BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg472044
Length=4305
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G18270.3 | Symbols: | ketose-bisphosphate aldolase class-II... 4294 0.0
> AT1G18270.3 | Symbols: | ketose-bisphosphate aldolase class-II
family protein | chr1:6283414-6293871 REVERSE LENGTH=4501
Length=4501
Score = 4294 bits (2325), Expect = 0.0
Identities = 2500/2585 (97%), Gaps = 9/2585 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CGGAGAATCGTAGTGATCGGAGAAGATGGGAGGCGTCGTTGGGTTTGTTGGTCTTGATTC 60
|||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGGAGAATTGTAGTGATCGGAGAAAATGAGTGGCGTGGTTGGGTTTGTTGGTCTTGATTC 134
Query 61 TTTCAGCTTCGAATTAGCTTCTTCGCTTCTTCGTTCTGGGTTTAAGGTTCAAGCATTCGA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 135 TTTCAGCTTCGAATTAGCTTCTTCGCTTCTTCGTTCTGGGTTTAAGGTTCAAGCATTCGA 194
Query 121 GATAAGTACAGAATTAGTGGAGAAGTTCACTGAATTGGGAGGACACAAATGTGACAGCCC 180
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 195 GATAAGTACAGAATTAGTGGAGAAGTTCATTGAATTGGGAGGACACAAATGTGACAGCCC 254
Query 181 TGCTGATGTTGGGAAAGGTGCAGCAGCCGTGGTGGTTTTACTATCCCACCCTGACCAAAT 240
||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 255 TGCAGATGTTGGGAAAGCTGCAGCAGCCGTTGTGGTTGTACTATCCCACCCTGACCAAAT 314
Query 241 TCAAGATGTCATTTTTGGTGATGAGGGTGTTATGAAAGGCCTACAGAAGGACACTGTATT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||
Sbjct 315 TCAAGATGTCATTTTTGGTGATGAGGGTGTTATGAAAGGTCTACAGAAGGACGCTGTATT 374
Query 301 GCTTTTGTCTTCGACAATTTCGACTTTGCAACTCCAGAAGCTAGAGAAACAACTTACAGA 360
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 375 GCTTTTGTCTTCGACAATATCGACTTTGCAACTCCAGAAACTAGAGAAACAACTTACAGA 434
Query 361 GAACAGAGAGCAGATTTTTGTAGTTGATGCCTATGTTTTAAAAGGGATGTCTGAGCTTCT 420
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 GAAAAGAGAGCAGATTTTTGTAGTTGATGCCTATGTTTTAAAAGGGATGTCTGAGCTTCT 494
Query 421 TGATGGAAAACTAATGATAATAGCATCTGGAAGGTCAGATTCGATCACAAGAGCACAACC 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 495 TGATGGAAAACTAATGATAATAGCATCTGGAAGGTCAGATTCGATCACAAGAGCACAACC 554
Query 481 CTTTCTTACTGCAATGTGTCAGAAGCTGTACACTTTTGATGGAGAAATTGGTGCTGGAAG 540
|| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 555 CTATCTTACTGCAATGTGTCAAAATCTGTACACCTTTGAGGGAGAAATTGGTGCTGGAAG 614
Query 541 TAAAGTTAAAATGGTGAATGAGCTGCTTGAGGGCATTCATCTTGTTGCTGCTGTGGAGGC 600
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 615 TAAAGTTAAAATGGTGAATGAGTTGCTTGAGGGCATACATCTTGTTGCTGCTGTGGAGGC 674
