BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg470606
Length=3887
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G05910.1 | Symbols: | cell division cycle protein 48-relate... 6263 0.0
> AT1G05910.1 | Symbols: | cell division cycle protein 48-related
/ CDC48-related | chr1:1790224-1796647 FORWARD LENGTH=3942
Length=3942
Score = 6263 bits (3391), Expect = 0.0
Identities = 3702/3847 (96%), Gaps = 42/3847 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAACaaaaaaaaaGAGGGAGAAGAGCAACGAAGACGGACCTGCAAATTCTGCAGTCTCCA 60
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 19 AAA-AAAAAAAAAGAGGGAGAAGAGCAACGAAGACGGACCTGCAAATTCTGCAGTCTCCA 77
Query 61 CTGACACTTTCGATCATTCTCTCTGTTCACCTTCTTCAATCCTCAGGTGTTTATGGAAGG 120
||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 78 CTGACACTTTCGATCTTTCTCTCTGTCCACTTTCTTCAATCCTCAGTTGTTTATGGAAGG 137
Query 121 AGATAATCATCAGAGGTAGCATTTCTCCATGCATCCTAAGCGATCAAGTCAAGGAGATGG 180
|||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 138 AGATAACCATCAGAGGTAGCATTTATCCATGCATCCCAAGCGATCAAGTCAAGGAGATGG 197
Query 181 GTCAGTTACTAAGCCAGTTAGAAGCAGTGATAGGCTTAGGAGGAGGCCCAAATTGTATAA 240
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 198 TTCAGTTACTAAGCCAGTTAGAACCAGTGATAGGCTTAGGAGGAGGCCCAAATTGCATGG 257
Query 241 TCGCTCATAC--GTA-TACTAC-TCACCAAACATATTACATAATAGGAAAAGAAACACAA 296
|||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 258 TCGCTCATACTTGTACTACT-CTTCACCAAACATGTTACATAATCGGAAAAGAAACACAA 316
Query 297 AGACAAGAACGGCAGCCTCTCAGATCGCAAAGATGCTGCACAAAGGGAGCCGTCCAGCGA 356
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 317 AGACAAGAACGGCAGCCTCTCAGATCGCAAAGATGCTGCACAAAGGAAACCGTCCAGCGA 376
Query 357 GGGCATCAAATGCCACGCCAATTGCATCTGATCTCCGGCGTTCCACGAGGAAGAGAAGAA 416
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 377 GGGCATCAAATGCCGCGCCAATTGCATCTGATCTCCGGCGTTCCACGAGGAAGAGAAGAA 436
Query 417 TTTCTGTAAACCTTGAGGACTATACAGACAGTTCTGGAGCGGAGGATGAAGATATGATGA 476
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 437 TTTCTGTAAACCTGGAGGACTATACAGACAGTTCTGGAGCGGAGGATGAGGATATGATGA 496
Query 477 GTCCAGCATATCGAACTTTGAGGAGTAGAGTTTATAATGGAGTTCATAAAAA-TTACTCA 535
||||||||||||||||||||| | | || | | ||||||||||||| || ||||
Sbjct 497 GTCCAGCATATCGAACTTTGA-G-G-AG-G------A--GAGTTCATAAAAACTT-CTCA 543
Query 536 ACTTCAAAAAGTAGAAAGGACATGGATGCTGAATTGGCACCACGTCGTGAAGGTCTCCGT 595
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 544 ACTTCAAAAAGTAGAAAGGACATGGATGCTGAATTGGCACCACGTCGTGAGGGTCTCCGT 603
Query 596 CCTCGTCGTT------C-A-----AATAAACGACTGAAAACAGAATCTGGTACTGACCAA 643
|||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 604 CCTCGTCGTTCAACAACAATTGCTAATAAACGACTGAAAACAGAATCTGGCGCTGACCAA 663
Query 644 GATACATCAGAAGAGAAAGATGGCCAAGATGAAACCGAGAATGGGAATGAATTAGATGAT 703
