BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg470649
Length=2365
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G06290.1 | Symbols: ACX3, ATACX3 | acyl-CoA oxidase 3 | chr1... 3727 0.0
AT1G06310.1 | Symbols: ACX6 | acyl-CoA oxidase 6 | chr1:1926791... 2591 0.0
AT3G06690.1 | Symbols: | acyl-CoA oxidases;oxidoreductases, ac... 977 0.0
> AT1G06290.1 | Symbols: ACX3, ATACX3 | acyl-CoA oxidase 3 | chr1:1922352-1926278
FORWARD LENGTH=2375
Length=2375
Score = 3727 bits (2018), Expect = 0.0
Identities = 2243/2350 (95%), Gaps = 22/2350 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATCTTCCTTATAACAACCACAACGTCACTTTCTTCCCGGAAAATTGATATTGGTGAACGG 60
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||
Sbjct 1 ATCTTCCTTAAAACAACCACAACGTCACTTTCTTCCCGGATAATTGAAATCGGTGATCGG 60
Query 61 AATCCCTAGAAATGTCGGATAATCGCGCACTCCGGCGAGCTCATGTTCTCGCCAACCACA 120
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 61 AATCCCTAGAAATGTCGGATAATCGTGCACTCCGACGAGCTCATGTTCTCGCCAATCACA 120
Query 121 TACTCCAATCAACTCCTCCGTCATCGAACCTC-TCCCTGACGCGCGAGGTATGTTTGCAG 179
|||||||||||| |||||| || ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 121 TACTCCAATCAAATCCTCCATCTTCGAACC-CGTCCCTGTCGCGCGAGTTATGTTTGCAG 179
Query 180 TACTCCCCACCGGAGCTCAACGAGAGCTATGGATTCGATGTCAAGGAGATGAGAAAATTA 239
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TACTCTCCACCGGAGCTCAACGAGAGCTATGGATTCGATGTCAAGGAGATGAGAAAATTA 239
Query 240 CTCGACGGACACAACCTCGTGGATCGGGACTGGATTTATGGACTCATGATGCAGAGCAAT 299
|| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 CTTGACGGACACAACGTGGTGGATCGGGACTGGATTTATGGACTCATGATGCAGAGCAAT 299
Query 300 CTGTTTAATCGCAAGGAGAGAGGAGGTAAGATTTTCGTGTCGCCGGATTATAATCAGACG 359
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 300 CTGTTTAATCGGAAGGAGAGAGGAGGTAAGATTTTCGTGTCGCCGGATTACAATCAGACG 359
Query 360 ATGGAGCAGCAGCGTGAGATCACTATGAAGCGGATCTGGTACTTGCTCGAGCATGGGGTT 419
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 360 ATGGAGCAGCAGCGTGAGATCACAATGAAACGGATCTGGTACTTGCTTGAGAATGGGGTT 419
Query 420 TTCAAAGGATGGTTGACGGAGACAGGTCCTGAGGCCGAGCTCAGGAAATTAGCTCTGCTT 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TTCAAAGGATGGTTGACGGAGACAGGTCCTGAGGCCGAGCTCAGGAAATTAGCTCTGCTT 479
Query 480 GAGGTTTGCGGGATTTATGATCACTCCGTCTCCATCAAAGTTGGTGTTCATTTCTTCCTG 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 480 GAGGTTTGCGGGATTTATGATCACTCCGTCTCCATCAAAGTTGGTGTGCATTTCTTCCTG 539
Query 540 TGGGGTAATGCTGTAAAGTTCTTTGGAACAAAGCGTCACCATGAAAAGTGGCTGAAGAAC 599
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 TGGGGTAATGCTGTAAAGTTTTTTGGAACAAAGCGTCACCATGAAAAGTGGCTGAAGAAC 599
Query 600 ACCGAAGATTATGTTGTCAAGGGCTGTTTTGCAATGACTGAGCTAGGCCATGGAAGTAAT 659
