BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg473061 Length=5394 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT1G28420.1 | Symbols: HB-1 | homeobox-1 | chr1:9979802-9987638... 8401 0.0 > AT1G28420.1 | Symbols: HB-1 | homeobox-1 | chr1:9979802-9987638 FORWARD LENGTH=5430 Length=5430 Score = 8401 bits (4549), Expect = 0.0 Identities = 5154/5437 (95%), Gaps = 77/5437 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 TTTGGGATCAGGGTTTGTTTG-T---T-GAAAGCCCTAgtttttgtttttgtgttctttg 55 ||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 28 TTTTGGATCAGGGTTTGTTTGTTCAATAGAAAGCCCTAGTTTTTGTTTTTGTGTTCTTTG 87 Query 56 a---ttcttgcggccgtttctgggtttcttcttcttcttctc-ttcCATGGAGATGGGTT 111 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 88 ATTCTTCTTGCGGCCGTTTCTGGGTTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTCCATGGAGATGGGTT 147 Query 112 CTGATGGAGATGAAGATC---AGATCAGGAGCGTTGGTGATGTTGGTGGTAATCATCTTA 168 |||| | | |||||||| |||||||||||| | || || || || ||||| | || Sbjct 148 CTGA-CG-G-TGAAGATCAGAAGATCAGGAGCG-TCGT--TGGTGATGCTAATCTTAATA 201 Query 169 ATAAGAAGAAGAAGATTG---ATAATTCCTCCTCCAAGGATGGTGGTCGTGTTAAGCCTA 225 |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| Sbjct 202 ATAAGAAGAAGAAGATTGATAATAATTCCTCCTCTAAGGA---TGGTCGTGTCAAGCCTA 258 Query 226 AGCGTCAGATGAAAACTCCGTTTCAGCTTGAAACCTTGGAGAAAGTTTATTCAGAGGAGA 285 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 259 AACGTCAGATGAAAACTCCGTTTCAGCTTGAAACCTTGGAGAAAGTTTATTCAGAGGAGA 318 Query 286 CGTATCCTTCGGAGGCCACGAGGGCTGACTTGTCTGAGAAATTGGATTTGTCAGATCGAC 345 |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 319 AGTATCCGTCGGAGGCGACGAGGGCTGAGTTATCTGAGAAATTGGATTTGTCAGATCGAC 378 Query 346 AATTACAGATGTGGTTTTGCCATAGACGCTTAAAGGACAAGAAGGATGGTCAGTCCAAGA 405 ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct 379 AATTACAGATGTGGTTTTGTCATAGACGGTTAAAGGACAAGAAGGATGGTCAGTCTAATA 438 Query 406 AACCCGCGAAATCAGCGGTTCAATCGTCTGCTT-TAGCGTCTTCCGTTCACGAGTTACC- 463 |||| | ||||||| ||||| | | | | || | || |||| ||| |||||||||| Sbjct 439 AACCGGTGAAATCATCGGTT-GCT-G-C-GGTTCAATCGGCTTCGGTTAACGAGTTACCG 494 Query 464 GC--CTGCTGGATCGGTACCTGAGCAAGATTCCAGATCTGATTCGGGCTCTGAGTCAGGT 521 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 495 GCTGCTGCTGGATCGGTACCTGAGCAAGATTCCAGATCTGATTCGGGTTCTGAGTCTGGT 554 Query 522 TGCAGTCCTTATTCCAACTCAAGGAGGAATTTTGCTAGTGGTAGTAGTAGTTCTCGAGCT 581 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 555 TGCAGTCCTTATTCCAACTCTAGGAGGAATTTTGCTAGTGGTAGTAGTAGTTCTCGAGCT 614 Query 582 GAATTGGATGAATACGAGACAATGGGAAAGGCGAGTTATGAGTCACGGTTGTCGACAATG 641 |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 615 GAATTGGATGAATATGAGACAATGGGAAAGCCGAGTTATGAGTCGCGGTTGTCGACAATG 674 Query 642 GTGCGTAGAGCTATTGTCTGCATTGAGGCACAGTTAGGTGAGCCATTGAGAGATGATGGA 701 |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 675 