BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg471559
Length=4636
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G13980.1 | Symbols: GN, VAN7, EMB30 | sec7 domain-containing... 7773 0.0
> AT1G13980.1 | Symbols: GN, VAN7, EMB30 | sec7 domain-containing
protein | chr1:4788559-4794654 FORWARD LENGTH=4835
Length=4835
Score = 7773 bits (4209), Expect = 0.0
Identities = 4499/4640 (97%), Gaps = 15/4640 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTCCTCGAGATTTTCCGATCGTGCTTTCCTCAAAAGCATTTCTGTTTCTCGTCGTCGG 60
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CCCTCCTCGAGAATTTCCGATCGTGCTTTCCTCAAAAGCATTTCTGTTTCTCGTCGTCGG 60
Query 61 AGCCCGACGACAGATCTCTGAATCGCTTGAGAAACATAATGATTGAGTTTGGCCTCTATC 120
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AGCCCGACGACAGATCTCTGAATCGCTGGAGAAACATAATGATTGAGTTTGGCCTCTATC 120
Query 121 TGTGAAGGGTATAT-ATGC-TCTGTATCTACTTTATATTCTGCCAGGAAGATTGTGAGCA 178
|||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TGTGAAGGGTATATGCTCCGGCTGTATCTACTTTATATTCTGCCAGGAAGATTGTGAGCA 180
Query 179 TTAAAGTGCCTTGGGCTCTGGCTGAAGATTTGAGCAGATTAAATGGGTCGCCTAAAGTTG 238
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTGAAGTGCCTTGGGCTCTGGCTGAAGATTTGAGCAGATTAAATGGGTCGCCTAAAGTTG 240
Query 239 CATTCTGGAATCAAGGCCATTGAGGAAGAGCCTGAGGACTTTGAGAGTACTGATTCAAGT 298
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 241 CATTCTGGAATCAAGGCCATTGAGGAAGAACCTGAGGACTTTGAGTGTACTGATTCAAGT 300
Query 299 AATACTACCACTTTAGCATGCATGATTGATACGGAAATTGCTGCTGTTTTAGCGGTTATG 358
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AATACAACCACTTTAGCATGCATGATTGATACGGAAATTGCTGCTGTTTTAGCGGTTATG 360
Query 359 AGAAGAAATGTAAGATGGGGAGGACGGTACATGTCTGGTGATGATCAACTAGAACACTCG 418
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 AGAAGAAATGTAAGATGGGGAGGTCGATACATGTCTGGTGATGATCAACTAGAACACTCG 420
Query 419 TTGATTCAGTCACTTAAAGCTCTTAGAAAACAGGTGTTCTCATGGAACCAGCCGTGGCAT 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TTGATTCAGTCACTTAAAGCTCTTAGAAAACAGGTGTTCTCATGGAACCAGCCGTGGCAT 480
Query 479 ACGATTAGTCCCATGTTGTATCTTCAGCCCTTTCTGGATGTGATACGGTCGGATGAAACT 538
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 481 ACAATTAGTCCCATGTTGTATCTTCAGCCCTTTCTTGATGTGATACGGTCAGATGAAACT 540
Query 539 GGAGCACCGATAACCAGCATTGCTTTGTCATCAGTTTACAAGATCTTAAATCTGAATGTA 598
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 541 GGAGCACCAATAACCAGCATTGCTTTGTCATCAGTTTACAAGATCTTAAACCTGAATGTA 600
Query 599 ATTGATCAAAATACTGCAAATATTGAAGACGCTATGCATTTGGTAGTTGATTCTGTGACA 658
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 601 ATTGATCAAAATACTGCGAATATTGAAGACGCTATGCACTTGGTAGTTGATTCTGTGACA 660
