BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg472916
Length=4300
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G24300.1 | Symbols: | GYF domain-containing protein | chr1:... 5267 0.0
AT1G27430.1 | Symbols: | GYF domain-containing protein | chr1:... 4370 0.0
> AT1G24300.1 | Symbols: | GYF domain-containing protein | chr1:8614365-8620420
REVERSE LENGTH=4638
Length=4638
Score = 5267 bits (2852), Expect = 0.0
Identities = 3294/3501 (94%), Gaps = 55/3501 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 845 CTGACTCAGGTGAAACAAAAGTTGATGGTGCTTTGCTAGGGTTTGTTAATGGTGACAATG 904
|||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 1076 CTGAGTCAGGTGAGACAAAAGTGGATGGTGCTTTGCTAGGGTTTATGAATGGTGACAATG 1135
Query 905 GTTCCATGCAAAATAGTGA-TCCTGGATTACTTGGTAGTCATAATGGAGATCTGGGGGGT 963
| |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1136 GCTCCATGAAAAATAATGATTCC-GGATTACTTGGTAGTCATAATGGAGGTCTGGGGGCA 1194
Query 964 GCTCCAAGCGTCTCAAGATTAAATTCTGTGGCTTCTGAAAGTTATGGATCTTTTGGAACT 1023
||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1195 GCTTCTAGCGTCCCAAGATTGAATTCAGTGGCTTCTGAAAGTTATGGATCTTTTGGAGCT 1254
Query 1024 GG-TATTCAAGTTTCTCATGGAAGTCCTGAAGCAGTTAGATCAGTTCTTACTAAGTCCTC 1082
|| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1255 GGTTA-TCAAGTTTCTCATGGAAGTCCTGAAGCAGTTAGATCAGTTTTTACTAAGTCCCC 1313
Query 1083 TGTGTTGGATGGGAGTGAATCCGTTGTTGGGTCTTTCGAGCAAGATTACATGGGCAAGCT 1142
||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1314 TGTGTTGGATGGGAGCGAATCTGTTGTTGGGTCGTTCGAGCAAGATTATATGGGCAAGCT 1373
Query 1143 GCAGCAACCAGATATTGAAGTAGATCACTCAGAAGGGGCTATGCCACCTGAGGAGTTT-T 1201
||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 1374 GCAGCAACCAGATGTTGAAGTGGATCAGTCAGAAGCGGCTATGCCACCTGAGGA-TTTCT 1432
Query 1202 TATTCTTGTATATTGATCCTCAAGGAGTAATTCAGGGACCATTCATTGGTTCTGACATTA 1261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 TATTCTTGTATATTGATCCTCAAGGAGTAATTCAGGGACCATTCATTGGTTCTGACATTA 1492
Query 1262 TTTCATGGTTTGAACAAGGGTTTTTTGGGACAGACCTACAGGTTCGCTTGGCAAATGCTC 1321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1493 TTTCATGGTTTGAACAAGGGTTTTTTGGGACAGACCTACAGGTGCGCTTGGCAAATGCTC 1552
Query 1322 CAGAAGAAACTCCTTTTCAAGATCTAGGTAGGGTCATGTCATATTTAAAGACAGAAAGCG 1381
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 CAGAAGGAACTCCTTTTCAAGATCTAGGCAGGGTCATGTCATATTTAAAGACAGAAAGCG 1612
Query 1382 CCCATGCCCATATCAGTAACCAAAAGAGTGAGCTAGAAGAGACTAGGTTAAAAGCAAATT 1441
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613 CCCATGCCCATATCAGTAACCAAGAGAGTGAGCTAGAAGAGACTAGGTTAAAAGCAAATT 1672
Query 1442 CAGACACTGGTTTATCAATTGCACCTGTAGCAGAATCAAATGATTCATCCTC------T- 1494
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 1673 CAGACACTGGTTTATCAATTGCACCAGTAGCAGAATCTAATGATTCATCCTCTATGAATG 1732
Query 1495 ---CGT-TCG-T--TTTT-GGTGTATAACAACCCCTCAGCTCAGGATAATTTTCAGAGAA 1546
||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1733 GCACGTCTCGTTCGTTTTCAGTGTATAACAACCCCTCAGCTCAGGATAATTTTCAAAGAA 1792
Query 1547 AGTCTGAGTCAGAAGTTTATGGGACACCACCACATACTGAGGACCGAAGTTTCTTGGACT 1606
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1793 AGTCTGAGTCAGAATTTTATGCGACACCACCACATACTGAGGACCGAAGTTTCTTGGACT 1852
Query 1607 TCTCTGCTCAGGATGAAGAAATTGTATTCCCAGGAAGAGCTGGAGTTTCTGGTTATGCAT 1666
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1853 TCTCTACTCAGGATGAAGAAATTGTATTCCCAGGAAGAGCTGGAGTTTCTGGTTATGCGT 1912
Query 1667 CAGTAAATTCCTCTACAAGTATGCATGATGCTTTAATGGAATTTTCTGGCCAGTCTGCTA 1726
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1913 CAGTAAAATCCTCTACAAGTATGCATGATGCTTTTATGGAAGTTTCTGGCCAGTCTGCTA 1972
Query 1727 TTCCTGTTGAATCAACTAAGGCTGCTACTCAAAAGCAGAATGAGAATAAGCTGCACCCGT 1786
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 1973 TTCCTGTTGAATCCACTAAGGCTGCTACTCAAAAGCAGCATGAGAATAAGCTGCATCCGT 2032
Query 1787 TTGGTGTGTTGTGGTCTGAGCTAGAGAGCAGTAATGCACCAGTTAACCTGTTCCCAAACA 1846
