BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg472057 Length=2955 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G18370.1 | Symbols: HIK, ATNACK1, NACK1 | ATP binding microt... 4854 0.0 > AT1G18370.1 | Symbols: HIK, ATNACK1, NACK1 | ATP binding microtubule motor family protein | chr1:6319650-6324222 REVERSE LENGTH=3118 Length=3118 Score = 4854 bits (2628), Expect = 0.0 Identities = 2850/2959 (96%), Gaps = 7/2959 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGACTATAAAAACACCGGGAACTCCGGTTTCGAAGATGGACAGAACACCAGCTGTAACA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 112 ATGACTATAAAAACACCGGGAACTCCGGTTTCGAAGATGGACAGAACACCAGCTGTAACA 171 Query 61 CCAGGTGGAAGCTCAAGATCCAGGGAAGAGAAGATTGTTGTCACTGTAAGGTTAAGACCA 120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct 172 CCAGGTGGAAGCTCAAGATCCAGGGAAGAGAAGATTGTTGTTACTGTAAGGTTAAGGCCA 231 Query 121 TTGAACAAGAAAGAACTGTTAGCTAAAGACCAAGTTGCTTGGGAATGTGTAGATGACCAC 180 |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 232 ATGAATAAGAGAGAACTGTTAGCTAAAGACCAAGTTGCTTGGGAATGTGTAAATGACCAC 291 Query 181 ACCATTGTGTCTAAACCACAAGTTCAAGAACGTTTGCATCATCAGTCCTCATTTACATTT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 292 ACCATTGTGTCTAAACCACAAGTTCAAGAACGTTTGCATCATCAGTCCTCATTTACATTT 351 Query 241 GATAAAGTTTTTGGACCAGAGAGTTTAACTGAGAATGTGTATGAAGATGGTGTTAAGAAT 300 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 352 GATAAAGTTTTTGGACCAGAGAGTTTAACAGAGAATGTGTATGAAGATGGTGTTAAGAAT 411 Query 301 GTTGCATTGTCTGCTTTGATGGGCATCAATGCAACAATTTTTGCATATGGACAAACGAGC 360 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct 412 GTTGCATTGTCTGCTTTGATGGGCATAAATGCAACAATATTTGCATATGGACAAACAAGC 471 Query 361 AGTGGTAAGACATATACCATGAGAGGAGTAACAGAGAAAGCTGTCAATGATATTTACAAT 420 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 472 AGTGGAAAGACATATACCATGAGAGGAGTAACGGAGAAAGCTGTCAATGATATTTACAAT 531 Query 421 CACATTATTAAGACCCCTGAAAGAGATTTTACTATCAAGATTTCTGGTCTGGAAATATAT 480 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 532 CACATAATTAAGACCCCTGAAAGAGATTTTACTATCAAGATTTCTGGTCTGGAAATATAT 591 Query 481 AATGAAAATGTCAGAGATCTGCTGAATTCAGATTCCGGACGTGCCCTTAAACTCCTTGAT 540 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 592 AATGAAAATGTCAGAGATCTGCTCAATTCAGATTCGGGACGTGCCCTTAAACTCCTTGAT 651 Query 541 GATCCAGAGAAAGGTACCGTGGTTGAAAAACTGGTTGAAGAAACAGCTAATAACGATCAA 600 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 652 GATCCAGAGAAAGGTACTGTGGTTGAAAAACTGGTTGAAGAAACAGCTAATAACGAT-AA 710 Query 601 -CATTTGCGGCATCTGATTAGCATTTGTGAAGCTCAAAGACAAGTTGGGGAAACTGCTTT 659 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 711 CCATTTGCGGCATCTGATTAGCATTTGTGAAGCTCAAAGACAAGTTGGAGAAACTGCTTT 