Query 659 AGCTGTCGATTTGAGGTGACAGATCCTGCATCAGAAGAGGTTGTGCTAATGAAGATACTT 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AGCTGTCGATTTGAGGTGACAGATCCTGCATCAGAAGAGGTTGTGCTAATGAAGATACTT 720
Query 719 CAGGTTCTTCTAGCATGCATGAAAAATAAAGCATCAGTTATGCTAAGCAATCAGCATGTA 778
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CAGGTTCTTCTAGCATGTATGAAAAATAAAGCATCAGTTATGCTAAGCAATCAGCATGTA 780
Query 779 TGCACTGTTGTCAACACTTGTTTTCGTGTTGTCCACCAAGCAGGAATGAAAGGTGAGTTA 838
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TGCACTGTCGTCAACACTTGTTTTCGTGTTGTCCACCAAGCAGGAATGAAAGGTGAGTTA 840
Query 839 CTGCAACGTGTAGCTCGCCACACGATGCATGAACTAGTGAGGTGTATCTTCTCGCATCTC 898
||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 TTGCAACGAGTAGCTCGCCACACGATGCATGAATTAGTGAGGTGTATCTTCTCGCATCTC 900
Query 899 CCAGATGTTGACAGAACAGAAAGTACACTTGTCAGCAGAGCTGGAAGCATCAAACAAGAG 958
||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 901 CCAGATGTTGAAAGAACAGAAACTACACTTGTCAACAGAGCTGGTAGCATCAAACAAGAG 960
Query 959 AAAGCTGGAGTAGACAGTGATTATGCCATTGTGAGTAAACCAGTCGAGGATGGAAATGCT 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 AAAGCTGGAGTAGACAGTGATTATGCCATTGTGAGTAAACCAGTCGAGGATGGAAATGCT 1020
Query 1019 AATTCCGAGTATGATAATGAAAATTCTGTGGCAACTTTTGCAACTGGTGCTCAAAGTTTG 1078
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 AATTCCGAGTATGATGTTGAAAATTCTATGGCAACTTTTGCAACTGGTGCTCAAAGTTTG 1080
Query 1079 ATGGATGATGGACTC-GTTGGCCCTGGAAGCAGAAAGCCGGCGTCTCCATATGATTTGCA 1137
||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1081 ATGGATGATGGAC-CAGTTGGCCCTGGAAGCAGAAAGCCGGCTTCTCCATATGATTTGCA 1139
Query 1138 TATAATGACAGAGCCATACGGAGTCCCAAGTATGGTGGAAATATTTCACTTCTTGTGCTC 1197
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1140 TATAATGACAGAGCCATACGGAGTCCCAAGTATGGTGGAAATTTTTCACTTCTTGTGCTC 1199
Query 1198 TTTGTTAAATGTGGTCGAACATGTTGGGATGGGATCCCGATCAAACACCATAGCATTTGA 1257
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 TTTGTTAAATGTGGTCGAACATGTTGGTATGGGATCCCGATCAAACACCATAGCATTTGA 1259
Query 1258 CGAAGATGTGCCTCTGTTTGCATTGAACTTGATCAACTCAGCCATTGAATTGGGTGGATC 1317
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 CGAAGATGTGCCTCTGTTTGCGTTGAACTTGATCAACTCAGCCATTGAATTGGGTGGATC 1319
Query 1318 ATCCATCCGCCATCACCCAAGATTGTTAAGCTTAATTCAAGATGAGTTATTTCGTAACTT 1377
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 GTCCATCCGCCATCACCCAAGATTGTTAAGCCTAATTCAAGATGAGTTATTTCGTAACTT 1379
Query 1378 GATGCAATTCGGATTGTCAATGAGTCCCCTTATTCTTTCGATGGTTTGCAGCATTGTGCT 1437
|||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 GATGCAGTTCGGATTGTCGATGAGCCCCCTGATTCTTTCGATGGTTTGCAGCATTGTGCT 1439
Query 1438 CAATTTGTATCAACATCTACGTACTGAACTCAAACTGCAGCTTGAGGCATTCTTTTCATG 1497
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 CAATTTGTATCAACATCTACGAACTGAACTCAAGTTGCAGCTTGAGGCATTCTTTTCATG 1499
