BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg470466
Length=3177
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G04810.1 | Symbols: | 26S proteasome regulatory complex, no... 5127 0.0
AT2G32730.1 | Symbols: | 26S proteasome regulatory complex, no... 3369 0.0
> AT1G04810.1 | Symbols: | 26S proteasome regulatory complex,
non-ATPase subcomplex, Rpn2/Psmd1 subunit | chr1:1350180-1355442
FORWARD LENGTH=3311
Length=3311
Score = 5127 bits (2776), Expect = 0.0
Identities = 3021/3142 (96%), Gaps = 6/3142 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCCGATTAGGATAATGGCCGCCGCGATGGTTAGTTCCGCCGGTGGGTTACTGGCAATGC 60
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 111 TTCCGATTAGGATAATGGCCGCCGCCATGGTTAGTTCCGCCGGTGGGTTACTGGCAATGC 170
Query 61 TCAACGAACCCCATCCTTCTTTGAAACTTCACGCTCTCTCATATCTCAACAGATTGGTTG 120
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 171 TCAACGAACCCCATCCTTCCTTGAAACTTCACGCTCTCTCATATCTCATCAGATTGGTTG 230
Query 121 ACCAATTTTGGCCTGAGATCTCCACTAGTGTCCCAATCATAGAGAGCTTATACGAAGATG 180
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231 ACCAATTTTGGCCCGAGATCTCCACTAGTGTCCCAATCATAGAGAGCTTATACGAAGATG 290
Query 181 AAGAGTTTGATCAGCATCAAAGACAGCTTGCTGCGTTGTTGGTCTCCAAGGTTTTCTATT 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 291 AAGAGTTTGATCAGCATCAAAGACAGCTTGCTGCCTTGTTGGCCTCCAAGGTTTTCTATT 350
Query 241 ACTTGGGTGAGCTTAACGATTCCTTGTCCTATGCCCTTGGAGCTGGATCCTTATTTGATG 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 351 ACTTGGGTGAGCTTAACGATTCCTTGTCCTATGCCCTTGGAGCTGGATCCTTGTTTGATG 410
Query 301 TGTCAGAGGATTCTGATTATATTCATACTCTTCTAGCCAAAGCAATAGATGAGTATGCTA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 TGTCAGAGGATTCTGATTATATTCATACTCTTCTATCCAAAGCAATAGATGAGTATGCTA 470
Query 361 TTCTCAGATCAAAGGCAGTCGAGTCAAGTGAGGAT-GTGGAAATTGACCCGAGATTGGAG 419
||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 471 TTCTCAGATCAAAGGCAGTCGAGTCAAGTGAGG-TGGTGGAAATTGACCCGAGATTGGTG 529
Query 420 GCCATTGTTGAACGAATGCTAGAAAAATGTATCACTGACGGGAAGTATCAACAAGCCATG 479
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 530 GCCATTGTTGAACGAATGCTAGACAAATGTATCACTGACGGAAAGTATCAACAAGCCATG 589
Query 480 GGCATTGCTATAGAATGCCGGAGATTGGATAAGTTGGAGGAAGCGATCATAAAGAGCGAA 539
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 590 GGCATTGCTATAGAATGCCGGAGATTGGATAAGTTGGAGGAAGCGATCATAAAGAGTGAG 649
Query 540 AATGTGCAGGGAACATTATCTTACTGCATCAATGTTTCCCACTCTTTTGTTAACCACAGA 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 650 AATGTGCAGGGAACATTATCTTACTGCATCAATGTTTCCCACTCTTTTGTTAATCAAAGA 709
Query 600 GAATATAGACATGAGGTTCTTCGGTTACTTGTTAATGTCCACCAGAAGCTGGCTTCTCCT 659
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 710 GAATATAGACATGAGGTTCTTCGGTTACTTGTTAATGTTTACCAGAAGCTGGCTTCTCCT 769
Query 660 GATTATTTGAGCATTTGCCAATGCCTTATGTTCTTGGATGAACCACAAGGTGTTGCAAGC 719
