BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg472902
Length=5190
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G24460.1 | Symbols: | unknown protein; FUNCTIONS IN: molecu... 5518 0.0
> AT1G24460.1 | Symbols: | unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function
unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown;
LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23
plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; BEST
Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT4G31570.1);
Has 181008 Blast hits to 85359 proteins in 3551
species: Archae - 3290; Bacteria - 48304; Metazoa - 70793;
Fungi - 13943; Plants - 10118; Viruses - 785; Other Eukaryotes
- 33775 (source: NCBI BLink). | chr1:8666072-8672651 FORWARD
LENGTH=5737
Length=5737
Score = 5518 bits (2988), Expect = 0.0
Identities = 3342/3510 (95%), Gaps = 36/3510 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCACGAGAATGATGATCTTCCGCATGATTC---CGTTGA--GAA-T--G-ATGACGAA 51
||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| ||| | | |||| ||
Sbjct 1 ATGCACGAGAAGGATGATCTTCCGCAGGATTCTATAGCTGATGGAATTGAGAATGATGAC 60
Query 52 GAGTCTAATGGGCAAGAAGAAGAAGAGCTTGATCCTGACCAGGGAACAGTTTTCGTTGAT 111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 61 GAGTCTAATGGGCAAGAAGAAGAAGAGCTTGATCCTGACCAGGGAACAGCTTTCGTTGAT 120
Query 112 AGTAAGGAAGATATGTTTGTTGATGCTCCTGAAGAGTTGAATTTTGATACACCTAGCAAG 171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AGTAAGGAAGATATGTTTGTTGATGCTCCTGAAGAGTTGAATTTTGATACACCTAGCAAG 180
Query 172 GAAGCTCTTACCACAgatgatgatgatgataatgatgaCCTTGCATA-TCATTTCAATGT 230
|||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |
Sbjct 181 GAAGCTCTTACCAC--A-GATGACGATGATAATGATGACCTTGGA-ACTCATTTCAATAT 236
Query 231 TGAGAAGGAGGATTGGGAGAAGGAACTTGCAGGGCTTCAGGAGCAGTTTAAGCTGTTGAC 290
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237 TGAGAAGGGGGATTGGGAGAAGGAACTTGCAGGGCTTCAGGAGCAGTTTAAGCTGTTGAC 296
Query 291 TGGTGTGAATGATTTGAAAGGTGAAGATGGGAGCACTACTGTGGATATTGTCAATCGCTT 350
||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 297 TGGTGAGAATGATTTGACAGGTGAAGATGGGAACACTACTGTGGATATTGTCAGTCGCTT 356
Query 351 CTCAAAGCTTCTT-ATAACTGCCAAGGAAGAGAGGATTCAGCATGAGGTTGCACTCAAGG 409
||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 CTCGAAG-TTCTTAAAAACTGCCAAGGAAGAGCGGATTCAGCATGAGGTTGCACTCAAGG 415
Query 410 AGCTTCACGGGGTTATTAGTGGGAAGGACGATGAGATTGCTGATCTCACCACAAAGATCT 469
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 416 AGCTTCACGGGGTTATTAGTGGGAGGGACGATGAGATTGCTGATCTCACCACAAAAATCT 475
Query 470 CTGAGCTTTCTTCGTCACAGCCGGTTTCCGAAATGGGCGATCAGGCACAGAACATGGAGC 529
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 476 CTGAGCTTTCTTCGTCGCAGCCGGTTTCCGAAATGGGTGATCAGGCACAGAACTTGGAGC 535
