BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg470142
Length=5756
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G01320.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like s... 9125 0.0
AT4G28080.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like s... 507 6e-142
> AT1G01320.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like
superfamily protein | chr1:121124-130570 REVERSE LENGTH=6015
Length=6015
Score = 9125 bits (4941), Expect = 0.0
Identities = 5520/5793 (95%), Gaps = 66/5793 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCTCCcaagaacaaccgtggaaagacaaaaggagacaagaagaagaaggaagagaaa 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 250 ATGGCTCCCAAGAACAACCGTGGAAAGACAAAAGGAGATAAGAAGAAGAAGGAAGAGAAA 309
Query 61 gTTCTCCCGGTTATCGTGGATGTCATTGTAAACCTTCCGGATGAGACGGAGGCTATTTTG 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 310 GTTCTCCCGGTTATCGTGGATGTCATTGTAAACCTTCCGGATGAAACGGAGGCTATTTTG 369
Query 121 AAGGGCATATCAACGGACAGGATCATAGATGTTCGGCGGCTTTTATCGGTTAACTTTGAC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 370 AAGGGCATATCAACGGACAGGATCATAGATGTTCGGCGGCTGTTATCGGTTAACTTCGAC 429
Query 181 ACTTGCCACGTCACCAATTATTCACTCTCCCATGAGATAAGAGGATCGCGGTTAAAAGAC 240
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430 ACCTGCCACGTCACCAATTATTCGCTCTCCCATGAGATAAGAGGATCGCGGTTAAAAGAC 489
Query 241 ACGGTAGATGTGTCGGCGCTTAAACCCTGTGTTCTCACGTTAACGGAAGAGGATTACAAT 300
|| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 490 ACAGTGGATGTGTCGGCCCTTAAACCCTGTGTTCTCACGTTAACGGAAGAGGATTACAAT 549
Query 301 GAAGGAACAGCAGTGGCGCACGTTAGACGGCTGCTTGACATCGTCGCCTGCACCACTTGC 360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 550 GAAGGAACAGCAGTGGCGCACGTTAGACGGCTGCTTGACATCGTCGCCTGTACCACTTGC 609
Query 361 TTCGGTCCATCGCCGGAGAAATCAGACACCGTGAAAAGTGCGCAGGTTAAGGGAGGTGGA 420
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 610 TTCGGTCCGTCGCCGGAGAAATCAGACTCCGTGAAAAGTGCGCAGGTTAAGGGAGGTGGA 669
Query 421 AAGAATTCCAAACACTCGGAGACGTCGCCTCCGCCGTCTCCTGCGTCGAAGGATGCGGTG 480
|||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 670 AAGAATTCTAAACAGTCGGATACGTCGCCTCCGCCGTCTCCTGCGTCGAAGGATACTGTG 729
Query 481 GTTGATGAAGCCGGAGAAACTAGCCACTCATTCCCTAAGCTTGGAAGTTTCTACGAGTTT 540
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 730 GTTGATGAAGCCGGAGAGACTAGCCACTCTTTCCCTAAGCTTGGAAGTTTCTACGAGTTT 789
Query 541 TTCTCTCTTGCTCATCTCACTCCTCCTCTTCAATATATTCGGCTTGTGAGTAAGCGGGAA 600
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||
Sbjct 790 TTCTCTCTCGCTCATCTCACTCCTCCTCTTCAATATATTCGGCTCGCGACTAAGCGGGAA 849
Query 601 ACTGAAGATATAGCGGCGGAAGATCATCTTCTCTCCATTGATGTGAAGCTTTGTAATGGG 660
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 850 ACTGAAGATATAGCCAAGGAAGATCATCTTCTCTCCATTGATGTGAAGCTTTGTAATGGG 909
Query 661 AAGCTCGTTCATATTGAAGGTTGCAGAAAAGGATTCTACAGCATTGGGAAACAAAGAATC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 910 AAGCTCGTTCATATTGAAGGTTGCAGAAAAGGATTTTACAGCATTGGGAAACAAAGAATA 969
