BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg472334
Length=6966
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G20960.1 | Symbols: emb1507 | U5 small nuclear ribonucleopro... 1.131e+04 0.0
AT2G42270.1 | Symbols: | U5 small nuclear ribonucleoprotein he... 6488 0.0
AT3G28870.1 | Symbols: | CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Histone d... 235 4e-60
> AT1G20960.1 | Symbols: emb1507 | U5 small nuclear ribonucleoprotein
helicase, putative | chr1:7301748-7310250 REVERSE LENGTH=7013
Length=7013
Score = 1.131e+04 bits (6123), Expect = 0.0
Identities = 6710/6992 (96%), Gaps = 45/6992 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTAGGTCGATTTTTAGGAGATAGAGGACGTGAGAAGGGAGAAGAAATCTGAATCTCCCA 60
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |
Sbjct 38 TTTAGGTCGATTATTAGGAGATAGAGGACGTGAGAAGGGAG-AG--ATCTGAGTCTCCTA 94
Query 61 TTAGGGTTTCTTCTAGTAGATTGATTCGTTGCCGAGAGTGAAGCTAAGAAGAGATTTCGT 120
|||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 95 CTAGGGTTTCTTCTACTGGATTGATTCGTTGCAGAGAGTGAAGCTAAGAAGAGA--T--T 150
Query 121 TTCGTAGCTGTTTCGGTTTTCGGATTTGGT-GATGGCGAACTTGGGAGGCGGTGCGGAAG 179
|||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 151 TTCGTAGCTGTTTCTGTTTTCGGA-TTGGTAGATGGCGAACTTGGGAGGCGGTGCGGAAG 209
Query 180 CACATGCCAGGTTCAAGCAGTATGAGTATAGAGCCAATTCTAGTCTGGTGTTAACTACTG 239
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 210 CACATGCCAGGTTCAAGCAGTATGAGTACAGAGCCAATTCTAGTCTGGTGTTAACTACTG 269
Query 240 ATAATCGTCCTCGCGATACTCATGAGCCTACAGGAGAACCGGAAACTCTGTGGGGGAAAA 299
||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 270 ATAATAGACCTCGGGATACTCATGAGCCTACAGGAGAACCGGAAACTCTGTGGGGGAAAA 329
Query 300 TTGATCCGAGGTCTTTTGGTGACCGTGTTGCTAAGGGGAGGCCTCAGGAGTTGGAGGATA 359
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 330 TCGATCCGAGGTCTTTTGGTGACCGTGTTGCTAAGGGAAGGCCTCAGGAGTTGGAGGATA 389
Query 360 AGCTTAAAAAGTCTAAGAAGAAGGAACGTGATGTTGTTGATGATACTGCT-AATGTTAGG 418
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||| |||||
Sbjct 390 AGCTGAAAAAGTCTAAGAAGAAGGAACGTGATGTTGTAGATGATA-TGGTAAATATTAGG 448
Query 419 CAGAGTAAGAGGCGTCGTCTAAGGGAAGAGAGCGTTCTAACTGATACTGATGATGCGGTT 478
|||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||
Sbjct 449 CAGAGTAAGAGGCGGCGTCTAAGGGAAGAGAGTGTGCTGACTGATACTGATGATGCGGTT 508
Query 479 TATCAGCCGAAGACTAAGGAGACTAGGGCTGCTTATGAGGCCATGCTTAGTCTAATTCAG 538
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||
Sbjct 509 TATCAGCCGAAGACTAAGGAGACGAGGGCTGCTTATGAAGCCATGCTTGGTCTTATCCAG 568
Query 539 CAGCAGTTGGGTGGGCAACCTCTGAGTATTGTTAGTGGTGCTGCAGATGAGATTTTGGCG 598
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 569 AAGCAGTTGGGTGGGCAACCTCCGAGTATTGTTAGTGGTGCAGCGGATGAGATTTTGGCT 628
Query 599 GTTCTCAAGAACGATACATTTAGAAACCCTGAGAAAAAGATGGAGATCGAGAAGTTGCTG 658
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 629 GTTCTCAAGAATGACGCATTTAGAAACCCTGAGAAAAAGATGGAGATTGAGAAGTTGCTG 688
Query 659 AACCATATTGAAAACCATGAGTTTGATCAGCTTGTTTCCATTGGAAAGCTGATCACGGAC 718
||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 689 AACAAGATTGAAAACCATGAGTTTGATCAGCTTGTTTCCATTGGAAAGTTAATCACGGAC 748
Query 719 TTTCAAGAGGGTGGTGATTCTGGTGGTGGTAAAGCTGATGACGATGAAGGACTTGATGAT 778
|| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||
Sbjct 749 TTCCAAGAGGGTGGTGATTCTGGTGGTGGTAGAGCTAATGATGATGAAGGGCTTGATGAT 808
Query 779 GATTTGGGCGTGGCTGTTGAATTTGAGGAGAATGAAGAAGACGATGATGAGAGTGATCCC 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||
Sbjct 809 GATTTGGGCGTGGCTGTTGAATTTGAGGAGAATGAAGAAGATGATGAGGAAAGCGATCCT 868
Query 839 GATATGGTTCAAGAGGAAGATGATGAGGAGGATGAAGAGCCTACCAGAACTGGAGGCATG 898
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 869 GATATGGTTGAAGAGGATGATGATGAGGAGGATGATGAGCCTACCAGAACTGGAGGCATG 928
Query 899 CAGGTTGATGCTGGGATCAATGATGAGGATGCAGGAGATGCAAATGAGGGCGCAAATCTT 958
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 929 CAGGTTGATGCAGGGATAAATGATGAGGATGCAGGAGATGCCAATGAGGGCACAAATCTT 988
Query 959 AATGTTCAAGACATTGATGCATATTGGCTCCAGAGAAAGATCTCTCAAGCATATGAACAG 1018
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 989 AATGTTCAAGACATTGATGCATATTGGCTCCAGAGAAAGATCTCTCAAGCGTATGAACAG 1048
Query 1019 CAGATTGATCCACAACAATGCCAGGTACTTGCAGAAGAGCTGCTTAAGGTACTCGCTGAA 1078
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||
Sbjct 1049 CAGATTGATCCACAACAATGCCAGGTACTCGCAGAAGAGCTACTAAAGATACTCGCTGAA 1108
Query 1079 GGGGATGATAGGGTTGTTGAGAACAAGCTGCTTATGCACCTTCAGTTCGAAAAGTTTAGC 1138
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 1109 GGGGATGATAGGGTTGTTGAGGACAAGCTGCTTATGCACCTTCAGTACGAAAAATTTAGC 1168
Query 1139 CTTGTTAAGTTTCTGCTGCGGAATCGTCTTAAAGTTGTGTGGTGCACTCGTTTGGCTAGG 1198
||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169 CTTGTCAAGTTTCTGCTGCGTAACCGTCTTAAAGTTGTGTGGTGCACTCGTTTGGCTAGG 1228
Query 1199 GCAGAAGACCAGGAAGAGAGGAAGAGAATTGAGGAGGAGATGAGGGGGTTGGGCCCAGAG 1258
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1229 GCAGAAGACCAGGAAGAGAGGAATAGAATCGAGGAGGAGATGAGGGGGTTAGGCCCAGAG 1288
Query 1259 TTGACAGCTATTGTGGAGCAGTTGCATGCAACAAGAGCAACAGCGAAAGAGAGGGAGGAG 1318
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1289 TTGACAGCAATTGTGGAGCAGTTGCATGCAACAAGAGCAACAGCGAAAGAGAGGGAGGAG 1348
Query 1319 AACCTGCAAAAAAGTATTAACGAAGAAGCCCGACGTTTGAAGGACGAAACTGGTGGAGAT 1378
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1349 AACCTGCAAAAAAGTATTAACGAGGAAGCCCGGCGTTTGAAGGACGAAACTGGTGGAGAT 1408
Query 1379 GGAGGCAGAGGCAGGAGAGATGTTGCTGACAGAGATTCAGAGAGTGGCTGGGTGAAGGGT 1438
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1409 GGAGGCAGAGGCAGGAGAGATGTTGCTGATAGAGATTCAGAGAGTGGGTGGGTGAAGGGT 1468
Query 1439 CAGCGTCAGATGCTGGACCTGGAGAGCTTGGCTTTTGACCAAGGTGGTCTCCTGATGGCG 1498
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1469 CAGCGTCAGATGCTGGACCTGGAGAGCTTGGCTTTTGACCAAGGTGGTCTTCTGATGGCG 1528
Query 1499 AATAAGAAGTGTGACCTTCCCCCTGGCTCTTACAGAAGTCATGGCAAGGGATATGATGAA 1558
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1529 AATAAGAAGTGTGACCTCCCCCCTGGCTCTTACAGAAGTCATGGCAAGGGATATGATGAA 1588
Query 1559 GTTCATGTGCCATGGGTTTCTAAAAAGGTCGATAGCAATGAGAAGCTTGTGAAGATTACG 1618
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1589 GTTCATGTGCCTTGGGTTTCTAAAAAGGTTGATAGGAATGAGAAGCTAGTGAAGATTACG 1648
Query 1619 GAAATGCCTGATTGGGCGCAACCGGCTTTTAAGGGAATGCAACAGTTAAACAGGGTTCAG 1678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1649 GAAATGCCTGATTGGGCGCAACCGGCTTTTAAGGGAATGCAACAGTTGAACAGGGTTCAG 1708