Query 530 ACCTTGAGGCTGCAACAGATAGGATTATGGTTTCTCTTAGTAATGTATTT-GGGCAGGAG 588
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |
Sbjct 536 ACCTTGAGGCTGCAACGGATAGGATTATGGTTTCTCTTAGTAATGTATTTGGGGAAGG-G 594
Query 589 GAGCTGCAGTATGGTTCTTCTATCTCTGAAAAGCTTGCTCATCTAGAAAACCGAGTTTCG 648
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 595 GAGTTGCAGTATGGTTCTTCTATCTCTGAAAAGCTTGCTCATCTGGAGAACCGAGTTTCG 654
Query 649 TTTTTAGGTGCAAAGTATACTGAATTTTACTATGGTGCTGATCAGTTAAGGAAGTGTTTG 708
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 TTTTTAGGTGCAAAGTATACTGAGTTTTACTATGGTGCTGATCAGTTAAGGAAGTGTTTG 714
Query 709 TCTAGTGATGTGTTGGATCTTAGTTTCCAAGAGGATTTTGGTTCAGCTCTCGGTGCTGCT 768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 715 GCTAGTGATGTGTTGGATCTTAGTTTCCAAGAGGATTTTGGTTCAGCTCTTGGTGCTGCT 774
Query 769 TGTTCTGAGCTACTTGAGCTCAAACAGAAGGAAGCAGCCTTTTTGGAAAGACTTAGTCTT 828
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 775 TGTTCTGAGCTATTTGAGCTCAAACAGAAGGAAGCAGCCTTTTTTGAAAGACTTAGTCAT 834
Query 829 CTAGAAGATGAAAATAGGAATTTTGTTGAACGAGTGGACAGAGATAAAGAAATGAT-TGA 887
||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | |||
Sbjct 835 CTAGAAGATGAGAATAGGAACTTTGTTGAACAAGTGAACAGAGAGAAAGAAATG-TGTGA 893
Query 888 GTCAATGAGAACAGAATTTGAAAAATTGAAGGCAGAGCTTGAGCAAGAAAAGACAAAGTG 947
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 894 GTCAATGAGAACAGAATTTGAAAAATTGAAGGCAGAGCTTGAGCTAGAAAAGACTAAGTG 953
Query 948 TACTAACACAAAAGAAAAGCTCAGCATCGCCGTAACAAAGGGGAAGGCGTTAGTTCAGAA 1007
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 954 TACTAACACAAAAGAAAAGCTCAGCATGGCCGTAACAAAGGGGAAGGCGTTAGTTCAGAA 1013
Query 1008 TCGGGATGCTCTGAAGCATCAATTGTCTGAAAAAATAACAGAGCTTGCGAATAGGTTGAC 1067
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014 CCGGGATGCTCTGAAGCATCAATTGTCTGAAAAAACAACAGAGCTTGCGAATAGGTTGAC 1073
Query 1068 TGAATTACAAGAGAAAGAGATTGCCCTTGAAAATTCTGAAGTAGTGAAGGGGCAGCTGGA 1127
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1074 TGAATTACAAGAGAAGGAGATTGCCCTTGAAAGTTCTGAAGTAATGAAGGGGCAGCTGGA 1133
Query 1128 ACAATCGTTAGCCGAAAAGACGGATGAACTTGAGAAATGCTATGCTGAATTGAATGATAG 1187
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1134 ACAATCGTTAACCGAAAAGACGGATGAACTTGAGAAATGCTATGCTGAATTGAATGATAG 1193
Query 1188 GTCCGTATCCCTGGAAGCATATGAGCTAACAAAGAAAGAGTTGGAACAGTCTCTGGCTGA 1247
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1194 GTCCGTATCCCTGGAAGCATATGAGCTAACAAAGAAGGAGTTGGAACAGTCTCTGGCTGA 1253
Query 1248 GAAAACCATAGAACTTGAAGAGTGTTTGATGAAACTACAAGAGATGTCAACAGCATTGGA 1307
||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 AAAAACAAAAGAACTTGAAGAGTGTTTGACGAAACTACAAGAGATGTCAACAGCATTGGA 1313
Query 1308 TCAATCTGAACTCGAAAAAGGCGAGTTAGCCAAATCCGATGCTATGGTTGCATCATATCA 1367
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314 TCAATCTGAACTCGACAAAGGCGAGTTAGCAAAATCCGATGCTATGGTTGCATCATATCA 1373
