BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg472946
Length=4636
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G27430.1 | Symbols: | GYF domain-containing protein | chr1:... 5904 0.0
AT1G24300.1 | Symbols: | GYF domain-containing protein | chr1:... 5051 0.0
> AT1G27430.1 | Symbols: | GYF domain-containing protein | chr1:9520911-9526928
REVERSE LENGTH=4613
Length=4613
Score = 5904 bits (3197), Expect = 0.0
Identities = 3769/4041 (93%), Gaps = 55/4041 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCCGAAGGGAAGTTCGATCTGCCTGACGATCTCATCGTTTCCAAATCTTCTGATCAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCGAAGGGAAGTTCGATCTGCCTGACGATCTCATCTTTTCCAAATCTTCTGATCAG 60
Query 61 TTGAAAGAATTGGCCTCAGATAACAGCATTCCCTTGTCTCCGCAGTGGCTTTACACCAAA 120
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 61 CTCAAAGAATTGGCCTCAGATAACAGCATTCCCTTGTCTCCGCAGTGGCTTTACACGAAA 120
Query 121 TCCAGCGAG-AGCAAGATGGATGTTCGATCTCCTACTCCTGTACCCATGGGAAATCCAAG 179
|| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 121 TCAAGCGAGTA-CAAGATGGATGTTCGATCTCCTACTCCTGTTCCCATGGGAAATCCAAG 179
Query 180 TGACCCAAATCTGAAGGATGCATGGCGCTTGGATGCACCTGAAGACAAAAAGGACTGGAG 239
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TGACCCAAATCCGAAGGATGCATGGCGCTTGGATGCACCTGAAGACAAAAAGGACTGGAA 239
Query 240 GAAAATTGTGCCTGAGAATGAAATTAGTCGCAGATGGCGTGAAGAGGAAAGAGAAACTGG 299
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 GAAAATTGTGCATGAGAATGAAACTAGTCGCAGATGGCGTGAAGAGGAAAGAGAAACTGG 299
Query 300 TTTACTCGGTGCTAGGAAAATTGATCGACGAAAAACAGAACGTCGCGTTGACAATGTCTC 359
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||
Sbjct 300 TTTACTCGGTGCTAGGAAAGTTGATCGACGAAAAACAGAGCGTCGTATTGACAGTGTCTC 359
Query 360 AGGCAGAGAAACTGGTGACAATAAAAATACTGCTGCTTCTGATAGGTGGAATGATGTTAA 419
| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 AAGCAGAGAAACTGGTGACATTAAAAATGCTGCTGCTTCTGATAGGTGGAATGATGTTAA 419
Query 420 TTCTCGTGCTGCTGTAAATGAACCCCGGCGCGACAACAAATGGTCATCTCGGTGGGGTCC 479
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TTCTCGTGCTGCTGTACATGAACCCCGGCGCGACAACAAATGGTCATCTCGGTGGGGTCC 479
Query 480 TGATGACAAAGAGAAAGAAACCCGTTGTGAAAAGGTAGATAACATCAAGGACAAGGAAGA 539
||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 480 TGATGACAAAGAGAAAGAAGCTCGTTGTGAGAAGGTAGATATTAACAAGGACAAGGAAGA 539
Query 540 GCCACAGGGTGAAAGTCAATCTGTGGTTAGCAGCGTCCGTACAACTTCTGAACGGGACTC 599
||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||
Sbjct 540 GCCTCAGAGTGAAAGTCAATCTGTGGTTAGCAATGTCCGTGCAACCTCTGAACGGGACTC 599
Query 600 CGACCCTCGTGACAAATGGAGGCCTCGTCATAGGATGGAATCTCAGTCTGGTGGGCCGAC 659
||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 600 TGACACTCGTGACAAATGGAGGCCACGTCATAGGATGGAATCCCAGTCTGGTGGGCCTTC 659
Query 660 TTCTTATCGCGCTGCACCTGGGTTTGGACTTGATAGAGGACGAGCCGAGGGCCCAAATTT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TTCTTATCGCGCTGCACCTGGGTTTGGACTTGATAGAGGACGAGCCGAGGGCCCAAATTT 719
Query 720 AGGGTTCACTGTGGGCCGAGGAAGGGCATCTACTATTGGGAGGGGTTCTTCAACTTCCTT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 AGGGTTCACTGTGGGCCGAGGAAGGGCATCTACTATTGGGAGGGGTTCTTCAACTTCCTT 779
Query 780 AATTGGTGCTGGTAGTGCTTCAGCCCCTGTGTTTCGGTATCCAAGGGGTAAGTTGCTTGA 839
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 AATTGGTGCTGGTAGTGCTTTATCCCCTGTGTTTCGTTATCCAAGGGGTAAGTTGCTTGA 839
Query 840 CATGTATAGAGAACAGAAGCCTGATCCTTCCCTAGGTAGGATACCGACTGAAATGGATGA 899
|||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 840 CATGTATAGAAAACAGAAGCCTGATTCTTCCCTAGGTAGGATTTTGACTGAAATGGATGA 899
Query 900 GGTTGCCTCCATAACTCAAGTGGCTCTGATCGAACCTCTTTCTTTTATCCCACCTGATGC 959
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 900 AGTTGCCTCCATAACGCAAGTGGCTCTGATTGAACCTCTTGCTTTTATTGCACCTGATGC 959
Query 960 CGAAGAAGAGGCAAGCCTTAACGGCATATGGAAGGGAAGGATCATTAGTAGCGAAGTTTA 1019
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 CGAAGAAGAGGCAAACCTTAACGGCATATGGAAGGGAAGGATCATTAGTAGCGAAGTTTA 1019
Query 1020 CACTTCATCTGGGGAAGAATCCTTAGGTGAAAACAGTCTGGTGAAATACCGCATACCTGA 1079
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||
Sbjct 1020 CACTTCATCTGGGGAAGAGTCCTTAGGTGGAAACAGTCTGTTGAAATGCCGCATTCCTGA 1079
