BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg470813
Length=3408
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G07810.1 | Symbols: ECA1, ATECA1, ACA3 | ER-type Ca2+-ATPase... 5168 0.0
AT1G07670.1 | Symbols: ATECA4, ECA4 | endomembrane-type CA-ATPa... 5000 0.0
> AT1G07810.1 | Symbols: ECA1, ATECA1, ACA3 | ER-type Ca2+-ATPase
1 | chr1:2416265-2420757 FORWARD LENGTH=3499
Length=3499
Score = 5168 bits (2798), Expect = 0.0
Identities = 3191/3385 (94%), Gaps = 10/3385 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GTCCCTGCGATAGCTTGCAGCGGGAAGTTTCTTTCTCTCTAGCCCCGCGGATTTGCTTTG 60
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||
Sbjct 1 GTCCCTGCGATTGCTTGCAGCGGGAAGTTTCTTTCTCTCTAG-CTC-CGGATTTGCTTTG 58
Query 61 TCGATAACCTTAAGCTTTGGCGATTTTCCGGGAGAATTTGACGAATCTGTTTTGCTACGA 120
|||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 59 TCGAAAACCGTAAGCTTTGGCGAGTTTCCGGGAGAATTTGACGAATCTGTTTTGCAACGA 118
Query 121 GTGGGAATTCATGGGGAAAGGATCAGAAGACCTTGTGGAGAAGGAAAGCTTAAATTCTAC 180
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 119 GTGAGAATTCATGGGGAAAGGATCAGAAGACCTTGTGAAGAAGGAAAGCTTAAATTCTAC 178
Query 181 ACCCGTAAATTCTGATACGTTTGCTGCTTGGGCTAAAGATGTTGCGGAATGCGAAGAGCA 240
||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||
Sbjct 179 ACCTGTAAATTCGGATACGTTTCCTGCTTGGGCTAAAGATGTCGCGGAATGTGAAGAACA 238
Query 241 TTTCGGTGTTAGTCGTGAGAAAGGGTTGAGTACTGATGAGGTGTTGAAGCGGCATCAGAT 300
||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 TTTCGTTGTTAGTCGTGAGAAAGGTTTGAGTAGTGATGAGGTGTTGAAGCGGCATCAGAT 298
Query 301 CTATGGTTTGAATGAGTTAGAGAAGCCTGAGGGTACTTCTATTTTTAAGTTGATTTTGGA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 299 CTATGGTTTGAATGAGTTAGAGAAGCCTGAGGGTACTTCTATTTTTAAGCTGATTTTGGA 358
Query 361 GCAGTTTAATGATACTTTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCCGTTATTTCCTTTGTCTT 420
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 359 GCAGTTTAATGATACATTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCTGTTATTTCCTTTGTCTT 418
Query 421 GGCCTTCTTTGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCT 480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 419 GGCCTTCTTTGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACTGCATTTGTTGAGCCGCT 478
Query 481 TGTTATTTTTCTCATCTTGATTGTTAATGCCATTGTTGGGATCTGGCAAGAAACTAATGC 540
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 479 TGTTATTTTTCTCATCTTAATTGTTAATGCCATTGTTGGCATCTGGCAAGAAACTAATGC 538
Query 541 TGAGAAGGCATTGGAAGCTTTGAAGGAGATTCAGTCTCAGCAAGCGACTGTCATGCGTGA 600
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 539 TGAGAAGGCGTTGGAAGCTTTGAAAGAGATTCAGTCTCAGCAAGCAACTGTCATGCGTGA 598
Query 601 TGGGACTAAGGTTTCCAGTTTGCCTGCTAAGGAGCTTGTTCCTGGTGACATTGTGGAACT 660
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 599 TGGGACTAAGGTTTCCAGTTTGCCTGCAAAGGAGCTTGTTCCTGGTGATATTGTGGAACT 658
Query 661 GAGGGTTGGTGATAAGGTGCCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGCTCAACCCT 720
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 659 GAGGGTTGGTGATAAGGTACCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGTTCAACTTT 718
