BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg470837
Length=1522
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G07930.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu fami... 2427 0.0
AT1G07940.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu fami... 2394 0.0
AT1G07920.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu fami... 2359 0.0
AT5G60390.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu fami... 1984 0.0
AT1G35550.1 | Symbols: | elongation factor Tu C-terminal domai... 409 5e-113
AT1G35545.1 | Symbols: | other RNA | chr1:13110517-13112832 RE... 228 1e-58
> AT1G07930.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu family
protein | chr1:2458244-2460790 FORWARD LENGTH=1807
Length=1807
Score = 2427 bits (1314), Expect = 0.0
Identities = 1452/1520 (96%), Gaps = 4/1520 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATCGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 180
Query 61 GTAAA-TCAACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTC 119
| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 181 G-AAAGTCGACAACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTG 239
Query 120 ATTGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGG 179
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 ATCGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGG 299
Query 180 GTTTTGGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 239
|| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 GTGTTGGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 359
Query 240 AAGTTTGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGTCATCGTGATTTC 299
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 AAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGTCATCGTGATTTC 419
Query 300 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCCGTCCTTATCATTGACTCC 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 420 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCC 479
Query 360 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTC 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 480 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTC 539
Query 420 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACC 479
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACT 599
Query 480 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 659
Query 540 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGA 599
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 660 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGT 719
Query 600 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTTGAG 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 720 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAG 779
Query 660 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 719
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 839
Query 720 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 899
Query 780 ATGATCAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAG 839
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 900 ATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAG 959
Query 840 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTC 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 960 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTC 1019
Query 900 AATGTTAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAG 959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1020 AATGTTAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCCAAG 1079
Query 960 GATGACCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 1019
||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 GATGACCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 1139
Query 1020 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 1079
|||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCTTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 1199
Query 1080 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 1259
Query 1140 CCCAAGTTTTTGAAGAATGGGGATGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCGACCAAGCCCATG 1199
||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1260 CCCAAATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATG 1319
Query 1200 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGGACGTTTTGCGGTGAGGGACATGAGG 1259
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 1320 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGG 1379
Query 1260 CAGACTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAG 1319
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 CAGACTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAG 1439
Query 1320 GTTACCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGAATTCCCAGCCTCAAAACTATATCC 1379
|||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| || | |||||||||| |||||
Sbjct 1440 GTTACCAAGGCTGCAGTTAAGAAGGGTGCAAAGTGAACTCGAATCCTCAAAACTCTATCC 1499
Query 1380 GCAGATGAATCCAAGGACTATTTTAGTTT-TTTCACTTTAGTTTGGTATTTGGTCGCTTA 1438
||||||||||| || || || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1500 GCAGATGAATCAAAAAACAATATTAGTTTCTTT-ACTTTAGTTTGGTATTTGGTCGCGTG 1558
Query 1439 TTACAGCTTCGTTTCTTCTCCGTCAGAGCTCAATTCCCGGAATTGGGTTCTTGATCGGAG 1498
||| ||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1559 TTATAGCTTCGTTTCTTCTCCATCGGAACTCTGTTCCCGGAACTGGGTTCTTGATCGGAG 1618
Query 1499 GTGGCGGAGCTACTTGGCAC 1518
||||||||||||||| ||||
Sbjct 1619 GTGGCGGAGCTACTTTGCAC 1638
> AT1G07940.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu family
protein | chr1:2462953-2465504 REVERSE LENGTH=1864
Length=1864
Score = 2394 bits (1296), Expect = 0.0
Identities = 1456/1532 (95%), Gaps = 15/1532 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATCGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 113 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 172
Query 61 GTAAA-TCAACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTC 119
| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 173 G-AAAGTCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTC 231
Query 120 ATTGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGG 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 232 ATTGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGG 291
Query 180 GTTTTGGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 239
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292 GTTTTGGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 351
Query 240 AAGTTTGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGTCATCGTGATTTC 299
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 352 AAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTC 411
Query 300 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCCGTCCTTATCATTGACTCC 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 412 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCC 471
Query 360 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTC 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 472 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTA 531
Query 420 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACC 479
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACT 591
Query 480 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 651
Query 540 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGA 599
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 652 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGT 711
Query 600 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTTGAG 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 712 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAG 771
Query 660 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 719
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 772 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 831
Query 720 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 832 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 891
Query 780 ATGATCAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAG 839
