BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg471776
Length=4169
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G15780.1 | Symbols: | unknown protein; BEST Arabidopsis tha... 6647 0.0
AT1G15770.1 | Symbols: | unknown protein; BEST Arabidopsis tha... 545 1e-153
> AT1G15780.1 | Symbols: | unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana
protein match is: unknown protein (TAIR:AT2G10440.1);
Has 103701 Blast hits to 43153 proteins in 1828 species: Archae
- 30; Bacteria - 7385; Metazoa - 38639; Fungi - 11531;
Plants - 7727; Viruses - 307; Other Eukaryotes - 38082 (source:
NCBI BLink). | chr1:5430183-5436412 REVERSE LENGTH=4338
Length=4338
Score = 6647 bits (3599), Expect = 0.0
Identities = 3959/4129 (96%), Gaps = 40/4129 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGATAATAACAACTGGAGGCCTTCTCTTCCAAACGGAGAACCTGCCATGGACT-CAGC 59
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||
Sbjct 68 ATGGATAATAACAATTGGAGGCCTTCTCTTCCAAACGGAGAGCCTGCCATGGA-TACAGG 126
Query 60 TGACTGGAGAACTCAATTGCCTCCTGATTCACGTCAGAAGATCGTCAACAAGATAATGGA 119
|||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127 TGACTGGAGAACGCAATTGCCACCTGATTCTCGTCAGAAGATCGTCAACAAGATAATGGA 186
Query 120 AACACTAAAGAAGCACCTTCCGTTTTCTGGACCGGAGGGAATTAACGAGCTCAGGAGAAT 179
||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 187 AACACTAAAGAAGCACCTTCCATTTTCCGGACCAGAGGGAATTAACGAGCTCAGGAGAAT 246
Query 180 TGCAGCCAGATTCGAGGAGAAAATTTTCAGCGGTGCTGTTAACCAGACTGATTACCTTCG 239
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 247 TGCAGCTAGATTCGAGGAGAAAATTTTCAGCGGTGCTCTTAACCAGACTGATTACCTTCG 306
Query 240 GAAAATATCAATGAAGATGCTGACAATGGAGACTAAATCACAAAATGCTGCTGGTTCTTC 299
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 307 GAAAATATCAATGAAGATGCTGACAATGGAGACTAAATCACAAAATGCAGCTGGTTCTTC 366
Query 300 CGCATCTATCCCTGCCGCTAATAATGGCACATCCATAGATTCGATACCCACCAATCAAGG 359
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367 CGCAGCTATCCCTGCCGCTAATAATGGCACATCCATAGATTCGATACCCACCAATCAAGG 426
Query 360 TCATCTTCTTCCAGGATCGTTACCAACCAATCAATCTCAAGCACCTCAGCCGTTACTGTC 419
|| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 427 CCAACTTCTTCCAGGATCGTTATCAACCAATCAATCTCAAGCACCTCAGCCGTTGCTGTC 486
Query 420 CCAAACCATGCAGAATAATAGC-GCCTCTGGAATGACGGGTTCTACTGCTTTACCATCTT 478
|||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 487 CCAAACCATGCAGAATAATA-CTGCCTCTGGAATGACGGGTTCTACTGCTTTACCATCTT 545
Query 479 CCATGCCGCCGGTTTCTTCCATAGCCAATAATAACGTCACAAGCGTTGTAAACCAGAATG 538
||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||
Sbjct 546 CCATGCCACCTGTTTCTTCCATAACCAATAATAACACCACAAGCGTTGTGAACCAGAATG 605