Query 721 ATATGTCACAATCTTGTTGATTTGCTTAGACAAATCAGTAGAGCCTTTGATAATGCTTAC 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 970 ATATGTCACAATCTTGTTGATTTGCTTAGACAAATCAGTAGAGCCTTCGATAATGCTTAC 1029
Query 781 AGTGATCTTCTAAAAGCATTTTCGGAGCGCAATAAGTTTGGAAATCTTCCATATGGGTTT 840
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 AGTGATCTTCTGAAAGCATTTTCGGAGCGCAATAAGTTTGGAAATCTTCCATATGGGTTT 1089
Query 841 AGAGCTAACACATGGCTCATCCCGCCTACTGCGGCGCAGTCACCAGCAGCGTTTCCGCCT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090 AGAGCTAACACATGGCTCATCCCGCCTACTGCGGCGCAGTCACCAGCAGCGTTTCCGCCT 1149
Query 901 CTCCCTGTTGAGGATGAGAGATGGGGAGGGGATGGTGGTGGTCAAGGGAGAGATGGCAGT 960
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1150 CTCCCTGTTGAGGATGAGAGATGGGGAGGGGATGGTGGTGGTCAAGGGAGAGATGGCAGC 1209
Query 961 TACGATTTGGTTCCATGGTCCAACGAATTCGCCTTTATTGCATCTATGCCTTGCAAAACA 1020
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1210 TACGACTTGGTTCCATGGTCCAACGAATTCGCCTTTATCGCATCTATGCCTTGCAAAACA 1269
Query 1021 GCTGAGGAGAGACAAGTCAGAGACAGAAAAGTGTTTCTTCTTCACAACCTCTTTGTTGAT 1080
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1270 GCAGAGGAGAGACAAGTCAGAGACAGAAAAGTGTTTCTTCTTCACAACCTCTTTGTTGAT 1329
Query 1081 GTCGCGACTTTCAGAGCCATCAAGGCTGTTCAGAAAGTAATGGCTGAGCCAGTACTTGCT 1140
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1330 GTCGCGACTTTCAGAGCCATCAAGGCTGTTCAGAAAGTAATGGCTGAGCCAGTACTGGCT 1389
Query 1141 GAAGAAGACTCCGAAGTTCTATATTCCGAGACAGTTGGAGACTTGAGTGTTACGGTTACA 1200
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1390 GAAGAAGACTCCGAAGTTCTCTATTCCGAGACAGTTAGAGACTTGACTGTTACGGTTACA 1449
Query 1201 AGGGATACTTCAAATGCAAGTAGTAAAGTGGATACAAAAATTGATGGAATTCAAGCCACT 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1450 AGGGATACTTCAAATGCAAGTAGTAAAGTGGATACAAAAATCGATGGAATTCAAGCCACT 1509
Query 1261 GGTTTGGATAAAAAGAAGCTGATGGAACGGAACCTTCTCAAGGGACTTACTGCTGATGAA 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1510 GGTTTGGATAAAAAGAAGCTGATGGAACGGAACCTTCTCAAGGGACTTACAGCTGATGAA 1569
Query 1321 AATACTGCTGCTCATGTCGTTGCTACTTTAGGAACTATAAGTCTTAAGTACTGTGGTTAC 1380
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1570 AATACTGCTGCTCATGACGTTGCTACTTTAGGAACTATAAGTCTTAAGTACTGTGGTTAC 1629
Query 1381 ATTGCTGTTGTGAAAATAGAGAAGGAGAGTGAGGAGTTAAGCCCACCTTCTCAAATTGTT 1440
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1630 ATTGCTGTTGTGAAATTAGAGAAGGAGAGTGAGGAGTTAAGCCCACCTTCTCAAATTGTT 1689
Query 1441 GACCTCCTTGAACAGCCTGAAGGTGGTGCTAATGCTCTAAATATCAACAGTTTGAGATTC 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1690 GACCTCCTTGAACAGCCTGAAGGTGGTGCTAATGCTCTAAATATCAATAGTTTGAGATTC 1749
Query 1501 CTTCTCCATAAATCCTCTCCTGAGCAGAACAAGAAAACACCTCAGCAACAGGATGATGAG 1560
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1750 CTTCTCCATAAATCCTCTCCTGAGCAGAACAAGAAAACACCTCAGCAACACGATGATGAA 1809
Query 1561 CTTACATCTTCACGGGAATTTGTTAGTAAAATGCTGGAAGAAAGCATTGTTAGGCTTGAG 1620
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1810 CTTACATCTTCACGGGAATTTGTAAGTAAAATGCTGGAAGAAAGCATTGCTAAGCTTGAG 1869