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 ACCGAAGATTATGTTGTCAAGGGCTGTTTTGCTATGACTGAGCTAGGCCATGGAAGTAAT 659
Query 660 GTACGGGGAATTGAAACAGTGACAACTTATGACCCAACAACTGAGGAGTTTGTGATAAAT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct 660 GTACGGGGAATTGAAACAGTGACAACTTATGACCCAAAAACTGAAGAGTTTGTGATAAAT 719
Query 720 ACTCCTTGTGAATCTGCTCAGAAGTATTGGATCGGTGGGGCAGCTAATCATGCAACACAC 779
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 720 ACTCCTTGTGAATCTGCTCAGAAGTATTGGATTGGTGGGGCAGCTAATCATGCAACCCAC 779
Query 780 ACCATTGTGTTTTCACAGCTTCAAATTAACGGAACCAACCAGGGGGTCCATGCCTTTATC 839
|| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 ACAATTGTGTTTTCACAGCTTCATATCAACGGAACCAACCAGGGGGTCCATGCCTTTATC 839
Query 840 GCCCAAATCAGGGATGAAGATGGCAACATATGTCCAAACATCCGCATTGCTGACTGTGGA 899
||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 840 GCCCAAATCAGGGATCAAGATGGCAGCATATGTCCAAATATCCGCATTGCTGACTGTGGA 899
Query 900 CACAAAATTGGTCTAAATGGTGTTGACAATGGCCGGATCTGGTTTGATAATCTTCGAATT 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 CACAAAATTGGTCTAAATGGTGTTGACAATGGCCGGATCTGGTTTGATAATCTTCGAATT 959
Query 960 CCAAGAGAGAATTTGTTGAACGCAGTTGCTGATGTTTCGTCTGATGGGAAGTATGTTAGC 1019
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 CCAAGAGAGAATTTGTTGAATGCAGTTGCTGATGTTTCGTCTGATGGGAAGTATGTTAGC 1019
Query 1020 TCAATTAAAGATCCTGATCAGAGATTTGGAGCATTCATGGCCCCTTTGACTTCTGGCCGA 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 TCAATTAAAGATCCTGATCAGAGATTTGGAGCATTCATGGCCCCTTTGACTTCTGGCCGA 1079
Query 1080 GTCACAATTGCATCAAGTGCAATTTATTCTGCAAAGGTCGGATTAGCTATTGCTATAAGG 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1080 GTCACAATTGCATCAAGTGCAATTTATTCTGCAAAGGTCGGATTATCTATTGCTATAAGG 1139
Query 1140 TACTCATTATCGAGAAGAGCCTTCTCTGTTACAGCTAATGGTCCTGAAGTCCTCCTCCTT 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 TACTCATTATCGAGAAGAGCCTTCTCTGTTACAGCTAATGGTCCTGAAGTCCTCCTCCTT 1199
Query 1200 GATTACCCAAGCCATCAAAGGCGACTGCTACCACTCCTAGCAAAGACATATGCTATGAGT 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 GATTACCCAAGCCATCAAAGGCGACTGCTACCACTCCTAGCAAAGACATATGCTATGAGT 1259
Query 1260 TTTGCTGCAAATGAATTGAAGATGATTTACGTAAAGAGAACACCGGAGACCAACAAAGCC 1319
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 TTTGCTGCAAATGAATTGAAGATGATTTACGTGAAGAGAACACCGGAGACCAACAAAGCC 1319
Query 1320 ATCCACGTTGTTTCAAGTGGGTTCAAAGCTGTTCTCACCTGGCACAATATGCACACACTT 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 ATCCACGTTGTTTCAAGTGGGTTCAAAGCTGTTCTCACCTGGCACAATATGCACACACTT 1379
Query 1380 CAGGAATGTCGTGAAGCTGTAGGAGGGCAAGGTGTGAAAACAGAAAATCTAGTTGGTCAG 1439
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 CAGGAATGTCGAGAAGCTGTCGGAGGGCAAGGTGTGAAAACAGAAAATCTAGTTGGTCAG 1439