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2033 TTGGTGTGTTGTGGTCTGAGCTAGAGAGCAGTAACGTACCAGTTAACCTGTTACCAAACA 2092
Query 1847 GGTCTTATGATGCAATGGGGGAGCCTACTGGTTCAATAGAAAATTGGCCCATTGATTCCC 1906
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 2093 GGTCCTATGATGCAATGGGGGAGCCTACTGGTGCAATAGACAATCGGCCCATTGATTCCC 2152
Query 1907 GAAGAAATAAACAAGTTGATCCCAACATGTCCCTTGATGCTCTGGCTTCTAACCGGATGT 1966
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2153 GAAGAAATACACAAGTTGATCCCAACATGTCCCTTGATGGTCTGGCTTCTAACCGGATGT 2212
Query 1967 CGCAGTTTGAACATGTTTCCAACCGCTTTAGCCTTGGGGATCAACTTTCATCAAATCAAC 2026
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2213 CGCAGTTTGAACATCTTTCCAACCGCTTTAACCTTGGGGATCAACTTTCATCAAATCAAC 2272
Query 2027 ATCACCAACAGCAATTCCAAAACCGGGATATGCTGTCGCATTCACATATAGGTGATCAAG 2086
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2273 ATAACCAACAGCAATTCCAAAACCGGGATATGCTGTCGCATTCACATATAGGTGATCAAG 2332
Query 2087 CTCAGGATCTTGAGCATTTAATAACTCTCcagttgcagcagcaacagaagattcagttgc 2146
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2333 CTCAGGATCTGGATTATTTAATAACTCTCCAGTTGCAGCAGCAACAAAAGATTCAGTTGC 2392
Query 2147 aacagcagcagaagattcagttgcaacagcagcagaagatgcagctgcaacagca----- 2201
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 2393 AACAGCAGCAGAAGATTCAATTGCAGCAGCAGCAGAAGATTCAGTTGCAACAGCAGCAGA 2452
Query 2202 ---T-CA-----A-C----T-A----GAACAAGAGCATCAGTTACATCAGAAGCTCTTAC 2242
| || | | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2453 AGATGCAGCTGCAACAGCATCAACTAGAACAAGAGCATCAGTTACATCAGAAGCTCTTAC 2512
Query 2243 AGGAGCAACAACAGTCCCATGCTCGACAATTGCATTTTCAACAGATTCTACAAGGACAGA 2302
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2513 AGGAGCAACAACAGTCCCATGCTCGGCAATTACATTATCAACAGATTCTACAAGGACAGA 2572
Query 2303 CTCCTGATTCAAGGTTTGGGCAGTCCCATGACTTCCCTCGATCCAACAGTGTTGATCAGA 2362
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2573 CTCCTGATTCAAGGTTTGGGCAGTCACATGACTTCCCTCGATCCAACAATGTTGATCAGA 2632
Query 2363 TGTTGTTAGAGCACCAGCTAATGAATGAACTGCAGAAAAATTCTGGTCATCCGTCACAAA 2422
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 2633 TGTTGTTAGAACACCAGCTAATGAATGAACTGCAGAAAAGTTCTGGCCATCCGTCACAAA 2692
Query 2423 ATTTTGCACCATACCTTGAGCAACTTGCTGCAGGAAATTTTGGTCAATTGCCACATGAAG 2482
|||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2693 ATTTTGCACCATACATTGAGCAACTTGCCGCTGGAAATTTTGGTCAATTGCCACATGAAG 2752
Query 2483 GCCATCAGAGGGAACTACTTGAACAGCTACTTTCAACAAAAATGCAATCTCAATATGGAC 2542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2753 GCCATCAGAGGGAACTACTTGAACAGCTACTTTCAACAAAAATGCAATCTCAATATGGAC 2812
Query 2543 CAATGCAATCTCAACATGGACAACTGCAATCTGAACCAACTCGGTCTTTGGAGTACCAAC 2602
|||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CAATGCAATCTCCATACGGACAACTGCAATCTGAACCAACTCGGTCTTTGGAGTACCAAC 2872
Query 2603 TGCTGCAGCAAGAGCAGCTGATGCAATTGGCAAACGGAGTGAGGCACAATACACTATTGG 2662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2873 TGCTGCAGCAAGAGCAGCTGATGCAATTGGCAAACGGAGTGAGGCACAATACACTATTGG 2932
Query 2663 AGGAACAGAGACATATTGATCCTCTGTGGCCATCTGACCATAATGATCAGCTTCTAAGAA 2722
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2933 AGGAACAGAGACATATTGACCCTCTGTGGCCATCTGACCATAATGATCAGCTTCTAAGAA 2992
Query 2723 ATCATCCTGGGATCCACCGTTCGCGGTCCTCTACAGGATTTAGACCACTAGACTTTCATC 2782
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2993 GTCATCCTGGGATCCAACGTTCGCGATCCTCTACAGGATTTAGACAACTAGACTTTCATC 3052
Query 2783 AACATCAGCAGAGGCCACCCTTCGAGGATCAGTTTGGTCAACTTGAGCGGAACCTTTTAT 2842
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3053 AACAGCAGCAGAGGCCACCCTTCGAGGATCAGTTTGGTCAACTTGAGCGGAACCTTTTAT 3112
Query 2843 ATCAGCAACAGCTTCGACAAGAATTATTTGAGCAGGGTCTGCCATTTGAGCGATCAGCAT 2902
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3113 ATCAGCAACAGCTTCGACAAGAATTATTCGAGCAGGGTCTGCCATTTGAGCGATCAGCAT 3172
Query 2903 CCTTACCCGTAAGTGTATCGGGGATGAATCTGGATGCAGTAAATGGTCTTGGACTCTCTC 2962
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3173 CCTTACCTGTAAGTGTATCGGGGATGAATCTGGATCCAGTAAATGGTCTTGGACTCTCTC 3232
