BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg470794
Length=3235
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G07670.1 | Symbols: ATECA4, ECA4 | endomembrane-type CA-ATPa... 5184 0.0
AT1G07810.1 | Symbols: ECA1, ATECA1, ACA3 | ER-type Ca2+-ATPase... 4929 0.0
> AT1G07670.1 | Symbols: ATECA4, ECA4 | endomembrane-type CA-ATPase
4 | chr1:2370052-2374545 REVERSE LENGTH=3538
Length=3538
Score = 5184 bits (2807), Expect = 0.0
Identities = 3107/3252 (96%), Gaps = 19/3252 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGGAAAGGAGGTGAAGATTGCGGGAATAAGCAAACGAATAGTTCTG-A----T--A- 52
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |
Sbjct 100 ATGGGGAAAGGAGGTGAAGATTGCGGGAATAAGCAAACTAATAGTTCTGAATTGGTCAAG 159
Query 53 -C-G-----TTTGCTGCTTGGGCTAAAGATGTTG-CGGAATGTGAGGAGAAGTTTGGTGT 104
| | ||| ||||||||| |||||||| || ||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 160 TCTGATACTTTTCCTGCTTGGGGTAAAGATG-TGTCGGAATGCGAAGAGAAGTTTGGTGT 218
Query 105 TAGTCGTGAGAAAGGGTTGGGTACTGATGAGGTGTTGAAGCGGCATCAGATCTATGGTTT 164
||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 219 TAGTCGTGAGAAAGGTTTGAGCACTGATGAGGTGTTGAAACGGCATCAGATCTATGGTTT 278
Query 165 GAATGAGTTAGAAAAGCCCGAGGGAACTTCTATCTTTAAGTTGATTTTGGAGCAGTTTAA 224
|||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 279 GAATGAATTAGAGAAGCCTGAGGGTACTTCTATTTTTAAGCTGATTTTGGAACAGTTTAA 338
Query 225 TGATACATTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCTGTTATTTCCTTTGTCTTGGCCTTCTT 284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 339 TGATACATTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCTGTTATTTCCTTTGTCTTAGCCTTCTT 398
Query 285 TGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATTTT 344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 399 TGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATTTT 458
Query 345 TCTCATCTTGATTGTTAATGCCATTGTTGGGATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAGGC 404
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 459 TCTCATCTTGATTGTTAATGCCATTGTTGGCATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAGGC 518
Query 405 ATTGGAAGCTTTGAAGGAGATTCAGTCTCAGCAAGCGACTGTCATGCGTGATGGGACTAA 464
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTTGGAAGCTTTGAAAGAGATTCAGTCTCAGCAAGCTACCGTCATGCGTGATGGGACTAA 578
Query 465 GGTTTCCAGTTTGCCTGCAAAGGAGCTTGTTCCTGGTGACATTGTGGAACTGAGGGTTGG 524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 579 GGTTTCCAGTTTGCCTGCAAAGGAGCTTGTTCCTGGTGATATTGTGGAACTGAGGGTTGG 638
Query 525 TGATAAGGTACCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGCTCAACCCTGAGACTCGA 584
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 639 TGATAAGGTGCCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGTTCAACTTTGAGAGTCGA 698
Query 585 GCAGGGCTCCTTGACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCATGTGGATGA 644
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 699 GCAGGGGTCCTTAACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCACGTGGATGA 758
Query 645 GAATGCCGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTATTTGCAGGAACCACTGTTGTGAATGG 704
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 759 GAATGCTGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTGTTTGCAGGAACCACTGTCGTGAATGG 818
Query 705 GAACTGTATATGCTTAGTTACAGATACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCACTC 764
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 819 GAACTGCATATGTTTAGTTACAGATACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCACTC 878
