BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg470456

Length=3696
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT1G04700.1 | Symbols:  | PB1 domain-containing protein tyrosin...  5337    0.0  


> AT1G04700.1 | Symbols:  | PB1 domain-containing protein tyrosine 
kinase | chr1:1316254-1320919 FORWARD LENGTH=3886
Length=3886

 Score = 5337 bits (2890),  Expect = 0.0
 Identities = 3138/3255 (96%), Gaps = 27/3255 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  298   AATTTGGGGAGTTGAAGAATAGGACTTGTTGGTTCCTCAGAATCTGTGATACAAGAGATT  357
             ||||||||||||||||||| | ||    |||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  395   AATTTGGGGAGTTGAAGAACA-GA--AATTGGTTACTCAGAATCTGTGATACAAGAGATT  451

Query  358   GTGCACAAGAAAGAATAAGGC-TTTTTGGTTCTTGAGAACATGAGAATGGAGTTTCCTGG  416
             ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  452   GTGCAGAAGAAAGAATAAAGCGTTTTTGGTTCTTGAGAACATGAGAATGGAGTTTCCTGG  511

Query  417   CAGCTCCAATCAGCATTTAGGTAGGGATAGGTTCAATGGGGAAGTCGGTAATAACACGCG  476
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |     || 
Sbjct  512   CAGCTCCAATCAGCATTTAGGTAGGGATAGGTTCAATGGAGAAGTTGGT--T-----GC-  563

Query  477   TGATGATAATATCTGTTCTCAGACAGGAGAGGAATTTTCAAATGAGTTTTTGAGGGATTT  536
              |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  564   -G--G-TAATAACTGTTCTCAGACAGGAGAGGAATTTTCAAATGAGTTTTTGAGGGATTT  619

Query  537   TGGTGCTCAACGAAGAGT---ACAGGGTGGTGTGAGTAGAAATATTGAGGGTAACTATAA  593
             |||||||||||||||| |   ||| |||||||| |  |||||| |||||||||| |||||
Sbjct  620   TGGTGCTCAACGAAGACTACAACATGGTGGTGTTAACAGAAATGTTGAGGGTAATTATAA  679

Query  594   TAATCGCCATCTTGTTTATGAGGATTTCAACAGAATTCTTGGGCTTCAAAGAGTTGATTC  653
             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  680   TAATCGCCATCTTGTTTACGAGGATTTCAACAGAATTCTTGGCCTTCAAAGAGTTGATTC  739

Query  654   CAACATGTCAGAAGGTATTAATTCCTCGAGTGGATACTTTGCTGAGTCAAATGTTGCAGA  713
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740   CAACATGTCAGAAGGTATTAATTCCTCGAATGGTTACTTTGCTGAGTCAAATGTTGCAGA  799

Query  714   CTCACCTCGGAAGATGTTTCAAACTGCAACATCAGATGTTTATTTGCCAGAAGTATTGAA  773
             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  800   CTCACCTCGGAAGATGTTTCAAACTGCAATATCAGATGTTTATTTGCCTGAAGTATTGAA  859

Query  774   GCTTCTTTGTAGTTTCGGGGGAAGGATCTTACAGAGACCTGGTGATGGCAAGCTTAGATA  833
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct  860   GCTTCTTTGTAGCTTCGGGGGAAGGATCTTACAGCGGCCTGGTGATGGCAAGCTTAGATA  919

Query  834   CATTGGAGGGGAGACTCGGATTATCTCAATACGAAAACATGTTGGATTAAACGAATTGAT  893
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  920   CATTGGAGGGGAGACTCGGATTATCTCAATACGCAAACATGTTGGATTAAACGAATTGAT  979

Query  894   GCACAAGACTTATGCTTTGTGCAACCATCCGCATACAATCAAGTATCAATTACCAGGAGA  953
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  980   GCACAAGACTTATGCTTTGTGCAACCATCCGCATACAATCAAGTATCAATTACCAGGAGA  1039