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 770 GATTATTTGAGCATTTGCCAATGCCTTATGTTCTTGGATGAACCACAAGGCGTTGCAAGC 829
Query 720 ATATTGGAGAAGCTTCTTCGTTCAGAGAGTAAAGATGATGCTTTATTGGCTTTGCAAATC 779
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 830 ATATTGGAGAAGCTTCTTCGTTCAGAGAACAAAGATGATGCTTTATTGGCTTTCCAAATC 889
Query 780 GCTTTCGATCTTGTAGAGAATGAGCACCAGGCATTTCTCATGAGTGTAAGAGACCGCCTT 839
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 890 TCTTTCGATCTTGTACAGAATGAGCACCAGGCATTCCTCATGAGTGTTAGAGATCGCCTT 949
Query 840 CCAGCGCCCAAGACCCGTCCTGTAGAAGCAGTTCAAGCTGTTGAAACCTCTACTGCTCAG 899
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 950 CCAGCGCCCAAGACCCGTCCTGTAGAAGCAATTCAAGCTGTTGAAACCTCTACTGCTCAG 1009
Query 900 AATGAGAACACTGAAGGGGATGTCCAGATGGCGGATGAAACTCCATCTCAGACAATTGTG 959
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010 AATGAGAACACTGCAGGGGATGTTCAGATGGCGGATGAAACTCCATCTCAGACAATTGTG 1069
Query 960 CATGAAACAGATCCTGCTGACGCTGTGTACGCTGAGAGGTTAACAAAGGTTAAGGGAATT 1019
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 1070 CATGAAACAGATCCTGTTGACGCTGTGTACGCTGAGAGGTTAACAAAGGCTAAGGGGATT 1129
Query 1020 TTATCTGGAGAGACATCAATACAACTGACCCTCCAGTTTCTTTACAGCCATAACAAATCG 1079
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130 TTATCTGGAGAGACATCAATACAACTGACACTCCAGTTTCTTTACAGCCATAACAAATCG 1189
Query 1080 GACCTGCTGATCCTGAAGACAATCAAACAATCCGTTGAGATGCGGAACAGTGTATGTCAC 1139
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1190 GACCTGCTGATCCTGAAGACAATCAAACAATCTGTTGAGATGCGGAACAGTGTATGTCAC 1249
Query 1140 AGTGCTACAATATATGCTAATGCTATAATGCATGCTGGAACGACAGTTGACACTTTTCTC 1199
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250 AGTGCTACAATTTATGCTAATGCTATAATGCATGCTGGAACGACAGTTGACACTTTTCTC 1309
Query 1200 AGGGAGAATTTGGATTGGCTAAGCAGGGCCACCAATTGGGCTAAGTTTAGTGCTACAGCA 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1310 AGGGAGAATTTGGATTGGCTAAGCAGGGCCACCAATTGGGCCAAGTTTAGTGCTACAGCA 1369
Query 1260 GGATTAGGTGTTATTCATAGGGGTCACTTACAACAGGGCAGGTCACTGATGGCCCCATAC 1319
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1370 GGATTAGGTGTTATTCATAGGGGTCACTTGCAACAGGGCAGGTCACTGATGGCCCCATAC 1429
Query 1320 TTGCCTCAAGGAGGAGCAGGTGGTGGTGGGAGTCCTTATTCCGAAGGGGGTGCGTTATAT 1379
|||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1430 TTGCCTCAGGGCGGAGCAGGTGGTGGCGGGAGTCCTTATTCCGAAGGGGGTGCTTTATAT 1489
Query 1380 GCTCTCGGTCTTATTCATGCCAACCATGGTGAGGGAATCAAGCAATTTCTTCGTGATAGC 1439
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1490 GCTCTCGGCCTTATTCATGCAAACCATGGTGAGGGAATCAAGCAATTTCTTCGTGATAGT 1549
Query 1440 CTACGCAGCACTAGTGTTGAGGTTATTCAACATGGAGCTTGTTTAGGTCTTGGTTTGGCA 1499
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550 CTACGCAGCACTAGTGTTGAGGTTATTCAACACGGAGCTTGTTTAGGTCTTGGTTTGGCT 1609
Query 1500 GCTCTTGGGACAGCTGATGAAGATATATATGATGATATCAAAAGTGTGCTTTACACTGAC 1559