Query 1440 TTGAAAGGTGAATTTGATGTGCAGACTACATTTGAGGGTGACAATAATGTATTGATGCAG 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 TTGAAAGGTGAATTTGATGTGCAGACTACATTTGAGGGTGACAATAATGTATTGATGCAG 1499
Query 1500 CAGGTGAGCAAGGCCCTTTTTGCTGAATACGTATCGTGTAAGAAGAGAAATAAACCTTTC 1559
|||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1500 CAGGTGAGCAAGGCGCTTTTCGCTGAATATGTATCGTGTAAGAAGAGAAACAAACCTTTC 1559
Query 1560 AAAGGATTAGGATTGGAGCACCTGAACAGTCCACGTCCTGTATTGCCGACTCAACTCACA 1619
|| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1560 AAGGGACTGGGATTGGAGCACATGAACAGTCCACGTCCTGTATTACCGACTCAACTCACA 1619
Query 1620 TCGTCTACCCTCAGATGCAGCCAGTTCCAGACAAATGTGTTCTGCTTAAGAGAGCGAGAT 1679
|| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 TCATCAACCCTCAGATGCAGCCAATTCCAGACAAATGTGTTCTGCTTAAGAGAGCGAGAT 1679
Query 1680 CTTCTGGAACGATTTACTTCTGAAGTTGCACAGCTTCAAGGTAGAGGAGAAAGTCGAGAG 1739
|||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1680 CTTCTGGAGCAATTTACTTCTGAAGTTGCACAGCTTCAAGGGAGAGGAGAAAGTCGAGAA 1739
Query 1740 TTCTCTTTCCTCCTGAGTCATCAACTTGCTGAAGACTTAGGTAAAGCTTTCACAGAGAAG 1799
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 TTCTCTTTCCTCCTGAGTCATCAACTTGCTGAAGACTTAGGTAAAGCTTTCACAGAGAAA 1799
Query 1800 GCAATACTGCAAACCATTTTGGATGCTGAAGCCAAACTACCTGCTGGCTCAGTAAAGGAT 1859
|||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1800 GCAATACTTCAAACCATTTTGGATGCTGAGGCAAAACTACCTACTGGCTCAGTAAAGGAT 1859
Query 1860 GTGTTGGGTCTTGTAAGATCAATGTACGCATTGATCAGCTTGGAAGAAGATCCGTCGTTG 1919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1860 GTGTTGGGTCTTGTAAGATCAATGTACGCATTGATCAGCTTGGAAGAAGATCCATCGTTG 1919
Query 1920 CTGCGGTATGGTTACCTTTCTCAGGATAATGTTGGAGATGTGAGGAGGGAAGTTTCAAAG 1979
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1920 CTGCGATATGGTTACCTATCTCAGGATAATGTTGGAGATGTGAGGAGAGAAGTTTCAAAG 1979
Query 1980 CTCTGTGGAGAGCTGAGACCTCACGCGCTTGCACTCGTCACTTCATTCGGCATTCCAGAC 2039
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 CTCTGTGGAGAGCTTAGACCACACGCGCTTGCACTCGTCACTTCATTCGGCATTCCAGAC 2039
Query 2040 TCCTTCTTGAGTCCAATTGCATTCAACTGGGTGGAAGCCAACGCTTGGTCTTCAGTTTAG 2099
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2040 TCCTTCTTGAGTCCAATTGCATTCAACTGGGTCGAAGCCAATGCTTGGTCTTCAGTTTAG 2099
Query 2100 TTACTTGCTGCTAGTAATAATCTCTTCCATGATTCCCACAT--CTCTTA-AAA-GTTATG 2155
|||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||||
Sbjct 2100 TTAC---CTGCTAGTAACAATCTCTTCCATAATTCCCATATATCTCTTATAAAAGTTATG 2156
Query 2156 TTTTCACGATATCTACAGAAACTGTTGTAAGCTCTTCATAATAAATTAAAAGGGG-TATG 2214
||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||
Sbjct 2157 TTTCCACAATATCTACAGAAACTGTTGTAAGCTCGTCATAATAAA--A---GGGTATATA 2211
Query 2215 TGATATGTATCCAGGGTTTATTCTTTACTCAAACTGGTCCAAACAAAAAGGTTTGGTGAT 2274