Query 539 CCAATATGCAAAATGTAGCTGGAATGTTGCAAGATTCATCTGGGCAGCATGGCCTTTCCT 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 606 CCAATATGCAAAATGTAGCTGGAATGTTGCAAGATTCATCTGGGCAGCATGGCCTTTCCT 665
Query 599 CGAATATGTTTTCTGGATCCCAAAGGCAGATGCTTGGAAGGCCACATGCTATGTCTTCAC 658
|||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 CGAACATGTTTTCAGGACCCCAAAGGCAGATGCTGGGTAGGCCACATGCTATGTCTTCAC 725
Query 659 AGCAACAACAGCAGCCATATCTTTATCAGCAGCAGCTACAGCAGCAACTTCTCAAGCAGA 718
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 726 AGCAACAACAGCAGCCATATCTTTACCAGCAGCAGCTACAGCAGCAACTTCTCAAGCAGA 785
Query 719 ACTTCCAGTCAGGGAATGTTCCCAATCCCAATTCGCTTTTGCCATCACACATTCAACAAC 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 786 ACTTCCAGTCAGGGAATGTTCCCAATCCCAATTCGCTTTTGCCATCACACATTCAACAAC 845
Query 779 AGCAACAAAATGTGCTGCAGCCAAATCAACTGCATTCGTCTCAACAACCAGGTGTTCCAA 838
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 846 AGCAGCAAAATGTGCTGCAGCCTAATCAACTGCATTCATCTCAACAACCTGGTGTTCCAA 905
Query 839 CATCTGCTACGCAGCCCTCCACTGTGAACTCAGCTCCTCTCCAGGGTCTCCACACAAATC 898
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 906 CATCTGCGACTCAGCCCTCCACTGTGAACTCAGCTCCTCTCCAAGGTCTCCACACCAATC 965
Query 899 AGCAATCAAGTCCGCAATTGTCTTCTCAGCAGACGACACAATCTATGCTTCGTCAGCATC 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 966 AGCAATCAAGTCCGCAATTGTCTTCTCAGCAGACGACACAATCTATGCTTCGTCAGCATC 1025
Query 959 AATCGTCGATGCTAAGGCAACATCCGCAATCACAACAAGCCTCTGGCATCCATCAGCAGC 1018
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1026 AATCGTCGATGCTAAGGCAACATCCGCAATCACAACAAGCCTCTGGTATCCATCAGCAGC 1085
Query 1019 AAACTTCATTGCCGCAGCAATCAATTTCTCCTCTACAACAGCAGCAAACACAAATAATGC 1078
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||
Sbjct 1086 AATCTTCATTGCCGCAACAATCAATTTCTCCTCTACAGCAGCAGCCTACACAATTAATGC 1145
Query 1079 GGCAACAAGCTGCAAATAGCTCAGGCATCCAACAGAAGCAGATGATGGGGCAGCATGTTG 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146 GGCAACAAGCTGCAAATAGCTCAGGCATCCAACAGAAGCAGATGATGGGGCAGCATGTTG 1205
Query 1139 TTGGGGATATGCAGCAGCAACATCAGCAAAGGTTACTGAACCAACAAAATAATATTATGA 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1206 TTGGGGATATGCAGCAGCAACATCAGCAAAGGTTACTGAACCAACAAAATAATGTTATGA 1265
Query 1199 ACATacaacagcagcagtcgcagcagcaaccactgcagcagccactgcagcagccacaac 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |
Sbjct 1266 ACATACAACAGCAGCAGTCGCAGCAGCAACCACTGCAGCAG---C--CA-CAG------C 1313
Query 1259 aacagcagaaacagcagccaccggcccagcagcagTTGATGTCTCAACAAAACAGCCTCC 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314 AACAGCAGAAACAGCAGCCACCGGCCCAGCAGCAGTTGATGTCTCAACAAAACAGCCTCC 1373
Query 1319 AGGCAACGCATCAGCAA-CCACTGGGCCCTCAAAGCAATGTTGCAGGATTGCAGCAACCA 1377
