BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg472328
Length=4343
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G20920.1 | Symbols: | P-loop containing nucleoside triphosp... 5633 0.0
AT3G09620.1 | Symbols: | P-loop containing nucleoside triphosp... 1855 0.0
> AT1G20920.1 | Symbols: | P-loop containing nucleoside triphosphate
hydrolases superfamily protein | chr1:7285114-7289778
FORWARD LENGTH=4430
Length=4430
Score = 5633 bits (3050), Expect = 0.0
Identities = 3253/3350 (97%), Gaps = 18/3350 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 804 GCGTGAAAAGAGTGTTGGCAGATCTAGCAGGCATGAAGATAGTCCaaggagaaagagtgt 863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 845 GCGTGAAAAGAGTGTTGGCAGATCTAGCAGGCATGAAGATAGTCCAAAGAGAAAGAGTGT 904
Query 864 tgaggaggatggtgaaaagaaagagaagaaaacccgagaagaagaacttgaggatgagca 923
||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 905 CGAGGATAATGGGGAAAAGAAAGAGAAGAAAACGCGAGAAGAAGAACTAGAGGATGAGCA 964
Query 924 gaagaagTTGGATGAGGAGGTGGAAAAACGAAGGAGAAGAGTCCAGGAGTGGCAAGAATT 983
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 965 GAAGAAGTTGGATGAGGAAGTGGAAAAACGAAGGAGAAGAGTCCAGGAGTGGCAAGAATT 1024
Query 984 GAAGAGGAAGAAGGAGGAAGCTGAAAGTGAAAGTAAGGGTGATGCGGATGGTAAAGAGCC 1043
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1025 GAAGAGGAAGAAGGAGGAAGCTGAAAGTGAAAGTAAGGGTGATGCGGATGGTAATGAGCC 1084
Query 1044 CAAGGCCGGTAAGGCTTGGACTCTTGAAGGAGAATCTGATGATGAAGAAGTTCATCCTGA 1103
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1085 CAAGGCCGGTAAGGCTTGGACTCTTGAAGGAGAATCTGATGATGAAGAAGGCCATCCGGA 1144
Query 1104 GGAAAAATCAGAAGCAGAAATGGATGTTGATGAAGAGACTAAACCTGAAAATGATGGAGA 1163
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1145 AGAAAAATCAGAAACAGAAATGGATGTTGATGAAGAGACTAAACCTGAAAATGATGGAGA 1204
Query 1164 TGCCAAGATGGTAGACTTGGAGAATGAGACAGCTGCTACTGTCTCTGAGAGTGGAGGTGA 1223
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1205 TGCTAAGATGGTAGACTTGGAGAATGAGACAGCTGCTACTGTCTCTGAGAGTGGAGGTGA 1264
Query 1224 TGGAGCTGCAGATGAAGAGGAAATTGATCCTTTAGATGCTTTTATGAATACTATGGTATT 1283
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1265 TGGAGCTGTAGATGAAGAGGAAATTGATCCTTTAGATGCTTTTATGAATACTATGGTATT 1324
Query 1284 ACCTGAGGTTGAGAAGCTTAGCAATGGTGCTCCTCCCCCAGCAGTCAACGATGGTATTTT 1343
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||
Sbjct 1325 ACCTGAGGTTGAGAAGTTTTGCAATGGTGCTCCTCCCCCAGCAGTGAACGATGGTACTTT 1384
Query 1344 GGATTCTAAAATGAATGGGAAGGAAAGTGATGACCAGCCAAAGAAAGGTTTTAATAAGGC 1403
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385 GGATTCTAAAATGAATGGGAAGGAAAGTGGTGACCGGCCAAAGAAAGGTTTTAATAAGGC 1444
Query 1404 CCTTGGTAGGATAATTCAAGGTGAAGATTCTGATTCAGATTATTCAGAACCAAAGAATGA 1463
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1445 CCTTGGTAGGATAATTCAAGGTGAAGATTCTGATTCTGATTATTCAGAACCAAAGAATGA 1504
Query 1464 TGATGATCCAAGTTTAGACGAAGATGATGAGGAGTTCATGAAGAGAGTGAAGAAGACAAA 1523
