BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg470456 Length=3696 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G04700.1 | Symbols: | PB1 domain-containing protein tyrosin... 5337 0.0 > AT1G04700.1 | Symbols: | PB1 domain-containing protein tyrosine kinase | chr1:1316254-1320919 FORWARD LENGTH=3886 Length=3886 Score = 5337 bits (2890), Expect = 0.0 Identities = 3138/3255 (96%), Gaps = 27/3255 (1%) Strand=Plus/Plus Query 298 AATTTGGGGAGTTGAAGAATAGGACTTGTTGGTTCCTCAGAATCTGTGATACAAGAGATT 357 ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 395 AATTTGGGGAGTTGAAGAACA-GA--AATTGGTTACTCAGAATCTGTGATACAAGAGATT 451 Query 358 GTGCACAAGAAAGAATAAGGC-TTTTTGGTTCTTGAGAACATGAGAATGGAGTTTCCTGG 416 ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 452 GTGCAGAAGAAAGAATAAAGCGTTTTTGGTTCTTGAGAACATGAGAATGGAGTTTCCTGG 511 Query 417 CAGCTCCAATCAGCATTTAGGTAGGGATAGGTTCAATGGGGAAGTCGGTAATAACACGCG 476 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || Sbjct 512 CAGCTCCAATCAGCATTTAGGTAGGGATAGGTTCAATGGAGAAGTTGGT--T-----GC- 563 Query 477 TGATGATAATATCTGTTCTCAGACAGGAGAGGAATTTTCAAATGAGTTTTTGAGGGATTT 536 | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 564 -G--G-TAATAACTGTTCTCAGACAGGAGAGGAATTTTCAAATGAGTTTTTGAGGGATTT 619 Query 537 TGGTGCTCAACGAAGAGT---ACAGGGTGGTGTGAGTAGAAATATTGAGGGTAACTATAA 593 |||||||||||||||| | ||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||||| Sbjct 620 TGGTGCTCAACGAAGACTACAACATGGTGGTGTTAACAGAAATGTTGAGGGTAATTATAA 679 Query 594 TAATCGCCATCTTGTTTATGAGGATTTCAACAGAATTCTTGGGCTTCAAAGAGTTGATTC 653 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 680 TAATCGCCATCTTGTTTACGAGGATTTCAACAGAATTCTTGGCCTTCAAAGAGTTGATTC 739 Query 654 CAACATGTCAGAAGGTATTAATTCCTCGAGTGGATACTTTGCTGAGTCAAATGTTGCAGA 713 ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 740 CAACATGTCAGAAGGTATTAATTCCTCGAATGGTTACTTTGCTGAGTCAAATGTTGCAGA 799 Query 714 CTCACCTCGGAAGATGTTTCAAACTGCAACATCAGATGTTTATTTGCCAGAAGTATTGAA 773 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 800 CTCACCTCGGAAGATGTTTCAAACTGCAATATCAGATGTTTATTTGCCTGAAGTATTGAA 859 Query 774 GCTTCTTTGTAGTTTCGGGGGAAGGATCTTACAGAGACCTGGTGATGGCAAGCTTAGATA 833 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| Sbjct 860 GCTTCTTTGTAGCTTCGGGGGAAGGATCTTACAGCGGCCTGGTGATGGCAAGCTTAGATA 919 Query 834 CATTGGAGGGGAGACTCGGATTATCTCAATACGAAAACATGTTGGATTAAACGAATTGAT 893 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 920 CATTGGAGGGGAGACTCGGATTATCTCAATACGCAAACATGTTGGATTAAACGAATTGAT 979 Query 894 GCACAAGACTTATGCTTTGTGCAACCATCCGCATACAATCAAGTATCAATTACCAGGAGA 953 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 980 