Query 765 ACAGATCCAGGAAGCTGCACAACACGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAACGA 824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 879 ACAGATCCAGGAAGCTGCACAACACGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAACGA 938
Query 825 GTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGCGCGTTAGTGTGGCTCATCAA 884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 939 GTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGTGCGTTAGTGTGGCTCATCAA 998
Query 885 TGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTCTC 944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 999 TGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTCTC 1058
Query 945 CTTCGAGAAGTGCACATACTACTTTGAGATTGCTGTTGCATTGGCGGTTGCTGCAATTCC 1004
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1059 CTTCGAGAAGTGCACATATTACTTTGAGATTGCTGTTGCACTGGCGGTTGCTGCAATTCC 1118
Query 1005 TGAAGGTCTGCCAGCAGTTATTACCACATGTTTGGCTCTTGGCACTAGGAAGATGGCTCA 1064
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119 AGAAGGTCTGCCAGCAGTTATTACCACATGTTTGGCTCTTGGCACTAGGAAGATGGCTCA 1178
Query 1065 GAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGCTACCCAGTGTGGAGACTCTTGGATGCACCACCGTGAT 1124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179 GAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGCTACCCAGTGTGGAGACTCTTGGATGCACCACCGTGAT 1238
Query 1125 ATGCTCTGACAAAACTGGAACTCTTACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAAGCTTGTTGC 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1239 ATGCTCTGACAAAACTGGAACTCTTACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAAGCTCGTTGC 1298
Query 1185 TATGGGTTCTAGGATTGGAACCCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGATCC 1244
||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1299 TATGGGTTCGAGGATCGGAACTCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGATCC 1358
Query 1245 TCGAGATGGGAAGATTGAAGATTGGCCAACAGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGATGAT 1304
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1359 TCGAGATGGAAAGATTGAAGATTGGCCAACGGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGATGAT 1418
Query 1305 TGCCAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAGTGTTGAGCAATCAGAGCAGCAATTTGT 1364
||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||
Sbjct 1419 TGCAAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAATGTTGAGAAATCTGATCAGCAATTTGT 1478
Query 1365 GTCTAGGGGAATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATTCCC 1424
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1479 GTCTAGGGGCATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATTTCC 1538
Query 1425 CCAAGGATTGAATGAAGCTTCATCCGATGGCGATGTCTTACGTTGTTGTCGGCTGTGGAG 1484
| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1539 CGAAGGATTGAATGAAGCTTCATCCGATGGCAATGTCTTACGTTGTTGTCGGCTATGGAG 1598
Query 1485 TGAACTAGAGCAACGAATTGCCACCCTTGAGTTCGACCGTGACCGGAAATCAATGGGAGT 1544
||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1599 TGAACTAGAACAACGGATTGCCACCCTTGAGTTTGACCGTGACCGGAAATCAATGGGAGT 1658
Query 1545 TATGGTGGATTCGAGCTCAGGAAAGAAGCTGCTACTGGTCAAGGGTGCGGTAGAAAATGT 1604
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1659 TATGGTGGATTCCAGCTCAGGAAAGAAACTGCTACTGGTCAAGGGTGCCGTAGAAAATGT 1718
Query 1605 ATTGGAAAGGAGTACACATATTCAGCTACTTGATGGTTCCATTCGAGAGCTTGACCAATA 1664
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1719 ATTGGAAAGGAGTACCCATATTCAGCTACTTGATGGTTCCACTCGAGAGCTTGACCAATA 1778
Query 1665 CTCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTACATGATATGTCCTTGAGTGCTTTAAGATGTCT 1724
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1779 CTCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTACATGATATGTCCTTGAGTGCATTAAGATGTCT 1838
