BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg471753
Length=4408
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G15520.1 | Symbols: PDR12, ATPDR12, ABCG40, ATABCG40 | pleio... 7204 0.0
> AT1G15520.1 | Symbols: PDR12, ATPDR12, ABCG40, ATABCG40 | pleiotropic
drug resistance 12 | chr1:5331858-5338326 REVERSE LENGTH=4558
Length=4558
Score = 7204 bits (3901), Expect = 0.0
Identities = 4261/4434 (96%), Gaps = 28/4434 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAAAGAAGAAGGCTTTGATTTCTTGGATACAAAATGGAGGGAACTAGTTTTCAGAAAGC 60
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 118 AAAAAGAAGAAGACTTTGATTTCTTGGATACAAAATGGAGGGAACTAGTTTTCACCAAGC 177
Query 61 GAGTAATAGTTTGAGAAGAAACTCATCGGTGTGGAGGAAAGATTCAGGAATGGAGATTTT 120
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 178 GAGTAATAGTATGAGAAGAAACTCATCGGTGTGGAAGAAAGATTCAGGAAGGGAGATTTT 237
Query 121 CTCGAGGTCATCTAGAGAAGAAGACGATGAAGAAGCTCTGAGATGGGCTGCTCTAGAGAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 238 CTCGAGGTCATCTAGAGAAGAAGACGATGAAGAAGCTTTGAGATGGGCTGCTCTTGAGAA 297
Query 181 GCTTCCCACTTTTGATCGTCTCAGGAAAGGAATTCTCACTGCCTCACATGCCGGTGGAGC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 298 GCTTCCCACTTTTGATCGTCTCAGGAAAGGAATCCTAACTGCCTCACATGCCGGAGGACC 357
Query 241 TATCAACGAGATCGATATTCAAAAGCTTGGGTTTCAAGATACGAAGAAACTGCTAGAGAG 300
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 358 CATCAACGAGATCGATATTCAGAAGCTTGGGTTTCAAGATACTAAGAAACTGCTAGAGAG 417
Query 301 GCTCATCAAAGTCGGTGACGATGAGCACGAGAAACTCCTCTGGAAACTCAAGAAACGTAT 360
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 418 GCTCATCAAAGTCGGTGACGATGAGCATGAGAAACTCCTCTGGAAACTCAAGAAACGTAT 477
Query 361 CGATAGAGTTGGAATCGATCTTCCGACAATAGAAGTTCGGTTTGATCATCTAAAAGTTGA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478 CGATAGAGTTGGAATCGATCTTCCGACAATAGAAGTTCGGTTTGATCATCTAAAAGTTGA 537
Query 421 AGCAGAGGTTCATGTTGGAGGCAGGGCTTTGCCTACGTTCGTTAATTTCATCTCCAATTT 480
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 538 AGCAGAGGTTCATGTTGGAGGCAGAGCTTTACCTACGTTCGTCAATTTCATCTCCAATTT 597
Query 481 TGGTGATAAGTTCCTGAATACTCTGCATCTTGTTCCGAACCGGAAGAAGAAGTTCACTAT 540
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 598 TGCTGATAAGTTCCTGAATACTCTGCATCTTGTTCCGAACCGAAAGAAGAAGTTCACTAT 657
Query 541 TCTCAACGACGTCAGCGGAATCGTCAAGCCTGGCAGGATGGCTCTGCTTTTGGGTCCTCC 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 ACTCAACGACGTCAGCGGAATCGTCAAGCCTGGCAGGATGGCTCTGCTTTTGGGTCCTCC 717
Query 601 AAGTTCTGGGAAAACGACCCTCTTGCTTGCCTTGGCGGGAAAGCTTGATCTTGAACTAAA 660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 718 AAGTTCTGGGAAAACGACCCTCTTGCTTGCCTTGGCGGGAAAGCTTGATCAAGAACTAAA 777