Query 721 GAGGGTCGAGCAAGGTTCCTTAACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCA 780
||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 GAGAGTCGAGCAGGGGTCCTTAACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCA 778
Query 781 TGTGGATGAGAACGCTGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTGTTTGCAGGAACCACTGT 840
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 CGTGGATGAGAATGCTGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTGTTTGCAGGAACCACTGT 838
Query 841 TGTGAATGGGAACTGCATATGCTTAGTTACAGACACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAG 900
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 CGTGAATGGGAACTGCATATGTTTAGTTACAGATACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAG 898
Query 901 GGTTCACTCACAGATCCAGGAAGCTGCACAACATGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 GGTTCACTCACAGATCCAGGAAGCTGCACAACACGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAA 958
Query 961 ACTTAACGAGTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGCGCGTTAGTGTG 1020
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 959 ACTTAACGAGTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGTGCGTTAGTGTG 1018
Query 1021 GCTCATCAATGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTT 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 GCTCATCAATGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTT 1078
Query 1081 TAAGTTCTCCTTCGAGAAGTGCACATATTACTTTGAGATTGCTGTAGCTTTGGCGGTTGC 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1079 TAAGTTCTCCTTCGAGAAGTGCACATATTACTTTGAGATTGCTGTTGCACTGGCGGTTGC 1138
Query 1141 TGCTATTCCAGAAGGTCTGCCAGCAGTTATCACCACATGTTTGGCTCTTGGTACAAGGAA 1200
||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 1139 TGCAATTCCTGAAGGTCTGCCAGCAGTTATTACCACATGTTTGGCTCTTGGCACACGGAA 1198
Query 1201 GATGGCTCAGAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGTTACCCAGTGTAGAGACTCTTGGATGCAC 1260
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1199 GATGGCTCAGAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGCTACCCAGTGTGGAGACTCTTGGATGCAC 1258
Query 1261 CACCGTAATATGCTCTGATAAAACTGGAACTCTGACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAA 1320
|||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1259 CACCGTGATATGCTCTGACAAAACTGGAACTCTCACAACCAATCAGATGGCTGTTTCTAA 1318
Query 1321 GCTCGTCGCTATGGGTTCGAGGATCGGAACTCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTC 1380
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 GCTCGTTGCTATGGGTTCGAGGATCGGTACTCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTC 1378
Query 1381 GTTTGATCCTCGAGATGGAAAGATTGAAGATTGGCCAACAGGTCGGATGGATGCAAATCT 1440
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 GTTTGATCCTCGAGATGGAAAGATTGAAGATTGGCCAATGGGTCGGATGGATGCAAATCT 1438
Query 1441 TCAGATGATTGCCAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAGTGTTGAGCAATCTGAGCA 1500
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||
Sbjct 1439 TCAGATGATTGCAAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAATGTCGAGCAATCTGATCA 1498
Query 1501 GCAATTTGTGTCTAGGGGAATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAAT 1560