Query 1725 CGGATTTGCATACTCAGATGTTCCATCAGATTTTGCCACTTATGACGGCAGTGAAGACCA 1784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1839 CGGATTTGCATACTCAGATGTTCCATCAGATTTTGCCACTTATGATGGCAGTGAAGACCA 1898
Query 1785 CCCTGCTCATCAGCAACTTCTCAACCCATCCAATTATTCATCAATTGAGTCCAATCTAGT 1844
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1899 TCCTGCTCATCAGCAACTTCTCAACCCATCCAATTATTCATCAATTGAGTCCAATCTAGT 1958
Query 1845 ATTCGCTGGATTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCAAGGAAAGAGGTGCGTCAAGCCATTGC 1904
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1959 ATTTGTTGGATTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCAAGGAAAGAGGTGCGTCAAGCCATTGC 2018
Query 1905 AGACTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATAGTTATCACCGGAGACAACAAGAGCACAGC 1964
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2019 AGACTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATGGTTATCACCGGAGACAACAAGAGCACAGC 2078
Query 1965 GGAAGCGATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATCTCCTCGAGAAG 2024
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2079 GGAAGCAATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATCTCCTCGAGAAG 2138
Query 2025 CTTGACAGGAAAAGAATTTATGGATGTCCAAGATCAGAAGAATCATCTAAGACAGACTGG 2084
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2139 CTTGACAGGAAAAGAATTTATGGATGTTAAAGATCAGAAGAATCATCTAAGACAGACAGG 2198
Query 2085 AGGGCTCTTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACTTAA 2144
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2199 AGGGCTCCTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACTGAA 2258
Query 2145 AGAAGATGGAGAAGTGGTTGCCATGACTGGAGATGGAGTTAATGATGCTCCTGCTTTGAA 2204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 2259 AGAAGATGGAGAAGTGGTTGCCATGACTGGAGATGGAGTCAATGATGCTCCTGCCCTGAA 2318
Query 2205 GTTGGCTGATATTGGTGTGGCAATGGGCATTTCCGGTACAGAGGTAGCAAAGGAGGCATC 2264
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2319 GTTGGCTGATATTGGTGTGGCTATGGGCATTTCCGGGACAGAGGTAGCAAAGGAGGCATC 2378
Query 2265 TGACATGGTGTTGGCAGATGATAATTTCAGCACTATTGTTGCAGCTGTTGGTGAAGGCAG 2324
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2379 TGACTTGGTGTTGGCAGATGATAATTTCAGCACCATTGTTGCAGCTGTTGGTGAAGGCAG 2438
Query 2325 GTCCATCTATAATAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGGTGA 2384
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2439 GTCCATCTATAACAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGGTGA 2498
Query 2385 GGTTGCATCGATATTCTTGACAGCTGCTCTTGGAATCCCAGAAGGCATGAT-CCCGGTTC 2443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 2499 GGTTGCATCGATATTCTTGACAGCTGCTCTTGGAATCCCAGAAGGCATGATACCCG-TTC 2557
Query 2444 AGCTTCTGTGGGTGAATCTTGTAACAGACGGTCCTCCAGCTACGGCTCTGGGATTCAATC 2503
| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |
Sbjct 2558 AACTTCTGTGGGTGAATCTCGTAACAGATGGTCCTCCAGCTACTGCTTTGGGATTCAACC 2617
Query 2504 CCCCTGACAAGGACATCATGAAGAAGCCTCCTCGTAGGAGTGATGACTCTCTTATCACTG 2563
||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2618 CCCCTGACAAGGATATTATGAAAAAGCCTCCTCGTAGGAGCGATGACTCTCTTATCACTG 2677
Query 2564 CCTGGATTCTCTTCCGCTACATGGTGATTGGTATGTATGTGGGAGTAGCAACGGTGGGAG 2623
| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2678 CGTGGATCCTCTTCCGCTATATGGTGATTGGTTTGTATGTGGGAGTAGCAACGGTGGGAG 2737
Query 2624 TATTCATTATATGGTACACACACAACAGCTTCATGGGCATAGACTTGAGCCAAGACGGTC 2683
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2738 TATTCATCATATGGTACACACACAACAGCTTTATGGGCATAGACCTGAGCCAAGACGGTC 2797
Query 2684 ACAGCCTTGTGAGCTATTCGCAGCTCGCACATTGGGGCCAGTGCTCTTCATGGGAAGGCT 2743
