BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg472714
Length=2429
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G26850.1 | Symbols: | S-adenosyl-L-methionine-dependent met... 3493 0.0
> AT1G26850.1 | Symbols: | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
superfamily protein | chr1:9300873-9304139
REVERSE LENGTH=2426
Length=2426
Score = 3493 bits (1891), Expect = 0.0
Identities = 2022/2086 (97%), Gaps = 5/2086 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 347 ATCAATAATGGCGTTGAAGTCTAGTTCTGCTGATGGTAAAACCAGAAGCTCTGTTCAGAT 406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 ATCAATAATGGCGTTGAAGTCTAGTTCTGCTGATGGTAAAACCAGAAGCTCTGTTCAGAT 355
Query 407 CTTCATTGTGTTTAGTTTATGTTGCTTCTTTTACATTCTT-GGAGCATGGCAACGAAGTG 465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 356 CTTCATTGTGTTTAGTTTATGTTGCTTCTTTTACATT-TTGGGAGCATGGCAACGAAGTG 414
Query 466 GTTTTGGTAAAGGAGACAGTATTGCTCTTGAGATGACTAACAGTGGAGCTGATTGCAATA 525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 415 GTTTTGGTAAAGGAGACAGTATTGCTCTTGAGATGACCAACAGTGGAGCTGATTGCAACA 474
Query 526 TTGTTCCTAGCTTGAATTTCGAGACTCACCACGCTGGCGAATCGAGTATTGTTGGTGCTT 585
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 475 TTGTTCCTAGCTTGAATTTCGAGACTCATCACGCTGGCGAATCAAGTCTTGTTGGTGCTT 534
Query 586 CTGAAGCAGCAAAGGTCAAGGCTTTTGAGCCTTGTGATGCTCGTTACACGGATTACACTC 645
||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 535 CTGAAGCTGCAAAGGTCAAGGCTTTCGAGCCCTGTGATGGTCGTTACACGGATTACACTC 594
Query 646 CCTGTCAAGATCAGAGACGTGCCATGACTTTCCCGAGAGATAGTATGATTTACCGAGAAA 705
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 CTTGTCAAGATCAGAGACGTGCCATGACTTTCCCGAGAGATAGTATGATTTACCGAGAAA 654
Query 706 GGCATTGTGCTCCCGAGAAGGAGAAGCTGCATTGTCTTATACCGGCTCCTAAAGGATATG 765
||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 GGCATTGCGCTCCTGAGAATGAGAAGCTCCATTGTCTTATACCGGCTCCTAAAGGATATG 714
Query 766 TGACACCTTTCTCTTGGCCCAAGAGTCGAGATTATGTGCCTTATGCTAATGCGCCGTATA 825
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 TGACACCTTTCTCTTGGCCTAAGAGTCGAGACTATGTGCCTTATGCTAATGCGCCGTATA 774
Query 826 AAGCCTTGACTGTTGAGAAGGCTATTCAGAACTGGATTCAGTATGAGGGTGATGTTTTTA 885
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 775 AAGCATTGACTGTTGAGAAGGCTATTCAGAATTGGATTCAGTATGAGGGAGACGTTTTTA 834
Query 886 GATTCCCTGGCGGTGGAACTCAGTTCCCTCAAGGTGCTGATAAGTATATCGATCAGCTTG 945
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 GATTCCCTGGTGGTGGAACTCAGTTCCCTCAAGGTGCTGATAAGTATATCGATCAGCTTG 894
Query 946 CTTCGGTGATACCTATGGAGAACGGAACTGTTAGGACTGCTTTGGACACTGGTTGTGGGG 1005
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 CTTCCGTGATACCTATGGAGAACGGAACTGTTAGGACTGCTTTGGACACTGGTTGTGGGG 954
Query 1006 TTGCAAGTTGGGGAGCATACTTATGGAGCAGAAATGTGCGTGCAATGTCTTTCGCACCAA 1065
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 955 TTGCAAGTTGGGGAGCGTACTTATGGAGCAGAAATGTGCGTGCAATGTCTTTTGCACCAA 1014