Query 1679 AGCAAAGTGTATGACACTGCACTTTTTAAGGCAGAGAACATTCTTCTTTGTGCTCCAACT 1738
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1709 AGCAAAGTGTATGACACTGCGCTTTTCAAGGCAGAGAATATTCTTCTTTGTGCTCCAACT 1768
Query 1739 GGTGCTGGGAAAACCAATGTTGCTATGCTCACCATACTGCAGCAACTTGAAATGAATAGG 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1769 GGTGCTGGGAAAACCAATGTTGCTATGCTCACCATACTGCAGCAACTTGAAATGAATAGG 1828
Query 1799 AACAAAGATGGAACTTATAACCATGGAGATTACAAAATTGTCTATGTTGCACCCATGAAA 1858
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1829 AACACAGATGGAACTTATAACCATGGAGATTACAAAATTGTCTATGTTGCACCCATGAAA 1888
Query 1859 GCCCTTGTTGCTGAAGTTGTAGGTAATTTGTCTAATCGTCTGAAGGATTATGGAGTTACT 1918
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1889 GCCCTTGTTGCTGAAGTTGTAGGTAATTTGTCTAATCGTCTGAAGGATTATGGAGTTATT 1948
Query 1919 GTGAGAGAACTCAGTGGGGATCAGTCCTTAACCGGGAGAGAAATTGAAGAGACTCAGATA 1978
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1949 GTGAGAGAACTCAGTGGGGATCAGTCCCTAACCGGAAGAGAAATTGAAGAGACTCAGATA 2008
Query 1979 ATTGTTACAACACCAGAGAAATGGGATATCATCACTAGGAAGTCTGGAGACCGAACTTAC 2038
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2009 ATTGTTACAACACCAGAGAAATGGGATATCATCACTAGGAAGTCTGGAGACCGAACTTAT 2068
Query 2039 ACTCAGCTTGTAAGACTTCTTATAATTGATGAAATTCATCTCCTTCATGATAATCGAGGG 2098
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2069 ACTCAGCTTGTGAGACTTCTTATAATTGATGAAATTCATCTCCTTCATGACAATCGAGGG 2128
Query 2099 CCTGTGCTTGAAAGCATTGTCGCTAGGACTCTTAGGCAAATTGAAACCACGAAAGAGAAT 2158
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2129 CCTGTGCTTGAAAGCATTGTTGCTAGGACTCTTAGGCAAATTGAAACCACGAAAGAGAAT 2188
Query 2159 ATTCGTCTGGTTGGTTTATCTGCTACACTGCCAAATTATGAAGACGTAGCCTTGTTTTTG 2218
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 2189 ATTCGTCTGGTTGGTTTATCTGCTACATTGCCAAATTATGAAGACGTGGCCTTATTTTTG 2248
Query 2219 CGGGTTGATCTTAAGAAAGGTTTGTTTAAATTTGACCGCAGCTACAGACCCGTGCCTCTC 2278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2249 CGGGTTGATCTTAAGAAAGGTTTGTTTAAATTTGACCGCAGCTACAGACCCGTGCCTCTC 2308
Query 2279 CATCAGCAGTATATTGGAATCACTGTGAAAAAACCGTTGCAGAGGTTCCAGTTGATGAAT 2338
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2309 CATCAGCAGTATATTGGAATCAGTGTGAAGAAACCGTTGCAGAGGTTCCAGTTGATGAAT 2368
Query 2339 GATCTATGCTATCAGAAAGTTTTGGCAGGTGCTGGAAAGCACCAGGTCCTTATTTTTGTT 2398
||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GATCTTTGTTATCAGAAAGTATTGGCTGGTGCTGGAAAGCACCAGGTCCTTATTTTTGTT 2428
Query 2399 CATTCAAGGAAGGAAACAGCGAAAACTGCTAAAGCAATACGGGACACTGCAATGGCAAAC 2458
|||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||
Sbjct 2429 CATTCAAGGAAGGAAACATCAAAAACTGCTAGAGCAATAAGGGACACTGCAATGGCGAAC 2488
Query 2459 GATACCCTCAGCAGATTCTTGAAGGAAGATAGTGTAACTCGTGAAGTTCTCCAGAGTCAT 2518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 2489 GATACCCTCAGCAGATTCTTGAAGGAAGATAGTGTAACTCGTGACGTTCTCCATAGTCAT 2548
Query 2519 GTTGACATTGTTAAAAATGGTGAGCTGAAAA-ATATTCTGCCTTACGGTTTTGCAATTCA 2577
| ||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2549 GAAGACATTGTTAAGAATAGTGACCT-AAAAGATATTCTGCCTTACGGTTTTGCAATTCA 2607
Query 2578 TCATGCTGGGTTAACAAGGGGTGATCGTGAGATCGTTGAGAATCTTTTTGCTCAGGGGCA 2637
||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 2608 TCATGCTGGGTTATCAAGGGGTGATCGTGAGATTGTTGAGACTCTTTTTTCTCAGGGGCA 2667
Query 2638 TGTGCAAGTCTTGGTTTCCACAGCAACTCTTGCATGGGGTGTGAATCTGCCTGCACATAC 2697
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2668 TGTGCAAGTCTTGGTTTCCACAGCAACTCTCGCATGGGGTGTGAATCTGCCTGCACATAC 2727
Query 2698 CGTTATTATAAAAGGAACCCAGGTGTATAATCCTGAAAAAGGGGCGTGGATGGAGCTGAG 2757
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2728 CGTAATTATAAAAGGAACCCAGGTGTATAATCCTGAAAAAGGGGCGTGGATGGAGCTGAG 2787
Query 2758 TCCTCTAGATGTTATGCAGATGCTTGGTCGTGCTGGAAGACCTCAGTATGATCAACACGG 2817
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2788 TCCTCTAGATGTTATGCAGATGCTTGGTCGTGCTGGAAGACCTCAGTATGATCAACATGG 2847
Query 2818 GGAGGGTATAATTATCACTGGCTACAGCGAGCTGCAATATTATCTTTCTTTGATGAATGA 2877
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2848 GGAGGGTATAATTATAACTGGCTACAGCGAGCTGCAATATTATCTTTCTTTGATGAATGA 2907
Query 2878 GCAACTACCTATTGAAAGCCAGTTTATTTCCAAACTTGCTGACCAGCTTAATGCTGAAAT 2937
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2908 GCAACTACCTATTGAAAGCCAGTTTATTTCCAAACTTGCTGATCAGCTTAATGCTGAAAT 2967
Query 2938 TGTGCTTGGAACCGTTCAGAATGCTAGAGAGGCTTGCCATTGGCTTGGTTATACGTATTT 2997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2968 TGTGCTTGGAACCGTTCAGAATGCTAGAGAGGCTTGCCATTGGCTTGGTTACACGTATTT 3027
Query 2998 ATATATCCGTATGGTTCGTAATCCAACGCTGTATGGCTTAGCGCCTGATGCCCTTGCAAA 3057
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3028 GTATATCCGTATGGTTCGTAATCCAACGTTGTATGGCTTAGCGCCTGATGCCCTTGCAAA 3087
Query 3058 AGACGTAGTGTTGGAGGAGAGAAGAGCTGACCTGATACATTCGGCTGCTACTATCTTGGA 3117
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3088 AGACGTAGTTTTGGAGGAGAGAAGAGCTGACCTGATACATTCGGCTGCTACTATCTTGGA 3147
Query 3118 CAAAAACAACTTGGTTAAGTATGACAGGAAAAGTGGATACTTCCAAGTTACAGATTTGGG 3177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3148 CAAAAACAACTTGGTTAAGTATGACAGGAAAAGTGGATACTTCCAAGTTACAGATTTGGG 3207
Query 3178 ACGCATTGCTAGCTACTATTACATAACCCATGGGACCATAGCTACATACAATGAGCATTT 3237
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3208 ACGCATAGCAAGCTACTATTACATAACCCATGGGACCATAGCTACATACAATGAGCATTT 3267
Query 3238 GAAGCCAACAATGGGTGATATAGATCTTTATCGTCTGTTCTCCCTGAGTGAAGAGTTCAA 3297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3268 GAAGCCAACAATGGGTGATATAGATCTTTATCGTCTGTTCTCCCTGAGTGACGAGTTCAA 3327
Query 3298 GTATGTGACGGTTCGGCAAGATGAGAAGATGGAACTGGCGAAACTTTTGGATCGTGTCCC 3357
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3328 GTATGTGACTGTTCGGCAAGATGAGAAGATGGAACTGGCGAAACTTTTGGATCGTGTCCC 3387
Query 3358 GATTCCGATCAAGGAAACTTTGGAGGAGCCCAGTGCAAAAATAAATGTATTGCTGCAGGC 3417
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3388 AATTCCGATCAAGGAAACTTTGGAGGAGCCCAGTGCCAAAATAAATGTATTGCTGCAGGC 3447
Query 3418 ATATATTTCACAGCTAAAGCTTGAGGGTCTTTCTTTGACATCTGACATGGTTTACATTAC 3477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3448 ATATATTTCACAGCTAAAGCTTGAGGGTCTTTCTTTGACATCTGACATGGTTTACATTAC 3507
Query 3478 TCAGAGTGCTGGACGTCTTGTGCGAGCTCTTTATGAAATTGTATTGAAGCGGGGATGGGC 3537