Query 1498 TGTGATTCTAAGGCTTGCTCAAGGAAAATATGGGCCCTCGTATCAGCAGCAAGAGGTTGC 1557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 TGTGATTCTAAGGCTTGCTCAAGGAAAATATGGGCCCTCGTATCAGCAGCAAGAGGTTGC 1559
Query 1558 TATGGAGGCTCTTGTGAACTTTTGTAGGCAGAAGAGTTTTATGGTGGAAATGTATGCCAA 1617
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1560 TATGGAGGCTCTTGTGAATTTTTGTAGGCAGAAGAGTTTTATGGTTGAAATGTATGCCAA 1619
Query 1618 TCTCGATTGTGATATAACTTGCAGCAATGTGTTTGAGGAGCTGTCTAACCTTCTATCGAA 1677
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1620 TCTCGATTGTGATATAACTTGCAGCAACGTGTTTGAGGAGCTGTCTAATCTTCTCTCGAA 1679
Query 1678 GAGCACATTTCCTGTGAACTGTCCTTTGTCCGCAATGCACATTCTTGCTCTGGATGGCCT 1737
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 GAGCACATTTCCTGTGAACTGTCCTTTGTCTGCAATGCACATTCTTGCTCTGGATGGCCT 1739
Query 1738 AATCGCTGTTATTCAGGGAATGGCCGAGAGGATAAGTAATGGATTGACTGGTTTGGACTT 1797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1740 AATCGCTGTTATTCAGGGAATGGCCGAGAGGATAAGTAATGGATTGACTGGTTTGGATTT 1799
Query 1798 GGGTCCTGTCCATCTTGATGAGTACACACCTTTCTGGATGGTTAAGTGTGACAACTATAG 1857
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 GGGTCCTGTCCATCTTGATGAGTACACGCCTTTCTGGATGGTTAAGTGTGACAACTATAG 1859
Query 1858 TGATCCAAATCACTGGGTTTCATTTGTCCGCAGGAGAAAATATATCAAGAGAAGGTTAAT 1917
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 TGATCCAAATCACTGGGTTTCATTTGTCCGCAGGAGAAAATATATCAAGAGAAGGTTAAT 1919
Query 1918 GATTGGAGCAGATCACTTTAACAGGGATCCAAAGAAGGGGTTAGAGTTTCTCCAAGGCAC 1977
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 GATTGGAGCAGATCATTTTAACAGGGATCCAAAGAAGGGGTTAGAGTTTCTCCAAGGCAC 1979
Query 1978 ACATCTTTTGCCTGACAAACTTGATCCCCAAAGTGTAGCTTGCTTTTTCAGATATACTGC 2037
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1980 ACATCTTTTGCCTGACAAACTCGATCCCCAAAGTGTTGCTTGCTTTTTTAGATATACTGC 2039
Query 2038 TGGGCTTGATAAGAACCTTGTTGGGGATTTTCTTGGAAATCATGACGAATTTTGTGTTCA 2097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 TGGGCTTGATAAGAACCTTGTTGGGGATTTTCTTGGAAATCATGACGAATTTTGTGTTCA 2099
Query 2098 AGTTCTCCATGAGTTTGCTGGGACTTTCGATTTCCAGTACATGAATCTGGATACTGCACT 2157
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 AGTTCTCAATGAGTTTGCTGGGACTTTCGATTTCCAGTACATGAATCTGGATACTGCACT 2159
Query 2158 CCGACTCTTCTTGGAAACCTTCAGGTTGCCTGGAGAATCTCAGAAAATACAGAGAGTGCT 2217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 CCGACTCTTCTTGGAAACCTTCAGGTTGCCTGGAGAATCCCAGAAAATACAGAGAGTGCT 2219
Query 2218 TGAAGCGTTCTCGGAAAGATACTATATGCAATCTCCTGAGATTCTGGCCAACAAGGATGC 2277
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 TGAGGCGTTCTCTGAAAGATACTATATGCAATCTCCTGAGATTCTGGCCAACAAGGATGC 2279