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1505 TGATGATCCAAGTTTAGACGAAGACGATGAGGAGTTCATGAAGAGAGTAAAGAAGACAAA 1564
Query 1524 AGCTGAGAAGTTGTCCCTTGTTGACCACTCAAAAATAGAGTATGAACCTTTCCGGAAGAA 1583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1565 AGCTGAGAAGTTGTCCCTTGTTGACCACTCAAAAATAGAGTATGAACCTTTCCGGAAGAA 1624
Query 1584 CTTCTATATCGAAGTGAAGGATATCTCTAGGATGACACAAGAAGAAGTTAACACTTACAG 1643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625 CTTCTATATCGAAGTGAAGGATATCTCTAGGATGACACAAGAAGAAGTTAACACTTACAG 1684
Query 1644 AAAGGAATTGGAGCTGAAAGTTCATGGAAAGGATGTTCCAAGACCCATAAAGTTTTGGCA 1703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1685 AAAGGAATTGGAGCTGAAAGTTCATGGAAAGGATGTTCCAAGACCCATAAAGTTTTGGCA 1744
Query 1704 CCAGACTGGGCTAACCAGCAAAATTTTGGATACTATGAAGAAGCTTAATTATGAAAAGCC 1763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1745 CCAGACTGGGCTAACCAGCAAAATTTTGGATACTATGAAGAAGCTTAATTATGAAAAGCC 1804
Query 1764 AATGCCTATTCAAACACAAGCACTCCCAATCATCATGAGCGGTCGAGACTGCATTGGGGT 1823
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1805 AATGCCTATTCAAACACAAGCACTCCCTATCATCATGAGCGGTCGAGACTGCATTGGGGT 1864
Query 1824 TGCAAAAACTGGTTCAGGTAAAACCCTTGGTTTTGTTTTGCCAATGCTGAGGCATATCAA 1883
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1865 TGCAAAAACCGGTTCAGGTAAAACCCTTGGTTTTGTTTTGCCAATGCTGAGGCATATTAA 1924
Query 1884 AGATCAGCCTCCCGTTGAAGCTGGTGATGGGCCAATTGGGCTTGTAATGGCACCTACGAG 1943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 1925 AGATCAGCCTCCCGTTGAAGCTGGTGATGGGCCAATTGGTCTTGTAATGGCACCTACTAG 1984
Query 1944 GGAGCTTGTTCAGCAGATTCACAGCGATATCAGAAAGTTTTCTAAGCCATTGGGTATAAG 2003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1985 GGAGCTTGTTCAGCAGATTCACAGCGATATCAGAAAGTTTTCTAAGCCATTGGGTATAAG 2044
Query 2004 ATGCGTCCCTGTGTATGGAGGATCAGGAGTTGCCCAGCAAATTAGTGAACTTAAACGAGG 2063
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2045 ATGCGTCCCTGTGTATGGAGGATCAGGAGTTGCCCAGCAAATTAGTGAACTTAAGCGAGG 2104
Query 2064 TACTGAGATTGTTGTGTGCACTCCTGGCAGAATGATTGATATCCTTTGCACAAGCAGTGG 2123
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2105 TACTGAGATTGTTGTGTGCACTCCTGGGAGAATGATTGATATCCTTTGCACAAGCAGTGG 2164
Query 2124 GAAAATCACTAATCTGCGAAGAGTCACATTTTTGGTAATGGATGAAGCTGATCGTATGTT 2183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2165 GAAAATCACTAATCTGCGAAGAGTCACATTTTTGGTAATGGATGAAGCTGATCGTATGTT 2224
Query 2184 TGACATGGGTTTTGAGCCTCAAATTACTCGTATTATTCAGAACATTCGACCGGAACGTCA 2243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2225 TGACATGGGTTTTGAGCCTCAAATTACTCGTATTATTCAGAACATTCGACCGGAACGCCA 2284
Query 2244 AACTGTGCTTTTTTCTGCCACTTTTCCACGCCAAGTTGAAACTTTGGCACGTAAAGTCTT 2303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285 AACTGTGCTTTTTTCTGCCACTTTTCCACGCCAAGTTGAAACTTTGGCACGTAAAGTCTT 2344
Query 2304 GAACAAGCCTGTAGAAATACAGGTCGGTGGAAGGAGTGTTGTGAATAAGGATATAACTCA 2363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2345 GAACAAGCCTGTAGAAATACAGGTCGGTGGAAGGAGTGTTGTGAATAAGGATATAACTCA 2404