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 2212 TGATATGTATCCAGGGTTTATTCTTTACTTAAACTGGTCCAAACAAAAATGTTTGGTAAT 2271
Query 2275 CATTTTCAAATTCTTATAAACAATTGTTGTTAT---GATTCTTAATTGGTATATGAGTTG 2331
|||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||
Sbjct 2272 AATTT-CAAATTCTTATAAT-AATTGTTATTATTATGATTCTTGATTGGT-T-TGAGTTG 2327
Query 2332 TGGATAAATT 2341
||||||||||
Sbjct 2328 TGGATAAATT 2337
> AT1G06310.1 | Symbols: ACX6 | acyl-CoA oxidase 6 | chr1:1926791-1930258
FORWARD LENGTH=2070
Length=2070
Score = 2591 bits (1403), Expect = 0.0
Identities = 1862/2083 (89%), Gaps = 33/2083 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 61 AATCCCTAGAAATGTCGGATAATCG-CGCACTCCGGCGAGCTCATGTTCTCGCCAACCAC 119
|||||||||||||||| || ||| | | |||||||||||| ||| ||||||| || |||
Sbjct 1 AATCCCTAGAAATGTCCGAAAAT-GTTGAACTCCGGCGAGCCCATATTCTCGCTAATCAC 59
Query 120 ATACTCCAATCAACTCCTCCGTCATCGAACCTCTCCCTGACG-CGCGAGGTATGTTTGCA 178
||||||| ||| ||| || || || |||| |||||| ||| || || |||||||| ||
Sbjct 60 ATACTCCGTTCACCTCGGCCTTCTTCAAACCCCTCCCTCACGCCG-GAAGTATGTTTTCA 118
Query 179 GTACTCCCCACCGGAGCTCAACGAGAGCTATGGATTCGATGTCAAGGAGATGAGAAAATT 238
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 119 GTACTCTCCACCGGAGCTCAACGAGAGCTATGGATTCGAAGTCAAGGAGATGAGAAAACT 178
Query 239 ACTCGACGGACACAACCTCGTGGATCGGGACTGGATTTATGGACTCATGATGCAGAGCAA 298
|||||||||||||||| | | ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 179 ACTCGACGGACACAACTTAGAGGAAAGAGACTGGCTTTATGGGCTCATGATGCAGAGCAA 238
Query 299 TCTGTTTAATCGC-AAGGAGAGAGGAGGTAAGATTTTCGTGTCGCCGGATTATAATCAGA 357
||||||||| | | || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |
Sbjct 239 TCTGTTTAA-CCCGAAACAGAGAGGAGGTCAGATTTTCGTCTCGCCCGATTACAATCAAA 297
Query 358 CGATGGAGCAGCAGCGTGAGATCACTATGAAGCGGATCTGGTACTTGCTCGAGCATGGGG 417
| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||
Sbjct 298 CAATGGAGCAACAGCGCCAGATCAGTATGAAGCGGATCTTTTACTTGCTCGAAAAAGGGG 357
Query 418 T-TTTCAAAGGATGGTTGACGGAGACAGGTCCTGAGGCCGAGCTCAGGAAATTAGCTCTG 476
| |||| |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||
Sbjct 358 TCTTTC-AAGGATGGCTAACGGAGACAGGTCCTGAAGCTGAGCTCAAGAAGTTTGCTCT- 415
Query 477 CT-TGAGGTTTGCGGGATTTATGATCACTCCGTCTCCATCAAAGTTGGTGTTCATTTCTT 535
|| || |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||| |||||
Sbjct 416 CTACGAAGTTTGCGGGATTTATGATTACTCCCTCTCCGCCAAACTCGGTGTTCACTTCTT 475
Query 536 CCTGTGGGGTAATGCTGTAAAGTTCTTTGGAACAAAGCGTCACCATGAAAAGTGGCTG-A 594
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 476 GTTGTGGGGTAATGCTGTTAAGTTCTTTGGGACAAAGCGTCACCATGAAAAGTGGCTGAA 535
Query 595 AGAACACCGAAGATTATGTTGTCAAGGGCTGTTTTGCAATGACTGAGCTAGGCCATGGAA 654
|| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 AG-ACACTGAAGATTATGTTGTCAAGGGCTGCTTTGCAATGACTGAGCTAGGCCATGGAA 594