GTGCATAGAGCTATTGTCTGTATTGAGGCTCAGTTAGGTGAGCCATTGAGAGATGATGGA 734 Query 702 CCTATTCTTGGTATGGAGTTTGATCCTTTGCCTCCTGGTGCATTCGGAACACCTATAGCG 761 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 735 CCTATTCTTGGCATGGAGTTTGATCCTTTGCCTCCTGGTGCGTTTGGAACACCTATAGCG 794 Query 762 ATGCAGAAACACCTAGTTCATCCGTATGAGAGCAATGTGTATGAGCGATATGATGCCCGA 821 ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 795 ATGCAGAAACACCTACTTCATCCCTATGAGAGCGATCTGTATGAGCGACATGATCCCCGA 854 Query 822 CCTCGAAGATCTCATGCTGCTGCCCGTTCTTTCCATGAGCAACAATCTCTGGATGATTCG 881 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 855 CCTCGAAGATCTCATGCTGCTGCCCGTTCTTTCCATGAGCAACAATCTCTGGATGATCCG 914 Query 882 TCTTCTTTTACACCTGAGATGTATGGACGATACTCTGAAAATCATGCACGTGGTATGGAC 941 ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 915 TCTTCTTTTACACCTAATATGTATGAACGATACTCTGAAAATCATGCACGTGGTATGGAC 974 Query 942 TATGAAATTGCACGTTCTAGGAGTTCATCATTTATGCACGCGAATGGGCCTTTACCAAGG 1001 |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct 975 TATGAAGTTGCACGTTCTAGAATTTCATCATTTATGCACGCGAATGGACCTGTACCAAGG 1034 Query 1002 TCCTATGTTACCCCTGGACATGTGTCTCGTAACTGTTCTACATCTCAACAAGACATGCCA 1061 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1035 TCCTATGTTACCCCTGGACATGCGTCTCGTAACTGTTCGACATCTCAACAAGACATGCCA 1094 Query 1062 ATCCCCATTGAATCAGCTCATCGTGGTGATAGATTCCTGCTGGAAAAGGATTCATCAGTC 1121 | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 1095 AGCCCCATTGAATCAGCGCATCATGGTGATAGATTCCTGCTGGAGAAGGACTCATCAGTC 1154 Query 1122 CTCGGTACAGAAGATCCATATTTGTTGCCTGATGGGGTGCGTAAGAGTAATGATGTGCAT 1181 || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1155 CTTGGTACAGAAGATCCATATTTGTTACCTGATGGAGTGCGTAAGAGTAGTGATGTGCAT 1214 Query 1182 CGGAAGGGAAAGATTAACGATGATAGACTTGGAAGAGGAAGTGAAATCCGAGAGAATCAT 1241 | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| Sbjct 1215 AGAAAGGGAAAGATTAACGATGGTAGACTTGGAAGAGGGAGTGAAACCCGAGAGAATCAT 1274 Query 1242 GGACCAAAAGATCTTGAGAAGCTAGAAATTCAGAGGaaaaaaaaTGAAGAACGCATGAGA 1301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1275 GGACCAAAAGATCTTGAGAAGCTAGAAATTCAGAGGAAAAAGAATGAAGAACGCATGAGA 1334 Query 1302 AAAGAAATGGAAAAGAACGAACGTGAGAGGCGTAAGGAAGAAGAGAGGTTGATGCGTGAA 1361 ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1335 AAAGAGATGGAAAGGAACGAGCGTGAGAGGCGTAAGGAAGAAGAGAGGTTGATGCGTGAA 1394 Query 1362 AGAATAAAAGAAGAGGAGAGGTTACAGCGTGAGCAGCGTCGTgaaatagaaagaagagaa 1421 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1395 AGAATAAAAGAAGAGGAAAGGTTACAGCGTGAGCAGCGTCGTGAAGTAGAAAGAAGAGAA 1454 Query 1422 aagttcttacagagagaaaatgaaagggcggagaaaaagaagcaaaaagacgagattcgc 1481 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1455 AAATTCTTACAGAGAGAAAATGAAAGGGCTGAGAAAAAGAAGCAAAAAGACGAGATTCGT 1514 Query 1482 cgagagaaagaCGCTATTAGACGCAAGCTTGCCATTGAGAAGGCAACTGCACGTAGAATT 1541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1515 