Query 1368 GGAAATGATATCGGTCAGGAACTCTACCATTGAAAATATTGAAACTATCCTGTCAAACAT 1427
||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374 GGAAATGTTATCGGTGAGGAACTCTATCATTGAAAATATTGAAACTATCCTGTCAAACAT 1433
Query 1428 AGATACACCAGAAGAAGGTCAGTCTTTTGATATCGTTGAAAAAGTTAGGTCACTTGCAGA 1487
| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1434 ATATACACCTGAAGAAGGTCACTCTTTTGATATCGTTGAAAAAGTAAGGTCACTTGCAGA 1493
Query 1488 AGAGAGGAAAGAGCTCATAAATGTTTCCCAGGAATACAACAGACTAAAAGATTTGATCTT 1547
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1494 AGAGAGGAAAGAGCTCACAAATGTTTCCCAGGAATACAACAGACTAAAAGATTTGATCGT 1553
Query 1548 TTCCATTGACTTACCAGAGGAGATTTCTCAATCCAGCTTAGAAATTCGCCTAGCTTGGCT 1607
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1554 TTCCATTGACTTACCAGAGGAGATGTCCCAATCCAGCTTAGAAAGTCGCCTAGCTTGGCT 1613
Query 1608 TAGAGAATCTTTTCTCCAGGGAAAAGATGAAATTAATGCCTTGCAAAACCGGATCGAAAG 1667
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1614 TAGAGAATCTTTTCTCCAGGGAAAAGATGAAGTTAATGCCTTGCAAAACCGGATTGAAAG 1673
Query 1668 TGTAAGCATGTCTCTTTCAGCAGAAATGGAGGAGAAAAATAACATTAGAAAGGAACTGGA 1727
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1674 TGTAAGCATGTCTCTTTCAGCAGAAATGGAGGAGAAAAGTAACATTAGAAAGGAACTGGA 1733
Query 1728 TGATTTAAGTTTCAGTTTGaaaaaaaTGGAGGAAACTGCAGAGCGAGGTTCTTTGGAGAG 1787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1734 TGATTTAAGTTTCAGTTTGAAAAAAATGGAGGAAACTGCAGAGCGAGGTTCGTTGGAGAG 1793
Query 1788 GGAGGAAATTGTGAGGAGACTTGTGGAAATCTCTGGCTTGATGACAGAAGGAGTCGAAGA 1847
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1794 GGAGGAAATTGTGAGGAGACTTGTGGAAACCTCTGGCTTGATGACAGAAGGAGTCGAAGA 1853
Query 1848 TCATAATTCTTCAGCTATCAATTTACTTGTTGATAGATCCTTCGAGAAGATAGAAAAGCA 1907
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1854 TCATACTTCTTCAGATATCAATTTACTTGTTGATAGATCATTCGACAAGATAGAAAAGCA 1913
Query 1908 AATCAGGGATTCTAGCGACAGTTCTTATGGCAACGAAGAAATATTCGAAGGCTTTCAAAG 1967
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 1914 AATCAGGGATTCTAGTGATAGTTCTTATGGCAACGAAGAAATATTTGAAGCCTTTCAAAG 1973
Query 1968 TCTCCTTTATGTGAGAGATCTGGAGTTTTCACTTTGTAAGGAAATGCTAGGAGAGGGAGA 2027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1974 TCTCCTTTATGTGAGAGATCTGGAGTTTTCACTTTGTAAGGAAATGCTAGGAGAGGGAGA 2033
Query 2028 GCTGGTTAGCTTTCAGGTAAGCAATCTCTCAAATAAACTAAAGATCGCATCTCAAGAACT 2087
|||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2034 GCTGATTAGCTTTCAGGTAAGCAATCTCTCAGATGAGCTAAAGATCGCATCTCAAGAACT 2093
Query 2088 TGCTTTCGTGAAAGAAGAAAAAATTGCTTTGGAGAAAGATCTTGAGCGATCAGAGGAGAA 2147
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2094 TGCTTTCGTGAAAGAAGAAAAAATTGCTTTGGAGAAAGATCTAGAGCGATCAGAGGAGAA 2153