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2798 ACAGCCTTGTGAGCTATTCACAGCTCGCACATTGGGGCCAATGCTCTTCATGGGAAGGCT 2857
Query 2744 TCAAAGTGTCTCCTTTCACGGCAGGCTCTCAGACTTTCTCATTCGACTCAAACCCTTGCG 2803
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2858 TCAAAGTGTCTCCTTTCACAGCAGGCTCTCAGACTTTCTCGTTCGACTCAAACCCTTGCG 2917
Query 2804 ACTATTTCCAGCAGGGGAAAATCAAGGCATCGACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGCCA 2863
||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2918 ACTATTTTCAGCAGGGTAAAATCAAGGCATCCACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGCCA 2977
Query 2864 TTGAAATGTTCAACTCTCTGAATGCACTCTCAGAAGATGGCAGCCTGGTGACGATGCCAC 2923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2978 TTGAAATGTTCAACTCTCTGAATGCACTCTCAGAAGATGGCAGCCTGGTGACGATGCCAC 3037
Query 2924 CATGGGTGAATCCGTGGCTGCTCCTTGCAATGGCGGTCTCATTTGGGCTCCACTTTGTGA 2983
| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3038 CCTGGGTTAACCCGTGGCTGCTCCTGGCAATGGCTGTCTCATTTGGACTCCACTTTGTGA 3097
Query 2984 TATTGTACGTCCCATTCTTGGCTCAAGTGTTTGGTATTGTGCCGCTGAGCTTGAACGAAT 3043
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 3098 TATTGTACGTCCCATTCTTGGCTCAGGTGTTTGGTATTGTGCCACTGAGCTTGAACGAGT 3157
Query 3044 GGCTGCTAGTGCTGGCTGTGTCTCTACCGGTGATTTTGATAGATGAAGTGCTCAAGTTTG 3103
|||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3158 GGCTGCTAGTGCTGGCTGTGTCGCTGCCGGTAATTTTGATAGACGAAGTGCTCAAGTTTG 3217
Query 3104 TAGGAAGGTGCACCAGTGGCTACCGCTACTCACCCCGCACTCGCTCCGCTAAGCAAAAGG 3163
||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 3218 TAGGAAGGTGCACGAGTGGCTACCGCTACTCACCTCGCACTCCCTCAGCTAAGCAAAAGG 3277
Query 3164 AGGAGTAAGAAAATAATTCAAAAGGCATTATTATTAGACTGTTAGTTTTAGCTGAAATTA 3223
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3278 AGGAGTAAGAAAATAATTCAAAAGGCATTATTATTAGACTCTTAGTTTTAGCTGAAATTA 3337
Query 3224 ACTTTGTTGCTT 3235
||||||||||||
Sbjct 3338 ACTTTGTTGCTT 3349
> AT1G07810.1 | Symbols: ECA1, ATECA1, ACA3 | ER-type Ca2+-ATPase
1 | chr1:2416265-2420757 FORWARD LENGTH=3499
Length=3499
Score = 4929 bits (2669), Expect = 0.0
Identities = 3023/3197 (95%), Gaps = 12/3197 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 45 TTCTGATACGTTTGCTGCTTGGGCTAAAGATGTTGCGGAATGTGAGGAGAA-GTTT-GGT 102
||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | |
Sbjct 188 TTCGGATACGTTTCCTGCTTGGGCTAAAGATGTCGCGGAATGTGA--AGAACATTTCGTT 245
Query 103 GTTAGTCGTGAGAAAGGGTTGGGTACTGATGAGGTGTTGAAGCGGCATCAGATCTATGGT 162
||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 246 GTTAGTCGTGAGAAAGGTTTGAGTAGTGATGAGGTGTTGAAGCGGCATCAGATCTATGGT 305
Query 163 TTGAATGAGTTAGAAAAGCCCGAGGGAACTTCTATCTTTAAGTTGATTTTGGAGCAGTTT 222
|||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 306 TTGAATGAGTTAGAGAAGCCTGAGGGTACTTCTATTTTTAAGCTGATTTTGGAGCAGTTT 365
Query 223 AATGATACATTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCTGTTATTTCCTTTGTCTTGGCCTTC 282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366 AATGATACATTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCTGTTATTTCCTTTGTCTTGGCCTTC 425
Query 283 TTTGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATT 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 426 TTTGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACTGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATT 485
Query 343 TTTCTCATCTTGATTGTTAATGCCATTGTTGGGATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAG 402
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 486 TTTCTCATCTTAATTGTTAATGCCATTGTTGGCATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAG 545