Query 1621 GAAGAGGAGATAGACAGGGATAGTATCATGAGATGGGAGCTTGGAGCTTGTTGGATACAG 1680
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1870 GGAGAGGAGATAGACAGGGATAGTATCATGAGATGGGAGCTTGGAGCTTGTTGGATACAG 1929
Query 1681 CATTTACAAGACCAAAAGAATACAGAGAAGGACAAAAAACAAACCAGTGAAAAGTCTAAG 1740
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1930 CATTTACAAGACCAAAAGAATACAGAAAAGGACAAAAAACAAACCGGTGAAAAGTCTAAG 1989
Query 1741 AATGAATTGAAGGTTGAAGGGCTTGGAAAACCGCTTAAGTCCCTCAATAGCAGCAAGaaa 1800
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1990 AATGAATTGAAGGTTGAAGGGCTTGGGAAACCGCTTAAGTCCCTCAATAGCAGCAA-AAA 2048
Query 1801 -aaaaCAGATGTAAATAGCCCTAAGACG-C-C-G---G---TATCGTCTCAAGTTGATGC 1850
||||||||||| | |||||||||||| | | | | ||||||||||||| |||||
Sbjct 2049 GAAAACAGATGTGAGCAGCCCTAAGACGCCGCAGACTGCATTATCGTCTCAAGTCGATGC 2108
Query 1851 GATTTCTTCAGAGGCTGATATTGCTGCAACAACTGCATCTTTGCAATCCGATGCTGAGAA 1910
| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2109 GGTTTCTTCAGAGGCTGATA---CTG------CTGCATCTTTGCAATCCGATGCTGAGAA 2159
Query 1911 GAATGCTCAAGAAAATGTGCTCATCTTGAAGAATTTGTTGTCTGATGCAGCCTTCACTCG 1970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 GAATGCTCAAGAAAATGTGCTCATCTTGAAGAATTTGTTGTCTGATGCAGCCTTCACTCG 2219
Query 1971 CCTAAAAGAGTCAGATACTGGACTTCATCACAAGTCTTTGCAAGAACTTGTCGACTTGGC 2030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 CCTAAAAGAGTCAGATACTGGACTTCATCACAAGTCTTTGCAAGAACTTGTCGACTTGGC 2279
Query 2031 ACAGAATTATTATACTGAAGTTGCTATACCAAAACTGGTTGCAGATTTTGGTTCGTTGGA 2090
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2280 ACAGAATTATTATACTGAAGTTGCTATTCCGAAACTGGTTGCAGATTTTGGTTCATTGGA 2339
Query 2091 GCTCTCCCCAGTCGATGGCCGGACTCTAACTGATTTTATGCACACAAGAGGTCTTCGGAT 2150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 GCTCTCCCCAGTCGATGGCCGGACTCTAACTGATTTTATGCACACAAGAGGTCTTCGGAT 2399
Query 2151 GCGTTCTTTAGGATATGTTGTGAAGCTTTCAGATAAATTGTCACATGTACAATCTCTGTG 2210
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2400 GCGTTCTTTAGGATATGTTGTGAAGCTTTCAGATAAATTGTCACATGTACAATCGCTGTG 2459
Query 2211 TGTTCATGAGATGATAGTAAGAGCCCTTAAGCATATCCTCCAGGCGGTGATTTCTGCTGT 2270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2460 TGTTCATGAGATGATAGTAAGAGCCCTTAAGCATATCCTCCAGGCGGTGATTTCTGCTGT 2519
Query 2271 TGCTACTGACACTGACAAAGTAGCTACAAAAGTAGCTGCTGCTTTGAACATGATGCTTGG 2330
||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2520 TGCTACTGACACTGACAAAATAGCTATAAAAGTAGCTGCTGCTTTGAACATGATGCTTGG 2579
Query 2331 GATTCCTGAAAATGTTGCAGCAGCACCACATAACTCTTGGAATGTACATCCTCTGATCTT 2390
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2580 GATTCCTGAAAATGTTGCAGCAACACCACATAACCCTTGGAATGTACATCCTCTGATCTT 2639
Query 2391 CCGGTGGTTGGAGAAATTCTTGAAGAAACGATATGATTATGATCTTAATGCCTTCAGTTA 2450
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640 CCGATGGTTGGAGAAATTCTTGAAGAAACGGTATGATTATGATCTTAATGCCTTCAGTTA 2699
Query 2451 CAAGGATCTACGGAAGTTTGCCATTCTCCGTGGATTATGCCATAAGGTTGGTATTGAGTT 2510