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3508 GCAGAGTGCTGGACGTCTTGTGCGAGCTCTTTATGAAATTGTATTGAAGCGGGGATGGGC 3567
Query 3538 TCAACTGGCAGAGAAGGCTCTGAACTTGTCTAAAATGGTTGGGAAGAGGATGTGGAGTGT 3597
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3568 TCAATTGGCAGAGAAGGCTCTGAACTTGTCTAAAATGGTAGGGAAGAGGATGTGGAGTGT 3627
Query 3598 CCAGACACCCCTGCGTCAGTTTCATGGAATCCCCAATGATATTTTAATGAATTTGGAGAA 3657
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||
Sbjct 3628 TCAGACACCCCTGCGTCAGTTTCATGGACTCTCCAATGATATTTTGATGCAGTTGGAGAA 3687
Query 3658 GAAGGATTTGGTGTGGGAGAGGTACTATGATCTATCCTCACAGGAGCTAGGAGAGCTTAT 3717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3688 GAAGGATTTGGTGTGGGAGAGGTACTATGATCTATCCGCACAGGAGCTAGGAGAGCTTAT 3747
Query 3718 TCGTAGTCCTAAGATGGGCAGGCCGCTTCACAAGTTCATTCACCAGTTCCCAAAATTGAC 3777
||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3748 TCGCAGTCCTAAGATGGGCAAGCCGCTTCACAAGTTCATTCACCAGTTCCCAAAAGTGAC 3807
Query 3778 TCTTTCTGCACATGTTCAGCCTATTACTCGCACTGTTCTGAAGGTGGAGCTCACAGTTAC 3837
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 3808 TCTTTCTGCACATGTTCAGCCTATTACTCGCACTGTTCTGAATGTGGAGCTTACAGTTAC 3867
Query 3838 ACCTGATTTCCTGTGGGACGAGAAAATTCATAAATATGTTGAGCCGTTTTGGATAATTGT 3897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3868 ACCTGATTTCCTGTGGGACGAGAAAATTCATAAATATGTTGAGCCGTTTTGGATAATTGT 3927
Query 3898 GGAAGACAATGATGGTGAAAAGATCCTTCATCACGAGTATTTTCTTTTGAAGAAGCAGTA 3957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3928 GGAAGACAATGATGGTGAAAAGATCCTTCATCACGAGTATTTTCTTTTGAAGAAGCAGTA 3987
Query 3958 TATTGATGAGGATCACACTTTGAACTTCACTGTGCCAATCTTTGAACCGCTGCCACCTCA 4017
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 3988 TATTGATGAGGATCACACTTTGCACTTCACTGTGCCAATTTTTGAACCGTTGCCACCTCA 4047
Query 4018 GTATTTTGTTCGAGTGGTTTCAGACAAGTGGCTTGGCTCGGAGACTGTGTTGCCTGTATC 4077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4048 GTATTTTGTTCGAGTGGTTTCAGACAAGTGGCTTGGCTCGGAGACTGTGTTGCCTGTATC 4107
Query 4078 TTTCAGGCATCTTATTCTTCCAGAAAAGTATCCACCTCCGACAGAGCTACTGGACTTGCA 4137
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4108 TTTCAGGCATCTTATTCTTCCAGAGAAGTATCCACCTCCGACAGAGTTACTGGACTTGCA 4167
Query 4138 GCCTCTCCCAGTGACGGCGCTAAGGAATCCGAATTATGAGATACTCTATCAGGATTTCAA 4197
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4168 ACCTCTCCCAGTGACGGCGCTAAGGAATCCGAATTATGAGATACTCTATCAGGATTTCAA 4227
Query 4198 GCATTTCAATCCAGTGCAGACTCAGGTCTTTACCGTTTTGTATAACACTAACGACAATGT 4257
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4228 GCATTTCAATCCAGTGCAGACTCAGGTCTTTACTGTTTTGTATAACACTAACGACAATGT 4287
Query 4258 GTTGGTTGCTGCTCCAACGGGAAGTGGGAAAACTATTTGTGCGGAGTTCGCTATTTTGAG 4317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4288 GTTGGTTGCTGCTCCAACGGGAAGTGGGAAAACTATTTGTGCGGAGTTCGCTATTTTGAG 4347
Query 4318 GAATCATCAAGAAGGACCTGATGCTACAATGCGTGTTGTTTATATTGCACCGCTTGAGGC 4377
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4348 GAATCATCATGAAGGACCTGATGCTACAATGCGTGTTGTTTATATTGCACCACTTGAGGC 4407
Query 4378 TATTGCCAAGGAGCAGTTTCGTATCTGGGAGGGGAAGTTTGGGAAGGGTCTTGGTTTACG 4437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4408 TATTGCCAAGGAGCAGTTTCGTATCTGGGAGGGGAAGTTTGGGAAGGGTCTTGGTTTACG 4467
Query 4438 GGTTGTTGAGCTAACTGGGGAGACATCATTGGATCTTAAGCTGCTTGAGAAAGGCCAGAT 4497
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4468 GGTTGTTGAGCTAACTGGGGAGACAGCATTGGATCTTAAGCTGCTTGAGAAAGGCCAGAT 4527
Query 4498 AATCATAAGTACTCCTGAGAAATGGGATGCTCTTTCCCGCAGGTGGAAACAGAGAAAATA 4557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4528 AATCATAAGTACTCCTGAGAAATGGGATGCTCTTTCCCGCAGGTGGAAACAGAGAAAATA 4587
Query 4558 CGTTCAACAAGTTAGTCTTTTCATCGTCGACGAACTCCATCTAATTGGAGGTCAAGGTGG 4617
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4588 TGTTCAACAAGTTAGTCTTTTCATCGTCGACGAACTCCATCTAATTGGAGGTCAACATGG 4647
Query 4618 TCCAGTGTTGGAGGTAATCGTCTCCAGAATGAGATATATTTCAAGTCAGGTCAATAATAA 4677
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4648 TCCAGTGTTGGAGGTAATCGTTTCCAGAATGAGATATATTTCAAGTCAGGTCATTAATAA 4707
Query 4678 GATCAGGATTGTTGCGCTATCCACTTCACTTGCAAATGCAAAAGATCTTGGGGAGTGGAT 4737
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4708 GATCAGGATTGTTGCGCTATCCACTTCGCTTGCAAATGCAAAAGATCTTGGGGAGTGGAT 4767
Query 4738 TGGGGCCAGTTCCCACGGCCTTTTCAACTTCCCTCCTGGCGTCCGTCCTGTTCCACTGGA 4797
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 4768 TGGGGCCAGTTCCCACGGCCTTTTCAACTTCCCTCCCGGAGTCCGTCCTGTTCCACTGGA 4827
Query 4798 GATCCACATTCAGGGAGTGGATATATCCAGTTTTGAAGCCAGGATGCAGGCGATGACCAA 4857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4828 GATCCACATTCAGGGAGTGGATATATCCAGTTTTGAAGCCAGGATGCAGGCGATGACCAA 4887
Query 4858 GCCAACCTACACCGCCATAGTTCAGCACGCCAAGAACAAGAAGCCGGCTATTGTTTTCGT 4917
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4888 ACCAACCTACACCGCCATAGTTCAGCACGCCAAGAACAAGAAGCCGGCTATTGTTTTCGT 4947
Query 4918 CCCAACCCGTAAACATGTCCGCTTGACTGCTGTGGATCTGATGGCTTATTCTCACATGGA 4977
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4948 CCCAACCCGTAAACATGTCCGCTTGACTGCTGTGGATCTGATGGCTTATTCTCACATGGA 5007
Query 4978 TAACCCGCAGAGTCCTGATTTCTTGTTAGGGAAACTGGAAGAACTGGACCCTTTTGTTAG 5037
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5008 TAACCCGCAGAGTCCTGATTTCTTGTTAGGGAAGCTGGAAGAACTGGACCCTTTTGTT-G 5066
Query 5038 -CCAAATCCGCGAGGAAACACTGAAGGAGACACTGCGTCATGGTATTGGGTACTTGCATG 5096
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 5067 AACAAATCCGCGAGGAAACACTGAAGGAGACACTGTGTCATGGTATTGGATACTTGCATG 5126
Query 5097 AGGGTTTAAGCAGTCTGGATCAGGAGATTGTGACACAGCTCTTTGAAGCCGGACGGATTC 5156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 5127 AGGGTTTAAGCAGTCTGGATCAGGAGATTGTGACACAGCTCTTTGAAGCTGGACGGATTC 5186
Query 5157 AGGCTTGTGTGATGAGCAGTTCATTGTGTTGGGGCACTCCATTAACTGCGCATTTGGTGG 5216
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5187 AGGTTTGTGTGATGAGCAGTTCATTGTGTTGGGGCACTCCATTAACTGCGCATTTGGTGG 5246
Query 5217 TCGTAATGGGGACACAGTATTACGATGGGAGGGAAAATTCACATTCTGATTATCCCGTCC 5276
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5247 TCGTAATGGGAACGCAGTATTACGATGGGAGGGAAAATTCACATTCTGATTATCCAGTCC 5306
Query 5277 CTGATCTGCTTCAGATGATGGGGCGTGCTAGCCGACCACTTCTTGACAATGCCGGGAAGT 5336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5307 CTGATCTGCTTCAGATGATGGGGCGTGCTAGCCGACCACTTCTTGACAATGCCGGGAAGT 5366
Query 5337 GTGTGATCTTTTGTCACGCACCGCAGAAAGAGTATTACAAGAAGTTTCTGTATGAAGCCT 5396