Query 2364 GTTAGTTGAAGTCAGACCGGAGAGTGATAGGTTCTTTAGACTTCTGGAACTTCTTGGGGA 2423
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2405 GTTAGTTGAAGTCAGACCGGAGAGTGATAGGTTCCTTAGACTTCTGGAACTTCTTGGGGA 2464
Query 2424 ATGGTATGAGAAAGGGAAAATTCTGGTTTTTGTTCAGTCGCAGGAAAAATGTGATGCCTT 2483
||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2465 ATGGTCTGAGAAAGGGAAAATTCTGGTCTTTGTTCAGTCGCAGGAAAAATGTGATGCCTT 2524
Query 2484 GTATAGGGATATGATTAAATCTAGTTACCCTTGTCTGTCTCTTCACGGGGGTAAGGATCA 2543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2525 GTATAGGGATATGATTAAATCTAGTTACCCTTGTCTGTCTCTTCACGGGGGTAAGGATCA 2584
Query 2544 GACTGATCGTGAATCAACTATCTCTGATTTTAAGAGCAATGTCTGCAATTTGTTGATTGC 2603
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2585 GACCGATCGTGAATCAACTATATCTGATTTTAAGAACGATGTCTGCAATTTGTTGATTGC 2644
Query 2604 CACAAGTGTTGCGGCTAGGGGTCTAGATGTGAAAGAGCTTGAGTTAGTTGTAAACTTTGA 2663
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2645 CACAAGTGTTGCTGCTAGGGGTCTAGATGTGAAAGAGCTTGAGTTGGTTGTAAACTTTGA 2704
Query 2664 TGCGCCGAACCACTATGAAGATTATGTGCATCGCGTTGGCAGGACAGGCAGGGCAGGGCG 2723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2705 TGCGCCGAACCACTATGAAGATTATGTGCATCGCGTTGGCAGGACAGGCAGGGCAGGGCG 2764
Query 2724 TAAAGGCTGTGCTGTGACATTTATCTCCGAGGATGATGCAAAATATGCACCAGATTTAGT 2783
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2765 TAAGGGCTGTGCTGTGACATTTATCTCCGAGGATGATGCAAAATATGCACCAGATTTAGT 2824
Query 2784 CAAGGCCCTGGAACTTTCTGAGCAGCCAGTTCCTGATGATCTGAAAGCACTTGCTGATGG 2843
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2825 CAAGGCCCTGGAGCTTTCTGAGCAGCCAGTTCCTGATGATCTGAAAGCACTTGCTGATGG 2884
Query 2844 TTTCATGGCGAAAGTGAAACAGGGTATTGAGCAAGCTCATGGAACTGGCTATGGTGGTAG 2903
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2885 TTTCATGGTGAAAGTGAAACAGGGTATTGAGCAAGCTCATGGAACTGGCTATGGTGGTAG 2944
Query 2904 TGGCTTTAAATTCAACGAAGAGGAGGAAGAAGTTAGAAAAGCAGCAAAGAAAGCACAAGC 2963
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2945 TGGCTTTAAATTCAACGAAGAGGAGGAAGAAGTTAGAAAAGCAGCAAAGAAAGCACAAGC 3004
Query 2964 AAAGGAGTATGGCTTTGAGGAAGACAAGTCTGACTCAGAAGATGAGAATGATGTAGTAAG 3023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3005 AAAGGAGTATGGCTTTGAGGAAGACAAGTCTGACTCAGAAGATGAGAATGATGTAGTAAG 3064
Query 3024 AAAGGCAGGTGGTGGTGAGATCTCACAGCAGCAGGCTACTTTTGCTCAGATAGCTGCCAT 3083
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3065 AAAGGCAGGTGGTGGTGAGATCTCACAGCAGCAGGCTACTTTTGCTCAGATAGCCGCCAT 3124
Query 3084 TGCTGCTGCTGCCAAAGCTGCTGC--C-GCTCCAGTGAGTGCTCCTGTGACAGCTAACCA 3140
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3125 TGCTGCTGCTGCCAAAGCTGCTGCTGCTGCTCCAGTGAGTGCTCCTGTGACAGCTAACCA 3184
Query 3141 ACTGCTGCCAAATGGTGGCGGGCTTGCCGCCATGCCAGGTGTCCTTCCGGTTACTGTTCC 3200
| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3185 ATTACTGGCAAATGGTGGCGGGCTTGCTGCCATGCCAGGTGTCCTTCCGGTTACTGTTCC 3244
Query 3201 TACCCTTCCTAGTGAAGGGGCAGGCCGTGCTGCAGCCATGGTTGCTGTCATGAATCTGCA 3260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3245 TACCCTTCCTAGTGAAGGGGCAGGCCGTGCTGCAGCCATGGTTGCTGCCATGAATCTGCA 3304
