BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg470642
Length=2964
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G06220.2 | Symbols: MEE5 | Ribosomal protein S5/Elongation f... 5048 0.0
AT5G25230.1 | Symbols: | Ribosomal protein S5/Elongation facto... 4540 0.0
> AT1G06220.2 | Symbols: MEE5 | Ribosomal protein S5/Elongation
factor G/III/V family protein | chr1:1899964-1904873 FORWARD
LENGTH=3543
Length=3543
Score = 5048 bits (2733), Expect = 0.0
Identities = 2881/2955 (97%), Gaps = 0/2955 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 AGCTTATATGATGAGTTTGGTAACTATATTGGACCTGAGATTGAGTCTGACAGAGACAGT 69
||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 299 AGCTTGTATGATGAGTTTGGTAACTATGTTGGACCTGAGATTGAGTCTGACAGAGATAGT 358
Query 70 GATGATGAAATAGAAGATGAAGATCTCCAAGATAAGCAACTTGAAGAAAATGGATCGGAT 129
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||
Sbjct 359 GATGATGAAGTAGAAGATGAAGATCTCCAAGATAAGCATCTTGAAGAAAATGGTTCCGAT 418
Query 130 GGCGAACATGGTCCTGGGGGTTCCAATGGCTGGATTACCACTATCAATGATGTTGAGATG 189
|||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 GGCGAACAAGGGCCTGGGGGTTCTAATGGCTGGATTACCACTATCAATGATGTTGAGATG 478
Query 190 GAGAACCAAATTGTTCTTCCTGAGGATAAGAAGTACTACCCTACTGCTGAGGAGGTTTAT 249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 GAGAACCAAATTGTTCTTCCTGAGGATAAGAAGTACTACCCTACTGCTGAGGAGGTTTAT 538
Query 250 GGTGAGGGTGTTGAGACCTTGGTTATGGATGAAGATGAGCAGCCTCTTGAGCAACCCATT 309
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 GGTGAGGATGTTGAGACCTTGGTTATGGATGAAGATGAGCAGCCTCTTGAGCAACCCATT 598
Query 310 ATCAAACCTGTTAGAGATATTAGATTTGAGGTGGGGGTCAAGGATCAATCAACCTATGTG 369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||
Sbjct 599 ATCAAACCTGTTAGAGATATTAGATTTGAGGTGGGGGTCAAAGATCAAGCAACGTATGTG 658
Query 370 TCTACACAGTTTCTTATCGGCCTCATGTCTAATCCCGCGCTTGTGAGGAATGTTGCTCTC 429
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 TCAACACAGTTTCTTATCGGCCTCATGTCTAATCCTGCGCTTGTGAGGAATGTTGCTCTT 718
Query 430 GTGGGGCATCTACAGCACGGCAAAACTGTCTTCATGGATATGTTGGTAGAGCAGACGCAT 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 GTGGGGCATCTACAGCACGGCAAAACTGTCTTCATGGATATGTTGGTAGAGCAGACGCAT 778
Query 490 CATATGTCTACTTTTAATACTAAAAACGAGAAGCATATGAAATATACAGACACAAGAGTC 549
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 779 CATATGTCTACTTTTAATGCTAAAAACGAGAAGCATATGAAATATACAGACACACGAGTC 838
Query 550 GATGAGCAGGAGAGAAATATATCAATCAAGGCGGTTCCAATGTCTCTTGTCCTTGAGGAC 609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 GATGAGCAGGAGAGAAATATATCAATCAAGGCGGTTCCAATGTCTCTTGTCCTTGAGGAC 898
Query 610 AGTAGATCCAAATCATACCTGTGCAATATCATGGATACCCCTGGACACGTCAATTTCTCT 669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 899 AGTAGATCCAAATCATACCTGTGCAATATCATGGATACCCCTGGACATGTCAATTTCTCT 958
Query 670 GACGAAATGACTGCTTCTTTAAGACTTGCTGATGGTGCTGTTCTGATTGTTGATGCTGCT 729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 GACGAAATGACTGCTTCTTTAAGACTTGCTGATGGTGCTGTTCTGATTGTTGATGCTGCT 1018