Query 661 GCAAACTGGAAGAGTGACATACAATGGTCATGGAATGAACGAGTTTGTGCCACAAAGAAC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 GCAAACTGGAAGAGTGACATACAATGGTCATGGAATGAACGAGTTTGTGCCACAAAGAAC 837
Query 721 AGCTGCGTATATCGGCCAAAACGATGTTCATATCGGTGAAATGACCGTTCGAGAGACTTT 780
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 838 AGCTGCATATATCGGCCAAAACGATGTTCATATCGGTGAGATGACTGTTCGTGAGACTTT 897
Query 781 TGCTTATGCCGCTCGCTTCCAAGGTGTCGGTTCGCGTTATGACATGTTGACTGAATTGGC 840
|||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 898 TGCTTACGCAGCTCGCTTCCAAGGTGTTGGTTCGCGTTATGACATGTTGACAGAGTTGGC 957
Query 841 AAGAAGAGAGAAAGAAGCAAACATCAAACCTGACGCTGATGTTGATGTATTCATGAAGGC 900
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 958 AAGAAGAGAGAAAGAAGCAAACATCAAACCTGACCCTGATATTGATATATTCATGAAGGC 1017
Query 901 AATGTCAACAGCAGGTGAAAAAACAAATGTGATGACAGATTATATCCTCAAGATCTTAGG 960
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 GATGTCAACAGCAGGTGAAAAAACAAATGTGATGACAGATTATATCCTCAAGATCTTAGG 1077
Query 961 ACTTGAGGTCTGCGCAGACACTATGGTCGGCGATGATATGTTGAGAGGCATTTCTGGAGG 1020
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 1078 ACTTGAGGTCTGTGCAGACACTATGGTCGGCGATGATATGTTGAGAGGCATCTCCGGAGG 1137
Query 1021 ACAAAAGAAGCGTGTCACTACTGGTGAAATGCTGGTTGGACCGTCTAGGGCTCTGTTCAT 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 ACAAAAGAAGCGTGTCACTACTGGTGAAATGCTGGTTGGACCGTCTAGGGCTCTGTTCAT 1197
Query 1081 GGACGAGATATCAACTGGTTTAGATAGCTCAACGACATACCAGATAGTGAACTCCCTCAG 1140
||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 GGATGAGATATCGACTGGTTTAGATAGTTCAACGACTTACCAGATAGTGAACTCCCTCAG 1257
Query 1141 AAACTATGTTCATATCTTCAATGGAACAGCTCTGATCTCTCTCCTTCAGCCTGCGCCAGA 1200
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 AAACTATGTTCATATCTTCAATGGGACAGCTCTGATCTCTCTCCTTCAGCCTGCGCCAGA 1317
Query 1201 GACATTCAATCTCTTCGATGATATCATTCTCATTGCAGAAGGCGAGATCATCTACGAGGG 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 GACATTCAATCTCTTCGATGATATCATTCTCATTGCAGAAGGCGAGATCATCTACGAGGG 1377
Query 1261 CCCTCGTGATTACGTCGTGGAGTTCTTTGAGACCATGGGATTCAAATGTCCTCCAAGAAA 1320
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1378 CCCTCGTGATCACGTTGTGGAGTTCTTTGAGACCATGGGATTCAAATGTCCTCCAAGAAA 1437
Query 1321 AGGGGTCGCTGATTTCCTCCAAGAAGTGACATCAAAGAAAGACCAAATGCAGTACTGGGC 1380
||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 AGGCGTTGCTGATTTCCTTCAAGAAGTGACATCAAAGAAAGACCAAATGCAGTACTGGGC 1497
Query 1381 ACGACGTGATGAGCCTTACAGGTTCATTAGAGTGAGGGAGTTTGCAGAGGCGTTTCAATC 1440