|||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 5367 GTGTGATCTTTTGTCATGCACCGCGGAAGGAGTATTACAAGAAGTTTTTGTACGAAGCCT 5426
Query 5397 TCCCTGTGGAAAGTCAGCTCCAGCATTTCTTGCATGATAATTTCAACGCAGAAGTGGTTG 5456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5427 TCCCTGTGGAAAGTCAGCTCCAGCATTTCTTGCATGATAATTTCAACGCAGAAGTGGTTG 5486
Query 5457 CTGGGGTTATAGAGAACAAGCAAGATGCCGTGGATTATCTTACATGGACTTTCATGTACA 5516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5487 CTGGGGTTATAGAGAACAAGCAAGATGCCGTGGATTATCTTACATGGACTTTCATGTACA 5546
Query 5517 GGAGGCTTCCCCAGAACCCTAACTACTACAATCTCCAAGGTGTTAGCCACAGGCATTTGT 5576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5547 GGAGGCTTCCCCAGAACCCTAACTACTACAATCTCCAAGGTGTTAGCCACAGGCATTTGT 5606
Query 5577 CTGATCACCTATCAGAGCTGGTTGAGAACACCTTGTCTAATCTTGAAGCCAGTAAATGCA 5636
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5607 CTGATCACCTATCAGAGCTGGTTGAGAACACCTTGTCTGATCTTGAAGCCAGTAAATGCA 5666
Query 5637 TTGAGATAGAGGATGAGATGGAACTCTCTCCTCTCAACCTTGGTATGATTGCATCGTATT 5696
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5667 TTGAGGTAGAGGATGAGATGGAACTCTCTCCTCTCAACCTTGGTATGATTGCATCCTATT 5726
Query 5697 ACTACATCAGTTATACCACCATTGAGCGCTTCAGTTCACTGTTGTCTTCTAAAACCAAGA 5756
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5727 ATTACATCAGTTATACCACCATTGAGCGCTTCAGTTCACTGTTGTCTTCTAAAACCAAGA 5786
Query 5757 TGAAGGGACTTCTTGAGATCTTAACATCAGCTTCGGAGTATGACATGATTCCTATACGGC 5816
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5787 TGAAGGGACTTCTTGAAATCTTAACATCGGCTTCAGAGTATGACATGATTCCTATACGGC 5846
Query 5817 CTGGCGAGGAGGATACGGTTCGAAGATTAATCAATCACCAGAGGTTCTCTTTTGAAAACC 5876
||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5847 CTGGCGAAGAGGACACCGTTCGAAGATTAATCAATCACCAGAGGTTCTCTTTTGAAAACC 5906
Query 5877 CAAAATGCACAGACCCTCATGTGAAGGCAAACGCGCTTCTTCAGGCGCATTTCTCAAGGC 5936
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5907 CAAAATGCACAGACCCTCATGTGAAGGCAAACGCGCTTCTTCAGGCGCATTTCTCAAGGC 5966
Query 5937 AAAACATTGGCGGGAACTTGGCAATGGATCAGCGTGATGTCCTTCTATCTGCAACCAGAC 5996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5967 AAAACATTGGCGGGAACTTGGCAATGGATCAGCGTGATGTCCTTCTATCTGCAACCAGAC 6026
Query 5997 TTCTTCAAGCGATGGTCGATGTGATATCAAGCAATGGCTGGCTGAATCTTGCTCTGTTAG 6056
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 6027 TTCTTCAAGCGATGGTCGATGTGATATCAAGCAATGGCTGGCTGAATCTTGCTCTGCTAG 6086
Query 6057 CTATGGAAGTAAGCCAGATGGTGACTCAAGGCATGTGGGAGCGGGACTCCATGCTTCTGC 6116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6087 CTATGGAAGTAAGCCAGATGGTGACTCAAGGCATGTGGGAGCGGGACTCCATGCTTCTGC 6146
Query 6117 AGCTCCCTCACTTCACAAAGGACTTGGCCAAGAGGTGCCAAGAGAATCCCGGGAAAAACA 6176
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 6147 AGCTCCCTCACTTCACAAAAGACTTGGCCAAGAGGTGCCAGGAGAATCCAGGGAAAAACA 6206
Query 6177 TTGAAACCGTATTCGATCTTGTGGAGATGGAGGACGAAGAACGCCAAGAGCTTCTCAAGA 6236
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6207 TTGAAACCGTATTCGATCTTGTGGAGATGGAGGATGAAGAACGCCAAGAGCTTCTCAAGA 6266
Query 6237 TGTCAGACGCTCAGCTTCTAGACATTGCCAGATTCTGCAACCGCTTCCCAAACATCGACC 6296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6267 TGTCAGACGCTCAGCTTCTAGACATTGCCAGATTCTGCAACCGCTTCCCAAACATCGACC 6326
Query 6297 TTACTTACGAGATTGTGGGCAGTGAAGAGGTGAACCCAGGGAAAGAGGTTACATTGCAAG 6356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6327 TTACTTACGAGATTGTGGGCAGTGAAGAGGTGAACCCAGGGAAAGAGGTTACATTGCAAG 6386
Query 6357 TGATGCTTGAGAGAGACATGGAGGGGAGGACAGAAGTGGGACCTGTGGATTCACTCAGGT 6416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6387 TGATGCTTGAGAGAGACATGGAGGGGAGGACAGAAGTGGGACCTGTGGATTCACTGAGGT 6446
Query 6417 ATCCCAAGACCAAAGAAGAAGGATGGTGGCTGGTCGTGGGCGACACCAAGACGAACCAGT 6476
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 6447 ATCCCAAGACCAAAGAAGAAGGATGGTGGCTGGTCGTGGGCGACACCAAGACAAACCAGT 6506
Query 6477 TGCTGGCAATCAAGCGTGTCTCATTGCAACGGAAAGCGAAGGTGAAGCTGGATTTCACAG 6536
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 6507 TGCTGGCAATCAAGCGTGTCTCATTGCAACGGAAAGTGAAGGTGAAGCTGGATTTCACAG 6566
Query 6537 TACCGAGTGAACCAGGAGAGAAGTCATACACACTATACTTCATGTGTGACTCTTATTTGG 6596
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6567 CACCGAGTGAACCAGGAGAGAAGTCATACACACTATACTTCATGTGTGACTCTTACTTGG 6626
Query 6597 GGTGTGACCAAGAGTACTCTTTCTCTGTTGATGTCAAAGGATCTAGCGCTGGAGATCACA 6656
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 6627 GGTGTGACCAAGAGTACTCGTTCTCTGTTGATGTCAAAGGATCCGGCGCTGGAGATCGCA 6686
Query 6657 TGGAAGAATGATTTGTTGTTCAG-CATATGCTGATTCTGGAGAGTG-G----GT-----A 6705
||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | || |
Sbjct 6687 TGGAAGAATGATTTGTTATTCAGGC-TATGCTGATTCTGGAGAGTGTGACTTGTCTTCCA 6745
Query 6706 AACTTGTCT---T-CCGTTAGGGTCTCTGCAATCTCAATTTTCTGAGAATAGATATTAAG 6761
|| | || | ||||| ||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||
Sbjct 6746 AAAA-GCCTCCGTACCGTTTGGGTCTCTGCAATCTTAGCTCTCTGAGAATATATATTAAG 6804
Query 6762 GTGTAATCGTTGTC--CTGGTCTTTTACTATTCC--TTGACCTCTGGCAATA-C-TAAAA 6815
||||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||| || | | |
Sbjct 6805 GTGTAATCGTTTTTTTCTGGTCTTTTACTATTCCAATT-AC-TCTTTTTATGTCGTGCAT 6862
Query 6816 CGAAACCTTTTAG-CCTATGTATGGGATTGTTTCTGGTTTTGTTTGGACCAAAGTCAAGA 6874
||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |
Sbjct 6863 CGAT---TTTTAATCCTATGTATGGC-TTGTTTCTAGTTTTGTTTGGACCAAACTCGACA 6918
Query 6875 GAGGAGCCAATGTCAAAACTACAATTTGAGTTTACGACTTTGAAAGCTGAGATTGCTTAA 6934
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 6919 GAGGAGCCAATGTCAAAACTACAATTTGAGTTTGTGACTTTGAAAGCTGAGATTACTTGA 6978
Query 6935 AAGAATTTTAAATGCAGCAGTGTTCATTTTGT 6966
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6979 AAGAATTTTAAATGCAGCAGTGTTCATTTTGT 7010
> AT2G42270.1 | Symbols: | U5 small nuclear ribonucleoprotein
helicase | chr2:17604330-17611333 FORWARD LENGTH=6906
Length=6906
Score = 6488 bits (3513), Expect = 0.0
Identities = 5598/6594 (85%), Gaps = 186/6594 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 170 GGTGCGGAAGCA-CATGCCAGGTTCAAGCAGTATGAGTATAGAGCCAATTCTAGTC-TGG 227
||||||| || | || |||||||| |||||||||| ||| | || |||||| |||| ||
Sbjct 22 GGTGCGG-AGGAGCAAGCCAGGTTGAAGCAGTATGGGTACAAAGTCAATTCCAGTCTTGT 80
Query 228 TGTTAACTACTGATAATCGTCCTCGCGATACTCATGAGCCTACAGGAGAACCGGAAACTC 287
| ||||| | |||| | |||| ||| ||||| ||||| || | || |||||||| | ||