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 892 ATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAG 951
Query 840 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTC 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 952 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTC 1011
Query 900 AATGTTAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAG 959
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1012 AATGTTAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCATCCAACTCCAAG 1071
Query 960 GATGACCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 1019
||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072 GATGACCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 1131
Query 1020 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 1079
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1132 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCCTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 1191
Query 1080 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1192 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 1251
Query 1140 CCCAAGTTTTTGAAGAATGGGGATGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCGACCAAGCCCATG 1199
|| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1252 CCTAAATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATG 1311
Query 1200 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGGACGTTTTGCGGTGAGGGACATGAGG 1259
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 1312 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGGACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGG 1371
Query 1260 CAGACTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAG 1319
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1372 CAGACTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAG 1431
Query 1320 GTTACCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGAATTCCCAGCCTCAAAACTATATCC 1379
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || | | |||||||| | |||
Sbjct 1432 GTTACCAAGGCTGCAGTCAAGAAGGGTGCCAAGTGAACTCTGAACATCAAAACTCTTTCC 1491
Query 1380 GCAGATGAA-TCCAAGGACTATTTTAGTTT-TTTCACTTTAGT--TT-GGTATTTGGTCG 1434
|| |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||| |
Sbjct 1492 GCTGATGAAATG-AAGGACTATTTTAGTTTCTTT-ACTTTAGTAGTTTGGTATTTGGTTG 1549
Query 1435 CTTATT------ACAGCTTCGTTTCTTCTCCGTCAGAGCTCAATTCCCGGAATTGGGTTC 1488
|| || || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1550 GTTGTTTGTGTTACCGCTTCGTTTATTCTCCGTCGGAGCTCAATTCTCGGAATTGGGTTC 1609
Query 1489 TTGATCGGAGGTGGCGGAGCTACTTGGCACTC 1520
||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1610 TTGATCGGAGGTGGCGGAGGTACTTGGCACTC 1641
> AT1G07920.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu family
protein | chr1:2454846-2457321 FORWARD LENGTH=1783
Length=1783
Score = 2359 bits (1277), Expect = 0.0
Identities = 1446/1525 (95%), Gaps = 22/1525 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATCGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 TAACCATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTG 168
Query 61 GTAAA-TCAACCACCACTGGACACTTGATCTACAAGTTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTC 119
| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 169 G-AAAGTCGACCACCACTGGGCACTTGATCTACAAGTTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTC 227
Query 120 ATTGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGG 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 228 ATTGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGG 287
Query 180 GTTTTGGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 239
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 GTTTTGGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGG 347
Query 240 AAGTTTGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGTCATCGTGATTTC 299
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 348 AAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTC 407
Query 300 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCCGTCCTTATCATTGACTCC 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 408 ATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCC 467
Query 360 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTC 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 468 ACCACTGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTA 527
Query 420 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACC 479
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 528 CTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACT 587
Query 480 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 588 ACCCCCAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTG 647
Query 540 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGA 599
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 648 AAGAAGGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGT 707
Query 600 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTTGAG 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 708 GACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAG 767
Query 660 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 719
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 768 GCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTT 827
Query 720 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 828 CAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGT 887
Query 780 ATGATCAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAG 839
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 888 ATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAG 947
Query 840 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTC 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 948 TCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTC 1007
Query 900 AATGTTAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAG 959
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1008 AATGTTAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCATCCAACTCCAAG 1067
Query 960 GATGACCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 1019
||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068 GATGACCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCT 1127
Query 1020 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 1079
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1128 GGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCCTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTC 1187
Query 1080 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1188 AAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAG 1247
Query 1140 CCCAAGTTTTTGAAGAATGGGGATGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCGACCAAGCCCATG 1199
|||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1248 CCCAAGTTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATG 1307
Query 1200 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGGACGTTTTGCGGTGAGGGACATGAGG 1259
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 1308 GTTGTGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGGACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGG 1367
Query 1260 CAGACTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAG 1319
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1368 CAGACTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAG 1427
Query 1320 GTTACCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGAATTCCCAGCCTCAAAACTATATC- 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||
Sbjct 1428 GTTACCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGAA--CC-ATCCTCAAAACTCTATCT 1484
Query 1379 -C-GCAGATGAATCCAAGGACTATT-TTAGTTTT-TTCACTTTAGTTTGGTATTTGGTCG 1434
| |||| |||||| |||||| | | |||||||| || || ||||||||||||||||||
Sbjct 1485 GCCGCAGGTGAATCAAAGGAC-AGTGTTAGTTTTATT-ACAATAGTTTGGTATTTGGTCG 1542
Query 1435 C-T-TAT-TA--CA-GCTTCGTTT-CTTCTCCGTCAGAGC-TCAATTCCCGGAATTGGGT 1486
| | | | | | | ||||||| || | |||||||||| | ||| || ||||||||
Sbjct 1543 CGTGTCTGTGTTCTTGTTTCGTTTTCTCC-CCGTCAGAGCGTTG-TTCTCGTAATTGGGT 1600
Query 1487 TCTTGATCGGAGGTGGCGGAGCTAC 1511