770 Query 660 GAACGATACCAGCTCCCGGTCACACCAAATAATTAGACTAACGATACAAAGTACTCACCG 719 ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| Sbjct 771 GAATGATACTAGCTCGCGGTCACACCAAATAATCAGACTGACAATACAAAGTACTCACCG 830 Query 720 CGAAAATTCAGATTGTGTGAGGTCATACATGGCTAGTCTGAACTTTGTGGACTTAGCAGG 779 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 831 CGAAAATTCAGATTGTGTGAGGTCATATATGGCTAGTCTGAACTTTGTGGACTTAGCAGG 890 Query 780 AAGCGAAAGAGCATCACAATCGCAGGCAGATGGAACGAGACTCAGGGAAGGTTGCCATAT 839 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 891 AAGCGAAAGAGCATCACAATCGCAGGCAGATGGAACGAGACTCAGGGAAGGTTGTCATAT 950 Query 840 CAATCTAAGTCTAATGACACTTACAACTGTCATAAGGAAGTTAAGTGTGGGGAAAAGAAG 899 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 951 CAATCTAAGTCTAATGACACTTACAACTGTCATAAGGAAATTAAGTGTGGGGAAAAGAAG 1010 Query 900 CGGCCATGTACCTTACAGAGACTCCAAGCTTACTCGGATTTTACAGCATTCACTAGGTGG 959 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1011 CGGCCATATACCTTACAGAGACTCCAAGCTTACTAGGATTTTACAGCATTCACTAGGTGG 1070 Query 960 GAATGCTCGAACAGCCATTATATGTACATTGAGTCCAGCTTTGGCTCATGTTGAACAATC 1019 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1071 GAATGCTCGAACAGCCATTATATGTACATTGAGTCCAGCTTTGGCTCATGTTGAACAATC 1130 Query 1020 AAGAAATACTCTATACTTTGCCAACCGAGCCAAGGAAGTTACAAACAATGCCCACGTGAA 1079 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1131 AAGAAATACTCTATACTTCGCCAACCGAGCCAAGGAAGTTACAAACAATGCCCACGTGAA 1190 Query 1080 CATGGTTGTCTCTGATAAGCAACTAGTGAAACATCTTCAGAAAGAATTGGCTAGATTGGA 1139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1191 CATGGTTGTCTCTGATAAGCAACTAGTGAAACATCTTCAGAAAGAAGTGGCTAGATTGGA 1250 Query 1140 GGCCGAGCGTCGAACCCCTAATCCATCAAGTGAAAAGGATTTCAAGATCCAGCAGATGGA 1199 |||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1251 GGCCGAGCGTCGCACCCCTGGTCCATCGACAGAAAAGGATTTCAAGATCCAGCAGATGGA 1310 Query 1200 AATGGAAATCGAAGAGCTTAGGAGACAAAGAGATGATGCACAAATTCAACTTGAGGAGTT 1259 ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1311 AATGGAAATCGGAGAGCTTAGAAGACAAAGAGATGATGCACAAATTCAACTTGAGGAGTT 1370 Query 1260 GCGCCAAAAGCTTCAAGGGGATCAGCAACAAAATAAGGGCCTAAATCCTTTTGAATCTCC 1319 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1371 ACGCCAAAAGCTTCAAGGGGATCAGCAACAAAATAAGGGCTTAAATCCTTTTGAATCTCC 1430 Query 1320 AGACCCACCGGTCAGAAAATGTCTTTCCTATTCTGTTGCCGTGACACCTAGCACGGAGAA 1379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| Sbjct 1431 AGACCCACCGGTCAGAAAATGTCTTTCCTATTCTGTTGCCGTAACGCCTAGCTCGGAGAA 1490 Query 1380 CAAAACGCTAAACCGGAATGAGAGAACAAGAAAGACCACGATACGCCAATCTATGATACG 1439 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1491 CAAAACGCTAAACCGGAATGAGAGAGCAAGAAAGACTACGATGCGCCAATCTATGATACG 1550 Query 