATCAGGGAAAGCAAAACTCGAAATTCTTCATGGAGGGCAGAAAAGGCCTATTCTGG 1956
Query 1787 AGAGTGTTAGAGGCAGAGACGTGAAGCTTTTTGGAACTCCTTTAGTGACTTATGTCAACA 1846
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1957 AGAGTGTTAGAGGCAGAGATGTGAAGCTCTTTGGAACTCCTTTTGTGACTTATGTCAACA 2016
Query 1847 CAGACCCACTAAGTGGAACTGACATTGATGCAGTTATCTCTGGATTTCTGTCACCTCTGC 1906
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||
Sbjct 2017 CAGAACCACTAAGTGGAGCTGACATTGATGCAGTTCTCTCTCGATTTCTGTCGCCTCTGC 2076
Query 1907 ACAGGGTCCATGCCTCATCTAAGATTCATAACGGAAGTGACAATGGCCACCTTGCTGATG 1966
||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 2077 ACAAGGTCCATGCCCCATCTAAGATTCATAACGGAAGTGAAAATGGCCACCTTCCTGATG 2136
Query 1967 CGACTGCTGACGAAACATCCGGAAGTTTATCATCCCCAGATACCGAGATAGACGATGCAT 2026
| |||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137 CTACTGTTGACGAAGCATCCGAAATTTTATCATCCCCAGATACCGAGATAGACGATGCAT 2196
Query 2027 CTGATGGACAGTTATCCTTCAGGATATTCTTGACAGATGAACGTGGTTTGAACTATAAAC 2086
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2197 CTGATAGAGAGTTATCCTTCAGGATATTCTTGACAGATGAACGTGGTTTGAACTTTAAAC 2256
Query 2087 CACTTCAGTCTGAATCTTCTGTGAGCCCGGGTA-CAATTACAAGAGTTTTAGTTGAGTGG 2145
|||| |||||||||||||| | |||| ||||| | | |||||||||||||| ||||||
Sbjct 2257 CACTGCAGTCTGAATCTTCCATAAGCCTGGGTATCGCT-ACAAGAGTTTTAGTCGAGTGG 2315
Query 2146 AATGAGGGTGAGCATGAAACATATGATTCCAGCTACTTGAATGAACTTCCGGAGGTTCAT 2205
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 2316 AATGAGGGTGAGCATGAAAGATATGATTCCAGCTACTTGAGTGATCTTCCGGAGGTTCAT 2375
Query 2206 AAAACAAGTTTCTCTGCAAAGAAGACAAGACAAGAAGCGATATCCCTGTTTTCGTGTTTG 2265
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2376 AAAACAAGTTTCTCTGCAAAGAAGACAAGGCAAGAATCGATATCCCTGTTTTCGTGTTTG 2435
Query 2266 GAGGCCTTTTTAGCAGAAGAACCTCTGGGACCAGATGACATGTGGTTTTGTCCGAGCTGC 2325
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2436 GAGGCGTTTTTAGCAGAAGAACCTCTGGGACCAGATGACATGTGGTTTTGTCCGAGCTGC 2495
Query 2326 AAAGAACACAGACAAGCGAACAAAAAGCTAGACCTGTGGAAGTTGCCCGATATCCTTGTG 2385
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||
Sbjct 2496 AAAGAACACAGACAAGCGAACAAAAAGCTAGACCTGTGGAAGTTACCAGATATTCTTGTG 2555
Query 2386 TTCCATTTAAAACGGTTCACATATAGCAGATATCTCAAGAACAAGATTGATACGTTTGTG 2445
|| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2556 TTTCATTTAAAAAGGTTCACTTACAGCAGATATCTCAAGAATAAGATTGATACGTTTGTG 2615
Query 2446 AATTTCCCAATTCAGGATTTAGACTTGAGCAAGTACGTGAAAAACAAGAATGGCCAGTCA 2505
||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2616 AATTTCCCAGTTCATGATCTAGACTTGAGCAAGTATGTGAAAAACAAGAATGACCAGTCA 2675
Query 2506 TATCTATATGAACTATATGCCATTAGTAATCATTACGGTGGACTTGGTGGTGGTCATTAC 2565