Query 1080 CTCAGGTGAGACAAAAGTGGATGGTGC-TT-C----------GAATGGTGACAATAGTTC 1127
|||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||
Sbjct 1080 GTCAGGTGAGACAAAAGTGGATGGTGCTTTGCTAGGGTTTATGAATGGTGACAATGGTTC 1139
Query 1128 CCTGCAAAATAATGATTCCGGATTACTTGGTAGTCATAGTGGAGGTTTAGGGGCTGCTTC 1187
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||
Sbjct 1140 CATGAAAAATAATGATTCCGGATTACTTGGTAGTCATAATGGAGGTCTGGGGGCTGCTTC 1199
Query 1188 TAACGTCTCAAGATTGAATTTAGTGGCTTCTGAAAGTTGTGGATCTGTTGGAGCTGGTTA 1247
|| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1200 TAGCGTCCCAAGATTGAATTCAGTGGCTTCTGAAAGTTATGGATCTGGTGGAGCTGGTTA 1259
Query 1248 TCAAGC-TTCTCATGGAAGTCCTGAAGCGGTTAGATCTGCGTTTACTAAGTCCTCTGTGT 1306
|| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 1260 TC-AGCTTTCTCATGGAAGTCCTGAAGCGGTTAGATCAGTTTTTACTAAGTCCTCTGTGT 1318
Query 1307 TGGATGGGAGTGAATCCGTTCTTGCTTCTTTCGAGCAAGATTATACGGGCAAGCTGCAGC 1366
|||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 TGGATGGGAGCGAATCCGTTGTTGGGTCTTTCGAGCAAGCTTATACGGGCAAGCTGCAGC 1378
Query 1367 AACCAGATATTGAAGTGAATCACCCGGAAGGGGCTATGCCACCTGAGGAGTTTC-TGTTC 1425
||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | |||
Sbjct 1379 AACCAGATACTGAAGTGGATCACTCAGAAGGGGCTATGCCACCTGAGGAG-TTCTTATTC 1437
Query 1426 TTGTATATTGACCCTCAAGGAGTAATTCAGGGACCGTTTATTGGTTCTGACATTATTTCA 1485
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 TTGTATATTGATCCTCAAGGAGTAATTCAGGGACCGTTCATTGGTTCTGACATTATTTCA 1497
Query 1486 TGGTTTGAACAAGGGTTTTTTGGGACAGACCTACAGGTTCGCTTGGCAAATGCTCCAGAA 1545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1498 TGGTTTGAACAAGGGTTTTTTGGGACAGACCTACAGGTTCGCTTGGCAAGTGCTCCAGAA 1557
Query 1546 GGAACTCCTTTTCAAGATCTAGGTAGGGTCATGTCATATTTAAAGACAGAAAGCGTTCAT 1605
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||
Sbjct 1558 GGGACTCCTTTTCAAGATCTAGGCAGGGTCATGTCATATATAAAGGCAGAAAGCGTACAT 1617
Query 1606 GCCCATATCAGTGACCAAAAGAGTGAGCTAGAAGAGACTATTTTAAAAGCAAATTCAGAG 1665
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1618 GCCCATATCAGTGACCAAAAGAGTGAGCTAGAAGAGACTAGTTTAAAAGCAAATTCAGAG 1677
Query 1666 GCTGGTGTATCAATTGCACCTGTTGCAGGAGCTAATGATTCATCCTCGTTGACTGGCATG 1725
||||||| |||| |||||| ||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1678 GCTGGTGGATCAGTTGCACATGTAGCAGAATCTAATGATTCATCCTCTTTGACTGGCATA 1737
Query 1726 TCTCGTTCATTCTCTGGGTATGATAACCCTTCAGCTCAGGATAATTTTCTGCGAAAGTCT 1785
||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1738 TCTCGTTCATTTTCTGTGTATAACAACCCTTCAGGTCAGGATAATTTTCAGAGAAAGTCT 1797
Query 1786 GAGTCAGAAGTTTATGTAAGACCACCAAATGCCGAGGACCAAAGTTTCTTGGACTTTTCT 1845
||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1798 GAGTCCGAAGTTTATGGAAGACCACCACATGCCGAGGACCAAAGTTTCTTGGACTTCTCT 1857
Query 1846 GCTCAGGATGAAGAAATTGTATTCCCAGGAAGAGCTGGAGTTTCTGGTTGTG-AGTCGTC 1904
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||
Sbjct 1858 GCTCAGGATGAAGAAATTGTATTCCCAGGAAGAGCTAGAGTTTCTGGTTATGCA-TCGTC 1916
Query 1905 TGTAAAATCCTCTACAAGTATGCATGATACTTTTATGGAATTTTCTGGCCACTCTGATAT 1964
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1917 TGTAAAATCCTCTACAAGTATGCATGATGCTTTAATGGAATTTTCTGGCCACTCTGATAT 1976
Query 1965 CCCTGTTGAA-TCAACTAAGGC-G--GCTCGAAATCAGAATGAGAATAAGCTGCACCCAT 2020
|||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1977 CCCTGTTGAAGT-AACTACGGCTGCTACTCGAAATCAGAATGAGAATAAGCTGCACCCAT 2035
Query 2021 TTGGTGTGTTGTGGTCTGAGCTAGAGGGCGGTAGTACACCAGTTAACCCG-T--CAAACA 2077
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 2036 TTGGTGTGTTGTGGTCTGAGCTAGAGGGCGGTAGTACACCAGTTAACCCGTTACCAAACA 2095
Query 2078 GATCTTATGGTGCGATGGGGGAGCCTACTGGTTCAATAGACAACCGTCCCATTAATTCCC 2137
|||||| |||||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2096 GATCTTCTGGTGCAATGGGAGAGCCTAGTTGTTCAATAGAAAACCGTCCCATTAATTCCC 2155
Query 2138 GAAGAAATACACAAATTGACCCCAGCATGTCCCTCGATACTCTGACTGCTAACCGGATGT 2197
|||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||| || || ||| |||||||||||
Sbjct 2156 GAAGAAATTCTCAAATTGACCCCAACATATCCCTCGATGCTTTGTCTGGTAACCGGATGT 2215
Query 2198 CACAGTTTGAACATGAATCCAACTTCTTTAACCAT-GGG----G----------ATCAAC 2242
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||
