BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg470695
Length=3518
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G06720.1 | Symbols: | P-loop containing nucleoside triphosp... 5483 0.0
> AT1G06720.1 | Symbols: | P-loop containing nucleoside triphosphate
hydrolases superfamily protein | chr1:2060444-2067323
REVERSE LENGTH=3657
Length=3657
Score = 5483 bits (2969), Expect = 0.0
Identities = 3355/3539 (95%), Gaps = 36/3539 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCATCGTTTAGAGCTCACTGCAAGCCATGGCCGCCGACGAACTGATGCCGTCTCACAGG 60
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16 TTCATCGTTTAGAGCTCACTTCAAGCCATGGCCGCCGACGAACTGATGCCGTCTCACAGG 75
Query 61 TCACACAGGACTCCCAAATCAGGTCCTACCGCGAGGAAGAAATCTGAACAAGATAAGAAG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 76 TCACACAGGACTCCCAAATCAGGTCCTACCGCGAGGAAGAAATCTGAACTAGATAAGAAG 135
Query 121 AAGCGTGGAATCACGGTTAACAAGAC-GCCAAACTTTAAGGCGTTTGGTGTTAAATCGGC 179
|||||||||||| | ||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 136 AAGCGTGGAATCTCCGTTGACAAG-CAGAAAAACCTTAAGGCGTTTGGTGTTAAATCGG- 193
Query 180 TCG--CAGGGCGCAGCGATCAAAATC-TCGCGCTGCGGAGAAGGATCAAAAACGACTTCA 236
| | || ||| || | ||||| | || ||||||||||||||| ||||| || |||||
Sbjct 194 TTGTTCA-TGCGAAGAAAGCAAAA-CATCACGCTGCGGAGAAGGAGCAAAAGCGGCTTCA 251
Query 237 TCTTCCGAAAATTGATCG-AACTTATGGCGAAGCTCCTCCTTTCGTCGTCGTGGTTCAAG 295
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252 TCTTCCGAAAATTGATCGTAA-TTATGGCGAAGCTCCTCCTTTCGTCGTCGTGGTTCAAG 310
Query 296 GCCCCCCAGGAGTTGGAAAGTCTCTCGTTATTAAGTCTCTTGTGAAGGATTTTACAAAAC 355
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 311 GCCCCCCAGGAGTTGGAAAGTCTCTCGTGATTAAATCTCTTGTGAAGGAATTTACAAAAC 370
Query 356 AGAATGTACCGGAGGTTCGAGGACCTATTACCATTGTACAAGGTAAACATACAAGGTTTC 415
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 371 AGAATGTACCCGAGGTTCGAGGACCTATTACCATTGTACAAGGTAAACAGAGAAGGTTTC 430
Query 416 AATTTGTGGAGTGCCCGAATGATGTCAATGCCATGGTAGATTGTGCAAAGGTTGCTGATC 475
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 431 AATTTGTGGAGTGCCCGAATGATATCAATGCGATGGTGGATTGTGCAAAGGTTGCTGATC 490
Query 476 TAGCCCTACTTGTTGTAGACGGGAGTTATGGTTTTGAGATGGAAACCTTTGAATTCCTCA 535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491 TAGCCCTACTTGTTGTAGACGGGAGTTATGGTTTTGAGATGGAAACCTTTGAATTCCTCA 550
Query 536 ATATTATGCAAGTGCATGGATTTCCTAGAGTTATGGGTGTCCTCACTCACCTTGATAAGT 595
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 551 ATATTATGCAAGTGCATGGATTTCCTAGAGTTATGGGTGTTCTCACTCACCTTGATAAGT 610
Query 596 TCAACAATGTAAAGAAGCTGAGGAAAACTAAACAACATCTCAAGCATCGGTTTTGGACCG 655
|||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 611 TCAATGATGTTAAGAAGCTGAGAAAAACAAAACATCATCTCAAGCATCGGTTTTGGACTG 670
Query 656 AAATATAT-AGTGGAGCTAAATTGTTCTATTTATCTGGTCTCATTCATGGGAAGTATTCG 714
|||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 671 AAATATATCA-TGGAGCTAAATTGTTTTATTTATCTGGTCTCATTCATGGGAAGTATACG 729
Query 715 CCGCGTGAAGTTCACAACCTCGCCCGCTTTGT-ATCCATTATCACA-CCTCAGCCTTTGA 772
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||||
Sbjct 730 CCGCGTGAAGTTCACAACCTCGCCCGCTTTGTAAT-TGTTATCA-AGCCTCAGCCATTGA 787
Query 773 CATGGCGAACATCACATCCTTATGTGTTGGCTGATCGCCTTGAAGATGTTACCCCTCCAG 832
