BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg353700
Length=3978
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G31210.1 | Symbols: | DNA topoisomerase, type IA, core | ch... 2311 0.0
> AT4G31210.1 | Symbols: | DNA topoisomerase, type IA, core |
chr4:15165156-15172738 FORWARD LENGTH=4183
Length=4183
Score = 2311 bits (1251), Expect = 0.0
Identities = 1297/1320 (98%), Gaps = 0/1320 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1814 GAGCTGAAAATCTGATTCTTGCATCGGATCCAGATCGTGAAGGAGAGGCAATTGCCTGGC 1873
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755 GAGCTGAAAATCTGATTCTTGCATCGGACCCAGATCGTGAAGGAGAGGCAATTGCCTGGC 1814
Query 1874 ACGTTATAGAGATGTTGCAGCAGCAGGGTGCCTTACATGAAAGTATGACAGTAGCAAGGG 1933
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1815 ACATTATAGAGATGTTGCAGCAGCAGGGTGCCTTACATGAAAGTATGACAGTAGCAAGGG 1874
Query 1934 TTGTTTTCCATGAGATAACTGAATCAGCAATAAAAACTGCACTTCAATCTCCACGAGAAA 1993
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1875 TTGTATTCCATGAGATAACTGAATCAGCAATAAAAAGTGCACTTCAATCTCCACGAGAAA 1934
Query 1994 TTGACGGGGACTTGGTGCATGCTTATCTTGCACGACGTGCTCTTGATTATCTCATCGGAT 2053
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1935 TCGACGGGGACTTGGTGCATGCTTATCTTGCACGGCGTGCTCTTGATTATCTCATCGGAT 1994
Query 2054 TTAATATTTCACCACTACTTTGGAGGAAACTTCCGGGTTGCCCGTCAGCTGGGCGGGTCC 2113
| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 TCAATATTTCACCACTACTATGGAGGAAACTTCCGGGTTGCCCGTCAGCTGGGCGGGTCC 2054
Query 2114 AGTCTGCTGCTTTGGCTCTTGTATGTGATAGAGAAAGTGAAATTGACGGATTTAAGCCTC 2173
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2055 AGTCTGCTGCTTTGGCTCTTGTATGTGATAGAGAAAGTGAAATTGATGGATTTAAGCCTC 2114
Query 2174 AGGAGTACTGGACTGTAGGAATCAAAGTGAAAGGGAAAGATAATTCAGCCACCTTTTCTG 2233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2115 AGGAGTACTGGACTGTAGGAATCAAAGTGAAAGGGAAAGATAATTCAGCCACCTTTTCTG 2174
Query 2234 CTCACTTGACCAGTTTAAATTCAAAAAGATTAAATCAGCTTTCTATCAGCTCTGAAGCAA 2293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2175 CTCACTTGACCAGTTTAAATTCAAAAAGATTAAATCAGCTTTCTATCAGCTCTGAAGCAA 2234
Query 2294 ATGCACAGGACATTGAGCAAAGGATCAAATCAGAAGGTTTTCTAGTGAAGGGCACTAAAA 2353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2235 ATGCACAGGACATTGAGCAAAGGATCAAATCAGAAGGTTTTCTAGTGAAGGGCACTAAAA 2294
Query 2354 CAAGTACTACACGGAAGAATCCACCAACTCCGTACATAACATCAACCCTTCAGCAGGATG 2413
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CAAGTACTACACGGAAGAATCCGCCAACTCCGTACATAACATCAACCCTTCAGCAGGATG 2354
Query 2414 CTGCTAACAAATTACATTTTTCAACAGCACATACCATGAAGCCCGCTCAAAAACTATATG 2473
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 2355 CTGCTAACAAATTACATTTTTCAACAGCACATACCATGAAGCTCGCTCAAAAATTATATG 2414
Query 2474 AGGGTGTCCAACTGTCCGATGGTAAATCAGCTGGTCTTATAACATACATGCGGACGGATG 2533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2415 AGGGTGTCCAACTGTCCGATGGTAAATCAGCTGGTCTTATAACATACATGCGGACAGATG 2474