Query 1066 GAGATTCCCACGAGGCTCAGGTCCAATTTGCTCTCGAGAGAGGTGTTCCCGCTGTTATTG 1125
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 GAGATTCACACGAGGCTCAGGTCCAGTTTGCTCTCGAGAGAGGTGTTCCCGCTGTTATTG 1074
Query 1126 GTGTTCTTGGCACCATAAAGTTACCATACCCAACACGTGCTTTCGACATGGCTCATTGCT 1185
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 GTGTTCTTGGTACCATAAAGTTGCCATACCCAACACGTGCTTTCGACATGGCTCATTGCT 1134
Query 1186 CTCGGTGTTTGATTCCATGGGGAGCAAATGATGGGATGTACTTGATGGAAGTTGACCGTG 1245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 CTCGGTGTTTGATTCCATGGGGAGCAAATGATGGGATGTACTTGATGGAAGTTGACCGTG 1194
Query 1246 TGCTTAGACCCGGTGGCTACTGGATTCTATCTGGTCCTCCAATCAACTGGAAAGTCAACT 1305
|||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 TGCTTAGACCTGGTGGGTACTGGATTCTGTCTGGTCCTCCAATCAACTGGAAAGTCAACT 1254
Query 1306 ACAAGGCATGGCAACGTCCCAAGGAGGACCTTCAAGAGGAACAAAGAAAGATTGAGGAAG 1365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 ACAAGGCATGGCAACGTCCCAAGGAGGACCTTCAAGAGGAACAAAGAAAGATTGAGGAAG 1314
Query 1366 CTACTAAACTTCTTTGTTGGGAGAAAAAGTATGAACACGGTGAGATCGCAATTTGGCAGA 1425
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1315 CTGCTAAACTTCTTTGTTGGGAGAAAAAGTATGAACACGGTGAGATTGCAATTTGGCAGA 1374
Query 1426 AGAGAGTCAATGATGAGGCATGCCGATCAAGACAAGATGATCCTAGAGCCAATTTCTGCA 1485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375 AGAGAGTCAATGATGAGGCATGCCGATCAAGACAAGATGATCCTAGAGCCAATTTCTGCA 1434
Query 1486 AAACCGATGATAGCGATGATGTCTGGTACAAGAAAATGGAGGCATGTATTACGCCGTATC 1545
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1435 AAACCGATGATACCGATGATGTCTGGTACAAGAAAATGGAGGCATGTATTACACCGTATC 1494
Query 1546 CGGAGACAAGTAGCTCAGATGAAGTAGCTGGTGGTGAGCTACAGGCTTTCCCAGATAGGC 1605
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1495 CGGAGACAAGTAGCTCAGATGAAGTAGCTGGTGGTGAGCTTCAGGCTTTCCCAGATAGGC 1554
Query 1606 TCAATGCAGTGCCGCCCAGGATCTCTAGCGGTTCGATCTCTGGTGTTACTGTTGATGCCT 1665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TCAATGCAGTGCCGCCCAGGATCTCTAGCGGTTCGATCTCTGGTGTTACTGTTGATGCCT 1614
Query 1666 ATGAAGACGATAACAGACAGTGGAAAAAACATGTGAAAGCCTACAAGAGAATCAACAGTC 1725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1615 ATGAAGACGATAACAGACAGTGGAAAAAACATGTGAAAGCCTACAAGAGAATCAACAGTC 1674
Query 1726 TACTTGACACGGGAAGGTACCGTAACATCATGGACATGAACGCAGGGTTTGGGGGATTTG 1785
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1675 TACTTGACACTGGAAGGTACCGTAACATCATGGACATGAACGCAGGGTTTGGTGGATTTG 1734
Query 1786 CTGCTGCTCTCGAATCCCAAAAGCTTTGGGTTATGAATGTTGTTCCCACAATTGCCGAAA 1845
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1735 CTGCTGCTCTTGAATCCCAAAAGCTTTGGGTTATGAATGTTGTTCCCACAATTGCCGAAA 1794
Query 1846 AGAATAGACTTGGAGTTGTATATGAACGAGGACTCATCGGTATCTACCATGACTGGTGTG 1905
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1795 AGAACAGACTCGGAGTTGTATATGAACGAGGACTCATCGGTATCTACCATGACTGGTGTG 1854