Query 2278 TGCTCTTGTGTTATCATACTCTATTATCATGCTTAACACTGATCAGCACAACGTTCAAGT 2337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 TGCTCTTGTGTTATCATACTCTATTATCATGCTTAACACTGATCAGCACAACGTTCAAGT 2339
Query 2338 GAAGaaaaaaaTGACAGAAGAGGATTTCATTCGCAATAATAGGCATATCAATGGAGGAAA 2397
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 AAAGAAAAAGATGACAGAAGAGGATTTCATTCGCAATAATAGGCATATCAATGGAGGAAA 2399
Query 2398 TGATCTACCTCGAGAATTTTTGTCCGAACTCTTTCACTCCATCTGCAACAATGAGATCAG 2457
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2400 TGATCTACCTCGAGAATTCTTGTCTGAACTCTTTCACTCCATCTGCAACAATGAGATCAG 2459
Query 2458 GACTACTCCAGAACAAGGTGCAGGCTTTCCTGAAATGACTCCCAGCCGTTGGATTGATTT 2517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2460 GACTACTCCAGAACAAGGTGCAGGCTTTCCTGAAATGACTCCCAGCCGTTGGATTGATTT 2519
Query 2518 GATGCATAAATCAAAGAAAACTGCTCCATATATTATGGCTGATTCAAGGGCTTATCTTGA 2577
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2520 GATGCATAAATCAAAGAAAACTGCTCCATATATTCTGGCTGATTCAAGGGCTTATCTTGA 2579
Query 2578 CCATGATATGTTTGCTATCATGTCTGGTCCAACCATTGCTGCCATATCAGTCGTTTTTGA 2637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2580 CCATGATATGTTTGCTATCATGTCTGGTCCAACCATTGCTGCCATATCAGTCGTTTTTGA 2639
Query 2638 CCATGCAGAACATGAAGACGTTTACCAGACATGCATAGATGGATTCTTGGCTATTGCTAA 2697
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2640 CCATGCAGAACATGAAGACGTTTACCAGACATGCATCGATGGATTCTTGGCTATAGCTAA 2699
Query 2698 AATTTCTGCCTGCCATCATCTTGAAGATGTGCTTGATGATCTGGTAGTATCTCTCTGCAA 2757
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2700 AATTTCTGCCTGTCATCATCTTGAAGATGTGCTTGATGATCTGGTTGTCTCTCTCTGCAA 2759
Query 2758 ATTCACAACTCTTTTGAATCCATCATCTGTTGATGAACCGGTTCTTGCATTTGGTGATGA 2817
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2760 ATTCACAACTCTGTTGAATCCATCATCTGTTGATGAACCCGTTCTTGCATTTGGTGATGA 2819
Query 2818 CGCAAAAGCAAGGATGGCTACCATCACTATTTTTACCATTGCAAACAAATATGGAGATTA 2877
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2820 CGCAAAAGCAAGGATGGCTACTATCACAATTTTTACCATTGCAAACAAATATGGAGATTA 2879
Query 2878 TATACGTACGGGTTGGAGGAACATATTGGACTGTATCTTACGGCTACATAAACTTGGACT 2937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2880 TATACGTACGGGTTGGAGGAACATATTGGACTGTATCTTACGGCTACATAAACTTGGACT 2939
Query 2938 TCTGCCAGCTCGTGTAGCCAGTGATGCAGCTGATGAATCTGAACTTTCACCTGAGCAAGG 2997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||
Sbjct 2940 TCTGCCAGCTCGTGTAGCCAGTGATGCAGCTGATGAATCAGAACATTCATCTGAGCAAGG 2999
Query 2998 ACAAGGAAAGCCCCTCGCGAACTCCCTATCTTCAGCTCATCTACAGTCAATGGGAACTCC 3057
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3000 GCAAGGAAAGCCCCTCGCGAATTCCCTATCTTCAGCTCATCTACAGTCAATGGGAACTCC 3059
Query 3058 AAGGAGATCTTCCGGATTGATGGGAAGGTTTAGTCAGCTTCTTTCCCTTGATACAGAAGA 3117