Sbjct 2216 CACAATTTGAACATGAATCCAACTTCTTTAACCATGGGGATCAGCTTCCATCAAATCAAC 2275
Query 2243 ATCACCAACAGCATTTCCAGAATCGGGATATGCTGTCGCATTTACATATAGGTGATCAAG 2302
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 2276 ATCACCAACAGCATTTCCAAAATCGGGATATGCTGTCACATTTACATATAGGTGATC-A- 2333
Query 2303 CTCAGGATCTGGAGCATTTAATAACTCTCCAGTTgcagcagcaacagaagattcagttgc 2362
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 2334 ---A-GATCTGGAGCATTTAATAACTCTCCAGTTGCAGCAACAACAGAAGATTCAGATGC 2389
Query 2363 aacagcagcagaagattcaattgcatcagcagcagaagaTTCAGTTGCAACAGCATCAGC 2422
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2390 AACAGCAGCAGAAGATTCAATTGCAACAGCAGCAGAAGATTCAGTTGCAACAGCATCAGT 2449
Query 2423 TGGAACAAGAGCATCAGTTACATCAGAAGCTCTTACAGGAGCAACAACAGTCCCATGCTC 2482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2450 TGGAACAAGAGCATCAGTTACATCAGAAGCTCTTACAGGAGCAGCAACAGTCCCATGCTC 2509
Query 2483 GACAATTACATTTTCAACAGATTTTACAAGGACAGACTCCTGATACACGGTTTGGGCAGT 2542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2510 GACAATTACATTTTCAACAGATTTTACAAGGACAGACTCCTGATACAAGGTTTGGGCAGT 2569
Query 2543 CACATGACTTCCCTCGATCCAACAATGTTGATCAGATGTTGTTAGAGCGGCAGCTGATGA 2602
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||
Sbjct 2570 CACATGACTTCCCTCGATCCAACAGTGTTGATCAGATGTTGTTAGAGCAGCAGATGCTGA 2629
Query 2603 ATGAACTGCAGAAAAGTTCTGGCCATCCTTCACAAAATTTCGCACCATATATTGAGCAAC 2662
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2630 ATGAGCTGCAGAAAAGTTCTGGCCATCCGTCACAAAATTTCGCACCATACATTGAGCAAC 2689
Query 2663 TTGCTGCAGGAAATTTTGGGCAGTTTTCTCATGAAGGCCACCAAAGGGAGCTACTTGAAC 2722
|| |||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2690 ACGCCGCAGGAAATTTTGGGCGGTTTACACATGAAGGTCACCAAAGGGAGCTACTTGAAC 2749
Query 2723 AGCTACTTTCAACACAAATGCAGTCTCAGTATGGACAAAAGCAATCTCATTATGGACAAA 2782
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2750 AGCTATTTTCAACACAAATGCAATCTCAGTATGGACAAAAGCAATCTCAATATGGACAAA 2809
Query 2783 TGCAATCTCAACACGGACAACTGCAATCTGAAACAATCCGGTCTTTGGAGTACCAGCTGC 2842
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2810 TGCAATCTCAACATGGACAACTGCAATCTGAACCAATCCGGTCTTTGGAGTACCAGCTGC 2869
Query 2843 TGCAGCAAGAGCAGCTTATGCAATTGGCAAATGGAGTGAGGCACAATACACTATTCGAAG 2902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 2870 TGCAGCAAGAGCAGCTTATGCAATTGGCAAATGGAGTGAGGCACAATACACTATTGGAGG 2929
Query 2903 AACAAAGACATATTGACCCTCTGTGGCCATCTGACCATAGTGATCAGCTTTTAAGGACTC 2962
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2930 AACAGAGACATATTGACCCTCTGTGGCCATCTGACCATAGTGATCAGCTTTTAAGAACTC 2989
Query 2963 ATCCTGGGATCCAGCGTTCACACTCTTCTGCAGGGTTTAGACCATTAGACTTTCATCAAC 3022
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2990 ATCCTGGGATCCACCGTTCACACTCTTCTGCAGGGTTTAGACCATTAGACTTTCATCAAC 3049
Query 3023 AGCAGCAGAGGCCACCCTTCGAGGATCAGTTGGGTCAACTTGAGCGGAATCTTTCATATC 3082
||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 3050 AGCAGCAGAGGCCACACTTCGAGGATCAGTTTAGTCAACTTGAGCGGAACCGTTCATATC 3109
Query 3083 AGCAACAACTTCGAC-AGGAATTATTCGAGCAGGGTCTTCCATTTGAGAGATCAGCATCG 3141
||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3110 AGCAACAACTTAGACTA-GAATTATTGGAGCACGGTCTTCCATTTGAGAGATCAGCATCG 3168
Query 3142 GGGCGGAATCTGGATGCAGTAAATGGTCTTGGTCTCTCTCAGGGTCTGGAGTTGCGGGAT 3201
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3169 GGGCTGAATCTGGATGCAGTAAATGGTCTTGGTCTCTCCCAGGGTCTGGAGTTGCGGGAT 3228
Query 3202 GCTACTGCCCACATGCAATCTTCTGGCAGATTGGGAAATTCTACTCCGGGTTTCAGTCAT 3261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3229 GCTACTGCCCACATGCAATCTTCTGGCAGATTGGGAAATTCTACTCCGGGTTTCAGTCAT 3288
Query 3262 CAGAATCCCCGTATACCATTAGGTGAACCACATTTTTCACAATTAGAACCAATGGAAGGA 3321
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||
Sbjct 3289 CAGAATCCCCGTATACCATTAGGTGAATCACATTTTTCACATTTGGAACCAACGGAAGGA 3348
Query 3322 CGCTGGTCTGGCGCAGATACACAGCTAGCTGGTGACTGGGCTGAATCTCAATTTCGTAGA 3381
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3349 CGCTGGTCTGGAGCCGATACACAGCTAGCTGGTGACTGGGCCGAATCTCAATTTCGTAGA 3408
Query 3382 TCTAATGTGGATACTGAACATCATAAAATGAGGTCGGAAATTAGGAGACTGGGTGAAGAT 3441
|||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3409 TCTAATATGGATACTGAGCATGATAAAATGAGGTCGGAAATTAGGAGACTGGGTGAAGAT 3468