|||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374 AGGCAACGCATCAG-AACCCACTGGGCACTCAAAGCAATGTTGCAGGATTGCAGCAACCA 1432
Query 1378 CAACAACAGATGCTCAATTCCCAGGTTGGCAATTCGAGTTTGCAGAATAACCAGCACTCG 1437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 CAACAACAGATGCTCAATTCCCAGGTTGGCAATTCGAGTTTGCAGAATAACCAGCACTCG 1492
Query 1438 GTGCATATGTTATCACAACCAACGGTTGGGCTGCAAAGAACACATCAGGCTGGCCATGGC 1497
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1493 GTGCACATGTTATCACAACCAACGGTTGGGCTGCAACGAACACATCAGGCTGGCCATGGC 1552
Query 1498 TTGTTTTCTTCTCAGGGCCAACAGTCACAAAATCAGCCATCCCAACAGCAGATGATGCCA 1557
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1553 TTGTATTCTTCTCAGGGACAACAGTCACAAAATCAGCCATCACAACAGCAGATGATGCCA 1612
Query 1558 CAGCTTCAATCGCATCATCAGCAGCTAGGTTTGCAACAACAACCTAATCTGCTACAACAG 1617
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613 CAGCTTCAATCGCATCATCAGCAGCTGGGTTTGCAACAACAACCTAATCTGCTACAACAG 1672
Query 1618 GATGTGCAACAAAGGCTACAAGCTTCAGGCCAAGTCACAGGTTCCCTGCTTCCACCTCAA 1677
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1673 GATGTGCAACAAAGGCTACAAGCTTCAGGCCAAGTCACTGGTTCCCTGCTTCCACCTCAA 1732
Query 1678 AATGTTGTGGACCAACAGAGACAACTATATCAATCCCAAAGAACCCTTCCGGAGATGCCA 1737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1733 AATGTTGTGGACCAACAGAGACAACTATATCAATCCCAAAGAACCCTTCCGGAGATGCCA 1792
Query 1738 TCATCATCGCTGGATTCGACGGCACAGACGGAAAGTGCAAATGGAGGTGATTGGCAAGAG 1797
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1793 TCATCATCGCTGGATTCGACAGCACAGACGGAAAGTGCAAATGGAGGTGATTGGCAAGAG 1852
Query 1798 GAGGTTTATCAAAAGATCAAATCTATGAAAGAGACGTATTTACCAGATCTGAATGAAATC 1857
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 1853 GAGGTTTACCAAAAGATCAAATCTATGAAAGAGACTTACTTACCAGATCTGAATGAAATC 1912
Query 1858 TACCAGAGAGTTGCAGCTAAGTTGCAGCAAGATTCTGTTCCACAGCAACAAAGATCAGAT 1917
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 1913 TACCAGAGAGTTGCAGCAAAGTTGCAGCAAGATTCTATGCCACAGCAACAAAGATCAGAT 1972
Query 1918 CAGTTTGAGAAATTGAAACAATTCAAAACAATGTTGGAGCGAATGATTCAATTTCTATCT 1977
||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1973 CAGCTTGAGAAACTGAGACAATTCAAAACAATGTTGGAGCGAATGATACAATTTCTATCT 2032
Query 1978 GTTTCAAAGAGCAATATCATGCCCGCATTAAAGGATAAGGTGGCTTATTATGAGAAGCAG 2037
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2033 GTTTCAAAGAGCAACATCATGCCCGCATTAAAAGATAAGGTGGCTTATTATGAGAAGCAG 2092
Query 2038 ATTATAGGTTTCTTAAATATGCACAGGCCGAGGAAGCCAGTACAGCAAGGGCAGCTTCCG 2097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2093 ATTATAGGTTTCTTAAATATGCACAGGCCGAGGAAGCCAGTACAGCAAGGGCAGCTTCCG 2152
Query 2098 CAATCTCAGATGCAGCCTATGCAGCAACCGCAATCTCAGACAGTTCAAGATCAATCTCAT 2157