Query 3261 ACACAACCTGGCAAAGATTCAAGCGGATGCAATGCCTGAGCACTATGAAGCAGAACTTGA 3320
||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3305 ACATAATCTGGCAAAGATTCAAGCTGATGCAATGCCTGAGCACTATGAAGCAGAACTTGA 3364
Query 3321 AATCAATGATTTCCCACAAAATGCTCGTTGGAAGGTCACCCACAAAGAAACTTTGGGTCC 3380
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3365 AATCAATGACTTCCCACAAAATGCTCGTTGGAAGGTCACCCATAAAGAAACTTTGGGTCC 3424
Query 3381 AATATCAGAGTGGACTGGAGCCGCTATTACCACCAGGGGTCAGTTTTATCCTACAGGACG 3440
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3425 AATATCAGAGTGGACTGGAGCTGCTATTACCACCAGGGGTCAGTTTTATCCTACAGGACG 3484
Query 3441 TATACCGGGACCTGGGGAACGGAAGCTGTACTTATTCATTGAAGGACCTAGCGAAAAATC 3500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3485 TATACCGGGACCTGGGGAACGGAAGCTGTACTTATTCATTGAAGGGCCTAGCGAAAAATC 3544
Query 3501 AGTTAAGCAAGCAAAAGTTGAACTCAAGCGTGTTCTTGAAGACATTACAAATCAGGCCAT 3560
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3545 AGTTAAGCACGCAAAAGCTGAACTCAAGCGTGTTCTTGAAGACATTACGAATCAGGCCAT 3604
Query 3561 GTCCTCACTTCCTGGAGGAGCAACCGGCAGATACTCAGTCCTTTAATGAAAGCAACCATG 3620
|||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3605 GTCCTCACTTCCTGGAGGAGCATCCGGGAGATACTCAGTCCTTTAATGAAAGCAACAATG 3664
Query 3621 AGGTGTGTGATTATAAGGGATTCAAATCACTGAGAGTTTTATTAAACAAGTATTATTGGT 3680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3665 AGGTGTGTGATTATAAGGGATTCAAATCACTGAGAGTTTTATTAAACAAGTATTATTGGT 3724
Query 3681 TGATGTTTTGGAATACAATCTCTGCACAATTGCTAAATCTTTTTACAGACTTGAACTTGA 3740
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3725 TGATGTTGTGGAATACAATCTCTGCACAATTGCTAAATCTTTTTACAGACTTGAACTTG- 3783
Query 3741 T-GTGATTAGAGAGATGGTCTCATAATGCTTGTTGTTTCTCATTCCGCAACtcttttcct 3799
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3784 TCGTGATTAGAGACATGGTCTCATAATGCTTGTTGTTTCTCATCCCGCAACTCTTTTCCT 3843
Query 3800 ctttttaattttattctctttttctttGTTATGTTTATACAATGTCCTCGATGGGTTTGC 3859
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3844 CTTTTTAATTCTATTCTCTTTTTCTTTGTCATGTTTATACAATGTCCTCGATGGGTTTGC 3903
Query 3860 TAATGAGCATTACCGCGTGGTGGCTGTAAAATGATGGGTAAAATCTAGTTTGATGCAGGT 3919
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3904 TAATGAGCATTACCGCGTGGTGGCTGTTAAATGATGGGTAAAATCTAGTTTGATGGAGGT 3963
Query 3920 TTTGTGTTTGGCAGTATGCTTGTTAGTTTCTTGCATCAA-TTCCCCGTTTTACAGCTTTT 3978
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3964 T--GTGTTTGGCACTATGCTTGTTAGTTTCTTGCATCAAGTTCCCCGTTTTACAGCTTTT 4021
Query 3979 GGCATCTTTTCTGCAGGGGAAATCTGTGAAACATGAAGCTCTCGGAGAAATGATATGTAA 4038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 4022 GGCATCTTTTCTGCAGGGGAAATCTGTGAAACATGAAGCTCCCGGAGAGATGATATGTAA 4081
Query 4039 TTTGTTTGTGATAGACAAGGCAAAGCTGTTT-TTACCTCTCCAATGGGTAAGGGTAAGAC 4097
||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |
Sbjct 4082 TTT-TTTGTGATAGACAAGGCAAAGCT-TTTCTTACCTCTCCAATGGGTAAG---A---C 4133