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 GCAATTTGTGTCTAGGGGCATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAAT 1558
Query 1561 GGGATTTCCTGAAGGATTGAATAAAG-TTCCGTCAAATGACGATGGCTTAAGTTGTAGTC 1619
||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||| ||| ||||| |||| ||||| |||
Sbjct 1559 GGGATTTCCCGAAGGATTGAATGAAGCTTC-GTCCGATGGCGATGTCTTACGTTGTTGTC 1617
Query 1620 GGCTATGGAGTGAACTAGAGCAACGGATTGCCACTCTTGAGTTTGACCGCGATCGGAAAT 1679
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1618 GGCTATGGAGTGAACTAGAACAACGGATTGCCACCCTTGAGTTTGACCGTGACCGGAAAT 1677
Query 1680 CAATGGGAGTTATGGTGGATTCCAGCTCAGGAAAGAAACTGCTACTGGTCAAGGGTGCGG 1739
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1678 CAATGGGAGTTATGGTGGATTCCAGCTCAGGAAACAAACTGCTACTGGTCAAGGGTGCGG 1737
Query 1740 TAGAAAATGTATTGGAAAGGAGTACACGTATTCAGTTACTTGATGGTTCTGTTCAAGAAC 1799
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| |
Sbjct 1738 TAGAAAATGTATTGGAAAGGAGTACACATATTCAGCTACTTGATGGTTCAAAACGAGAGC 1797
Query 1800 TTGACCAATACTCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTACGTGATATGTCCTTGAGTGCAT 1859
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1798 TTGACCAATACTCAAGGGATCTGATTTTACAAAGCCTACGTGATATGTCCTTGAGTGCAT 1857
Query 1860 TAAGATGTCTTGGATTTGCGTACTCAGATGTTCCATCAGATTTTACCACTTACGATGGCA 1919
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 1858 TAAGATGTCTCGGATTTGCTTACTCAGATGTTCCATCAGATTTTGCCACTTATGATGGCA 1917
Query 1920 GTGAAGACCATCCTGCTCACCAGCAACTTCTCAACCCGTCCAATTATTCTTCTATCGAGT 1979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||
Sbjct 1918 GTGAAGACCATCCTGCTCACCAGCAACTTCTCAACCCATCCAATTATTCATCAATTGAGT 1977
Query 1980 CCAATCTAACATTCGCTGGCTTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCGAGGAAAGAGGTGCGCC 2039
||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 1978 CCAATCTAATATTCGTTGGATTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCAAGGAAAGAGGTGCGTC 2037
Query 2040 AAGCCATTGCAGACTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATGGTCATCACCGGAGACAACA 2099
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 2038 AAGCCATTGCAGATTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATGGTCATTACTGGAGACAACA 2097
Query 2100 AGAACACAGCGGAAGCAATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATTT 2159
||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2098 AGAGCACAGCGGAAGCGATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATCT 2157
Query 2160 CCTCGAGAAGCTTGACAGGAAAAGAATTTATGGATGTTCAAGATCAGAAGAATCATCTAA 2219
|||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2158 CCTCAAGAAGCTTGACGGGAATAGAATTTATGGATGTTCAAGATCAGAAGAATCATCTAC 2217
Query 2220 GACAGACTGGAGGGCTCTTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCA 2279
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 GACAGACTGGAGGGCTCCTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCA 2277
Query 2280 GGTTACTTAAAGAAGATGGAGAAGTAGTTGCCATGACTGGAGATGGAGTCAATGATGCTC 2339
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2278 GGTTACTGAAAGAAGATGGAGAAGTGGTTGCCATGACTGGAGACGGAGTCAATGATGCTC 2337
