BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg471852
Length=2577
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G16540.1 | Symbols: SIR3, LOS5, ABA3, ATABA3, ACI2 | molybde... 4145 0.0
> AT1G16540.1 | Symbols: SIR3, LOS5, ABA3, ATABA3, ACI2 | molybdenum
cofactor sulfurase (LOS5) (ABA3) | chr1:5659415-5665449
FORWARD LENGTH=2758
Length=2758
Score = 4145 bits (2244), Expect = 0.0
Identities = 2459/2563 (96%), Gaps = 14/2563 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGATTTTTCTGAGATTAACAGAGAGACAGAGAGACACTTTTCTTTCGGCGATGGAAGCAT 60
||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CGATTTTTCAGAGATTACCAGAGAGACAGCGAGAAACATTTCTTTCGGCGATGGAAGCAT 60
Query 61 TTCTTAAGGAATTCGGAGATTATTATGGATACCCAGATGGTCCCAAGAACA-TCAAAGAG 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 61 TTCTTAAGGAATTCGGAGATTATTATGGATACCCAGATGGTCCCAAGAACATTC-AAGAG 119
Query 120 ATCCGTGACACCGAATTCAAGAGATTAGATAAAGGTGTTGTATACTTGGATCATGCTGGT 179
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 ATCCGCGACACCGAATTCAAGAGATTAGATAAAGGTGTTGTATACTTGGATCATGCTGGT 179
Query 180 TCTACTTTGTATTCTGAGTTGCAGATGGAAAATATTTTTAAGGACTTTACAAGCAATGTT 239
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 180 TCTACTTTGTATTCTGAGTTGCAGATGGAATATATTTTTAAGGACTTCACAAGCAATGTT 239
Query 240 TTTGGAAATCCACATAGTCAAAGTGATATCAGTTCGGCGACCAGTGACCTTATAGCGGAT 299
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 240 TTTGGAAATCCACATAGTCAAAGTGATATCAGTTCGGCCACCAGTGACCTTATAGCGGAT 299
Query 300 GCTCGGCATCAGGTGCTTGAATACTTCAATGCATCTCCTGAAGATTACAGTTGCATATTC 359
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 300 GCTCGACATCAGGTGCTTGAATACTTTAATGCATCTCCTGAAGATTACAGTTGCTTATTC 359
Query 360 ACCTCCGGAGCCACAGCAGCGCTGAAGCTTGTCGGAGAGACATTTCCGTGGACCCAAGAC 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 360 ACCTCCGGAGCCACAGCAGCGCTGAAGCTTGTCGGAGAGACTTTTCCGTGGACCCAAGAC 419
Query 420 AGTAATTTTTTGTATACCATGGAGAATCACAACAGTGTGCTTGGTATTAGGGAATATGCA 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 420 AGTAATTTTTTGTATACCATGGAGAATCACAACAGTGTACTTGGTATTAGGGAATATGCA 479
Query 480 TTAGCTCAAGGTGCTTCAGCATGTGCTGTGGATATTGAAGAGGTAGCTAACCAACCAGGC 539
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 480 TTAGCTCAAGGTGCTTCAGCATGTGCAGTGGATATTGAAGAGGCAGCTAACCAACCAGGC 539
Query 540 CAGCTCACAAATTCAGGACCATCTATCAAGGTAAAGCATCGTGCTGTGCAGATGAGAAAC 599
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 CAGCTTACAAATTCAGGACCATCTATCAAGGTAAAGCATCGTGCTGTGCAGATGAGAAAC 599
Query 600 ACTTCTAAAATCCAAAAGGAAGAGTCAAGAGGAAATGCCTATAATCTATTTGCTTTCCCC 659
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 ACTTCTAAACTCCAAAAGGAAGAGTCAAGAGGAAATGCCTATAATCTATTTGCTTTCCCC 659
Query 660 TCGGAGTGCAATTTTTCTGGCCTGAGGTTTAATCTAAATCTGGTGAAGTTGATTAAAGAA 719
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||
Sbjct 660 TCGGAGTGCAATTTTTCTGGCCTGAGGTTTAATCTAGATCTGGTGAAGTTGATGAAAGAA 719
Query 720 AATCCTGAAATCATGCTACAAGGCTCTCCCTTTAGCAAGAGCAAGCGGTGGATGGTCTTG 779
||| |||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 AATACTGAGACCGTGCTACAAGGCTCCCCCTTTAGCAAGAGCAAGCGGTGGATGGTCTTG 779