Query 730 GAAGGAGTGATGGTAAACACAGAGAGAGCTATACGGCATGCAATCCAGGACCGTCTCCCT 789
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1019 GAAGGAGTGATGGTTAACACAGAGAGAGCTATACGGCATGCAATCCAGGACCATCTCCCT 1078
Query 790 ATTGTTGTTGTCATCAATAAGGTTGACAGGCTCATAACTGAGCTCAAACTACCTCCAAGG 849
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 ATTGTAGTTGTTATCAATAAGGTTGACAGGCTCATAACTGAGCTCAAACTACCTCCAAGG 1138
Query 850 GATGCTTACTACAAGCTGAGGCATACAATTGAAGTCATTAACAACCACATATCTGCTGCT 909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1139 GATGCTTACTACAAGCTGAGGCATACAATTGAAGTCATTAATAACCACATATCTGCTGCT 1198
Query 910 TCAACAACTGCTGGAAACTTACCTCTTATAGACCCTGCAGCTGGAAATGTATGTTTTGCC 969
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 TCAACAACTGCTGGAGACTTACCTCTTATAGACCCTGCAGCTGGAAATGTATGTTTTGCC 1258
Query 970 AGTGGCACAGCCGGATGGTCGTTCACATTGCAATCTTTTTCTAAAATGTATGCCAAGCTT 1029
||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGTGGTACAGCCGGATGGTCCTTCACATTACAATCTTTTGCTAAAATGTATGCCAAGCTT 1318
Query 1030 CATGGGGTGGCCATGGACGTGGATAAGTTTGCATCTCGACTTTGGGGAGATGTTTATTAT 1089
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1319 CATGGTGTGGCCATGGACGTGGATAAGTTTGCATCTCGACTTTGGGGAGATGTATATTAT 1378
Query 1090 CACCCTGATACTAGGGTATTCAAGAGAAGTCCTCCTGTAGGTGGTGGAGAAAGAGCATTT 1149
||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 CACTCTGATACTAGGGTATTCAAGAGAAGTCCTCCAGTAGGTGGTGGAGAAAGAGCATTT 1438
Query 1150 GTTCAGTTTATTCTGGAGCCTCTGTACAAAATATACAGCCAAGTGATAGGTGAACATAAG 1209
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439 GTTCAGTTTATTCTGGAGCCCCTATACAAGATATACAGCCAAGTGATAGGTGAACATAAG 1498
Query 1210 AAGAGTGTAGAGACAACCCTTGCAGAATTAGGAGTGACTCTGAGTAATAGTGCATATAAG 1269
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 AAGAGTGTAGAGACCACCCTTGCAGAATTAGGAGTGACTCTGAGTAATAGTGCATATAAG 1558
Query 1270 CTGAACGTCAGACCTTTACTTAGGTTAGCCTGTAGTTCAGTTTTTGGTTCGGCATCAGGG 1329
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1559 CTGAACGTCAGACCTCTACTTAGGTTAGCCTGTAGTTCAGTGTTTGGTTCGGCATCAGGG 1618
Query 1330 TTCACTGATATGTTGGTAAAGCACATTCCTTCCCCCCGAGAGGCCGCAGCTAGGAAAGTC 1389
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1619 TTCACTGATATGTTGGTAAAGCACATTCCTTCACCCAGAGAGGCTGCAGCTAGGAAGGTC 1678
Query 1390 GACCATTCATACACTGGAACCAAAGATTCCCCCATTTATGAATCAATGGTAGAATGTGAT 1449
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679 GACCATTCATATACCGGAACCAAAGATTCCCCCATTTATGAATCAATGGTAGAATGTGAT 1738
Query 1450 CCATCTGGACCTCTCATGGTTAATGTGACAAAGTTGTACCCCAAATCAGATACTAGTGTT 1509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739 CCATCTGGACCTCTCATGGTTAATGTGACAAAGTTGTACCCCAAATCAGATACTAGTGTT 1798
Query 1510 TTTGATGTGTTTGGAAGAGTTTATAGCGGTAGGCTTCAAACAGGGCAAAGCGTACGTGTA 1569
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799 TTTGATGTGTTTGGAAGAGTTTATAGTGGTAGGCTTCAAACAGGGCAAAGCGTACGTGTA 1858
Query 1570 CTAGGAGAAGGGTATTTACCTGAGGATGAGGAGGACATGACTATAAAAGAAGTGACGAAG 1629