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||
Sbjct 2676 TATCTATATGAACTGTATGCCGTTAGTAATCATTATGGTGGACTTGGTGGTGGCCACTAC 2735
Query 2566 ACTGCCTACGCGAAGTTGATTGATGACAACAAATGGTATCATTTCGATGATAGTCACGTT 2625
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||
Sbjct 2736 ACTGCCTACGCTAAGTTGATTGATGACAATGAATGGTACCATTTCGACGACAGTCATGTG 2795
Query 2626 TCATCAGTAAATGAATCTGAAATCAAAAACTCAGCTGCATATGTACTGTTCTACCGAAGA 2685
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 2796 TCATCTGTAAATGAATCTGAAATAAAAAACTCAGCTGCATATGTTCTTTTCTACCGAAGA 2855
Query 2686 GTGGGAAGTGAAACAGAGACACAAACAGCTG-AGATGCCGAGGAGTGATATGGATTAG 2742
||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 2856 GTGAGAAGTGAAACAGAGACACAAACAG-TGGAGATGTCGAC---TGATATGGATTAG 2909
> AT4G10570.1 | Symbols: UBP9 | ubiquitin-specific protease 9 |
chr4:6523255-6528173 REVERSE LENGTH=3289
Length=3289
Score = 3971 bits (2150), Expect = 0.0
Identities = 2567/2763 (93%), Gaps = 50/2763 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGACGATCCCTAATTCCGATTTCATGATT-GAAAACGGAGTCTGTGATTTTCCGACTAC 59
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 116 ATGACGATCCCTAATTCCGATTTCATG-TTAGAAAACGGAGTCTGTGATTTGCCTTTTAC 174
Query 60 TCCTGCCGAAGAGAAACGTATTGTATCGGAGCTGATTACCGAATCGGAAGATAATTTGAA 119
||||| ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||
Sbjct 175 TCCTGAGGAAGAGAAACGGATTGTATCGGAGCTTACTAGCGAATCGGAGGATAATTTGAA 234
Query 120 AGAAGGAAACTTGTATTTTGTCATCTCTAAAAGGTGGTATGCAAGCTGGCAGAAATATGT 179
| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 235 ACAAGGCAACTTGTATTTTGTCATCTCTAAAAGGTGGTATACAAGCTGGCAGGAATATGT 294
Query 180 TGAGCAA-TCGAC-AGATGAATGTAT-AAGTGGGGAG---TC-----CT-CGAGGCCTGG 227
|||| || ||| | | |||||||| | || ||| ||| || || ||||||||||
Sbjct 295 TGAG-AATTCGGCTA-ATGAATGT-TCAACTGGAGAGTCTTCGGAAGCTCCGAGGCCTGG 351
Query 228 AGCGATTGATAACCATGATATTATCGAAAGTGAAAGCGACGCGAATGATCCACAGCTTCG 287
| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 352 ACCGATTGATAACCATGATATTATCGAAAGTGATAGCGACATTAATGATCCACAACTTCG 411
Query 288 TAGATTGTTGGTGGAAGGGGTTGACTACGTTTTAGTTCCTCAAGAAGTCTGGAAAAGACT 347
||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||
Sbjct 412 TAGATTGCTGGTGGAAGGGGAGGACTACGTTTTAGTTCCTAAACAAGTTTGGAAAAGACT 471
Query 348 TGTTGAATGGTATAGCGGAGGTCCTCCGATAGAAAGGAAGTTGATCTGTCAAGGCTTTTA 407
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472 TGTTGAATGGTATAGCGGAGGTCCTCCGATAGAAAGGAAGTTGATCTGTCAAGGCTTTTA 531
Query 408 TAGTAGGAGTTATAGTGTAGAGGTTTACCCACTCTGCCTTATGTTGACAGACGGACGAGA 467
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 TACAAGGAGTTATAGTGTAGAGGTTTATCCACTCTGCCTTATGTTGACAGACGGACGAGA 591