Query 601 TATATCTTTAGGTTCTCAGGCGGGTGTGCATCCGTGGATACTGTATGACATCATTTCCAA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 675 TATATCTTTAGGTTCTCAGGCGGGTGTGCATCCATGGATACTTTATGACATAATTTCCAA 734
Query 661 TGCTGCTGGAAATTCATGGATTTACAAGAATCATATTCCGTTGTTGCTAAAAGATGATAT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 735 TGCTGCTGGAAATTCATGGATTTACAAGAATCATATTCCGTTGTTGCTAAAAGATGACAT 794
Query 721 AGAGGGTCGCTTCCTCGATGTTCTCTCTCAGAATCTGGGCATTGTTGAAGATAAAGCCAA 780
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 795 AGAGGGTCGCTTCCTCGATGTTCTCTCTCAGAATCTGGCCATTGTTGAAGATAAAGCCAA 854
Query 781 ATCGCTCCCATTTCCTGTCCCACTTTTGGCAGTTGCACGCCAACAACTAATCTCCGGAAT 840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 855 ATCGCTCCCATTTCCTGTCCCACTTTTGGCAGTTGCACGCCAACAACTAATCTCTGGAAT 914
Query 841 ATCACAGATGCAGGGAGATGATACAGCTACTTCATTAGCTAAGATCTGGGAAAAAGTACT 900
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 915 ATCACAGATGCAGGGAGATGATACAGCTACTTCATTGGCTAAGATCTCGGAAAAAGTACT 974
Query 901 TGGTGTTGGCATATTGGAAGCAGCCAATAGAGAACTTTATAAGCCAGAGGATTTGGCCAA 960
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 975 TGGTGTTGGCATATTAGAAGCAGCCAATAGAGAACTTTATAAGCCAGAGGATTTGGCCAA 1034
Query 961 AGAAATTACTACTCAAGCAAAGCCTGTTAATAGAGTTGGTTTTATTGGTCTTGGAGCAAT 1020
||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 AGAAATTACTACTCAAGCAAAGCCTGTGAATAGAATTGGTTTTATTGGTCTTGGAGCAAT 1094
Query 1021 GGGTTTTGGCATGGCAGCACACCTGTTGAAATCAAACTTTTCTGTCCGTGGTTATGACGT 1080
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1095 GGGTTTTGGCATGGCAGCACACCTGTTGAAATCAAATTTTTCTGTCTGTGGTTATGACGT 1154
Query 1081 ATACAAGCCAACACTTGTCAGATTTGAGAATGTCGGGGGATTGGCGGCAAATTCTCCAGC 1140
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155 ATACAAGCCAACACTTGTCAGATTTGAGAATGCCGGGGGATTGGCGGCAAATTCTCCAGC 1214
Query 1141 TGAAGTGACGAAAGATGTAGATGTTCTTGTAATTATGGTAACAAACGAGGTTCAGGCTGA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1215 TGAAGTGACGAAAGATGTAGATGTTCTTGTAATTATGGTAACAAACGAGGTTCAGGCTGA 1274
Query 1201 GGATGTCTTGTATGGACATCTTGGAGCGGTTGAAGCTATTCCATCTGGAGCAACTGTTGT 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1275 GGATGTCTTGTATGGACATCTTGGAGCGGTTGAAGCTATACCATCTGGAGCAACTGTTGT 1334
Query 1261 ACTTGCGTCAACAGTCTCTCCCGCGTTTGTTAGCCAACTTGAAAGGCGTCTAGAAAATGA 1320
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1335 ACTTGCGTCAACAGTATCTCCCGCGTTTGTTAGCCAACTTGAAAGGCGTCTAGAAAATGA 1394
Query 1321 GGGAAAGGACCTAAAGCTGGTGGATGCTCCTGTTTCTGGTGGTGTCAAGAGGGCTGCCAT 1380
|||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395 GGGAAAAGACCTAAAGCTAGTTGATGCTCCTGTGTCTGGTGGTGTCAAGAGGGCTGCCAT 1454
Query 1381 GGGGGAACTTACGATAATGGCTTCAGGTACCGATGAAGCACTTAAGTCTGCGGGACTTGT 1440