Query 2963 AGGGTCTGGAGTTGCGGGATGCCACTGCCCACATGCAGATTGGGAATTCTACTCTGGGTT 3022
| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3233 AAGGTCTGGAGTTGCGGGATGCTACTACCCACATGCAGATTGGGAATTCTACTCTGGGTT 3292
Query 3023 TCAGTCATCAGAATCCCCGTATACCATTAGGTGAACCTCATTTTTCACAGTTGGAACCAA 3082
| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3293 TTAATCATCAGAATCCCCGTATACCAATAGGTGAACCTCATTTTTCACAGTTGGAATCAA 3352
Query 3083 TAGAAGGACGCTGGTCTGGAGCTGATACACAGGTTGTTGGTGAGTGGGCCGAATCTCAAT 3142
| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3353 TGGAAGGACGTTGGTCTGGAGCTGACACACAGGTTGTTGGTGACTGGGCCGAATCTCAAC 3412
Query 3143 TTCATAGATCAAATATTGATGCTGAACATCATAAAATAAGGTCAGAAAGTAGGAGAATGG 3202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3413 TTCATAGATCAAATATTGATGCTGAACATCATAAAATGAGGTCAGAAAGTAGGAGAATGG 3472
Query 3203 GTGAGGATTCCAACTCATGGATGGTAGGTGGAACTACAGAAGACAGGTCAAAACAGCTAT 3262
|||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3473 GTGAAGATTCCAACTCATGGATGTTAGGTGGGACTACAGAAGACAGGTCAAAACAGCTAT 3532
Query 3263 TTTTGGAGTTGCTCCACCAGAGACCCGGCCATCAATCTGCTGAATCACCAAGCATGAACC 3322
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3533 TTATGGAGTTGCTCCACCAGAGACCCGGCCATCAATCTGCTGAATCACCAAGCATGAACC 3592
Query 3323 GTGGGGAATCCTATGACAGGATGGCTCCTTCTGGCCTTACCCCAGGGATTCAAACACTTG 3382
||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3593 GTGGGCAATCCTTTGACAGGATGGCTCCTTCTGGCCTTACCCCAGGGATTCAAACACTTG 3652
Query 3383 GCGGCCT-TTCAGACCATGGTGGTAGTCTTAACGCTCCATCTACTTTTGGGGCTCGAGCA 3441
||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||
Sbjct 3653 GCGGC-TATTCAGATCATGGTGGTAGTCATAACGCTCCTTCAACTTTTGGTGCTCGAGCA 3711
Query 3442 TTTTCTGATGAACAGATCAACAGATCATCAGGAGATAGGAACAATATGGGATCATTGCAC 3501
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3712 TTTTCTGATGAACAGATCAACAGATCATCCGGAGATAGGAACAATATGGGATCATTGCAC 3771
Query 3502 CGTAACAGTTCCTTGCTTTCTGGAATTATTGATGGTGGGCGGTCAAATCAGAATGAAAGT 3561
||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 3772 CGTAATAATTCCTTGCTTTCTGGAATTATTGATGGTGGGCGGTCAACTCAGAATGAAACT 3831
Query 3562 CAAGCCTTCAGTAATATGTTTGCTATGAACAAGGACACAAACGACATCAAAACTTGGAAC 3621
||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||
Sbjct 3832 CAAGCCTTCAGTAATATGTATGCTATGAACAAAGACGCGAATGACATCAAAACTTGGAAC 3891
Query 3622 AACGTGCCGCTTAAAAATGATGGAATGGGAAGGATGATGTCATATGAAGCCCAAGACAGA 3681
|| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 3892 AATGTGCCGCCTAAAAATGAGGGAATGGGAAGGATGATGTCATTTGAAGCCCAAGATAGA 3951
Query 3682 ATGGGCAAGCAAGCAGTATTAGACTCCCTGGTTCAAGAGGAGCTTCCTGTTGTTACGCCT 3741
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3952 ATGGGCAAGCAAGCAGTATTAGACTCACTGGTTCATGGGGAGCTTCCTGTTGTTACGCCT 4011
Query 3742 GGTCAACATTCTTCTTTCAATATCTCTGACCAGTACAGTGACAACTTGGTTGGAGAAGAT 3801
|| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4012 GGCCAACAGTCTTCTTTAAATATCTCTGACCAATACAGTGACAACTTGGTTGGAGAAGAT 4071
Query 3802 AGAAGGAAGGATAGGTTGGTAGTTCCATCACATGGACATGA-TCCAGTTTTGTTAAAAAG 3860
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||
Sbjct 4072 AGAAGGAAGGATAGGTTGGTAGTTCCATCACATGGACA-GAATTCAGTATTGTTAAAAAG 4130
Query 3861 GCCTCCCTCATCCCATTCTTCATCATCGCATGAAGGAGTGCTCGAGCGTATGTCTGACAC 3920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||
Sbjct 4131 GCCTCCCTCATCCCATTCTTCATCATCGCATGAAGGATTGATAGAGCGTATCTCTGACAC 4190
Query 3921 AGCTAGCAGGACAGCAGCAAGTTCTTATAGTGGAATTGAAGGAGGTGTGAGACGGGAATC 3980
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4191 AGCTAGCAGGACAGCAGCAAGTTCGTATAGTGGAATTGAAGGCGGTGTGAGACGGGAATC 4250
Query 3981 AGGAGCAGCGGGAAATAAAGGGTCAACGTCAGAGGC-AGCATCGTTCAGTGAGATGTTGA 4039
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 4251 AGGAGCAGCGGGAAACAAAGGGTCAACGTCAGAGGCGA-CATCGTTCAGTGAGATGTTGA 4309
Query 4040 AGAAGAGTAATAGCATGAAGAAGGTGGCAGCAGAGTCATCTGATGCAACCGAAGGAAGCA 4099
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||