Query 3442 TCCAACTCATGGATGGTAGGTGGGTCTACAGACGACAAGTCAAAACAGCTTTTTATGGAG 3501
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3469 CCCAACTCATGGATGGTAGGTGGATCTACAGACGACAAGTCAAAGCAGCTTTTTATGGAG 3528
Query 3502 TTGCTCCACCAGAGACCCGGCCATCAATCTGCTGAGTCACCAAGCATGAACCGTGGGTAT 3561
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3529 TTGCTCCACCAGAGACCTGGCCATCAATCTGCTGAGTCACCAAACATGAACCGTGGGTAT 3588
Query 3562 GCCT-ATGACAGGATGGTTCCTTCAGGCCTTACCCCAGGGATTCAAACGCTTGGCGGCCT 3620
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3589 -CCTTATGACAGGATGGTTCCTTCAGGCCTTACCCCAGGGATTCAAACGCTTGGCGGCCT 3647
Query 3621 TTCAGACCATGGTGGTAGTCAAAACGTTTCATCTACTTTTGGGGCTCGAGCATTTTCTGA 3680
||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 3648 TTCAGACCATGGTGGTAATCAAAACGTTTCATCTGCTTTTGGGGATCGTTCATTTTCTGA 3707
Query 3681 TGAACAGGTCAACAGAATGCCGGCAGATAGGAACAATATGGGATCATTGCACCGTAATGG 3740
|||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 3708 TGAACAGGTCAACAGAGTACCGGGATATGGGAACAATATGGGATCATTGCACCATAATAG 3767
Query 3741 TTCCTTGCTTTCTGGAATCATTGATGGTGGGCGGTCAACTCAGAATGAAAGTCAAGCCTT 3800
|||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3768 TTCCTTACTTTCTGGAATTATCGATGCTGGGCGGTCAACTCAGAATGAAACTCAAGCCTT 3827
Query 3801 CAGTAATATGTTTGCTATGAACAAGGACGCAAATGACATCAAAACTTGGAACAACT-TGC 3859
|||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||
Sbjct 3828 CAGTAATATGTTTGGTATGAACAAAGACGCGAATGACATCAATACTTGGAACAA-TGTGC 3886
Query 3860 CGCCTAAAAATGAGGGAATGGGAAGGATGATGTCATATGAAGCCCAAGACAGAATGGGCA 3919
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3887 CGCCTAAAAATGAGGGAATGGGAAGGATGATGTCATATGATGCCCAAGACAGAATGGGCA 3946
Query 3920 AACAAGCAGTATTAGACTCCCTGGTTCAAGACGAGCTTCCTGTTGTTACGCGTGGTCAAC 3979
| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3947 AGCAAGCAGTATTAGACTCCCTGATTCAAGAGGAGCTTCCTGTTGGTACGCCTGGTCAAC 4006
Query 3980 AGTCTTCTTTCAATATATCTG 4000
|||| ||||||||||| ||||
Sbjct 4007 AGTCCTCTTTCAATATCTCTG 4027
Score = 728 bits (394), Expect = 0.0
Identities = 499/546 (91%), Gaps = 21/546 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 4101 AGTGACAACTTGGTTGGAGAAGATAGAAGGAAGG--A------TAGTTCCATCACATGGA 4152
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 4036 AGTGACAACTTGGTTGGAGAAGATAGAAGGAAGGATAGGTTGGTAGTTCCATCACATGGG 4095
Query 4153 CATG-ATCCAGTTTTGTTAAAAAGGCCTCCCTCATCCCATTCTTCATCATCGCATGAAGG 4211
|| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||
Sbjct 4096 CA-GAATTCAGTTTTGTTAAAAAGGCCTCCCTCATCTCATTCTTCTTCGTCGCATGAAGG 4154
Query 4212 ATTGCTCGAGCGTATGTCTGATACAGCTAGCAGGACAGCAGCAAGTTCTTATAGTGGAAT 4271
||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4155 ATTACTCGAGCGTATGTCTGACACAGCTAGCAGGGCAGCAGCAAGTTCCTATAGTGGAAT 4214
Query 4272 AGAAGGAGGTGTGAGACGGGAATCAGGAGCAGCAGGAAACAAAGGGTCAACGTCAGAGGC 4331
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4215 TGAAGGAGGTGTGAGACGGGAATCAGGAGCAGCAGGAAACAAAGGGTCAACGTCAGAGGC 4274
Query 4332 CGCATCGTTCAGTGAGATGTTGAAGAAGAGTAATAGCATGAAGAAGGTGGTGGTAGAGTC 4391
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 4275 GGCATCGTTTAGTGAGATGTTGAAGAAGAGTAATAGCATGAAGAAGGTGGCGGCAGAGTC 4334
Query 4392 ATCTGATGCAACCGAAGGAAGCAAAGGTGGTGGTGGGAAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGAG 4451
| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4335 AACTGATGCAACCGAAGGAAGCAAAGGTGGCGGTGGTAAGAAGAAAGGGAAGAAAGGGAG 4394
Query 4452 GCAGATAGATCCAGCTCTTCTCGGTTTCAAAGTCACTAGTAATCGCATTCTTATGGGCGA 4511
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 4395 GCAAATCGATCCAGCTCTTCTCGGTTTCAAAGTCACTAGCAATCGAATTCTTATGGGCGA 4454
Query 4512 GATCCACCGTGCTGATGATTTTTAGCTTTTTGTTC-TTCTGTACAAAATCTTTACTTGTA 4570
||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||
Sbjct 4455 GATCCACCGCGCTGATGATTTTTAGCTTTT-GTTCGTT-TGTACAAAATCTTTACATGTA 4512
Query 4571 AAGATTAGCTTCTCATTCTTAGGCAGTTAGGCGTATAGGTCCTTCTCGGACAGATTTCTT 4630
|||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4513 AAGATTAGATTCTCAT----A--C--TTAGGCGTATAGGTCCTTTTCGGACAGATTTCTT 4564
Query 4631 CCATCA 4636
|||||
Sbjct 4565 ACATCA 4570
> AT1G24300.1 | Symbols: | GYF domain-containing protein | chr1:8614365-8620420
