BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg472501
Length=3056
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G22620.1 | Symbols: ATSAC1 | Phosphoinositide phosphatase fa... 5068 0.0
> AT1G22620.1 | Symbols: ATSAC1 | Phosphoinositide phosphatase
family protein | chr1:7997676-8002944 REVERSE LENGTH=3109
Length=3109
Score = 5068 bits (2744), Expect = 0.0
Identities = 2981/3090 (96%), Gaps = 37/3090 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CACGATCCTAAACTGGAAAAGTACGAAAACACCCCTTATCTTCCGAACA-TTTTCCGATT 59
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 23 CACGATCCTAAAATAGAAAAGTACGAAAACACCCCTTATCTTCCGAACACTTTTCCGATC 82
Query 60 GCAAAATGATCGCCTGAAACCATCGCCGGCTTCAGAGTATCTGATCGTTTCTCC----AG 115
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||
Sbjct 83 GCAAAATGATCGCCTGAAACCATCGCCGGCTTCAGAGTGTTTGATCGTTTCTCCAGATAG 142
Query 116 ATAGATTGATCCATTATGGCGAAATCGGAAAACTCAACGACTTCTACTTTCTCTTCTTTC 175
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 143 ATAGATTGATCCAATATGGCGAAATCGGAAAACTCAACGACTTCGACTTTCTCTTCTTTC 202
Query 176 G-C--CAAGATTCAACCGTCCAACGATGCAGAGTCCGATCCCGATTCGTACGCCCTCGAG 232
| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 203 GCCAACAAGATTCAACCGTCCAACGATGCAGAGTCCGATCCCGATTCGTATGCCCTCGAG 262
Query 233 AAATTCAAACTCTACGAAACCAGAGCGAGGTTTTATCTAGTGGGGAGTGATAGGAATAAA 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 263 AAATTCAAACTCTACGAAACCAGAGCGAGGTTTTATCTAGTAGGGAGTGATAGGAATAAA 322
Query 293 CGATTCTTCAGAGTGTTGAAGATTGATCGTTCAGAGCCATCTGAGCTTAACATTAGTGAA 352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 323 AGATTCTTCAGAGTGTTGAAGATTGATCGTTCAGAGCCATCTGAGCTTAATATTAGTGAA 382
Query 353 GATCCTGTTGTATATTCGCCTCAAGAGATCAAGAGTCTGCTTCAGCGTATCGCTGAAGGC 412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 383 GATCCTGTTGTATATTCGCCTCAAGAGATCAAGAGTCTGCTTCAGCGTATCGCTGAAGGC 442
Query 413 AATCGTGCCACGGGAGGATTGGCTTTTGTGGCCAAAGTCTATGGAATTGCTGGTTGTGCT 472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 AATCGTGCCACGGGAGGATTGGCTTTTGTGGCCAAAGTCTATGGAATTGCTGGTTGTGCT 502
Query 473 AAGTTTATGGAGTCTTACTATTTAGTTTTGGTGACAAAACGGCGGCAGATTGGATGTATA 532
|||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 503 AAGTTTATGGAGTCATACTATTTAGTTTTGGTTACAAAACGGCGACAGATTGGATGTATA 562
Query 533 TGCGGGCATGCGATATATGCTATTGATGAAAGTCAAATGATCAGTGTTCCACATGCAACT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 563 TGCGGGCATGCGATATATGCTATTGATGAAAGTCAAATGATCAGTGTTCCACATGCAACT 622
Query 593 ATTCAATCTGATGTTGCGAATTCCAAAACTGAACTAAGGTACAAGAAGCTTCTGTCAAGT 652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 623 ATTCAATCTGATGTTGCGAATTCCAAAACTGAACTAAGGTACAAGAAGCTTCTGTCAAGT 682
Query 653 GTAGATTTGACAAAAGATTTCTTCTACAGTTACACTTATCCTATAATGCAAAGCTTGCAA 712