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2700 CAAGGATCTACGGAAGTTTGCCATTCTCCGAGGCTTATGCCATAAGGTTGGTATTGAGTT 2759
Query 2511 GATTCCAAGGGACTTTGACATGGATTCTCCTGCACCTTTCCGGAAAACAGATGTGGTCAG 2570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2760 GATTCCAAGGGACTTTGACATGGATTCTCCTGCACCTTTCCGGAAAACAGATGTGGTTAG 2819
Query 2571 TCTTGTCCCAGTGCATAAGACTTTCTATTTAAAATCTCTGCAGCAAGCAGCATGTTCATC 2630
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2820 TCTTGTCCCAGTGCATAAGACTTTCTATTTTAAATCTATGCAGCAAGCAGCATGTTCATC 2879
Query 2631 TGCTGATGGAAGGCAACTTCTGGAGTCATCTAAAACAGCTTTAGACAAAGGAAAGCTTGA 2690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2880 TGCTGATGGAAGGCAACTTCTGGAGTCATCTAAAACAGCTTTAGACAAAGGAAAGCTTGA 2939
Query 2691 AGATGCAGTTACATATGGAACGAAGGCTCTTGCTAAACTTGTAGCAGTTTGCGGTCCCTA 2750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2940 AGATGCAGTTACATATGGAACGAAGGCTCTTGCTAAACTCGTAGCAGTTTGCGGTCCCTA 2999
Query 2751 TCACAGAATGACAGCCGGAGCTTACAGTTTACTTGCTGTAGTTCTATATCACACTGGTGA 2810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3000 TCACAGAATGACAGCCGGAGCTTACAGTTTACTTGCTGTGGTTCTATATCACACTGGTGA 3059
Query 2811 CTTTAACCAGGCTACAATATATCAGCAAAAGGCTTTAGACATCAATGAAAGGGAACTTGG 2870
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3060 CTTTAACCAGGCTACAATATATCAGCAAAAGGCTTTAGACATCAATGAGAGGGAACTTGG 3119
Query 2871 ACTTGATCATCCAGATACAATGAAGAGTTATGGTGATCTTGCTGTCTTCTATTATAGGCT 2930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 ACTTGATCATCCAGATACAATGAAGAGTTATGGTGATCTTGCTGTCTTCTATTATAGGCT 3179
Query 2931 TCAGCATACAGAGCTGGCTCTCAAGTATGTTAAGCGTGCGTTGTATCTCTTACATCTCAC 2990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3180 TCAGCATACAGAGCTGGCTCTCAAGTATGTTAAGCGTGCGTTGTATCTCTTACATCTCAC 3239
Query 2991 ATGCGGTCCATCTCATCCAAACACTGCTGCTACATACATCAATGTAGCCATGATGGAAGA 3050
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3240 ATGCGGTCCATCTCATCCAAATACTGCTGCTACATACATCAATGTAGCCATGATGGAGGA 3299
Query 3051 AGGTCTAGGAAATGTACACGTTGCGTTGAGGTATCTTCACAAAGCTCTCAAGTGTAATCA 3110
||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3300 AGGTCTAGGAAATGTGCATGTTGCCTTGAGGTATCTTCACAAAGCTCTCAAGTGTAATCA 3359
Query 3111 AAGGTTGCTTGGTCCGGACCATATCCAGACTGCTGCAAGCTACCATGCCATAGCAATTGC 3170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3360 AAGGTTGCTTGGTCCGGACCATATCCAGACTGCTGCAAGCTACCATGCCATAGCAATTGC 3419
Query 3171 GCTCTCGTTGATGGAGGCATACCATTTAAGTGTTCAGCATGAGCAAACAACCTTAAGAAT 3230
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3420 GCTCTCCTTGATGGAGGCATACCATTTAAGTGTTCAGCATGAGCAAACAACCTTAAGAAT 3479
Query 3231 CCTCCGAGCAAAGCTGGGGCCAGATGATTTACGTACTCAAGATGCTGCTGCTTGGCTAGA 3290
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3480 CCTTCGAGCAAAGCTGGGGCCAGATGATTTACGTACTCAGGATGCTGCTGCTTGGCTAGA 3539
Query 3291 ATACTTTGAGTCCAAGGCTTTTGAACAACAAGAAGCTGCGCGAAATGGTACTCCGAAGCC 3350
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3540 ATACTTTGAGTCCAAGGCTTTTGAACAACAAGAAGCTGCGCGAAATGGTACTCCTAAGCC 3599