Sbjct 4310 AGAAGAGTAATAGCATGAAGAAGGTGGCGGCAGAGTCAAATGATGTAACAGAAGGAAGCA 4369
Query 4100 AAGGTGGCGGTGGGAAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGAGGCAGATAGATCCAGCTCTTCTCG 4159
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 4370 AAGGTGGTGGCGGGAAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGAGGCAGATCGATCCAGCTCTTCTTG 4429
Query 4160 GTTTCAAAGTCACTAGCAATCGCATTCTTATGGGCGAGATCCACCGTGCTGATGATTTTT 4219
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4430 GTTTCAAAGTCACTAGCAATCGCATT---ATGGGCGAGATCCACCGTGCTGATGATTTTT 4486
Query 4220 AACTCTTTGTTTTCTTTTTGTACAAAATCTTTACATGTAAAGATTAGCTTCTCAAGCTTA 4279
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4487 AACTCTTT-TTTTCTTTTTGTACAAAATCTTTACATGTAAAGATTAGCTTCTCAAGCTTA 4545
Query 4280 GGCGTATAGGTTTTTTACAGA 4300
|||||||||||||||||||||
Sbjct 4546 GGCGTATAGGTTTTTTACAGA 4566
Score = 1218 bits (659), Expect = 0.0
Identities = 780/839 (93%), Gaps = 5/839 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCCGAAGGGAAGTTCGATCTGCCTGACGATCTCATCGTTTCCAAATCTTCTGATCAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCGAAGGGAAGTTCGATCTGCCTGACGATCTCATCCTTTCCAAATCTTCTGATCAG 60
Query 61 TTGAAAGAATTGGCCTCAGATAACAGCATTCCCTTGTCTCCGCAATGGCTTTACACGAAA 120
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 61 TTGAAAGAATTGGCCTCAGATAACAGCATTCCGTTGTCTCCGCAGTGGCTTTACACGAAA 120
Query 121 TCAAGCGAGAGCAAGATGGATGTTCGATCTCCTACTCCTGTACCCATGGGAAATCCAAGT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCAAGCGAGAGCAAGATGGATGTTCGATCTCCTACTCCTATGCCCATGGGAAATCCAAGT 180
Query 181 GACCCAAATCTGAAGGATGCATGGCGCTTGGATACACCCGAAGACAAAAAGGACTGGAGG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 181 GACCCAAATCTGAAGGATGCATGGCGCTTGGATGCACCCGAAGACAAAAAAGACTGGAAG 240
Query 241 AAAATTGTGCCTGAGAATGAAACTAGTCGCAGATGGCGTGAAGAGGAAAGAGAAACTGGT 300
||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAAATTGTGTCTGAGAATGAAACTAATCGCAGATGGCGTGAAGAGGAAAGAGAAACTGGT 300
Query 301 TTACTCGGTGCTAGGAAAGTTGATCGACGAAAAACAGAACGTCGCATTGACTCTGTCTCA 360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||
Sbjct 301 TTACTCGGTGCTAGGAAAGTTGATCGACGAAAAACAGAGCGTCGCATTGACAATGTCTCA 360
Query 361 AGCAGAGATACTGGTGACAATAAAAA-TACTGCTGCTTCTGATAGGTGGAATGATGTTAA 419
|||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 AGCAGAGAAACTGGTGA-AGTTAAAACTACTGCTGCTTCTGATAGGTGGAATGATGTTAA 419
Query 420 TTCTCGCGCTGCTGTAAACGAACCCCGCCGCGACAATAAATGGTCATCTCGGTGGGGTCC 479
|||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TTCTCGTGCTGCTGTACATGAACCCCGTCGCGACAACAAATGGTCATCTCGGTGGGGTCC 479
Query 480 TGATGACAAAGAGAAAGAAACCCGTTGTGAAAAGGTAGATAATATCAAGGACAAGGAGGA 539
||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||
Sbjct 480 TGATGACAAAGAGAAAGAAGCCCGTTGTGAGAAGGTAGAGATTAACAAGGACAAGGAAGA 539
Query 540 GCCACTGGGTGAAAGTCAATCTGTGGTTAGCAGCGTCCGTACAACTTCTGAGCGGGACTC 599
||| | | |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 540 GCCTCAGAGTGAAAGTCAATCTGTTGTTAGCAATGTCCGTGCAACTTCTGAACGGGACTC 599
Query 600 TGACCCTCGTGACAAATGGAGGCCACGTCATAGGATGGAATCCCAGTCTGGTGGGCCGAC 659
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||
Sbjct 600 TGACCCTCGTGACAAATGGAGGCCACGTCATAGGATGGAATCGCAGTCTGGTGTGCCTAC 659
Query 660 TTCTTATCGCGCTGCACCTGGGTTTGGACTTGATAGAGGACGAGCCGAGGGCCCAAATTT 719
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 660 TTCTTATCGTACTGCACCTGGGTTTGGACTTGATAGAGGACGAGCTGAGGGCCCAAATTT 719
Query 720 AGGGTTCTCTGTGGGCCGAGGAAGGGCAAATGCAACTCGGAGGAGTTCTTCAACTTCCTT 779
||||||| |||| ||||||||||||||| | | | | ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 720 AGGGTTCACTGTTGGCCGAGGAAGGGCATCTACTATTGGGAGGGGTTCTTCAACTTCCTT 779
Query 780 AATTGGTGCTGGTGCATGTGCGTCTGCCTCTATGTTTCGGTATCCAAGGGGTAAGTTGC 838
||||||||||||| | |||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 AATTGGTGCTGGT--A-GTGCTTCAGCCCCTGTGTTTCGGTATCCAAGGGGTAAGTTGC 835
> AT1G27430.1 | Symbols: | GYF domain-containing protein | chr1:9520911-9526928
REVERSE LENGTH=4613
Length=4613