GCACAAGACTTATGCTTTGTGCAACCATCCGCATACAATCAAGTATCAATTACCAGGAGA 1039 Query 954 AGATCTTGATGCACTAATATCGGTTTGCTCAGATGAGGATCTTCTTCATATGATTGAAGA 1013 |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1040 AGATCTTGATGCCCTTATATCGGTTTGCTCAGATGAGGATCTTCTTCATATGATTGAAGA 1099 Query 1014 GTATCAAGAAGCTGAAACAAAGGCTGGATCCCAGAGGATTAGGGTCTTTCTTGTATCTTC 1073 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1100 GTATCAAGAAGCTGAAACAAAGGCTGGATCCCAGAGGATTAGGGTCTTTCTTGTACCTTC 1159 Query 1074 AACAGAATCATCAGAGAGTCC-AAAGATTTTCAATGAAAGGAATATGAACATAAACCGAA 1132 |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1160 CACAGAATCATCAGAGAGTCCTAAA-ATTTTCCATGAAAGGAATATGAACATAAACCGAA 1218 Query 1133 ACACGAACCAGCAGACTGATATAGATCATTATCAGTATGTTTCAGCTCTTAATAATGTTG 1192 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| Sbjct 1219 ACACGAACCAGCAGACGGATATAGATCATTATCAGTATGTTTCAGCTCTTAATGGTATTG 1278 Query 1193 TGGATGTGAGTCCTCAAAAGAGTTCCAGCGGGCAAAGTGGGACAAGTCAGACAACACAAT 1252 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct 1279 TAGATGTGAGTCCTCAAAAGAGTTCCAGCGGCCAAAGTGGAACAAGTCAGACCACACAAT 1338 Query 1253 TTGGGAATGCTTCAGAATTTAGCCCTACATTTCATCTTCGAGACTCGCCTACTTCTGTTC 1312 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1339 TTGGGAATGCTTCAGAATTTAGCCCTACATTTCATCTTCGAGACTCGCCTACTTCTGTTC 1398 Query 1313 ATACATGGGAACACAAAGACTA-CAACAGTCCAACCTTCATGAAACCATATGCGAACACG 1371 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1399 ATACATGGGAACACAAAGAC-AGCAACAGTCCAACCTTCATGAAACCATATGGGAACACG 1457 Query 1372 AATGCTGTTCATTTTATGCCGAAAATGCAGATTCCGAGGAACTCGTTTGGTCAACAATCT 1431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1458 AATGCTGTTCATTTTATGCCGAAAATGCAGATTCCCAGGAACTCGTTTGGTCAACAATCT 1517 Query 1432 CCTCCAGCATCTCCTTTTTCAGCT-CACAAGAGAGCAAATACCGACGTTCCTTATTTTGC 1490 |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1518 CCTCCAACATCTCCTTTTTCAG-TCCACAAGAGAGCAAACACCGACGTTCCTTATTTTGC 1576 Query 1491 TGATCAAAATGGTTTCTTTGACCCTTACTTGGCTGCTCCAAACTTCCCTCAGCAACATAG 1550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| Sbjct 1577 CGATCAAAATGGTTTCTTTGACCCTTACTTGGCTGCTCCAAACTTCCCACAGCAAAATAG 1636 Query 1551 GTTCTTTTTTGATACTACTACACAAAAGCAGAAGCATCCAGAAGTGAATCTTCATGACCG 1610 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1637 GTTCTTTTTTGAGACTACTACACAAAAGCAGAAGCATCCAGAAGTGAATCTTCATGACCG 1696 Query 1611 GAGGCCAAGCGACGATATTTACCCCCATGGCCAAGCTTATATGGGAGCCGAGAAATTGAC 1670 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| Sbjct 1697 GAGGCCAAGCGATGATATTTACCCCCATGGCCAAGCTTATATCGGAGCCGAGAAAATGAC 1756 Query 1671 GCTTAAGAAAAACGCTCTTTCTGATCCCCAGCTGCATGATGAGAGCCAAATCAACAATGG 1730 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1757 