Query 3351 AGACGCGTCTATAGCCAGCAAAGGCCACCTAAGTGTTTTCGATCTACTCGACTATATCAA 3410
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3600 AGACGCGTCTATAGCCAGCAAAGGCCACCTAAGTGTTTCCGATCTACTCGACTATATCAA 3659
Query 3411 CCCAAGCCATAACGCAAAAGGGAAAGAGAGTGTTGCAGCAAAGAGGAAGAACTATATTAT 3470
|||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3660 CCCAAGTCATAACGCAAAAGGCAAAGAGAGCGTGGCAGCAAAGAGGAAGAACTATATTCT 3719
Query 3471 GAAGCTAAAGGAAAAATCCAAGCAGAGCAATGTTTCTGACCACTTGGCAGTGGCAGACAC 3530
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | | |
Sbjct 3720 GAAGCTAAAGGAAAAATCCAAGCAAAGCAATGTTTCTGAACACTTGG---TGG-A-A-AT 3773
Query 3531 TCCGAGAGAAAATCAAAAGGAGATGTCTGAGGAGGAGACGGAAGAAACTGGATCAGAAGA 3590
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3774 TCCGAGAGAAAAGCAAAAGGAGATGTCTGAAGAGGATACGGAAGAAACTGGATCAGAAGA 3833
Query 3591 AGGTAAATCAAGCGAAGACAATCACGACACAATTCTTGCACCAGTAGAAGAATCACCTTC 3650
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 3834 AGGTAAATCAAGCGAAGAGAATCACGAGACAATTCTTGCACCAGTTGAAGAACCACCTTC 3893
Query 3651 TCCTCCAGTCATTGAGGAGGCTATTATGGATAACAGTAATCCAATTACAGCTAGTGAAGT 3710
||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||
Sbjct 3894 TCCTCCAGTAATTGAGGACGCTACTATGGATAACAGTAATCCAATTACATCTAGCGACGT 3953
Query 3711 TTCAACTGAGCCACAACACCCTGATGGTAGTGAAGATGGATGGCAACCGGTGCAAAGACC 3770
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3954 TTCAACCGAGCCACAACACCCTGATGGTAGTGAAGATGGATGGCAACCGGTGCAAAGACC 4013
Query 3771 AAGGTCTACTGGATCATATGGTCGCAGGATGAAGCAACGACGAGCATCTATCGGGAAGGT 3830
|| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 4014 GAGATCTGCTGGATCATATGGTCGCAGGATGAAGCAACGGCGAGCATCCATCGGGAAGGT 4073
Query 3831 ATATACATATCAGAAGAAGAATGTTGAAGCTGATATCGATAACCCTCTTTTCCAGAAAGC 3890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4074 ATATACATATCAGAAGAAGAATGTTGAAGCTGATATCGATAACCCTCTTTTCCAGAATGC 4133
Query 3891 TACTCAGCAGAACGGCAAATACTACATTCTCAAGAAGAGAACAGCATCATATGCAAGCTA 3950
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 4134 TACTCAGCAGAACGACAAATACTACATTCTCAAGAAGCGAACAGCATCATATTCAAGCTA 4193
Query 3951 TGCAGATCATCATTCTCCCGGTTTAACAACTCAAGGCACCAAATTTGGCAGGAAGATAGT 4010
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4194 TGCAGATCATCATTCTCCTGGTTTAACAACTCAAGGCACCAAATTTGGCAGGAAGATAGT 4253
Query 4011 TAAAACCTTGGCGTATCGGGTTAAATCGATGCAGCCATCTTCTGGTAGCACTAAGACTGC 4070
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||
Sbjct 4254 TAAAACCTTGGCGTATCGGGTTAAATCGACGCAGCCGTCTTCTGGTAACGCTAAGACTGC 4313
Query 4071 TGGTGAAACTTCAGAAGAAGATGGGTTGAAGACAGATGCTTCTTCTGTTGAGCCATCTAC 4130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4314 TGGTGAAACTTCAGAAGAAGATGGGTTGAAGACAGATGCTTCTTCTGTTGAGCCACCTAC 4373
Query 4131 TTTGTCTAGTACAGTGCAAAGTGAAGCCTACCACACGAAAAACTCTGTTGTAAGTCTTGG 4190
| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4374 TCTGTCTAGTACTGTGCAAAGTGAAGCCTACCACACGAAAAACTCTGTTGTAAGTCTTGG 4433
Query 4191 AAAATCTCCATCCTACAAAGAAGTAGCACTGGCACCACCTGGTTCCATAGCCAAGTATCA 4250