Query 403 GCATTGGAAGCTTTGAAGGAGATTCAGTCTCAGCAAGCGACTGTCATGCGTGATGGGACT 462
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 546 GCGTTGGAAGCTTTGAAAGAGATTCAGTCTCAGCAAGCAACTGTCATGCGTGATGGGACT 605
Query 463 AAGGTTTCCAGTTTGCCTGCAAAGGAGCTTGTTCCTGGTGACATTGTGGAACTGAGGGTT 522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 606 AAGGTTTCCAGTTTGCCTGCAAAGGAGCTTGTTCCTGGTGATATTGTGGAACTGAGGGTT 665
Query 523 GGTGATAAGGTACCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGCTCAACCCTGAGACTC 582
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||
Sbjct 666 GGTGATAAGGTACCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGTTCAACTTTGAGAGTC 725
Query 583 GAGCAGGGCTCCTTGACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCATGTGGAT 642
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 726 GAGCAGGGGTCCTTAACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCACGTGGAT 785
Query 643 GAGAATGCCGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTATTTGCAGGAACCACTGTTGTGAAT 702
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 786 GAGAATGCTGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTGTTTGCAGGAACCACTGTCGTGAAT 845
Query 703 GGGAACTGTATATGCTTAGTTACAGATACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCAC 762
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 846 GGGAACTGCATATGTTTAGTTACAGATACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCAC 905
Query 763 TCACAGATCCAGGAAGCTGCACAACACGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAAC 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 906 TCACAGATCCAGGAAGCTGCACAACACGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAAC 965
Query 823 GAGTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGCGCGTTAGTGTGGCTCATC 882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 966 GAGTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGTGCGTTAGTGTGGCTCATC 1025
Query 883 AATGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTC 942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026 AATGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTC 1085
Query 943 TCCTTCGAGAAGTGCACATACTACTTTGAGATTGCTGTTGCATTGGCGGTTGCTGCAATT 1002
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1086 TCCTTCGAGAAGTGCACATATTACTTTGAGATTGCTGTTGCACTGGCGGTTGCTGCAATT 1145
Query 1003 CCTGAAGGTCTGCCAGCAGTTATTACCACATGTTTGGCTCTTGGCACTA-GGAAGATGGC 1061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 1146 CCTGAAGGTCTGCCAGCAGTTATTACCACATGTTTGGCTCTTGGCAC-ACGGAAGATGGC 1204
Query 1062 TCAGAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGCTACCCAGTGTGGAGACTCTTGGATGCACCACCGT 1121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1205 TCAGAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGCTACCCAGTGTGGAGACTCTTGGATGCACCACCGT 1264
Query 1122 GATATGCTCTGACAAAACTGGAACTCTTACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAAGCTTGT 1181
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1265 GATATGCTCTGACAAAACTGGAACTCTCACAACCAATCAGATGGCTGTTTCTAAGCTCGT 1324
Query 1182 TGCTATGGGTTCTAGGATTGGAACCCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGA 1241
|||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325 TGCTATGGGTTCGAGGATCGGTACTCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGA 1384
Query 1242 TCCTCGAGATGGGAAGATTGAAGATTGGCCAACAGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGAT 1301
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385 TCCTCGAGATGGAAAGATTGAAGATTGGCCAATGGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGAT 1444