Sbjct 81 TCTTAAC-AGTGATGAGCGTCGTCGTGATACGCATGAATCTTCTGGTGAACCGGAGAGTC 139
Query 288 TGTGGGGGAAAATTGATCCGAGGTCTTTTGGTGACCGTGTTGCTAAGGGG-AGGCCTCAG 346
| |||| | |||||||||| || ||||| || ||||| | | ||||| ||||||||
Sbjct 140 TCAGGGGTAGGATTGATCCGAAATCCTTTGGAGATCGTGTCG-TTAGGGGAAGGCCTCAT 198
Query 347 GAGTTGGAGGATAAGCTTAA-AAAGTCTAAGAAGAAGGAACGTG-ATGTTGTTGATGATA 404
||||| || || |||||| ||| ||||||||||| ||| | | | |||| |||||||
Sbjct 199 GAGTTAGATGAGCGGCTTAATAAA-TCTAAGAAGAA-GAA-G-GAACGTTG-TGATGAT- 252
Query 405 CTGCT-AATGTTAG-GCAGAGTAAGAGGCG-TCGTCTAAGGGAAGAGAGCGTTC-TAACT 460
|| | || | | | |||| || | | | |||||| ||||| | ||| || | ||| |
Sbjct 253 TTGGTGTCTGCTCGTG-AGAGCAA-AAGAGTTCGTCTTAGGGAGGTGAGTGTACTTAA-T 309
Query 461 GATACTGATGATGCG-GTTTATCAGCCGAAGACTAAGGAGACTAGGGCTGCTTATGAGGC 519
||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||
Sbjct 310 GATACGGAGGATG-GTGTTTATCAGCCGAAGACTAAGGAAACAAGGGTTGCTTTTGAGAT 368
Query 520 CATGCTTAGTCTAATTCAGCAGCAGTTGGGTGGGCAACCTCT-GAGTATTGTTAGTGGTG 578
|||||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || |||||| | ||||
Sbjct 369 TATGCTTGGTCTTATCCAGCAGCAATTGGGTGGGCAGCCTTTGGA-CATTGTTTGCGGTG 427
Query 579 CTGCAGATGAGATTTTGGCGGTTCTCAAGAACG-ATACATTTAGAAACCCTGAGAAA-AA 636
| || |||||||||||||| ||||| ||||| | || | | | ||||| ||| ||| ||
Sbjct 428 CGGCTGATGAGATTTTGGCAGTTCTTAAGAATGAAT-CCGTCAAAAACCATGA-AAAGAA 485
Query 637 GATGGAGATCGAGAAGTTGCTGAACCATATTGA-AAACCATGAG-TTTGA-TCAGCTTGT 693
| | ||||| ||||| | || ||| |||| | | || | | ||| | |||| ||||
Sbjct 486 GGTAGAGATTGAGAAACTACTAAACGTTATT-ACTGATCA-G-GTTTTCAGTCAGTTTGT 542
Query 694 TTCCATTGGAAAGCTGATCACGGACTTTCAAGAGGGTGGTGATTCTGGT-GGTGGTAAAG 752
||| |||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 543 TTCGATTGGAAAACTGATTACAGACTATGAAGAGGGTGGTGATTCT-TTAAGTGGTAAAG 601
Query 753 CTGA-TGACGATGAAGGACTTGATGATGAT-TTGGGCGTGGCTGTTGAATTTGAGGAGAA 810
|| | ||| |||| |||||||||| ||||| || || || || ||||| | |
Sbjct 602 CT-AGTGAGGATGGAGGACTTGATTATGATATT-GGTGTTGCCCTTGAA--T-----G-- 650
Query 811 TGAAGAAGACGATGATGAGAGTGATCCCGATATGGTTCAAGAGGAAGATGATGAGGAGGA 870
|||||| || |||||||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||
Sbjct 651 TGAAGAGGATGATGATGAGAGTGATCTTGATATGGTCCAGGATGAAAAAGATGAGGAGGA 710
Query 871 TG-A-A-------GAGCCTACCAGAACTGGAGGCATGCAGGTTGATGCTGG-GATCAATG 920
|| | | |||| || || |||||||| | ||||| | || ||| || || |
Sbjct 711 TGAAGATGTTGTTGAGCTTAACAAAACTGGAGTTGTCCAGGTGGGTG-TGGCAATAAACG 769
Query 921 ATGAGGATGCAGGAGATGCAAATGAGGGCGCAAATCTTAATGTTCAAGACATTGATGCAT 980
||||||||| || | ||||| |||| | | ||||||||||| || |||||||| |
Sbjct 770 GCGAGGATGCAAGACAGGCAAAGGAGGATACGAGTCTTAATGTTCTGGATATTGATGCTT 829
Query 981 ATTGGCTCCAGAGAAAGATCTCTCAAGCATATGAACAGCAGATTGATCCACAACAATGCC 1040
||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| | ||||
Sbjct 830 ATTGGCTTCAGAGAAAGATATCTCAAGAATATGAGCAGAAGATTGATGCACAAGAGTGCC 889
Query 1041 AGGTACTTGCAGAAGAGCTGCTTAAGGTACTCGCTGAAGGG-GATGATAGGGTTGTTGAG 1099
||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||||||
Sbjct 890 AGGAACTCGCAGAAGAGCTGCTTAAGATACTTGCTG-AGGGTAATGATAGGGATGTTGAG 948
Query 1100 AACAAGCTGCTT-ATGCACCTTCAGTTCGAAAAGTTTAGCCTTGTTAAGTTTCTGCTGCG 1158
| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||
Sbjct 949 ATCAAGCTGCTTGA-GCACCTTCAGTTTGAAAAGTTCAGCCTTGTTAAATTTCTGTTGCA 1007
Query 1159 GAATCGTCTTAAAGTTGTGTGGTGCACTCGTTTGGCTA-GGGCAGAAGACCAGGAAGAGA 1217
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||
Sbjct 1008 AAACCGTCTTAAAGTTGTGTGGTGCACCCGTTTGGCTAGGGGAAG-AGACCAGGAAGAGA 1066
Query 1218 GGAA-GAGAATTGAGGAGGAGATGAGGGGGTTGGGCCCAGAGTTGACAGCTATTGTGGAG 1276
|||| | |||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| ||||| ||
Sbjct 1067 GGAATCA-AATTGAGGAGGAGATGTTGGGGTTAGGTTCAGAGTTGGCAGCAATTGTTAAG 1125
Query 1277 CAGTTGCATG-CAACAAGAGCAACAGCGAAAGAGAGGGAGGAGAACCTGCAAAAAAG-TA 1334
||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| | | | |||| ||
Sbjct 1126 GAGTTGCATGCCAA-AAGAGCAACAGCCAAAGAAAGGGAGGAGAAAC-GGGAGAAAGATA 1183
Query 1335 TTAACGAAGAAGCCCGAC--GTT-TGAAGGACGAAACTGGTGGAGATGGAGGCAGAGGCA 1391
| || |||||||| | || || || | || || |||||| || |||| ||||||||
Sbjct 1184 TCAAAGAAGAAGCTCAACATCTTATGGATGATGATTCTGGTGTTGACGGAGACAGAGGCA 1243
Query 1392 GGAGAGATGTTGCTGACAGAGATTCAGAGAGTGGCTGGGTGAAGGGTCAGCGTCAGATGC 1451
||||||||||| ||| ||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||
Sbjct 1244 TGAGAGATGTTGATGATTTAGATTTGGAGAATGGTTGGTTGAAGGGCCAGCGTCAGGTGA 1303
Query 1452 TGGACCTGGAGAG-CTTGGCTTTTGACCAAGGTGGTCTC-CTGATGGCGAATAAGAAGTG 1509
||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| || | || || |||||| |||||
Sbjct 1304 TGGACCTGGAGAGCCTT-GCTTTTAACCAAGGTGGTTTCAC-GAGGGAGAATAACAAGTG 1361
Query 1510 TGACCTTCCCCCTGGCTCTTACAGAAGT-CATGGCAAGGGATATGATGAAGTTCATGTGC 1568
||| ||||| | |||||| ||||| | | |||||||| || |||||| ||||||||||
Sbjct 1362 TGAGCTTCCTGATCGCTCTTTCAGAA-TACGTGGCAAGGAATTTGATGAGGTTCATGTGC 1420
Query 1569 CATGGGTTTCTAAAAAGGTCGATAGCAATGAGAAGCTTGTGAAGATTACG-GAAATGCCT 1627
| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||| | || ||||
Sbjct 1421 CGTGGGTTTCTAAAAAGTTTGATAGTAATGAAAAGCTTGTGAAAATTA-GCGATTTGCCA 1479
Query 1628 GATTGGGCGCAACCGGCTTTTAAGGGAATGCAACAGTTAAACAGGGTTCAGAGCAAAGTG 1687
|| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1480 GAGTGGGCCCAACCAGCTTTTAGGGGAATGCAGCAGTTGAATAGGGTTCAGAGCAAAGTG 1539
Query 1688 TATGACACTGCACTTTTTAAGGCAGAGAACATTCTTCTTTGTGCTCCAACTGGTGCTGGG 1747
|| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1540 TACGGCACTGCTCTTTTTAAGGCTGACAACATTCTTCTTTGTGCTCCAACTGGTGCTGGG 1599
Query 1748 AAAACCAATGTTGCTATGCTCACCATACTGCAGCAACTTGAAATGAATAGGAACAAAGAT 1807
|| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| | |
Sbjct 1600 AAGACCAATGTTGCCGTGCTCACCATACTGCACCAGCTTGGATTGAATATGAACCCTGGT 1659
Query 1808 GGAAC-TTATAACCATGG-AGATTACAAAATTGTCTATGTTGCACCCATGAAAGCCCTTG 1865
||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1660 GGAACGTT-TAATCATGGTA-ATTACAAAATTGTCTATGTTGCACCAATGAAAGCCCTTG 1717
Query 1866 TTGCTGAAGTTGTAGG-TAATTTGTCT-AATCGTCTGAAGGATTATGGAGTTACTGTG-A 1922
||||||| || || || || | | ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 1718 TTGCTGAGGTCGT-GGATAGTCTATCTCAA-CGTTTGAAGGATTTTGGAGTTACTGTGAA 1775
Query 1923 GAGAACTCAGTGGGGATCAGT-CCTTAACCGGG-AGAGAAATTGAAGAGACTCAGATAAT 1980
| ||||||||||||||||||| |||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1776 G-GAACTCAGTGGGGATCAGTCCCTT-ACTGGGCA-AGAAATCAAAGAGACTCAGATAAT 1832
