BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg358300
Length=4026
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G60930.1 | Symbols: | P-loop containing nucleoside triphosp... 3374 0.0
> AT5G60930.1 | Symbols: | P-loop containing nucleoside triphosphate
hydrolases superfamily protein | chr5:24515398-24522511
REVERSE LENGTH=3885
Length=3885
Score = 3374 bits (1827), Expect = 0.0
Identities = 1970/2041 (97%), Gaps = 2/2041 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAGAGCACAGAGTGCGTTAGGGTTGCCGTTAACATCCGTCCCTTGATTACGCCGGAG 60
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||
Sbjct 1 ATGGAGAGCACAGAGTGCGTTAGGGTTGCCGTCAACATCCGTCCGTTAATTACACCGGAG 60
Query 61 CTTTTGAACGGATGCACCGATTGCATCACCGTTGCTCCAAAAGAGCCACAGGTTCATATT 120
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 61 CTTTTGAACGGATGCACAGATTGCATCACCGTGGCTCCCAAAGAGCCACAGGTACATATT 120
Query 121 GGTTCGCATACTTTTACTTATGATTTCGTTTACGGAAATGCTGGCTACCCGTGTTCGGAG 180
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 121 GGTTCGCATACATTTACTTATGATTTCGTCTACGGAAATGGTGGCTATCCGTGTTCGGAG 180
Query 181 ATTTACAATCACTGTGTTGCTCCACTTGTGGATGCATTATTTAAAGGTTACAATGCCACT 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 181 ATTTACAATCACTGTGTTGCTCCACTTGTGGATGCATTGTTTAAAGGATACAATGCCACT 240
Query 241 GTTCTAGCTTATGGCCAGACTGGTTCAGGTAAAACCTACACCATGGGTACTAATTATAGT 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GTTCTAGCTTATGGCCAGACTGGTTCAGGTAAAACCTATACCATGGGTACTAATTATAGT 300
Query 301 GGAGATGGCACAAATGGTGGCATTATACCAAACGTTATGGAGGATATATTTAGAAGAGTG 360
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GGAGATTGCACAAATGGTGGCGTTATACCAAACGTTATGGAGGATATATTTAGAAGAGTG 360
Query 361 GATACAACCAAAGATTCGTCCGAACTATTGATACGAGTGTCTTTTATTGAGATTTTTAAG 420
|| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GAGACAACCAAAGATTCATCTGAACTATTGATACGAGTGTCTTTTATTGAGATTTTTAAG 420
Query 421 GAAGAAGTTTTCGATTTGCTGGACTCAAATTCTTCGGCCCTCCTTAAAAATGACAGTTGC 480
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 421 GAAGAAGTTTTTGATTTGCTGGACTCAAATTCTTCGGCCCTCCTTAAAAATGACAGTGGC 480
Query 481 GTTCAAGCAAAGCACACTGCACTCTCACGAGCTCCAATTCAAATAAGAGAAACTGCCAGT 540
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 481 GTTCAAGCAAAGCACACTGCTCTCTCACGAGCTCCAATTCAAATCAGGGAAACTGCCAGT 540
Query 541 GGAGGAATAACATTGGCTGGAGTTACTGAGGCAGAAGTCAAGACGAAAGAGGAGATGGGC 600
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GGAGGAATAACATTGGCTGGAGTTACTGAGGCTGAAGTCAAGACGAAAGAGGAGATGGGC 600
Query 601 TCGTATCTAGCACGAGGCTCTTTGTGTCGAGCTACTGGCAGCACAAACATGAATAGCCAA 660
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TCGTTTCTAGCACGAGGCTCTTTGTCTCGAGCTACAGGCAGCACAAACATGAATAGCCAG 660
Query 661 TCAAGTCGGTCACATGCAATCTTCACAATCACTCTGGAACAAAAGAAGATTGCCAGTGGT 720
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 661 TCAAGTCGGTCCCATGCAATCTTCACAATCACTCTGGAACAAAAGAAGATTGCCGGTGGT 720