REVERSE LENGTH=4638
Length=4638
Score = 5051 bits (2735), Expect = 0.0
Identities = 3659/4087 (90%), Gaps = 135/4087 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCCGAAGGGAAGTTCGATCTGCCTGACGATCTCATCGTTTCCAAATCTTCTGATCAG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCGAAGGGAAGTTCGATCTGCCTGACGATCTCATCCTTTCCAAATCTTCTGATCAG 60
Query 61 TTGAAAGAATTGGCCTCAGATAACAGCATTCCCTTGTCTCCGCAGTGGCTTTACACCAAA 120
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 61 TTGAAAGAATTGGCCTCAGATAACAGCATTCCGTTGTCTCCGCAGTGGCTTTACACGAAA 120
Query 121 TCCAGCGAGAGCAAGATGGATGTTCGATCTCCTACTCCTGTACCCATGGGAAATCCAAGT 180
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCAAGCGAGAGCAAGATGGATGTTCGATCTCCTACTCCTATGCCCATGGGAAATCCAAGT 180
Query 181 GACCCAAATCTGAAGGATGCATGGCGCTTGGATGCACCTGAAGACAAAAAGGACTGGAGG 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |
Sbjct 181 GACCCAAATCTGAAGGATGCATGGCGCTTGGATGCACCCGAAGACAAAAAAGACTGGAAG 240
Query 241 AAAATTGTGCCTGAGAATGAAATTAGTCGCAGATGGCGTGAAGAGGAAAGAGAAACTGGT 300
||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAAATTGTGTCTGAGAATGAAACTAATCGCAGATGGCGTGAAGAGGAAAGAGAAACTGGT 300
Query 301 TTACTCGGTGCTAGGAAAATTGATCGACGAAAAACAGAACGTCGCGTTGACAATGTCTCA 360
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 301 TTACTCGGTGCTAGGAAAGTTGATCGACGAAAAACAGAGCGTCGCATTGACAATGTCTCA 360
Query 361 GGCAGAGAAACTGGTGACA-ATAAAAATACTGCTGCTTCTGATAGGTGGAATGATGTTAA 419
|||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 AGCAGAGAAACTGGTGA-AGTTAAAACTACTGCTGCTTCTGATAGGTGGAATGATGTTAA 419
Query 420 TTCTCGTGCTGCTGTAAATGAACCCCGGCGCGACAACAAATGGTCATCTCGGTGGGGTCC 479
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TTCTCGTGCTGCTGTACATGAACCCCGTCGCGACAACAAATGGTCATCTCGGTGGGGTCC 479
Query 480 TGATGACAAAGAGAAAGAAACCCGTTGTGAAAAGGTAGATAACATCAAGGACAAGGAAGA 539
||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||
Sbjct 480 TGATGACAAAGAGAAAGAAGCCCGTTGTGAGAAGGTAGAGATTAACAAGGACAAGGAAGA 539
Query 540 GCCACAGGGTGAAAGTCAATCTGTGGTTAGCAGCGTCCGTACAACTTCTGAACGGGACTC 599
||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 540 GCCTCAGAGTGAAAGTCAATCTGTTGTTAGCAATGTCCGTGCAACTTCTGAACGGGACTC 599
Query 600 CGACCCTCGTGACAAATGGAGGCCTCGTCATAGGATGGAATCTCAGTCTGGTGGGCCGAC 659
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||
Sbjct 600 TGACCCTCGTGACAAATGGAGGCCACGTCATAGGATGGAATCGCAGTCTGGTGTGCCTAC 659
Query 660 TTCTTATCGCGCTGCACCTGGGTTTGGACTTGATAGAGGACGAGCCGAGGGCCCAAATTT 719
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 660 TTCTTATCGTACTGCACCTGGGTTTGGACTTGATAGAGGACGAGCTGAGGGCCCAAATTT 719
Query 720 AGGGTTCACTGTGGGCCGAGGAAGGGCATCTACTATTGGGAGGGGTTCTTCAACTTCCTT 779
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 AGGGTTCACTGTTGGCCGAGGAAGGGCATCTACTATTGGGAGGGGTTCTTCAACTTCCTT 779
Query 780 AATTGGTGCTGGTAGTGCTTCAGCCCCTGTGTTTCGGTATCCAAGGGGTAAGTTGCTTGA 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 AATTGGTGCTGGTAGTGCTTCAGCCCCTGTGTTTCGGTATCCAAGGGGTAAGTTGCTTGA 839
Query 840 CATGTATAGAGAACAGAAGCCTGATCCTTCCCTAGGTAGGATACCGACTGAAATGGATGA 899
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TATGTATAGAAAACAGAAGCCTGATCCTTCCCTAGGTAGGATACCGACTGAAATGGATGA 899
Query 900 GGTTGCCTCCATAACTCAAGTGGCTCTGATCGAACCTCTTTCTTTTATCCCACCTGATGC 959
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |
Sbjct 900 AGTTGCCTCCATAACGCAAGTGGCTCTGATCGAACCTCTTGCTTTTATCGCACCTGATAC 959
Query 960 CGAAGAAGAGGCAAGCCTTAACGGCATATGGAAGGGAAGGATCATTAGTAGCGAAGTTTA 1019
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 960 CGAAGAAGAGGCAAGCATTAACGGCATATGGAAGGGAAGGATCATTAGTAGTGAAGTTTA 1019
Query 1020 CACTTCATCTGGGGAAGAATCCTTAGGTGAAAACAGTCTGGTGAAATACCGCATACCTGA 1079
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 1020 CACTTCATCTGGGGAAGAGTCCTTAGGTGAAAACAGTCTGTTGAAATGCCGCATACCTGA 1079
Query 1080 CTCAGGTGAGACAAAAGTGGATGGTGCTT--C--G-----A--A-TGGTGACAATAGTTC 1127
|||||||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||| | ||
Sbjct 1080 GTCAGGTGAGACAAAAGTGGATGGTGCTTTGCTAGGGTTTATGAATGGTGACAATGGCTC 1139
Query 1128 CCTGCAAAATAATGATTCCGGATTACTTGGTAGTCATAGTGGAGGTTTAGGGGCTGCTTC 1187
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||