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 GATACATCAGAAGAGAAAGATGGCCAAGATGAAACTGAGAATGGGAATGAATTAGATGAT 723
Query 704 GCGGATGATGGTGAAAATGAGGTTGAGGCTGAAGACGAGGGTAatggagaagatgaaggt 763
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 724 GCGGATGATGGTGAAAATGAGGTTGAGGCTGAAGACGAGGGTAATGGAGAAGATGAAGGC 783
Query 764 gatggcgaagatgagggagaagaagatggtgatgatgatgaagagggtgatgaagaacaa 823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 GATGGCGAAGATGAGGGAGAAGAAGATGGTGATGATGATGAAGAGGGTGATGAAGAACAA 843
Query 824 gagggaaggaagagatatgatCTGCGAAACCGTGCTGAAGTGCGGAGGATGCCTACAGAA 883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |
Sbjct 844 GAGGGAAGGAAGAGATATGATCTGCGAAACCGTGCTGAAGTCCGGAGAATGCCTACGGGA 903
Query 884 GAAATCAACAAGCAACAACAACCTAGATCTCCTCGGAGAGTATTGCATCAAGGCATGGGC 943
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 904 GAAATCAACAAGCAACAACAACCTAGATCTCCTCGGAGAGTATTGCATCAGGGCATGGGC 963
Query 944 ACCAGGGTTGGAAG-GCATGTTAGGAGAGGTGGGTCTCGGCCTCACAAGCGCCATCGTTT 1002
|||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 964 ACCAGGGTTGGAAGAG-ATGGTAGGAGAGGTGGGTCTCGGCCTCACAAGCGCCATCGCTT 1022
Query 1003 TACAAGAACAGATGATTCAGATGATTCTCTTCTTGTGGACGAGTTGGACCAGGGCCCTGC 1062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023 TACAAGAACAGATGATTCAGATGATTCTCTTCTTGTGGACGAGTTGGACCAGGGCCCTGC 1082
Query 1063 AATTCCCTGGGCTCGAGGTGGAAACAGATCTGGAGCACCTTGGCTATTTGGGGGTTTGGA 1122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083 AATTCCCTGGGCTCGAGGTGGAAACAGATCTGGAGCACCTTGGCTATTTGGGGGTTTGGA 1142
Query 1123 CACGTATGGGTCAAGTTCATTGGGGTTGAACGTTGGAGCTTCTGGTTGGGGTCACCAGAG 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1143 CACGTATGGGTCAAGTTCATTGGGGTTGAACGTTGGAGCTTCTGGTTGGGGTCACCAGAG 1202
Query 1183 TGATGGTTTGGCTGCATTAACTTCTGGTGTTCAGACTGCTGGGCCAAGCTCTAAAGGAGG 1242
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1203 TGATGGTTTGGCTGCATTAACTTCTGGTGTTCAGACTGCTGGCCCAAGCTCTAAAGGAGG 1262
Query 1243 TGCAGATATCCAGCCACTGCAGATTAATGAGGATATAAATTTTGATGACATTGGTGGGCT 1302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263 TGCAGATATCCAGCCACTGCAGATTAATGAGGATATAAATTTTGATGACATTGGTGGGCT 1322
Query 1303 GTCCGAATACATTAATGATTTGAAGGAAATGGTTTTCTTTCCGTTGCTGTATCCAGAGTT 1362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 GTCCGAATACATTAATGATTTGAAGGAAATGGTTTTCTTTCCGTTGCTGTATCCAGAGTT 1382
Query 1363 CTTTGCAAGTTACAGCATTACTCCTCCCAGAGGTGTACTGCTGTGTGGTCCTCCAGGCAC 1422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1383 CTTTGCAAGTTACAGCATTACTCCTCCCAGAGGTGTACTGCTGTGTGGTCCTCCAGGCAC 1442
Query 1423 TGGTAAAACACTGATTGCTCGAGCATTAGCATGTGCTGCTTCAAAAGCTGGACAGAAAGT 1482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1443 TGGTAAAACACTGATTGCTCGAGCATTAGCATGTGCTGCTTCAAAAGCTGGACAGAAAGT 1502