Score = 4370 bits (2366), Expect = 0.0
Identities = 3150/3516 (90%), Gaps = 103/3516 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 838 CGC-TTCTCTGACTCAGGTGAAACAAAAGTTGATGGTGCTTTGCTAGGGTTTGTTAATGG 896
||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 1069 CGCATTC-CTGAGTCAGGTGAGACAAAAGTGGATGGTGCTTTGCTAGGGTTTATGAATGG 1127
Query 897 TGACAATGGTTCCATGCAAAATAGTGA-TCCTGGATTACTTGGTAGTCATAATGGAGATC 955
|||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1128 TGACAATGGTTCCATGAAAAATAATGATTCC-GGATTACTTGGTAGTCATAATGGAGGTC 1186
Query 956 TGGGGGGTGCTCCAAGCGTCTCAAGATTAAATTCTGTGGCTTCTGAAAGTTATGGATCTT 1015
|||||| |||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187 TGGGGGCTGCTTCTAGCGTCCCAAGATTGAATTCAGTGGCTTCTGAAAGTTATGGATCTG 1246
Query 1016 TTGGAACTGG-TATTCAAG-TTTCTCATGGAAGTCCTGAAGCAGTTAGATCAGTTCTTAC 1073
|||| |||| || || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 1247 GTGGAGCTGGTTA-TC-AGCTTTCTCATGGAAGTCCTGAAGCGGTTAGATCAGTTTTTAC 1304
Query 1074 TAAGTCCTCTGTGTTGGATGGGAGTGAATCCGTTGTTGGGTCTTTCGAGCAAGATTACAT 1133
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 1305 TAAGTCCTCTGTGTTGGATGGGAGCGAATCCGTTGTTGGGTCTTTCGAGCAAGCTTATAC 1364
Query 1134 GGGCAAGCTGCAGCAACCAGATATTGAAGTAGATCACTCAGAAGGGGCTATGCCACCTGA 1193
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1365 GGGCAAGCTGCAGCAACCAGATACTGAAGTGGATCACTCAGAAGGGGCTATGCCACCTGA 1424
Query 1194 GGAGTTTTTATTCTTGTATATTGATCCTCAAGGAGTAATTCAGGGACCATTCATTGGTTC 1253
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1425 GGAGTTCTTATTCTTGTATATTGATCCTCAAGGAGTAATTCAGGGACCGTTCATTGGTTC 1484
Query 1254 TGACATTATTTCATGGTTTGAACAAGGGTTTTTTGGGACAGACCTACAGGTTCGCTTGGC 1313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485 TGACATTATTTCATGGTTTGAACAAGGGTTTTTTGGGACAGACCTACAGGTTCGCTTGGC 1544
Query 1314 AAATGCTCCAGAAGAAACTCCTTTTCAAGATCTAGGTAGGGTCATGTCATATTTAAAGAC 1373
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 1545 AAGTGCTCCAGAAGGGACTCCTTTTCAAGATCTAGGCAGGGTCATGTCATATATAAAGGC 1604
Query 1374 AGAAAGCGCCCATGCCCATATCAGTAACCAAAAGAGTGAGCTAGAAGAGACTAGGTTAAA 1433
|||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1605 AGAAAGCGTACATGCCCATATCAGTGACCAAAAGAGTGAGCTAGAAGAGACTAGTTTAAA 1664
Query 1434 AGCAAATTCAGACACTGGTTTATCAATTGCACCTGTAGCAGAATCAAATGATTCATCCTC 1493
|||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1665 AGCAAATTCAGAGGCTGGTGGATCAGTTGCACATGTAGCAGAATCTAATGATTCATCCTC 1724
Query 1494 --T--C--G----T-TCG-T--TTTT-GGTGTATAACAACCCCTCAGCTCAGGATAATTT 1538
| | | | ||| | |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 1725 TTTGACTGGCATATCTCGTTCATTTTCTGTGTATAACAACCCTTCAGGTCAGGATAATTT 1784
Query 1539 TCAGAGAAAGTCTGAGTCAGAAGTTTATGGGACACCACCACATACTGAGGACCGAAGTTT 1598
|||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||||| ||||||
Sbjct 1785 TCAGAGAAAGTCTGAGTCCGAAGTTTATGGAAGACCACCACATGCCGAGGACCAAAGTTT 1844
Query 1599 CTTGGACTTCTCTGCTCAGGATGAAGAAATTGTATTCCCAGGAAGAGCTGGAGTTTCTGG 1658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1845 CTTGGACTTCTCTGCTCAGGATGAAGAAATTGTATTCCCAGGAAGAGCTAGAGTTTCTGG 1904
Query 1659 TTATGCA---TCAGTAAATTCCTCTACAAGTATGCATGATGCTTTAATGGAATTTTCTGG 1715
||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1905 TTATGCATCGTCTGTAAAATCCTCTACAAGTATGCATGATGCTTTAATGGAATTTTCTGG 1964
Query 1716 CCAGTCTGCTATTCCTGTTGAA-TCAACTAAGGCTGCTACTCAAAAGCAGAATGAGAATA 1774
||| |||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 1965 CCACTCTGATATCCCTGTTGAAGT-AACTACGGCTGCTACTCGAAATCAGAATGAGAATA 2023
Query 1775 AGCTGCACCCGTTTGGTGTGTTGTGGTCTGAGCTAGAGAGCAGTAATGCACCAGTTAACC 1834
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||
Sbjct 2024 AGCTGCACCCATTTGGTGTGTTGTGGTCTGAGCTAGAGGGCGGTAGTACACCAGTTAACC 2083
Query 1835 TGTTCCCAAACAGGTCTTATGATGCAATGGGGGAGCCTACTGGTTCAATAGAAAATTGGC 1894
||| |||||||| |||| || ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | |
Sbjct 2084 CGTTACCAAACAGATCTTCTGGTGCAATGGGAGAGCCTAGTTGTTCAATAGAAAACCGTC 2143