|||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1601 TCTTGATCGGAGGTGGCGGATCTAC 1625
> AT5G60390.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu family
protein | chr5:24288658-24291020 FORWARD LENGTH=1764
Length=1764
Score = 1984 bits (1074), Expect = 0.0
Identities = 1260/1352 (93%), Gaps = 4/1352 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATCGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGTAAA 65
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| |||
Sbjct 70 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGTCATGTTGATTCTGGAAAA 129
Query 66 TCAACCACCACTGGACACTTGATCTACAAG-TTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 124
|| ||||| ||||| ||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 130 TCGACCACAACTGGTCACTTGATCTATAAGCTT-GGTGGTATTGACAAGCGTGTCATCGA 188
Query 125 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTTTT 184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 189 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTGTT 248
Query 185 GGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 244
||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||
Sbjct 249 GGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATTACCATCGATATTGCTCTATGGAAGTT 308
Query 245 TGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGTCATCGTGATTTCATCAA 304
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||
Sbjct 309 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTCATTGATGCCCCAGGACATCGTGATTTCATCAA 368
Query 305 GAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCCGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 364
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 369 GAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCAC 428
Query 365 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTCCTTGC 424
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 429 TGGAGGTTTTGAGGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGC 488
Query 425 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 484
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATTTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 548
Query 485 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 544
||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 549 CAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCATACCTGAAGAA 608
Query 545 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 604
||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 609 GGTCGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTGCCAATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 668
Query 605 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTTGAGGCTCT 664
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 CATGATTGAGAGGTCAACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTTGAGGCTCT 728
Query 665 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 724
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 729 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTTCCACTTCAGGA 788
Query 725 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 848
Query 785 CAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 844
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 849 CAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCTGT 908
Query 845 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTCAATGT 904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 909 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGATTCAATGT 968
Query 905 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGA 964
||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 969 CAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGATACGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGA 1028
Query 965 CCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1024
|| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 TCCAGCTAAGGGTGCCGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1088
Query 1025 GATTGGTAACGGTTACGCCCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1084
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1148
Query 1085 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1208
Query 1145 GTTTTTGAAGAATGGGGATGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCGACCAAGCCCATGGTTGT 1204
||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1209 GTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACCCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1268
Query 1205 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGG-ACGTTTTGCGGTGAGGGACATGAGGCAGA 1263
||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||
Sbjct 1269 TGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCT-TTGGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGA 1327
Query 1264 CTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTA 1323
| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1328 CCGTTGCTGTTGGTGTTATTAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTCA 1387
Query 1324 CCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGA 1355
|||||||||| || ||||||||||| || |||
Sbjct 1388 CCAAGGCTGCAGTGAAGAAGGGTGCCAAATGA 1419
> AT1G35550.1 | Symbols: | elongation factor Tu C-terminal domain-containing
protein | chr1:13112506-13113136 FORWARD LENGTH=631
Length=631
Score = 409 bits (221), Expect = 5e-113
Identities = 339/397 (85%), Gaps = 3/397 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 923 GGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGACCCTGCCAAGGGAGCAGC 982
||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || ||
Sbjct 133 GGA-CTTAAGCGTGGGTACGTCGCCTCAAACTCCAAGGATGATCCTGCAAAGGTTGCTGC 191
Query 983 CAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATTGGTAACGGTTACGC 1042
| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |
Sbjct 192 TAGCTTCACCTCCCAGGTCGTCATCATGAACCACCTTGGTCAGATTAAAAATGGTTACAC 251
Query 1043 CCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 1102
||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252 CCCAGTTCTTGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 311
Query 1103 GATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAAGTTTTTGAAGAATGGGGA 1162
||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||
Sbjct 312 GATTGACTGGCGTACTGGTCATGAGATTGAGAAGGAGCCAAAGTTTTTAAAGAACAGTGA 371
Query 1163 TGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCGACCAAGCCCATGGTTGTGGAGACCTT-CTCTGAGT 1221
|||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| | || ||||| ||
Sbjct 372 GGCCGCTATTATTAATATGACTCCCACCAAGCCTATGGTGGTTGAGGC-TTACTCTGCGT 430
Query 1222 ACCCACCCCTTGGACGTTTTGCGGTGAGGGACATGAGGCAGACTGTTGCAGTCGGTGTCA 1281
|||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| || |||| || || || |
Sbjct 431 ACCCACCCCTGGGACGTTTTGCTATTAGGGACATGAGGCAAACCGTTGGTGTTGGAGTTA 490
Query 1282 TCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAA 1318
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 491 TCAAGAGTGTTGTCAAGAAGGACCCAAGTGGAGCCAA 527
> AT1G35545.1 | Symbols: | other RNA | chr1:13110517-13112832
REVERSE LENGTH=814
Length=814
Score = 228 bits (123), Expect = 1e-58
Identities = 170/193 (88%), Gaps = 1/193 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 923 GGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGACCCTGCCAAGGGAGCAGC 982
||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || ||
Sbjct 195 GGA-CTTAAGCGTGGGTACGTCGCCTCAAACTCCAAGGATGATCCTGCAAAGGTTGCTGC 137
Query 983 CAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATTGGTAACGGTTACGC 1042
| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |
Sbjct 136 TAGCTTCACCTCCCAGGTCGTCATCATGAACCACCTTGGTCAGATTAAAAATGGTTACAC 77
Query 1043 CCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 1102
||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 76 CCCAGTTCTTGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 17
Query 1103 GATTGACAGGCGT 1115
||||||| |||||
Sbjct 16 GATTGACTGGCGT 4
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 75100015320
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5