Query 721 TCTTGCGCAACAACTGAAGATGGAGGTGAAGATATATTATGTGCAAAGCTTCATTTGGTT 780
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TCTTGCACAACAACTGAAGATGGAGGTGAAGATATATTATGTGCAAAGCTTCATTTGGTT 780
Query 781 GACCTAGCGGGGTCAGAACGAGCAAAACGAACAGGAGCTGATGGGATGCGTTTGAAAGAA 840
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 781 GACCTAGCGGGGTCAGAACGTGCAAAACGAACAGGAGCTGATGGGATGCGTTTAAAAGAA 840
Query 841 GGTATTCACATCAACAAAGGTCTATTAGCTCTTGGAAATGTAATAAGTGCACTTGGAGAT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 841 GGTATTCACATCAACAAAGGTCTATTAGCTCTTGGAAATGTTATAAGTGCACTTGGAGAT 900
Query 901 GAGAAAAAGAGAAAGGAAGGAGGTCACGTTCCTTATCGTGACAGCAAGTTAACTCGTTTG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GAGAAAAAGAGAAAGGAAGGAGGTCACGTTCCTTACCGTGACAGCAAGTTAACTCGTTTG 960
Query 961 CTCCAGGATTCTCTTGGTGGCAATAGCAAAACTGTGATGATTGCTTGTGTAAGTCCAGCT 1020
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 961 CTACAGGATTCTCTTGGTGGCAATAGCAAAACTGTGATGATTGCTTGTGTAAGTCCCGCT 1020
Query 1021 GATACAAATGCTGAGGAAACTTTAAATACGCTCAAATACGCAAATCGTGCTCGCAATATT 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 GATACAAATGCTGAGGAAACTTTAAATACGCTCAAATACGCAAATCGTGCTCGCAATATT 1080
Query 1081 CAAAACAAAGCAGTGATCAATCGAGACCCAGCAACCGCACAAATGCAAAGAATGCGGAGC 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 CAAAACAAAGCAGTGATCAATCGAGACCCAGCAACCGCACAAATGCAAAGAATGCGGAGC 1140
Query 1141 CAAATTGAGCAACTGCAAACAGAACTCTTGTTCTATCGGGGTGATAGTGGTGCTTTTGAT 1200
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 CAAATTGAGCAACTGCAAACAGAACTCTTGTTCTATAGGGGTGATAGTGGTGCTTTTGAT 1200
Query 1201 GAGCTCCAGATCCTCAAGCATAAGGTATCACTGCTTGAGGCAAGCAATCGTGAGTTACAA 1260
||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1201 GAGCTCCAGATTCTCAAGCATAAGATATCACTACTTGAGGCAAGCAATCGTGAGCTACAC 1260
Query 1261 AATGAACTTCAAGAACGGAGAGTCGCTTCTGAGCATTTTTCAAAGTGTGCTTATGATGCT 1320
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 1261 AATGAACTTCAAGAACGGAGAGTCGCGTCTGAGCATTTCTCAAAGCGTGCTTATGATGCT 1320
Query 1321 CAGGTTGAAAAGGACAAACTTATAATGATAATTGAATCTGTTCGTAATGGTAAATCCTTG 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 CAGGTTGAAAAGGACAAACTTATAATGATAATTGAATCTGTTCGTAATGGTAAATCCTTG 1380
Query 1381 GATGAGATTGAATCCTGCCAAAATGAGGATGTTGGTTTGGTGAAGAAGTATGTTTCGAAA 1440
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1381 GATGAGATTGAATCCTGCCAAAATGAGGATGTTGGTTTGGTGAACAAGTATGTCTCGAAA 1440
Query 1441 ATTCAAGAGCTAGAAGGAGAACTGTTGCATATCAAAAGCTTGAAGAAAACCAGTAACCAC 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 ATTCAAGAGCTAGAAGGAGAACTGTTGCATATCAAAAACTTGAAGAAAACCAGTAACCAC 1500
Query 1501 CAATTTTCGGATGATTCCTATGACGATGGGCCTCGTTCGAACAATGTCTTGTTTCCCTCA 1560
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 CAATATTCGGATGATTCCTATGACGTTGGGCCTCGTTCGAACAATGTCTTGTTTCCCTCA 1560