Query  954   AGATCTTGATGCACTAATATCGGTTTGCTCAGATGAGGATCTTCTTCATATGATTGAAGA  1013
             |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1040  AGATCTTGATGCCCTTATATCGGTTTGCTCAGATGAGGATCTTCTTCATATGATTGAAGA  1099

Query  1014  GTATCAAGAAGCTGAAACAAAGGCTGGATCCCAGAGGATTAGGGTCTTTCTTGTATCTTC  1073
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  1100  GTATCAAGAAGCTGAAACAAAGGCTGGATCCCAGAGGATTAGGGTCTTTCTTGTACCTTC  1159

Query  1074  AACAGAATCATCAGAGAGTCC-AAAGATTTTCAATGAAAGGAATATGAACATAAACCGAA  1132
              |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1160  CACAGAATCATCAGAGAGTCCTAAA-ATTTTCCATGAAAGGAATATGAACATAAACCGAA  1218

Query  1133  ACACGAACCAGCAGACTGATATAGATCATTATCAGTATGTTTCAGCTCTTAATAATGTTG  1192
             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||
Sbjct  1219  ACACGAACCAGCAGACGGATATAGATCATTATCAGTATGTTTCAGCTCTTAATGGTATTG  1278

Query  1193  TGGATGTGAGTCCTCAAAAGAGTTCCAGCGGGCAAAGTGGGACAAGTCAGACAACACAAT  1252
             | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct  1279  TAGATGTGAGTCCTCAAAAGAGTTCCAGCGGCCAAAGTGGAACAAGTCAGACCACACAAT  1338

Query  1253  TTGGGAATGCTTCAGAATTTAGCCCTACATTTCATCTTCGAGACTCGCCTACTTCTGTTC  1312
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1339  TTGGGAATGCTTCAGAATTTAGCCCTACATTTCATCTTCGAGACTCGCCTACTTCTGTTC  1398

Query  1313  ATACATGGGAACACAAAGACTA-CAACAGTCCAACCTTCATGAAACCATATGCGAACACG  1371
             |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1399  ATACATGGGAACACAAAGAC-AGCAACAGTCCAACCTTCATGAAACCATATGGGAACACG  1457

Query  1372  AATGCTGTTCATTTTATGCCGAAAATGCAGATTCCGAGGAACTCGTTTGGTCAACAATCT  1431
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1458  AATGCTGTTCATTTTATGCCGAAAATGCAGATTCCCAGGAACTCGTTTGGTCAACAATCT  1517

Query  1432  CCTCCAGCATCTCCTTTTTCAGCT-CACAAGAGAGCAAATACCGACGTTCCTTATTTTGC  1490
             |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  1518  CCTCCAACATCTCCTTTTTCAG-TCCACAAGAGAGCAAACACCGACGTTCCTTATTTTGC  1576

Query  1491  TGATCAAAATGGTTTCTTTGACCCTTACTTGGCTGCTCCAAACTTCCCTCAGCAACATAG  1550
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct  1577  CGATCAAAATGGTTTCTTTGACCCTTACTTGGCTGCTCCAAACTTCCCACAGCAAAATAG  1636

Query  1551  GTTCTTTTTTGATACTACTACACAAAAGCAGAAGCATCCAGAAGTGAATCTTCATGACCG  1610
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1637  GTTCTTTTTTGAGACTACTACACAAAAGCAGAAGCATCCAGAAGTGAATCTTCATGACCG  1696

Query  1611  GAGGCCAAGCGACGATATTTACCCCCATGGCCAAGCTTATATGGGAGCCGAGAAATTGAC  1670
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct  1697  GAGGCCAAGCGATGATATTTACCCCCATGGCCAAGCTTATATCGGAGCCGAGAAAATGAC  1756

Query  1671  GCTTAAGAAAAACGCTCTTTCTGATCCCCAGCTGCATGATGAGAGCCAAATCAACAATGG  1730
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1757  GCTTAAGAAAAACGCTCTTTCTGATCCGCAGCTGCATGATGAGAGCCAAATCAACAATGG  1816