Query 2148 ATCTGCTTTGCTCAGAGACAAACTTTCTATGGCTATCAAGAAAGGCAAGGGACTAGTCCA 2207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2154 ATCTGCTTTGCTCAGAGACAAACTTTCTATGGCTATCAAGAAAGGCAAGGGACTAGTCCA 2213
Query 2208 AGATAGGGAAAAGTTTAAAACTCAGTTGGATGAGAAAAATTCTGAAATCGAAAAGCTGAT 2267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2214 AGATAGGGAAAAGTTTAAAACTCAGTTGGATGAGAAAAAATCTGAAATCGAAAAGCTGAT 2273
Query 2268 GCTCGAGTTGCAGCAGCTAGGTGGTACGGTTGATGGCTACAAGAATCAGATAGATATGTT 2327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2274 GCTCGAGTTGCAGCAGCTAGGTGGTACGGTTGATGGCTACAAGAATCAGATAGATATGTT 2333
Query 2328 ATCGAGAGACTTAGAGCGCACGAAAAAGCTAGAGACTGAGCTTGTTGCAATTAAAGAAGA 2387
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 2334 ATCGAGAGACTTAGAGCGCACGAAAGAGCTAGAGACTGAGCTTGTTGCTACTAAAGAAGA 2393
Query 2388 AAGAGATCAAC-TCAAGCAATCCTTATCTCTAAATGACACGTTGTTGCAGAAAGTGATGA 2446
||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2394 AAGAGATCAACTTC-AGCAATCCTTATCTCTAATTGACACGTTGTTGCAGAAAGTGATGA 2452
Query 2447 AATCAGTCGAAATTATAGCTGTCCCTGTTGATTTAGCAGTATCTGAGGATCCTTCAGAAA 2506
||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 2453 AATCAGTTGAAATTATAGCTCTCCCTGTTGATCTAGC---ATCTGAAGATCCTTCAGAAA 2509
Query 2507 AGATTGACCGACTTGCTGGGTACATCAAAGAAGTGCAGCTGGCTAGAGGT-GAGGAACAA 2565
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 2510 AGATTGACCGACTTGCTGGGTACATCCAAGAAGTGCAGCTGGCTAGA-GTAGAGGAACAA 2568
Query 2566 GAAGAACTAGAGAAAGTAAAGGCAGAAGTTTATGCGTTAGCCAGTAAATTAGCAGAAACC 2625
|||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2569 GAAGAAATAGAAAAAGTAAAGTCAGAAGTTGATGCGTTAACCAGTAAATTAGCAGAAACC 2628
Query 2626 CAAACAGCCCTGAAATTGGTTGAGGATGCCTTGTCTACTGCAGAGGGTAACATCAGTCAG 2685
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 2629 CAAACAGCCCTGAAGTTGGTTGAGGATGCCTTGTCTACTGCAGAGGATAACATCAGTCGG 2688
Query 2686 CTTACTGAGTACAATAGAGAA-GTCCAAGCTGCCAAGGAAAATGTTGACCTTGAGCTGCA 2744
||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 2689 CTTACTGAGGAGAATAGA-AATGTCCAAGCTGCCAAGGAAAATGCTGAGCTTGAGCTGCA 2747
Query 2745 AAAAGCAGTTGCAGATGCCTCCTCTGTAGCTAGTGAACTGGATGAAGCTT-TTGCAACCA 2803
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 2748 AAAAGCAGTTGCAGATGCCTCCTCTGTAGCTAGCGAACTGGATGAAG-TTCTTGCAACCA 2806
Query 2804 GAAGCACACTTGAAGCTGCACTCATGCAGGCTGaaaaaaaTATATCTGATATTATTAGTG 2863
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2807 AAAGCACACTTGAAGCTGCACTCATGCAGGCTGAAAGAAATATATCTGATATTATTAGTG 2866
Query 2864 AAAAGGAAGAGGCTCAAGGCAGAACTGCTACTGCAGAGATGGAGCTAGAGATGGTGCAAA 2923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 2867 AAAAGGAAGAGGCTCAAGGCAGAACTGCTACTGCAGAGATGGAGCAAGAGATGCTGCAAA 2926
Query 2924 AAGAAGTTTCAGTTCAGAAGAACAAATTAACAGAAGCCCATAGCACCATAAATTCACTTG 2983
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2927 AAGAAGCTTCAATTCAGAAGAACAAATTAACAGAAGCACATAGCACCATAAATTCACTTG 2986