||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 788 CATGGCGAACAGCACATCCTTATGTGTTGGTTGATCGCCTTGAAGATGTTACCCCTCCGG 847
Query 833 AGAAAGTTCAGATGGATAAGAAATGTGATAGAAATATCACTTTGTATGGTTACCTACGTG 892
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 848 AGAAAGTTCAGATGGATAAGAAATGCGATAGAAATATCACTGTGTTTGGTTACCTACGTG 907
Query 893 GCTGTAACTTCAAAAAAGGGATGAAGGTTCATATTGCTGGAGTTGGCGACTACAGTGTAG 952
| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||
Sbjct 908 GTTGTAACTTCAAAAAAAGGATGAAGGTTCATATTGCTGGAGTTGGTGACTTCATTGTAG 967
Query 953 CTGGGGTGACTGCTTTACCTGATCCTTGTCCTTTACCTTCAGCTGGCAAGAGAAAAGGGC 1012
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 968 CTGGGGTGACTGCTTTAACTGATCCTTGTCCTTTACCTTCAGCTGGCAAGAAAAAAGGGC 1027
Query 1013 TGAGGGACAGGGATAAGCTTTTCTATGCTCCTATGTCCGGGATTGGAGATCTTTTATATG 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 1028 TGAGGGACAGGGATAAGCTTTTCTATGCTCCTATGTCCGGGATTGGAGATCTTGTGTATG 1087
Query 1073 ACAAAGATGCTGTTTACATCAACATAAATGA-TCACCAAGTTCAGTACTCTAAAACTGAC 1131
||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088 ACAAAGATGCTGTTTACATCAACATAAAT-AGTCACCAAGTTCAGTACTCTAAAACTGAC 1146
Query 1132 GATGGAAAGGGAGAACCTACTAATAAAGGAAAGGGCAGAGATGTTGGTGAAGATTTGGTA 1191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1147 GATGGAAAGGGAGAACCTACTAATAAAGGAAAGGGCAGAGATGTTGGTGAAGATTTGGTA 1206
Query 1192 AAGTCGTTGCAGAACACAAAGTATTCTGTTGATGAGAAACTGGATAAGACATTCATTAAC 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1207 AAGTCGTTGCAGAACACAAAGTATTCTGTTGATGAGAAACTAGATAAGACATTCATTAAC 1266
Query 1252 ATTTTTGGCAAAAAGACTAGTGCCAGTTCAGAAACAAAACTTAAGGCTGAAGATGCGTAT 1311
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267 TTTTTTGGCAAAAAGACTAGTGCCAGTTCAGAAACAAAACTTAAGGCTGAAGATGCGTAT 1326
Query 1312 CAATCCTTACCGGAAGGTTCTGACAGTGAGTCTCAATCTGGCGATGATGAGGAGGATGTA 1371
|| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1327 CACTCTTTGCCGGAAGGTTCTGACAGTGAGTCTCAATCTGGCGATGATGAGGAGGATATA 1386
Query 1372 GTAGGTAATGACAGTGAAATCAAGCAGGAAACTGAGATTCATGGTGGAAGGTTGAGGAGG 1431
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1387 GTAGGTAATGAAAGTGAAATGAAGCAGGAAACTGAGATTCATGGTGGAAGGTTGAGGAGG 1446
Query 1432 AAAGCTATCTTC-AGGCAGGACTTAAATGAAGATGATTTTGAGGAAGCAGATGATGTTGA 1490
|||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 1447 AAAGCTATCTTCAAGAC-GGACTTGAATGAAGATGATTTTGAGGAAGCAGACGATCTTGA 1505
Query 1491 ATTGGACTCATATGACCCAAATATATATGGTTTTAAGGAAGCAGACGATGTTGAATCGGA 1550
|||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 1506 ATTGGATTCATATGACCCAGATACATATGATTTTGAGGAAGCAGACGATGCTGAATCAGA 1565
Query 1551 CAAAAATGAAGTTGAAGATGGTGGAGATGACTCTGCTTCCGATTC-GCCAGATGATGAGG 1609
| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||
Sbjct 1566 CGATAATGAAGTTGAAGATGGTGGAGATGACTCTGCTTCCGATTCAGCC-GATGGTGAAC 1624
Query 1610 CAGGGGATTATCAGATAGATGATAAGGACTTTGGTAACATATCAAAATGGAAAGCACCCT 1669
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1625 CAGGGGATTATCAGATAGATGATAAGGACTCTGGTAACATATCACAATGGAAAGCACCCT 1684
Query 1670 TGAAGGAGAAAGCCAGAAAGAAGAACCCCAACTTGATGCAGATTGTGTATGGAGCATCGG 1729
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1685 TGAAGGAGATAGCCAGAAAGAAGAACCCCAACTTGATGCAAATTGTGTATGGAGCATC-- 1742