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 CTAGGAGAAGGGTATTCACCTGAGGATGAGGAGGACATGACTATAAAAGAAGTGACGAAG 1918
Query 1630 CTATGGATATATCAAGCTAGGTATAGAATACCAGTAAGCAGTGCCCCTCCTGGTTCCTGG 1689
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1919 CTATGGATATATCAAGCTAGGTATAGAATACCAGTAAGCAGTGCCCCTCCCGGTTCCTGG 1978
Query 1690 GTTTTAATTGAAGGTGTCGATGCATCCATCATGAAAACTGCGACTCTGTGTAATGCAAGC 1749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 GTTTTAATTGAAGGTGTCGATGCATCCATCATGAAAACTGCGACTCTGTGTAATGCAAGC 2038
Query 1750 TACGATGAAGATGTTTACATATTCCGGGCTCTCCAATTTAATACCCTCCCAGTAGTCAAG 1809
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 TATGATGAAGATGTCTACATATTCCGGGCTCTCCAATTTAATACCCTCCCAGTAGTCAAG 2098
Query 1810 ACTGCAACTGAGCCTTTGAATCCTAGTGAGCTGCCTAAAATGGTGGAAGGGCTTAGGAAA 1869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2099 ACTGCAACTGAGCCTTTGAATCCTAGTGAGCTGCCTAAAATGGTGGAAGGGCTTAGGAAA 2158
Query 1870 ATTAGCAAAAGCTATCCCCTTGCGATTACCAAAGTCGAGGAGTCTGGGGAACATACTATT 1929
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 ATTAGCAAAAGCTATCCCCTTGCGATTACCAAAGTTGAGGAGTCTGGGGAACATACTATT 2218
Query 1930 CTAGGCACTGGTGAGTTGTACTTGGATTCCATCATGAAGGACCTCAGGGAACTCTATTCA 1989
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2219 CTAGGCACAGGTGAGTTGTACTTGGATTCAATCATGAAGGACCTCAGGGAGCTCTATTCA 2278
Query 1990 GAGGTCGAAGTAAAGGTAGCAGATCCGGTGGTCTCCTTCTGTGAGACAGTAGTTGAATCT 2049
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2279 GAGGTCGAAGTAAAGGTTGCAGATCCGGTGGTCTCCTTCTGTGAGACAGTGGTTGAATCT 2338
Query 2050 TCGTCGATGAAGTGTTTTGCTGAGACACCAAACAAAAAGAACAAAATAACTATGATTGCA 2109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2339 TCGTCGATGAAGTGTTTTGCTGAGACACCAAACAAAAAGAACAAAATAACTATGATTGCA 2398
Query 2110 GAGCCATTGGATAGAGGACTTGCAGAGGACATTGAGAATGGCGTTGTAAGCATTGACTGG 2169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2399 GAGCCATTGGATAGAGGACTTGCAGAGGACATTGAGAATGGCGTTGTAAGCATTGACTGG 2458
Query 2170 AACAGAAAACAACTTGGTGACTTCTTCAGGACGAAATATGACTGGGATTTACTTGCTGCA 2229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2459 AACAGAAAACAACTTGGTGACTTCTTCAGGACGAAATATGACTGGGATTTACTTGCTGCA 2518
Query 2230 CGTTCCATCTGGGCTTTTGGCCCTGACAAACAGGGGCCAAATATATTATTGGATGACACG 2289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2519 CGTTCCATCTGGGCTTTTGGCCCTGACAAACAGGGGCCAAACATATTATTGGATGACACC 2578
Query 2290 CTTCCAACTGAGGTGGACAGGAACTTGATGATGGCAGTGAAAGACTCCATTGTTCAAGGG 2349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2579 CTTCCAACTGAGGTGGACAGGAACTTGATGATGGCAGTGAAAGACTCCATTGTTCAAGGG 2638
Query 2350 TTCCAGTGGGGTGCTCGTGAAGGTCCCCTCTGTGATGAGCCCATCAGAAATGTAAAGTTC 2409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2639 TTCCAGTGGGGTGCTCGTGAAGGTCCCCTCTGTGATGAGCCCATCAGAAATGTAAAGTTC 2698
Query 2410 AAGATTGTTGATGCAAGGATAGCACCAGAGCCGTTGCATAGAGGATCTGGTCAGATGATT 2469
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2699 AAGATTGTTGATGCACGGATAGCACCAGAGCCATTGCATAGAGGATCTGGTCAGATGATT 2758