Query 1981 TGTTACAACACCAGAGAAATGGGATATCATCACTAGGAAGTCTGGAGACCGAACTTACAC 2040
||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||
Sbjct 1833 TGTTACAACGCCAGAGAAGTGGGATATCATCACCAGGAAATCTGGAGATCGCACTTATAC 1892
Query 2041 TCAGCTTGTAAGACTTCTTATAATTGATGAAATTCATCTCCTTCATGATAATCGAGGGCC 2100
|||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 1893 ACAGCTTGTGAGGCTTCTTATAATCGACGAAATTCATCTTCTTGATGATAATCGAGGGCC 1952
Query 2101 TGTGCTTGAAAGCATTGTCGCTAGGACTCTTAGGCAAATTGAAACCACGAAA-GAGAATA 2159
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| |||
Sbjct 1953 TGTGCTTGAAAGTATTGTCGCTAGGACTCTTAGGCAGATTGAAAGCAC-AAAGGAGCATA 2011
Query 2160 TTCGTCTGGTTGGTTTATCTGCTACACTGCCAAATTATGAAGACGTAGCCTT-GTTTTTG 2218
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || || | ||| ||||||
Sbjct 2012 TTCGTCTGGTAGGTTTATCTGCAACACTGCCAAATTGTGACGATGT-GGCTTCATTTTTG 2070
Query 2219 CGGGTTGATCTTAAGAAA-GGTTTGTTTAAATTTGACCGCAGCTACAGACCCGTGCCTCT 2277
|| || |||||||| ||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 2071 CGAGTGGATCTTAA-AAATGGGTTGTTTATATTTGACCGTAGCTACAGACCTGTGCCTCT 2129
Query 2278 CCATCAGCAGTATATTGGAATCACTGTGAAAAAACCGTTGCAGAGGTTCCAGTTGATGAA 2337
| |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 2130 CGGTCAGCAGTATATAGGAATTAATGTGAAAAAGCCGTTACGGAGGTTCCAGTTGATGAA 2189
Query 2338 TGATCTATGCTATCAGAAAGTTTTGGCAGGTGCTGGAAAGCACCAGGTCCTTATTTTTGT 2397
|||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2190 TGATATATGTTATCAGAAAGTAGTGGCTGTTGCTGGAAAACACCAGGTCCTTATTTTTGT 2249
Query 2398 TCATTCAAGGAAGGAAACAGCGAAAACTGCTAA-AGCAATACGGGACACTGCAATGGCAA 2456
|||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||
Sbjct 2250 TCATTCGAGGAAGGAAACAGCAAAAACTGC-AAGGGCAATACGGGACACAGCTATGGCAA 2308
Query 2457 ACGATACCCTCAGCAGATTCTTGAAGGAAGATAGTGTAACTCGTGAAGTTCTCCAGAG-T 2515
| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || | |
Sbjct 2309 ATGATACCCTCAGCAGATTCTTGAAGGAAGATAGTCAAAGTCGTGAAATTCTTAAGTGTT 2368
Query 2516 CATG-TTGACATTGTTAAAAATGGTGAGCTGAAAAATATTCTGCCTTACGGTTTTGCAAT 2574
| | | ||| || | || ||| ||| |||||| | |||||||||| |||||||||||
Sbjct 2369 TA-GCTGGAC-TTCTCAAGAATAATGACCTGAAAGAGCTTCTGCCTTATGGTTTTGCAAT 2426
Query 2575 TCATCATGCTGGGTTAACAAGGGGTGATCGTGAGATCGTTGAGAATC-TTTTTGCTCAGG 2633
||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||
Sbjct 2427 TCATCATGCTGGGTTGACAAGGACTGATCGTGAGATAGTTGAGAATCAATTTCGCT-GGG 2485
Query 2634 GGCATGTGCAAGTCTTGGTTTCCACAGCAACTCTTGCATGGGGTGTGAATCTGCCTGCAC 2693
|| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 2486 GGAATTTGCAAGTGTTGATTTCCACGGCAACTCTTGCCTGGGGTGTGAATTTGCCTGCAC 2545
Query 2694 ATACCGTTATTATAAAAGGAACCCAGGTGTATAATCCTGAAAAAGGGGCGTGGATGGAGC 2753
|||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||||| |||||||||||
Sbjct 2546 ATACTGTCATTATCAAAGGAACCCAAGTATATAATCCTGAGAGAGGGGAGTGGATGGAGC 2605
Query 2754 TGAGTCCTCTAGATGTTATGCAGATGCTTGGTCGTGCTGGAAGACCTCAGTATGATCAAC 2813
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 2606 TGAGTCCTTTAGATGTTATGCAGATGATTGGTCGTGCCGGAAGACCTCAATATGACCAAC 2665
Query 2814 ACGGGGAGGGTATAATTATCACTGGCTACAGCGAGCTGCAATATTATCTTTC-TTTGATG 2872
| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||| ||| |||||||
Sbjct 2666 AAGGGGAGGGAATAATAATCACTGGATACAGCAAGCTACAGTATTATC-TTCGTTTGATG 2724
Query 2873 AATGAGCAACTACCTATTGAAAGCCAGTTTATTTCCAAACTTGCTGACCAGCTTAATGCT 2932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 2725 AATGAGCAACTACCTATTGAAAGCCAGTTTATTTCCAAACTTGCTGATCAGCTCAATGCT 2784
Query 2933 GAAATTGTGCTTGGAACCGTTCAGAATGCTAGAGAGGCTTGCCATTGGCTTGGTTATACG 2992
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2785 GAAATTGTGCTTGGAACCATTCAGAATGCTAGAGAAGCTTGCCACTGGCTTGGCTATACA 2844
Query 2993 TATTTATATATCCGTATGGTTCGTAATCCAACGCTGTATGGCTTAGCGCCTGATGCCCTT 3052
||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 2845 TATTTATATGTCCGCATGGTTCGTAATCCGACACTGTATGGCGTATCGCCTGATGCCCTT 2904
Query 3053 GCAAAAGACGTAG-TGTTGGAGGAGAGAAGAGCTGACCTGATACATTCGGCTGCTACTAT 3111
||||||||| | | | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 2905 GCAAAAGACTT-GCTATTGGAGGAGAGAAGAGCTGATCTGATACATTCTGCTGCCACTAT 2963
Query 3112 CTTGGACAAAAACAACTTGGTTAAGTATGACAGGAAAAGTGGATACTTCCAAGTTACAGA 3171
||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||
Sbjct 2964 CTTGGACAAGAACAACCTGATTAAGTACGACAGGAAAAGTGGACACTTCCAGGTTACTGA 3023
Query 3172 TTTGGGACGCATTGCTAGCTACTATTACATAACCCATGGGACCATAGCTACATACAATGA 3231
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||| ||||||||||
Sbjct 3024 TTTGGGACGCATTGCTAGCTACTACTACATAAGCCATGGAACAATAGCTGCATACAATGA 3083
Query 3232 GCATTTGAAGCCAACAATGGGTGATATAGATCTTTATCGTCTGTTCTCCCTGAGTGAAGA 3291
| || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 3084 GAATCTGAAGCCAACAATGAATGATATAGAGCTTTGTCGTCTGTTCTCTCTGAGTGAGGA 3143
Query 3292 GTTCAAGTATGTGACGGTTCGGCAAGATGAGAAGATGGAACTGGCGAAA-CTTTTGGATC 3350
|||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 3144 GTTCAAGTATGTCACTGTTCGACAAGATGAGAAGATGGAACTGGC-AAAGCTTTTGGATC 3202
Query 3351 GTGTCCCGATTCCGATCAAGGAAACTTTGGAGGAGCCCAGTGCAAAAATAAATGTATTGC 3410
|||| || |||||| | |||||||| | || || ||||||||||| || || || ||||
Sbjct 3203 GTGTACCAATTCCGGTAAAGGAAACACTAGAAGATCCCAGTGCAAAGATCAACGTTTTGC 3262
Query 3411 TGCAGGCATATATTTCACAGCTAAAGCTTGAGGGTCTTTCTTTGACATCTGACATGGTTT 3470
|||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3263 TGCAAGTATATATTTCAAAGCTAAAGCTCGAGGGTCTTTCTTTGACATCTGACATGGTTT 3322
Query 3471 ACATTACTCAGAGTGCTGGACGTCTTGTG-CGAGCTCTTTATGAAATTGTATTGAAGCGG 3529
| ||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||||| |||||| ||
Sbjct 3323 ATATTACCCAAAGTGCTGGACGT-TTGTTACGAGCTATTTTTGAGATTGTGTTGAAGAGG 3381
Query 3530 GGATGGGCTCAACTGGCAGAGAAGGCTCTGAACTTGTCTAAAATGGTTGGGAAGAGGATG 3589
|| |||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3382 GGGTGGGCTCAACTGTCTCAGAAAGCTCTCAACTTGTCTAAAATGGTAGGGAAGAGGATG 3441
Query 3590 TGGAGTGTCCAGACACCCCTGC-GTCAGTTTCATGGAATCCCCAATGATATTTTAATGAA 3648
|||||||| ||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| || ||| | |||||
Sbjct 3442 TGGAGTGTTCAGACACCCCT-CTGGCAGTTTCCTGGAATTCCCAAGGAGATTCTGATGAA 3500
Query 3649 TTTGGAGAAGAAGGATTTGGTGTGGGAGAGGTACTATGATCTATCCTCACAGGAGCTAGG 3708
|||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3501 GTTGGAGAAAAACGATCTGGTGTGGGAGAGGTACTATGATCTATCTTCACAGGAGCTAGG 3560