Query 2340 CTGCCCTGAAGTTGGCTGATATTGGTGTGGCTATGGGCATTTCCGGCACAGAGGTAGCAA 2399
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2338 CTGCTCTGAAGTTGGCTGATATTGGTGTGGCTATGGGCATTTCCGGCACAGAGGTAGCAA 2397
Query 2400 AGGAGGCATCTGACATGGTGTTGGCAGATGATAATTTCAGCACCATTGTTGCAGCTGTTG 2459
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2398 AGGAGGCATCTGACATGGTTTTGGCAGATGATAATTTCAGCACCATTGTTGCAGCTGTAG 2457
Query 2460 GTGAAGGCAGGTCCATCTATAACAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCA 2519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2458 GTGAAGGCAGGTCCATCTATAACAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCA 2517
Query 2520 ACATCGGCGAGGTTGCATCGATATTCTTGACAGCTGCTCTGGGAATCCCAGAAGGCATGA 2579
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2518 ACATCGGCGAGGTTGCATCGATATTTTTGACAGCTGCTCTTGGAATCCCAGAAGGCATGA 2577
Query 2580 TCCCGGTTCAGCTTCTGTGGGTGAATCTTGTAACAGACGGTCCTCCAGCTACGGCTCTGG 2639
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 2578 TCCCGGTTCAGCTTCTGTGGGTAAATCTCGTAACAGACGGTCCTCCAGCTACTGCTTTGG 2637
Query 2640 GATTCAATCCCCCTGACAAAGACATCATGAAGAAGCCTCCTCGTAGGAGTGATGACTCTC 2699
| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 2638 GGTTCAACCCCCCTGACAAAGATATTATGAAAAAGCCTCCTCGTAGGAGCGATGACTCGC 2697
Query 2700 TTATAACTGCCTGGATCCTCTTCCGCTACATGGTGATTGGTATGTATGTGGGAGTAGCAA 2759
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 2698 TTATCACTGCCTGGATCCTCTTCCGCTATATGGTGATTGGTCTGTACGTGGGAGTAGCAA 2757
Query 2760 CGGTGGGAGTATTCATCATATGGTACACTCACAACAGCTTCATGGGAATAGACTTGAGCC 2819
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2758 CGGTGGGAGTATTCATCATATGGTACACACACAGTAGCTTCATGGGCATAGACTTGAGCC 2817
Query 2820 AAGATGGCCACAGCCTTGTGAGCTATTCACAGCTTGCACACTGGGACCAATGCTCTTCGT 2879
|||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |
Sbjct 2818 AAGACGGTCACAGCCTTGTGAGCTATTCACAGCTCGCACATTGGGGCCAATGCTCTTCAT 2877
Query 2880 GGGAAGGCTTCAAAGTGTCTCCTTTCACAGCAGGCTCTCAGACTTTCTCATTCGACTCAA 2939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2878 GGGAAGGCTTCAAAGTGTCTCCTTTCACAGCAGGCTCTCAGACTTTCTCGTTCGACTCAA 2937
Query 2940 ACCCATGCGAGTATTTCCAGCAGGGTAAAATCAAAGCATCCACACTCTCCCTCTCGGTGT 2999
|||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2938 ACCCTTGCGACTATTTCCAGCAGGGGAAAATCAAGGCGTCCACACTCTCCCTCTCGGTGT 2997
Query 3000 TGGTGGCCATTGAAATGTTCAACTCTCTGAATGCACTTTCAGAAGACGGCAGCCTGGTAA 3059
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2998 TGGTGGCCATTGAAATGTTCAACTCCCTGAACGCACTCTCAGAAGACGGCAGCCTGGTAA 3057
Query 3060 CGATGCCACCGTGGGTGAACCCGTGGTTGCTCCTGGCAATGGCGGTCTCATTCGGGCTCC 3119
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3058 CGATGCCGCCGTGGGTGAACCCGTGGTTACTCCTGGCTATGGCTGTCTCATTCGGGCTCC 3117
Query 3120 ACTTTGTGATATTGTACGTCCCATTCTTGGCTCAAGTGTTTGGTATTGTGCCGCTGAGCT 3179
||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||| || ||||| |||||||
Sbjct 3118 ACTTTGTGATACTGTACGTGCCATTCCTGGCTCAGGTATTTGGGATAGTGCCACTGAGCT 3177
Query 3180 TGAACGAGTGGCTGCTAGTGCTGGCTGTGTCGCTGCCGGTGATT-TTGATAGATGAAGTG 3238
|||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||| || ||||| ||||||
Sbjct 3178 TGAACGAGTGGCTGCTGGTACTGGCTGTTTCGCTTCCAGTGATTCTT-ATAGACGAAGTG 3236