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 ACGACGTGATGAGCCTTACAGGTTCATTAGAGTGAGAGAGTTTGCAGAGGCGTTTCAATC 1557
Query 1441 ATTCCACGTTGGCCGGAGAATCGGAGATGAGCTTGCTTTGCCCTTTGACAAGACAAAGAG 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558 ATTCCACGTTGGCCGGAGAATCGGAGATGAGCTTGCTTTGCCCTTTGACAAGACAAAGAG 1617
Query 1501 CCATCCGGCTGCTCTAACCACCAAGAAATACGGAGTTGGGATTAAAGAACTTGTCAAGAC 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 CCATCCGGCTGCTCTAACCACCAAGAAATACGGAGTTGGGATTAAAGAACTTGTCAAGAC 1677
Query 1561 CAGCTTCGCCAGAGAATACCTACTCATGAAAAGAAACTCCTTTGTTTACTACTTCAAGTT 1620
||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1678 CAGCTTCTCAAGAGAATACTTACTCATGAAAAGAAACTCCTTTGTTTACTACTTCAAGTT 1737
Query 1621 TGGACAACTGCTGGTAATGGCATTTTTGACAATGACGTTGTTCTTTCGGACAGAGATGCA 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1738 TGGACAACTGCTGGTAATGGCATTTTTGACAATGACGTTGTTCTTTCGGACGGAGATGCA 1797
Query 1681 AAAGAAAACTGTGGTGGATGGGAGTCTCTACACTGGAGCCTTGTTCTTCCTCCTAATGAT 1740
|||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 1798 AAAGAAGACTGAGGTTGATGGGAGTCTCTACACTGGAGCCTTGTTCTTCATCCTTATGAT 1857
Query 1741 GCTCATGTTCAATGGAATGTCTGAACTTTCAATGACCATTGCAAAACTTCCTGTGTTTTA 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1858 GCTCATGTTCAATGGAATGTCTGAACTTTCAATGACCATAGCAAAACTTCCTGTGTTTTA 1917
Query 1801 CAAACAACGAGATCTCCTCTTCTACCCTGCATGGGTGTACTCTCTGCCTCCTTGGCTCCT 1860
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1918 CAAACAAAGAGATCTCCTCTTCTACCCTGCATGGGTGTACTCTCTGCCTCCTTGGCTCCT 1977
Query 1861 CAAGATCCCTATAAGCTTCATTGAAGCTGCTCTGACAACATTCATCACTTACTACGTTAT 1920
|||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 1978 CAAGATACCTATAAGCTTCATGGAAGCCGCTCTCACAACATTCATCACTTACTATGTCAT 2037
Query 1921 CGGTTTTGATCCCAACGTTGGAAGGCTGTTTAAGCAGTATATTCTGCTCGTGCTCATGAA 1980
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2038 CGGCTTTGATCCCAACGTTGGAAGGCTGTTTAAGCAGTATATTCTCCTCGTGCTCATGAA 2097
Query 1981 CCAGATGGCTTCAGCATTGTTTAAGATGGTGGCAGCATTGGGAAGAAACATGATCGTTGC 2040
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2098 CCAAATGGCTTCAGCATTGTTTAAGATGGTGGCAGCATTGGGAAGAAACATGATCGTTGC 2157
Query 2041 AAACACATTTGGCGCATTTGCGATGCTTGTCTTCTTTGCCTTGGGTGGTGTGGTACTTTC 2100
||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2158 AAATACATTTGGTGCATTTGCGATGCTCGTCTTCTTTGCCTTGGGTGGTGTGGTACTTTC 2217
Query 2101 ACGAGACGACATTAAGAAGTGGTGGATATGGGGCTACTGGATCTCCCCAATAATGTATGG 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 ACGAGACGACATTAAGAAGTGGTGGATATGGGGTTACTGGATCTCCCCAATAATGTATGG 2277
Query 2161 ACAGAACGCGATCTTGGCCAACGAGTTCTTCGGACACAGCTGGAGTCGAGCTGTCCCAAT 2220