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 683 GTAGATTTGACAAAAGATTTCTTCTACAGTTACACTTACCCTATAATGCAAAGCTTGCAA 742
Query 713 AAGAATGTTCTATCATCTGGTGAGGAAGGGATGCCTTATGATAACATATTCGTATGGAAT 772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 743 AAGAATGTTCTATCATCTGGTGAGGAAGGGATGCCTTATGATAACATATTCGTATGGAAT 802
Query 773 TCGTATCTGACGCAGCCTATTCGATCAAGATGCAACAACACTATTTGGACACTGGCATTA 832
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 803 TCGTATCTGACGCAGCCTATTCGATCAAGGTGCAACAACACTATTTGGACACTGGCATTA 862
Query 833 GTTCATGGGCATTTTAAGCAAATAAGACTATCAATATATGGAAGGGACTTCAGTGTTACT 892
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 863 GTTCATGGGCACTTTAAGCAGATAAGACTATCAATATATGGAAGAGACTTCAGTGTTACT 922
Query 893 CTAGTCTCTAGGCGTTCTCGACATTTTGCTGGCACACGTTACTTGAAAAGGGGAGTGAAT 952
||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 923 TTAGTCTCCAGACGTTCTCGACATTTTGCAGGCACACGTTACTTGAAAAGGGGAGTGAAT 982
Query 953 GATCGTGGAAGGGTTGCAAATGATGTTGAAACAGAACAACTTGTTCTTGATGATGAAGCT 1012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 983 GATCGTGGAAGGGTTGCAAATGATGTTGAAACAGAACAACTTGTTCTTGATGATGAAGCT 1042
Query 1013 GGATCATGCAAAGGAAAAATGAGCTCAGTGGTGCAGATGCGAGGGTCAATTCCACTCTTT 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1043 GGATCATGCAAAGGAAAAATGAGCTCAGTGGTGCAGATGCGAGGGTCAATTCCACTCTTT 1102
Query 1073 TGGTCGCAAGAGGCCTCCAGATTTAGTCCTAAGCCTGATATTTTCTTACAGAGGTATGAT 1132
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1103 TGGTCACAAGAGGCCTCCAGATTTAGTCCTAAGCCTGATATCTTCTTACAGAGGTATGAC 1162
Query 1133 CCTACATATGAGTCAACCAAAATGCATTTTGAAGACCTGGTGAATCGATATGGGAACCCG 1192
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1163 CCTACATATGAGTCAACCAAAATGCATTTTGAAGACCTGGTGAATCGATATGGGAATCCG 1222
Query 1193 ATCATTGTGCTCAACTTAATTAAGACTGTTGAGAAAAGGCCTAGGGAAATGGTGCTAAGA 1252
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1223 ATCATTGTGCTCAACTTAATTAAGACAGTTGAGAAAAGGCCAAGGGAAATGGTGCTAAGA 1282
Query 1253 CGTGAGTTTGCGAATGCAGTGGGTTATCTAAATTCAATTTTTCGTGAAGAAAATCATCTC 1312
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1283 CGTGAGTTTGCGAATGCTGTGGGTTATCTAAATTCAATTTTTCGTGAAGAAAATCATCTC 1342
Query 1313 AAATTCATCCACTGGGATTTCCATAAATTTGCAAAGAGCAAGTCGGCGAATGTATTAGCT 1372
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1343 AAATTCATCCACTGGGATTTCCATAAATTTGCGAAGAGCAAGTCGGCGAATGTATTGGCT 1402
Query 1373 GTTTTGGGTGCTGTAGCAAGTGAAGCCCTTGATTTGACTGGATTATACTTCAGCGGCAAG 1432
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1403 GTTTTGGGTGCTGTAGCAAGCGAAGCCCTTGATTTGACTGGATTATATTTCAGCGGCAAG 1462
Query 1433 CCTAAAATTGTTAAGAAGAAGGCTAAACAACTTAGTCATGCTAGCACTGGAAGGGAACCT 1492
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 1463 CCTAAAATTGTTAAGAAGAAGGCTAGCCAACTTAGTCATGCTAACACTGCAAGGGAACCT 1522