Query 3239 CTTAAGTTTGTAGGAAGGTGCACCAGTGGCTACCGCTACTCACCCCGCACTCGCTCCGCT 3298
|| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
Sbjct 3237 CTCAAGTTTGTAGGAAGGTGTACGAGTGGCTACCGCTACTCACCTCGCACTCTTTCCACG 3296
Query 3299 AAGCAAAAGGAGGAGTAAGAAAATAATTCAAAAGGCATTAT-T-ATTAGACTGTTAGTTT 3356
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||| |||||||
Sbjct 3297 AAGCAAAAGGAGGAGTAAGAAA-TAAATCAAAAG-CATTATATTATTAGACTCTTAGTTT 3354
Query 3357 TAGCTGAAATTAACTTTGTTGCTTA 3381
|||||||||||| | ||||| ||||
Sbjct 3355 TAGCTGAAATTAGCGTTGTTACTTA 3379
> AT1G07670.1 | Symbols: ATECA4, ECA4 | endomembrane-type CA-ATPase
4 | chr1:2370052-2374545 REVERSE LENGTH=3538
Length=3538
Score = 5000 bits (2707), Expect = 0.0
Identities = 3033/3194 (95%), Gaps = 8/3194 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 191 TCTGATACGTTTGCTGCTTGGGCTAAAGATGTTG-CGGAATGCGAAGAGCA-TTTCGGTG 248
|||||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||
Sbjct 160 TCTGATACTTTTCCTGCTTGGGGTAAAGATG-TGTCGGAATGCGAAGAGAAGTTT-GGTG 217
Query 249 TTAGTCGTGAGAAAGGGTTGAGTACTGATGAGGTGTTGAAGCGGCATCAGATCTATGGTT 308
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 218 TTAGTCGTGAGAAAGGTTTGAGCACTGATGAGGTGTTGAAACGGCATCAGATCTATGGTT 277
Query 309 TGAATGAGTTAGAGAAGCCTGAGGGTACTTCTATTTTTAAGTTGATTTTGGAGCAGTTTA 368
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||
Sbjct 278 TGAATGAATTAGAGAAGCCTGAGGGTACTTCTATTTTTAAGCTGATTTTGGAACAGTTTA 337
Query 369 ATGATACTTTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCCGTTATTTCCTTTGTCTTGGCCTTCT 428
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 338 ATGATACATTGGTTCGTATTCTTTTGGCGGCTGCTGTTATTTCCTTTGTCTTAGCCTTCT 397
Query 429 TTGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATTT 488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 398 TTGATGGCGACGAAGGTGGTGAGATGGGTATCACCGCATTTGTTGAGCCGCTTGTTATTT 457
Query 489 TTCTCATCTTGATTGTTAATGCCATTGTTGGGATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAGG 548
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 458 TTCTCATCTTGATTGTTAATGCCATTGTTGGCATCTGGCAAGAAACTAATGCTGAGAAGG 517
Query 549 CATTGGAAGCTTTGAAGGAGATTCAGTCTCAGCAAGCGACTGTCATGCGTGATGGGACTA 608
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 518 CGTTGGAAGCTTTGAAAGAGATTCAGTCTCAGCAAGCTACCGTCATGCGTGATGGGACTA 577
Query 609 AGGTTTCCAGTTTGCCTGCTAAGGAGCTTGTTCCTGGTGACATTGTGGAACTGAGGGTTG 668
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 578 AGGTTTCCAGTTTGCCTGCAAAGGAGCTTGTTCCTGGTGATATTGTGGAACTGAGGGTTG 637
Query 669 GTGATAAGGTGCCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGCTCAACCCTGAGGGTCG 728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||
Sbjct 638 GTGATAAGGTGCCTGCTGATATGCGTGTGGTTGCTTTGATCAGTTCAACTTTGAGAGTCG 697
Query 729 AGCAAGGTTCCTTAACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCATGTGGATG 788
|||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 698 AGCAGGGGTCCTTAACAGGAGAGAGTGAGGCAGTGAGCAAAACCACCAAGCACGTGGATG 757
Query 789 AGAACGCTGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTGTTTGCAGGAACCACTGTTGTGAATG 848