Query 2470 CCAACAGCAAGACGTGTTGCATATTCAGCCTTTCTTATGGCAACTCCAAGGCTAATGGAA 2529
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2759 CCAACAGCAAGACGTGTTGCATATTCAGCTTTTCTAATGGCAACTCCAAGGCTAATGGAA 2818
Query 2530 CCTGTCTACTATGTGGAGATACAAACGCCAATCGACTGTGTAACTGCAATCTACACAGTT 2589
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2819 CCTGTCTACTATGTGGAGATACAAACACCAATCGACTGTGTAACTGCAATCTACACAGTT 2878
Query 2590 TTGTCACGTAGACGTGGGCATGTCACATCTGATGTTCCTCAACCCGGTACTCCGGCTTAT 2649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2879 TTGTCACGTAGACGTGGGCATGTCACATCTGATGTTCCTCAACCCGGTACTCCAGCTTAT 2938
Query 2650 ATTGTGAAGGCTTTTCTGCCTGTGATAGAGTCATTTGGGTTTGAGACAGATCTGAGGTAC 2709
|| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2939 ATCGTGAAGGCCTTTCTGCCTGTGATAGAGTCCTTTGGGTTTGAGACAGATCTGAGGTAC 2998
Query 2710 CACACTCAGGGACAAGCCTTTTGCCTATCTGTGTTTGATCACTGGGCCATAGTGCCAGGA 2769
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2999 CACACTCAGGGACAAGCCTTTTGCCTATCTGTGTTTGATCACTGGGCCATTGTGCCAGGA 3058
Query 2770 GACCCTCTAGACAAAGCCATACAATTGCGCCCACTTGAGCCCGCCCCTATTCAGCATCTA 2829
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3059 GACCCTCTAGACAAAGCCATCCAGTTGCGCCCACTTGAGCCCGCTCCTATTCAGCATCTA 3118
Query 2830 GCTCGTGAATTCATGGTCAAGACCCGCCGTAGAAAGGGAATGAGCGAAGACGTCAGCGGG 2889
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3119 GCTCGGGAATTCATGGTCAAGACCCGCCGTAGAAAGGGAATGAGCGAAGACGTCAGCGGA 3178
Query 2890 AATAAATTCTTTGATGAAGCGATGATGGTAGAGCTTGCCCAGCAAACAGGCGATCTCCAT 2949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3179 AATAAATTCTTTGATGAAGCGATGATGGTAGAGCTTGCCCAGCAAACAGGCGATCTCCAT 3238
Query 2950 CTGCAGATGATTTGA 2964
|||||||||||||||
Sbjct 3239 CTGCAGATGATTTGA 3253
> AT5G25230.1 | Symbols: | Ribosomal protein S5/Elongation factor
G/III/V family protein | chr5:8739709-8743594 FORWARD LENGTH=2922
Length=2922
Score = 4540 bits (2458), Expect = 0.0
Identities = 2708/2829 (96%), Gaps = 15/2829 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 142 CCTGGGGGTTCCAATGGCTGGATTACCACTATCAATGATGTTGAGATGGAGAACCAAATT 201
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | || | |||
Sbjct 103 CCTGGGGGTTCTAATGGCTGGATTACCACTATCAATGA----GA-A-CCA-AA--ATATT 153
Query 202 GTTCTTCCTGAGGATAAGAAGTACTACCCTACTGCTGAGGAGGTTTATGGTGAGGGTGTT 261
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 154 GTTCTTCCTGAGGATAAGAAGTACTACCCTATTGCTAAGGAGGTTTATGGTGAGGATGTT 213
Query 262 GAGACCTTGGTTATGGATGAAGATGAGCAGCCTCTTGAGCAACCCATTATCAAACCTGTT 321
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 214 GAGACCTTGGTTATGGATGAAGATGAGCAGTCTCTTGAGCAACCCATTATCAAACCCGTT 273
Query 322 AGAGATATTAGATTTGAGGTGGGGG---TCAAGGATCAATCAAC--C-TATGTGTCTACA 375
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||
Sbjct 274 AGAGATATTAGATTTGAGGTGGGGGTCATCAAGGATCAAACAACAACGTATGTGTCAACA 333
Query 376 CAGTTTCTTATCGGCCTCATGTCTAATCCCGCGCTTGTGAGGAATGTTGCTCTCGTGGGG 435
| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 334 CTGTTTCTTATCGGCCTCATGTCTAATCCTGCGCTTGTGAGGAATGTTGCTCTTGTGGGG 393
Query 436 CATCTACAGCACGGCAAAACTGTCTTCATGGATATGTTGGTAGAGCAGACGCATCATATG 495
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 394 CATCTCCAGCACGGCAAAACTGTCTTCATGGATATGTTGGTAGAGCAGACGCATCGTATG 453
Query 496 TCTACTTTTAATACTAAAAACGAGAAGCATATGAAATATACAGACACAAGAGTCGATGAG 555
|||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 454 TCTACTTTTAATGCTGAAAACGACAAGCATATGAGATATACGGACACAAGAGTCGATGAG 513
Query 556 CAGGAGAGAAATATATCAATCAAGGCGGTTCCAATGTCTCTTGTCCTTGAGGACAGTAGA 615
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514 CAGGAGAGAAATATATCTATCAAGGCGGTTCCAATGTCTCTTGTCCTTGAGGACAGTAGA 573
Query 616 TCCAAATCATACCTGTGCAATATCATGGATACCCCTGGACACGTCAATTTCTCTGACGAA 675
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 574 TCCAAATCATACCTGTGCAATATCATGGATACACCTGGAAATGTCAATTTCTCTGACGAA 633
Query 676 ATGACTGCTTCTTTAAGACTTGCTGATGGTGCTGTTCTGATTGTTGATGCTGCTGAAGGA 735
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||
Sbjct 634 ATGACTGCTTCTTTAAGACTTGCTGATGGTGCTGTTTTCATTGTTGATGCTGCTCAAGGA 693
Query 736 GTGATGGTAAACACAGAGAGAGCTATACGGCATGCAATCCAGGACCGTCTCCCTATTGTT 795
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 694 GTCATGGTAAACACAGAGAGAGCTATACGGCATGCAATCCAGGATCATCTCCCTATTGTT 753
Query 796 GTTGTCATCAATAAGGTTGACAGGCTCATAACTGAGCTCAAACTACCTCCAAGGGATGCT 855
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 754 GTTGTGATCAATAAGGTTGACAGGCTCATAACTGAGCTCAAACTACCTCCAAGGGATGCT 813
Query 856 TACTACAAGCTGAGGCATACAATTGAAGTCATTAACAACCACATATCTGCTGCTTCAACA 915
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 814 TACTACAAGCTGAGGTATACAATTGAAGTCATTAATAACCATATATCTGCTGCTTCAACA 873
Query 916 ACTGCTGGAAACTTACCTCTTATAGACCCTGCAGCTGGAAATGTATGTTTTGCCAGTGGC 975
| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 874 AATGCTGCAGACTTACCTCTTATAGACCCTGCAGCTGGAAATGTATGTTTCGCCAGTGGT 933
Query 976 ACAGCCGGATGGTCGTTCACATTGCAATCTTTTTCTAAAATGTATGCCAAGCTTCATGGG 1035
|||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 934 ACAGCCGGATGGTCCTTCACATTACAATCTTTTGCTAGAATGTATGCCAAGCTTCATGGT 993
Query 1036 GTGGCCATGGACGTGGATAAGTTTGCATCTCGACTTTGGGGAGATGTTTATTATCACCCT 1095
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 994 GTGGCCATGGACGTGGATAAGTTTGCATCTAGACTTTGGGGAGATGTATATTATCACCCT 1053
Query 1096 GATACTAGGGTATTCAAGAGAAGTCCTCCTGTAGGTGGTGGAGAAAGAGCATTTGTTCAG 1155
||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1054 GATACTAGGGTATTCAATACAAGTCCTCCAGTAGGTGGTGGAGAAAGAGCATTTGTTCAG 1113
Query 1156 TTTATTCTGGAGCCTCTGTACAAAATATACAGCCAAGTGATAGGTGAACATAAGAAGAGT 1215
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1114 TTTATTCTGGAGCCTCTATACAAGATATACAGCCAAGTGATAGGTGAACATAAGAAGAGT 1173
Query 1216 GTAGAGACAACCCTTGCAGAATTAGGAGTGACTCTGAGTAATAGTGCATATAAGCTGAAC 1275
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174 GTAGAGACCACCCTTGCAGAATTAGGAGTGACTCTGAGTAATAGTGCATATAAGCTGAAC 1233