Query 655 GTAATGTACGGGGAATTGAAACAGTGACAACTTATGACCCAACAACTGAGGAGTTTGTGA 714
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 595 CTAATGTACGGGGAATTGAAACAGTGACTACTTATGACCCAACAACTGAAGAGTTTGTGA 654
Query 715 TAAATACTCCTTGTGAATCTGCTCAGAAGTATTGGATCGGTGGGGCAGCTAATCATGC-A 773
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
Sbjct 655 TAAATACTCCTTGTGAATCTGCTCAGAAGTATTGGATCGGTGAGGCAGCTAACCATGCAA 714
Query 774 ACACACACCATTGTGTTTTCACAGCTTCA-AATTAACGGAACCAACCAGGGGGTCCATGC 832
|| || | |||||| |||| |||||| | || || || |||||||||||| | ||||
Sbjct 715 AC-CATGCAATTGTGATTTCTCAGCTT-AGTATGAATGGGACCAACCAGGGGATTCATGT 772
Query 833 CTTTATCGCCCAAATCAGGGATGAAGATGGCAACATATGTCCAAACATCCGCATTGCTGA 892
|||||| || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||
Sbjct 773 CTTTATTGCTCAAATCAGAGATCATGATGGCAACACATGTCCTAACGTCCGCATAGCTGA 832
Query 893 CTGTGGACACAAAATTGGTCTAAATGGTGTTGACAATGGCCGGATCTGGTTTGATAATCT 952
||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||
Sbjct 833 CTGTGGACACAAAATTGGTTTGAATGGTGTTGACAATGGCCGTATATGGTTTGACAATCT 892
Query 953 TCGAATTCCAAGAGAGAATTTGTTGAACGCAGTTGCTGATG-TTTCGTCTGATGGGAAGT 1011
||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||
Sbjct 893 TCGAATTCCAAGAGAGAATTTATTGAACTCAGTTGCTGATGTTTTAG-CTGATGGGAAGT 951
Query 1012 ATGTTAGCTCAATTAAAGATCCTGATCAGAGATTTGGAGCATTCATGGCCCCTTTGACTT 1071
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 952 ATGTTAGCTCAATTAAAGATCCTGATCAGAGATTTGGAGCATTCTTGGCCCCTTTGACAT 1011
Query 1072 CTGGCCGAGTCACAATTGCATCAAGTGCAATTTATTCTGCAAAGGTCGGATTAGCTATTG 1131
|||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1012 CTGGTCGTGTCACAATTGCTTCAAGTGCAATTTATTCTGCAAAGCTCGGATTAGCTGTTG 1071
Query 1132 CTATAAGGTACTCATTATCGAGAAGAGCCTTCTCTGTTACAGCTAATGGTCCTGAAGTCC 1191
|||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |
Sbjct 1072 CTATTAGATACTCACTATCGAGAAGAGCCTTCTCAGTTGCAGCCAATGGTCCTGAAGTTC 1131
Query 1192 TCCTCCTTGATTACCCAAGCCATCAAAGGCGACTGCTACCACTCCTAGCAAAGACATATG 1251
|||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1132 TCCTTCTTGATTATCCAAGCCATCAAAGACGACTTTTACCACTCCTAGCAAAGACATATG 1191
Query 1252 CTATGAGTTTTGCTGCAAATGAATTGAAGATGATTTACGTAAAGAGAACACCGGAGACCA 1311
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||
Sbjct 1192 CTATGAGTTTTGCTGTAAATGACTTGAAGATGATTTACGTGAAGAGGACACCTGAGACCA 1251
Query 1312 ACAAAGCCATCCACGTTGTTTCAAGTGGGTTCAAAGCTGTTCTCACCTGGCACAATATGC 1371
||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1252 ACAAAGCCATCCATGTCGTTTCAAGTGGATTCAAAGCTGTTCTCACTTGGCACAATATGC 1311
Query 1372 -ACACACTTCAGGAATGTCGTGAAGCTGTAGGAGGGCAAGGTGTGAAAACAGAAAATCTA 1430
| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| | |