Query 780 ATCGATGCTGCAAAGGGTTGTGCTACACTACCACCTGATTTATTGGAGTATCCTGCAGAT 839
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 780 ATTGATGCTGCAAAGGGTTGTGCTACACTACCACCTGATTTATCGGAGTATCCTGCAGAT 839
Query 840 TTTGTTGTTGTGTCATTCTACAAGTTATTTGGTTATCCTACTGGGCTTGGCGCTCTCCTT 899
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TTTGTTGTTCTGTCATTCTACAAGTTATTTGGTTATCCTACTGGGCTTGGCGCTCTCCTT 899
Query 900 GTACGGAATGATGCAGCCAAATTGCTCAAAAAGACTTATTTTAGTGGGGGCACTGTTGCT 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 900 GTACGGAATGATGCAGCCAAATTGCTCAAAAAGACTTATTTTAGTGGAGGCACTGTTGCT 959
Query 960 GCTTCAATTGCTGACATCGACTTTGTAAAAAGAAGGGAAAGGGTGGAGGAGTTTTTTGAG 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 GCTTCAATTGCTGACATCGACTTTGTAAAAAGAAGGGAAAGGGTGGAGGAGTTTTTTGAG 1019
Query 1020 GATGGTTCTGCTTCATTCCTGAGCATAGCAGCCATCCGTCATGGCTTCAAATTACTCAAG 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GATGGTTCTGCTTCATTCCTGAGCATAGCAGCCATCCGTCATGGCTTCAAATTACTCAAG 1079
Query 1080 TCGCTTACACCTTCTGCAATTTGGATGCACACAACGTCACTTTCCATATATGTGAAAAAG 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 TCGCTTACACCTTCTGCAATTTGGATGCACACAACGTCACTTTCCATATATGTGAAAAAG 1139
Query 1140 AAACTTCAGGCTTTACAACATGGAATTGGGGCTGGTGTATGTGTTCTGTATGGCAGTGAA 1199
|| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 AAGCTTCAGGCTTTACGACATGGAAACGGGGCTGCTGTATGTGTTCTGTATGGCAGTGAA 1199
Query 1200 AATCTGAAGTTATCTTCGCATAGATCAGGCCCAACGGTTACATTTAACTTGAAAAGACCT 1259
|||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1200 AATCTGGAGTTATCTTCACATAAATCAGGCCCAACGGTTACATTCAACTTGAAAAGACCT 1259
Query 1260 GATGGCTCTTGGTTTGGCTACTTGGAGGTGGAAAAACTTGCTTCTTTATCTGGAATTCAG 1319
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 GATGGCTCTTGGTTTGGCTACTTGGAGGTGGAGAAGCTTGCTTCTTTATCTGGAATTCAG 1319
Query 1320 TTACGGACAGGATGTTTTTGCAATCCTGGCGCATGTGCAAAGTATCTCGACTTGTCTCAT 1379
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||
Sbjct 1320 TTACGGACAGGATGTTTTTGCAATCCTGGCGCATGTGCAAAGTATCTCGAGTTATCCCAT 1379
Query 1380 TCTGATTTATTGTCTAATGTGGAGGCTGGGCATATTTGCTGGGACGACAATGATGTGATA 1439
||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1380 TCTGAGCTACGGTCTAATGTAGAGGCTGGGCATATTTGCTGGGATGACAATGATGTGATA 1439
Query 1440 AATGGAAAACCAACAGGGGCTGTTCGGGTTTCGTTTGGTTACATGTCAACCTTTGAAGAG 1499
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1440 AATGGAAAACCAACAGGGGCTGTTAGGGTTTCGTTTGGTTATATGTCAACCTTTGAAGAT 1499
Query 1500 GCCCAGAAATTTATTGATTTCATCATAAGTTCATTTGTTTCACCTCCAAAGAAGATTGGG 1559
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1500 GCCAAGAAATTTATTGATTTCATCATAAGTTCATTTGCTTCACCTCCAAAGAAGACTGGG 1559
Query 1560 AATGGAACTGTCGTCAGTGGAAGGTTTTCTCAACTTCCTAGTGAAGAACTTGAAAGTAAA 1619
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1560 AATGGAACCGTCGTCAGTGGAAGGTTTCCTCAACTTCCTAGTGAAGACCTTGAAAGTAAA 1619
Query 1620 GAATCTTTTCAAAGTCACTACCTTAAGTCAATTACTATATACCCCATCAAGTCATGTGCT 1679
|||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1620 GAATCTTTTCCAAGCCACTACCTTAAGTCAATTACTGTATACCCGATCAAGTCATGTGCT 1679
