BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg471852 Length=2577 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G16540.1 | Symbols: SIR3, LOS5, ABA3, ATABA3, ACI2 | molybde... 4145 0.0 > AT1G16540.1 | Symbols: SIR3, LOS5, ABA3, ATABA3, ACI2 | molybdenum cofactor sulfurase (LOS5) (ABA3) | chr1:5659415-5665449 FORWARD LENGTH=2758 Length=2758 Score = 4145 bits (2244), Expect = 0.0 Identities = 2459/2563 (96%), Gaps = 14/2563 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 CGATTTTTCTGAGATTAACAGAGAGACAGAGAGACACTTTTCTTTCGGCGATGGAAGCAT 60 ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CGATTTTTCAGAGATTACCAGAGAGACAGCGAGAAACATTTCTTTCGGCGATGGAAGCAT 60 Query 61 TTCTTAAGGAATTCGGAGATTATTATGGATACCCAGATGGTCCCAAGAACA-TCAAAGAG 119 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct 61 TTCTTAAGGAATTCGGAGATTATTATGGATACCCAGATGGTCCCAAGAACATTC-AAGAG 119 Query 120 ATCCGTGACACCGAATTCAAGAGATTAGATAAAGGTGTTGTATACTTGGATCATGCTGGT 179 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 ATCCGCGACACCGAATTCAAGAGATTAGATAAAGGTGTTGTATACTTGGATCATGCTGGT 179 Query 180 TCTACTTTGTATTCTGAGTTGCAGATGGAAAATATTTTTAAGGACTTTACAAGCAATGTT 239 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 180 TCTACTTTGTATTCTGAGTTGCAGATGGAATATATTTTTAAGGACTTCACAAGCAATGTT 239 Query 240 TTTGGAAATCCACATAGTCAAAGTGATATCAGTTCGGCGACCAGTGACCTTATAGCGGAT 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 240 TTTGGAAATCCACATAGTCAAAGTGATATCAGTTCGGCCACCAGTGACCTTATAGCGGAT 299 Query 300 GCTCGGCATCAGGTGCTTGAATACTTCAATGCATCTCCTGAAGATTACAGTTGCATATTC 359 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 300 GCTCGACATCAGGTGCTTGAATACTTTAATGCATCTCCTGAAGATTACAGTTGCTTATTC 359 Query 360 ACCTCCGGAGCCACAGCAGCGCTGAAGCTTGTCGGAGAGACATTTCCGTGGACCCAAGAC 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 360 ACCTCCGGAGCCACAGCAGCGCTGAAGCTTGTCGGAGAGACTTTTCCGTGGACCCAAGAC 419 Query 420 AGTAATTTTTTGTATACCATGGAGAATCACAACAGTGTGCTTGGTATTAGGGAATATGCA 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 420 AGTAATTTTTTGTATACCATGGAGAATCACAACAGTGTACTTGGTATTAGGGAATATGCA 479 Query 480 TTAGCTCAAGGTGCTTCAGCATGTGCTGTGGATATTGAAGAGGTAGCTAACCAACCAGGC 539 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 480 TTAGCTCAAGGTGCTTCAGCATGTGCAGTGGATATTGAAGAGGCAGCTAACCAACCAGGC 539 Query 540 CAGCTCACAAATTCAGGACCATCTATCAAGGTAAAGCATCGTGCTGTGCAGATGAGAAAC 599 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 CAGCTTACAAATTCAGGACCATCTATCAAGGTAAAGCATCGTGCTGTGCAGATGAGAAAC 599 Query 600 ACTTCTAAAATCCAAAAGGAAGAGTCAAGAGGAAATGCCTATAATCTATTTGCTTTCCCC 659 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 ACTTCTAAACTCCAAAAGGAAGAGTCAAGAGGAAATGCCTATAATCTATTTGCTTTCCCC 659 Query 660 TCGGAGTGCAATTTTTCTGGCCTGAGGTTTAATCTAAATCTGGTGAAGTTGATTAAAGAA 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| Sbjct 660 TCGGAGTGCAATTTTTCTGGCCTGAGGTTTAATCTAGATCTGGTGAAGTTGATGAAAGAA 719 Query 720 AATCCTGAAATCATGCTACAAGGCTCTCCCTTTAGCAAGAGCAAGCGGTGGATGGTCTTG 779 ||| |||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 AATACTGAGACCGTGCTACAAGGCTCCCCCTTTAGCAAGAGCAAGCGGTGGATGGTCTTG 779 Query 780 