CGAGAGAAAGACGCTATTAGACGCAAGCTTGCCATTGAGAAGGCAACTGCACGTAGAATT 1574 Query 1542 GCCAAGGAGTCTATGGATCTTATTGAAGATGAGCAGCTAGAACTGATGGAATTGGCTGCT 1601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1575 GCCAAGGAGTCTATGGATCTTATTGAAGATGAGCAGCTAGAACTAATGGAATTGGCTGCT 1634 Query 1602 ATTAGCAAAGGATTGCCCTCAGTATTACAGCTTGATCACGACACATTGCAAAATCTTGAA 1661 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1635 ATTAGCAAAGGATTACCCTCAGTATTACAGCTTGATCACGACACATTGCAGAATCTTGAG 1694 Query 1662 GTGTATAGAGATTCTCTGAGCACATTTCCACCAAAGTCTTTGCAACTAAAAATGCCGTTT 1721 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1695 GTGTATAGAGATTCTCTGAGCACATTTCCACCAAAGTCTTTGCAACTAAAAATGCCGTTT 1754 Query 1722 GCCATTTCTCCATGGAAAGATTCTGATGAAACTGTTGGAAACCTTCTAATGGTTTGGAGA 1781 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1755 GCCATTTCTCCATGGAAAGATTCTGATGAAACTGTTGGAAACCTTCTAATGGTTTGGAGA 1814 Query 1782 TTCCTGATATCATTTTCTGATGTTCTTGACCTATGGCCTTTTACACTGGATGAGTTTATT 1841 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1815 TTCCTGATATCATTTTCTGATGTTCTTGACCTATGGCCTTTTACACTGGATGAGTTTATT 1874 Query 1842 CAGGCTTTTCATGACTATGACTCAAGGTTGTTGGGGGAGATACATGTTACTCTTCTGAGA 1901 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1875 CAGGCTTTTCATGACTATGACTCAAGGTTGCTGGGGGAGATACATGTTACTCTTCTGAGA 1934 Query 1902 TCAATAATACGAGATATCGAAGATGTTGCTAGGACACCCTTTAGTGGAATTGGAAATAAC 1961 ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1935 TCAATAATACGAGATGTCGAAGATGTTGCTAGAACACCCTTTAGTGGAATTGGAAATAAC 1994 Query 1962 CAATATACTACAGCCAATCCTGAGGGTGGACATCCGCAAATAGTTGAAGGGGCTTATGCA 2021 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1995 CAATATACTACAGCCAATCCTGAGGGTGGACATCCGCAAATAGTTGAAGGGGCTTATGCA 2054 Query 2022 TGGGGCTTTGACATTCGTAGCTGGAAAAAGCATTTGAACCCACTAACATGGCCTGAAATA 2081 ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2055 TGGGGTTTTGACATTCGTAGTTGGAAAAAGCATTTGAACCCACTAACATGGCCTGAAATA 2114 Query 2082 CTGCGACAATTGGCACTCTCTGCTGGATTTGGGCCTAGGCTGAAGAAAAAACATTCCCGA 2141 ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2115 CTGCGACAATTAGCGCTCTCTGCTGGATTTGGACCTAAGCTGAAGAAAAAACATTCCCGA 2174 Query 2142 TTGACCAATACTGGTGATAAGGATGAGGCTAAAGGTTGTGAAGATATCATTTCTACTATC 2201 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2175 TTGACCAATACTGGTGATAAGGATGAGGCTAAAGGTTGTGAAGATGTCATTTCTACTATC 2234 Query 2202 CGAAATGGTTCAGCAGCTGAAAGTGCTTTTGCATCGATGCGGGAGAAAGGGTTACTCGCT 2261 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2235 CGAAATGGTACAGCAGCTGAAAGTGCTTTTGCATCGATGCGGGAGAAAGGGTTGCTCGCT 2294 Query 2262 CCTCGCAAGTCAAGGCACCGGTTGACACCTGGAACCGTCAAATTCGCAGCCTTTCATGTA 2321 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2295 CCTCGCAAGTCGAGGCACCGGTTGACACCTGGAACCGTCAAATTTGCAGCCTTTCATGTT 2354 Query 2322 CTATCTCTTGAGGGAAGCAAGGGACTGACAGTATTAGAACTTGCTGACAAGATTCAGAAA 2381 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2355 CTATCTCTTGAAGGAAGCAAGGGACTGACAGTATTAGAACTTGCTGACAAGATTCAGAAA 