Query 1483 TAGCTTTTATATGCGGAAGGGTGCTGATGTTCTTAGCAAGTGGGTTGGCGAGGCTGAGAG 1542
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1503 TAGCTTTTATATGCGGAAGGGTGCTGATGTTCTTAGTAAGTGGGTTGGCGAGGCTGAGAG 1562
Query 1543 ACAGCTAAAGCTACTCTTTGAGGAGGCTCAGCGAAACCAGCCTTCCATAATCTTTTTTGA 1602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1563 ACAGCTAAAGCTACTCTTTGAGGAGGCTCAGCGAAACCAGCCTTCCATAATCTTTTTTGA 1622
Query 1603 TGAAATTGATGGTCTTGCTCCCGTAAGATCTAGCAAACAGGAACAAATACATAATTCTAT 1662
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1623 TGAAATTGATGGTCTTGCTCCTGTAAGATCTAGCAAGCAGGAACAAATACATAATTCTAT 1682
Query 1663 TGTTTCAACTTTGCTGGCGCTGATGGATGGCCTCGATTCTCGTGGTCAAGTTGTTCTCAT 1722
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1683 TGTTTCAACTTTACTGGCGCTGATGGATGGCCTCGATTCTCGTGGTCAAGTTGTTCTCAT 1742
Query 1723 TGGAGCAACAAACAGGGTAGATGCAATAGATGGAGCGTTACGCCGCCCTGGCAGATTCGA 1782
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1743 TGGAGCAACAAACAGGGTAGATGCAATAGACGGAGCTTTACGCCGCCCTGGCAGATTCGA 1802
Query 1783 TCGGGAGTTCAATTTTTCTTTACCAGGCTGCGAAGCACGAGCCGAAATATTGGATATTCA 1842
||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1803 TCGGGAGTTTAATTTTTCCTTACCAGGTTGCGAAGCACGAGCCGAAATATTGGATATTCA 1862
Query 1843 CACTCGTAAATGGAAGCACCCACCTACTAGGGAGCTGAAAGAGGAACTGGCAGCTACTTG 1902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1863 CACTCGTAAATGGAAGCACCCACCTACTAGGGAGCTGAAAGAGGAACTGGCAGCTACTTG 1922
Query 1903 TGTAGGGTATTGTGGTGCTGATCTAAAAGCTTTGTGCACTGAAGCTGCGATTCGTGCTTT 1962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1923 TGTAGGGTATTGTGGTGCTGATCTAAAAGCTTTGTGCACTGAAGCTGCGATTCGTGCTTT 1982
Query 1963 TCGTGAGAAATATCCACAAGTTTATACCAGTGATGATAAATACGCCATAGATGTTGGGTT 2022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1983 TCGTGAGAAATATCCACAAGTTTATACCAGTGATGATAAATACGCCATAGATGTTGGGTT 2042
Query 2023 GGTTAACGTTGAGAAGAGCCACTTTGTAGAGGCAATGTCAGCTATTACCCCTGCTGCCCA 2082
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2043 GGTTAATGTTGAAAAGAGCCACTTTGTAGAGGCAATGTCAGCTATTACTCCTGCTGCCCA 2102
Query 2083 TAGAGGGTCTGTTGTGCAATCCAGACCACTCTCTCCGGTTGTATTGCCATGTTTACATCG 2142
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2103 TAGAGGGTCTGTTGTGCAATCCAGACCACTCTCTCCGGTTGTGTTGCCATGTTTACATCG 2162
Query 2143 ACACCTCCTTGAATCCATGAGTTTAATATCAGATATTTTTCCCTCGTCAGCCACGTCATC 2202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2163 ACACCTCCTTGAATCCATGAGTTTAATATCAGATATTTTTCCCTCGTCAGCCACGTCATC 2222
Query 2203 GGATTTGACGAAGCTGTCAATACTTTCATTTGGATCTGCAATTCCTCTTGTTTATCGACC 2262
||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2223 GGAGTTGACGAAGCTGTCAATACTTACATTTGGATCTGCAATTCCTCTTGTTTATCGACC 2282