Query 468 TGAGAGTAGAACTACAATACGGTTGGGAAAACAAACCTCTATAAGGGAACTTTGTGAGAA 527
||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 592 TGAAAGTAGAACTGTAATACGGTTGGGAAAACAGGCCTCTATAAGGGAACTTTATGAGAA 651
Query 528 GGTTTGCACTATGACAGGGGTAGCGCAAGAAAAGGCTCACATATGGGATTATTTCCATAA 587
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||
Sbjct 652 GGTTTGTGCTATGACAGGGGTACCGCAAGAAAAGGCTCATATCTGGGATTACTTCGATAA 711
Query 588 GAGGAAAAACGGACTCTTGGATCCTTCATCTAACAAGAGCCTGGAAGAGTCTAGCCTTCA 647
||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 712 GAGGAAAAACGGACTGTTGGATCCTTTATCTTACAAGAGCCTGGAAGAGTCAAGCCTTCA 771
Query 648 GATGGACCAAGATATTCTTCTTGAAGTTGATGGGTCGTC-T--TCCTCTCAATATGCTAT 704
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||
Sbjct 772 TATGGACCAAGATATTCTTGTTGAAGTTGATGGGTTGTCTTCCTCCTCTCAATCTGCTAT 831
Query 705 GAGCTCGGCAGGAAATGAGTTAGCTCTGGTACCTCTGGAACCTTCAAGGTCGCGTGTTAC 764
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 832 GAGCTCGACAGGAAATGAGTTAGCTCTGGTACCTCTGGAACCTTCAAGGTCGATTGTTAC 891
Query 765 AATTGCTGGGGGGCCTACCCTATCAAATGGTCATTCCACTACGTCCAAGTTTAGTCTCTT 824
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 892 AATTGCTGGGGGGCCTACCCTATCAAATGGTCATTCCACTACGTCCAACTTTAGTCTCTT 951
Query 825 TCCGAGAATAACTTCTGAAGACGACGGCTGCA-ATTCTTTGAGTATTCTTGGAAAAGGAG 883
|||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 952 TCCGAGAATAACTTCTGAAGACGACGGCAG-AGATTCTTTGAGTATTCTTGGAAAAGGAG 1010
Query 884 AAAAGGGAGGATTAGCAGGATTGAGTAATTTGGGAAATACCTGCTTTATGAATAGCGCTC 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 AAAAGGGAGGATTAGCAGGATTGAGTAATTTGGGAAATACCTGCTTTATGAATAGCGCTC 1070
Query 944 TTCAGTGTTTGGCCCACACACCTCCAATTGTTGAATACTTCTTGCAAGATTACAGTGATG 1003
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1071 TTCAGTGTTTGGCCCACACACCTCCAATTGTTGAATACTTCTTGCAAGATTACAGTGACG 1130
Query 1004 ACATAAATAGAGATAATCCTTTGGGAATGTGTGGTGAGCTTGCTATCGCATTTGGTGATT 1063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1131 ACATAAATAGAGATAATCCTTTGGGAATGTGTGGTGAGCTTGCTATCGCGTTTGGTGATT 1190
Query 1064 TGTTGAAGAAATTATGGTCATC---AAGGAACGCAGTTGCACCACGCTCTTTTAAGAC-A 1119
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 1191 TGTTGAAGAAATTATGGTCATCAGGAAGGAATGCAGTTGCACCACGCGCTTTTAAGACGA 1250
Query 1120 AAGTTGGCTAGATTTGCTCCACAGTTTAGTGGTTACAATCAGCATGATTCTCAAGAACTG 1179
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 AA-TTGGCTAGATTTGCCCCACAGTTTAGTGGTTACAATCAGCATGATTCTCAAGAACTG 1309
Query 1180 CTTGCTTTCTTATTGGATGGGCTGCATGAAGATTTGAATAAGGTCAAACGAAAACCTTAC 1239
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1310 CTTGCTTTCTTATTAGATGGGCTGCATGAAGATTTGAATAAGGTCAAACGAAAACCTTAC 1369