GCTTAAGAAAAACGCTCTTTCTGATCCGCAGCTGCATGATGAGAGCCAAATCAACAATGG 1816 Query 1731 GTTAGAAGCATTTACCAAACAACCATGGAAAATATTGAGAAAGAATCTACATGTTGTGGC 1790 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1817 GTTAGAAGCATTTACCAAACAACCATGGAAAATATTGAGAAAGAATCTACGTGTTGTGGC 1876 Query 1791 TACGTCAAAGTGGGAAGATAGTGATGATATCTATTTCAATAATCCAGAAGGCAAGAGAAG 1850 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1877 TACATCAAAGTGGGAAGATAGTGATGATATCTATTTCAATAATCCAGAAGGCAAGAGATG 1936 Query 1851 CAAGGAGCTTGAACTCACCAAAGAAGTTCCTAATAATTGGATCGATGGCGATCATAATCC 1910 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| Sbjct 1937 CAAGGAGCTTGAACTCACCAAGGAAGTTCCTAATAGTTGGATCAATCGCGATAATAATCC 1996 Query 1911 CGGTTCTTTTGACCAGGCAACAAAGAAACAAGG-TGGTAGTAACAGTAATAGCTCCTTCA 1969 || ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1997 CGATTCTTTTGATCAGGCAACAAAGAAAC-AGGATGGTAGTAACAGTAATAGCTCCTTCA 2055 Query 1970 GTCCGAATTATTTCAGTCCGAATCATCAACCAGCTGCTCAGGTTACTTCAAGTGATTCAC 2029 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2056 GTCCGAATTATTTCAGTCCGAATCATCAACCAGCTGCTCAGATTACTTCAAGTGATTCAC 2115 Query 2030 AAGATTCAGGAAGCTCAGTGTTCTCTTTATCAGTTAACACTAACGAAAATTATCTTGATT 2089 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2116 AAGATTCAGGAAGCTCAGTGTTCTCTTTATCAGTTAACACCAACGAAAATTATCTTGATT 2175 Query 2090 GTTCGAAGGACAAATTCAATGGTTTCCAGCATGACATGTCACTAGATATTCTCATCAGAA 2149 |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2176 GTTCGAGGGAAAAATTTAATGGTTTCCAGCATGACATGTCACTAGATATTCTCATCAGAA 2235 Query 2150 GCCACACTTCAGCTACAGATCAACTATGTTGTACAACCAAGTCAAGTGATAAAGCAGATT 2209 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2236 GCCACACTTCAGCTACAGATCAACTATGTAGTACAACCAAGTCAAGTGATAAAGCAGATT 2295 Query 2210 ACTCCTCACCCAATACAAATTTCCCCGTGGAATTTCTGAGACAGGAGCCTATGATTCCGA 2269 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2296 ACTCCTCACCCAATACAAATTTCCCCGTGGTATTTCTGAGACAGGAACCTATGATTCCGA 2355 Query 2270 GACATGATTTGGAGACAAATAGCGATGATTCAGATACTCAAAACTCTCTTCCTAGAGAAG 2329 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2356 GACATGATTTGGAGACAAATAGCGATGATTCAGATACTCAAAAATCTCTTCCTAGAGAAG 2415 Query 2330 AGAGTATTCACTATAGTGGATTGCCACTTAGGAAGGTGGGAAGTAGAGAAACTACTTTTA 2389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2416 AGAGTATTCACTATAGTGGATTGCCACTTAGGAAGGTGGGAAGTAGAGAAACTACTTTTA 2475 Query 2390 TGCACACGCAGGAATCAGATGATTTCTTCAAAAGCAAGCTGCTTGGTCCACAGTTGATAG 2449 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2476 TGCACACGCAGGGGTCAGATGATTTCTTCAAAAGCAAGCTGCTTGGTCCACAGTTGATAG 2535 Query 2450 TTGAGGATGTGACGAACGAAGTAATTTCAGATAACCTCTTATCAGCTACTATTGTCCCTC 2509 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2536 