BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg470155
Length=3212
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G01220.1 | Symbols: FKGP, AtFKGP | L-fucokinase/GDP-L-fucose... 5046 0.0
> AT1G01220.1 | Symbols: FKGP, AtFKGP | L-fucokinase/GDP-L-fucose
pyrophosphorylase | chr1:91376-95651 FORWARD LENGTH=3532
Length=3532
Score = 5046 bits (2732), Expect = 0.0
Identities = 3031/3178 (95%), Gaps = 9/3178 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTCTAAGCAGAGGAAGAAAGCTGACTTAGCCACCGTTTTGCGCAAGTCATGGTACCAC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 266 ATGTCTAAGCAGAGGAAGAAAGCTGACTTAGCCACCGTTTTGCGCAAGTCATGGTACCAC 325
Query 61 TTAAGGCTCTCGGTTCGCCATCCCACTAGGGTCCCAACCTGGGATGCGATTGTTCTCACA 120
|||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||
Sbjct 326 TTAAGGCTCTCGGTGCGCCATCCCACTCGGGTCCCGACTTGGGATGCGATTGTGCTCACA 385
Query 121 GCGGCTAGTCCTGAACAGGCAGAGCTCTACGAGTGGCAGCTCCGGCGAGCGAAACGGATG 180
||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 386 GCGGCTAGTCCTGAACAAGCGGAGCTCTACGACTGGCAGCTCCGGCGAGCGAAACGTATG 445
Query 181 GGACGAATAGCTAGCTCCACTGTCACTTTAGCTGTTCCTGATCCAGATGGCAAACGGATC 240
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 446 GGACGAATAGCTAGCTCCACTGTCACTTTGGCCGTTCCTGATCCAGATGGCAAACGGATC 505
Query 241 GGGTCTGGTGCTGCTACTCTCAACGCCATTTATGCTCTCGCTCGCCATTATGAGAAATTG 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 506 GGGTCTGGTGCTGCTACTCTCAACGCCATTTATGCTCTCGCTCGTCATTATGAGAAATTG 565
Query 301 GGTTTTGATCCTGGTCCCGAGGTGGAAGTTGCAAATGGTACTTGCAAATGGGTTAGATTC 360
|||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 566 GGTTTTGATCTTGGTCCCGAGATGGAAGTTGCGAATGGTGCTTGCAAATGGGTTAGATTC 625
Query 361 ATCTCTGGAAAGCATGTATTGATGCTTCATGCTGGTGGTGACTCCAAAAGGGTTCCTTGG 420
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 626 ATCTCTGCAAAGCATGTATTGATGCTTCATGCTGGAGGTGACTCCAAAAGGGTTCCATGG 685
Query 421 GCAAATCCTATGGGGAAAGTATTCCTCCCACTTCCTTATCTTGCAGCTGATGACCCTGAT 480
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 686 GCAAATCCTATGGGCAAAGTATTCCTCCCACTTCCTTATCTTGCAGCTGATGACCCTGAT 745
Query 481 GGTCCTGTTCCTCTTCTTTTTGATCATATACTTGCAATCGCTTCATGTGCAAGACAAGCT 540
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 746 GGTCCTGTTCCTCTCCTTTTTGATCATATTCTTGCTATCGCTTCATGTGCAAGACAAGCT 805
Query 541 TT-GAGAGACCAAGGTGGATTATTCATTATGACTGGAGACGTCCTTCCTTGTTTTGATGC 599
|| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 806 TTCCA-AGACCAAGGTGGATTATTTATTATGACTGGAGACGTCCTTCCTTGTTTTGATGC 864
Query 600 TTTTAGAATGACTCTCCCTGAAGACGCAGCTTCTATAGTTACTGTGCCTATCACTCTCGA 659
||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 865 TTTTAAAATGACTCTCCCTGAAGACGCAGCTTCCATAGTTACTGTGCCTATTACTCTCGA 924
Query 660 TATTGCTTCCAACCATGGTGTTATTGTCACATCCAAATCTGAGTCCCTTGCTGAAAGCTA 719
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 925 TATTGCCTCCAACCATGGTGTTATTGTCACATCAAAATCTGAGTCACTTGCTGAAAGCTA 984