Query 2534 GTTTACATATAGCTGATGAAGCTATCAAAGATATACAGTCCTTGGTGGCAGAAAGGTATG 2593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2475 GTTTACATATAGCTGATGAAGCTATCAAAGATATACAGTCCTTGGTGGCAGAAAGGTATG 2534
Query 2594 GGAAGAATTTTACATCAGATAGTCCTCGTAAATATTTTAAAAAGGTTAAGAACGCTCAGG 2653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2535 GGAAGAATTTTACATCAGATAGTCCTCGTAAATATTTTAAAAAGGTTAAGAACGCTCAGG 2594
Query 2654 AGGCCCATGAAGCTATTAGACCTACCGATATACGTAGATTACCGTCAACGATTGCTAGCC 2713
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2595 AGGCCCATGAAGCTATTAGACCTACTGATATACGTAGATTACCGTCAACGATTGCTAGCC 2654
Query 2714 TGCTTGATGCGGATTCTCTAAAATTATATACCTTGATATGGTCACGAGCTGTGGCATGTC 2773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2655 TGCTTGATGCGGATTCTCTAAAATTATATACCTTGATATGGTCACGAGCTGTGGCATGTC 2714
Query 2774 AAATGGAGCCTGCTTCCATTGCGCAGATACAACTTGATATTGGAAATGCCTCTGAATCCA 2833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2715 AAATGGAGCCTGCTTCCATTGCGCAGATACAACTTGATATTGGCAATGCCTCTGAATCCA 2774
Query 2834 TCATCTTCAGATCATCATGCTCAAAAGTCGAATTCCTTGGATACCAGGCAGTTTACGAGG 2893
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2775 TCATCTTCAGATCATCATGCTCAAAAGTTGAATTCCTTGGGTACCAGGCAGTTTACGAGG 2834
Query 2894 ATCCTGAAGCTAAGGCAATCAAAAATAAAGACGGTGATCAGAGTAGTGAGCGTGAGGAAA 2953
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2835 ATCCTGAAGCTAAGGCAATCAAAAATAACGATAATGATCAGAGTAGTGAGCGTGAGGAAA 2894
Query 2954 CTTTTAAAACTCTCAGTTTGTTGAAGGATGGAGATTTGCTACAGATTGGTGAAGTGGAGC 3013
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2895 CTTTTAAAACTCTCAGTTCGTTGAAGGATGGAGATTTGCTACAGATTGGTGAAGTGGAGC 2954
Query 3014 TCAAGCAGCACCATACTCAGCACCCACCACGCTATTCTGAGGGCTCTCTGATTAAAAAGC 3073
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2955 TCAAGCAGCACCATACTCAGCACCCACCACGCTATTCTGAGGGCTCTCTGGTTAAAAAGC 3014
Query 3074 TCGAGGAGCTCGGGATAGGTAGACCCTCGACATATGCATCTATATTTAGGGTTTTACAGC 3133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3015 TCGAGGAGCTCGGGATAGGTAGACCCTCGACATATGCATCTATATTTAGGGTTTTACAGC 3074
Score = 1367 bits (740), Expect = 0.0
Identities = 813/848 (96%), Gaps = 6/848 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3134 TTTCAGCTTTTCTTACCCACTACTTCACTGAGATCACAGACTATAGTTTCACTGCTGATA 3193
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3135 TTTCAGCTTTTCTTACCCACTACTTTACTGAGATCACAGACTATAGTTTCACTGCGGATA 3194
Query 3194 TGGAGGTTGAGCTTGATAATGTTTCTGGTGGTGTAACTGAATGGAAAGGTCTCCTAAGAG 3253
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3195 TGGAGACTGAGCTTGATAACGTTTCTGGTGGTGTAACTGAATGGAAAGGTCTCCTAAGAG 3254
Query 3254 ACTACTGGACACGATTCAGCGCATATTGTAAACGTGTTGAAAATGTCCAACGC-CAACAG 3312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 3255 ACTACTGGACACGATTCAGCGCATATTGTAAACGTGTTGAAAATGTCCAACGCTC-ACAG 3313