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1610 GCTCTTGGGACAGCTGATGAAGACATATATGATGATATCAAAAGTGTGCTTTACACTGAC 1669
Query 1560 AGTGCTGTTGCTGGTGAAGCTGCTGGCATCAGCATGGGTCTATTGTTGGTTGGAACTGCA 1619
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1670 AGTGCTGTTGCTGGTGAAGCTGCCGGCATAAGCATGGGTCTATTGTTGGTTGGAACAGCA 1729
Query 1620 ACTGATAAGGCAAGTGAGATGCTTGCTTATGCTCACGAGACTCAGCATGAGAAGATAATA 1679
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1730 ACTGATAAGGCAAGTGAGATGCTCGCTTATGCTCACGAGACTCAGCATGAGAAGATAATA 1789
Query 1680 AGGGGATTGGCTCTAGGAACAGCTCTCACAGTATATGGTAGAGAAGAGGGAGCAGATACA 1739
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1790 AGGGGATTGGCTCTAGGAATAGCTCTCACAGTATATGGAAGAGAAGAGGGAGCAGATACT 1849
Query 1740 TTGATTGAGCAGATGACTAGAGATCAGGATCCTATCATCCGTTATGGTGGAATGTATGCA 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 TTGATTGAGCAGATGACTAGAGATCAGGATCCTATCATCCGTTATGGTGGAATGTATGCA 1909
Query 1800 CTCGCATTGGCTTACAGTGGAACTGCAAACAACAAAGCCATTCGCCAACTTCTTCACTTT 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1910 CTCGCATTGGCTTACAGTGGAACTGCAAACAACAAAGCCATCCGCCAACTTCTTCACTTT 1969
Query 1860 GCTGTGTCTGATGTTAGTGACGATGTCAGGAGGACGGCTGTTCTTGCACTTGGATTTGTC 1919
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1970 GCTGTGTCTGATGTCAGTGACGATGTTAGGAGGACTGCTGTTCTTGCACTTGGATTTGTC 2029
Query 1920 TTATACTCTGATCCAGAGCAGACTCCCCGTATTGTATCCCTTCTTTCTGAGTCGTACAAT 1979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2030 TTATACTCTGATCCAGAGCAGACTCCCCGTATTGTATCCCTTCTTTCCGAGTCGTACAAT 2089
Query 1980 CCACATGTCCGCTATGGCGCAGCTCTTGCAGTTGGCATATCTTGTGCAGGCACTGGCCTG 2039
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 2090 CCACATGTCCGCTATGGCGCAGCTCTTGCAGTTGGCATCTCTTGTGCAGGCACTGGTCTG 2149
Query 2040 AGTGAGGCGATATCCTTGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTGGTAGACTTTGTTCGTCAA 2099
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2150 AGTGAGGCGATATCTTTGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTTGTAGACTTTGTTCGTCAA 2209
Query 2100 GGTGCTCTGATTGCCATGGCCATGGTGATGGTCCAAATTAGTGAAGCAAGCGATTCTCGC 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2210 GGTGCTCTGATTGCCATGGCCATGGTGATGGTCCAAATTAGTGAAGCAAGCGATTCTCGC 2269
Query 2160 GTTGGAGCATTTAGGCGTCAACTTGAGAAGATAATACTTGACAAGCATGAAGATACAATG 2219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2270 GTTGGAGCATTTAGGCGTCAACTTGAGAAGATAATACTTGACAAGCATGAAGATACAATG 2329
Query 2220 AGCAAGATGGGAGCAATTTTGGCTTCAGGTATTCTTGATGCTGGTGGAAGGAATGTGACG 2279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2330 AGCAAGATGGGAGCAATTTTGGCTTCAGGTATTCTTGATGCTGGTGGAAGGAATGTGACG 2389
Query 2280 ATAAGACTGCTTTCTAAGACAAAACATGACAAAGTCACTGCGGTCATTGGACTTGCTGTC 2339
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||
Sbjct 2390 ATAAGACTGCTGTCTAAGACAAAACATGACAAAGTCACTGCAGTCATTGGCCTTACTGTC 2449