Query 4098 TTGGAGCTTATTCAGTTTTTGTGTCTGGATACTTTGTCTGTGGAGCTCCG 4147
||||||||||||||||| | || ||||||| || |||||||| |||||||
Sbjct 4134 TTGGAGCTTATTCAGTTAT-GTTTCTGGATCCTATGTCTGTGAAGCTCCG 4182
Score = 693 bits (375), Expect = 0.0
Identities = 423/445 (95%), Gaps = 7/445 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 322 CGTAAAGAGAAGGAGAGGGAGCGGAGACGGAGGGATAAGGATAGGGTGAAGAGACGGTCT 381
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 CGTAAGGAGAAGGAGAGGGAGCGGAGACGGAGGGATAAGGATAGGGTGAAGAGACGGTCT 428
Query 382 GAGCGAAGGAAGAGTAGTGATTCTGAGGATGATGATGAAGAAGAGGATgagagggataaa 441
||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 429 GAGAGAAGGAAGAGTAGTGATTCTGAAGATGACGTTGAAGAAGAGGATGAGAGGGATAAA 488
Query 442 cgcagagttaaggagaaggagagagggcatcgagaacatgagagagatagagggaaagac 501
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 489 CGCAGAGTGAATGAGAAGGAGAGAGGGCATCGAGAACATGAGAGAGATAGAGGCAAAGAT 548
Query 502 cggaaaagggatagagatagagagagggatgagaggaaggagaaagaaagagaaagggag 561
|||||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 549 AGGAAAA--G---G-GATAGAGAGAGGGAAGAGAGGAAGGATAAAGAAAGAGAAAGGGAG 602
Query 562 aaggatagagagaggagagaacgggaacgggaagagcgggagaaggagagagttaaagaa 621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 603 AAGGATAGAGAGAGGAGAGAACGGGAACGGGAAGAGCGGGAGAAGGAGAGAGTTAAAGAA 662
Query 622 agagaaaggcgggaacgggaagatggagagagggataggagagaacgtgagaaagaaagg 681
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 663 AGAGAAAGGCGGGAACGGGAAGATGGAGAGAGGGATAGGAGAGAGCGTGAGAAAGAAAGG 722
Query 682 GGTAGTAGGAGGAACCGGGAAAGGGAAAGGTCACGAGAGGTTGGCAATGAAGAGAGTGAT 741
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 723 GGTAGTAGGAGGAACCGGGAAAGGGAAAGGTCAAGAGAGGTGGGCAATGAAGAGAGTGAT 782
Query 742 GATGATGTCAAGCGTGACT-GAAAC 765
||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 783 GATGATGTCAAGCGTGACTTGAAAC 807
> AT3G09620.1 | Symbols: | P-loop containing nucleoside triphosphate
hydrolases superfamily protein | chr3:2949152-2952205
REVERSE LENGTH=2970
Length=2970
Score = 1855 bits (1004), Expect = 0.0
Identities = 1412/1599 (88%), Gaps = 67/1599 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 886 gagaagaaaacccgagaagaagaacttgaggatgagcagaagaagTTGGATGAGGAGGTG 945
||||||||||| || || ||| || | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||
Sbjct 424 GAGAAGAAAACTCGGGATGAACAAGTAGAGGATGAGCAGAAGCAGTTGGCTGAGGAAGTA 483
Query 946 GAAAAACGAAGGAGAAGAGTCCAGGAGTGGCAAGAATTGAAGAGG-AAGAAGGAGGAAGC 1004
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||
Sbjct 484 GAAAAACGGAGGAGAAGAGTCCAGGAGTGGCAAGAGTTGAAGAGGCAA-AACGAGGAAGC 542
Query 1005 TGAAAGTGAAAGTAAGGGTGATGCGGATGGTAAAGAGCCCAAGGCCGGTAAGGCTTGGAC 1064
| ||| ||||||||| || | | | | ||| | ||||||||||||||||
Sbjct 543 TCAAATTGAAAGTAA-GG-G-T-C-----CT---GAG----A--CCGGTAAGGCTTGGAC 584
Query 1065 TCTTGAAGGAGAATCTGATGATGAAGAAGTTCATCCTGAGGAAAAATCAGAAGCAGAAAT 1124
|||||| || |||||||||||| |||| | | |||||||| |||| ||