TTGAGGATGTGACGAACGAAGTAATTTCAGATAATCTCTTATCAGCTACTATTGTCCCTC 2595 Query 2510 ATGTACATAGTGAGTCAGATGATGATCACAAATCCTACACAAGGGAGAAAGAGATTACAA 2569 | ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2596 AAGTAAATAGGGAGTCCGATGATGATCACAAATCCTACACAAGGGAGAAAGAGATTACAA 2655 Query 2570 ATGCGGATCATGAATCAGAAATGGAGGAAAAGTACAAGAAAAGCAGAAACACCGATGATT 2629 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2656 ATGCGGATCATGAATCAGAAATGGAGGAAAAGTACAAGAAAAGCAGAAACACCGATGATT 2715 Query 2630 CATTCAGCGAAGCTGCAATGGTTGAAATTGAAGCTGGAATATATGGCTTACAGATAATTA 2689 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2716 CATTCAGCGAAGCTGCAATGGTTGAAATCGAAGCTGGAATATATGGCTTACAGATAATTA 2775 Query 2690 AAAACACTGATCTTGAAGACTTACACGAGCTTGGTTCTGGTACATTTGGAACTGTTTACT 2749 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2776 AAAACACTGATCTTGAAGACTTACACGAGCTTGGATCTGGTACATTTGGAACTGTTTACT 2835 Query 2750 ATGGGAAGTGGAGAGGAACTGATGTTGCTATCAAGAGGATAAAGAATAGTTGCTTCTCTG 2809 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2836 ATGGGAAGTGGAGAGGAACTGATGTTGCTATCAAGAGGATAAAGAATAGTTGTTTCTCTG 2895 Query 2810 GTGGATCATCCGAGCAAGCACGGCAGACTAAAGATTTCTGGAGAGAAGCTCGGATATTGG 2869 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2896 GTGGATCATCCGAGCAAGCACGGCAGACTAAAGATTTCTGGAGAGAAGCTCGGATATTGG 2955 Query 2870 CGAATCTTCACCATCCCAACGTAGTGGCCTTTTATGGAGTTGTACCAGATGGACCTGGTG 2929 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2956 CGAATCTTCACCATCCTAACGTAGTGGCCTTTTATGGAGTTGTACCAGATGGACCTGGTG 3015 Query 2930 GAACAATGGCAACAGTGACTGAGTATATGGTGAACGGATCTTTGAGACATGTCTTGCAGA 2989 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3016 GAACAATGGCAACAGTGACTGAGTATATGGTGAACGGATCTTTGAGGCATGTCTTGCAGA 3075 Query 2990 GAAAAGACAGATTACTTGATAGGCGCAAAAAACTGATGATAACTCTTGATTCTGCATTTG 3049 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3076 GAAAAGACAGATTACTTGATAGGCGCAAAAAACTGATGATAACTCTTGATTCTGCATTTG 3135 Query 3050 GCATGGAGTATCTACATATGAAAAATATTGTTCATTTTGATCTTAAATGCGATAACTTGC 3109 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3136 GCATGGAGTATCTACATATGAAAAATATTGTTCATTTTGATCTTAAATGCGATAACTTGC 3195 Query 3110 TAGTAAACTTGAGGGATCCACAACGACCCATTTGCAAGGTTGGAGATTTCGGATTGTCGA 3169 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3196 TTGTAAACTTGAGGGATCCACAACGACCCATTTGCAAGGTTGGAGATTTCGGATTGTCGA 3255 Query 3170 GAATAAAACGAAACACGCTTGTCTCTGGTGGAGTAAGAGGAACCCTTCCTTGGATGGCTC 3229 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | Sbjct 3256 GAATAAAACGAAACACGCTTGTCTCTGGTGGAGTAAGAGGAACCCTTCCATGGATGGCAC 3315 Query 3230 CAGAGCTTCTAAACGGAAGCAGCAATCGGGTCTCAGAGAAAGTCGATGTTTTCTCATTTG 3289 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3316 