Query 2984 AAGAGACACTTGCTCAGGCAGAAAGCAACATGGATTCGCTGTCCAAACAAATTGAAGATG 3043
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2987 AAGAAACACTTGCTCAGACAGAAAGCAACATGGATTCGCTGTCCAAACAAATTGAAGATG 3046
Query 3044 GCAAAGTTCTTAGTGCAAGTTTGAAGAATGAGTTAGAGAAGCATAAAATTGAGGCCGAGT 3103
||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |
Sbjct 3047 ACAAAGTTCTTACTACAAGTTTAAAGAATGAGTTAGAGAAGCTTAAAATTGAGGCAGAAT 3106
Query 3104 TTGAGCGTAGCAAGATGGCCGATGCTTCCTTGACAATAGGATCCCTA-GAGGAGGCACTA 3162
||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||
Sbjct 3107 TTGAGCGTAACAAGATGGCCGAAGCTTCCTTGACAATAGTATCCC-ATGAGGAGGCACTA 3165
Query 3163 ATGAAGGCAGAGAATAGTCTTTCTGCTTTACAAGGAGAAATGGTGAAAGCTGAAGGCGAG 3222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3166 ATGAAGGCAGAGAATAGTCTTTCTGCTTTACAAGGAGAAATGGTGAAAGCTGAAGGCGAG 3225
Query 3223 ATATCAACTCTCAGTAGTAAACTTAATGTATGCATGGAAGAGTTAGCTGGATCAAGTGGA 3282
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3226 ATATCAACTCTCAGTAGTAAACTTAATGTATGCATGGAAGAGTTAGCTGGATCAAGCGGA 3285
Query 3283 AACTCACAGAGTAAATCTTTGGAGATTATTGCTCATCTTGATAATCTCCAGATGCTACTG 3342
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3286 AACTCACAGAGTAAATCTTTGGAGATTATTACTCATCTTGATAATCTCCAGATGCTACTG 3345
Query 3343 AAGGATGGAGGTCTAATTTCCAGGGTGAATGAATTCCTTCAAAGGAAGTTCAAGAGCCTT 3402
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3346 AAGGATGGAGGTCTAATTTCCAAGGTGAATGAATTCCTTCAAAGGAAGTTCAAGAGCCTT 3405
Query 3403 AGAGACGTGGATGTCATTGCTAGAGATATCACACGAAATATTGGTGAGAA-GGTATTATT 3461
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 3406 AGAGACGTGGATGTCATTGCTAGAGATATCACACGAAATATTGGTGAGAATGG-ATTATT 3464
Query 3462 GGCAGCGGAAATCGGCAACGCTGAGGATAA 3491
||||| |||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 3465 GGCAGGGGAAATGGGCAACGCTGAGG-TAA 3493
Score = 1308 bits (708), Expect = 0.0
Identities = 771/802 (96%), Gaps = 2/802 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4254 AGAGGCAAAGGAAATTCTAATTCCAGCTTCTGATATGCGTGCCCTTTTTGACAAAATAAA 4313
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4440 AGAGGCAAAGGAAAATCTAATTCCAGCTTCTGATATGCGAACCCTTTTTGACAAAATAAA 4499
Query 4314 TGATATTGAGGTGCCTTCAGTAGATCTAGTCAACGGATTAGATCCACAGAGTCCATATGA 4373
|| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4500 TGGTATTGAAGTGCCATCAGTAGATCTAGTCAACGGATTAGATCCACAGAGTCCATATGA 4559
Query 4374 TGTAAAGAAGCTATTCGCGATTGTTGATAGTGTTACTGAAATGCAGCATCAGATAGACAT 4433
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4560 TGTGAAGAAGCTATTCGCGATTGTTGATAGTGTTACTGAGATGCAGCATCAGATAGACAT 4619
Query 4434 CTTATCATATGGACAAAAAGAGCTCAATTCCACTTTGGCAGAAAAGGATCTTGAAATTCA 4493
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4620 CTTATCATATGGACAAAAAGAGCTCAATTCTACTTTGGCAGAAAAGGATCTTGAAATTCA 4679
Query 4494 AGGTCTAAAGAAGGCGGCTGAAGCAGAGAGTACGACCGAGCTAGAGTTAGTGAAGGCAAA 4553