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2153 CAATCTCAGATGCAGCCTATGCAGCAACCACAATCTCAGACAGTTCAAGATCAATCCCAT 2212
Query 2158 GATAACCAAACAAATCAGCAAATGCAATCAATGAGCATGCAGGGTGCTGGGCCAAGGGCA 2217
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2213 GATAACCAAACAAATCCGCAGATGCAATCAATGAGCATGCAGGGTGCTGGGCCAAGGGCA 2272
Query 2218 CAACAGAGTAGTCTGCCAAATATGCAGAACAATGTTCTATCATCTCGTCCCGGAGTTTCA 2277
|||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2273 CAACAGAGTAGTATGACAAATATGCAGAGCAATGTTCTATCATCTCGTCCTGGAGTTTCA 2332
Query 2278 GCTCCACAGCAGAACATTCCCAGTTCCATACCGGCTTCTAGTTTAGAATCAGGCCAAGGA 2337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2333 GCTCCACAGCAGAACATTCCCAGTTCCATACCGGCTTCTAGTTTAGAATCAGGCCAAGGA 2392
Query 2338 AATGCCTTGAATAATGGCCAGCAGGTTGCCATGGGATCCATGCAACAAAATACTTCTCAA 2397
||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2393 AATACCTTGAACAATGGACAGCAGGTTGCCATGGGATCTATGCAACAAAATACTTCTCAA 2452
Query 2398 CAAGTTAATAACAGTTCTGCCTCTGCTCAAAGTGGGTTAAGCACACTGCAGTCTAATGTA 2457
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 2453 CTAGTAAATAACAGTTCTGCCTCTGCTCAAAGTGGGTTGAGCACACTGCAGTCGAATGTG 2512
Query 2458 AATCAACCCCAGTTAAGTTCCAGTTTGCTTCAGCATCAGCACCTCAAGCAACAGCAAGAT 2517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2513 AATCAACCCCAGTTAAGTTCCAGTTTGCTTCAGCATCAGCACCTCAAGCAACAGCAAGAT 2572
Query 2518 CAACAAATGACGCAGCAGCTCAAACAGCAATTTCAACAGCGCCAGATgcaacagcaacag 2577
||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2573 CAACAAATG-C--AGC---TCAAACAGCAATTTCAACAGCGCCAGATGCAACAGCAACAG 2626
Query 2578 ttgcaagcaagacatcaacagcaacagcaacagttgcaagcaagacagcaagcggcacaa 2637
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2627 TTGCAAGCAAGACAGCAACAGCAACAGCAACAGTTGCAAGCAAGACAGCAAGCGGCACAA 2686
Query 2638 ttacagcagATGAATGATATGAATGATTTAACATCAAGGCAGGGGATGAATGTCAGTCGT 2697
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2687 TTACAGCAGATGAATGATATGAATGATTTAACATCGAGGCAGGGGATGAATGTCAGTCGT 2746
Query 2698 GGGATGTTCCAGCAACATTCTCTGCAGGGTCAGCGTGCTACTTATCCTCTTCAACAGTTA 2757
|||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 2747 GGGATGTTTCAGCAACATTCTATGCAGGGTCAGCGTGCGAATTATCCTCTTCAACAGTTA 2806
Query 2758 AAACCAGGAGCTGTTTCGTCGCCTCAACTTCTGCAAGGTGCATCTCCTCAGATGTCACAA 2817
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2807 AAACCAGGAGCTGTTTCGTCGCCTCAACTTCTGCAAGGTGCATCTCCTCAGATGTCACAA 2866
Query 2818 CAACATTTGTCTCCTCAGGTTGACCAGAAAAATCTGTCAACTGTCAACAAGATGGGAACT 2877
|| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 2867 CA---TTTGTCTCCTCAGGTTGACCAGAAAAAT-----A-CTGTCAACAAGATGGGAACT 2917
Query 2878 CCATTGCAACCTGCAAATTCCCCTTTTGTTGTCCCATCTCCTTC---AACCCCCTTGGCT 2934