ATCGATGCTGCAAAGGGTTGTGCTACACTACCACCTGATTTATTGGAGTATCCTGCAGAT 839 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 780 ATTGATGCTGCAAAGGGTTGTGCTACACTACCACCTGATTTATCGGAGTATCCTGCAGAT 839 Query 840 TTTGTTGTTGTGTCATTCTACAAGTTATTTGGTTATCCTACTGGGCTTGGCGCTCTCCTT 899 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 TTTGTTGTTCTGTCATTCTACAAGTTATTTGGTTATCCTACTGGGCTTGGCGCTCTCCTT 899 Query 900 GTACGGAATGATGCAGCCAAATTGCTCAAAAAGACTTATTTTAGTGGGGGCACTGTTGCT 959 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 900 GTACGGAATGATGCAGCCAAATTGCTCAAAAAGACTTATTTTAGTGGAGGCACTGTTGCT 959 Query 960 GCTTCAATTGCTGACATCGACTTTGTAAAAAGAAGGGAAAGGGTGGAGGAGTTTTTTGAG 1019 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 960 GCTTCAATTGCTGACATCGACTTTGTAAAAAGAAGGGAAAGGGTGGAGGAGTTTTTTGAG 1019 Query 1020 GATGGTTCTGCTTCATTCCTGAGCATAGCAGCCATCCGTCATGGCTTCAAATTACTCAAG 1079 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1020 GATGGTTCTGCTTCATTCCTGAGCATAGCAGCCATCCGTCATGGCTTCAAATTACTCAAG 1079 Query 1080 TCGCTTACACCTTCTGCAATTTGGATGCACACAACGTCACTTTCCATATATGTGAAAAAG 1139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1080 TCGCTTACACCTTCTGCAATTTGGATGCACACAACGTCACTTTCCATATATGTGAAAAAG 1139 Query 1140 AAACTTCAGGCTTTACAACATGGAATTGGGGCTGGTGTATGTGTTCTGTATGGCAGTGAA 1199 || ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1140 AAGCTTCAGGCTTTACGACATGGAAACGGGGCTGCTGTATGTGTTCTGTATGGCAGTGAA 1199 Query 1200 AATCTGAAGTTATCTTCGCATAGATCAGGCCCAACGGTTACATTTAACTTGAAAAGACCT 1259 |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1200 AATCTGGAGTTATCTTCACATAAATCAGGCCCAACGGTTACATTCAACTTGAAAAGACCT 1259 Query 1260 GATGGCTCTTGGTTTGGCTACTTGGAGGTGGAAAAACTTGCTTCTTTATCTGGAATTCAG 1319 |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1260 GATGGCTCTTGGTTTGGCTACTTGGAGGTGGAGAAGCTTGCTTCTTTATCTGGAATTCAG 1319 Query 1320 TTACGGACAGGATGTTTTTGCAATCCTGGCGCATGTGCAAAGTATCTCGACTTGTCTCAT 1379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| Sbjct 1320 TTACGGACAGGATGTTTTTGCAATCCTGGCGCATGTGCAAAGTATCTCGAGTTATCCCAT 1379 Query 1380 TCTGATTTATTGTCTAATGTGGAGGCTGGGCATATTTGCTGGGACGACAATGATGTGATA 1439 ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1380 TCTGAGCTACGGTCTAATGTAGAGGCTGGGCATATTTGCTGGGATGACAATGATGTGATA 1439 Query 1440 AATGGAAAACCAACAGGGGCTGTTCGGGTTTCGTTTGGTTACATGTCAACCTTTGAAGAG 1499 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1440 AATGGAAAACCAACAGGGGCTGTTAGGGTTTCGTTTGGTTATATGTCAACCTTTGAAGAT 1499 Query 1500 GCCCAGAAATTTATTGATTTCATCATAAGTTCATTTGTTTCACCTCCAAAGAAGATTGGG 1559 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct 1500 GCCAAGAAATTTATTGATTTCATCATAAGTTCATTTGCTTCACCTCCAAAGAAGACTGGG 1559 Query 1560 AATGGAACTGTCGTCAGTGGAAGGTTTTCTCAACTTCCTAGTGAAGAACTTGAAAGTAAA 1619 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1560 AATGGAACCGTCGTCAGTGGAAGGTTTCCTCAACTTCCTAGTGAAGACCTTGAAAGTAAA 1619 Query 1620 GAATCTTTTCAAAGTCACTACCTTAAGTCAATTACTATATACCCCATCAAGTCATGTGCT 1679 |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1620 GAATCTTTTCCAAGCCACTACCTTAAGTCAATTACTGTATACCCGATCAAGTCATGTGCT 1679 Query 1680 GGATTTTCTGTGATACGTTGGCCACTTTGCAGAACAGGCCTGCTGCATGATCGAGAATGG 1739 