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1455 GGGGGAGCTTACGATAATGGCTTCAGGTACCGATGAAGCACTTAAGTCTGCGGGACTTGT 1514
Query 1441 GTTATCAGCATTAAGTGAGAAGCTCTACGTGATTCAAGGAGGTTGTGGGGCAGGAAGTGG 1500
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1515 GTTATCAGCATTAAGTGAGAAGCTCTACGTGATTAAAGGAGGTTGTGGGGCAGGAAGTGG 1574
Query 1501 TGTAAAAATGGTCAATCAATTGCTTGCGGGAGTTCATATCGGATCAGCTGCCGAGGCAAT 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1575 TGTAAAAATGGTCAATCAATTGCTTGCGGGAGTTCATATCGCATCAGCTGCCGAGGCAAT 1634
Query 1561 GGCATTCGGAGCTCGGTTAGGTCTGAATACTCGAAAGCTATTCAATGTGATTTCCAACAT 1620
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1635 GGCATTTGGAGCTCGGTTAGGTCTGAATACTCGAAAGCTATTCAATGTTATTTCCAACAG 1694
Query 1621 CGGTGGAACATCTTGGATGTTTGAAAATCGTGTTCCGCACATGCTCGATAATGATTATAC 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1695 CGGTGGAACATCTTGGATGTTTGAAAATCGTGTTCCGCACATGCTGGATAATGATTACAC 1754
Query 1681 ACCATACTCTGCTCTTGATATTTTTGTCAAGGATTTGGGAATTGTTACTCGAGAAGGTTC 1740
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1755 ACCATACTCTGCTCTTGATATTTTTGTCAAGGATTTGGGAATTGTTACCCGAGAAGGTTC 1814
Query 1741 ATCCCGTAAAGTTCCACTCCATATATCAACAGTGGCACACCAGCTATTCTTAGCCGGCTC 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1815 ATCCCGTAAAGTTCCACTCCATATATCAACAGTGGCACACCAGCTATTCTTAGCCGGCTC 1874
Query 1801 TGCAGCGGGCTGGGGACGGATTGATGATGCTGGAGTGGTGAAGGTATATGAAACCCTTAC 1860
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 1875 TGCTGCGGGCTGGGGACGGATAGATGATGCTGGAGTGGTGAAGGTTTATGAAACCCTTGC 1934
Query 1861 TGGGATTAAAGTCGAAGGGAGACTTCCTGTTCTGAAGAAACAAGACCTACTGAATTCTCT 1920
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1935 TGGAATTAAAGTCGAAGGGAGACTTCCTGTTCTGAAGAAACAAGACCTACTGAAATCTCT 1994
Query 1921 TCCATCTGAATGGCCTTTAGACCCTACAGCTGACATACATAGACTAAATATGGGAAACTC 1980
|||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 TCCAGCTGAATGGCCTTCAGACCCTACAACTGACATACATAGACTAAATATGGGAAACTC 2054
Query 1981 GAAGACATTGGTTGTTCTTGATGATGATCCAACCGGGACACAAACTGTTCATGACGTAGA 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2055 GAAGACATTGGTTGTTCTTGATGATGATCCAACTGGCACACAAACTGTTCATGACGTAGA 2114
Query 2041 GGTTTTAACTGAATGGAGTGTTGAATCTATTTCTGAGCAGTTCAGAAAAAAGCCTGCATG 2100
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2115 GGTTTTAACTGAATGGAGTGTTGAATCTATTTCTGAGCAGTTTAGAAAAAAGCCTGCATG 2174
Query 2101 CTTCTTCATTTTGACAAATTCAAGGTCATTGAGCCCTGAGAAGGCTAGTGCGTTGATCAA 2160
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2175 CTTCTTCATTTTGACAAATTCAAGGTCCCTGAGCCCTGAGAAGGCTAGTGAATTGATCAA 2234