Sbjct 1140 CATGAAAAATAATGATTCCGGATTACTTGGTAGTCATAATGGAGGTCTGGGGGCAGCTTC 1199
Query 1188 TAACGTCTCAAGATTGAATTTAGTGGCTTCTGAAAGTTGTGGATCTGTTGGAGCTGGTTA 1247
|| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 1200 TAGCGTCCCAAGATTGAATTCAGTGGCTTCTGAAAGTTATGGATCTTTTGGAGCTGGTTA 1259
Query 1248 TCAAGCTTCTCATGGAAGTCCTGAAGCGGTTAGATCTGCGTTTACTAAGTCCTCTGTGTT 1307
||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||
Sbjct 1260 TCAAGTTTCTCATGGAAGTCCTGAAGCAGTTAGATCAGTTTTTACTAAGTCCCCTGTGTT 1319
Query 1308 GGATGGGAGTGAATCCGTTCTTGCTTCTTTCGAGCAAGATTATACGGGCAAGCTGCAGCA 1367
||||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1320 GGATGGGAGCGAATCTGTTGTTGGGTCGTTCGAGCAAGATTATATGGGCAAGCTGCAGCA 1379
Query 1368 ACCAGATATTGAAGTGAATCACCCGGAAGGGGCTATGCCACCTGAGGAGTTTCTG-TTCT 1426
||||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 1380 ACCAGATGTTGAAGTGGATCAGTCAGAAGCGGCTATGCCACCTGAGGA-TTTCTTATTCT 1438
Query 1427 TGTATATTGACCCTCAAGGAGTAATTCAGGGACCGTTTATTGGTTCTGACATTATTTCAT 1486
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439 TGTATATTGATCCTCAAGGAGTAATTCAGGGACCATTCATTGGTTCTGACATTATTTCAT 1498
Query 1487 GGTTTGAACAAGGGTTTTTTGGGACAGACCTACAGGTTCGCTTGGCAAATGCTCCAGAAG 1546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 GGTTTGAACAAGGGTTTTTTGGGACAGACCTACAGGTGCGCTTGGCAAATGCTCCAGAAG 1558
Query 1547 GAACTCCTTTTCAAGATCTAGGTAGGGTCATGTCATATTTAAAGACAGAAAGCGTTCATG 1606
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1559 GAACTCCTTTTCAAGATCTAGGCAGGGTCATGTCATATTTAAAGACAGAAAGCGCCCATG 1618
Query 1607 CCCATATCAGTGACCAAAAGAGTGAGCTAGAAGAGACTATTTTAAAAGCAAATTCAGAGG 1666
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1619 CCCATATCAGTAACCAAGAGAGTGAGCTAGAAGAGACTAGGTTAAAAGCAAATTCAGACA 1678
Query 1667 CTGGTGTATCAATTGCACCTGTTGCAGGAGCTAATGATTCATCCTCGT-TGACTGGCATG 1725
||||| ||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| | ||| ||||| |
Sbjct 1679 CTGGTTTATCAATTGCACCAGTAGCAGAATCTAATGATTCATCCTC-TATGAATGGCACG 1737
Query 1726 TCTCGTTCATTCTCTGGGTATGATAACCCTTCAGCTCAGGATAATTTTCTGCGAAAGTCT 1785
|||||||| || || | |||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1738 TCTCGTTCGTTTTCAGTGTATAACAACCCCTCAGCTCAGGATAATTTTCAAAGAAAGTCT 1797
Query 1786 GAGTCAGAAGTTTATGTAAGACCACCAAATGCCGAGGACCAAAGTTTCTTGGACTTTTCT 1845
||||||||| |||||| | ||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 1798 GAGTCAGAATTTTATGCGACACCACCACATACTGAGGACCGAAGTTTCTTGGACTTCTCT 1857
Query 1846 GCTCAGGATGAAGAAATTGTATTCCCAGGAAGAGCTGGAGTTTCTGGTTGTGAGTCGTCT 1905
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 1858 ACTCAGGATGAAGAAATTGTATTCCCAGGAAGAGCTGGAGTTTCTGGTTATG---CGTCA 1914
Query 1906 GTAAAATCCTCTACAAGTATGCATGATACTTTTATGGAATTTTCTGGCCACTCTGATATC 1965
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||
Sbjct 1915 GTAAAATCCTCTACAAGTATGCATGATGCTTTTATGGAAGTTTCTGGCCAGTCTGCTATT 1974
Query 1966 CCTGTTGAATCAACTAAGGCGGCT-CG-AAAT-CAGAATGAGAATAAGCTGCACCCATTT 2022
||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||| |||||||||||||||| || |||
Sbjct 1975 CCTGTTGAATCCACTAAGGCTGCTACTCAAAAGCAGCATGAGAATAAGCTGCATCCGTTT 2034
Query 2023 GGTGTGTTGTGGTCTGAGCTAGAGGGCGGTA--GTACACCAGTTAACCCGT--C-AAACA 2077
|||||||||||||||||||||||| || ||| |||| | |||||||| || | |||||
Sbjct 2035 GGTGTGTTGTGGTCTGAGCTAGAGAGCAGTAACGTAC-C-AGTTAACCTGTTACCAAACA 2092
Query 2078 GATCTTATGGTGCGATGGGGGAGCCTACTGGTTCAATAGACAACCGTCCCATTAATTCCC 2137
| || |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||
Sbjct 2093 GGTCCTATGATGCAATGGGGGAGCCTACTGGTGCAATAGACAATCGGCCCATTGATTCCC 2152
Query 2138 GAAGAAATACACAAATTGACCCCAGCATGTCCCTCGATACTCTGACTGCTAACCGGATGT 2197
|||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||||||
Sbjct 2153 GAAGAAATACACAAGTTGATCCCAACATGTCCCTTGATGGTCTGGCTTCTAACCGGATGT 2212
Query 2198 CACAGTTTGAACATGAATCCAACTTCTTTAACCATGGGGATCAAC----ATCA---C--C 2248
| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| | |
Sbjct 2213 CGCAGTTTGAACATCTTTCCAACCGCTTTAACCTTGGGGATCAACTTTCATCAAATCAAC 2272
Query 2249 A-A-C-A---GCATTTCCAGAATCGGGATATGCTGTCGCATTTACATATAGGTGATCAAG 2302
| | | | ||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2273 ATAACCAACAGCAATTCCAAAACCGGGATATGCTGTCGCATTCACATATAGGTGATCAAG 2332