Query 1895 CCATTGATTCCCGAAGAAATAAACAAGTTGATCCCAACATGTCCCTTGATGCTCTGGCTT 1954
||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||| || ||
Sbjct 2144 CCATTAATTCCCGAAGAAATTCTCAAATTGACCCCAACATATCCCTCGATGCTTTGTCTG 2203
Query 1955 CTAACCGGATGTCGCAGTTTGAACATGTTTCCAACCGCTTTAGCCTTGGGGATCAACTTT 2014
|||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||
Sbjct 2204 GTAACCGGATGTCACAATTTGAACATGAATCCAACTTCTTTAACCATGGGGATCAGCTTC 2263
Query 2015 CATCAAATCAACATCACCAACAGCAATTCCAAAACCGGGATATGCTGTCGCATTCACATA 2074
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 2264 CATCAAATCAACATCACCAACAGCATTTCCAAAATCGGGATATGCTGTCACATTTACATA 2323
Query 2075 TAGGTGATCAAGCTCAGGATCTTGAGCATTTAATAACTCTCcagttgcagcagcaacaga 2134
||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2324 TAGGTGATC-A----A-GATCTGGAGCATTTAATAACTCTCCAGTTGCAGCAACAACAGA 2377
Query 2135 agattcagttgcaacagcagcagaagattcagttgcaacagcagcagaagatgcagctgc 2194
|||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 2378 AGATTCAGATGCAACAGCAGCAGAAGATTCAATTGCAACAGCAGCAGAAGATTCAGTTGC 2437
Query 2195 aacagcaTCAACTAGAACAAGAGCATCAGTTACATCAGAAGCTCTTACAGGAGCAACAAC 2254
|||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2438 AACAGCATCAGTTGGAACAAGAGCATCAGTTACATCAGAAGCTCTTACAGGAGCAGCAAC 2497
Query 2255 AGTCCCATGCTCGACAATTGCATTTTCAACAGATTCTACAAGGACAGACTCCTGATTCAA 2314
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2498 AGTCCCATGCTCGACAATTACATTTTCAACAGATTTTACAAGGACAGACTCCTGATACAA 2557
Query 2315 GGTTTGGGCAGTCCCATGACTTCCCTCGATCCAACAGTGTTGATCAGATGTTGTTAGAGC 2374
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2558 GGTTTGGGCAGTCACATGACTTCCCTCGATCCAACAGTGTTGATCAGATGTTGTTAGAGC 2617
Query 2375 ACCAGCTAATGAATGAACTGCAGAAAAATTCTGGTCATCCGTCACAAAATTTTGCACCAT 2434
| ||| | ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2618 AGCAGATGCTGAATGAGCTGCAGAAAAGTTCTGGCCATCCGTCACAAAATTTCGCACCAT 2677
Query 2435 ACCTTGAGCAACTTGCTGCAGGAAATTTTGGTCAATTGCCACATGAAGGCCATCAGAGGG 2494
|| ||||||||| || |||||||||||||| | || |||||||||| || || ||||
Sbjct 2678 ACATTGAGCAACACGCCGCAGGAAATTTTGGGCGGTTTACACATGAAGGTCACCAAAGGG 2737
Query 2495 AACTACTTGAACAGCTACTTTC-A-AC--A---AA----A--AT--------GCAATCTC 2533
| ||||||||||||||| |||| | || | || | || ||||||||
Sbjct 2738 AGCTACTTGAACAGCTATTTTCAACACAAATGCAATCTCAGTATGGACAAAAGCAATCTC 2797
Query 2534 AATATGGACCAATGCAATCTCAACATGGACAACTGCAATCTGAACCAACT-CGGTCTTTG 2592
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 2798 AATATGGACAAATGCAATCTCAACATGGACAACTGCAATCTGAACCAA-TCCGGTCTTTG 2856
Query 2593 GAGTACCAACTGCTGCAGCAAGAGCAGCTGATGCAATTGGCAAACGGAGTGAGGCACAAT 2652
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2857 GAGTACCAGCTGCTGCAGCAAGAGCAGCTTATGCAATTGGCAAATGGAGTGAGGCACAAT 2916
Query 2653 ACACTATTGGAGGAACAGAGACATATTGATCCTCTGTGGCCATCTGACCATAATGATCAG 2712
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2917 ACACTATTGGAGGAACAGAGACATATTGACCCTCTGTGGCCATCTGACCATAGTGATCAG 2976
Query 2713 CTTCTAAGAAATCATCCTGGGATCCACCGTTCGCGGTCCTCTACAGGATTTAGACCACTA 2772
||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||||||||| ||
Sbjct 2977 CTTTTAAGAACTCATCCTGGGATCCACCGTTCACACTCTTCTGCAGGGTTTAGACCATTA 3036
Query 2773 GACTTTCATCAACATCAGCAGAGGCCACCCTTCGAGGATCAGTTTGGTCAACTTGAGCGG 2832
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3037 GACTTTCATCAACAGCAGCAGAGGCCACACTTCGAGGATCAGTTTAGTCAACTTGAGCGG 3096
Query 2833 AACCTTTTATATCAGCAACAGCTTCGACAAGAATTATTTGAGCAGGGTCTGCCATTTGAG 2892
|||| || |||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3097 AACCGTTCATATCAGCAACAACTTAGACTAGAATTATTGGAGCACGGTCTTCCATTTGA- 3155
Query 2893 CGATCAGCATCCTTACCCGTAAGTGTATCGGGGATGAATCTGGATGCAGTAAATGGTCTT 2952
| || | | | | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3156 -G---AG-A----T---C---A--GCATCGGGGCTGAATCTGGATGCAGTAAATGGTCTT 3198
Query 2953 GGACTCTCTCAGGGTCTGGAGTTGCGGGATGCCACTG-CC-CA--C-A-----T-GCAGA 3001
|| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || || | | | |||||