1440 GCAATCATCAACTGCTCCTTTTACATTGATGCATGAAATCCGCAAACTTGAACACCTTCA 1499 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1551 GCAATCATCAACTGCTCCATTTACATTGATGCATGAAATCCGCAAACTCGAACACCTTCA 1610 Query 1500 AGAACAGTTAGGGGAGGAAGCAACGAAAGCTCTTGAAGTGTTACAGAAGGAAGTAGCCTG 1559 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 1611 AGAACAGTTAGGGGAGGAAGCAACGAAAGCCCTTGAAGTGTTACAAAAGGAAGTAGCTTG 1670 Query 1560 CCATAGACTAGGGAATCAAGATGCAGCTCAAACAATAGCTAAGCTTCAAGCAGAGATAAG 1619 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1671 CCATAGACTAGGGAATCAAGATGCAGCTCAGACGATAGCTAAGCTTCAAGCAGAGATAAG 1730 Query 1620 GGAAATGCGTACTGTTAAACCATCTGCAATGCTTAAAGAGGTTGGAGATGTCATAGCTCC 1679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1731 GGAAATGCGTACTGTTAAACCATCTGCAATGCTTAAAGAGGTTGGAGATGTCATAGCTCC 1790 Query 1680 TAACAAGAGCGTAAGTGCCAATCTCAAGGAAGAGATAACAAGGCTCCATTCACAAGGAAG 1739 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1791 TAACAAGAGCGTAAGTGCCAATCTCAAGGAAGAGATAACAAGGCTCCATTCACAAGGAAG 1850 Query 1740 CACCATTGCAAATCTAGAGGAGCAACTTGAGAGCGTTCAGAAGTCAATAGATAAGTTGGT 1799 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1851 CACCATTGCGAATCTAGAGGAGCAACTTGAGAGCGTTCAGAAGTCAATAGATAAGTTGGT 1910 Query 1800 GATGTCTCTTCCAAGCAATATCAATGCTGGAGATGAGACCCCAAGGACAAAGAATCATCA 1859 |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct 1911 GATGTCTCTTCCGAGCAATATCAGTGCTGGAGATGAGACTCCAAAGACAAAGAATCATCA 1970 Query 1860 TCATCAATCAAAGAAGAAGAAACTTCTTCCTCTGACACCAAGCAGCGTTTCCAACCGCCA 1919 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1971 TCATCAATCAAAGAAGAAGAAGCTTCTTCCTCTGACACCAAGCAGCGCATCCAACCGCCA 2030 Query 1920 GAATTTCTTGAAATCTCCATGCTCTCCTCTTTCCGCTTCTAGGCAAGTCTTGGATTGTGA 1979 ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2031 GAACTTCTTGAAATCTCCATGCTCTCCGCTTTCAGCTTCTAGGCAAGTCTTGGATTGTGA 2090 Query 1980 TGCGGAGAACAAAGCTCCTCAAGAGAACAACA-TCTCTGCAACTAGAGGGGCAACGACAC 2038 ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| Sbjct 2091 TGCTGAGAACAAAGCTCCTCAAGAAAACAACAGT-TCTGCAGCTAGAGGGGCGACGACAC 2149 Query 2039 CACAAGGGTCTGAGAAAGAGACTCCACAGAAAGGAGAAGAAAGCGGAGATGTCTCGTCAA 2098 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2150 CACAGGGGTCTGAGAAAGAGACTCCACAGAAAGGAGAAGAAAGCGGAGATGTCTCGTCAA 2209 Query 2099 GAGAAAGCACACCAGGCTACAGGAGATCAAGCTCAGTGAACATGAAGAAAATGCAGCAAA 2158 ||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2210 GAGAAGGTACTCCAGGCTACAGAAGATCAAGCTCAGTGAACATGAAGAAAATGCAGCAAA 2269 Query 2159 TGTTCCAAAATGCAGCAGAGGAGAACGTGAGAAGCATAAGAGCATACGTAACTGAACTCA 2218 |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2270 TGTTTCAAAACGCAGCAGAGGAGAATGTAAGAAGCATAAGAGCATACGTAACCGAACTCA 2329 Query 2219 