Sbjct 585 TCTTGATGGTGAATCTGATGAT---GAAG----T--T------AAATCAGACTCAGAGAT 629
Query 1125 GGATGTTGAT-GAAGAGACTAAACCT-GAAAATGATGGAGATGCCAAGATGGTAGACTTG 1182
|||||||||| | || |||||| || ||||||| |||||||||||||||||| | || |
Sbjct 630 GGATGTTGATCG-TGATACTAAA-CTCGAAAATGGTGGAGATGCCAAGATGGTCGCCTCG 687
Query 1183 GAGAATGAGACAGCTGCTACTGTCTCTGAGAGTGGAGGTGATGGAGCTGCAGATGAAGAG 1242
|||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 688 GAGAATGAGACAGCTGTTACTGTCTCTGAGAATGGAGGTGACAGAGCTGCAGATGAAGAC 747
Query 1243 GAAATTGATCCTTTAGATGCTTTTATGAATACTATGGTATTACCTGAGGTTGAGAAGCTT 1302
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 748 GAAATTGATCCCTTAGATGCTTTTATGAATACTATGGTATTACCTGAGGTTGAAAAGCTT 807
Query 1303 AGCAATGGTGCTCCTCCCCCAGCAGTCAACGATGGTATTTTGGATTCTAAAATGAATGGG 1362
|||||| | | | | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 808 AGCAAT-AT--T-GT------G-A-T---CGATGGTATTTTGGATTTTAAAATGAATGGG 852
Query 1363 AAGGAAAGTGATGACC-AGCCAAAGAAAGGTTTTAATAA-G--GCCCTTGGTAGGATAAT 1418
||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 853 AAGGAAACTGGTGACCAAGCCAAA-AAAGGTTTTAATAAGGCCGCCCTTGGTAGGATAAT 911
Query 1419 TCAAGGTGAAGATTCTGATTCAGATTATTCAGAACCAAAGAATGATGATGATCCAAGTTT 1478
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 912 TCAAGGTGAAGATTCTGATTCAGATTACTCAGAACCAAAGAGTGATGATGATCCAAGTTT 971
Query 1479 AGACGAAGATGATGAGGAGTTCATGAAGAGAGTGAAGAAGACAAAAGCTGAGAAGTTGTC 1538
||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 972 AGACGAAGACGACGAGGAGTTTATGAAGAGAGTTAAGAAGACAAAAGCAGAGAAATTGTC 1031
Query 1539 CCTTGTTGACCACTCAAAAATAGAGTATGAACCTTTCCGGAAGAACTTCTATATCGAAGT 1598
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 1032 TCTTGTTGACCACTCCAAAATAGAGTATGAACCTTTCCGGAAGAATTTTTATATCGAAGT 1091
Query 1599 GAAGGATATCTCTAGGATGACACAAGAAGAAGTTAACACTTACAGAAAGGAATTGGAGCT 1658
||||||||||| ||||||||||| || | ||| ||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 1092 CAAGGATATCTCAAGGATGACACAGGATGCAGTGAACGCTTATAGAAAGGAATTGGAGCT 1151
Query 1659 GAAAGTTCAT-GGAAAGGATGTTCCAAGACCCA-TAAAGTTTTGGCACCAGACTGGGCTA 1716
|||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||
Sbjct 1152 GAAAGTTCATGGGAAA-GATGTTCCAAGACCCATTCAA-TTTTGGCACCAGACTGGATTA 1209
Query 1717 ACCAGCAAAATTTTGGATACTATGAAGAAGCTTAATTATGAAAAGCCAATGCCTATTCAA 1776
|| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1210 ACTAGCAAAATTTTGGATACTCTGAAGAAGCTTAACTATGAAAAGCCAATGCCTATCCAA 1269
Query 1777 ACACAAGCACTCCCAATCATCATGAGCGGTCGAGACTGCATTGGGGTTGCAAAAACTGGT 1836
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1270 GCACAAGCACTTCCAATCATCATGAGCGGTAGAGACTGCATTGGGGTTGCCAAAACCGGG 1329
Query 1837 TCAGGTAAAACCCTTGGTTTTGTTTTGCCAATGCTGAGGCATATCAAAGATCAGCCTCCC 1896
||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 TCAGGTAAAACCCTTGGCTTTGTTTTGCCTATGTTGAGGCATATCAAAGATCAGCCTCCC 1389
Query 1897 GTTGAAGCTGGTGATGGGCCAATTGGGCTTGTAATGGCACCTACGAGGGAGCTTGTTCAG 1956
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||