Query 2263 TCGACTTTTGCTGCTTGGTGGTGAAGGAGTTGGACTGGATCATCTTGGGCCTGCAATTTT 2322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2283 TCGACTTTTGCTGCTTGGTGGTGAAGGAGTTGGACTGGATCATCTTGGGCCTGCAATTTT 2342
Query 2323 ACATGAGCTAGAAAAATTCCCTATTCATTCTCTGGGACTTCCATCTCTCCTTTCGGATCC 2382
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2343 ACATGAGCTAGAAAAGTTCCCTATTCATTCTCTGGGACTTCCATCTCTCCTTTCGGATCC 2402
Query 2383 TGGTGCAAAGACCCCGGAAGAGGCGTTAGTACATATATTTAGTGAAGCTAGGAGAACAAC 2442
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2403 TGGTGCAAAGACCCCAGAAGAAGCGTTAGTACATATATTTAGTGAAGCTAGAAGAACAAC 2462
Query 2443 ACCTTCAATACTTTACATACCAATGTTCAATAATTGGTGGGAAAATGCTCATGAACAGCT 2502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2463 ACCTTCAATACTTTACATACCAATGTTCAATAATTGGTGGGAAAATGCTCATGAACAGCT 2522
Query 2503 TAGGGCTGTATTTCTGACTTTGTTAGAAGAATTGCCATCAAATCTACCCATTTTATTACT 2562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2523 TAGGGCTGTATTTCTGACTTTGTTAGAAGAATTGCCATCAAATCTACCCATATTATTACT 2582
Query 2563 TGCTACATCTTATGGTGAATTATCTGACGTGGAAGAGCAGTCAGTATTTGACAATCGATC 2622
||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2583 TGCTACATCTTATGGTGAATTGTCTGACATGGAAGAGCAGTCAGTATTTGACAATCGATC 2642
Query 2623 TGTCTATACTGTGGACAAACCATCAAATGAAGACAGGTCTTTGTTCTTTGACCGTTTGAT 2682
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2643 TGTCTATACTGTGGACAAACCATCAAGTGAAGACAGGTCTTTGTTCTTTGACCGTTTGAT 2702
Query 2683 TGAAGCTGCTCTCTCAGTCATTTCTGGCTTAAATGGCAAACCATT-TGGACCACAATCCC 2741
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||
Sbjct 2703 TGAAGCTGCTCTCTCAGTCATTTCTGGCTTAAATGGCAAACC-TGATGGACCACAACCCC 2761
Query 2742 TTCCAGAACTTCCCAAGGTTCCAAAAGAACCTACTGGTCCAAAACCCGCAGAAGTAAAAG 2801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2762 TTCCAGAACTTCCCAAGGTTCCAAAAGAACCTACTGGTCCAAAACCCGCAGAAGTAAAAG 2821
Query 2802 CCAAGGTGGAAGCAGAGCAGCATGCCCTTCGACGATTGCGTATGTGTCTCAGAGATGTTT 2861
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2822 CCAAGGTGGAAGCAGAGCAGCATGCCCTTCGGCGATTGCGTATGTGTCTCAGAGATGTTT 2881
Query 2862 GCAATAGGATACTATATGATAAAAGATTCAGCGCATTCCACTTTCCAGTTACTGACGAGG 2921
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2882 GCAATAGAATACTATATGATAAAAGATTCAGCGCATTCCACTTTCCAGTTACTGACGAGG 2941
Query 2922 ATGCTCCAAACTATCGCTCAATAATTCAAAATCCAATGGATACGGCTACTCTGCTGCAGC 2981
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2942 ATGCTCCAAACTATCGCTCAATAATTCAAATTCCAATGGATACGGCTACTCTGCTGCAGC 3001
Query 2982 GTGTTGATACTGGGCAGTATCTGACATGTGCACCGTTCTTGCAAGATGTTGATCTCATTG 3041
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3002 GTGTTGATACTGGGCAGTATCTGACATGTACACCGTTTTTGCAAGATGTGGATCTCATTG 3061
Query 3042 TGAGAAATGCCAAGGCTTACAATGGAGATGATTACGCAGGAGCGAGAATTGTCAGTAGAG 3101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3062 TGAGAAATGCCAAGGCTTACAATGGAGATGATTACGCTGGAGCGAGAATTGTCAGTAGAG 3121