CAGAGCTGCTAAACGGAAGCAGCAATCGGGTCTCAGAGAAAGTCGATGTTTTCTCATTTG 3375 Query 3290 GTATTGTGATGTGGGAGATCTTGACAGGCGAAGAACCCTATGCGAATCTGCATTGCGGTG 3349 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3376 GTATCGTGATGTGGGAGATCTTGACAGGCGAAGAACCCTATGCGAATCTGCATTGCGGTG 3435 Query 3350 CCATCATTGGTGGAATTGTGAACAATACGTTAAGACCTCCGGTGCCTGAACGGTGTGAAG 3409 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3436 CCATCATTGGTGGAATTGTGAACAATACGTTAAGACCTCCGGTGCCTGAACGGTGTGAAG 3495 Query 3410 CAGAGTGGAGGAAGCTGATGGAACAATGCTGGTCATTCGATCCAGGAGTACGGCCATCGT 3469 | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3496 CTGAGTGGAGGAAGTTGATGGAGCAATGCTGGTCATTCGATCCAGGAGTACGGCCATCGT 3555 Query 3470 TTACGGAGATTGTTGAACGACTTCGATCAATGACTGTTGCCTTGCAACCCAAGCGAAGAA 3529 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3556 TTACGGAGATTGTTGAACGACTTCGATCAATGACTGTTGCCTTGCAACCCAAGCGAAGAA 3615 Query 3530 CCTAAAAGCCCTCTC 3544 ||||||||||||||| Sbjct 3616 CCTAAAAGCCCTCTC 3630 Score = 174 bits (94), Expect = 5e-42 Identities = 102/106 (96%), Gaps = 0/106 (0%) Strand=Plus/Plus Query 3591 TATAGATTTATGAGATTGTGTGGAGTCTGTAAATTAGTATTGAGAGGCATTTACCGGTTT 3650 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3718 TATAGATTTATGAGATTGTGTGGAGTCTGTAAATTAGTATTGAGAAGCATTTACCGGTTT 3777 Query 3651 AGGTAAAAGTTGTATACCAAAAAAGTTGAAGGTCCATTGTGTAAAA 3696 |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| Sbjct 3778 AGGTAAAAGTTGTATACCAAGAAAGTTGAGGGTCAATTGTGTAAAA 3823 Score = 159 bits (86), Expect = 1e-37 Identities = 225/283 (80%), Gaps = 45/283 (16%) Strand=Plus/Plus Query 1 GCGTTATTTTGAGAGCGCTtctctgcgtctctcttctttctctctctctcGCAAATCAAA 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GCGTTATTTTGAGAGCGCTTCTCTGCGTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCGCAAATCAAA 60 Query 61 AACCTCAAAC-TTTG-AAAA--AC-A--TC-----A-A------TC---T--CCAGAAA- 95 |||||| ||| |||| |||| | | || | | || | ||| ||| Sbjct 61 AACCTC-AACTTTTGAAAAACTTCAATCTCTAGAAACATTCTTCTCTTTTACCCAAAAAT 119 Query 96 --CAT-TTTTGTTTG--TG-T-TCCTTCTCCTTCATTGTTAATCTCATTGG-CAATTTTC 147 ||| ||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct 120 CTCATCTTTTGTTTGTTTGTTATTCTTCTCCTTCATTGTTAATCTCATTGGCCATTTTTC 179 Query 148 CCCCGGGTAA-GTC----CCAATACGTTTGAATAAGAACAAATCTCTGGTCTCTGTTTGA 202 || |||||| || | ||| ||||||||| | | | ||||||||| ||||||| Sbjct 180 CCTAGGGTAATTTCTGGTCTAATTCGTTTGAAT--G---AGA-CTCTGGTCTTTGTTTGA 233 Query 203 TTTGGTATGATCTTGTAGCAATATACCCTGAAGATGTTTTTTG 245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 234 TTTGGTATGATCTTGTAGCAATATACCCTGAAGATGTTTGTTG 276 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 184062513867 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5