Query 1302 GATTGCCAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAGTGTTGAGCAATCAGAGCAGCAATT 1361
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||
Sbjct 1445 GATTGCAAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAATGTCGAGCAATCTGATCAGCAATT 1504
Query 1362 TGTGTCTAGGGGAATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATT 1421
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1505 TGTGTCTAGGGGCATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATT 1564
Query 1422 CCCCCAAGGATTGAATGAAGCTTCATCCGATGGCGATGTCTTACGTTGTTGTCGGCTGTG 1481
||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1565 TCCCGAAGGATTGAATGAAGCTTCGTCCGATGGCGATGTCTTACGTTGTTGTCGGCTATG 1624
Query 1482 GAGTGAACTAGAGCAACGAATTGCCACCCTTGAGTTCGACCGTGACCGGAAATCAATGGG 1541
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625 GAGTGAACTAGAACAACGGATTGCCACCCTTGAGTTTGACCGTGACCGGAAATCAATGGG 1684
Query 1542 AGTTATGGTGGATTCGAGCTCAGGAAAGAAGCTGCTACTGGTCAAGGGTGCGGTAGAAAA 1601
||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1685 AGTTATGGTGGATTCCAGCTCAGGAAACAAACTGCTACTGGTCAAGGGTGCGGTAGAAAA 1744
Query 1602 TGTATTGGAAAGGAGTACACATATTCAGCTACTTGATGGTTCCATTCGAGAGCTTGACCA 1661
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1745 TGTATTGGAAAGGAGTACACATATTCAGCTACTTGATGGTTCAAAACGAGAGCTTGACCA 1804
Query 1662 ATACTCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTACATGATATGTCCTTGAGTGCTTTAAGATG 1721
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1805 ATACTCAAGGGATCTGATTTTACAAAGCCTACGTGATATGTCCTTGAGTGCATTAAGATG 1864
Query 1722 TCTCGGATTTGCATACTCAGATGTTCCATCAGATTTTGCCACTTATGACGGCAGTGAAGA 1781
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1865 TCTCGGATTTGCTTACTCAGATGTTCCATCAGATTTTGCCACTTATGATGGCAGTGAAGA 1924
Query 1782 CCACCCTGCTCATCAGCAACTTCTCAACCCATCCAATTATTCATCAATTGAGTCCAATCT 1841
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CCATCCTGCTCACCAGCAACTTCTCAACCCATCCAATTATTCATCAATTGAGTCCAATCT 1984
Query 1842 AGTATTCGCTGGATTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCAAGGAAAGAGGTGCGTCAAGCCAT 1901
| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1985 AATATTCGTTGGATTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCAAGGAAAGAGGTGCGTCAAGCCAT 2044
Query 1902 TGCAGACTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATAGTTATCACCGGAGACAACAAGAGCAC 1961
|||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||
Sbjct 2045 TGCAGATTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATGGTCATTACTGGAGACAACAAGAGCAC 2104
Query 1962 AGCGGAAGCGATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATCTCCTCGAG 2021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2105 AGCGGAAGCGATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATCTCCTCAAG 2164
Query 2022 AAGCTTGACAGGAAAAGAATTTATGGATGTCCAAGATCAGAAGAATCATCTAAGACAGAC 2081
||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2165 AAGCTTGACGGGAATAGAATTTATGGATGTTCAAGATCAGAAGAATCATCTACGACAGAC 2224
Query 2082 TGGAGGGCTCTTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACT 2141
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2225 TGGAGGGCTCCTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACT 2284
Query 2142 TAAAGAAGATGGAGAAGTGGTTGCCATGACTGGAGATGGAGTTAATGATGCTCCTGCTTT 2201
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 2285 GAAAGAAGATGGAGAAGTGGTTGCCATGACTGGAGACGGAGTCAATGATGCTCCTGCTCT 2344
Query 2202 GAAGTTGGCTGATATTGGTGTGGCAATGGGCATTTCCGGTACAGAGGTAGCAAAGGAGGC 2261
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2345 GAAGTTGGCTGATATTGGTGTGGCTATGGGCATTTCCGGCACAGAGGTAGCAAAGGAGGC 2404
Query 2262 ATCTGACATGGTGTTGGCAGATGATAATTTCAGCACTATTGTTGCAGCTGTTGGTGAAGG 2321