Query 3102 CCTATGAGCTTCGAGATGTAGTGCATGGGATGCTGTCACAGGTGGACCCAGCACTGCTAA 3161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3122 CCTATGAGCTTCGAGATGTAGTGCATGGGATGCTGTCACAGATGGACCCAGCACTGCTAA 3181
Query 3162 CACATTGTGATAAGATCGCAGCTGAAGGTGGTCCTTCACAGATACCAGATGATCTGAGTG 3221
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3182 CATATTGTGATAAGATCGCAGCTGAAGGTGGTCCTTCACTGATACCAGATGATCTGAGTG 3241
Query 3222 GATCAATCCTCGGTTTAGCTCCTGTTGTACAGATGGGAACTGTTACTAGAACCAGTGCCC 3281
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3242 GATCAATCCTCGGTTTAGCTCCTGTTGTGCAGATGGGAACTGTTACTAGAACCAGTGCCA 3301
Query 3282 GACTTCGAAATGTGCAGCCAGAGGTCAATTTAGATCGAGATTATGAAGGTCTTAAAAAGC 3341
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3302 GACTTCGAAATGTGCAGCCAGAGGTTAATTTAGATCGAGATTATGAAGGTCTTAAAAAGC 3361
Query 3342 CCAAGAAAACTACTGATGCTGTCTGTACAGAATCAGCTGCAGACAAATCACAAAACCAAG 3401
||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3362 CCAAGAAAACTACTGATGCTGTCAGTATAGATTCAGCTGCAGACAAATCACAGAACCAAG 3421
Query 3402 ATTCAGGCAAAGAGATACCATCTCCGGAAGCGGCCAACACACAGTCAGCAGATCCTTCTC 3461
|||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 3422 ATTCAGGCCAAGAAATGCCATCTCCGGATGCGGCCAACCCACAGTCAGCAGCTCCTTCTC 3481
Query 3462 CAACAGATGGTAATAGAGAAGACCGAAGCGAGCCACCAAGTAAAGAGGCATCTGCAGTAG 3521
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3482 CAACAGATGGTGATAGAGAAGACCAAAGCGAGCCACCAAGTAAAGAGGCATCTGCAGAAG 3541
Query 3522 ATGTGAGTGGTGATACTTCCA-GGGATTCTGCT---AAGTCGGATGAAGAAATTTCAAGC 3577
|| ||||||||||| ||| || ||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3542 ATATGAGTGGTGATTCTTGCAAGGG-TCCTGCGGCCAAGTCGGATAAAGAAATTTCAAGC 3600
Query 3578 CGAACAGAATCTGTAAAGGGATTACTCATGGAACGCACTGACAACTACAGCATTCCGCAG 3637
||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3601 CGAACAGAATCTGTAAAGGGAGTATTCATGGAACGTACTGACAACTACAGCATTCCGCAG 3660
Query 3638 ATGGAGAGGCTCTACACTCGAATCATGAAGGGTGTTCTTGAGACTTTAGACGAAGGGCTT 3697
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||
Sbjct 3661 ATGGAGAGGCTTTACACTCGAATCATGAAGGGTGTTCTTGAGACTCTGGACAAAGGGCTT 3720
Query 3698 CGTGATGATGATAATAACCCTAAGTATTCAATTTTGAGATTTTTGTCGGAATTCGCTCAG 3757
||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3721 CGTGATGATGATAATAATCCTAAGCATTCAATTTTGAGATTTTTGTCGGAATTCGCACAG 3780
Query 3758 CATCAGGCGAATTTCTGAGGCTAAATTTTCTCATATCGGTCACTAGG-TAGGTTTGCTAA 3816
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3781 CATCAGGCGAATTTCTGAATCTAAATTTTCTCATATCGGTCACTAGGATAGGTTTGCTAG 3840
Query 3817 AAGAAAG 3823
||||||
Sbjct 3841 GAGAAAG 3847
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 193644399980
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5