Query 1561 TCTAATGAGTCGTCGGATTGTGAAGATAAAGTGATTGATGTCACAGATGAACTTGAATTT 1620
|| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1561 TCCAATGAGTCGTCAGATTGTGAAGACAAAGTGATGGATGTCACTGATGAACTTGAATTT 1620
Query 1621 CAAGAAAAGGAGATTGAACACTGCTCACTTCAAGAAAAGTTGGATATGGAGCTAAAGGAA 1680
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 CAAGAAAAAGAGATTGAACATTGCTCACTTCAAGAAAAGTTGGATATGGAGCTAAAGGAA 1680
Query 1681 TTGGATAAGAGACTTGAAGAAAAAGAGGCTGAAATGAAGCGCTTTTCAAGTGGTGGTGCA 1740
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1681 TTGGATAAGAGACTTGAAGAAAAGGAGGCTGAAATGAAGCGCTTTTCAAGTGGTGGTACA 1740
Query 1741 TCTGTTCTCAAACAACACTATGAGAAAAAGGTTTATGACCTAGAACAGGAAAAAAGAGCA 1800
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 TCTGTTCTCAAACAACACTATGAGAAAAAAGTTTATGACCTAGAACAGGAAAAAAGAGCA 1800
Query 1801 CTACAGAGAGAAATCGAAGGTTTGAGACAGAACCTTGCTAGCATACCATCTGG-CTCAGG 1859
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 1801 CTACAGAGAGAAATCGAAGGTTTGAGACATAATCTTGCTAGCATACCATCTGGAC-CAGG 1859
Query 1860 AGATGGTGCCCAGAAACTGAAGGAAGAGTATGTTCAGAAACTGAACACGCTTGAAACACA 1919
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 AGATGGTGCCCAGAAACTGAAGGAAGAATATGTTCAGAAACTGAACACGCTTGAAACACA 1919
Query 1920 GGTTTCTGTTCTGAAGAAGAAACAAGATGCACAAGCTCAGCTTATGAGACAAAAGCAGAA 1979
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 GGTTTCTGTTCTGAAGAAGAAACAAGATGCACAGGCTCAGCTTATGAGACAAAAGCAGAA 1979
Query 1980 AAGTGACGATGCGGCAATAAAATTGCAGGATGAAATACACAGAATTAAGTCCCAGAAGGT 2039
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1980 AAGTGACGATGCCGCAATAAAATTGCAGGATGAAATACACAGAATTAAGTCTCAGAAGGT 2039
Query 2040 G 2040
|
Sbjct 2040 G 2040
Score = 2098 bits (1136), Expect = 0.0
Identities = 1276/1340 (95%), Gaps = 23/1340 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2411 GTGGTGCTAATGGTCCTGGAACTCAGGCATTGATGCAAGCAATTGAGCATGAGATTGAAG 2470
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285 GTGGTGCTAATGGCCCTGGAACTCAGGCATTGATGCAAGCAATTGAGCATGAGATTGAAG 2344
Query 2471 TCACTGTTCGGGTTCACGAAGTGCGTTCTGAATATGAGAGGCAAAAGGAAGAGAGGGCAA 2530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2345 TCACTGTTCGGGTTCACGAAGTGCGTTCTGAATATGAGAGGCAAACGGAAGAGAGGGCAA 2404
Query 2531 GAATGGCTAAGGAAGTTGCAAGGCTAAGAGAAGAAAACGAG-TTGCTCAAGAATGCCAAA 2589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 2405 GAATGGCTAAGGAAGTTGCAAGGCTAAGAGAAGAAAACGAGCTT-CTCAAGAATGCC--- 2460
Query 2590 ATAAGTGCCTTCTCTGACCAAAGCAGCGTTCATGGTGACACCATGTCTCCTGGTGCAAGA 2649
|| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2461 --AA-----------G---ATA--AGCGTTCATGGTGACACCATGTCTCCTGGTGCAAGA 2502
Query 2650 AACTCAAGGATTTTTGCTCTGGAGAATATGCTTGCGACCTCTTCCAACACTCTCGTCTCC 2709
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 2503 AACTCAAGGATTTTTGCTCTGGAGAATATGCTTGCGACCTCTTCCAGCACTCTTGTCTCC 2562