Query 2340 TTCAGCCAATTTTGGTATTGGTACCCATTGATTTACTTCATAAGCTTGGCATTTTCACCA 2399
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2450 TTCAGCCAGTTTTGGTATTGGTACCCATTGATTTACTTCATAAGCTTGGCGTTTTCACCC 2509
Query 2400 ACTGCGTTCATTGGTTTGAACTACGATCTCAAAGTCCCAAAGTTCGAATTCATGTCGCAT 2459
|| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2510 ACCGCCTTCATCGGTTTGAACTACGATCTCAAAGTCCCAAAGTTTGAATTCATGTCACAC 2569
Query 2460 GCAAAACCATCTTTGTTTGAGTATCCAAAACCAACCACGGTTGCTACTGCCAACACCGCC 2519
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2570 GCAAAACCATCGTTGTTTGAGTATCCAAAACCAACTACGGTTGCTACTGCCAACACCGCT 2629
Query 2520 GCGAAATTACCAACAGCTGTGCTCTCAACCTCAGCCAAAGCCAAAGCTAGGGCTAAGAAA 2579
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2630 GCCAAATTACCAACTGCTGTGCTCTCAACCTCAGCCAAAGCCAAAGCTAAGGCTAAGAAA 2689
Query 2580 GAAGCAGAGCAGAAAACTAATGCCGAAAAGTCTGGCAACGAAGCTGGAAAAGCAAAAGCA 2639
||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||
Sbjct 2690 GAAGCAGAGCAGAAAGCTAAAGCTGAAAACTCTGGCAATGAAGCTGGAAAAGCCAATGCA 2749
Query 2640 GCTTCAGATGAGAAGGAACCAGAGTCTATGCAGGTTGATAGCACAGCTACAACGGTGGAG 2699
|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2750 GCGTCAGATGAGAAGGAAGCAGAGTCTATGCAGGTTGATAGCACAGCTACAACGGTGGAG 2809
Query 2700 AAGAAGGTTGAGCCAGAAGCAACGTTTGAGATTCTAGTGAATCCAGCTCGTGTAGTCCCT 2759
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||
Sbjct 2810 AAGAAGGTTGAGCCAGAAGCAACGTTTGAGATTCTAGTCAATCCTGCGCGTGTAGTCCCT 2869
Query 2760 TCACAGGAGAAATACATCAAATTGATGGAGGAAAGCAGATATGTACCGGTGAAGCTAGCT 2819
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2870 TCACAGGAGAAATACATCAAATTGATGGAGGATAGCCGATATGTACCGATGAAGCTAGCT 2929
Query 2820 CCATCAGGGTTTGTCCTTCTCAGAGACTTGCGTCCTCATGAGCCTGAGGTTCTGTCTCTG 2879
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2930 CCATCAGGGTTTGTCCTTCTCAGAGACTTGCGTCCGCATGAGCCTGAAGTTCTGTCTCTG 2989
Query 2880 ACCGATGCACCAACTTCAACAGCATCTCCTGCAGGGGGTGCAGCAGCTGCAGGACAAGCC 2939
||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2990 ACCGATGCACCGACTTCAACAGCATCCCCTGCAGTGGGTGCAGAAGCTGCAGGACAAGCC 3049
Query 2940 CAACAAGCATCCACCACCTCTGCTATGGCCGTAGATGACGAGCCACAACCTCCACAGGCC 2999
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3050 CAACAAGCAGCCACCACCTCTGCTATGGCCATAGATGACGAGCCACAACCTCCGCAGGCC 3109
Query 3000 TTTGAATACGCTTCTCCATGATTTTGTTTTTTGATTAGTGGCCAATTTGTTTTCTGTTAA 3059
||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 3110 TTTGAATACGCTTCTCCATGATTTTGTAATTTGATCAGTTGCCATTTTGTTTTCTGTTAA 3169
Query 3060 TTAAACAGAGAAACAGTTCTCtttttttttttGAACTTGGAGACTAGTACTTATTGCATT 3119
||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3170 TTAAACAGAGAAACAGTTCTCCTTTTTT----GAACTTGGAGACTAGTACTTATTGCATT 3225
Query 3120 CGTTCCCACTTGTTCATGTGtt 3141
||||| |||||||| ||||||
Sbjct 3226 GGTTCCGACTTGTTCTTGTGTT 3247
> AT2G32730.1 | Symbols: | 26S proteasome regulatory complex,