Query 2161 AGACATCTGTTCCAACCTATGTGCTGCATCAAAAGAAGTTGGGAACGCTGACTACACTAT 2220
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||
Sbjct 2235 AGACATCTGTTCCAACCTATGTGCTGCATCAAAAGAAGTTGGCAATGCTGACTACACGAT 2294
Query 2221 TGTTCTGAGGGGTGATTCAACATTACGTGGTCATTTTCCTCAGGCAAGTTTGGAAGCAGA 2280
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 2295 TGTTCTGAGGGGTGATTCAACATTACGTGGTCATTTTCCTCAGG-AAG--------CAGA 2345
Query 2281 TGCTGCTGTCTCAATACTTGGGGAAATGGATGCGTGGATTATTTGCCCCTTCTTCCTTCA 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2346 TGCTGCTGTCTCAATACTTGGGGAAATGGATGCATGGATTATTTGCCCCTTCTTCCTTCA 2405
Query 2341 AGGTGGACGTTATACTATTGATGATGTGCATTATGTTGCAGATTCTGATAGGCTCGTTCC 2400
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2406 AGGGGGACGTTATACTATTGATGATGTGCATTATGTTGCGGATTCTGATAGGCTCGTTCC 2465
Query 2401 TGCAGGAGAGACAGAGTTTGCCAAAGATGCATCCTTTGGATATAAATCCTCAAATCTCCG 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2466 TGCAGGAGAGACAGAGTTTGCCAAAGATGCATCCTTTGGATATAAATCCTCAAATCTCCG 2525
Query 2461 TGAGTGGGTTGAGGAGAAAACAGCTGGCATCATTCCGGCTAACAGCGTTCAGTCGATCCC 2520
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2526 TGAGTGGGTTGAGGAGAAAACAGCTGGCGTCATTCCGGCTAACAGCGTTCAGTCGATCTC 2585
Query 2521 AATTCAGCTTTTAAGAAAAGGTGGCCCTGATGCAGTGTGTGAGTTTCTATGCAGTTTAAA 2580
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2586 AATTCAGCTTTTAAGAAAAGGTGGCCCTGATGCAGTGTGTGAGTTTCTGTGCAGTTTAAA 2645
Query 2581 GAAGG 2585
|||||
Sbjct 2646 GAAGG 2650
Score = 2728 bits (1477), Expect = 0.0
Identities = 1651/1734 (95%), Gaps = 16/1734 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2584 GGGGTCTGCATGTATTGTCAACGCCGCTAGTGAAAGAGACATGGCTGTATTTGCAGCGGG 2643
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2709 GGGGTCTACATGTATTGTCAACGCCGCTAGTGAAAGAGACATGGCTGTATTTGCAGCCGG 2768
Query 2644 GATGATCCAGGCAGAACTGAAAGGAAGATCCTTTTTATGCCGCACTGCTGCTAGCTTTGT 2703
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2769 GATGATCCAGGCAGAACTGAAAGGGAGATCCTTTTTATGCCGCACTGCTGCTAGCTTTGT 2828
Query 2704 GTCTGCTCTAATAGGGATTATTCCAAAAGATCCAGTGTTGCCGAAAGATTTCGCATCTAA 2763
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 2829 GTCTGCTCTAATAGGGATTATTCCAAAAGATCCTGTGTTGCCAAAAGATTTCGAATCTAA 2888
Query 2764 CAAAGAAAGCAGTGGTGCACTAATAGTTGTAGGCTCATATGTCCCGAAAACAACAAAGCA 2823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2889 CAAAGAAAGCAGTGGTGCACTAATAGTTGTAGGCTCATATGTCCCGAAAACAACAAAGCA 2948
Query 2824 GGTTGAAGAACTTCAATTACAACATAAGCAGAAGTTAAGGAGCATCGAGATCTCTGTAGA 2883