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2918 CCATTGCAACCTGCAAATTCCCCTTTTGTTGTCCCATCTCCTTCTTCAACCCCCTTGGCT 2977
Query 2935 CCATCCCCTATGCAAGTTGACTCTGAGAAACCTGGTGCTTCTTCGTTGTCAATGGGAAAT 2994
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2978 CCGTCCCCTATGCAAGTTGACTCTGAGAAACCTGGTTCTTCTTCGTTGTCAATGGGAAAT 3037
Query 2995 ATTGCACGCCAACAAGCAACTGGCATGCAAGGTGTAGTTCAGTCCCTAGCAATTGGCACT 3054
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3038 ATTGCACGCCAACAAGCAACCGGCATGCAAGGTGTAGTTCAGTCCCTAGCAATTGGCACT 3097
Query 3055 CCAGGGATCTCTGCCTCTCCTCTCCTTCAGGAGTTTACTAGTCCTGATGGAAATATTTTA 3114
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3098 CCAGGGATCTCTGCCTCTCCTCTCCTTCAGGAGTTTACTAGTCCTGATGGGAATATTTTA 3157
Query 3115 AATCCTTTGGCAATTACATCTGGAAAACCGAGTGCTACTGAGCTGCCTATTGAACGCCTT 3174
||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3158 AATTCTTCGACAATTACATCTGGAAAACCGAGTGCTACTGAGCTGCCTATTGAACGCCTT 3217
Query 3175 ATTAGAGCCGTGAAGTCCATCTCACCACAAGCGCTTTCTTCTGCAGTAAGTGACATCGGA 3234
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3218 ATTAGAGCCGTGAAGTCCATCTCACCACAAGCCCTTTCTTCTGCAGTAAGTGACATCGGA 3277
Query 3235 TCGGTTGTAAGCATGGTTGATAGGATAGCTGGTTCAGCACCAGGAAACGGTTCAAGAGCT 3294
|| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3278 TCTGTTGTAAGCATGGTTGATCGGATAGCTGGTTCAGCACCAGGAAACGGTTCAAGAGCT 3337
Query 3295 TCAGTTGGTGAGGACTTGGTTGCAATGACTAAGTGTCGTCTCCAAGCAAGAAACTTCATG 3354
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3338 TCCGTTGGTGAAGACTTGGTTGCAATGACTAAGTGCCGTCTCCAAGCAAGAAACTTCATG 3397
Query 3355 ACGCAAGAGGGAATGATGGCGACCAAGAAAATGAAGCGTCACACAACCGCAATGCCACTA 3414
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3398 ACCCAAGAGGGAATGATGGCGACTAAGAAAATGAAGCGTCACACAACCGCAATGCCACTA 3457
Query 3415 AGTGTTGCTTCGCTGGGAGGAAGCGTTGGTGATAACTACAAGCAGTTTGCTGGTTCAGAA 3474
|| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3458 AGCGTTGCTTCACTGGGAGGAAGTGTTGGTGATAACTACAAGCAGTTTGCTGGTTCAGAA 3517
Query 3475 ACATCAGATCTAGAATCTACTGCGACTTCTGATGGCAAGAAGGCAAGAACTGAGACCGAG 3534
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3518 ACATCCGATCTAGAATCTACTGCGACTTCGGATGGCAAGAAGGCAAGAACTGAGACCGAG 3577
Query 3535 CATGCCCTTTTGGAGGAAATAAAGGAAATAAACCAGCGGCTGATAGATACAGTTGTTGAG 3594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3578 CATGCCCTTTTGGAGGAAATAAAGGAAATAAACCAGCGGCTGATAGATACAGTTGTTGAG 3637
Query 3595 ATAAGTGATGATGAAGATGCTGCTGATCGTAGTGAGAGA-GCAATATCAAGCATAGGGTG 3653
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 3638 ATAAGTGATGATGAAGATGCTGCTGATCCTAGTGAG-GTTGCAATATCAAGCATAGGGTG 3696
Query 3654 TGAAGGAACAACAGTTAGATTCTCGTTTATAGCTGTTTCTCTCAGCCCAGCCTTGAAGGC 3713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3697 TGAAGGAACAACAGTTAGATTCTCGTTTATAGCTGTTTCTCTCAGCCCAGCCTTGAAGGC 3756