Query 1906 AGGCTTTTTCTACATACCCAAGAACATATGACCTGATCCACGCGAACCACCTCTTCAGTC 1965
||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855 AGGCTTTCTCTACATATCCAAGAACATATGACCTGATCCACGCGAACCACCTCTTCAGTC 1914
Query 1966 TGTACAAGAACAAGTGCAATGCGGATGACATTCTTCTGGAGATGGATAGAATTCTCCGAC 2025
| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915 TATACAAGAACAAGTGCAATGCGGATGATATTCTTCTAGAGATGGATAGAATTCTCCGAC 1974
Query 2026 CAGAAGGTGCGGTTATAATCCGGGACGATGTGGATACATTGATCAAGGTGAAGAGAATCA 2085
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1975 CAGAAGGAGCGGTTATAATCCGGGATGATGTGGATACATTGATCAAGGTGAAGAGAATCA 2034
Query 2086 TCGCCGGAATGAGATGGGATTCGAAGCTTGTCGATCACGAGGATGGTCCTTTAGTTCCTG 2145
|||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2035 TCGCTGGAATGAGATGGGATGCGAAGCTTGTCGATCATGAGGATGGTCCTTTAGTTCCTG 2094
Query 2146 AGAAGGTTTTGATTGCTGTGAAGCAGTATTGGGTCACCAACTCCACCTCGACCCACTGAA 2205
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2095 AGAAGGTTTTGATTGCCGTGAAGCAGTATTGGGTCACCAACTCCACCTCGACTCACTGAA 2154
Query 2206 GTTACTTTATTGCCGGTGTGACCTGACATTTTGATCAAATGATAGAGCTTTCGTCCTTAG 2265
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155 GTTACTTTATTTCCGGTGTGACCTGACATTTTGATCAAATGATAGAGCTTTCGTCCTTAG 2214
Query 2266 GGAATGTGAGAGAGCTGCAA-TCTCGTCTTTAAACACTTTTTGAAGTATCTATTTATTAA 2324
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2215 GGAATGTGAGAGAGCTGCAAATCTTGTCTTTAAACACTTTTTGAAGTATCTATTTATTGA 2274
Query 2325 TGTTATAGTTTATATTTGTTTCCCAATCCAAAAACTTGGAACTTTGTGGTGTATCATTGA 2384
||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2275 TGTTATAGTTTATTTTTGTTTCCCAATCCAAAAGCTTGGAACTTTGTGGTGTACCATTGA 2334
Query 2385 ATTCTCAACTTAATAGTTTTTGCA-TAAGCCAACTCTGTTTCTTCT 2429
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 2335 ATTCTCAACTTAATAGTTTTTGCACTA-GCCAACTCTGTTTCTTCT 2379
Score = 291 bits (157), Expect = 3e-77
Identities = 217/242 (90%), Gaps = 20/242 (8%)
Strand=Plus/Plus
Query 114 AATCTCAATGGCTCTGTTTTAAAAAGGGCAAATTAGAGAG-----TCCTTCGATAAC--A 166
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
Sbjct 1 AATCTCAATGGCTCTGTTTTAAAAAGGGCAAATTAGAGAGATTTCTCCTTCAATAACAAA 60
Query 167 AAATCGCCAGCTTTAtctctctctctctctTTTTTACACATCCCATGGCTAGATGATGAC 226
||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 61 AAATCGCCAGCTTTA------TCTCTCTC-TTTTT-CACATCCCATGGCTAGATGGTGAC 112
Query 227 GACGATTCA--CATAAACTAGGGTTTCCCCACAAATAATCTTACACGTATCCTCTATTCC 284
||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 113 GACGATTCACGCATAAACTAGGGTTCCCCCACAAATCATCTTACACGTATCCTCTATTCC 172
Query 285 TTCCTTCCTTTCTCCGTCATCATCATCATTTTTCCCACCGACAACAATCTCTCAGAGTTT 344
|||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 173 TTCCTTCCTTTCTCCGTCATCATCAT--TTTT-CCCACCGACAACAATCTCTCGGAGTTT 229
Query 345 GG 346
||
Sbjct 230 GG 231
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 120631909635
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5