||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2949 GGTTGAAGAACTTCAATCACAACATAACCAGAATTTAAGGAGCATCGAGATCTCTGTAGA 3008
Query 2884 AAAAGTTGCTCTCAAGTCATCCGAAGTGAGAGAGGAAGAAATCAGAAGAGCAGTTGAGAT 2943
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3009 AAAAGTTGCTCTCAAGTCATCTGAAGTGAGAGATGAAGAAATCAGAAGAGCAGTTGAGAT 3068
Query 2944 GGCTGATGCTTTCCTTCGGGCTGGCAGGGAGACTCTGATTATGAGCAGTCGTGAACTCAT 3003
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3069 GGCCGATGCTTTCCTTCGGGCTGGCAGGGAGACTCTAATTATGAGCAGTCGTGAACTCAT 3128
Query 3004 CACAGGG-AAAACATCTTCGGAAAGTCTTGATATTAACAGCAAAGTGAGCTCCGCTCTGG 3062
||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3129 CAC-GGGAAAAACATCTTCGGAAAGTCTTGATATTAACAGCAAAGTGAGCTCCGCTCTGG 3187
Query 3063 TTGAAGTAGTGAGCCAGATATCTACCAGACCTCGTTATATTCTTGCTAAGGGTGGAATTA 3122
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3188 TTGAAGTAGTGAGCCAGATATCGACCAGACCTCGTTATATTCTTGCTAAGGGTGGAATTA 3247
Query 3123 CGTCATCAGACACAGCAACAAAAGCACTTAAAGCAAGACGTGCACTTGTGATTGGTCAAG 3182
||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3248 CGTCATCAGACACAGCAACGAAAGCCCTGAAAGCACGACGTGCACTTGTGATTGGTCAAG 3307
Query 3183 CCCTTGCTGGTGTTCCAGTATGGAAGTTAGGTCCAGAAAGTAGACATCCCGGAGTCCCCT 3242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 3308 CCCTTGCTGGTGTTCCAGTATGGAAGTTAGGTCCAGAAAGTAGACATCCAGGGGTCCCCT 3367
Query 3243 ACATTGTTTTCCCAGGTAATGTTGGTAACAGCACAGCTCTTGCAGAAGTTGTGAAGTCTT 3302
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3368 ACATTGTTTTCCCTGGTAATGTTGGTAACAGCACAGCGCTTGCAGAAGTTGTGAAGTCTT 3427
Query 3303 GGTCAGTTGTAGCAAGACGGTCGACAAAAGAGCTGCTTCTTAATGCAGAAAAAGGTGGAT 3362
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3428 GGTCAGTGGTAGCAGGACGGTCGACAAAAGAGCTGCTTCTGAATGCAGAAAAAGGTGGAT 3487
Query 3363 ATGCAGTTGGAGCATTTAACGTGTATAACCTGGAAGGAGTAGAAGCTGTTGTAGCAGCTG 3422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |
Sbjct 3488 ATGCAGTTGGAGCATTTAACGTGTATAACCTGGAAGGAATAGAAGCTGTTGTAGCGGCCG 3547
Query 3423 CAGAGGAAGAAAACAGTCCTGCCATATTGCAGGTCCATCCAGGTGCCTTCAAGCAAGGAG 3482
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 3548 CAGAGGAAGAAAATAGTCCTGCTATATTGCAGGTCCATCCAGGTGCCTTTAAACAAGGAG 3607
Query 3483 GCATTCCGTTGGTTTCATGTTGCATCTCTGCAGCTGAACAAGCAAGGGTTCCAATATCCG 3542
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3608 GCATTCCTTTGGTTTCATGTTGCATCTCTGCAGCTGAACAAGCCAGGGTTCCAATATCCG 3667
Query 3543 TACACTTTGACCATGGAACTACAAAGCATGAGCTATTAGAAGCTCTTGAGCTAGGATTAG 3602
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3668 TACACTTTGATCATGGAACTACAAAGCATGAGCTATTAGAAGCTCTTGAGCTAGGACTAG 3727