Query 2303 CTCAGGATCTGGAGCATTTAATAACTCTCCAGTTgcagcagcaacagaagattcagttgc 2362
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2333 CTCAGGATCTGGATTATTTAATAACTCTCCAGTTGCAGCAGCAACAAAAGATTCAGTTGC 2392
Query 2363 aacagcagcagaagattcaattgcatcagcagcagaagaTTCAGTTGCAACAGCA----- 2417
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2393 AACAGCAGCAGAAGATTCAATTGCAGCAGCAGCAGAAGATTCAGTTGCAACAGCAGCAGA 2452
Query 2418 ---T-CAGCTG-----G-A--A-C-A-A----GAGCATCAGTTACATCAGAAGCTCTTAC 2458
| |||||| | | | | | | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2453 AGATGCAGCTGCAACAGCATCAACTAGAACAAGAGCATCAGTTACATCAGAAGCTCTTAC 2512
Query 2459 AGGAGCAACAACAGTCCCATGCTCGACAATTACATTTTCAACAGATTTTACAAGGACAGA 2518
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2513 AGGAGCAACAACAGTCCCATGCTCGGCAATTACATTATCAACAGATTCTACAAGGACAGA 2572
Query 2519 CTCCTGATACACGGTTTGGGCAGTCACATGACTTCCCTCGATCCAACAATGTTGATCAGA 2578
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2573 CTCCTGATTCAAGGTTTGGGCAGTCACATGACTTCCCTCGATCCAACAATGTTGATCAGA 2632
Query 2579 TGTTGTTAGAGCGGCAGCTGATGAATGAACTGCAGAAAAGTTCTGGCCATCCTTCACAAA 2638
|||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2633 TGTTGTTAGAACACCAGCTAATGAATGAACTGCAGAAAAGTTCTGGCCATCCGTCACAAA 2692
Query 2639 ATTTCGCACCATATATTGAGCAACTTGCTGCAGGAAATTTTGGGCAGTTTTCTCATGAAG 2698
|||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || | |||||||
Sbjct 2693 ATTTTGCACCATACATTGAGCAACTTGCCGCTGGAAATTTTGGTCAATTGCCACATGAAG 2752
Query 2699 GCCACCAAAGGGAGCTACTTGAACAGCTACTTTCAACACAAATGCAGTCTCAGTATGGAC 2758
|||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||
Sbjct 2753 GCCATCAGAGGGAACTACTTGAACAGCTACTTTCAACAAAAATGCAATCTCAATATGGAC 2812
Query 2759 AAAAGCAATCTCATTATGGACAAATGCAATCTCAACACGGACAACTGCAATCTGAAACAA 2818
|||| | ||| | | || || |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2813 -----CAAT--------G--CAA-T-C--TC-CAT-ACGGACAACTGCAATCTGAACCAA 2851
Query 2819 -TCCGGTCTTTGGAGTACCAGCTGCTGCAGCAAGAGCAGCTTATGCAATTGGCAAATGGA 2877
|| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 2852 CTC-GGTCTTTGGAGTACCAACTGCTGCAGCAAGAGCAGCTGATGCAATTGGCAAACGGA 2910
Query 2878 GTGAGGCACAATACACTATTCGAAGAACAAAGACATATTGACCCTCTGTGGCCATCTGAC 2937
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2911 GTGAGGCACAATACACTATTGGAGGAACAGAGACATATTGACCCTCTGTGGCCATCTGAC 2970
Query 2938 CATAGTGATCAGCTTTTAAGGACTCATCCTGGGATCCAGCGTTCAC-ACTCTTCTGCAGG 2996
|||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| | | || ||| ||||
Sbjct 2971 CATAATGATCAGCTTCTAAGAAGTCATCCTGGGATCCAACGTTCGCGA-TCCTCTACAGG 3029
Query 2997 GTTTAGACCATTAGACTTTCATCAACAGCAGCAGAGGCCACCCTTCGAGGATCAGTTGGG 3056
||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3030 ATTTAGACAACTAGACTTTCATCAACAGCAGCAGAGGCCACCCTTCGAGGATCAGTTTGG 3089
Query 3057 TCAACTTGAGCGGAATCTTTCATATCAGCAACAACTTCGACAGGAATTATTCGAGCAGGG 3116
||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3090 TCAACTTGAGCGGAACCTTTTATATCAGCAACAGCTTCGACAAGAATTATTCGAGCAGGG 3149
Query 3117 TCTTCCATTTGAGAGATCAGCATCG------G---G-G---CGG--A--A-TCTGGATGC 3158
||| ||||||||| |||||||||| | | | ||| | | ||||||| |
Sbjct 3150 TCTGCCATTTGAGCGATCAGCATCCTTACCTGTAAGTGTATCGGGGATGAATCTGGATCC 3209
Query 3159 AGTAAATGGTCTTGGTCTCTCTCAGGGTCTGGAGTTGCGGGATGCTACTGCCCACATGCA 3218
||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3210 AGTAAATGGTCTTGGACTCTCTCAAGGTCTGGAGTTGCGGGATGCTACTACCCACATGCA 3269
Query 3219 ATCTTCTGGCAGATTGGGAAATTCTACTCCGGGTTTCAGTCATCAGAATCCCCGTATACC 3278
| | ||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 3270 -------G--A--TTGGGAA-TTCTACTCTGGGTTTTAATCATCAGAATCCCCGTATACC 3317
Query 3279 ATTAGGTGAACCACATTTTTCACAATTAGAACCAATGGAAGGACGCTGGTCTGGCGCAGA 3338
| |||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||| || ||
Sbjct 3318 AATAGGTGAACCTCATTTTTCACAGTTGGAATCAATGGAAGGACGTTGGTCTGGAGCTGA 3377
Query 3339 TACACAGCTAGCTGGTGACTGGGCTGAATCTCAATTTCGTAGATCTAATGTGGATACTGA 3398
|||||| | | |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| | ||| ||||
Sbjct 3378 CACACAGGTTGTTGGTGACTGGGCCGAATCTCAACTTCATAGATCAAATATTGATGCTGA 3437
Query 3399 ACATCATAAAATGAGGTCGGAAATTAGGAGACTGGGTGAAGATTCCAACTCATGGATGGT 3458