non-ATPase subcomplex, Rpn2/Psmd1 subunit | chr2:13880046-13885736
FORWARD LENGTH=3430
Length=3430
Score = 3369 bits (1824), Expect = 0.0
Identities = 2670/3072 (87%), Gaps = 84/3072 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 27 ATGGTTAGTTCCGCCGGTGGGTTACTGGCAATGCTCAACGAACCCCATCCT-TCTTTGAA 85
|||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||||
Sbjct 156 ATGGTTAGTTCCGCTGGAGGATTACTAGCAATGCTCAACGAGCCTCATCCTGT-TTTGAA 214
Query 86 ACTTCA--CGCTCTCTCATATCTCAACAGA-TTGGTTGACCAATTTTGGCCTGAGATCTC 142
||||| |||||||| | | ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 215 GCTTCATGCGCTCTCT-A-ACCTCAACA-ATTTGGTTGACCAATTCTGGCCTGAGATCTC 271
Query 143 CACTAGTGTCCCAATCATAGAGAGCTTATACGAAGATGAAGAGTTTGATCAGCATCAAAG 202
|||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||
Sbjct 272 CACTAGTGTCCCCATCATTGAGAGTTTATATGAAGATGAAGAATTCGATCTGCATCAAAG 331
Query 203 ACAGCTTGCTGCGTTGTTGGTCTCCAAGGTTTTCTATTACTTGGGTGAGCTTAACGATTC 262
|||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 332 ACAGCTTGCTGCTTTGCTGGTCTCTAAGGTTTTCTATTACTTGGGCGAGCTTAATGATTC 391
Query 263 -CTTGTCCTATGCCCTTGGAGCTGGAT-CCTTATTTGATGTGTCAGAGGATTCTGATTAT 320
| |||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 392 GC-TGTCTTATGCCCTAGGAGCCGG-TCCCTTATTTGATGTTTCAGAGGATTCTGATTAT 449
Query 321 ATTCATACTCTTCTAGCCAAAGCAATAGATGAGTATGCTATTCTCAGATCAAAGGCAGTC 380
||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 450 GTTCATACGCTTCTGGCCAAAGCAATAGACGAATATGCCAGTCTCAGATCAAAGGCAGTT 509
Query 381 GAGTCAAGTGAGGAT-GTGGAAATTGA-CCCGAGATTGGAGGCCATTGTTGAACGAATGC 438
||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||| || | ||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 510 GAGTCAAATGA-GATGGTGGACATTGATCCC-AGGCTAGAGGCGATTGTTGAAAGAATGC 567
Query 439 TAGAAAAATGTATCACTGACGGGAAGTATCAACAAGCCATGGGCATTGCTATAGAATGCC 498
| | |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 568 TTGGAAAATGCATCAGTGATGGGAAGTATCAACAAGCCATGGGCATTGCGATAGAATGCC 627
Query 499 GGAGATTGGATAAGTTGGAGGAAGCGATCATAAAGAGCGAAAATGTGCAGGGAACATTAT 558
||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||
Sbjct 628 GGAGATTGGATAAGTTGGAAGAAGCTATCATTAAGAGCGATAATGTTCAGGGAACTTTAT 687
Query 559 CTTACTGCATCAATGTTTCCCACTCTTTTGTTAACCACAGAGAATATAGACATGAGGTTC 618
| || |||||||||||||| || || ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |
Sbjct 688 CATATTGCATCAATGTTTCTCATTCCTTTGTCAACCGCAGAGAGTACAGACATGAGGTGC 747
Query 619 TTCGGTTACTTGTTAATGTCCACCAGAAGCTGGCTTCTCCTGATTATTTGAGCATTTGCC 678
|| | |||||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 748 TTAGTTTACTTGTAAAAGTCTACCAGAAGCTGCCCTCTCCTGATTATTTGAGCATTTGTC 807
Query 679 AATGCCTTATGTTCTTGGATGAACCACAAGGTGTTGCAAGCATATTGGAGAAGCTTCTTC 738
||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 AATGCCTCATGTTTTTGGATGAACCGCAAGGTGTTGCAAGCATATTGGAGAAGCTTCTTC 867