Query 3714 TCATCTTTCATCAACACAAATGTCTCCTATTCAACCATTGCGTCTGCTGGTTCCTTGTAG 3773
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3757 TCATCTCTCATCAACACAAATGTCTCCTATTCAACCATTGCGTCTGCTGGTTCCTTGTAG 3816
Query 3774 CTACCCCAATGGCTCTCCTTCTCTTCTGGATAAACTCCCGGTCGAAACCAGCAAAGAAAA 3833
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3817 CTACCCCAATGGCTCTCCATCTCTTCTAGATAAACTCCCGGTCGAAACCAGCAAAGAAAA 3876
Query 3834 TGAGGACCTCTCGTCCAAAGCTATGGCAAGGTTCAACATATTGCTAAGAAGTTTGTCACA 3893
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3877 CGAGGACCTGTCGTCCAAAGCTATGGCAAGGTTCAACATATTGCTAAGAAGTTTGTCACA 3936
Query 3894 GCCAATGTCGCTCAAAGACATAGCCAAGACATGGGACGCCTGTGCTCGGGCTGTGATCTG 3953
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3937 GCCGATGTCGCTCAAAGACATAGCCAAGACATGGGACGCCTGTGCTCGGGCAGTGATCTG 3996
Query 3954 TGAGTACGCACAGCAATTTGGCGGTGGAACTTTCAGCTCAAAATACGGAACTTGGGAGAA 4013
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3997 TGAGTACGCACAGCAATTTGGCGGTGGAACTTTCAGCTCAAAATACGGCACTTGGGAGAA 4056
Query 4014 ATATGTAGCAGCTTCATGAATCTGGCGGATCTCTCAAGTCCTCAACGGCAACTCTGTGAT 4073
||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||
Sbjct 4057 ATATGTAGCAGCTTCCTGAATCTGACGGATCTCTCTCGTCTTCAATAGCAGCTCTGTGAT 4116
Query 4074 TCACTTGCAGTTTCATGTCAAAACTATTGGaaaaaaaaGCCAAAAAGTT 4122
|||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||
Sbjct 4117 TCACTTGCAGGTTCATGTCAAAACTAAAG-AAAAAAA-GCCAAAAAGTT 4163
> AT1G15770.1 | Symbols: | unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana
protein match is: unknown protein (TAIR:AT1G15780.1);
Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae
- 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants
- 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI
BLink). | chr1:5426892-5428280 REVERSE LENGTH=947
Length=947
Score = 545 bits (295), Expect = 1e-153
Identities = 402/452 (89%), Gaps = 13/452 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 3021 GCAAGGTGTAGTTCAGTCCCTAGCAATTGGCACTCCAGGGATCTCTGCCTCTCCTCTCCT 3080
|||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 500 GCAAGGTGTACTTCAATCCCTTGAAATTGGCACTCCAGGGATCTCTGCCTCTCCTCTCCT 559
Query 3081 TCAGGAGTTTACTAGTCCTGATGGAAATATTTTAAATCCTTTGGCAATTACATCTGGAAA 3140
|| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||
Sbjct 560 TCCGGAGCTTACCAGTCCTGATGGAAATATTATAAATCCTTTGACAAGTACTTGTGGAAA 619
Query 3141 ACCGAGTGCTACTGAGCTGCCTATTGAACGCCTTATTAGAGCCGTGAAGTCCATCTCACC 3200
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 620 ATCGAGTGCTACTGAGCTGCCTATTGAACGCCTTATTAGAGCCATGAAATCCATCTCACC 679
Query 3201 ACAAGCGCTTTCTTCTGCAGTAAGTGACATCGGATCGGTTGTAAGCATGGTTGATAGGAT 3260