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4680 AGGTCTAAAGAAGGCGACTGAAGCAGAGAGTACGACCGAGCTAGAGTTAGTGAAGGCAAA 4739
Query 4554 GACTGAATTGTCCAAGCTAATATCTGGCTTGGAGAAACTGCTGGGTATATTGGCGGGCAA 4613
|| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4740 GAATGAACTGTCCAAGCTAATATCTGGCTTGGAAAAACTGCTGGGTATATTGGCAAGCAA 4799
Query 4614 TGATCCTGTTGTAGACCCAAACTACTCCGAGTCATGGACACTCGTACAAGCACTAGaaaa 4673
| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4800 TAATCCTGTTGTAGACCCAAACTTCTCCGAGTCATGGACACTCGTACAAGCACTAGAAAA 4859
Query 4674 aaaGATAACTTCCCTTCTCCTAGAATCAGAGAGTTCAAAATCAAGGGCCCAAGAACTTGG 4733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4860 AAAGATAACTTCCCTTCTCCTAGAATCAGAGAGTTCAAAATCAAGGGCCCAAGAACTTGG 4919
Query 4734 TTTAAAGTTGGCCGGTAGCGAGAAAATTGTCGATAAATTATCTATAAA-AGTCAAAGAAT 4792
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||||| |
Sbjct 4920 TTTAAAGTTGGCCGGTAGCGAGAAACTTGTCGATAAACTATC-ATTAAGAGTCAAAGAGT 4978
Query 4793 TTGAAGATAAACTTCAAAGCAAAGCAATTCAGCCTGATATTGTTCACGAAAGAAGCATCT 4852
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4979 TTGAAGAGAAACTTCAAACCAAAGCAATTCAGCCTGATATTGTTCAAGAAAGAAGCATCT 5038
Query 4853 TCGAAGCACCAAGAGCACCTTCTACCTCAGAGATATCCGAGATTGAGGACAAGGGAGCCT 4912
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5039 TCGAAACACCGAGAGCACCTTCTACCTCAGAGATATCCGAGATTGAGGACAAGGGAGCCT 5098
Query 4913 TGGGGATAAAATCAATATCACCGGTGCCTACAGCAGCACAAGTGAGAACAGTGAGGAAGG 4972
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5099 TGGGAATAAAATCAATATCACCGGTGCCTACAGCAGCACAAGTGAGAACAGTGAGGAAGG 5158
Query 4973 GATCGACGGATCATCTTTTAATCAACATAGATTCAGAGTCCGAGCATCTGATGAACCACA 5032
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5159 GATCGACGGATCATCTTTCAATCAACATAGATTCAGAGTCCGAGCATCTGATGAACAACA 5218
Query 5033 ACGAAACAGATGAAGATAAAGG 5054
||||||||||||||||||||||
Sbjct 5219 ACGAAACAGATGAAGATAAAGG 5240
Score = 1109 bits (600), Expect = 0.0
Identities = 670/704 (95%), Gaps = 4/704 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3485 AGGATAATTCGACTGAGGCAAAATCGTTGTTGAGTGACCTTGATAATTCAGTGAACACAG 3544
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3527 AGGATGATTCGACTGAGGCAAAATCGTTGTTGAGTGACCTTGATAATTCAGTGAACACAG 3586
Query 3545 AGCCGGAGAATAGTCAAGGGAATGCAGCTAATGAAGACGAAATTTCTTCATCCCTTAGGA 3604
||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3587 AGCCGGAGAATAGTCAAGGGAGTGCAGCTGATGAAGACGAAATTTCTTCATCCCTTAGGA 3646
Query 3605 AGATGGCAGAGGGGGTCAGGCTGAGAAACAAAACCCTCGAGAATAACTTTGAGGGTTTCT 3664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3647 AGATGGCAGAGGGGGTCAGGCTGAGAAACAAAACCCTCGAGAATAACTTTGAGGGTTTCT 3706
Query 3665 CAACTAAAATTGACACTCTCATAGCGGCGGTGATGCAAAACATGACAGCAGCTAGGGCTG 3724