Query 1276 GTCAGACCTTTACTTAGGTTAGCCTGTAGTTCAGTTTTTGGTTCGGCATCAGGGTTCACT 1335
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1234 GTCAGACCTTTACTTAGGTTAGCCTGTAGTTCAGTGTTTGGTTCGGCATCAGGGTTCACT 1293
Query 1336 GATATGTTGGTAAAGCACATTCCTTCCCCCCGAGAGGCCGCAGCTAGGAAAGTCGACCAT 1395
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1294 GATATGTTGGTAAAGCACATTCCTTCACCCAGAGAGGCTGCAGCTAGGAAAGTGGACCAT 1353
Query 1396 TCATACACTGGAACCAAAGATTCCCCCATTTATGAATCAATGGTAGAATGTGATCCATCT 1455
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1354 TCATACACTGGAACCAAAGATTCTCCCATTTATGAATCAATGGTAGAATGTGATCCATCT 1413
Query 1456 GGACCTCTCATGGTTAATGTGACAAAGTTGTACCCCAAATCAGATACTAGTGTTTTTGAT 1515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1414 GGACCTCTCATGGTTAATGTGACAAAGTTGTACCCCAAATCAGATACTAGTGTTTTTGAT 1473
Query 1516 GTGTTTGGAAGAGTTTATAGCGGTAGGCTTCAAACAGGGCAAAGCGTACGTGTACTAGGA 1575
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474 GTGTTTGGAAGAGTTTATAGTGGTAGGCTTCAAACAGGGCAAAGCGTACGTGTACTAGGA 1533
Query 1576 GAAGGGTATTTACCTGAGGATGAGGAGGACATGACTATAAAAGAAGTGACGAAGCTATGG 1635
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1534 GAAGGGTATTCACCTGAGGATGAGGAGGACATGACTATAAAAGAAGTCACGAAGCTATGG 1593
Query 1636 ATATATCAAGCTAGGTATAGAATACCAGTAAGCAGTGCCCCTCCTGGTTCCTGGGTTTTA 1695
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 1594 ATATATCAAGCTAGGTATAGAATACCAGTAAGCAGTGCCCCTCCCGGTTCTTGGGTTTTA 1653
Query 1696 ATTGAAGGTGTCGATGCATCCATCATGAAAACTGCGACTCTGTGTAATGCAAGCTACGAT 1755
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1654 ATTGAAGGTGTCGATGCATCCATCATGAAAACTGCAACTCTGTGTAATGCAAGTTATGAT 1713
Query 1756 GAAGATGTTTACATATTCCGGGCTCTCCAATTTAATACCCTCCCAGTAGTCAAGACTGCA 1815
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1714 GAAGATGTCTACATATTCCGGGCTCTCAAATTTAATACCCTCCCAGTAGTCAAGACTGCA 1773
Query 1816 ACTGAGCCTTTGAATCCTAGTGAGCTGCCTAAAATGGTGGAAGGGCTTAGGAAAATTAGC 1875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 ACTGAGCCTTTGAATCCTAGTGAGCTGCCTAAAATGGTGGAAGGGCTTAGGAAAATTAGC 1833
Query 1876 AAAAGCTATCCCCTTGCGATTACCAAAGTCGAGGAGTCTGGGGAACATACTATTCTAGGC 1935
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1834 AAAAGCTATCCCCTTGCGATAACCAAAGTTGAGGAGTCTGGGGAACATACTATTCTAGGC 1893
Query 1936 ACTGGTGAGTTGTACTTGGATTCCATCATGAAGGACCTCAGGGAACTCTATTCAGAGGTC 1995
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1894 ACAGGTGAGTTGTACTTGGATTCCATCATCAAGGACCTCAGGGAACTCTATTCAGAGGTC 1953
Query 1996 GAAGTAAAGGTAGCAGATCCGGTGGTCTCCTTCTGTGAGACAGTAGTTGAATCTTCGTCG 2055
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1954 CAAGTAAAGGTTGCAGATCCTGTGGTCTCCTTCTGTGAGACAGTGGTTGAATCTTCGTCA 2013
Query 2056 ATGAAGTGTTTTGCTGAGACACCAAACAAAAAGAACAAAATAACTATGATTGCAGAGCCA 2115
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2014 ATGAAGTGCTTTGCTGAGACACCAAACAAAAAGAACAAACTAACTATGATTGCAGAGCCA 2073
Query 2116 TTGGATAGAGGACTTGCAGAGGACATTGAGAATGGCGTTGTAAGCATTGACTGGAACAGA 2175