Query 2710 ATGGCATCACAGTTATCTGAAGCAGAAGAACGCGAGCGTGTGTTTGGTGGAAGAGGGAGG 2769
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2563 ATGGCATCACAGTTATCTGAAGCAGAAGAACGTGAGCGTGTGTTTGGTGGAAGAGGGAGG 2622
Query 2770 TGGAACCAAGTTAGAACACTAGGTGACGCGAAGAGTATCATGAACTATCTGTTCAATTTG 2829
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 2623 TGGAACCAAGTTAGAACATTAGGTGACGCCAAGAGTATCATGAACTATCTATTCAACTTG 2682
Query 2830 GCGTCAACTGCGAGGTGTCTAGCCCGAGATAAAGAGGCAGACTGCAGAGAAAAGGATGTC 2889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2683 GCGTCAACTGCGAGGTGTCTAGCCCGAGATAAAGAGGCAGACTGCAGAGAAAAAGATGTC 2742
Query 2890 CTTATAAGAGACCTGAAAGAAAAAATAGTAAAGTTTAGCAGTTATGTTAGATACATGGAG 2949
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2743 CTAATAAGAGACCTCAAAGAAAAAATAGTAAAGTTTAGCAGTTATGTAAGATACATGGAG 2802
Query 2950 ATCCAAAAAGCAGACCTCGTGCATCAGGTGAAAGCACAGACCTCTGCAATGAAGATATTG 3009
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2803 ATCCAGAAAGCAGACCTCGTGCATCAAGTGAAAGCACAGACCTCTGCAATGAAGAAATTG 2862
Query 3010 TCCGCAGAGGAGAACCTAAAGAACGAGCATAGTATGAAAAAGCAGGAAACCCGAAACTCG 3069
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2863 TCAGCAGATGAGAACCTAAAGAACGAGCATAGTATGAAAAAGCAGGAAACCCGAAACTCG 2922
Query 3070 ACTATAGTTCTTGAGGACATGGATACCTCTGATTCTGAAGAGTCAGGCCATGAACGGGAA 3129
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 2923 ACTATAGTTCTTGAGGACATGGATACCTCTGATTCTGAAGCGTCAGACCATGAACGGGAA 2982
Query 3130 GATCCAGATCTTGATGTTGAATGGAAACCTGAACATGAATCAGAGCGTGAGTCAGAGCAG 3189
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2983 GATCCAGATCTTGATGATGAATGGAAACCTGAACATGAATCAGAGCGTGAGTCCGAGCAG 3042
Query 3190 GAATCGGTTATAAAGCTAAATAGGAAACGAAACTTCAAAGTGGGAAGACGGCGCTCGAGT 3249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3043 GAATCGGTTATAAAGCTAAATAGGAAACGAAACTTCAAAGTGGGAAGACGGCGCTCGAGT 3102
Query 3250 GTGGTCATGAGGCGTTCATATGAAGAGAATTCGGAAGCTCCTTTGGATGATGTGGTGAAA 3309
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||
Sbjct 3103 GTGGTCATGAGGCGTTCATATGAAGAGAATTCGGAAACTCCTTCAGATGATGCAGTGAAA 3162
Query 3310 TCTGACGTGTGTTGTTGCACTTGCAGCAAGAGCTCTTCTTGCAAGACAATGAAGTGTCAG 3369
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3163 TCTGACGTGTGTTGTTGCACTTGCAGCAAGAGCTCCTCTTGCAAGACAATGAAGTGTCAG 3222
Query 3370 TGTCGAGCTACAAAGGGATCTTGTGGTCCGTCATGTGGATGTTCTTCAGTGAAATGCTCC 3429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3223 TGTCGAGCTACAAAGGGATCTTGTGGTCCGTCATGTGGATGTTCTTCCGTGAAATGCTCC 3282
Query 3430 AACAGAAACGCAGACGGAAAGGAGAACAATTCCATCTCAGAATCAGAGGCATTGGAAAAC 3489
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 3283 AACAGAAACGCAGACGGAAAGGAGAACAATTCCATCTCGGAATCAGAGGCCTTGGAAAAC 3342
Query 3490 GGGGAGAACTCGCAAGAGTCTGATGAAAAGGACAAAGAACAACAACAACTAGTCCTTGCT 3549
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||