Sbjct 1312 GA-ACGCTTCAGGAATGTCGTGAAGCTGTTGGAGGCCAAGGTTTGAAAACAGAAAACCGA 1370
Query 1431 GTTGGTCAGTTGAAAGGTGAATTTGATGTGCAGACTACATTTGAGGGTGACAATAATGTA 1490
|| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1371 GTAGGTCATTTAAAAGGAGAATATGATGTGCAGACTACATTTGAGGGTGACAATAATGTA 1430
Query 1491 TTGATGCAGCAGGTGAGCAAGGCCCTTTTTGCTGAATACGTATCGTGTAAGAAGAGAAAT 1550
| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1431 CTCATGCAGCTGGTGAGCAAGGCACTTTTTGCTGAATATGTATCGTGTAAGAAGAGAAAT 1490
Query 1551 AAACCTTTCAAAGGATTAGGATTGGAGCACCTGAACAGTCCACGTCCTGTATTGCCGACT 1610
||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1491 AAACCTTTCAAAGGATTGGGATTGGAGCACATGAACAGTCCACGTCCTGTATTGCCGACT 1550
Query 1611 CAACTCACATCGTCTACCCTCAGATGCAGCCAGTTCCAGACAAA-TGTGTTCTGCTTAAG 1669
||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||
Sbjct 1551 CAACTCACATCATCTACACTAAGATGCAGCCAGTTCCAGA-AAAGTGTGTTTTGCTTAAG 1609
Query 1670 AGAGCGAGATCTTCTGGAACGATTTACTTCTGAAGTTGCACAGCTTCAAGGTAGAGGAGA 1729
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 1610 AGAGCGAGATCTTCTAGAACGGTTTACTTCTGAAGTTGCAGAGCTTCAAGGGAGAGGAGA 1669
Query 1730 AAGTC-GAGAGTTCTCT-TTCCTCCTGAGTCATCAACTTGCTGAAGACTTAGGTAAAGCT 1787
||| | ||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1670 AAG-CAGAGAGTTCT-TATTCCTTTTGAATCATCAACTTTCTGAAGACTTAAGTAAAGCT 1727
Query 1788 TTCACAGAGAAGGCAATACTGCAAACCATTTTGGATGCTGAAGCCAAACTACCTGCTGGC 1847
|||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| |||||
Sbjct 1728 TTCACAGAAAAAGCAATACTGCAAACCGTTTTGGATGCTGAGGCCAAATTGCCTCCTGGC 1787
Query 1848 TCAGTAAAGGATGTGTTGGGTCTTGTAAGATCAATGTACGCATTGATCAGCTTGGAAGAA 1907
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1788 TCAGTTAAGGATGTGTTGGGTCTTGTAAGATCAATGTACGCATTGATCAGCTTGGAAGAA 1847
Query 1908 GATCCGTCGTTGCTGCGGTATGGTTACCTTTCTCA-GG-ATAATGTTGGAGATGTGAGGA 1965
||||| ||| |||| | |||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 GATCCATCGCTGCTAAGATATGGTCACCT--CTCAAGGGATAATGTTGGAGATGTGAGGA 1905
Query 1966 GGGAAGTTTCAAAGCTCTGTGGAGAGCTGAGACCTCACGCGCTTGCACTCGTCACTTCAT 2025
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 1906 AAGAAGTTTCAAAGCTCTGTGGAGAGCTTAGACCTCACGCACTTGCACTCGTGGCTTCAT 1965
Query 2026 TCGGCATTCCAGACTCCTTCTTGAGTCCAATTGCATTCAACTGGGTGGAAGCCAACGCTT 2085
|||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1966 TCGGGATTCCAGACGCCTTCTTGAGTCCAATTGCATTCAACTGGGTCGAAGCCAACGCTT 2025
Query 2086 GGTCTTCAGTTTAGTTACTTGCTGCTAGTAATAATCTCTTCCA 2128
|||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2026 GGTCTTCACTTTAGTTACTTGCT---AGTAATAATCTCTTCCA 2065
> AT3G06690.1 | Symbols: | acyl-CoA oxidases;oxidoreductases,
acting on the CH-CH group of donors;FAD binding;oxidoreductases;acyl-CoA