||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3707 CAACTTCCATTGATACTCTCATAGCGACTTTGATGCAAAACATGACAGCAGCTAGGGCTG 3766
Query 3725 ATGTGATAAATATCGTGGTTCATAATGCGTCCTTGGAAGAACAGGTGAGGAGTGTGGAAG 3784
||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3767 ATGTGTTAAATATCGTGGGTCATAATTCATCCTTGGAAGAACAGGTGAGGAGTGTGGAA- 3825
Query 3785 AA-ATTGTTCGCGAACAGGAGAACACTATATCTGCATTACAAAAAGATTTGTCATCTTTG 3843
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3826 AATATTGTTCGTGAACAGGAGAACACTATATCTGCATTACAAAAAGATTTGTCATCTTTG 3885
Query 3844 ATGTCTGCATGTGGTGCGGCTGCCAGAGAACTGCAGTTGGAAGTTAAAAATAACCTCTTA 3903
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3886 ATATCTGCATGTGGTGCGGCTGCCAGAGAACTGCAGTTGGAAGTGAAAAATAACCTCTTA 3945
Query 3904 GAGCTGGTTCAGTTCCAAGAAAATGAAAATGGTGGTGAGACGGAATTAGCTGAAGACCCA 3963
||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||
Sbjct 3946 GAGTTGGTTCAATTCCAAGAAAATGAAAACGGTGGTGAGATGGAATCAACTGAAGACCCA 4005
Query 3964 CAGGAGCTTCATGTAAGTGAATGCGCCCAAAG-AGTAAAAGAATTATCTTCTGCCGCAGA 4022
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4006 CAGGAGCTTCATGTAAGTGAATGCGCCCAAAGGA-TAAAAGAATTATCTTCTGCCGCAGA 4064
Query 4023 GAAGGCATGTGCTACTCTTAAGCTCTTCGAAACAACAAATAATGCAGCTGCCGCTGTAAT 4082
||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4065 GAAGGCATGTGCTACTCTTAAACTCTTTGAGACAACAAATAATGCAGCTGCCACTGTAAT 4124
Query 4083 CCGAGATATGGAGAATAGACTAACAGAAGCATCTGTCGCTCTAGAAAAGGTTGTGTTAGA 4142
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4125 CCGAGATATGGAGAACAGGCTAACAGAAGCATCTGTCGCTCTAGAAAAGGCTGTGTTAGA 4184
Query 4143 AAGAGATCTAAACCAAACTAAGGTTTCAAGTTCTGAGGCCAAGG 4186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4185 AAGAGATCTAAACCAAACTAAGGTTTCAAGTTCTGAGGCCAAGG 4228
Score = 217 bits (117), Expect = 1e-54
Identities = 121/123 (98%), Gaps = 0/123 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5068 GGTCTCAGGTGGAAGAGTATTAATGAGCCGTCCTCAAGCAAGGCTTGGCGTAATGGTATA 5127
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5322 GGTCTCAGGTGGAAGAGTATTGATGAGCCGTCCTCAAGCAAGGCTTGGCGTTATGGTATA 5381
Query 5128 CAGTCTCTTATTGCATCTGTGGCTCCTAGCCTCCATCTTGTAATCAAGACAGGTGACTCT 5187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5382 CAGTCTCTTATTGCATCTGTGGCTCCTAGCCTCCATCTTGTAATCAAGACAGGTGACTCT 5441
Query 5188 TAG 5190
|||
Sbjct 5442 TAG 5444
Score = 135 bits (73), Expect = 3e-30
Identities = 73/73 (100%), Gaps = 0/73 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4183 AAGGAAGAGAAATGGCATGAAAAAGAGGTGGAACTGTCTACGTTATATGATAAACTATTG 4242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4273 AAGGAAGAGAAATGGCATGAAAAAGAGGTGGAACTGTCTACGTTATATGATAAACTATTG 4332
Query 4243 GTGCAAGAGCAAG 4255
|||||||||||||
Sbjct 4333 GTGCAAGAGCAAG 4345
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 259011926709
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5