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2074 TTGGATAGAGGACTTGCAGAGGATATTGAGAATGGCGTTGTAAGCATTGACTGGAACAGA 2133
Query 2176 AAACAACTTGGTGACTTCTTCAGGACGAAATATGACTGGGATTTACTTGCTGCACGTTCC 2235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2134 GTACAACTTGGTGACTTCTTCAGGACGAAATATGACTGGGATTTACTTGCTGCACGTTCC 2193
Query 2236 ATCTGGGCTTTTGGCCCTGACAAACAGGGGCCAAATATATTATTGGATGACACGCTTCCA 2295
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2194 ATCTGGGCTTTTGGCCCTGACAAACAGGGGACAAACATATTATTGGATGACACCCTTCCA 2253
Query 2296 ACTGAGGTGGACAGGAACTTGATGATGGCAGTGAAAGACTCCATTGTTCAAGGGTTCCAG 2355
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2254 ACTGAGGTGGACAGGAACTTGATGATGGGAGTGAAAGACTCCATTGTTCAAGGGTTCCAG 2313
Query 2356 TGGGGTGCTCGTGAAGGTCCCCTCTGTGATGAGCCCATCAGAAATGTAAAGTTCAAGATT 2415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2314 TGGGGTGCTCGTGAAGGTCCCCTCTGTGATGAGCCCATCAGAAATGTAAAGTTCAAGATT 2373
Query 2416 GTTGATGCAAGGATAGCACCAGAGCCGTTGCATAGAGGATCTGGTCAGATGATTCCAACA 2475
||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2374 GTTGATGCACGGATAGCACCTGAGCCGTTGCATAGAGGATCTGGTCAGATGATTCCAACG 2433
Query 2476 GCAAGACGTGTTGCATATTCAGCCTTTCTTATGGCAACTCCAAGGCTAATGGAACCTGTC 2535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2434 GCAAGACGTGTTGCATATTCAGCCTTTCTTATGGCAACTCCAAGGCTAATGGAACCTGTC 2493
Query 2536 TACTATGTGGAGATACAAACGCCAATCGACTGTGTAACTGCAATCTACACAGTTTTGTCA 2595
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2494 TACTATGTGGAGATACAAACACCAATAGACTGTGTAACTGCCATCTACACAGTTTTGTCA 2553
Query 2596 CGTAGACGTGGGCATGTCACATCTGATGTTCCTCAACCCGGTACTCCGGCTTATATTGTG 2655
|||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 2554 CGTAGACGTGGGTATGTCACATCTGATGTTCCACAACCCGGTACTCCTGCTTATATCGTG 2613
Query 2656 AAGGCTTTTCTGCCTGTGATAGAGTCATTTGGGTTTGAGACAGATCTGAGGTACCACACT 2715
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2614 AAGGCTTTTCTGCCTGTGATAGAGTCGTTTGGGTTTGAGACAGATCTGAGGTACCACACT 2673
Query 2716 CAGGGACAAGCCTTTTGCCTATCTGTGTTTGATCACTGGGCCATAGTGCCAGGAGACCCT 2775
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||
Sbjct 2674 CAGGGCCAAGCCTTTTGCCTATCTGTGTTTGATCATTGGGCCATAGTCCCTGGAGACCCT 2733
Query 2776 CTAGACAAAGCCATACAATTGCGCCCACTTGAGCCCGCCCCTATTCAGCATCTAGCTCGT 2835
|||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2734 CTAGACAAAGCCATCCAATTGCGCCCACTTGAACCCGCCCCTATTCAGCATCTAGCTCGG 2793
Query 2836 GAATTCATGGTCAAGACCCGCCGTAGAAAGGGAATGAGCGAAGACGTCAGCGGGAATAAA 2895
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2794 GAATTCATGGTCAAGACCCGCCGTAGAAAGGGAATGAGCGAAGATGTCAGCGGGAATAAA 2853
Query 2896 TTCTTTGATGAAGCGATGATGGTAGAGCTTGCCCAGCAAACAGGCGATCTCCATCTGCAG 2955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2854 TTCTTTGATGAAGCGATGATGGTAGAGCTTGCCCAGCAAACAGGCGATCTCCATCTGCAG 2913
Query 2956 ATGATTTGA 2964
|||||||||
Sbjct 2914 ATGATTTGA 2922
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 147340311591
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5