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1680 GGATTTTCTGTGATACGTTGGCCACTTTGCAGAACAGGCCTGCTGCATGATCGAGAATGG 1739 Query 1740 ATGGTTCAGGGTCTGACCGGTGAAATTCTTACCCAAAAGAAGGTGCCTGAAATGTCTCTT 1799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1740 ATGGTTCAGGGTCTGACCGGTGAAATTCTTACCCAAAAGAAGGTGCCTGAGATGTCTCTT 1799 Query 1800 ATAAGGACCTTTATCGACCTTGAGGAAGGACTGCTGTCTGTAGAATCTTCTCGCTGCAAA 1859 |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1800 ATAAAAACCTTTATCGACCTTGAGGAAGGACTACTGTCTGTAGAATCTTCTCGCTGCGAA 1859 Query 1860 GACAAGTTGCACATCAGAATCAAGTCTGATTCATATAATCCGAGGAGCGATGAGTTTGAT 1919 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| Sbjct 1860 GACAAGTTGCACATCAGAATCAAGTCTGATTCATATAACCCGAGGAACGATGAGTTTGAT 1919 Query 1920 TCACATGCCAACATGCTTGGAAACCATAATGAGGAAACTAGAATCAATCATTGGTTCAGC 1979 |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | Sbjct 1920 TCACATGCCAACATACTTGAAAACCGTAATGAGGAAACTAGAATCAATCGTTGGTTCACC 1979 Query 1980 AATGCCATTGGTCGACAATGCAAGTTGCTACGGTATTCTAGCTCTACTTCCAAAGACTGC 2039 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1980 AATGCCATTGGTCGACAATGCAAGTTGCTACGGTATTCTAGCTCTACTTCCAAAGACTGC 2039 Query 2040 TTGAACAGAAACAAGAGTCCTGGTTTGTGCAGAGATTTGGAAAGCAATATCAACTTTGCT 2099 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2040 TTGAACAGAAACAAGAGTCCTGGTTTGTGCAGAGATTTGGAAAGCAATATCAACTTTGCT 2099 Query 2100 AATGAAGCTCAGTTCTTGTTAATCTCCGAGGAGAGTGTTGCTGACCTAAACAGAAGATTA 2159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2100 AATGAAGCTCAGTTCTTGTTAATCTCCGAGGAGAGTGTTGCTGACCTAAACAGAAGATTA 2159 Query 2160 GAAGCAAAAGACGAGGATTACAAACGGGCTTATGAGAAACTCAATCCATATAGATTCAGA 2219 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| Sbjct 2160 GAAGCAAAAGACGAGGATTACAAACGGGCTCATGAAAAACTCAATCCACATAGGTTCAGA 2219 Query 2220 CCAAATCTGGTTATATCTGGAGGTGAACCATACGCAGAAGATAAATGGAGAACTGTCAAG 2279 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2220 CCAAATCTGGTTATATCTGGAGGTGAACCATACGGGGAAGATAAATGGAAAACTGTCAAG 2279 Query 2280 ATAGGAGACAAT-ACTTTCACAGTAAGTTCATTGGGCGGTTGTAACCGGTGCCAGATGAT 2338 |||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2280 ATAGGAGACAATCA-TTTCACA-T-----CATTGGGCGGTTGTAACCGGTGCCAGATGAT 2332 Query 2339 AAACATAAGTAATGA-GTCTGGACAAGTGAAGAAATCCAATGAGCCCTTAACAACTTTAG 2397 ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2333 AAACATAAGTAATGAAG-CTGGACTAGTGAAGAAATCCAATGAGCCCTTAACAACTTTAG 2391 Query 2398 CTTCATATAGGAGAGTAAAGGGAAAGATCTTGTTTGGAACTCTTCTGAGATACGAGATTG 2457 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| Sbjct 2392 CTTCATATAGGAGAGTAAAGGGAAAGATCTTGTTTGGAACGCTTTTGAGATACGAGATTG 2451 Query 2458 ATGAGAAAACACAATGTTGGGTTGGAGCTGGGGAAGAAGTAAATCCAGATATTGAATAGG 2517 ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct 2452 ATGAGAAAAGACAATGTTGGATTGGAGTTGGGGAAGAAGTTAATCCAGATATTGAATAAG 2511 Query 2518 TTCAAGCTTGTGTGTGTATTATTGTCTACTATACATAAAAATA 2560 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2512 TTCAAGCTTGTGTGT--ATTATCGTCTACTATACATAAAAATA 2552 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 127925704650 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5