Query 720 TACTGTCAGTTTAGTGAATGATCTTCTGCAGAAGCCTACAGTAGAAGAGCTTGTCAAGAA 779
||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 985 TACAGTTAGTTTAGTCAATGATCTTCTGCAGAAGCCTACAGTAGAGGATCTTGTCAAGAA 1044
Query 780 AGATGCTATCTTACATGATGGACGGACGCTCCTTGACACTGGAATAATATCTGCAAAGGG 839
|||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||
Sbjct 1045 AGATGCAATTTTACATGATGGACGGACACTCCTTGACACTGGGATAATATCTGCTAGGGG 1104
Query 840 TAGAGCATGGTTGGACCTAGTCGCTCTTGGATGCTCGTGCCAACCCATGATCTTAGAGCT 899
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105 CAGAGCATGGTCGGACCTGGTCGCTCTTGGATGCTCGTGCCAACCCATGATCTTAGAGCT 1164
Query 900 TATAAGCAGTAAGAAAGAGATGAGTTTGTACGAAGATTTGGTGGCTGCTTGGGTTCCTTC 959
|||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1165 TATAGGTAGTAAGAAAGAGATGAGTTTGTATGAAGATTTGGTGGCTGCTTGGGTTCCTTC 1224
Query 960 AAGGCATGATTGGCTGCGAACCAGACCTTTGGGTGAACTTCTTGTTAACAGTCTGGGGAG 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1225 AAGGCATGATTGGCTGCGAACCAGACCTTTGGGTGAACTTCTTGTTAACAGTCTGGGGAG 1284
Query 1020 GCAAAAGATGTACAGCTACTGCACCTATGATTTGCAGTTTTTGCATTTTGGAACATCAAG 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285 GCAAAAGATGTACAGCTACTGCACCTATGATTTGCAGTTTTTGCATTTTGGAACATCAAG 1344
Query 1080 TGAGGTATTGGATCACTTAAGCGGAGATGCTTCAGGAATCGTCGGTCGAAGACACTTATG 1139
||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||
Sbjct 1345 TGAGGTATTGGATCATTTAAGCGGGGATGCTTCAGGAATTGTTGGTCGGAGACACTTATG 1404
Query 1140 TTCCATCCCTGCAACCACCGTTTCTGATATTGCAGCATCTTCTGTTATTTTGTCTAGTGA 1199
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1405 TTCCATCCCTGCAACTACGGTTTCTGATATTGCAGCATCTTCCGTTATTTTGTCTAGTGA 1464
Query 1200 AATTGCACCTGGTGTCTCCATTGGTGAAGATTCACTTATATATGATTCAACAGTTTCTGG 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465 AATTGCACCTGGTGTCTCCATTGGTGAAGATTCACTTATATATGATTCAACAGTTTCTGG 1524
Query 1260 TGCTGTACAAATTGGTTCTCAGTCAATAGTTGTTGGTATTCACATCCCGAGCGAAGATCT 1319
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1525 TGCTGTACAAATTGGTTCTCAGTCCATAGTTGTTGGTATTCACATCCCGAGCGAAGATCT 1584
Query 1320 TGGAACTCCAGAGAGGTTCAGGTTCATGCTTCCGGATAGGCATTGTCTTTGGGAGGTCCC 1379
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1585 TGGAACTCCAGAGAGTTTCAGGTTCATGCTTCCTGATAGGCATTGTCTTTGGGAGGTCCC 1644
Query 1380 ACTGGTGGGACATAAGGGAAGAGTGATTGTGTATTGTGGTCTCCATGACAATCCAAAGAA 1439
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1645 ACTAGTGGGACATAAGGGAAGAGTGATTGTGTATTGTGGTCTCCATGACAATCCAAAGAA 1704
Query 1440 CTCAATTCATAAAGATGGAACTTTTTGCGGTAAACCCTTAGAGAAGGTATTGTTTGATCT 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1705 CTCAATTCATAAAGATGGAACTTTTTGCGGTAAACCCTTGGAGAAGGTATTGTTTGATCT 1764
Query 1500 TGGCATTGAGGAAAGTGACCTTTGGAGCTCGTATGTTGCACAAGATAGGTGTTTGTGGAA 1559
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1765 TGGCATTGAGGAAAGCGACCTCTGGAGCTCGTATGTTGCACAAGATAGATGTTTGTGGAA 1824