Query 1680 GGATTTTCTGTGATACGTTGGCCACTTTGCAGAACAGGCCTGCTGCATGATCGAGAATGG 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 GGATTTTCTGTGATACGTTGGCCACTTTGCAGAACAGGCCTGCTGCATGATCGAGAATGG 1739
Query 1740 ATGGTTCAGGGTCTGACCGGTGAAATTCTTACCCAAAAGAAGGTGCCTGAAATGTCTCTT 1799
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1740 ATGGTTCAGGGTCTGACCGGTGAAATTCTTACCCAAAAGAAGGTGCCTGAGATGTCTCTT 1799
Query 1800 ATAAGGACCTTTATCGACCTTGAGGAAGGACTGCTGTCTGTAGAATCTTCTCGCTGCAAA 1859
|||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1800 ATAAAAACCTTTATCGACCTTGAGGAAGGACTACTGTCTGTAGAATCTTCTCGCTGCGAA 1859
Query 1860 GACAAGTTGCACATCAGAATCAAGTCTGATTCATATAATCCGAGGAGCGATGAGTTTGAT 1919
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 1860 GACAAGTTGCACATCAGAATCAAGTCTGATTCATATAACCCGAGGAACGATGAGTTTGAT 1919
Query 1920 TCACATGCCAACATGCTTGGAAACCATAATGAGGAAACTAGAATCAATCATTGGTTCAGC 1979
|||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1920 TCACATGCCAACATACTTGAAAACCGTAATGAGGAAACTAGAATCAATCGTTGGTTCACC 1979
Query 1980 AATGCCATTGGTCGACAATGCAAGTTGCTACGGTATTCTAGCTCTACTTCCAAAGACTGC 2039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 AATGCCATTGGTCGACAATGCAAGTTGCTACGGTATTCTAGCTCTACTTCCAAAGACTGC 2039
Query 2040 TTGAACAGAAACAAGAGTCCTGGTTTGTGCAGAGATTTGGAAAGCAATATCAACTTTGCT 2099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 TTGAACAGAAACAAGAGTCCTGGTTTGTGCAGAGATTTGGAAAGCAATATCAACTTTGCT 2099
Query 2100 AATGAAGCTCAGTTCTTGTTAATCTCCGAGGAGAGTGTTGCTGACCTAAACAGAAGATTA 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 AATGAAGCTCAGTTCTTGTTAATCTCCGAGGAGAGTGTTGCTGACCTAAACAGAAGATTA 2159
Query 2160 GAAGCAAAAGACGAGGATTACAAACGGGCTTATGAGAAACTCAATCCATATAGATTCAGA 2219
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 2160 GAAGCAAAAGACGAGGATTACAAACGGGCTCATGAAAAACTCAATCCACATAGGTTCAGA 2219
Query 2220 CCAAATCTGGTTATATCTGGAGGTGAACCATACGCAGAAGATAAATGGAGAACTGTCAAG 2279
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2220 CCAAATCTGGTTATATCTGGAGGTGAACCATACGGGGAAGATAAATGGAAAACTGTCAAG 2279
Query 2280 ATAGGAGACAAT-ACTTTCACAGTAAGTTCATTGGGCGGTTGTAACCGGTGCCAGATGAT 2338
|||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 ATAGGAGACAATCA-TTTCACA-T-----CATTGGGCGGTTGTAACCGGTGCCAGATGAT 2332
Query 2339 AAACATAAGTAATGA-GTCTGGACAAGTGAAGAAATCCAATGAGCCCTTAACAACTTTAG 2397
||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2333 AAACATAAGTAATGAAG-CTGGACTAGTGAAGAAATCCAATGAGCCCTTAACAACTTTAG 2391
Query 2398 CTTCATATAGGAGAGTAAAGGGAAAGATCTTGTTTGGAACTCTTCTGAGATACGAGATTG 2457
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 2392 CTTCATATAGGAGAGTAAAGGGAAAGATCTTGTTTGGAACGCTTTTGAGATACGAGATTG 2451
Query 2458 ATGAGAAAACACAATGTTGGGTTGGAGCTGGGGAAGAAGTAAATCCAGATATTGAATAGG 2517
||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2452 ATGAGAAAAGACAATGTTGGATTGGAGTTGGGGAAGAAGTTAATCCAGATATTGAATAAG 2511
Query 2518 TTCAAGCTTGTGTGTGTATTATTGTCTACTATACATAAAAATA 2560
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2512 TTCAAGCTTGTGTGT--ATTATCGTCTACTATACATAAAAATA 2552
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 127925704650
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5