Query 1730 GATCATCAGCTACTCCCTTGATAAATGAGAACCATGACATTAGTGATGATGAAGAAAGTG 1789
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1743 -ATCATTAGCTACTCCCTTGATAAATGAGAACCATGACATTAGTGATGATGACGAAAGTG 1801
Query 1790 ATGATGAAGACTTCTTTAAGCCAAAAGGAGAACAA-AGCAAGAATCTGGGTGGTGAATGG 1848
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| || |
Sbjct 1802 ATGATGAAGACTTCTTTAAGCCAAAAGGAGAACAACA-CAAGAATTTAGGTGGTGGATTG 1860
Query 1849 GATGTGGGATATGTCAACTCAGAGGATTGTTCTAAATTTGTGAATTATGGTTACCTAAAG 1908
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1861 GATGTGGGATATGTCAACTCAGAGGATTGTTCTAAATTTGTGAATTATGGATACCTAAAG 1920
Query 1909 AATTGGAAAGAGAAAGAAGTCTGTGAGAGCATTCGTGATCGATTTACCACTGGTGATTGG 1968
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 AATTGGAAAGAGAAAGAAGTATGTGAGAGCATTCGTGATCGATTTACCACTGGTGATTGG 1980
Query 1969 TCAAAAGCTGCTCTGAGAGACAAAAATTTAGGTACTGGCGGTGAGGGAGAAGATGATGAA 2028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 TCAAAAGCTGCTCTGAGAGACAAAAATTTAGGTACTGGCGGTGAGGGAGAAGATGATGAA 2040
Query 2029 CTTTATGGTGATTTTGAGGATCTAGAGACGGGAGAGAAGCATAAAAGCCATGTTAACATG 2088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||
Sbjct 2041 CTTTATGGTGATTTTGAGGATCTAGAGACGGGAGAGAAGCACAAAAGCCATGAGAACTTG 2100
Query 2089 GAATCGGGTGCAAATGAAAATGAAGATGAAGATGCAGAAGTCGTTGAGCGTGATGGGAAC 2148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 GAATCGGGTGCAAATGAAAATGAAGATGAAGATGCAGAAGTCGTTGAGCGTGATGGGAAC 2160
Query 2149 AATCCTCGTAGTCAAGCCAATGAACCAGGATACGTTGATAAATTGAAGGAAGAGCTTGAA 2208
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||
Sbjct 2161 AATCCTCGTAGTCAAGCCGATGAACCAGGATACGCTGATAAATTGAAGGAAGCGCAGGAA 2220
Query 2209 ATTATAAAACAGAGGAATGAGTTAGAATACAATGATCTTGACGAGGAAACTCGAATTGAG 2268
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 ATTACAAAACAGAGGAATGAGTTAGAATACAATGATCTTGACGAGGAAACTCGAATTGAG 2280
Query 2269 TTAGCGGGATTCCGGACTGGAACATACTTGAGGCTGGAAATTCACAATGTTCCTTATGAG 2328
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2281 TTAGCAGGATTCCGGACTGGAACATACTTGAGGCTGGAGATTCACAATGTTCCTTATGAG 2340
Query 2329 ATGGTTGAATTCTTTGATCCTTGTCATCCAATTCTGGTTGGAGGTATTGGTTTCGGCGAG 2388
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2341 ATGGTTGAATTCTTTGATCCTTGTCATCCAATTCTAGTTGGAGGTATTGGTTTCGGCGAG 2400
Query 2389 GACAATGTTGGATATATGCAGGCCCGGTTGAAGAGACATAGGTGGCATAAGAAAGTACTA 2448
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401 GACAATGTTGGATATATGCAGGCCCGGTTGAAGAAACATAGGTGGCATAAGAAAGTACTA 2460
Query 2449 AAGACAAGAGATCCTATTATTGTGTCTATCGGATGGAGACGCTATCAAACAATGCCTGTA 2508
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||
Sbjct 2461 AAGACAAGAGATCCTATTATTGTGTCTATTGGATGGAGACGCTATCAGACTATTCCTGTA 2520
Query 2509 TATGCCATTGAAGATCGCAATGGCAGGCATCGAATGCTCAAGTATACTCCAGAACACATG 2568
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2521 TTTGCCATTGAAGATCGCAATGGCAGGCATCGAATGCTCAAGTATACTCCAGAACACATG 2580
Query 2569 CACTGCCTTGCTACGTTCTGGGGTCCTCTTGTCCCACCCAACACCGGCTTTGTCGCTTTC 2628
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2581 CACTGCCTTGCTTCGTTCTGGGGTCCTCTTGTCCCACCCAACACTGGCTTTGTCGCTTTC 2640