Query  1731  GTTAGAAGCATTTACCAAACAACCATGGAAAATATTGAGAAAGAATCTACATGTTGTGGC  1790
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1817  GTTAGAAGCATTTACCAAACAACCATGGAAAATATTGAGAAAGAATCTACGTGTTGTGGC  1876

Query  1791  TACGTCAAAGTGGGAAGATAGTGATGATATCTATTTCAATAATCCAGAAGGCAAGAGAAG  1850
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  1877  TACATCAAAGTGGGAAGATAGTGATGATATCTATTTCAATAATCCAGAAGGCAAGAGATG  1936

Query  1851  CAAGGAGCTTGAACTCACCAAAGAAGTTCCTAATAATTGGATCGATGGCGATCATAATCC  1910
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||
Sbjct  1937  CAAGGAGCTTGAACTCACCAAGGAAGTTCCTAATAGTTGGATCAATCGCGATAATAATCC  1996

Query  1911  CGGTTCTTTTGACCAGGCAACAAAGAAACAAGG-TGGTAGTAACAGTAATAGCTCCTTCA  1969
             || ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1997  CGATTCTTTTGATCAGGCAACAAAGAAAC-AGGATGGTAGTAACAGTAATAGCTCCTTCA  2055

Query  1970  GTCCGAATTATTTCAGTCCGAATCATCAACCAGCTGCTCAGGTTACTTCAAGTGATTCAC  2029
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  2056  GTCCGAATTATTTCAGTCCGAATCATCAACCAGCTGCTCAGATTACTTCAAGTGATTCAC  2115

Query  2030  AAGATTCAGGAAGCTCAGTGTTCTCTTTATCAGTTAACACTAACGAAAATTATCTTGATT  2089
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  2116  AAGATTCAGGAAGCTCAGTGTTCTCTTTATCAGTTAACACCAACGAAAATTATCTTGATT  2175

Query  2090  GTTCGAAGGACAAATTCAATGGTTTCCAGCATGACATGTCACTAGATATTCTCATCAGAA  2149
             |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2176  GTTCGAGGGAAAAATTTAATGGTTTCCAGCATGACATGTCACTAGATATTCTCATCAGAA  2235

Query  2150  GCCACACTTCAGCTACAGATCAACTATGTTGTACAACCAAGTCAAGTGATAAAGCAGATT  2209
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2236  GCCACACTTCAGCTACAGATCAACTATGTAGTACAACCAAGTCAAGTGATAAAGCAGATT  2295

Query  2210  ACTCCTCACCCAATACAAATTTCCCCGTGGAATTTCTGAGACAGGAGCCTATGATTCCGA  2269
             |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  2296  ACTCCTCACCCAATACAAATTTCCCCGTGGTATTTCTGAGACAGGAACCTATGATTCCGA  2355

Query  2270  GACATGATTTGGAGACAAATAGCGATGATTCAGATACTCAAAACTCTCTTCCTAGAGAAG  2329
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  2356  GACATGATTTGGAGACAAATAGCGATGATTCAGATACTCAAAAATCTCTTCCTAGAGAAG  2415

Query  2330  AGAGTATTCACTATAGTGGATTGCCACTTAGGAAGGTGGGAAGTAGAGAAACTACTTTTA  2389
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2416  AGAGTATTCACTATAGTGGATTGCCACTTAGGAAGGTGGGAAGTAGAGAAACTACTTTTA  2475

Query  2390  TGCACACGCAGGAATCAGATGATTTCTTCAAAAGCAAGCTGCTTGGTCCACAGTTGATAG  2449
             ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2476  TGCACACGCAGGGGTCAGATGATTTCTTCAAAAGCAAGCTGCTTGGTCCACAGTTGATAG  2535

Query  2450  TTGAGGATGTGACGAACGAAGTAATTTCAGATAACCTCTTATCAGCTACTATTGTCCCTC  2509
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2536  TTGAGGATGTGACGAACGAAGTAATTTCAGATAATCTCTTATCAGCTACTATTGTCCCTC  2595