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3060 GAGGAGATCTTCCGGATTGATGGGAAGATTTAGTCAGCTTCTTTCACTTGATACAGAAGA 3119
Query 3118 GCCAAGATCACAGCCTACTGAGCAACAGCTTGCGGCTCATCAACGAACACTTCAAACAAT 3177
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 GCCAAGATCACAGCCTACTGAGCAACAGCTTGCAGCTCATCAACGAACACTTCAAACAAT 3179
Query 3178 TCAGAAATGTCACATTGACAGCATATTTACCGAAAGCAAGTTTCTACAAGCTGAATCTTT 3237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3180 TCAGAAATGTCACATTGACAGCATATTTACCGAAAGCAAGTTTCTACAAGCTGAATCTTT 3239
Query 3238 GCTGCAGCTTGCGCGTGCGCTCATTTGGGCTGCAGGTAGGCCACAAAAAGGAACCAGTTC 3297
| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3240 GTTGCAGCTTGCGCGTGCTCTCATTTGGGCTGCAGGTAGGCCACAGAAAGGAACCAGTTC 3299
Query 3298 TCCAGAGGATGAGGATACTGCAGTTTTCTGTCTGGAATTGCTTATTGCAATCACTCTAAA 3357
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3300 TCCAGAGGATGAGGATACTGCGGTTTTCTGTCTGGAATTGCTTATTGCAATCACTCTAAA 3359
Query 3358 CAACAGAGACAGGATCGTTCTCCTATGGCAAGGCGTCTATGAACATATAGCTACAATTGC 3417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3360 CAACAGAGACAGGATCGTTCTCCTATGGCAAGGCGTCTATGAACATATAGCTACAATTGC 3419
Query 3418 TCAGTCAACGGTGATGCCCTGCAACTTAGTGGATAAAGCTATTTTTGGTCTACTTCGGAT 3477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3420 TCAGTCAACGGTGATGCCCTGCAACTTAGTGGATAAAGCTATTTTTGGTCTACTTCGGAT 3479
Query 3478 CTGCCAGAGACTACTTCCTTATAAAGAAAGCCTAGCTGATGAGCTTTTGAGATCTCTTCA 3537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3480 CTGCCAGAGACTACTTCCTTATAAAGAAAGCCTAGCTGATGAGCTTTTGAGATCTCTTCA 3539
Query 3538 GCTTGTGCTGAAACTGGATGCACGTGTTGCCGATGCCTATTGTGAGCAAATTGCAATTGA 3597
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3540 GCTTGTGCTGAAACTGGATGCACGTGTTGCAGATGCCTATTGTGAGCAAATTGCAATTGA 3599
Query 3598 AGTCAGCCGTCTTGTGAAAGCCAATGCTAATCACATCAGGTCTCAGGCGGGTTGGAGAAC 3657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3600 AGTCAGCCGTCTTGTGAAAGCCAATGCTAATCACATCAGGTCTCAGGCGGGTTGGAGAAC 3659
Query 3658 AATCACATCCTTACTCTCCATCACAGCGCGGCACCCAGAAGCTTCTGAAGCAGGATTTAA 3717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 3660 AATCACATCCTTACTCTCCATCACAGCGCGGCACCCAGAAGCTTCTGAATCAGGATTTGA 3719
Query 3718 TGCCGTATCCTTTGTTATGTCTGAAGGAACTCACCTGTATCCAGCCAATTATGTACTCTG 3777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3720 TGCCGTATCCTTTGTTATGTCTGAAGGAACTCACCTGTATCCAGCCAATTATGTACTCTG 3779
Query 3778 TGTTGATGCTGCAAGACAGTTTGCTGAATCCCGCGTGGGACAGTCCGAACGGTCTACCCG 3837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 3780 TGTTGATGCTGCAAGACAGTTTGCTGAATCCCGCGTGGGACAGTCCGAACGCTCTATCCG 3839
Query 3838 TGCCCTTGATCTAATGGGAGATTCATTAGAATATTTGGCTAAATGGGCTTTGTCAGCTAA 3897
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 3840 TGCCCTTGATCTAATGGGAGATTCATTAGAATTTTTGGCTAAATGGGCTCTCTCAGCTAA 3899