Query 2629 CAGAACCTGTCAAACAATCAGGCAGGATTTAGGATAACAGCGACATCTGTAGTTCTTGAG 2688
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 2641 CAGAACCTGTCAAACAATCAGGCAGGATTTAGGATAACAGCGACTTCTGTAGTTCTGGAG 2700
Query 2689 TTTAATCACCAGGCCCGTATTGTAAAGAAAATCAAGATGGTTGGGACTCCCTGCAAGATC 2748
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2701 TTTAATCACCAGGCCCGTATTGTAAAGAAAATCAAGCTGGTTGGGACTCCGTGCAAGATC 2760
Query 2749 AAGAAAAAGACTGCATTTATCAAAGACATGTTCACTTCTGACCTAGAAATAGCTCGATTT 2808
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2761 AAGAAAAAGACTGCATTTATCAAAGACATGTTCACTTCTGACCTTGAAATAGCTCGATTT 2820
Query 2809 GAAGGTTCATCTGTCCGAACAGTTAGTGGCATTAGAGGACAAGTTAAAAAGGCTGGAAAA 2868
|||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2821 GAAGGTTCATCTGTTCGGACAGTTAGTGGCATTAGAGGACAAGTAAAAAAGGCTGGAAAA 2880
Query 2869 AACATGCTTGATAACAAGGCTGAAGAAGGGATTGCGAGGTGTACCTTTGAAGATCAAATC 2928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2881 AACATGCTTGATAACAAGGCTGAAGAAGGGATTGCGAGGTGTACCTTTGAAGATCAAATC 2940
Query 2929 CATATGAGCGACATGGTCTTCTTAAGGGCTTGGACTACAGTGGAAGTTCCACAATTTTAC 2988
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2941 CATATGAGCGACATGGTATTCTTAAGGGCTTGGACTACAGTGGAAGTTCCACAATTTTAC 3000
Query 2989 AATCCTCTAACGACAGCCTTGCAACCCCGTGATAAGACCTGGAATGGGATGAAAACCTTT 3048
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3001 AATCCTCTAACGACAGCCTTGCAACCCCGCGATAAGACCTGGAATGGGATGAAAACTTTT 3060
Query 3049 GGCGAACTCCGTAGAGAGCTGAATATTCCTGTTCCAGTGAATAAGGATTCACTCTACAAG 3108
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3061 GGCGAACTCCGTAGAGAGCTGAATATTCCTATTCCAGTGAATAAGGATTCACTCTACAAG 3120
Query 3109 CCAATTGAAAGAAAGCCAAAGAAGCTCTATCCACTAAAGATTCCAAAGAGTCTACAAAAA 3168
|||| |||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 3121 GCAATCGAAAGAAAGCAAAAGAAGTTCAATCCACTACAGATTCCAAAGCGTCTAGAAAAA 3180
Query 3169 GATTTACCGTTTACATCGAAACCCAAAGATATACCAAAGCGGAAAAGACCATCACTAGAT 3228
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3181 GATTTACCGTTTATGTCGAAACCCAAAAATATACCAAAGCGGAAAAGACCATCACTAGAG 3240
Query 3229 GATAAAAGAGCAGTTATAATGGAACCTAAAGAAAGAAAAGAGCATTCTATCATCCAGCAA 3288
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3241 GATAAAAGAGCAGTTATAATGGAACCGAAAGAAAGAAAAGAGCATACTATCATCCAGCAA 3300
Query 3289 TTCCAGCTGCTGCAACATCACAGGATgaagaagaaaaaggcaacggatcagaagaagagg 3348
||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3301 TTCCAGCTGCTTCAACATCACACGATGAAGAAGAAAAAGGCAACGGATCAGAAGAAGAGG 3360
Query 3349 aaagagtatgaagcagagaaagctaagaaTGAGGAAATAAATAAGAAACGGAGGAGAGAG 3408
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3361 AAAGAGTATGAAGCAGAGAAAGCTAAGAATGAGGAAATAAATAAGAAACGTAGGAGAGAA 3420
Query 3409 GAGAGACGTGACAGATATCGTGAGGAAGATAAACaaaaaaaGAAGACGAGAAGAAGCCAA 3468
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3421 GAGAGACGGGACAGATATCGTGAGGAAGATAAACAGAAAAAGAAGACGAGAAGAAGCCTT 3480
Query 3469 GATTAATG-A--A-TACGTTATTTCAACT---GTG-A-TACTAAAAGTTTTGTTTTCAT 3518
||||||| | | ||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 3481 GATTAATTTATTAATACCTTATTTCAACTTTTGTGTAATACTAAAAGTTTTGTTTTCAT 3539
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 175132798013
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5