Query 3313 GTGGAGAAAATGTTGGAAAAGAAATATGAGGACTTTCTGTTTTCTTCCCTTCCTTATCCC 3372
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3314 GTGGAAAAAATGTTGGAAAAGAAATATGAGGACGTTCTGTTTTCTTTGCTTCCTTATCCC 3373
Query 3373 AGTAGGACATGCCCGAGTTGTATGGAAGGCACCTTAAGTTTCAAAGCAAGTAAGTATGGT 3432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3374 AGTAGGACATGCCCGAGTTGTATGGAAGGCACCTTAAGTTTCAAAGCAAGTAAGTTTGGT 3433
Query 3433 GCGGGGTATTTCATCGGTTGTGATCAGCACCCTTCATGCAAGTTCATTGCTAAAACGCTT 3492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3434 GCGGGGTATTTCATCGGTTGTGATCAGCACCCTTCATGCAAGTTCATTGCTAAAACGCTT 3493
Query 3493 TATGGAGAGGATGAAGATGAAGATGATCCTCCAAAGAATACCTGCGTAGAAGAGCCCAAA 3552
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3494 TATGGAGAGGATGAAGATGAAGATGATCCTCCAAAGAATAACTGCGTAGAAGAGCCCAAA 3553
Query 3553 TTGCTGGGTCTTCATCCCAATACCAGTGAGAAGGTTATTTTAAAGTGTGGCCCCTATGGG 3612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 3554 TTGCTGGGTCTTCATCCCAATACCAGTGAGAAGGTTATTCTAAAGTGTGGACCCTATGGG 3613
Query 3613 CATTATGTACAGCTCGGTGAAGATAAAAAAGGGCACACACCAAAACGAGCAAATGCGGCC 3672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3614 CATTATGTACAGCTCGGTGAAGATAAAAAAGGGCACACACCAAAACGAGCAAATGCGGCC 3673
Query 3673 CATATAAAGGATGTGAACTCCATTACGCTTGAAAGTGCTCTCGAATTATTACGCTATCCT 3732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3674 CATATAAAGGATGTGAACTCCATTACGCTTGAAAGTGCTCTCGAATTATTACGCTATCCT 3733
Query 3733 TTGACACTGGGAAACCACCCT-ATAGATGGACATCCTGTGGTCTT-AAGGCTTAGTAAAT 3790
||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 3734 TTGACACTGGGAACCCACCCTGA-AGATGGACAGCCTGTGGTCTTGAAG-CTTAGTAAAT 3791
Query 3791 CTGGATTTACTATTAAACATCGCTGCACTATGGCTACTGTTCCAAAGAACACGGAACCAG 3850
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3792 CTGGATTTACTATTAAACATCGCCGCAATATGGCTACTGTTCCAAAGAACACGGAACCAG 3851
Query 3851 GTGAGGTTACTTTAGAGAAAGCAATGAAGCTCTTGTCTGGCAAAAATGCGAGACATAGTG 3910
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||
Sbjct 3852 GTGAGGTTACTTTAGAGAGAGCAATGAAGCTCTTGTCTGGCAAAAATGTGAGAAAAAGTG 3911
Query 3911 GCAGACCACCTAAGGGTATCCAGCCTGAGGAAGAGAAAGGAGAGGAAGAAGTTGCGGTAG 3970
||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 3912 GCAGACCTCCTAAGAGTATACTGCCTGAGGAAGAGAAAGGAGATGAAGAAGTTGTGGTAG 3971
Query 3971 TGATGTAA 3978
||| |||
Sbjct 3972 CGATATAA 3979
Score = 1182 bits (640), Expect = 0.0
Identities = 798/868 (92%), Gaps = 35/868 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCAGAGAACCATCTCACTTGCGGCTGCTAAGTCTTCTTCTTCTTCGACTTCAGTTCTG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 125 ATGCAGAGAACCATCTCACTTGCGGCTGCTAAG---TCTTCTTCTTCGACTTCAGTTCTG 181
Query 61 TCTCTTCGTCCTCTCATGGCTAAGTTGCAGTTGCAGTGCAGGGCGATTCAGAATTTCCCA 120
||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 182 TCTCTTCATCCTCTCATGGCT-A-----AGTTGCAGTGCAGGGCGATTCAAAATTTCCCA 235