Query 3898 GGAAAACATGGGAGAAGAAGATTTCGGGAAGATGTCACAAGATATTGGGGAAATGTGGTT 3957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3900 GGAAAACATGGGAGAAGAAGATTTCGGGAAGATGTCACAAGATATTGGGGAAATGTGGTT 3959
Query 3958 AAGGCTTGTTCAAGCACTAAGAAAAGTGTGTTTAGACCAGAGAGAGGATGTCCGAAATCA 4017
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 3960 AAGGCTTGTTCAAGGACTAAGAAAAGTGTGTTTAGACCAGAGGGAGGATGTCCGAAACCA 4019
Query 4018 CGCGTTACAGTCATTACAGAAGTGTTTAGGCGGAGTAGACGGGATCAACCTAGCTCATAG 4077
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4020 CGCTTTACAGTCATTACAGAAGTGTTTAGGCGGAGTAGACGGAATCAACCTAGCTCATAG 4079
Query 4078 CATGTGGTCTCAATGCTTTGAGAAGGTAATCTTCACGGTTTTAGATGACTTATTTGAGAT 4137
||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 4080 CATGTGGTCTCAATGCTTTGACAAAGTAATCTTCACGGTTTTGGATGACTTACTTGAGAT 4139
Query 4138 AGCTGGTGGGTCACAGAAAGACTACCGAAACATGGAAGGCACATTGCTTCTCGCAATCAA 4197
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4140 AGCTGCTGGGTCACAGAAAGACTACCGAAACATGGAAGGCACATTGCTTCTCGCAATCAA 4199
Query 4198 ACTTCTCTCCAAAGTGTTTCTTCAGCAACTCCAAGAGCTGTCTCAGTTATCAACCTTCTG 4257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4200 ACTTCTCTCCAAAGTGTTTCTTCAGCAACTCCAAGAGCTATCTCAGTTATCAACCTTCTG 4259
Query 4258 CAAGCTATGGCTCGGTGTTCTAACCCGAATGGAGAAATACATGAAAGTGAAAGTAAGAGG 4317
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4260 CAAGCTATGGCTCGGTGTTCTAACTCGAATGGAGAAATACATGAAAGTGAAAGTAAGAGG 4319
Query 4318 CaaaaaaaGCGACAAGCTTCAAGAATCAGTGCCAGAGCTTCT-AAAGAACATATTGCTGG 4376
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 4320 CAAAAAAAGCGACAAGCTACAAGAATCAGTACCAGAGCTTCTCAAA-AACATATTGCTGG 4378
Query 4377 TAATGAAGACGAAAGGCGTGCTTTTGCAAAGAAGTGCTCTTGGTGGAGATAGTTTATGGG 4436
| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4379 TGATGAAGACGAAAGGCGTGCTATTGCAAAGAAGTGCTCTTGGTGGAGATAGCTTATGGG 4438
Query 4437 AACTAACATGGCTTCATGTAAACAACGTTGCTCCTTCTATGCGACTCGAGCTATTCCCTG 4496
| ||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4439 AGCTAACATGGCTTCATGTGAATAACATTGCACCGTCTATGCGACTGGAGCTATTCCCTG 4498
Query 4497 ATCAAGAATGCTCACAGCTTGGTGATGATGAAACAGTATCGAATGGCTTATCATCTCCTG 4556
||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4499 ATCAAGAATCCTCACAACTTGGTGATGATGAAACCGTATCGAATGGCTTATCTTCTCCTG 4558
Query 4557 AAGCTGGAGCAAACACAACGGGTTCGTGACCTTGTAAGTGAGATCATTAGGTGAGTTTCT 4616
|| | | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4559 AA-----A--A--CACAACTGGTTCGTGACCTTACAAGTGAGATCATTAGGTGAGTTTCT 4609
Query 4617 TTTGAATATCCATATAAGTA 4636
|| |||||||||||||||||
Sbjct 4610 TTCGAATATCCATATAAGTA 4629
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 231219440287
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5