Query 3709 AGAGCTTATTCGTAGTCCTAAGATGGGCAGGCCGCTTCACAAGT-TCATTCACCAGTTCC 3767
|||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||| | || || |||||||
Sbjct 3561 AGAGCTTATTTGTAATCCTAAGATGGGCAGACCACTTCACAAGTAT-ATCCATCAGTTCC 3619
Query 3768 CAAAATTGACTCTTTCTGCACATGTTCAGCCTATTACTCGCACTGTTCTGAAGGTGGAGC 3827
||||| ||| ||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||
Sbjct 3620 CAAAACTGAAACTTGCAGCACATGTTCAGCCGATTTCTCGTTCTGTTCTGCAGGTTGAGC 3679
Query 3828 TCACAGTTACACCTGATTTCCTGTGGGACGAGAAAATTCATAAATATGTTGAGCCGTTTT 3887
|||| || ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 3680 TCACGGTGACACCTGATTTCCACTGGGATGACAAAGCAAATAAATATGTTGAACCGTTTT 3739
Query 3888 GGATAATTGTGGAAGACAATGATGGTGAAAAGATCCTTCATCACGAGTATTTTCTTTTGA 3947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
Sbjct 3740 GGATAATTGTGGAAGACAATGATGGTGAAAAGATCCTTCATCATGAGTACTTTCTTTTTA 3799
Query 3948 AGAAGCAG-TATATTGATGAGGATCACACTTTGAACTTCACTGTGCCAATCTTTGAACCG 4006
| || | | | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||
Sbjct 3800 AAAAACGGGT-TATTGATGAGGACCACACTTTGAACTTCACTGTACCAATCTCTGAGCCA 3858
Query 4007 CTGCCACCTCAGTATTTTGTTCGAGTGGTTTCAGACAAGTGGCTTGGCTCGGAGACTGTG 4066
| || || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||
Sbjct 3859 ATTCCCCCACAGTATTTCATCCGAGTGGTTTCAGACAAATGGCTTGACTCGCCGACTGTG 3918
Query 4067 TTGCCTGTATCTTTCAGGCATCTTATTCTTCCAGAAAAGTATCCACCTCCGACAGAGCTA 4126
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||
Sbjct 3919 TTACCTGTATCTTTCAGGCATCTTATTCTTCCAGAAAAATACCCACCACCTACAGAGCTA 3978
Query 4127 CTGGACTTGCAGCCTCTCCCAGTGACGGCGCTAAGGAATCCGAATTATGAGATACTCT-- 4184
||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||| | |||||
Sbjct 3979 CTGGATTTGCAGCCCCTCCCGGTGATGGCCCTAAGAAATCCTTCTTATGA-A-ACTCTTT 4036
Query 4185 ATCAGGATTTCAAGCATTTCAATCCAGTGCAGACTCAGGTCTTTACCGTTTTGTATAACA 4244
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4037 ATCAGGATTTCAAGCATTTCAATCCAGTGCAGACTCAGGTCTTTACTGTTTTGTATAACA 4096
Query 4245 CTAAC-GACAATGT-GTTGGTTGCTGCTCCAACGGGAAGTGGGAAAACTATTTGTGCGGA 4302
| || |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 4097 C-AAGTGACAATGTAGT-GGTTGCTGCTCCAACAGGAAGTGGGAAGACTATATGTGCGGA 4154
Query 4303 GTTCGCTATTTTGAGGAATCATCAAGAAGGACCTGATGCTACAATGCGTGTTGTTTATAT 4362
||| ||||| || |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||
Sbjct 4155 GTTTGCTATATTAAGGAATCATCTCGAAGGACCTGATTCTGCAATGCGTGTTGTCTATAT 4214
Query 4363 TGCACCGCTTGAGGCTATTGCCAAGGAGCAGTTTCGT-ATCTGGGAGGGGAAGTTTGGGA 4421
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| || |
Sbjct 4215 AGCACCTCTTGAGGCTATTGCCAAGGAGCAGTTTCGTGAT-TGGGAGAAAAAGTTCGGAA 4273
Query 4422 AGGGTCTTGGTTTACGGGTTGTTGAGCTAACTGGGGAGACATCATTGGATCTTAAGCTGC 4481
|||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 4274 AGGGGCTTGGTTTACGGGTTGTTGAGTTAACTGGGGAGACATTATTGGATCTTAAGTTGC 4333
Query 4482 TTGAGAAAGGCCAGATAATCATAAGTACTCCTGAGAAATGGGATGCTCTTTCCCGCAGGT 4541
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 4334 TTGAGAAAGGTCAGATAATCATAAGTACTCCTGAGAAATGGGACGCTCTGTCCCGGAGGT 4393
Query 4542 GGAAACAGAGAAAATACGTTCAACAAGTTAGTCT-TTTCATCGTCGACGAACTCCATCTA 4600
|||||||||||||||| | || || |||||| | ||| ||||| ||||| || ||| ||
Sbjct 4394 GGAAACAGAGAAAATATATCCAGCAGGTTAGTTTGTTT-ATCGTTGACGAGCTTCATTTA 4452
Query 4601 ATTGGAGGTCAAGGTGGTCCAGTGTTGGAGGTAATCGTCTCCAGAATGAGATATATTTCA 4660
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4453 ATTGGGGGTCAAGGTGGTCAAGTGTTGGAGGTAATTGTCTCTAGAATGAGATATATTTCA 4512
Query 4661 AGTCAGGTCAATAATAAGATCAGGATTGTTGCGCTATCCACTTCACTTGCAAATGCAAAA 4720
|||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||
Sbjct 4513 AGTCAGGTTGGGAATAAAATCAGGATTGTTGCATTATCAACTTCCCTTGCAAATGCCAAA 4572
Query 4721 GATCTTGGGGAGTGGATTGGGGCCAGTTCCCACGGCCTTTTCAACTTCCCTCCTGGCGTC 4780
|||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||
Sbjct 4573 GATCTTGGAGAGTGGATTGGGGCCAGTTCATGTGGCGTTTTTAACTTCCCGCCTAATGTT 4632
Query 4781 CGTCCTGTTCCACTGGAGATCCACATTCA-GGGAGTGGATATATCCAGTTTTGAAGCCAG 4839
|||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||
Sbjct 4633 CGTCCTGTCCCACTGGAGATCCACATTCATGGG-GTGGACATATTGAGTTTTGAAGCCAG 4691
Query 4840 GATGCAGGCGATGACCAAGCCAACCTACACCGCCATAGTTCAGCACGCCAAGAACAAGAA 4899
||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 4692 GATGCAGGCGATGACTAAGCCAACATACACTGCCATAGTACAGCATGCCAAGAACAAGAA 4751
Query 4900 GCCGGCTATTGTTTTCGTCCCAACCCGTAAACATGTCCGC-TTGACTGCTGTGGATCTGA 4958
|| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 4752 ACCAGCTATCGTTTTTGTCCCGACCCGTAAACATGTCCGCCTT-ACTGCTGTGGATCTGA 4810
Query 4959 TGGCTTATTCTCACATGGATAACCCGCAGAGTCCTGATTTC-TTGTTAGGGAAACTGGAA 5017
| || || || |||||||| ||| | |||| ||||||||| || |||||||| ||||||
Sbjct 4811 TAGCATACTCGCACATGGACAACATGAAGAGCCCTGATTTCCTT-TTAGGGAATCTGGAA 4869
Query 5018 GAACTGGACCCTTTTGTTAGC-CAAATCCGCGAGGAAACACTGAAGGAGACACTGCGTCA 5076
||| | || |||||| ||| ||||| | |||||||| ||||||||||| | || ||
Sbjct 4870 GAATTAGAGCCTTTT-TTAATACAAATTTGTGAGGAAACTCTGAAGGAGACTTTACGCCA 4928
Query 5077 TGGTATTGGGTACTTGCATGAGGGTTTAAGCAGTCTGGATCAGGAGATTGTGACACAGCT 5136
||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4929 TGGCATTGGCTACCTGCACGAGGGTTTAAGCAATCTGGATCAGGAGATTGTGACTCAGCT 4988
Query 5137 CTTTGAAGCCGGACGGATTCAGGCT-TGTGTGATGAGC-AGTTCATTGTGTTGGGGCACT 5194
|||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||
Sbjct 4989 TTTTGAAGCTGGACGGATTCAGG-TATGTGTAATGT-CTAGTTCATTGTGTTGGGGTACT 5046
Query 5195 CCATT-AACTGCGCATTTGGTGGTCGTAATGGGGACACAGTAT-TACGATGGGA-GGGAA 5251
||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| | | |||||||| | |||||
Sbjct 5047 CCATTGAAG-GCACATTTGGTTGTTGTAATGGGAACACATT-TCTACGATGG-ACGGGAA 5103
Query 5252 AATTCACATTCTGATTATCCCGTCCCTGATCTGCTTCAGATGATGGGGCGTGCTAGCCGA 5311
||||| ||||| ||||| ||| || || ||||||| || ||||||||||||| |||||||
Sbjct 5104 AATTCTCATTCGGATTACCCCATCTCTAATCTGCTCCAAATGATGGGGCGTGGTAGCCGA 5163
Query 5312 CCACTTCTTGACAATGCCGGGAAGTGTGTGATCTTTTGTCACGCACCGCAG-AAAGAGTA 5370
|| || |||||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| | | ||||||||
Sbjct 5164 CCTCTGCTTGACGACGCTGGGAAGTGTGTGATCTTCTGTCATGCACCAC-GTAAAGAGTA 5222
Query 5371 TTACAAGAAGTTTCTGTATGAAGC-CTTCCCTGTGGAAAGTCAGCTCCAGCATTTCTTGC 5429
||||||||| ||| |||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||
Sbjct 5223 TTACAAGAAATTTTTGTATGAAGCTCTTCCG-GTTGAGAGTCATCTTCAACATTTCTTGC 5281