||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2278 ACAGAACGCGATCCTAGCCAATGAGTTCTTTGGACACAGCTGGAGTCGAGCTGTCGAAAA 2337
Query 2221 CTCGAGTGAAACACTTGGAGTTACTTTCCTTAAGTCTCGTGGGTTCTTACCACATGCATA 2280
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2338 CTCGAGCGAAACACTTGGAGTTACTTTCCTTAAGTCTCGTGGGTTCTTACCCCATGCATA 2397
Query 2281 CTGGTATTGGATTGGAACTGGAGCCTTACTTGGGTTCGTCGTGTTGTTCAATTTTGGTTT 2340
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2398 CTGGTACTGGATTGGAACTGGAGCCTTACTTGGGTTCGTCGTGTTATTCAATTTTGGTTT 2457
Query 2341 CACGCTGGCTCTGACGTTTCTAAACTCCTTGGGAAAGCCTCAAGCTGTTATTGCAGAAGA 2400
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2458 CACGCTGGCTCTGACGTTTCTGAACTCCTTGGGAAAGCCTCAAGCTGTTATTGCAGAAGA 2517
Query 2401 GCCTGCGAGTGATGAGACAGAACTTCAGTCGGCTCGGACAGAAGGTGTAGTTGAAGCTGG 2460
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2518 GCCTGCGAGTGATGAGACAGAACTTCAGTCTGCTAGGTCAGAAGGTGTAGTTGAAGCTGG 2577
Query 2461 TGCCAATAAGAAAAGAGGAATGGTGCTTCCATTTGAGCCACATTCAATTACCTTCGACAA 2520
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2578 TGCCAATAAGAAAAGAGGGATGGTGCTTCCATTTGAGCCACATTCAATTACCTTCGACAA 2637
Query 2521 TGTTGTATACTCAGTTGACATGCCCCAGGAAATGATAGAGCAAGGCACACAAGAAGACAG 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2638 TGTTGTATACTCAGTTGACATGCCCCAGGAAATGATAGAGCAAGGCACACAAGAAGACAG 2697
Query 2581 ACTTGTCCTGTTGAAAGGTGTGAATGGTGCATTCAGGCCAGGCGTGCTTACGGCTCTCAT 2640
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2698 ACTTGTCCTGTTGAAAGGTGTGAATGGTGCATTCAGGCCAGGCGTGCTCACGGCTCTCAT 2757
Query 2641 GGGTGTCTCTGGAGCTGGCAAAACCACTCTGATGGATGTTCTTGCCGGAAGGAAAACCGG 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2758 GGGTGTCTCTGGAGCTGGCAAAACCACTCTGATGGATGTTCTTGCCGGAAGGAAAACCGG 2817
Query 2701 TGGTTATATTGATGGCAACATCACCATTTCCGGTTACCCTAAGAATCAACAAACATTTGC 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2818 TGGTTATATTGATGGCAACATCACCATTTCCGGTTACCCTAAGAATCAACAAACATTTGC 2877
Query 2761 CCGTATCTCAGGATACTGTGAACAAACTGATATCCATTCCCCACATGTCACTGTTTACGA 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2878 CCGTATCTCAGGATACTGTGAACAAACTGATATCCATTCCCCACATGTCACTGTTTACGA 2937
Query 2821 GTCCTTGGTTTACTCAGCCTGGCTCCGATTACCTAAAGAAGTTGATTCAAACAAGAGAAA 2880
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2938 GTCCTTGGTTTACTCAGCCTGGCTCCGATTACCTAAAGAAGTTGATAAAAACAAGAGAAA 2997
Query 2881 GATATTCATAGAGGAAGTGATGGAGCTGGTGGAGTTAACGCCGCTGAGGCAAGCACTGGT 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2998 GATATTCATAGAGGAAGTGATGGAGCTGGTGGAGTTAACGCCGCTGAGGCAAGCACTGGT 3057