Sbjct 3199 GGTCTCTCCCAGGGTCTGGAGTTGCGGGATGCTACTGCCCACATGCAATCTTCTGGCAGA 3258
Query 3002 TTGGG-AATTCTACTCTGGGTTTCAGTCATCAGAATCCCCGTATACCATTAGGTGAACCT 3060
||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3259 TTGGGAAATTCTACTCCGGGTTTCAGTCATCAGAATCCCCGTATACCATTAGGTGAATCA 3318
Query 3061 CATTTTTCACAGTTGGAACCAATAGAAGGACGCTGGTCTGGAGCTGATACACAGGTTGTT 3120
||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | |
Sbjct 3319 CATTTTTCACATTTGGAACCAACGGAAGGACGCTGGTCTGGAGCCGATACACAGCTAGCT 3378
Query 3121 GGTGAGTGGGCCGAATCTCAATTTCATAGATCAAATATTGATGCTGAACATCATAAAATA 3180
||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||| ||| |||||||
Sbjct 3379 GGTGACTGGGCCGAATCTCAATTTCGTAGATCTAATATGGATACTGAGCATGATAAAATG 3438
Query 3181 AGGTCAGAAAGTAGGAGAATGGGTGAGGATTCCAACTCATGGATGGTAGGTGGAACTACA 3240
||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3439 AGGTCGGAAATTAGGAGACTGGGTGAAGATCCCAACTCATGGATGGTAGGTGGATCTACA 3498
Query 3241 GAAGACAGGTCAAAACAGCTATTTT-TGGAGTTGCTCCACCAGAGACCCGGCCATCAATC 3299
|| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3499 GACGACAAGTCAAAGCAGCT-TTTTATGGAGTTGCTCCACCAGAGACCTGGCCATCAATC 3557
Query 3300 TGCTGAATCACCAAGCATGAACCGTGGGGAATCC-TATGACAGGATGGCTCCTTCTGGCC 3358
|||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 3558 TGCTGAGTCACCAAACATGAACCGT-GGGTATCCTTATGACAGGATGGTTCCTTCAGGCC 3616
Query 3359 TTACCCCAGGGATTCAAACACTTGGCGGCCTTTCAGACCATGGTGGTAGTCTTAACGCTC 3418
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |
Sbjct 3617 TTACCCCAGGGATTCAAACGCTTGGCGGCCTTTCAGACCATGGTGGTAATCAAAACGTTT 3676
Query 3419 CATCTACTTTTGGGGCTCGAGCATTTTCTGATGAACAGATCAACAGA-TCATCAGGAGAT 3477
||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| | | | ||| ||
Sbjct 3677 CATCTGCTTTTGGGGATCGTTCATTTTCTGATGAACAGGTCAACAGAGT-ACCGGGATAT 3735
Query 3478 AGGAACAATATGGGATCATTGCACCGTAACAGTTCCTTGCTTTCTGGAATTATTGATGGT 3537
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||| |
Sbjct 3736 GGGAACAATATGGGATCATTGCACCATAATAGTTCCTTACTTTCTGGAATTATCGATGCT 3795
Query 3538 GGGCGGTCAAATCAGAATGAAAGTCAAGCCTTCAGTAATATGTTTGCTATGAACAAGGAC 3597
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 3796 GGGCGGTCAACTCAGAATGAAACTCAAGCCTTCAGTAATATGTTTGGTATGAACAAAGAC 3855
Query 3598 ACAAACGACATCAAAACTTGGAACAACGTGCCGCTTAAAAATGATGGAATGGGAAGGATG 3657
| || |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3856 GCGAATGACATCAATACTTGGAACAATGTGCCGCCTAAAAATGAGGGAATGGGAAGGATG 3915
Query 3658 ATGTCATATGAAGCCCAAGACAGAATGGGCAAGCAAGCAGTATTAGACTCCCTGGTTCAA 3717
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3916 ATGTCATATGATGCCCAAGACAGAATGGGCAAGCAAGCAGTATTAGACTCCCTGATTCAA 3975
Query 3718 GAGGAGCTTCCTGTTGTTACGCCTGGTCAACATTCTTCTTTCAATATCTCTGACCAG-TA 3776
|||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 3976 GAGGAGCTTCCTGTTGGTACGCCTGGTCAACAGTCCTCTTTCAATATCTCTGACC-GATA 4034
Query 3777 CAGTGACAACTTGGTTGGAGAAGATAGAAGGAAGGATAGGTTGGTAGTTCCATCACATGG 3836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4035 CAGTGACAACTTGGTTGGAGAAGATAGAAGGAAGGATAGGTTGGTAGTTCCATCACATGG 4094
Query 3837 ACATGA-TCCAGTTTTGTTAAAAAGGCCTCCCTCATCCCATTCTTCATCATCGCATGAAG 3895
|| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||
Sbjct 4095 GCA-GAATTCAGTTTTGTTAAAAAGGCCTCCCTCATCTCATTCTTCTTCGTCGCATGAAG 4153
Query 3896 GAGTGCTCGAGCGTATGTCTGACACAGCTAGCAGGACAGCAGCAAGTTCTTATAGTGGAA 3955
|| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4154 GATTACTCGAGCGTATGTCTGACACAGCTAGCAGGGCAGCAGCAAGTTCCTATAGTGGAA 4213
Query 3956 TTGAAGGAGGTGTGAGACGGGAATCAGGAGCAGCGGGAAATAAAGGGTCAACGTCAGAGG 4015
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4214 TTGAAGGAGGTGTGAGACGGGAATCAGGAGCAGCAGGAAACAAAGGGTCAACGTCAGAGG 4273
Query 4016 CAGCATCGTTCAGTGAGATGTTGAAGAAGAGTAATAGCATGAAGAAGGTGGCAGCAGAGT 4075
| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4274 CGGCATCGTTTAGTGAGATGTTGAAGAAGAGTAATAGCATGAAGAAGGTGGCGGCAGAGT 4333