Query 121 GCTTACTCTTCCTCTTCACTAGTTCAGGTCGATAGAGTGTATAGAAATGTATCACAGCTT 180
|||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 236 GCTTCCTCTTCCTCTTCAGTAGTTCGGGTCGATAGAGTGTATAGAAATGTATCCCAGCTT 295
Query 181 CAGTTTAAAAGAGAAAATTCAAGCTGTCTTAAGTTAGCTTGTGCACTTCCTTCG---C-- 235
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 296 CAGTTTAAAAGAGAAAATTCAAGTTGTCTTAAGTTAGCTTGTGCACTTCCTTCGCATCTA 355
Query 236 A----TCTCGGTTCCCTTAGTTATGCAACACATTGGAGCAGCTTCACTTCAAGGTCCTTT 291
| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 356 AGTCTTCTCGGTTCTCTTAGTTATGCAACACATTGGAGCAGCTCCACTTCAAGGGCCTTT 415
Query 292 GGATATAGTTTCAGATCGTTTACGAGGAGATATATTTCTCAAGTCCCTAATACTGGA-AT 350
||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||
Sbjct 416 GGATATAGTTTCAGACCGTTTGCGAGGAGATATTTTTCTCAAGTCGCTAGTACT-GAGAT 474
Query 351 TAAGGATAGCATTGTTGGTGGTGTTGAAAAGTTTGGTGGGAATAAAATAGGTTTCAAGAA 410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 475 TAAGGATAGCATTGTTGGTGGTGTTGAAAAGTTTGGTGGGAATAAAATAGGTTTCAAGAA 534
Query 411 ATTTAATAAGAAGTGGAAGAAGCATAAGGTTTTGGCTTCCACAAAAGCTGATGTGGTGGC 470
||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 535 ATTCAATAAGAAGTGGAAGAAGCATAGGGTTTTGGCTTCCACAAAAGCTGAAGTGGTGGC 594
Query 471 -T-T-CT--A-CAGTTGTTGGAGATGTTAGCATTGCCATCAA-G-G-------CAACTGC 515
| | || | ||||| |||||||||||| || || |||||| | | |||||||
Sbjct 595 TTCTACTGAACCAGTTATTGGAGATGTTAACAGTGGCATCAAGGCGAAACTATCAACTGC 654
Query 516 AGCTTCACCTGCTAGCAATGCTAAGCAAGCCTCTACTGTCAAAACAAAACGGCGGCCAAA 575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 655 AGCTTCACCTGCTAGCAATGCTAAGCAAGCCTCTACTGTCAAAACAAAACGGCAGCCAAA 714
Query 576 GAGCAAGAAAGTCGAAAATAAATCTTCTCCAACGGTATCGGTTTTGGAAACGGTCTCTGT 635
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 715 GAGCAAGAAATTCGAAGATAAATCTTCTCCAACGGTATCGGTTTTGGAGACCGTCTCTGT 774
Query 636 AGACGAGAGTTTGCAAAGCTTTCCCAAGCCAAGACATTCGGGTTCCGGAAATCGGAAGTC 695
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 AGACGAGAGTTTGCAAAGCTTTCCCAAGCCTAGACATTCGGGTTCCGGAAATCGGAAGTC 834
Query 696 TTCATCTGCTGAGTACAGTTCTCAGAAGGAGGTGGCAAAAAATCCCATTGTGGAGGGGCC 755
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 835 TTCATCTGCTGAGTACAGTTCTCAGAAGGAGGTGGTAAAAAAAACCAATGTGGAGGGGCC 894
Query 756 CAAAAGTCCTACTCCATCAAATTCCATGTCGGAACAACAGCATTGGACCTCAACAAAAGC 815
||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 CAAAAGTTCTACTCCATCGAATTCCATGTCAGAACAACAGCATTGGACCTCAACAAAAGC 954
Query 816 AAGCAATGCACCAAAACAGGAGCAGGAT 843
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 AAGCAATGCACCAAAACAGGAGCAGGAT 982
Score = 691 bits (374), Expect = 0.0
Identities = 388/395 (98%), Gaps = 0/395 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1313 AGAAGGAGGTGGCAAAAAATCACCCTGTGGAGGAGCCCAAAAGTCCTGCTCCATCAAATT 1372