Sbjct 3343 GGGGAGAACTCGCAAGAATCTGATGAAAAGGACAAAGGCCAACAACAACAAGTTCTTGCT 3402
Query 3550 TCACGTGGAGCTATGCTGCTACAGAACGCTCTTGCTGACAAGCCAGGGGAGGAGACAAAT 3609
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3403 TCACGTGGAGCTATGCTGCTACAGAACGCTCTTGCTGACAAGCCAGAGGAGGAGACAAAC 3462
Query 3610 GATGATGGAGGAACAAGAAGAAGAAGAAAACCTCTATCAGACATAGGAAACACGACGGGT 3669
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3463 GATGATGGAGGAACACGAAGAAGAAGAAAACCTCTATCAGACATAGGAAACACAACGGGT 3522
Query 3670 AAATCGAATGTGCCAAGGCCAAGCCAAAGAAAGAAATGGAAGAAGACTGTGCTTCAGCTT 3729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3523 AAATCGAATGTGCCAAGGCCAAGCCAAAGAAAGAAATGGAAGAAGACTGTGCTTCAGCTT 3582
Query 3730 GTTCCTGTAGGTCCACCAGC 3749
||||||||||||||||||||
Sbjct 3583 GTTCCTGTAGGTCCACCAGC 3602
Score = 446 bits (241), Expect = 1e-123
Identities = 247/250 (99%), Gaps = 0/250 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2083 GTGCAATTACAGCAAAAGATTAAGCAGGAGTCAGAGCAGTTCAGGGCTTGGAAGGCTTCA 2142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2038 GTGCAATTACAGCAAAAGATTAAGCAGGAGTCAGAGCAGTTTAGGGCTTGGAAGGCTTCA 2097
Query 2143 AGAGAGAAGGAAGTTATGCAGCTCAAAAAAGAGGGAAGGAGAAATGAGTATGAGATGCAC 2202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2098 AGAGAGAAGGAAGTTATGCAGCTCAAAAAAGAGGGAAGGAGAAATGAGTATGAGATGCAC 2157
Query 2203 AAACTCATGGCTTTGAATCAAAAACAGAAGCTGGTTTTGCAAAGAAAGACAGAAGAGGCA 2262
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2158 AAACTCATGGCTCTGAATCAAAAACAGAAGCTGGTTTTGCAAAGAAAGACAGAAGAGGCA 2217
Query 2263 TCTCAGGTGACAAAAAGACTCAAAGAGCTTTTAGATAATCGAAAGGCTTCTTCACGCGAG 2322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 TCTCAGGTGACAAAAAGACTCAAAGAGCTTTTAGATAATCGAAAGGCTTCTTCACGCGAG 2277
Query 2323 ACACTGAGTG 2332
||| ||||||
Sbjct 2278 ACATTGAGTG 2287
Score = 148 bits (80), Expect = 3e-34
Identities = 97/105 (92%), Gaps = 2/105 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 3763 GAAGCTAATCCGGTGACTTTGGACTCGGA-AGCAGCGAGAATGCCAGAAAACAGCGAGTC 3821
||||||||| | |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 3640 GAAGCTAATTCAGTGACTGTGGACTCGGACA-CAGCGAGAATGCCAGAAAACAGTGACTC 3698
Query 3822 AGGAGAGTCTAATAGCATCAAACTGAAGCTACCAAGGGCAATGAG 3866
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3699 AGGAGAGTCTAATAGCATCAAACTGAAGCTACCGAGGGCAATGAG 3743
Score = 110 bits (59), Expect = 1e-22
Identities = 67/71 (94%), Gaps = 0/71 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3956 AGAGCAACTCAGGTAGGGCAAGTGGAAGTAGAACTTCAGATGAAAAGGAGAACCATACTC 4015
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3742 AGAGCAATTCGGGTAGGGCAAGTGGAAGTAGAACTTCAGATGAAAAGGAGAACCACACTC 3801
Query 4016 GTCGGATCTAA 4026
||||| |||||
Sbjct 3802 GTCGGGTCTAA 3812
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 200617605057
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5