|||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3438 ACATCATAAAATGAGGTCAGAAAGTAGGAGAATGGGTGAAGATTCCAACTCATGGATGTT 3497
Query 3459 AGGTGGGTCTACAGACGACAAGTCAAAACAGCTTTTTATGGAGTTGCTCCACCAGAGACC 3518
||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3498 AGGTGGGACTACAGAAGACAGGTCAAAACAGCTATTTATGGAGTTGCTCCACCAGAGACC 3557
Query 3519 CGGCCATCAATCTGCTGAGTCACCAAGCATGAACCGTGGGTA-TGCCTATGACAGGATGG 3577
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||
Sbjct 3558 CGGCCATCAATCTGCTGAATCACCAAGCATGAACCGTGGGCAAT-CCTTTGACAGGATGG 3616
Query 3578 TTCCTTCAGGCCTTACCCCAGGGATTCAAACGCTTGGCGGCCT-TTCAGACCATGGTGGT 3636
|||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||
Sbjct 3617 CTCCTTCTGGCCTTACCCCAGGGATTCAAACACTTGGCGGC-TATTCAGATCATGGTGGT 3675
Query 3637 AGTCAAAACGTTTCATCTACTTTTGGGGCTCGAGCATTTTCTGATGAACAGGTCAACAGA 3696
||||| |||| | | || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3676 AGTCATAACGCTCCTTCAACTTTTGGTGCTCGAGCATTTTCTGATGAACAGATCAACAGA 3735
Query 3697 --ATGCCGGCAGATAGGAACAATATGGGATCATTGCACCGTAATGGTTCCTTGCTTTCTG 3754
|| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3736 TCAT-CCGG-AGATAGGAACAATATGGGATCATTGCACCGTAATAATTCCTTGCTTTCTG 3793
Query 3755 GAATCATTGATGGTGGGCGGTCAACTCAGAATGAAAGTCAAGCCTTCAGTAATATGTTTG 3814
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3794 GAATTATTGATGGTGGGCGGTCAACTCAGAATGAAACTCAAGCCTTCAGTAATATGTATG 3853
Query 3815 CTATGAACAAGGACGCAAATGACATCAAAACTTGGAACAACT-TGCCGCCTAAAAATGAG 3873
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 3854 CTATGAACAAAGACGCGAATGACATCAAAACTTGGAACAA-TGTGCCGCCTAAAAATGAG 3912
Query 3874 GGAATGGGAAGGATGATGTCATATGAAGCCCAAGACAGAATGGGCAAACAAGCAGTATTA 3933
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3913 GGAATGGGAAGGATGATGTCATTTGAAGCCCAAGATAGAATGGGCAAGCAAGCAGTATTA 3972
Query 3934 GACTCCCTGGTTCAAGACGAGCTTCCTGTTGTTACGCGTGGTCAACAGTCTTCTTTCAAT 3993
||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||
Sbjct 3973 GACTCACTGGTTCATGGGGAGCTTCCTGTTGTTACGCCTGGCCAACAGTCTTCTTTAAAT 4032
Query 3994 ATATCTG 4000
|| ||||
Sbjct 4033 ATCTCTG 4039
Score = 688 bits (372), Expect = 0.0
Identities = 476/523 (91%), Gaps = 19/523 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 4092 GACCAGTATAGTGACAACTTGGTTGGAGAAGATAGAAGGAAGG--A------TAGTTCCA 4143
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 4039 GACCAATACAGTGACAACTTGGTTGGAGAAGATAGAAGGAAGGATAGGTTGGTAGTTCCA 4098
Query 4144 TCACATGGACATG-ATCCAGTTTTGTTAAAAAGGCCTCCCTCATCCCATTCTTCATCATC 4202
||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4099 TCACATGGACA-GAATTCAGTATTGTTAAAAAGGCCTCCCTCATCCCATTCTTCATCATC 4157
Query 4203 GCATGAAGGATTGCTCGAGCGTATGTCTGATACAGCTAGCAGGACAGCAGCAAGTTCTTA 4262
||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4158 GCATGAAGGATTGATAGAGCGTATCTCTGACACAGCTAGCAGGACAGCAGCAAGTTCGTA 4217
Query 4263 TAGTGGAATAGAAGGAGGTGTGAGACGGGAATCAGGAGCAGCAGGAAACAAAGGGTCAAC 4322
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4218 TAGTGGAATTGAAGGCGGTGTGAGACGGGAATCAGGAGCAGCGGGAAACAAAGGGTCAAC 4277
Query 4323 GTCAGAGGCCG-CATCGTTCAGTGAGATGTTGAAGAAGAGTAATAGCATGAAGAAGGTGG 4381
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4278 GTCAGAGGC-GACATCGTTCAGTGAGATGTTGAAGAAGAGTAATAGCATGAAGAAGGTGG 4336
Query 4382 TGGTAGAGTCATCTGATGCAACCGAAGGAAGCAAAGGTGGTGGTGGGAAGAAGAAAGGGA 4441
|| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4337 CGGCAGAGTCAAATGATGTAACAGAAGGAAGCAAAGGTGGTGGCGGGAAGAAGAAAGGGA 4396
Query 4442 AGAAAGGGAGGCAGATAGATCCAGCTCTTCTCGGTTTCAAAGTCACTAGTAATCGCATTC 4501
|||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4397 AGAAAGGGAGGCAGATCGATCCAGCTCTTCTTGGTTTCAAAGTCACTAGCAATCGCATT- 4455
Query 4502 TTATGGGCGAGATCCACCGTGCTGATGATTTTTAGCT-TTTTGTTCTTCT-GTACAAAAT 4559
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| | |||||||||
Sbjct 4456 --ATGGGCGAGATCCACCGTGCTGATGATTTTTAACTCTTTTTTTCTTTTTGTACAAAAT 4513
Query 4560 CTTTACTTGTAAAGATTAGCTTCTCATTCTTAGGCAGT-TAGG 4601
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||
Sbjct 4514 CTTTACATGTAAAGATTAGCTTCTCAAGCTTAGGC-GTATAGG 4555
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 231219440287
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5