|||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||
Sbjct 4434 AAAATCTCCATCCTACAAGGAAGTAGCATTGGCACCACCTGGTTCAATTGCTAAGTATCA 4493
Query 4251 AGTCTGGGTTCCACAAGCTGAAGTTTCAGATAAGCAAGAGGATGATGAGGTGGAGaaaaa 4310
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4494 AGTCTGGGTTCCACAAGCGGAAGTTTCAGATAAGCAAGAGGATGATGAGATGGAGAAAAA 4553
Query 4311 aaCTGAACAGGGTACATCAGTGGAGCTTACGAGGGATGAGAAAATGATAACAGGGTTAGA 4370
||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4554 AACTGAACAGGGTACATCAATGGAGCTTACAAGGGATGAGCAAATGATAACAGGGTTAGA 4613
Query 4371 GGAAGAGGTaaaaaaaGAAATTTCTGCAGACACAGAATCTAACAGAACTCAAGGCGAAGA 4430
||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 4614 GGAAGAGGTAAAAAAGGAAATTTCTGCAGACCCAGAATCTAACATAACCCAAGGCGAAGA 4673
Query 4431 AGAGATCAAAGTAGAGTTACAACCATCTGAAGGTGTAGTAGGAGGAAACCTTTTGAATGA 4490
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | | | |||||
Sbjct 4674 AGAGATCAAAGTAGAGTTACAACCATCTGAAGGAGTACTCGGAGGAAGTCATATAAATGA 4733
Query 4491 AAATGAAGAATCTGGAGGTGGCATTCAGGTGGAAGAACAAGTCGAAGCTGAATTGATAGA 4550
||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 4734 AAACGACGAATCTGGGGGTGGAATTCAGGTTGAAGAACAAGTCGAAGTTGAATTGATAAA 4793
Query 4551 CGACGGTGTAACAGATATGATTGATTCGACCAGAGAGCAAGAAGTGATAGATCAATTAGC 4610
||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4794 CGATGGTGTAACAGATATGATTCATTCGACCAGAGAGCAACAAGTGATAGATCAATTAGC 4853
Query 4611 TGCCGATTCCGAAGATCTGAAGGCAAAACTGTTAATATCTACCACAGACTCAGGCGATGC 4670
||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||
Sbjct 4854 TGCTGATTCCGAAGATCTGAAGGCAAAACTGTCAATTTCTACTACGGACTCAGGCGATGC 4913
Query 4671 CTCACGAGGATTGTTACCTAACAAGAAGTTATCTGCGTCAGCTGCTCCATTCAACCCATC 4730
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4914 CTCACGAGGATTGTTGCCTAACAAGAAGCTATCTGCGTCAGCTGCTCCATTCAACCCATC 4973
Query 4731 ATCACCTCCAAGTATTGTACGTCCTACTCCAATAGGCATGAACATTGGACCGTCGTGGCC 4790
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4974 ATCACCTCCAAGTATTATACGTCCTACTCCAATAGGCATGAACATTGGACCGTCGTGGCC 5033
Query 4791 AGTGAACATGACTCTCCATCACGGACCTCCTCCTCCTTACCCTTCACCTCCGACAACTCC 4850
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5034 AGTGAACATGACTCTTCATCACGGACCTCCTCCTCCTTACCCTTCACCTCCGACAACTCC 5093
Query 4851 AAACTTGATGCAGCCAATGTCCTTTGTTTACCCTCCTCCTTACACTCAATCAGTCCCCAC 4910
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5094 AAACTTGATGCAGCCAATGTCCTTTGTTTACCCTCCTCCTTACAGTCAATCAGTCCCCAC 5153
Query 4911 AAGTACTTACCCTGTAACAAGCGGTCCTTTTCATCCCAATCAGTTCCCATGGCAGCTCAA 4970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5154 AAGTACTTACCCTGTAACAAGCGGTCCTTTTCATCCCAATCAGTTCCCATGGCAGCTCAA 5213
Query 4971 TGTGTCGGATTTTGTACCAAGAACGGTTTGGCCCGGATGCCATCCCGTTGAGTTTCCCCC 5030
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5214 TGTGTCGGATTTTGTACCAAGAACGGTTTGGCCTGGATGCCATCCCGTTGAGTTTCCCCC 5273
Query 5031 TCCGCACATGATCACGGAGCCAATAGCTGCAACTGTGTTAGAGCCAACTGTGATTCTGCC 5090