Query 1560 TGCAAAACTGTTCCCGATTCTTACTTATAGTGAAATGCTGAAGTTAGCGTCGTGGTTGAT 1619
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1825 TGCAAAACTGTTCCCGATTCTTACGTATAGTGAAATGCTGAAGTTAGCGTCGTGGTTGAT 1884
Query 1620 GGGTTTAGATGATAGTAGAAACAAGGAGAAGATTACCTTGTGGAGAAGCTCACAACGTGT 1679
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1885 GGGTTTAGATGATAGTAGAAACAAGGAGAAGATTAAGTTGTGGAGAAGCTCACAACGTGT 1944
Query 1680 AAGCTTAGAAGAGTTGCACGGATCAATAAACTTTCCTGAGATGTGCAATGGCTCCAGCAA 1739
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1945 AAGCTTAGAAGAGTTGCATGGATCAATCAACTTTCCTGAGATGTGCAATGGTTCCAGCAA 2004
Query 1740 TCATCAAGCTGATCTTGCGGCTGGAATCGCTAAAGCATGTATGAACTATGGTATGCTTGG 1799
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2005 TCATCAAGCTGATCTTGCGGGTGGAATCGCTAAAGCATGTATGAACTATGGTATGCTTGG 2064
Query 1800 GCGAAATTTTTCTCAGCTGTGCCATGAGATTTTACAGAAAGAGTCATTAGGATTGGAAAT 1859
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2065 GCGTAATTTGTCTCAGCTGTGCCATGAGATTTTACAGAAAGAGTCATTAGGATTGGAAAT 2124
Query 1860 ATGCAAGAATTTTCTGGATCAATGTCCCAAATTTCAGGAGCAAAACTCCAAAATTCTTTC 1919
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 2125 ATGCAAGAATTTTCTGGATCAATGTCCCAAATTTCAGGAGCAGAACTCCAAAATTCTTCC 2184
Query 1920 AAAGAGTCGGGCATACCAGGTAGAAGTTGATCTTCTTCGAGCATGTGGGGATGA-GCCAA 1978
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2185 AAAGAGTCGAGCATACCAGGTAGAAGTTGATCTTCTTCGAGCATGTGGGGATGAAGC-AA 2243
Query 1979 AAGCTATCGACTTGGAGCATAAAGTCTGGGCAGCAGTTGCAGAAGAAACTGCTTCAGCTG 2038
||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2244 AAGCTATAGAGTTGGAGCATAAAGTATGGGGAGCAGTTGCAGAAGAAACTGCTTCAGCTG 2303
Query 2039 TGAGATATGGTTTTAGAGAACATCTGTTGGAATCAAGTGGAAAGCCCCATTCCGAGAA-C 2097
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |
Sbjct 2304 TGAGATATGGTTTTAGAGAACATCTGTTGGAATCAAGTGGCAAGTCTCATTCTGAGAATC 2363
Query 2098 AATATTTCTCATCCGGATCGAGTTTTTCAACCAAAAAGGACAAAAGTTGAACTACCAGTT 2157
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2364 A-TATTTCTCATCCGGATCGAGTTTTTCAACCAAGAAGGACAAAAGTTGAACTACCAGTT 2422
Query 2158 CGGGTAGATTTTGTAGGAGGTTGGAGTGATACACCTCCATGGAGTTTAGAGCGTGCAGGT 2217
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2423 CGGGTAGATTTTGTAGGAGGTTGGAGTGATACACCTCCATGGAGCTTAGAGCGTGCAGGT 2482
Query 2218 TGCGTCCTGAACATGGCTATAACTTTAGAAGGTTCACTTCCAATTGGCACAATCATCGAA 2277
| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2483 TACGTCCTGAACATGGCTATAACCTTAGAAGGTTCACTTCCAATTGGCACAATCATTGAA 2542
Query 2278 ACAACAAATCAGATCGGAATCTCAATCCAAGACGACACTGGAAATGAGCTACACATCGAA 2337
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2543 ACAACAAATCAGATGGGAATCTCAATCCAAGACGACGCTGGAAACGAGCTACACATCGAA 2602
Query 2338 GATCCAATAAGCATCAAGACACCATTTGAAGTCAATGATCCATTCAGGCTTGTTAAATCT 2397
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2603 GATCCAATAAGCATTAAGACACCATTTGAAGTCAATGATCCATTCAGGCTTGTTAAATCT 2662