Query  2510  ATGTACATAGTGAGTCAGATGATGATCACAAATCCTACACAAGGGAGAAAGAGATTACAA  2569
             | ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2596  AAGTAAATAGGGAGTCCGATGATGATCACAAATCCTACACAAGGGAGAAAGAGATTACAA  2655

Query  2570  ATGCGGATCATGAATCAGAAATGGAGGAAAAGTACAAGAAAAGCAGAAACACCGATGATT  2629
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2656  ATGCGGATCATGAATCAGAAATGGAGGAAAAGTACAAGAAAAGCAGAAACACCGATGATT  2715

Query  2630  CATTCAGCGAAGCTGCAATGGTTGAAATTGAAGCTGGAATATATGGCTTACAGATAATTA  2689
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2716  CATTCAGCGAAGCTGCAATGGTTGAAATCGAAGCTGGAATATATGGCTTACAGATAATTA  2775

Query  2690  AAAACACTGATCTTGAAGACTTACACGAGCTTGGTTCTGGTACATTTGGAACTGTTTACT  2749
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2776  AAAACACTGATCTTGAAGACTTACACGAGCTTGGATCTGGTACATTTGGAACTGTTTACT  2835

Query  2750  ATGGGAAGTGGAGAGGAACTGATGTTGCTATCAAGAGGATAAAGAATAGTTGCTTCTCTG  2809
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  2836  ATGGGAAGTGGAGAGGAACTGATGTTGCTATCAAGAGGATAAAGAATAGTTGTTTCTCTG  2895

Query  2810  GTGGATCATCCGAGCAAGCACGGCAGACTAAAGATTTCTGGAGAGAAGCTCGGATATTGG  2869
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2896  GTGGATCATCCGAGCAAGCACGGCAGACTAAAGATTTCTGGAGAGAAGCTCGGATATTGG  2955

Query  2870  CGAATCTTCACCATCCCAACGTAGTGGCCTTTTATGGAGTTGTACCAGATGGACCTGGTG  2929
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2956  CGAATCTTCACCATCCTAACGTAGTGGCCTTTTATGGAGTTGTACCAGATGGACCTGGTG  3015

Query  2930  GAACAATGGCAACAGTGACTGAGTATATGGTGAACGGATCTTTGAGACATGTCTTGCAGA  2989
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  3016  GAACAATGGCAACAGTGACTGAGTATATGGTGAACGGATCTTTGAGGCATGTCTTGCAGA  3075

Query  2990  GAAAAGACAGATTACTTGATAGGCGCAAAAAACTGATGATAACTCTTGATTCTGCATTTG  3049
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3076  GAAAAGACAGATTACTTGATAGGCGCAAAAAACTGATGATAACTCTTGATTCTGCATTTG  3135

Query  3050  GCATGGAGTATCTACATATGAAAAATATTGTTCATTTTGATCTTAAATGCGATAACTTGC  3109
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3136  GCATGGAGTATCTACATATGAAAAATATTGTTCATTTTGATCTTAAATGCGATAACTTGC  3195

Query  3110  TAGTAAACTTGAGGGATCCACAACGACCCATTTGCAAGGTTGGAGATTTCGGATTGTCGA  3169
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3196  TTGTAAACTTGAGGGATCCACAACGACCCATTTGCAAGGTTGGAGATTTCGGATTGTCGA  3255

Query  3170  GAATAAAACGAAACACGCTTGTCTCTGGTGGAGTAAGAGGAACCCTTCCTTGGATGGCTC  3229
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct  3256  GAATAAAACGAAACACGCTTGTCTCTGGTGGAGTAAGAGGAACCCTTCCATGGATGGCAC  3315

Query  3230  CAGAGCTTCTAAACGGAAGCAGCAATCGGGTCTCAGAGAAAGTCGATGTTTTCTCATTTG  3289
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3316  CAGAGCTGCTAAACGGAAGCAGCAATCGGGTCTCAGAGAAAGTCGATGTTTTCTCATTTG  3375