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5274 ACCGCACATGATCACCGAGCCAATAGCTGCAACTGTGTTAGAGCCAACTGTGATTCTGCC 5333
Query 5091 AACGGATATTGACACATCAGGGGTAGAAGAAGA--AAACAA---A-G-AAGAAG-G-CAG 5141
||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| || | | |||| | | |||
Sbjct 5334 AACGGATATTGACACTTCAGGTGTAGAAGAA-ACCAAAGAAGGCACGCAAGATGTGGCAG 5392
Query 5142 --GCA-A-GATGT---GG---CAGTTGACCATGTGAACAACGCAGTTGCACGCAGTGAAA 5191
|| | || || || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5393 TCGCCGATGAAGTTATGGATTCTGTTAACCATGTGAACAACGCAGTTGCACGCAGTGAAA 5452
Query 5192 TGGAGAATGGAAACCGGAAATCCGAGGATGGTGAGAAAACTTTCAGCATTTTGTTAAGAG 5251
||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5453 CGGAGAATGGAAACCGGAAATCTGAGGAAGGTGAGAAAACTTTCAGCATTTTGTTAAGAG 5512
Query 5252 GGAGGAGAAACAGGAAACAAACACTGAGAATGCCAATCAGTTTGCTTAATCGACCTTATG 5311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 5513 GGAGGAGAAACAGGAAACAAACACTGAGAATGCCAATCAGTTTGCTTAACCGGCCTTATG 5572
Query 5312 ATTCTCAACCGTTCAAGCTTGGTTATAGCAGAGTGATCAGAGACAGCGAGGCTCCAAAGT 5371
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5573 ATTCTCAACCGTTCAAGCTTGGCTATAGCAGAGTTATCAGAGACAGCGAGGCTCCAAAGT 5632
Query 5372 CTGTAGCTTGAAACACTCTCCAAAGATTCAGCCAATTCGATGAAATGCAAAACTTACTCA 5431
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || || ||
Sbjct 5633 CTGTAGCTTGAAACACTCTCCAAAGATTGAGCTAATTCGATGAAATGCAAA-CTCACACA 5691
Query 5432 CACATCTCTGATCTTTGCTGTTTCATAGGGGCAGTATAAAGGTAGTTTTGTT-ATTAGTC 5490
|||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||
Sbjct 5692 CACATCTCTGATATTTGCTGTTTCATAGGGACAATATAAAGGTAGTTTCATTCAC-AGTC 5750
Query 5491 AAGGGAAACTGAGGCTTGTGATAGCCTCGAAATGAAGTTACAATGATTTGGATTTTAACC 5550
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||
Sbjct 5751 ATGGGAAACTGAGGCTTGTGATAGCCTCGAAATGAAGTTACAATGTTTTGGATTTTGACC 5810
Query 5551 GGGAAAGGTTGTGCAGAGG-GaaaaaaaGCCAAACCATTCTTTTGTTTACCAAGTGAGGT 5609
|| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5811 GG-AAAGGTTGTGCAGAGGTGAGAAAAAGCCAAGCCATTCTTTTGTTTACCAAGTGAGGT 5869
Query 5610 GATGTATCATTTTTCTGGGGttttttttttttttATTTTAATTCAGCCAATAAAACGTAG 5669
||| || |||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||
Sbjct 5870 GATATAACATTTTTCTGGGGTTTTTCTTTT----A----A-TTCAGCCAATAAAACGTAG 5920
Query 5670 GAAATTTTGGACATAAtttttt-t-----GGTTCTCCATGTTTAAACGTTAGTTTTCACT 5723
|||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5921 GAAATTTTGGACATAATTTTTTCTTTTATGGTTCTTCATGTTTAAACATTAGTTTTCACG 5980
Query 5724 TAATTTACTTCCGTATTTGTCATCGATTACATC 5756
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5981 TAATTTACTTGCGTATTTCTCATCGATTACATC 6013
> AT4G28080.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like
superfamily protein | chr4:13948603-13957840 REVERSE LENGTH=5850
Length=5850
Score = 507 bits (274), Expect = 6e-142
Identities = 626/793 (79%), Gaps = 36/793 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 2612 AGCAAGCAGCATGTTCATCTGCTGATGGAAG-GCAAC-TT-CTGGAGTCATCTAAAACAG 2668