oxidases | chr3:2115426-2116825 REVERSE LENGTH=727
Length=727
Score = 977 bits (529), Expect = 0.0
Identities = 639/690 (93%), Gaps = 16/690 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1580 CCTGAACAGTCCACGTCCTGTATTGCCGACTCAACTCACATCGTCTACCCTCAGATGCAG 1639
|||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 46 CCTG-ATAGTCCACGTCCTGTATTACCGACTCAACTCACATCATCAACCCTCAGATGCAG 104
Query 1640 CCAGTTCCAGACAAATGTGTTCTGCTTAAGAGAGCGAGATCTTCTGGAACGATTTACTTC 1699
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 105 CCAATTCCAGACAAATGTGTTCTGCTTAAGAGAGCGAGATCTTCTAGAGCGATTTACTTC 164
Query 1700 TGAAGTTGCACAGCTTCAAGGTAGAGGAGAAAGTCGAGAGTTCTCTTTCCTCCTGAGTCA 1759
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 165 TGAAGTTGCACAGCTTCAAGGGAGAGGAGAAAGTCGAGAATTCTCTTTCCTCCTGAGTCA 224
Query 1760 TCAACTTGCTGAAGACTTAGGTAAAGCTTTCACAGAGAAGGCAATACTGCAAACCATTTT 1819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||
Sbjct 225 TCAACTTGCTGAAGACTTAGGTAAAGCTTTCACAGAGAAAGCAATGCTTCAAACCATTTT 284
Query 1820 GGATGCTGAAGCCAAACTACCTGCTGGCTCAGTAAAGGATGTGTTGGGTCTTGTAAGATC 1879
||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 GGATGCTGAGGCAAAACTACCTACTGGCTCAGTAAAGGATGTGTTGGGTCTTGTAAGATC 344
Query 1880 AATGTACGCATTGATCAGCTTGGAAGAAGATCCGTCGTTGCTGCGGTATGGTTACCTTTC 1939
||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 345 AATGTACGCATTGATCAGCCTGGAAGAAGATCCATCGTTGCTGCGATATGGTTACCTATC 404
Query 1940 TCAGGATAATGTTGGAGATGTGAGGAGGGAAGTTTCAAAGCTCTGTGGAGAGCTGAGACC 1999
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 405 TCAGGATAATGTTGGAGATGTGAGGAGAGAAGTTTCAAAGCTCTGTGGAGAGCTTAGACC 464
Query 2000 TCACGCGCTTGCACTCGTCACTTCATTCGGCATTCCAGACTCCTTCTTGAGTCCAATTGC 2059
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 465 ACACGCGCTTGCACTCGTCACTTCATTCGGCATTCCAGACTCCTTCTTGAGTCCAATTGC 524
Query 2060 ATTCAACTGGGTGGAAGCCAACGCTTGGTCTTCAGTTTAGTTACTTGCTGCTAGTAATAA 2119
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 525 ATTCAACTGGGTCGAAGCCAATACTTGGTCTTCAGTTTAGTTAC---CTGCTAGTAACAA 581
Query 2120 TCTCTTCCATGATTCCCACAT--CTCTTA-AAA-GTTATGTTTTCACGATATCTACAGAA 2175
|||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||
Sbjct 582 TCTCTTCCATAATTCCCATATATCTCTTATAAAAGTTATGTTTCCACAA-ATCTACAGAA 640
Query 2176 ACTGTTGTAAGCTCTTCATAATAAATTAAAAGGGG-TATGTGATATGTATCCAGGGTTTA 2234
||||||||| |||| |||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 641 ACTGTTGTATGCTCGTCATAATAAA--A---GGGTATATATGATATGTATCCAGGGTTTA 695
Query 2235 TTCTTTACTCAAA-CTGGTCCAAACAAAAA 2263
||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 696 TTCTTTACTTAAAACTGGTCCAAACAAAAA 725
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 117419074755
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5