Query 1240 ATCGAACTTAAAGATTCTGACAGTCGTCCGGATGATGAAGTTGCTGAAGAGCTTTGGAAT 1299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1370 ATCGAACTTAAAGATTCTGACAGTCGTCCGGATGATGAAGTTGCTGAAGAGCTTTGGAAT 1429
Query 1300 TATCATAAGGCCCGAAATGATTCTGTAATAGTTAACGTCTGTCAAGTATTCGATTTCTGT 1359
|||||||||||||||||||||||||| | | | | | | | | | || |||||
Sbjct 1430 TATCATAAGGCCCGAAATGATTCTGT-A-A--T-A-G--T-T---G-A--CG---TCTGT 1471
Query 1360 CAAGGCCAATACAAGTCAACTCTGGTTTGTCCAGTTTGCGGAAAAATATCAATCACTTTT 1419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472 CAAGGCCAATACAAGTCAACTCTGGTTTGTCCAGTTTGCGGAAAAATATCAATCACTTTT 1531
Query 1420 GATCCCTTCATGTACTTGTCTGTACCTTTGCCATCAACACTTACGCGATCCATGACAGTT 1479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1532 GATCCCTTCATGTACTTGTCTGTACCTTTGCCATCAACACTTACGCGATCCATGACAATT 1591
Query 1480 ACGGTGTTTTATTGCGATGGAAGTCGTCTTCCGATGCCGTATACTGTAACAGTGCCTAAA 1539
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||
Sbjct 1592 ACGGTGTTTTATTGCGATGGAAGTCGTCTTCCGATGCCATACACAGTAATAGTGCCTAAA 1651
Query 1540 CATGGATCTATTAGAGATCTCATTACCGCATTAGGTACTGCTTGCTGTCTAGCCGATGAT 1599
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||
Sbjct 1652 CAGGGATCTATTAGAGATCTCATTACCGCATTAGGTACTGCTTGTTGTTTAGCTGAAGAT 1711
Query 1600 GAGAGCCTATTACTTGCAGAGGTATATGATCACAAGATCTTTAGATATTTTGAGAATCCC 1659
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1712 GAGAGTCTTTTACTTGCAGAGGTATATGATCACAAGATCTTTAGATATTTTGAGATTCCC 1771
Query 1660 CTGGAGTCACTGAGTGTGATAAAAGATGATGAGCATATTGTGGCGTATCGGTTAAATCAG 1719
||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1772 CTGGATTCACTGAGTGCGATAAAAGATGATGAGCATATTGTGGCGTATCGGTTGAATCAG 1831
Query 1720 ATGCCGAAAGGATCAGGAAAAGCAAAACTCGAGATTCTTCATGGAGGGCTGGAAAGGGAT 1779
|| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1832 ATTCCGAAAGGATCAAGAAAAGCAAAACTCGAAATTCTTCATGGAGGGCAGGAAAGGGCT 1891
Query 1780 GTTCTGGAGAGTGTTAGAGGCAGAGACGTGAAGCTTTTTGGAACTCCTTTAGTGACTTAT 1839
|||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1892 GTTCTGGATAGTGTTAGAGGCAGCGACGTGAAGCTTTTTGGAACTCCTTTTGTGACTTAT 1951
Query 1840 GTCAACACAGACCCACTAAGTGGAACTGACATTGATGCAGTTATCTCTGGATTTCTGTCA 1899
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1952 GTCAACACAGAACCACTAAGTGGAACTGACATTGATGCAGTTATCTCTGGATTTTTGTCG 2011
Query 1900 CCTCTGCACAGGGTCCATGCCTCATCTAAGATTCATAACGGAAGTGACAATGGCCACCTT 1959
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2012 CCTCTGCACAAGGTCCATGCCCCATCTAAGATTCATAACGGAAGTGATAATGGCCACCTT 2071
Query 1960 GCTGATGCGACTGCTGACGAAACATCCGGAAGTTTATCATCCCCAGATACCGAGATAGAC 2019
|||||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072 GCTGATGCTACTGTTGACCAAGCATCCGGAATTTTATCATCCCCAGATACCGAGATAGAC 2131