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1347 AGAAGGAGGTGGCAAAAAATCACCCTGTGGAAGAGCCCAAAAGTCCTGCTCCATCAAATT 1406
Query 1373 CCAAGTCGGAACAACAGCATTTGAAGTCAACAAAAGCAAGTAAGGCACCAAAACAGAAGC 1432
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1407 CCAAGTCGGAACAACAGCATTTGAAGTCAACTAAAGCAAGTAAGGCACCAAAACAAAAGC 1466
Query 1433 TGGTTCCTCAACACATGAAAAACAGCATAGAGCATCGAGGTCAAAATGCATCTAAACCGC 1492
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1467 TGGTTCCTCAACACATGAAAAACAGCATAGAACATCGAGGTCAAAATGCATCTAAACCGC 1526
Query 1493 TTTATCCACCAAGTGGAAAATCTGTTATTGTCGTTGAGTCAATCACAAAAGCAAAGATTA 1552
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1527 TTTATCCGCCAAGTGGAAAATCTGTTATTGTCGTTGAGTCAATGACAAAAGCAAAGATTA 1586
Query 1553 TTCAGGGTTATCTTGGTGACATGTATGAGGTTTTGCCAAGTTATGGTCATATCAGGGACC 1612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1587 TTCAGGGTTATCTTGGTGACATGTATGAGGTTTTGCCAAGTTATGGTCATATCAGGGACC 1646
Query 1613 TGGCCACAAGGTCTGGTTCAGTGAGGCCAGATGACGATTTTAGCATGGTTTGGGAGGTTC 1672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1647 TGGCCACAAGGTCTGGTTCAGTGAGGCCAGATGACGATTTTAGCATGGTTTGGGAGGTTC 1706
Query 1673 CATCTTCCGCCTGGACTCATATTAAGAGCATAAAG 1707
||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1707 CATCTTCCGCCTGGACTCATATTAAGAGCATTAAG 1741
Score = 566 bits (306), Expect = 7e-160
Identities = 355/377 (94%), Gaps = 9/377 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 893 AGGATAACATTGTTGGTGGTGATGAGAAGGCTGGTGGGAATAAATTAGGTTTCAAGAAAT 952
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 978 AGGATAACATTGTTGGTGGTGATGAGAAGGCTGGTGGGAATAAAGTAGGTTTCAAGAAAT 1037
Query 953 TTAATAAGAACCAAAAGAAGCATAATGTTTTGGCTTCCTCGGAAGCTGAAGTGGTGACTT 1012
|||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1038 TTAACAAGAACCGAAAGAAGCATAATGTGTTGGCTTCCTCAGAAGCTGAAGTGGTGACTT 1097
Query 1013 CTACTGAACCAGTTATTGGAGATGGTAACAGTGGCATCAAGGCGGAACTATCAACAGCAG 1072
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 1098 CTACTGAACCAGTTATTGGAGATGGTAGCAGTGGCATCAAGGCGGAACTATCCACGGCAG 1157
Query 1073 CCTCACCTGCTAGTGCTAGCAATGGTAATCAAGCCACTACTGTCAAA--AAT-CGGCGCC 1129
||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1158 CCTCACCTGCTAG--C-A--A-TGGTAATCAAGCCACTACTGTCAAATCAAAACGGCGCC 1211
Query 1130 CTAAGAACAAGAAAGTCGAAGATAAATCTTCTTCAGTGGGACCAGTTTTGGAGGCGGTCT 1189
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1212 CCAAGAACAAGAAAGTCGAAGATAAATCTTCTTCAGTGGTACCAGTTTTGGAGGCGGTCT 1271
Query 1190 CTCTAGAAGAGAGTCCGATAAGCGTTCCCAAGCCAAAACATTCTGGTTCTAGAAATCGGA 1249
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1272 CTCTAGATGAGAGTCCGATAAGCGTTCCCAAGCCAAAACATTCTGGTTCTGGAAATCGGA 1331
Query 1250 AGTCTTCATCTGCTAAG 1266
|||||||||||||||||
Sbjct 1332 AGTCTTCATCTGCTAAG 1348
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 198209591793
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5