Query 2941 TGGACTACCTGGTGAGAGCGGTTTGTCAACAGAGCAAAGAAAGAGACTGACCATTGCGGT 3000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3058 TGGACTACCTGGTGAGAGCGGTTTGTCAACAGAGCAAAGAAAGAGACTGACCATTGCGGT 3117
Query 3001 GGAGCTGGTTGCAAACCCTTCCATCATCTTCATGGATGAACCTACTTCAGGATTGGATGC 3060
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3118 GGAGCTGGTTGCAAATCCTTCCATCATATTCATGGATGAACCTACTTCAGGATTGGATGC 3177
Query 3061 ACGAGCTGCTGCCATCGTTATGAGGACTGTGAGGAACACGGTTGACACTGGCAGAACTGT 3120
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||
Sbjct 3178 ACGAGCTGCTGCCATCGTTATGAGGACTGTAAGGAACACAGTTGACACTGGTAGAACAGT 3237
Query 3121 CGTCTGCACCATTCACCAGCCTAGCATCGACATATTTGAAGCCTTCGATGAGTTGTTCTT 3180
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 3238 CGTCTGCACCATTCACCAGCCTAGCATCGACATCTTTGAAGCCTTTGATGAGTTGTTCCT 3297
Query 3181 ACTTAAGCGTGGAGGTGAGGAGATCTACGTTGGACCTCTTGGCCACGAATCAACCCATTT 3240
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3298 ACTTAAGCGTGGAGGTGAGGAGATATACGTTGGACCTCTTGGCCACGAATCAACCCATTT 3357
Query 3241 GATCAACTATTTTGAGAGTATTCAAGGAATCAGCAAGATCACAGAAGGGTACAACCCAGC 3300
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3358 GATCAACTATTTTGAGAGTATTCAAGGAATCAACAAGATCACAGAAGGATACAACCCAGC 3417
Query 3301 AACCTGGATGCTTGAAGTCTCAAACACATCTCAAGAAGCGGCTTTAGGAGTCGATTTCGC 3360
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3418 AACCTGGATGCTTGAAGTCTCAACCACATCTCAAGAAGCGGCTTTAGGAGTCGATTTCGC 3477
Query 3361 CCAACTCTACAAAAATTCAGAACTTTACAAGAGAAACAAGGAGCTTATCAAGGAGCTAAG 3420
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3478 CCAAGTCTACAAAAATTCAGAACTTTACAAGAGAAACAAGGAGCTAATCAAGGAGCTAAG 3537
Query 3421 CCAGCCAGCTCCAGGATCAAAAGATCTGTATTTCCCAACACAATACTCACAATCGTTCTG 3480
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3538 CCAGCCAGCTCCAGGATCAAAAGATTTATATTTCCCAACACAATACTCTCAATCGTTCTT 3597
Query 3481 GACACAATGTATGGCTTCTCTATGGAAACAACACTGGTCCTACTGGAGAAACCCGCCTTA 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 3598 GACACAATGTATGGCTTCTCTATGGAAACAACACTGGTCCTACTGGAGAAATCCTCCTTA 3657
Query 3541 CACCGCCGTGAGATTCCTCTTCACAATCGGCATTGCTCTCATGTTCGGCACAATGTTCTG 3600
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3658 CACAGCCGTGAGATTCCTCTTCACAATCGGCATTGCTCTTATGTTCGGCACAATGTTCTG 3717
Query 3601 GGACCTTGGAGGCAAAACGAAAACGACACAGGATTTATCCAATGCAATGGGTTCAATGTA 3660
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3718 GGACCTTGGAGGCAAAACGAAAACGAGACAGGATTTATCGAATGCAATGGGTTCAATGTA 3777
Query 3661 CACAGCTGTTCTCTTCCTCGGATTACAAAACGCCGCTTCAGTGCAACCAGTCGTCAACGT 3720
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3778 CACAGCTGTTCTCTTCCTCGGATTACAAAACGCAGCTTCAGTGCAACCAGTCGTCAACGT 3837