|||| | |||||||||||| || ||||| | || || || |||| ||||| |||||
Sbjct 2648 AGCACGTAGCATGTTCATCCGCAGATGG--GCGC-ACTTTGTTGGAATCATCCAAAACCT 2704
Query 2669 CTTTAGACAAAGG-AAAGCTTGAAGATGCAGTTACA-TATGGAACGAAGGCTCTT-GCTA 2725
| ||||| ||||| ||| || || ||||| || | | ||||| || ||||| || || |
Sbjct 2705 CCTTAGATAAAGGCAAA-CTGGAGGATGCTGTCA-ATTATGGCACCAAGGC-ATTGGCCA 2761
Query 2726 AACTTGTAGCAGTTTGCGGTCCC-TATCACAGAATGACAGCCGGAGCTTACAGT-TTACT 2783
| |||||||| || ||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| || ||| || ||
Sbjct 2762 AGCTTGTAGCTGTGTGCGG-CCCATATCATAGAATGACCGCTGGAGCGTATAGTCTT-CT 2819
Query 2784 TGCTGTAGTTCTATATCACACTGGTGACTTTAACCAGGCTACAATATATCAGCA-AAAGG 2842
||||| || || || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||| |
Sbjct 2820 CGCTGTTGTGCTGTACCATACTGGGGATTTTAACCAGGCTACCATTTATCAGCAGAAA-G 2878
Query 2843 CTTTAGACATCAATGAAAGGGAACTTGGACTTGATCATCCAGATACAATGAAGAGTTATG 2902
| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |
Sbjct 2879 CACTCGACATAAATGAAAGGGAACTTGGACTTGATCACCCAGACACAATGAAAAGCTACG 2938
Query 2903 GTGATCTTGCTGTCTTCTATTATAGGCTTCAGCATACAGAGCT-GGCTCTCAAGTATGTT 2961
| || || ||||||||||||||| | |||||||| |||||| | | || | ||||||||
Sbjct 2939 GCGACCTGGCTGTCTTCTATTATCGTCTTCAGCACACAGAGTTAGCCT-TGAAGTATGTC 2997
Query 2962 AAGCGTGCGTTGTATCTCTTACATCTCACATGCGGTCCATCTCATCCAAACACTGCTGCT 3021
|| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||
Sbjct 2998 AACCGTGCCTTGTATCTTTTGCATCTAACATGTGGACCATCACATCCAAATACAGCTGCC 3057
Query 3022 ACATACATCAATGTAGCCATGATGGAAGAAGGTCTAGGA-AATGTACACGTTGCGTTGAG 3080
|| || || || ||||| ||||||||||||||| | | | |||| || || || || ||
Sbjct 3058 ACTTATATAAACGTAGCAATGATGGAAGAAGGTAT-GAAGAATGCCCATGTGGCTTTAAG 3116
Query 3081 GTATCTTCACAAAGC-TCTCAAGTGTAATCAAAGGTTGCTTGGTCCGGACCATATCCAGA 3139
|| ||||| |||| | | || ||||| || || | ||||| | || ||||||||||
Sbjct 3117 ATACCTTCATGAAGCAT-TGAAATGTAACCAGAGACTACTTGGAGCTGATCATATCCAGA 3175
Query 3140 CTGCTGCAAGCTACCATGCCATAGCAATTGCGCTCTCGT-TGATGGAGGCATAC-CATTT 3197
|||||||||||||||||||||| || ||||| || || | ||||||| |||||| | ||
Sbjct 3176 CTGCTGCAAGCTACCATGCCATTGCTATTGCTCTTTC-TCTGATGGACGCATACTCCTTG 3234
Query 3198 AAGTGTTCAGCATGAGCAAACAAC-CTTA-AGAATCCTCCGAGCAAAGCTGGGGCCAGAT 3255
| | ||||| |||||||| || || || | ||| || | | |||||| || || || ||
Sbjct 3235 A-GCGTTCAACATGAGCAGACCACTCT-ACAGATTC-TACAAGCAAAACTAGGCCCTGAG 3291
Query 3256 GAT-TTACGTACTCAAGATGCTGCTGCTTGGCTAGAATACTTT-GAGTCCAAGGCTTTTG 3313
||| || || || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||| | |
Sbjct 3292 GATCTT-CGGACACAGGATGCGGCTGCGTGGCTTGAATA-TTTCGAGTCCAAAGCTCTGG 3349
Query 3314 AACAACAAGAAGCTGCGCGAAATGGTACTCCGAAGCCAGACGCGTCTATAGCCAGCAAAG 3373
|||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 3350 AACAGCAAGAAGCTGCACGAAATGGTACTCCCAAGCCAGACGCCTCTATTTCCAGCAAAG 3409
Query 3374 GCCACCTAAGTGT 3386
|||| || |||||
Sbjct 3410 GCCATCTCAGTGT 3422
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 287163777248
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5