Query 4076 CATCTGATGCAACCGAAGGAAGCAAAGGTGGCGGTGGGAAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGA 4135
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4334 CAACTGATGCAACCGAAGGAAGCAAAGGTGGCGGTGGTAAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGA 4393
Query 4136 GGCAGATAGATCCAGCTCTTCTCGGTTTCAAAGTCACTAGCAATCGCATTCTTATGGGCG 4195
|||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4394 GGCAAATCGATCCAGCTCTTCTCGGTTTCAAAGTCACTAGCAATCGAATTCTTATGGGCG 4453
Query 4196 AGATCCACCGTGCTGATGATTTTTAACTCTTTGTTTTCTTTTTGTACAAAATCTTTACAT 4255
|||||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||| |||||||||||||||||
Sbjct 4454 AGATCCACCGCGCTGATGATTTTTAGCT-TTTGTT--CGTTT-GTACAAAATCTTTACAT 4509
Query 4256 GTAAAGATTAGCTTCTCA-AGCTTAGGCGTATAGGT 4290
||||||||||| |||||| | |||||||||||||||
Sbjct 4510 GTAAAGATTAGATTCTCATA-CTTAGGCGTATAGGT 4544
Score = 1218 bits (659), Expect = 0.0
Identities = 781/840 (93%), Gaps = 7/840 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCCGAAGGGAAGTTCGATCTGCCTGACGATCTCATCGTTTCCAAATCTTCTGATCAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCGAAGGGAAGTTCGATCTGCCTGACGATCTCATCTTTTCCAAATCTTCTGATCAG 60
Query 61 TTGAAAGAATTGGCCTCAGATAACAGCATTCCCTTGTCTCCGCAATGGCTTTACACGAAA 120
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 61 CTCAAAGAATTGGCCTCAGATAACAGCATTCCCTTGTCTCCGCAGTGGCTTTACACGAAA 120
Query 121 TCAAGCGAG-AGCAAGATGGATGTTCGATCTCCTACTCCTGTACCCATGGGAAATCCAAG 179
||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 121 TCAAGCGAGTA-CAAGATGGATGTTCGATCTCCTACTCCTGTTCCCATGGGAAATCCAAG 179
Query 180 TGACCCAAATCTGAAGGATGCATGGCGCTTGGATACACCCGAAGACAAAAAGGACTGGAG 239
||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 180 TGACCCAAATCCGAAGGATGCATGGCGCTTGGATGCACCTGAAGACAAAAAGGACTGGAA 239
Query 240 GAAAATTGTGCCTGAGAATGAAACTAGTCGCAGATGGCGTGAAGAGGAAAGAGAAACTGG 299
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 GAAAATTGTGCATGAGAATGAAACTAGTCGCAGATGGCGTGAAGAGGAAAGAGAAACTGG 299
Query 300 TTTACTCGGTGCTAGGAAAGTTGATCGACGAAAAACAGAACGTCGCATTGACTCTGTCTC 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||
Sbjct 300 TTTACTCGGTGCTAGGAAAGTTGATCGACGAAAAACAGAGCGTCGTATTGACAGTGTCTC 359
Query 360 AAGCAGAGATACTGGTGACAATAAAAATACTGCTGCTTCTGATAGGTGGAATGATGTTAA 419
||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 AAGCAGAGAAACTGGTGACATTAAAAATGCTGCTGCTTCTGATAGGTGGAATGATGTTAA 419
Query 420 TTCTCGCGCTGCTGTAAACGAACCCCGCCGCGACAATAAATGGTCATCTCGGTGGGGTCC 479
|||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TTCTCGTGCTGCTGTACATGAACCCCGGCGCGACAACAAATGGTCATCTCGGTGGGGTCC 479
Query 480 TGATGACAAAGAGAAAGAAACCCGTTGTGAAAAGGTAGATAATATCAAGGACAAGGAGGA 539
||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||
Sbjct 480 TGATGACAAAGAGAAAGAAGCTCGTTGTGAGAAGGTAGATATTAACAAGGACAAGGAAGA 539
Query 540 GCCACTGGGTGAAAGTCAATCTGTGGTTAGCAGCGTCCGTACAACTTCTGAGCGGGACTC 599
||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||
Sbjct 540 GCCTCAGAGTGAAAGTCAATCTGTGGTTAGCAATGTCCGTGCAACCTCTGAACGGGACTC 599
Query 600 TGACCCTCGTGACAAATGGAGGCCACGTCATAGGATGGAATCCCAGTCTGGTGGGCCGAC 659
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 600 TGACACTCGTGACAAATGGAGGCCACGTCATAGGATGGAATCCCAGTCTGGTGGGCCTTC 659
Query 660 TTCTTATCGCGCTGCACCTGGGTTTGGACTTGATAGAGGACGAGCCGAGGGCCCAAATTT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TTCTTATCGCGCTGCACCTGGGTTTGGACTTGATAGAGGACGAGCCGAGGGCCCAAATTT 719
Query 720 AGGGTTCTCTGTGGGCCGAGGAAGGGCAAATGCAACTCGGAGGAGTTCTTCAACTTCCTT 779
||||||| |||||||||||||||||||| | | | | ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 720 AGGGTTCACTGTGGGCCGAGGAAGGGCATCTACTATTGGGAGGGGTTCTTCAACTTCCTT 779
Query 780 AATTGGTGCTGGTGCATGTGCGTC-TGCCTCTATGTTTCGGTATCCAAGGGGTAAGTTGC 838
||||||||||||| | |||| | | || || ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 780 AATTGGTGCTGGT--A-GTGCTTTATCCC-CTGTGTTTCGTTATCCAAGGGGTAAGTTGC 835
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 214363347439
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5