Query  3290  GTATTGTGATGTGGGAGATCTTGACAGGCGAAGAACCCTATGCGAATCTGCATTGCGGTG  3349
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3376  GTATCGTGATGTGGGAGATCTTGACAGGCGAAGAACCCTATGCGAATCTGCATTGCGGTG  3435

Query  3350  CCATCATTGGTGGAATTGTGAACAATACGTTAAGACCTCCGGTGCCTGAACGGTGTGAAG  3409
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3436  CCATCATTGGTGGAATTGTGAACAATACGTTAAGACCTCCGGTGCCTGAACGGTGTGAAG  3495

Query  3410  CAGAGTGGAGGAAGCTGATGGAACAATGCTGGTCATTCGATCCAGGAGTACGGCCATCGT  3469
             | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3496  CTGAGTGGAGGAAGTTGATGGAGCAATGCTGGTCATTCGATCCAGGAGTACGGCCATCGT  3555

Query  3470  TTACGGAGATTGTTGAACGACTTCGATCAATGACTGTTGCCTTGCAACCCAAGCGAAGAA  3529
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3556  TTACGGAGATTGTTGAACGACTTCGATCAATGACTGTTGCCTTGCAACCCAAGCGAAGAA  3615

Query  3530  CCTAAAAGCCCTCTC  3544
             |||||||||||||||
Sbjct  3616  CCTAAAAGCCCTCTC  3630


 Score =  174 bits (94),  Expect = 5e-42
 Identities = 102/106 (96%), Gaps = 0/106 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  3591  TATAGATTTATGAGATTGTGTGGAGTCTGTAAATTAGTATTGAGAGGCATTTACCGGTTT  3650
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  3718  TATAGATTTATGAGATTGTGTGGAGTCTGTAAATTAGTATTGAGAAGCATTTACCGGTTT  3777

Query  3651  AGGTAAAAGTTGTATACCAAAAAAGTTGAAGGTCCATTGTGTAAAA  3696
             |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||
Sbjct  3778  AGGTAAAAGTTGTATACCAAGAAAGTTGAGGGTCAATTGTGTAAAA  3823


 Score =  159 bits (86),  Expect = 1e-37
 Identities = 225/283 (80%), Gaps = 45/283 (16%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1    GCGTTATTTTGAGAGCGCTtctctgcgtctctcttctttctctctctctcGCAAATCAAA  60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    GCGTTATTTTGAGAGCGCTTCTCTGCGTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCGCAAATCAAA  60

Query  61   AACCTCAAAC-TTTG-AAAA--AC-A--TC-----A-A------TC---T--CCAGAAA-  95
            |||||| ||| |||| ||||   | |  ||     | |      ||   |  ||| ||| 
Sbjct  61   AACCTC-AACTTTTGAAAAACTTCAATCTCTAGAAACATTCTTCTCTTTTACCCAAAAAT  119

Query  96   --CAT-TTTTGTTTG--TG-T-TCCTTCTCCTTCATTGTTAATCTCATTGG-CAATTTTC  147
              ||| |||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct  120  CTCATCTTTTGTTTGTTTGTTATTCTTCTCCTTCATTGTTAATCTCATTGGCCATTTTTC  179

Query  148  CCCCGGGTAA-GTC----CCAATACGTTTGAATAAGAACAAATCTCTGGTCTCTGTTTGA  202
            ||  ||||||  ||    | ||| |||||||||  |   | | ||||||||| |||||||
Sbjct  180  CCTAGGGTAATTTCTGGTCTAATTCGTTTGAAT--G---AGA-CTCTGGTCTTTGTTTGA  233

Query  203  TTTGGTATGATCTTGTAGCAATATACCCTGAAGATGTTTTTTG  245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  234  TTTGGTATGATCTTGTAGCAATATACCCTGAAGATGTTTGTTG  276



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 184062513867


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5