Query 1493 TCTCTACGTGATCTCAGAGCTTACTCTGCGGAACTTTCAAGGGGTGAGAGTTCAAATGAT 1552
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1523 TCTCTGCGTGATCTAAGAGCTTACTCTGCGGAACTTTCAAGGGGTGAGAGTGCAAATGAT 1582
Query 1553 ATACTTAGTGCTCTTGCTAATCGAGAGAAGGAGATGAAGCTAAGCCAACaaaaaaaaGAC 1612
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1583 ATACTTAGTGCTCTTGCTAATCGAGAGAAAGAGATGAAGCTAACCCAACAAAAAAAAGAC 1642
Query 1613 GAGGGAACTGATTCTTCAGCTCCGCGTTACCAAAGTGGTGTTCTGCGTACTAACTGCATT 1672
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1643 GAGGGAACTAATTCTTCAGCTCCTCGTTACCAAAGTGGTGTTCTGCGTACTAACTGTATC 1702
Query 1673 GATTGCTTGGATCGAACAAATGTAGCACAGTATGCATATGGTTTGGCTGCTTTAGGCCGG 1732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GATTGCTTGGATCGAACAAATGTAGCACAGTATGCATATGGTTTGGCTGCTTTAGGCCGG 1762
Query 1733 CAGCTGCATGCAATGGGTTTGAGCGATACACCTAAAATCGACCCTGACAGTAGCATAGCT 1792
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1763 CAGCTGCATGCAATGGGTTTGAGCGATACACCTAAGATCGACCCTGACAGTAGCATAGCT 1822
Query 1793 GCTGCACTTATGGATATGTACCAGAGCATGGGAGATGCCCTTGCACAACAATATGGCGGC 1852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1823 GCTGCACTTATGGATATGTACCAGAGCATGGGAGATGCCCTTGCACAACAATATGGCGGC 1882
Query 1853 TCAGCTGCTCATAACACTGTTTTCCCAGAAAGGCAGGGGAAATGGAAGGCCACAACACAG 1912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1883 TCAGCTGCTCATAACACTGTTTTCCCAGAAAGGCAGGGGAAATGGAAGGCCACGACACAG 1942
Query 1913 TCTAGAGAGTTTCTCAAGTCTATCAAACGATACTACAGCAATACCTACACCGATGGCGAA 1972
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1943 TCTAGAGAGTTTCTCAAGTCTATCAAACGATACTACAGCAATACCTACACTGATGGCGAA 2002
Query 1973 AAGCAAGACGCCATAAACTTATTCTTGGGCTACTTTCAACCTCAGGAAGGGAAACCTGCG 2032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2003 AAGCAAGACGCCATAAACTTATTCTTGGGCTACTTTCAACCTCAGGAAGGGAAACCTGCG 2062
Query 2033 CTCTGGGAGCTGGATTCTGATTATTATCTCCATGTTTCAGGGATTGGAGATGATATTTTC 2092
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2063 CTCTGGGAGCTGGATTCTGATTACTATCTCCATGTTTCAGGGATTGGAGATGATATTTTC 2122
Query 2093 CCAGATATCGGGGTCCAGTCCATTGCTAAACCTATGAGTGGTATTGGAGTCAATCTTGCA 2152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2123 CCAGATATCGGGGTCCAGTCCATTGCTAAACCTATGAGTGGTATTGGAGTCAATCTTGCA 2182
Query 2153 CCAGTGCCAGCTTTCAGAGACGACTTCTCGCGGAAGAAGCTGACATCGTTTGACAAACTG 2212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2183 CCAGTGCCAGCTTTCAGAGACGACTTCTCGCGGAAGAAGCTGACATCGTTTGACAAACTG 2242
Query 2213 ATAGAGCAGACATGCAGTTCAATAAAGAACGTGAGGCTTTGTAGTGAGACAGACCAAAGG 2272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2243 ATAGAGCAGACATGCAGTTCAATAAAGAACGTGAGGCTTTGTAGTGAGACAGACCAAAGG 2302
Query 2273 CCAGGTGGCAACACTGGAAGCACTGGTGTGGCTCCTGATGCAGCTGAGATTCAGCTCAAG 2332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2303 CCAGGTGGCAACACTGGAAGCACTGGTGTGGCTCCTGATGCAGCTGAGATTCAACTCAAG 2362