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 758 AGAATGCTGATATTCAAGGAAAGAAATGCATGGTGTTTGCAGGAACCACTGTCGTGAATG 817
Query 849 GGAACTGCATATGCTTAGTTACAGACACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCACT 908
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 818 GGAACTGCATATGTTTAGTTACAGATACTGGGATGAATACTGAGATTGGAAGGGTTCACT 877
Query 909 CACAGATCCAGGAAGCTGCACAACATGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAACG 968
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 878 CACAGATCCAGGAAGCTGCACAACACGAGGAAGATACCCCTCTGAAGAAAAAACTTAACG 937
Query 969 AGTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGCGCGTTAGTGTGGCTCATCA 1028
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 938 AGTTTGGGGAAGTTCTGACTATGATCATTGGGTTAATTTGTGCGTTAGTGTGGCTCATCA 997
Query 1029 ATGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTCT 1088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 ATGTCAAATACTTTCTGTCATGGGAGTATGTTGATGGCTGGCCCAGAAACTTTAAGTTCT 1057
Query 1089 CCTTCGAGAAGTGCACATATTACTTTGAGATTGCTGTAGCTTTGGCGGTTGCTGCTATTC 1148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||
Sbjct 1058 CCTTCGAGAAGTGCACATATTACTTTGAGATTGCTGTTGCACTGGCGGTTGCTGCAATTC 1117
Query 1149 CAGAAGGTCTGCCAGCAGTTATCACCACATGTTTGGCTCTTGGTACAAGGAAGATGGCTC 1208
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1118 CAGAAGGTCTGCCAGCAGTTATTACCACATGTTTGGCTCTTGGCACTAGGAAGATGGCTC 1177
Query 1209 AGAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGTTACCCAGTGTAGAGACTCTTGGATGCACCACCGTAA 1268
||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1178 AGAAGAATGCTCTGGTTAGGAAGCTACCCAGTGTGGAGACTCTTGGATGCACCACCGTGA 1237
Query 1269 TATGCTCTGATAAAACTGGAACTCTGACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAAGCTCGTCG 1328
|||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1238 TATGCTCTGACAAAACTGGAACTCTTACAACCAATCAGATGGCTGTTTCAAAGCTCGTTG 1297
Query 1329 CTATGGGTTCGAGGATCGGAACTCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGATC 1388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1298 CTATGGGTTCGAGGATCGGAACTCTTCGATCTTTCAATGTTGAGGGGACCTCGTTTGATC 1357
Query 1389 CTCGAGATGGAAAGATTGAAGATTGGCCAACAGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGATGA 1448
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358 CTCGAGATGGAAAGATTGAAGATTGGCCAACGGGTCGGATGGATGCAAATCTTCAGATGA 1417
Query 1449 TTGCCAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAGTGTTGAGCAATCTGAGCAGCAATTTG 1508
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 1418 TTGCAAAAATTGCTGCCATTTGCAACGATGCTAATGTTGAGAAATCTGATCAGCAATTTG 1477
Query 1509 TGTCTAGGGGAATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATTTC 1568
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 TGTCTAGGGGCATGCCTACTGAGGCAGCTTTGAAGGTTTTGGTTGAGAAAATGGGATTTC 1537
Query 1569 CTGAAGGATTGAATAAAG-TTCCGTCAAATGACGATGGCTTAAGTTGTAGTCGGCTATGG 1627
| |||||||||||| ||| ||| || ||| | ||| |||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1538 CCGAAGGATTGAATGAAGCTTCA-TCCGATGGCAATGTCTTACGTTGTTGTCGGCTATGG 1596
Query 1628 AGTGAACTAGAGCAACGGATTGCCACTCTTGAGTTTGACCGCGATCGGAAATCAATGGGA 1687