Query 2020 GATGCATCTGATGGACAGTTATCCTTCAGGATATTCTTGACAGATGAACGTGGTTTGAAC 2079
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2132 AATGCATCTGATAGAGAGTTATCCTTCAGGATATTCTTGACAGATGAACGTGGTTTGAAC 2191
Query 2080 TAT-AAACCACTTCAGTCTGAATCTTCTGTGAGCCCGGGTACAATTACAAGAGTTTTAGT 2138
|| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2192 -ATTAAACCACTGCAGTCTGAATCTTCTATAAGCCCGGGTACCGTTACAAGAGTTTTAGT 2250
Query 2139 TGAGTGGAATGAGGGTGAGCATGAAACATATGATTCCAGCTACTTGAATGAACTTCCGGA 2198
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||
Sbjct 2251 CGAGTGGAATGAGGGTGAGCATGAAAGATATGATTCCAGCTACTTGAGTGATCTTCCAGA 2310
Query 2199 GGTTCATAAAACAAGTTTCTCTGCAAAGAAGACAAGACAAGAAGCGATATCCCTGTTTTC 2258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2311 GGTTCATAAAACAAGTTTCTCTGCAAAGAAGACAAGGCAAGAATCGATATCCCTGTTTTC 2370
Query 2259 GTGTTTGGAGGCCTTTTTAGCAGAAGAACCTCTGGGACCAGATGACATGTGGTTTTGTCC 2318
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2371 GTGTTTGGAGGCTTTTTTAGCAGAAGAACCTCTGGGACCAGATGACATGTGGTTTTGTCC 2430
Query 2319 GAGCTGCAAAGAACACAGACAAGCGAACAAAAAGCTAGACCTGTGGAAGTTGCCCGATAT 2378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 2431 GAGCTGCAAAGAACACAGACAAGCGAACAAAAAGCTAGACCTGTGGAAGTTACCAGATAT 2490
Query 2379 CCTTGTGTTCCATTTAAAACGGTTCACATATAGCAGATATCTCAAGAACAAGATTGATAC 2438
|||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2491 TCTTGTGTTTCATTTAAAAAGGTTCACTTACAGCAGATATCTGAAGAACAAGATTGATAC 2550
Query 2439 GTTTGTGAATTTCCCAATTCAGGATTTAGACTTGAGCAAGTACGTGAAAAACAAGAATGG 2498
|||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2551 GTTTGTGAATTTCCCAGTTCATGATCTAGACTTGAGCAAGTATGTGAAAAACAAGAATGG 2610
Query 2499 CCAGTCATATCTATATGAACTATATGCCATTAGTAATCATTACGGTGGACTTGGTGGTGG 2558
|||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2611 CCAGTCATATCTTTATGAACTGTATGCCGTTAGTAATCATTACGGTGGACTTGGTGGTGG 2670
Query 2559 TCATTACACTGCCTACGCGAAGTTGATTGATGACAACAAATGGTATCATTTCGATGATAG 2618
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||
Sbjct 2671 CCACTACACTGCCTACGCTAAGTTGATTGATGACAACAAATGGTACCATTTCGACGACAG 2730
Query 2619 TCACGTTTCATCAGTAAATGAATCTGAAATCAAAAACTCAGCTGCATATGTACTGTTCTA 2678
||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 2731 TCATGTGTCATCTGTAAATGAATCTGAAATCAGAAACTCAGCTGCATATGTTCTTTTCTA 2790
Query 2679 CCGAAGAGTGGGAAGTGAAACAGAGACACAAACAGCTGAGATGCCGAGGAGTGATATGGA 2738
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 2791 CCGAAGAGTGAGAAGTGAAACAGAGACACAAACAGCTGAGATGTCGAC---TGATATGGA 2847
Query 2739 TTA 2741
|||
Sbjct 2848 TTA 2850
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 136203250245
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5