Sbjct 1390 GTTGAAGCTGGTGATGGGCCGATTGGGCTTGTAATGGCACCTACTAGAGAACTTGTTCAG 1449
Query 1957 CAGATTCACAGCGATATCAGAAAGTTTTCTAAGCCATTGGGTATAAGATGCGTCCCTGTG 2016
|||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||
Sbjct 1450 CAGATTTACAGCGATATCAGAAAGTTTTCTAAGGCATTGGGTATAATATGTGTGCCTGTG 1509
Query 2017 TATGGAGGATCAGGAGTTGCCCAGCAAATTAGTGAACTTAAACGAGGTACTGAGATTGTT 2076
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1510 TATGGAGGATCTGGAGTTGCCCAGCAAATCAGTGAGCTTAAGCGAGGTACCGAGATTGTT 1569
Query 2077 GTGTGCACTCCTGGCAGAATGATTGATATCCTTTGCACAAGCAGTGGGAAAATCACTAAT 2136
|| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||
Sbjct 1570 GTTTGTACTCCTGGAAGAATGATCGATATTCTTTGCACAAGCAGTGGAAAAATTACCAAT 1629
Query 2137 CTGCGAAGAGTCACATTTTTGGTAATGGATGAAGCTGATCGTATGTTTGACATGGGTTTT 2196
|| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1630 CTACGAAGGGTCACATATTTGGTAATGGATGAAGCTGATCGTATGTTTGATATGGGTTTT 1689
Query 2197 GAGCCTCAAATTACTCGTATTATTCAGAACATTCGACCGGAACGTCAAACTGTGCTTTTT 2256
||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| || |||||||||||||| |||
Sbjct 1690 GAGCCTCAAATAACTCGCATTGTTCAAAATATTCGACCTGATCGTCAAACTGTGCTCTTT 1749
Query 2257 TCTGCCACTTTTCCACGCCAAGTTGAAACTTTGGCACGTAAAGTCTTGAACAAGCCTGTA 2316
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1750 TCTGCCACTTTTCCACGCCAAGTTGAAACTTTGGCACGTAAAGTCTTGAACAAGCCTGTG 1809
Query 2317 GAAATACAGGTCGGTGGAAGGAGTGTTGTGAATAAGGATATAACTCAGTTAGTTGAAGTC 2376
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1810 GAGATACAGGTCGGTGGGAGGAGTGTTGTGAATAAAGATATAACTCAGTTAGTTGAAATC 1869
Query 2377 AGACCGGAGAGTGATAGGTTCTTTAGACTTCTGGAACTTCTTGGGGAATGGTATGAGAAA 2436
||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1870 AGACCCGAGAGTGAGAGGTTCTCAAGACTTCTGGAACTTCTTGGGGAATGGTATGAGAAA 1929
Query 2437 GGGAAAA-TTCTGGTTTTTGTTCAGT-CGCAGGAAAAAT 2473
|| |||| || |||| ||||||| || ||||||||||||
Sbjct 1930 GG-AAAAGTTTTGGTCTTTGTTC-GTTCGCAGGAAAAAT 1966
Score = 1016 bits (550), Expect = 0.0
Identities = 889/1044 (85%), Gaps = 58/1044 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 2561 CTATCTCTGATTTTAAGAGCAATGTCTGCAATTTGTTGATTGCCACAAGTGTTGCGGCTA 2620
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |
Sbjct 1967 CTATATCTGATTTTAAGAGCGATGTCTGCAATTTGTTGATCGCCACAAGTGTTGCAGCCA 2026
Query 2621 GGGGTCTAGATGTGAAAGAGCTTGAGTTAGTTGTAAACTTTGATGCGCCGAACCACTATG 2680
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||
Sbjct 2027 GGGGTCTAGATGTGAAAGAGCTCGAGTTGGTTGTAAACTTCGATGCACCAAACCACTATG 2086
Query 2681 AAGATTATGTGCATCGCGTTGGCAGGACAGGCAGGGCAGGGCGTAAAGGCTGTGCTGTGA 2740
|||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 2087 AAGACTATGTGCATCGTGTTGGTAGGACAGGTAGGGCAGGGCGGAAAGGCTGTGCTGTAA 2146
Query 2741 CATTTATCTCCGAGGATGATGCAAAATATGCACCAGATTTAGTCAAGGCCCTGGAACTTT 2800
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2147 CATTTATCTCTGAGGATGATGCAAAATATGCACCAGATTTAGTCAAGGCCCTGGAACTAT 2206
Query 2801 CTGAGCAGCCAGTTCCTGATGATCTGAAAGCACTTGCTGATGGTTTCATGGCGAAAGTGA 2860