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2405 ATCTGACATGGTTTTGGCAGATGATAATTTCAGCACCATTGTTGCAGCTGTAGGTGAAGG 2464
Query 2322 CAGGTCCATCTATAATAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGG 2381
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2465 CAGGTCCATCTATAACAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGG 2524
Query 2382 TGAGGTTGCATCGATATTCTTGACAGCTGCTCTTGGAATCCCAGAAGGCATGATCCCGGT 2441
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2525 CGAGGTTGCATCGATATTTTTGACAGCTGCTCTTGGAATCCCAGAAGGCATGATCCCGGT 2584
Query 2442 TCAGCTTCTGTGGGTGAATCTTGTAACAGACGGTCCTCCAGCTACGGCTCTGGGATTCAA 2501
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||
Sbjct 2585 TCAGCTTCTGTGGGTAAATCTCGTAACAGACGGTCCTCCAGCTACTGCTTTGGGGTTCAA 2644
Query 2502 TCCCCCTGACAAGGACATCATGAAGAAGCCTCCTCGTAGGAGTGATGACTCTCTTATCAC 2561
||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 2645 CCCCCCTGACAAAGATATTATGAAAAAGCCTCCTCGTAGGAGCGATGACTCGCTTATCAC 2704
Query 2562 TGCCTGGATTCTCTTCCGCTACATGGTGATTGGTATGTATGTGGGAGTAGCAACGGTGGG 2621
||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2705 TGCCTGGATCCTCTTCCGCTATATGGTGATTGGTCTGTACGTGGGAGTAGCAACGGTGGG 2764
Query 2622 AGTATTCATTATATGGTACACACACAACAGCTTCATGGGCATAGACTTGAGCCAAGACGG 2681
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2765 AGTATTCATCATATGGTACACACACAGTAGCTTCATGGGCATAGACTTGAGCCAAGACGG 2824
Query 2682 TCACAGCCTTGTGAGCTATTCGCAGCTCGCACATTGGGGCCAGTGCTCTTCATGGGAAGG 2741
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2825 TCACAGCCTTGTGAGCTATTCACAGCTCGCACATTGGGGCCAATGCTCTTCATGGGAAGG 2884
Query 2742 CTTCAAAGTGTCTCCTTTCACGGCAGGCTCTCAGACTTTCTCATTCGACTCAAACCCTTG 2801
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2885 CTTCAAAGTGTCTCCTTTCACAGCAGGCTCTCAGACTTTCTCGTTCGACTCAAACCCTTG 2944
Query 2802 CGACTATTTCCAGCAGGGGAAAATCAAGGCATCGACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGC 2861
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2945 CGACTATTTCCAGCAGGGGAAAATCAAGGCGTCCACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGC 3004
Query 2862 CATTGAAATGTTCAACTCTCTGAATGCACTCTCAGAAGATGGCAGCCTGGTGACGATGCC 2921
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 3005 CATTGAAATGTTCAACTCCCTGAACGCACTCTCAGAAGACGGCAGCCTGGTAACGATGCC 3064
Query 2922 ACCATGGGTGAATCCGTGGCTGCTCCTTGCAATGGCGGTCTCATTTGGGCTCCACTTTGT 2981
|| |||||||| |||||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3065 GCCGTGGGTGAACCCGTGGTTACTCCTGGCTATGGCTGTCTCATTCGGGCTCCACTTTGT 3124
Query 2982 GATATTGTACGTCCCATTCTTGGCTCAAGTGTTTGGTATTGTGCCGCTGAGCTTGAACGA 3041
|||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||
Sbjct 3125 GATACTGTACGTGCCATTCCTGGCTCAGGTATTTGGGATAGTGCCACTGAGCTTGAACGA 3184
Query 3042 ATGGCTGCTAGTGCTGGCTGTGTCTCTACCGGTGATT-TTGATAGATGAAGTGCTCAAGT 3100
|||||||| || |||||||| || || || |||||| || ||||| |||||||||||||
Sbjct 3185 GTGGCTGCTGGTACTGGCTGTTTCGCTTCCAGTGATTCTT-ATAGACGAAGTGCTCAAGT 3243
Query 3101 TTGTAGGAAGGTGCACCAGTGGCTACCGCTACTCACCCCGCACTCGCTCCGCTAAGCAAA 3160
||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||
Sbjct 3244 TTGTAGGAAGGTGTACGAGTGGCTACCGCTACTCACCTCGCACTCTTTCCACGAAGCAAA 3303
Query 3161 AGGAGGAGTAAGAAAATAATTCAAAAGGCATTAT-T-ATTAGACTGTTAGTTTTAGCTGA 3218
||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3304 AGGAGGAGTAAGAAA-TAAATCAAAAG-CATTATATTATTAGACTCTTAGTTTTAGCTGA 3361
Query 3219 AATTAACTTTGTTGCTT 3235
||||| | ||||| |||
Sbjct 3362 AATTAGCGTTGTTACTT 3378
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 160935553144
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5