Query 3603 ATTCAGTGATGGTAGATGGTTCTCATCTTTCCTTCACAGAAAATTTATCCTACACGAAAT 3662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3728 ATTCAGTGATGGTAGATGGTTCTCATCTTTCCTTCACAGAAAATTTATCCTACACGAAAT 3787
Query 3663 CCATAACAGAGTTGGCCCGTTCCAAAAACATTATGGTGGAAGCTGAACTAGGACGACTCT 3722
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3788 CCATAACAGAGTTGGCCCGTTCCAAAAACATTATGGTGGAAGCTGAACTAGGCCGACTCT 3847
Query 3723 CAGGAACGGAGGATGGCTTGACTGTTGAAGATTATGAAGCAAAGCTCACCAACGTTCACC 3782
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3848 CAGGAACAGAGGATGGCTTGACTGTTGAAGACTATGAAGCAAAGCTCACCAACGTTAACC 3907
Query 3783 AGGCTCAGGAATTTATGGAAACTGGTATAGATGCTTTGGCTGTGTGTATAGGAAATGTCC 3842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3908 AGGCTCAGGAATTTATGGAAACTGGTATAGATGCTTTGGCTGTGTGTATAGGAAATGTCC 3967
Query 3843 ATGGAAAATACCCCGAGTCCGGTCCAAACCTCAAGCTTGACTTACTTAAGGAACTGCACA 3902
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3968 ATGGAAAGTACCCCAAGTCCGGTCCAAACCTCAAGCTTGATTTACTTAAGGAACTGCACG 4027
Query 3903 CCTTAAGCTCAAAGAAAGGCGTCTTTCTCGTTCTTCATGGAGCTTCTGGTTTGTCTGAGA 3962
|||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4028 CCTTAAGCTCGAAGAAAGGCGTTTTTCTTGTTCTTCACGGAGCTTCTGGTTTGTCTGAGA 4087
Query 3963 AGCTTATCAAGGAATGCATTGAAAATGGAGTGAGGAAGTTCAACGTGAACACAGAAGTAA 4022
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4088 ACCTTATCAAGGAATGCATTGAGAATGGAGTGAGGAAGTTCAACGTGAACACAGAAGTAA 4147
Query 4023 GAACGGCTTACATGGAAGCTCTTAGCTCTGGGAAGAAGACCGACCTTGTTGATGTCATGT 4082
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4148 GAACGGCTTACATGGAAGCTCTTAGCTCTGGGAAGAAGACCGACATTGTTGATGTCATGT 4207
Query 4083 CGGCAACAAAAGCAGCCATGAAAGCTGTGATCACCGATAAGATCCGTCTCTTTGGCTCTG 4142
| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4208 CCGCAACAAAAGCAGCCATGAAAGCTGTGATCGCAGATAAGATCCGTCTCTTTGGCTCTG 4267
Query 4143 CTGGAAAAGCTTGAGTTATTGTTGATGAACACTGTCCGATCAATTTGTTTAGTTCAGTTG 4202
| ||||||||||||||| ||| | | || | ||||||||||||| ||| ||| || |||
Sbjct 4268 CCGGAAAAGCTTGAGTTGTTGATAAAAAA-A-TGTCCGATCAATTAGTTAAGTACAATTG 4325
Query 4203 TACATCACATCCAAAGAATAAAAAA-CAA-ATAATATTAGATCACATCCAAAGAAGATGA 4260
||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4326 TACATCACATCCAAAGAATAAAAAAACAACA-AATATTACATCACATCCAAAGAAGATGA 4384
Query 4261 ATGCA----ATGCA--G-A--TGCACTGTTGTTGGAAATAAAGAAATCAGTTTT 4305
||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4385 ATGCATTGTATGCAATGCAGATGCAGTGTTGTTGGAAATAAAGAAATCATTTTT 4438
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 214614182154
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5