||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 1597 AGTGAACTAGAACAACGGATTGCCACCCTTGAGTTTGACCGTGACCGGAAATCAATGGGA 1656
Query 1688 GTTATGGTGGATTCCAGCTCAGGAAAGAAACTGCTACTGGTCAAGGGTGCGGTAGAAAAT 1747
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1657 GTTATGGTGGATTCCAGCTCAGGAAAGAAACTGCTACTGGTCAAGGGTGCCGTAGAAAAT 1716
Query 1748 GTATTGGAAAGGAGTACACGTATTCAGTTACTTGATGGTTCTGTTCAAGAACTTGACCAA 1807
||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||
Sbjct 1717 GTATTGGAAAGGAGTACCCATATTCAGCTACTTGATGGTTCCACTCGAGAGCTTGACCAA 1776
Query 1808 TACTCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTACGTGATATGTCCTTGAGTGCATTAAGATGT 1867
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TACTCAAGGGATCTTATTTTACAAAGCCTACATGATATGTCCTTGAGTGCATTAAGATGT 1836
Query 1868 CTTGGATTTGCGTACTCAGATGTTCCATCAGATTTTACCACTTACGATGGCAGTGAAGAC 1927
|| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1837 CTCGGATTTGCATACTCAGATGTTCCATCAGATTTTGCCACTTATGATGGCAGTGAAGAC 1896
Query 1928 CATCCTGCTCACCAGCAACTTCTCAACCCGTCCAATTATTCTTCTATCGAGTCCAATCTA 1987
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 1897 CATCCTGCTCATCAGCAACTTCTCAACCCATCCAATTATTCATCAATTGAGTCCAATCTA 1956
Query 1988 ACATTCGCTGGCTTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCGAGGAAAGAGGTGCGCCAAGCCATT 2047
||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1957 GTATTTGTTGGATTTGTTGGTTTAAGGGATCCTCCAAGGAAAGAGGTGCGTCAAGCCATT 2016
Query 2048 GCAGACTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATGGTCATCACCGGAGACAACAAGAACACA 2107
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2017 GCAGACTGCAGAACAGCAGGTATTCGGGTCATGGTTATCACCGGAGACAACAAGAGCACA 2076
Query 2108 GCGGAAGCAATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATTTCCTCGAGA 2167
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2077 GCGGAAGCAATCTGCCGTGAAATTGGCGTATTTGAAGCAGATGAAGATATCTCCTCGAGA 2136
Query 2168 AGCTTGACAGGAAAAGAATTTATGGATGTTCAAGATCAGAAGAATCATCTAAGACAGACT 2227
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137 AGCTTGACAGGAAAAGAATTTATGGATGTTAAAGATCAGAAGAATCATCTAAGACAGACA 2196
Query 2228 GGAGGGCTCTTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACTT 2287
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2197 GGAGGGCTCCTGTTCTCAAGGGCTGAACCAAAACACAAACAAGAGATTGTCAGGTTACTG 2256
Query 2288 AAAGAAGATGGAGAAGTAGTTGCCATGACTGGAGATGGAGTCAATGATGCTCCTGCCCTG 2347
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2257 AAAGAAGATGGAGAAGTGGTTGCCATGACTGGAGATGGAGTCAATGATGCTCCTGCCCTG 2316
Query 2348 AAGTTGGCTGATATTGGTGTGGCTATGGGCATTTCCGGCACAGAGGTAGCAAAGGAGGCA 2407
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2317 AAGTTGGCTGATATTGGTGTGGCTATGGGCATTTCCGGGACAGAGGTAGCAAAGGAGGCA 2376
Query 2408 TCTGACATGGTGTTGGCAGATGATAATTTCAGCACCATTGTTGCAGCTGTTGGTGAAGGC 2467
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2377 TCTGACTTGGTGTTGGCAGATGATAATTTCAGCACCATTGTTGCAGCTGTTGGTGAAGGC 2436
Query 2468 AGGTCCATCTATAACAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGGC 2527
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2437 AGGTCCATCTATAACAACATGAAGGCCTTCATCAGGTACATGATCTCTTCCAACATCGGT 2496