Query 739 GTTCAGAGAGTAAAGATGATGCTTTATTGGCTTTGCAAATCGC-TTTCGATCTTGTAGAG 797
| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||
Sbjct 868 GCTCAGAGAACAAGGATGATGCTTTATTGGCATTGCAAATTGCATTT-GATCTTGTAGAG 926
Query 798 AATGAGCACCAGGCATTTCTCATGAGTGTAAGAGACCGCCTTCCAGCGCCCAAGACCCGT 857
|| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||
Sbjct 927 AACGAGCACCAGGCCTTTCTCTTGAGTGTTAGAGATCGCCTTCCAGCTCCCAAAACACGT 986
Query 858 CCTGTAGAAGCAGTTCAAGCTGTTGAAACCTCTACTGCTCAGAATGAGAACACTGAAGGG 917
||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || |||
Sbjct 987 GCTGTAGAAGCAACTCAGGCTGTTGAAACAACTATTGCTCCTAATGAGAACCCT-TCGGG 1045
Query 918 -GATGTCCAGATGGCGGATGAAACTCCATCTCAGACAATTGTGCATGAAACAGATCCTGC 976
||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |
Sbjct 1046 AGATGTTCAGATGGCAGATGAAACTCCAGCTCAGACAATTGTGCATGAGACGGATCCAGT 1105
Query 977 TGACGCTGTGTACGCTGAGAGGTTAACAAAGGTTAAGGGAATTTTATCTGGAGAGACATC 1036
||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106 TGATGCTACATATGCTGAGAGGTTAACAAAGATTAAGGGAATTTTATCTGGAGAGACATC 1165
Query 1037 AATACAACTGACCCTCCAGTTTCTTTACAGCCATAACAAATCGGACCTGCTGATCCTGAA 1096
|| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1166 TATTCAGCTGACACTGCAGTTTCTTTACAGCCACAACAAATCGGACCTGCTGATACTGAA 1225
Query 1097 GACAATCAAACAATCCGTTGAGATGCGGAACAGTGTATGTCACAGTGCTACAATATATGC 1156
|||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1226 GACAATCAAACAGTCTGTAGAGATGCGGAACAGTGTATGCCACAGTGCTACAATATATGC 1285
Query 1157 TAATGCTATAATGCATGCTGGAACGACAGTTGACACTTTTCTCAGGGAGAATTTGGATTG 1216
|||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||
Sbjct 1286 TAATGCCATTATGCATGCTGGAACTACAGTGGACACTTTCCTTAGAGAGAATTTGGATTG 1345
Query 1217 GCTAAGCAGGGCCACCAATTGGGCTAAGTTTAGTGCTACAGCAGGATTAGGTGTTATTCA 1276
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1346 GCTAAGCAGGGCAACCAATTGGGCTAAGTTCAGTGCTACCGCGGGATTAGGTGTTATTCA 1405
Query 1277 TAGGGGTCACTTACAACAGGGCAGGTCACTGATGGCCCCATACTTGCCTCAAGGAGGAGC 1336
|| |||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1406 CAGAGGTCACCTGCAACAGGGTAGGTCATTGATGGCTCCATACTTGCCTCAGGGAGGAGC 1465
Query 1337 AGGTGGTGGTGGGAGTCCTTATTCCGAAGGGGGTGCGTTATATGCTCTCGGTCTTATTCA 1396
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1466 AGGTGGTGGTGGGAGTCCTTATTCCGAAGGAGGTGCTTTATATGCTCTTGGCCTTATTCA 1525
Query 1397 TGCCAACCATGGTGAGGGAATCAAGCAATTTCTTCGTGATAGCCTACGCAGCACTAGTGT 1456
||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1526 TGCTAACCATGGCGAGGGAATCAAGCAATTTCTACGTGATAGCCTACGCAGCACTAATGT 1585
Query 1457 TGAGGTTATTCAACATGGAGCTTGTTTAGGTCTTGGTTTGGCAGCTCTTGGGACAGCTGA 1516
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 1586 TGAGGTCATTCAACATGGAGCTTGTTTAGGTCTTGGCTTGTCAGCTCTCGGGACAGCTGA 1645
Query 1517 TGAAGATATATATGATGATATCAAAAGTGTGCTTTACACTGACAGTGCTGTTGCTGGTGA 1576
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1646 TGAAGAGATATATGATGATGTCAAAAGCGTGCTTTATACTGACAGTGCAGTTGCTGGTGA 1705