AAGAACGTGTAGCTAAACTACAGTATCAGAAACAACTTCTCGTTTGTCAGGTGCTTGAGT 2278 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2330 AAGAACGAGTAGCTAAACTACAGTACCAGAAACAACTTCTCGTTTGTCAGGTGCTTGAGT 2389 Query 2279 TGGAAGCAAATGATGGAGCTGGATATAGTGTAGAGAACGAGGAGAACACGATAATAGAAG 2338 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2390 TGGAAGCAAATGATGGAGCTGGATATAGTGTAGAGAACGAGGAGAACACGATAATGGAAG 2449 Query 2339 ATGAAGAGCAGAGTCAAGTTGCGTGGCATATAACTTTCATAGAGGAAAGACAACAGATCA 2398 |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2450 ATGAAGAGCAGAATCAAGTGGCGTGGCATATAACTTTCATAGAGGAAAGACAACAGATCA 2509 Query 2399 TAGAGCTGTGGCATGTTTGCCATGTCTCCATAATCCACAGGACACAATTCTATCTACTGT 2458 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2510 TAGAGCTGTGGCATGTCTGCCATGTCTCCATAATCCACAGGACACAATTCTACCTACTGT 2569 Query 2459 TCAAAGGTGATCAAGCCGATCAAATCTACATGGAAGTCGAGCTAAGACGGTTAACTTGGT 2518 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2570 TCAAAGGTGACCAAGCCGATCAAATCTACATGGAAGTCGAGCTAAGACGGTTAACTTGGT 2629 Query 2519 TAGAACAACATCTAGCAGAAGTAGGTAATGCAACTCCAGCTCGAAACTGCGACGAATCCG 2578 ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct 2630 TAGAACAACATCTAGCAGAAGTAGGAAACGCAACTCCAGCTCGAAACTGCGATGAATCTG 2689 Query 2579 TAGTTTCTCTATCATCAAGTATAAAAGCATTGAGAAGAGAGCGAGAGTTTTTGGCGAAAA 2638 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2690 TGGTTTCTCTATCATCAAGTATAAAAGCATTGAGAAGAGAGCGAGAGTTTTTGGCGAAAA 2749 Query 2639 GGGTTAACTCAAGATTGACGCCTGAGGAGAGAGAGGAGCTGTATATGAAATGGGATGTGC 2698 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2750 GGGTTAACTCGAGATTGACGCCTGAGGAGAGAGAGGAGCTGTATATGAAATGGGATGTGC 2809 Query 2699 CATTGGAAGGGAAACAGAGGAAACTCCAGTTCGTGAACAAGCTATGGACTGATCCTTACG 2758 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2810 CATTGGAAGGGAAACAGAGGAAACTTCAGTTCGTGAACAAGCTATGGACTGATCCTTATG 2869 Query 2759 ATTCAAGGCACGTGCAAGAGAGTGCAGAGATAGTTGCGAAGCTAGTTGGATTCTGTGAAA 2818 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2870 ATTCAAGGCACGTGCAAGAGAGTGCAGAGATAGTTGCGAAGCTAGTTGGATTCTGTGAAA 2929 Query 2819 GTGGTAACATCTCTAAAGAGATGTTCGAGCTCAATTTCGCTGTGCCTTCAGATAGAAGGC 2878 |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | Sbjct 2930 GTGGCAACATCTCTAAAGAGATGTTTGAGCTCAATTTCGCAGTGCCTTCAGATAAAAGAC 2989 Query 2879 AGTGGAACATTGGTTGGGACAACATCTCTAATCTTCTTCACCTGTGAAGAAATTTTTGTG 2938 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| Sbjct 2990 AGTGGAACATTGGTTGGGACAACATCTCTAATCTTCTTCACCTATGAAGAC-TTATTGTG 3048 Query 2939 T-TTT-TGATTTGTAAAAG 2955 | ||| ||||||||||||| Sbjct 3049 TGTTTATGATTTGTAAAAG 3067 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 146888809104 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5