Query 2528 GAGGTTGCATCGATATTCTTGACAGCTGCTCTGGGAATCCCAGAAGGCATGAT-CCCGGT 2586
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 2497 GAGGTTGCATCGATATTCTTGACAGCTGCTCTTGGAATCCCAGAAGGCATGATACCCG-T 2555
Query 2587 TCAGCTTCTGTGGGTGAATCTTGTAACAGACGGTCCTCCAGCTACGGCTCTGGGATTCAA 2646
||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 2556 TCAACTTCTGTGGGTGAATCTCGTAACAGATGGTCCTCCAGCTACTGCTTTGGGATTCAA 2615
Query 2647 TCCCCCTGACAAAGACATCATGAAGAAGCCTCCTCGTAGGAGTGATGACTCTCTTATAAC 2706
||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 2616 CCCCCCTGACAAGGATATTATGAAAAAGCCTCCTCGTAGGAGCGATGACTCTCTTATCAC 2675
Query 2707 TGCCTGGATCCTCTTCCGCTACATGGTGATTGGTATGTATGTGGGAGTAGCAACGGTGGG 2766
||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2676 TGCGTGGATCCTCTTCCGCTATATGGTGATTGGTTTGTATGTGGGAGTAGCAACGGTGGG 2735
Query 2767 AGTATTCATCATATGGTACACTCACAACAGCTTCATGGGAATAGACTTGAGCCAAGATGG 2826
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||
Sbjct 2736 AGTATTCATCATATGGTACACACACAACAGCTTTATGGGCATAGACCTGAGCCAAGACGG 2795
Query 2827 CCACAGCCTTGTGAGCTATTCACAGCTTGCACACTGGGACCAATGCTCTTCGTGGGAAGG 2886
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 2796 TCACAGCCTTGTGAGCTATTCACAGCTCGCACATTGGGGCCAATGCTCTTCATGGGAAGG 2855
Query 2887 CTTCAAAGTGTCTCCTTTCACAGCAGGCTCTCAGACTTTCTCATTCGACTCAAACCCATG 2946
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 2856 CTTCAAAGTGTCTCCTTTCACAGCAGGCTCTCAGACTTTCTCGTTCGACTCAAACCCTTG 2915
Query 2947 CGAGTATTTCCAGCAGGGTAAAATCAAAGCATCCACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGC 3006
||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2916 CGACTATTTTCAGCAGGGTAAAATCAAGGCATCCACACTCTCCCTCTCGGTGTTGGTGGC 2975
Query 3007 CATTGAAATGTTCAACTCTCTGAATGCACTTTCAGAAGACGGCAGCCTGGTAACGATGCC 3066
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 2976 CATTGAAATGTTCAACTCTCTGAATGCACTCTCAGAAGATGGCAGCCTGGTGACGATGCC 3035
Query 3067 ACCGTGGGTGAACCCGTGGTTGCTCCTGGCAATGGCGGTCTCATTCGGGCTCCACTTTGT 3126
||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||
Sbjct 3036 ACCCTGGGTTAACCCGTGGCTGCTCCTGGCAATGGCTGTCTCATTTGGACTCCACTTTGT 3095
Query 3127 GATATTGTACGTCCCATTCTTGGCTCAAGTGTTTGGTATTGTGCCGCTGAGCTTGAACGA 3186
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3096 GATATTGTACGTCCCATTCTTGGCTCAGGTGTTTGGTATTGTGCCACTGAGCTTGAACGA 3155
Query 3187 GTGGCTGCTAGTGCTGGCTGTGTCGCTGCCGGTGATTTTGATAGATGAAGTGCTTAAGTT 3246
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 3156 GTGGCTGCTAGTGCTGGCTGTGTCGCTGCCGGTAATTTTGATAGACGAAGTGCTCAAGTT 3215
Query 3247 TGTAGGAAGGTGCACCAGTGGCTACCGCTACTCACCCCGCACTCGCTCCGCTAAGCAAAA 3306
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 3216 TGTAGGAAGGTGCACGAGTGGCTACCGCTACTCACCTCGCACTCCCTCAGCTAAGCAAAA 3275
Query 3307 GGAGGAGTAAGAAAATAATTCAAAAGGCATTATTATTAGACTGTTAGTTTTAGCTGAAAT 3366
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3276 GGAGGAGTAAGAAAATAATTCAAAAGGCATTATTATTAGACTCTTAGTTTTAGCTGAAAT 3335
Query 3367 TAACTTTGTTGCTT 3380
||||||||||||||
Sbjct 3336 TAACTTTGTTGCTT 3349
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 169614434283
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5