Query 2398 GCTCT-TCTGGTAACAGGCATTGTCCAAGAAAACTTTGTCGACTCCACGGGGTTAGCAAT 2456
||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 2663 GCTCTAT-TGGTAACCGGCATTGTCCAAGAAAATTTTGTTGACTCCACAGGGTTAGCAAT 2721
Query 2457 AAAGACATGGGCAAATGTTCCTCGTGGTAGTGGTCTAGGAACCTCGAGTATTCTAGCTGC 2516
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2722 AAAGACATGGGCCAATGTTCCTCGTGGCAGTGGTCTAGGAACCTCGAGCATTCTAGCTGC 2781
Query 2517 AGCTGTTGTGACAGGACTTCTCCAGATATCTGATGGAGATGAAAGCAATGAAAACGTTGC 2576
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2782 AGCTGTTGTGAAAGGACTTCTCCAGATATCTAATGGAGATGAAAGCAATGAAAACATTGC 2841
Query 2577 GAGGCTCGTCTTGGTTCTGGAGCAACTCATGGGTACTGGAGGTGGCTGGCAAGATCAGAT 2636
|| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2842 AAGACTTGTCTTGGTTCTGGAGCAACTCATGGGTACAGGAGGTGGCTGGCAAGATCAGAT 2901
Query 2637 TGGTGGATTATACCCAGGAATCAAATTCACTTCAAGTTTTCCAGGAATTCCTTTGCGTCT 2696
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 2902 TGGTGGATTATATCCAGGAATCAAATTCACTTCAAGTTTTCCAGGAATCCCTATGCGTCT 2961
Query 2697 CCAAGTTGTTCCTTTACTCGCCTCGCCACAGCTAATCTCAGAGTTGGAGAAACGCCTCCT 2756
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2962 TCAAGTTGTTCCTTTACTCGCCTCGCCACAGCTAATTTCAGAGTTGGAGCAACGCCTCCT 3021
Query 2757 CGTAGTTTTCACGGGTCAAGTCAGGCTTGCTCATCAAGTCCTACACAAGGTCGTTACAAG 2816
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3022 TGTTGTTTTCACGGGTCAAGTCAGGCTAGCTCATCAAGTCCTACACAAGGTCGTTACAAG 3081
Query 2817 GTATCTGCAAAGAGATAATCTCTTGATTTCAAGCATTAAGCGATTGACCGAGCTGGCGAA 2876
|||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3082 GTATTTGCAAAGAGATAATCTCCTAATTTCAAGCATTAAGCGATTGACGGAGCTGGCGAA 3141
Query 2877 ATCCGGGAGAGAAGCTTTAATGAACTGTGAAGTTGACGAGCTAGGCGACATAATGTCAGA 2936
|||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3142 ATCCGGTAGAGAAGCGTTGATGAACTGTGAAGTTGACGAGGTAGGCGACATAATGTCAGA 3201
Query 2937 AGCTTGGAGATTGCATCAAGAGCTCGACCCGTATTGCAGCAATGAGTTTGTGGATAAGCT 2996
|||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3202 AGCTTGGAGACTGCATCAAGAGCTGGATCCGTATTGCAGCAATGAGTTTGTGGATAAGCT 3261
Query 2997 TTTCGCGTTTTCGCAACCTTATAGCTCAGGATTCAAGCTTGTAGGTGCAGGTGGTGGAGG 3056
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 3262 TTTTGAGTTTTCGCAACCTTATAGCTCAGGATTCAAGCTGGTAGGTGCAGGTGGTGGTGG 3321
Query 3057 ATTCTCTCTTATATTGGCTAAAGACACAGAGAAAGCTAAGGAGTTAAGACAGAGATTGGA 3116
|||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3322 ATTCTCACTTATATTGGCTAAGGACGCAGAGAAAGCCAAGGAGTTAAGACAGAGATTGGA 3381
Query 3117 AGAACATGCAGAGTTTGATGTCAAAGTTTATAACTGGAGCGTCTGTATTT-AAATATA 3173
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||
Sbjct 3382 AGAACATGCAGAGTTTGATGTCAAAGTTTACAACTGGAGCATCTGTATTTGAAAGATA 3439
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 159781713455
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5