Query 3721 CGAAAGAACTGTCTTTTACCGAGAACAAGCCGCCGGAATGTACTCCGCCATGCCTTATGC 3780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3838 CGAAAGAACTGTCTTTTACCGAGAACAAGCCGCCGGAATGTACTCCGCCATGCCTTATGC 3897
Query 3781 TTTCGCTCAGGTTTTCATCGAGATCCCATACGTTTTCGTGCAAGCGATTGTGTACGGTCT 3840
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3898 TTTCGCTCAGGTTTTCATCGAGATCCCATACGTTCTCGTGCAAGCGATAGTGTACGGTCT 3957
Query 3841 CATAGTGTACGCAATGATAGGGTTCGAGTGGACAGCGGTGAAGTTCTTCTGGTACCTCTT 3900
|||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3958 CATAGTGTACGCTATGATAGGATTCGAGTGGACGGCGGTGAAGTTCTTCTGGTACCTCTT 4017
Query 3901 CTTTATGTACGGATCATTCTTAACTTTCACCTTCTACGGCATGATGGCTGTTGCTATGAC 3960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 4018 CTTTATGTACGGATCATTCTTAACTTTCACCTTCTACGGAATGATGGCTGTAGCTATGAC 4077
Query 3961 GCCTAACCACCACATCGCCTCCGTCGTCTCCTCCGCTTTCTACGGCATCTGGAATCTCTT 4020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4078 GCCTAACCACCACATCGCCTCCGTCGTCTCCTCCGCTTTCTACGGCATCTGGAATCTCTT 4137
Query 4021 CTCCGGCTTCCTCATCCCTCGTCCCAGTATGCCGGTATGGTGGGAATGGTACTACTGGCT 4080
||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4138 CTCCGGCTTCCTCATCCCTCGTCCCAGTATGCCTGTGTGGTGGGAATGGTACTACTGGCT 4197
Query 4081 TTGCCCAGTTGCATGGACATTGTATGGATTAATCGCATCACAGTTCGGTGATATTACAGA 4140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4198 TTGCCCAGTTGCATGGACATTGTATGGATTAATCGCATCACAGTTCGGTGATATTACAGA 4257
Query 4141 ACCTATGGCGGATGGTAC---GAGTGTGAAGCAATTCATTAGAGATTTCTATGGATATAG 4197
||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4258 ACCTATGGCAGATAGTAATATGAGTGTGAAGCAATTCATTAGAGAATTCTATGGATATAG 4317
Query 4198 AGAAGGTTTCTTGGGAGTTGTCGCCGCCATGAACGTCATCTTCCCATTGCTCTTTGCCGT 4257
||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 4318 AGAAGGTTTCTTGGGTGTGGTTGCCGCCATGAACGTCATCTTTCCTTTGCTCTTTGCCGT 4377
Query 4258 TATCTTTGCTGTTGGAATCAAGAGTTTCAATTTCCAAAAACGATAGACAGTTTATT-TTT 4316
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4378 TATCTTTGCTATCGGAATCAAGAGTTTCAATTTCCAAAAACGATAGACAGTTTATAGTTT 4437
Query 4317 TGCAATTCTATTTCCTGTAACA----------G----TTT------ATATGTTATTCTTT 4356
|||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||
Sbjct 4438 TGCA-TTCTATTTCATGTAACACAAATAAAAAGAGACTTTTTGTTTATATGCTATTCTTT 4496
Query 4357 CTCTTTTTTGTAATGCCATATTGATA--AATAAAAGGATGATCAACAACACTGG 4408
|| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4497 CTATTTTT-GTAATGCCGTATTGATATTAATAAAAGGATGATCAACAACACTGG 4549
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 219781377283
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5