|||||||||||| ||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 680 ACAAGCGCTTTCGTCTGCAGTATGTGATATTAGATCTGTTGTAAGCATGGTTGATAGGAT 739
Query 3261 AGCTGGTTCAGCACCAGG-AAACGGTTCAAGAGCTTCAGTTGGTGAGGACTTGGTTGCAA 3319
|||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 740 TGCTGGTTCAGTACCAGGCAAA-GGTTCAAGAGCTTCATTTGGTGTGGACTTGGTTGCAA 798
Query 3320 TGACTAAGTGTCGTCTCCAAGCAAGAAACTTCATGACGCAAGAGGGAATGATGGCGACCA 3379
|||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||
Sbjct 799 TGACTAAGTGCCATCTCCAAGAAAGAAACTTCATGACGCAAGA-----TG--G-CGACCA 850
Query 3380 AGAAAATGAAGCGTCACACAACCGCAATGCCA-CTAAGTGTTGCTTCGCTGGGAGGAA-G 3437
||||| ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 851 TGAAAAGGAAGCGTCAGACAACCCCAATGCCATC-AAGTGTTGCTTCATTGGGAGGAAAG 909
Query 3438 CGTTGGTGATAACTACAAGCAGTTTGCTGGTT 3469
||||||| ||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 910 CGTTGGTAATAGCTACAAGCATTTTGCTGGTT 941
Score = 359 bits (194), Expect = 1e-97
Identities = 330/394 (84%), Gaps = 16/394 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1842 AGATCTGAATGAAATCTACCAGAGAGTTGCAGCTAAGTTGCAGC-A-A-GATTCT-GTTC 1897
||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | | |||||| |||
Sbjct 107 AGACCTCAATGAAATCTACCAGAGAGTAGCAGCCAAGTTGCAGCAAGAGGATTCTCTTTC 166
Query 1898 -CA-CAGCAACAAAGATCAGATCAGTTTGAGAAATTGAAACAATTCAAAACAATGTTGGA 1955
|| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||
Sbjct 167 GCATCAGAAACAAAGATCAGATCAGTTTGAGAAATTGAAACGAGGCAAGACAGTGTTGGA 226
Query 1956 GCGAATGATTCAATTTC-TATCTGTTTCAAAGAGCAATATCATGCCCG-CATTAAAGGAT 2013
| ||||| | | |||| ||||| |||||||||||||||||| || | | || ||||||
Sbjct 227 GGGAATGCTACG-TTTCCTATCTCTTTCAAAGAGCAATATCAAACCTGAC-TTGAAGGAT 284
Query 2014 AAGG-TGGCTTATTATGAGAAGCAG-ATTAT-AGGTTTCTTAAATATGCACAGGCCGAGG 2070
| | ||| |||| |||| || ||||| | ||||||||||||||| || | ||||
Sbjct 285 A-GTATGGATTATCGCAAGAA-CAACATTATGAA-TTTCTTAAATATGCAGAGTCTGAGG 341
Query 2071 AAGCCAGTACAGCAAGGGCAGCTTCCGCAATCTCAGATGCAGCCTATGCAGCAACCGCAA 2130
||| |||||||| || ||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| | |
Sbjct 342 AAGACAGTACAGAAACTGCAGCTTACGAAATCTGAGATTCAGCCTATGCAGCAACCACTA 401
Query 2131 TCTCAGACAGTTCAAGATCAATCTCATGATAACCAAACAAATCAGCAAATGCAATCAATG 2190
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||
Sbjct 402 TCTCAGACAGTTCAAGATCAGTCTCATGATGACCAAACAACTCTGCAGATGCAATCAATG 461
Query 2191 AGCATGCAGGGTGCTGGGCCAAGGGCACAACAGA 2224
|||||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 462 AGCATGCAGGGTGCTGGGTCAAGGGTACAACAGA 495
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 207791477906
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5