Query 2333 AGCCCCAATTGGCTGTTTGGTTCAAGAAAGCCCGAAGAGAGTAGTTCTGCCACAAAATCT 2392
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2363 AGCCCCAATTGGCTGTTTGGTTCAAGAAAGCCCGAAGAGAGTAGCTCTGCCACAAAATCT 2422
Query 2393 GGTGCAGACGATAGTGAGAAAGGAGTAACCTCGACTGAGAGAGTCAACGATTTCTGCAAC 2452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2423 GGTGCAGACGATAGTGAGAAAGGAGTAACCTCGACTGAGAGAGTCAACGATTTCTGCAAC 2482
Query 2453 TTGGACTGGCTTTCTAAGTCCGACCGTCATCAAGAAGATATCTTCCAAAGGTATCTATCG 2512
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2483 TTGGACTGGCTTTCTAAGTCCGACCGTCATCAAGGAGATATCTTCCAAAGGTATCTATCG 2542
Query 2513 ATTACATCAACCAATGAAGCCAATGGTTGGTATGGTGGTACTCTCCTCGGTGACCAAGAT 2572
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2543 ATTACATCAACCAATGAAGCCAATGGTTGGTATGGTGGCACTCTCCTCGGTGACCAAGAT 2602
Query 2573 GAAAACAGCGAAATTTACAGACATTACGCTCAATTCTGTCAGTGTCCAGCGATGGAACCA 2632
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2603 GAAAACAGCGAAATTTACAGACATTACGCCCAATTCTGTCAGTGTCCAGCGATGGAACCA 2662
Query 2633 TTTGAGAATGATCATGAGTTAGAACAAAACTTTGCGGAAGTTCTCCGCATGAACACAGTT 2692
|||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2663 TTTGAGAACGATCATGAGTTTGAACAGAACTTTGCGGAAGTTCTCCGCATGAACACAATC 2722
Query 2693 GATGTAATGGACATTGAAGAAGAAAAAACAGAGATGGAAAGCGCTTTCAATGAATACACA 2752
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2723 GATGTAATGGACATTGAAGAAGAAGAAACGGAGATGGAAAGCGATTTCAATGAATACACT 2782
Query 2753 CAGATCGGTAGCGATCTCGGGATCATTCCAATGCAATGCAAACACTTTGCTGGTGATCCT 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2783 CAGATCGGTAGCGATCTCGGGATCATTCCAATGCAATGCAAACACTTTGCTAGTGATCCT 2842
Query 2813 TGTTGGCTAGCCAGATGGCTTGTCGGAGATGATAAGGTCCCAAAGGTCATTTAATCACGA 2872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2843 TGTTGGCTAGCCAGATGGCTTGTCGGAGATGATAAGGTCCCGAAGGTCATTTAATCACGA 2902
Query 2873 AACCAATGA-----------A-GA-C---AC-----C--T-CTTTTTTGGTTGCATGTTT 2908
||||||||| | || | || | | |||||||||||||||||||
Sbjct 2903 AACCAATGATTTTGCTCCCCAAGAACGTCACGGAGACACTTCTTTTTTGGTTGCATGTTT 2962
Query 2909 GTGAATGTGTTTG-GCTGTGCATTTTGTGTAGATATATATATAAGAAGGGACAAACCCAA 2967
||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||
Sbjct 2963 GTGAATGTGTTCGAG-TGTGCATTTTGTGTAGATATATGTA-A-GAAGGGACAAACCCAA 3019
Query 2968 AACAATATTTTGTACCC-AAAAAATATTTGTTGGTTTATGATTAAGCTCACGTATAATAC 3026
| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3020 AGCAATATTTTGTACCCCAAAAAATATTTGTTGGTTTATGATTAAGCTCACGTATAATAC 3079
Query 3027 AGAATATACGAATGATTTAACCCCAGAGGC 3056
||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 3080 AGAATATACGAATGATTCAACCTCAGAGGC 3109
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 151955670347
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5