||||||||||||||||||||||| | |||||| | || || || |||||||||||||| |
Sbjct 2207 CTGAGCAGCCAGTTCCTGATGATGTTAAAGCAGTAGCCGAAGGGTTCATGGCGAAAGTAA 2266
Query 2861 AACAGGGTATTGAGCAAGCTCATGGAACTGGCTATGGTGGTAGTGGCTTTAAATTCAACG 2920
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2267 AACAGGGTATTGAGCAAGCTCATGGAACTGGCTATGGTGGAAGTGGCTTTAAATTCAACG 2326
Query 2921 AAGAGGAGGAAGAAGTTAGAAAAGCAGCAAAGAAAGCACAAGCAAAGGAGTATGGCTTTG 2980
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2327 AAGAGGAGGATGAAGTTAGGAAAGCAGCAAAGAAAGCACAAGCGAAGGAGTATGGCTTTG 2386
Query 2981 AGGAAGACAAGTCTGACTCAGAAGATGAGAATGATGTAGTAAGAAAGGCAGGTGGTGGTG 3040
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2387 AAGAAGAGAAGTCTGACTCAGAAGATGAGAATGATGTAGTAAGAAAGGC---TGGTGGTG 2443
Query 3041 AGATCTCACAGCAGCAGGCTACTTTTGCTCAGATAGCTGCCATTGCTGCTGCTGCCAAAG 3100
| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 2444 ATATCTCACAGCAGCAGATTACTCTTGCTCAGATAGCCGCCATTGCTTCTGCTGC----- 2498
Query 3101 CTGCTGCCGCTCCAGTGAGTGCTCCTGTGACAGCTAACCAACTGCTGCCAAATGGTGGCG 3160
| | | | | || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |
Sbjct 2499 -T--T-C---T--A---AG-GCTCCTGTGACTGCTAACCAATTGCTTCCAAATGGTGGTG 2545
Query 3161 GGCTTGCCGCCATGCCAGGTGTCCTTCCGGTTACTGTTCCTACCCTTCCTAGTGAAGGGG 3220
|||| ||| | || || || ||| | | || | | |||| ||| || |
Sbjct 2546 GGCTAGCCAC--TG--AG----CCA---GGT-A-T---CC--C--T-CCTACTGATGGAG 2584
Query 3221 CAGGCCGTGCTGCAGCCATGGTTGCTG-T-CATGAATC-TGCAACACAACCTGGCAAAGA 3277
||||||| | |||||||||| |||||| | | | || | ||||||| |||| |||||||
Sbjct 2585 CAGGCCGCGTTGCAGCCATGATTGCTGCTGC-T-AA-CGTGCAACAGTACCTTGCAAAGA 2641
Query 3278 TTCAAGCGGATGCAATGCCTGAGCACTATGAAGCAGAACTTG-AAATCAATGATTTCCCA 3336
||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 2642 TTCAAGCTGATGCGATACCTGAACACTATGAAGCAGAA-TTGGAAATCAATGATTTCCCA 2700
Query 3337 CAAAATGCTCGTTGGAAGGTCACCCACAAAGAAACTTTGGGTCCAATATCAGAGTGGACT 3396
|| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
Sbjct 2701 CAGAATGCTCGGTGGAAAGTTACCCACAAAGAAACGCTGGGACCAATATCAGAGTGGAGT 2760
Query 3397 GGAGCCGCTATTACCACCAGGGGTCAGTTTTATCCTACAGGACGTATACCGGGACCTGGG 3456
||||| | |||||||| || ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |
Sbjct 2761 GGAGCTTCCATTACCACTAGAGGTAAGTTTTATGAGGCAGGACGTATCCCGGGACCTGAG 2820
Query 3457 GAACGGAAGCTGTACTTATTCATTGAAGGACCTAGCGAAAAATCAGTTAAG-CAAGCAAA 3515
||||| ||||| || || ||| | ||||| |||| ||||| ||| |||||| || || ||
Sbjct 2821 GAACGCAAGCTCTATTTGTTCGTCGAAGGGCCTACCGAAATATCTGTTAAGACA-GCGAA 2879
Query 3516 AGTTGAACTCAAGCGTGTTCTTGAAGACATTACAAATCAGGCCATGTCCTCACTTCCTGG 3575
|| ||||||||||||||||||||||||||| || || || || | || || ||||||||
Sbjct 2880 AGCTGAACTCAAGCGTGTTCTTGAAGACATAACTAACCAAACC-T-TC-TCCCTTCCTGG 2936
Query 3576 AGGAGCA-AC-C-GGCAGATACTC 3596
||||||| | | |||||||||||
Sbjct 2937 AGGAGCACAATCAGGCAGATACTC 2960
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 216520525988
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5