Query 1577 AGCTGCTGGCATCAGCATGGGTCTATTGTTGGTTGGAACTGCAACTGATAAGGCAAGTGA 1636
|||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1706 AGCTGCTGGCATCAGCATGGGTTTATTATTGGTTGGAACTGCTACTGAAAAGGCAAGTGA 1765
Query 1637 GATGCTTGCTTATGCTCACGAGACTCAGCATGAGAAGATAATAAGGGGATTGGCTCTAGG 1696
|||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766 GATGCTCGCTTATGCTCATGAGACACAACATGAGAAGATAATAAGGGGATTGGCTCTAGG 1825
Query 1697 AACAGCTCTCACAGTATATGGTAGAGAAGAGGGAGCAGATACATTGATTGAGCAGATGAC 1756
|| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1826 AATAGCTCTTACAGTATATGGTAGAGAAGAAGGAGCAGATACCTTGATTGAGCAGATGAC 1885
Query 1757 TAGAGATCAGGATCCTATCATCCGTTATGGTGGAATGTATGCACTCGCATTGGCTTACAG 1816
|||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||
Sbjct 1886 GAGAGATCAGGATCCAATCATTCGTTATGGTGGCATGTACGCATTGGCATTGGCTTACAG 1945
Query 1817 TGGAACTGCAAACAACAAAGCCATTCGCCAACTT-CTTCACTTTGCTGTGTCTGATGTTA 1875
|||||| ||||||||||| || ||||| ||| || || ||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1946 TGGAACCGCAAACAACAAGGCAATTCGACAA-TTGCTGCACTTTGCTGTATCTGATGTCA 2004
Query 1876 GTGACGATGTCAGGAGGACGGCTGTTCTTGCACTTGGATTTGTCTTATACTCTGATCCAG 1935
|||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2005 GTGATGATGTTAGGAGGACTGCCGTTCTGGCACTTGGATTTGTCTTGTACTCTGATCCAG 2064
Query 1936 AGCAGACTCCCCGTATTGTATCCCTTCTTTCTGAGTCGTACAATCCACATGTCCGCTATG 1995
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 2065 AGCAGACTCCCCGTATTGTATCACTGCTTTCTGAGTCATACAATCCACATGTTCGCTATG 2124
Query 1996 GCGCAGCTCTTGCAGTTGGCATATCTTGTGCAGGCACTGGCCTGAGTGAGGCGATATCCT 2055
| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||
Sbjct 2125 GTGCGGCTCTTGCAGTGGGTATTTCTTGTGCAGGCACTGGCCTCAGCGAAGCGATATCCT 2184
Query 2056 TGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTGGTAGACTTTGTTCGTCAAGGTGCTCTGATTGCCA 2115
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 2185 TGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTTGTTGACTTTGTTCGTCAAGGTGCTTTGATTGCAA 2244
Query 2116 TGGCCATGGTGATGGTCCAAATTAGTGAAGCAAGCGATTCTCGCGTTGGAGCATTTAGGC 2175
|||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 2245 TGGCCATGGTGATGGTTCAAATTAGCGAAGCTAGCGATTCTCGTGTTGGAGTATTTAGGC 2304
Query 2176 GTCAACTTGAGAAGATAATACTTGACAAGCATGAAGATACAATGAGCAAGATGGGAGCAA 2235
| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2305 GCCAACTTGAGAAGATTATACTTGACAAGCACGAAGATACAATGAGCAAGATGGGAGCGA 2364
Query 2236 TTTTGGCTTCAGGTATTCTTGATGCTGGTGGAAGGAATGTGACGATAAGACTGCTTTCTA 2295
|| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||
Sbjct 2365 TTCTGGCCTCTGGTATCCTTGATGCTGGTGGTAGGAACGTTACTATAAGACTGCTCTCTA 2424
Query 2296 AGACAAAACATGACAAAGTCACTGCGGTCATTGGACTTGCTGTCTTCAGCCAATTTTGGT 2355
|||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 2425 AGACCAAACATGACAAAGTCACTGCTGTTATCGGCCTTGCAGTCTTCAGCCAGTTTTGGT 2484