Query 5430 ATGATAATTTCAACGCAGAAGTGGTTGCTGGGGTTATAGAGAACAAGCAAGATGCCGTGG 5489
||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 5282 ATGATAATTTCAATGCAGAAGTAGTTGCTAGAGTTATAGAGAACAAACAAGATGCTGTGG 5341
Query 5490 ATTATCTTACATGGA-CTTTCATGTACAGGAGGCTTCCCCAGAACCCTAACTACTACAAT 5548
|||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5342 ATTATCTTACCTGGAGCTT-CATGTACAGGAGGCTTCCCCAGAACCCTAACTACTACAAT 5400
Query 5549 CTCCAAGGTGTTAGCCACAGGCATTTGTCTGATCACCTATCAGAGCTGGTTGAGAACACC 5608
|||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||
Sbjct 5401 CTCCTGGGAGTGAGCCACAGACATTTATCTGATCACCTCTCAGAGCTCGTTGAAAACACT 5460
Query 5609 TTGTCTAATCTTGAAGCCAGTAAATGCATTGAGATAGAGGATGAGATGGAACTCTCTCCT 5668
|||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||
Sbjct 5461 TTGTCTGATCTTGAAGTGAGTAAATGCATTGAAATAGACAATGAGTTGGATCTCTCTCCT 5520
Query 5669 CTCAACCTTGGTATGATTGCATCGTATTACTACATCAGTTATACCACCATTGAGCGCTTC 5728
||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||
Sbjct 5521 CTCAATCTTGGTATGATTGCGTCATATTACTACATAAATTACACCACCATTGAGCGATTC 5580
Query 5729 AGTTCACTGTTGTCTTCTAAAACCAAGATGAAGGGACTTCTTGAGATCTTAACATCAGCT 5788
||||| || ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||
Sbjct 5581 AGTTCTCTCTTGGCTTCCAAGACCAAGATGAAGGGTCTTCTTGAGATCTTGACTTCAGCT 5640
Query 5789 TCGGAGTATGACATGATTCCTATACGGCCTGGCGAGGAGGATACGGTTCGAAGATTAATC 5848
|||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| ||| | |||
Sbjct 5641 TCGGAGTATGACTTGATTCCTATACGTCCTGGTGAAGAGGACGCAGTTCGGAGACTCATC 5700
Query 5849 AATCACCAGAGGTTCTCTTTTGAAAACCCAAAATGCACAGACCCTCATGTGAAGGCAAAC 5908
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |
Sbjct 5701 AATCACCAGAGGTTCTCTTTTCAAAACCCAAGATGCACAGACCCTCGTGTGAAGACAAGC 5760
Query 5909 GCGCTTCTTCAGGCGCATTTCTCAAGGCAAAACATTGGCGGGAAC-TTGGCAATGGATCA 5967
|| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||
Sbjct 5761 GCACTTCTTCAGGCGCATTTCTCAAGGCAAAAAATCAGCGGGAACCTTGT-AATGGATCA 5819
Query 5968 GCGTGATGTCCTTCTATCTGCAACCAGACTTCTTCAAGCGATGGTCGATGTGATATCAAG 6027
| |||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 5820 GTGTGAGGTCCTTTTATCAGCAACAAGGCTTCTTCAAGCAATGGTCGATGTGATATCGAG 5879
Query 6028 CAATGGCTGGCTGAATCTTGCTCTGTTAGCTATGGAAGTAAGCCAGATGGTGACTCAAGG 6087
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5880 CAATGGCTGTCTGAATCTTGCTCTTTTAGCTATGGAAGTAAGCCAGATGGTGACTCAAGG 5939
Query 6088 CATGTGGGAGCGGGACTCCATGCTTCTGCAGCTCCCTCACTTCACAAAGGACTTGGCCAA 6147
||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 5940 CATGTGGGATCGAGACTCCATGCTTCTGCAGCTTCCTCACTTCACAAAGGACTTAGCCAA 5999
Query 6148 GAGGTGCCAAGAGAATCCCGGGAAAAACATTGAAACCGTATTCGATCTTGTGGAGATGGA 6207
|||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||
Sbjct 6000 AAGGTGCCATGAGAATCCGGGGAATAACATTGAAACCATATTTGATCTTGTGGAAATGGA 6059
Query 6208 GGACGA-AGAACGCCAAGAGCTTCTC-AAGATGTCAGACGCTCAGCTTCTAGACATTGCC 6265
|| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 6060 AGATGACA-AACGCCAAGAGCTTCTCCAA-ATGTCAGACGCTCAGCTTCTTGACATTGCC 6117
Query 6266 AGATTCTGCAACCGCTTCCCAAACATCGACCTTACTTACGAGATTGTGGGCAGTGAA-GA 6324
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| || ||
Sbjct 6118 AGATTCTGCAACCGCTTCCCCAACATTGACCTTACATATGAGATTGTGGGAAGT-AACGA 6176
Query 6325 GGTGAA-CCCAGGGAAAGAGGTTACATTGCAAGTGATG-CTTGAGAGAGACATGGAGGGG 6382
||| || ||| || ||||| | |||||||| || || || |||||||||||||||||
Sbjct 6177 GGT-AAGCCCTGGAAAAGATATCACATTGCAGGT-ATTACTGGAGAGAGACATGGAGGGA 6234
Query 6383 AGGACAGAAGTGGGACCTGTGGATTCACTCAGG-TATCCCAAGACCAAAGAAGAAGGATG 6441
||||| || |||||||||||||| | | || | ||||| ||||| ||||||||||| ||
Sbjct 6235 AGGACCGAGGTGGGACCTGTGGACGCGC-CAAGATATCCTAAGACTAAAGAAGAAGGTTG 6293
Query 6442 GTGGCTGGTCGTGGGCGACA-CCAAGACGAACCAGTTGCTGGCAATCAAGCGTGTCTCAT 6500
|||||| ||||| || || | ||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||
Sbjct 6294 GTGGCTAGTCGTTGGAGA-AGCCAAGACGAACCAGTTGATGGCCATCAAGAGAATCTCCC 6352
Query 6501 TGCAACGGAAAGCGAAGGTGAAGCTGGA-TTTCACAGTACCGAGTGAACCAGGAGAGAAG 6559
|||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||||||||||
Sbjct 6353 TGCAACGGAAGGCGCAGGTGAAGCTGGAGTTTG-CAGTACCAACTGAAACAGGAGAGAAG 6411
Query 6560 TCATACACACTATACTTCATGTGTGACTCTTATTTGGGGTGTGACCAAGAGTACTCTTTC 6619
|| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||
Sbjct 6412 TCGTATACACTCTACTTCATGTGCGATTCTTACTTGGGTTGTGACCAGGAGTATTCTTTC 6471
Query 6620 TCTGTTGATGTCAAAGGAT-CT-A-GCGCTGGAGATCACATGGAAGAATGATTT 6670
||||||||||||||| || || | || | | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 6472 ACTGTTGATGTCAAAG-ATTCTGATGC-C-GCAGATCACATGGAAGAATGATTT 6522
> AT3G28870.1 | Symbols: | CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Histone
deacetylase interacting (InterPro:IPR013194), Sec63 domain
(InterPro:IPR004179); BEST Arabidopsis thaliana protein match
is: unknown protein (TAIR:AT3G24260.1); Has 531 Blast hits
to 527 proteins in 118 species: Archae - 0; Bacteria - 10;
Metazoa - 251; Fungi - 29; Plants - 170; Viruses - 0; Other
Eukaryotes - 71 (source: NCBI BLink). | chr3:10890355-10891839
FORWARD LENGTH=1068
Length=1068
Score = 235 bits (127), Expect = 4e-60
Identities = 149/160 (93%), Gaps = 0/160 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6508 GAAAGCGAAGGTGAAGCTGGATTTCACAGTACCGAGTGAACCAGGAGAGAAGTCATACAC 6567
|||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 909 GAAAGCTAAGGTAAAACTTGATTTCACAGTACCGAGTGAACCAGGAGAGAAGTCATACAC 968
Query 6568 ACTATACTTCATGTGTGACTCTTATTTGGGGTGTGACCAAGAGTACTCTTTCTCTGTTGA 6627
||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 969 ACTATACTTTATGTGTGACTCTTACTTGGGCTGTGACCAAGAGTACTCTTTCTCGGTTGA 1028
Query 6628 TGTCAAAGGATCTAGCGCTGGAGATCACATGGAAGAATGA 6667
|| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 TGACAAAGGATCTGGCGTTGGAGATCACATGGAAGAATGA 1068
Score = 139 bits (75), Expect = 3e-31
Identities = 83/87 (95%), Gaps = 0/87 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6064 AGTAAGCCAGATGGTGACTCAAGGCATGTGGGAGCGGGACTCCATGCTTCTGCAGCTCCC 6123
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||
Sbjct 820 AGTAAGCCAGATGGTGACTCAGGGCATGTGGGAGCGGGCCTCTATGCTTCGGCAGCTCCC 879
Query 6124 TCACTTCACAAAGGACTTGGCCAAGAG 6150
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 880 TCACTTCACAAAGGACTTGGCCAAGAG 906
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 347825119858
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5