Query 2356 ATTGGTACCCATTGATTTACTTCATAAGCTTGGCATTTTCACCAACTGCGTTCATTGGTT 2415
||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||
Sbjct 2485 ATTGGTACCCACTGATCTATTTCATTAGTTTGGCCTTCTCACCAACCGCTTTCATCGGTT 2544
Query 2416 TGAACTACGATCTCAAAGTCCCAAAGTTCGAATTCATGTCGCATGCAAAACCATCTTTGT 2475
||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |
Sbjct 2545 TGAACTATGACCTTAAGGTCCCAAAGTTTGAGTTCATGTCACATGCAAAACCGTCTTTAT 2604
Query 2476 TTGAGTATCCAAAACCAACCACGGTTGCTACTGCCAACACCGCCGCGAAA-TTACCAACA 2534
||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||
Sbjct 2605 TTGAGTACCCAAAACCCACCACGGTTCCTACAGCCAATACCGCCGTTAAACTT-CCAACC 2663
Query 2535 GCTGTGCTCTCAACCTCAGCCAAAGCCAAAGCTAGGGCTAAGAAAGAAGCAGAGCAGAAA 2594
||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2664 GCTGTTCTCTCAACTTCAGTTAAAGCCAAAGCTAGGGCTAAGAAAGAAGCAGAGCAAAAA 2723
Query 2595 ---A---CT-A-A-----T--G-CC--GAAAAGTCTGGCAACGAA-G-----CTGGAAAA 2630
| || | | | | || |||||| ||| ||| ||| | ||||||||
Sbjct 2724 GCTATTGCTGAGAAAACATCTGGCCCTGAAAAGCCTGTCAATGAAAGTGGATCTGGAAAA 2783
Query 2631 GCAAAAGCAGCTTCAGA-TGAGAAGGAACCAGAGTCTATGCAGGTTGATAGCACAGCTAC 2689
| ||||||| | || | |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||| |
Sbjct 2784 GGAAAAGCA--T-CA-ACTGAGAAGGAAGGAGACTCTATGCAGGTCGATAGCCCAGC-AG 2838
Query 2690 AACGGTGGAGAAGAAGGT---TGAGCCAGAAGCAA-CGTTTGAGATTCTAGTGAATCCAG 2745
|||| |||||||| | |||||| || || | ||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 2839 --CGGTCGAGAAGAAAGCACCTGAGCCTGA-GCCAGCGTTTGAGATTTTAGTGAACCCAG 2895
Query 2746 CTCGTGTAGTCCCTTCACAGGAGAAATACATCAAA-TTGA-TGGAGGAAAGCAGATATGT 2803
|||| |||||||| | || ||||||||||| ||| || | | || || |||||||||||
Sbjct 2896 CTCGAGTAGTCCCAGCTCAAGAGAAATACAT-AAAGTT-ACTTGATGACAGCAGATATGT 2953
Query 2804 ACCGGTGAAGCTAGCTCCATCAGGGTTT-GTCCTTCTCAGAGACTTGCGTCCTCATGAGC 2862
||| ||||||||||| || ||||| ||| || ||||||| |||||||||| || ||||
Sbjct 2954 ACCAGTGAAGCTAGCACCGTCAGG-TTTCGTTCTTCTCAAAGACTTGCGTGAACACGAGC 3012
Query 2863 CTGAGGTTCTGTCTCTGACCGATGCACCAACTTCAACAGCATCTCCTGCAGGGGGTGCAG 2922
| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||
Sbjct 3013 CAGAGGTTCTCTCTCTGACCGACGCACCAACTTCAACAGCTTCTCCTGCAACTGGTACAG 3072
Query 2923 CAGCTGCAGGACAAGCCCAACAAGCATCCACCACCTCTGCTATGGCCGTAGATGACGAGC 2982
|||| || | ||||| ||| | || | | || ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3073 CAGCGGCTGCACAAGG--AAC---C--CCGGC-C-TCAGCTATGGCCGTAGATGATGAGC 3123
Query 2983 CACAACCTCCACAGGCCTTTGAATACGCTTCTCCATGATTTTGTTT--TTTGA--TTAGT 3038
||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | |||||
Sbjct 3124 CACAACCTCCACAAGCCTTTGAATACGCTTC---ATGATTTTATTTCATTTAAAATTAGT 3180
Query 3039 GGCCAATTTGTT 3050
|| ||||||||
Sbjct 3181 GGG-AATTTGTT 3191
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 158025870450
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5