2414 Query 2382 TCTGGACTTCGGGACTTGACAACAAGCAAGACACCAGAGGCTTCTATTTCTGTTGCATTG 2441 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2415 TCTGGACTTCGGGACTTGACCACAAGCAAGACACCAGAGGCTTCTATTTCTGTTGCATTG 2474 Query 2442 ACAAGAGATGTGAAACTCTTCGAAAGAATAGCTCCTTCGACTTATTGTGTACGAGCTCCT 2501 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2475 ACAAGAGATGTGAAACTCTTTGAAAGAATAGCTCCTTCGACTTATTGTGTACGAGCTCCT 2534 Query 2502 TATGTGAAGGATCCTGCGGATGGAGAGGCAATACTCGCAGATGCCAGGAAGAAGATAAGG 2561 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2535 TATGTGAAGGATCCTAAGGATGGAGAGGCAATACTCGCAGATGCCAGGAAGAAGATACGG 2594 Query 2562 GCATTTGAAAATGGATTTACAGGTCCAGAAGATGTGAATGATCTTGAAAGGGATGAAGAA 2621 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2595 GCTTTTGAAAATGGATTTACAGGTCCAGAAGATGTGAATGATCTTGAAAGGGATGAAGAC 2654 Query 2622 TTTGAAATTGATATTGATGAGGATCCTGAGGTTGATGATTTAGCTACTCTGGCAAGTGCA 2681 || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2655 TTCGAAATTGATATTGATGAGGATCCCGAGGTTGATGATTTAGCTACACTGGCAAGTGCA 2714 Query 2682 TCAAAAAGTGCCGTTCTAGGTGAAGCGAATGTTTTGTCAGGAAAGGGGGGAAATACTATG 2741 ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| Sbjct 2715 TCAAAAAGTGCCGTTCTTGGAGAAGCGAATGTTTTGTCAGGAAAGGGGGTAGATACAATG 2774 Query 2742 TTCTGTGATGTTAAAGCTGATGTAAAGAGTGAGCCTGAGAAGGAGTTTCCATCTCCTCCT 2801 ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2775 TTCTGTGATGTTAAAGCAGATGTAAAGAGTGAGCTTGAGAAGGAGTTTTCATCTCCTCCT 2834 Query 2802 CCAAGCAGTATGAAGAGCATTGTTCCACAACATAGTGAGCGGTTTAAAGATACAGTGGTT 2861 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| Sbjct 2835 CCAAGCACTATGAAGAGCATTGTTCCACAACATAGTGAGCGGCATAAAAATACAGTGGTT 2894 Query 2862 GGCTGCGTGGATACCGTGGTTGATGAAAGCAACCAGGGCCAATCATGGATTCAAGGTCTT 2921 ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2895 GGCGGCGTGGATGCCGTAATTGATGAAAGCAACCAGGGCCAATCATGGATTCAAGGTCTT 2954 Query 2922 ACGGAAGGGGATTACTGTCATCTAAGTGTTGAAGAGCGCCTTAATGCCCTTGTTGCTTTA 2981 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2955 ACGGAAGGGGATTACTGTCATCTAAGTGTTGAAGAGCGCCTTAATGCCCTTGTTGCTTTA 3014 Query 2982 GTCGGCATTGCCAATGAAGGAAACTCCATCAGAGCTGGTCTTGAGGATCGTATGGAAGCA 3041 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3015 GTCGGCATTGCCAATGAAGGAAACTCCATCAGAACAGGTCTTGAGGATCGTATGGAAGCA 3074 Query 3042 GCAAATTCTCTTAAAAAGCAAATGTGGGCTGAAGCACAGTTAGATAACAGCTGTATGAGA 3101 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3075 GCAAATGCTCTTAAAAAGCAAATGTGGGCTGAAGCACAGTTAGATAACAGCTGTATGAGA 3134 Query 3102 GATGTACTTAAGCTTGATTTTCAAAACCTAGCAAGCAGCAAAACCGAATCAACGATGGGT 3161 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 3135 GATGTACTTAAGCTTGATCTTCAAAACTTAGCAAGCAGCAAAACTGAATCAACGATAGGC 3194 Query 3162 CTACCAATCATCCAAAGCTCTACTCGTGAGAGGGATAGTTTCGATAGAGACCCTTCTCAA 3221 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3195 CTACCAATCATTCAAAGCTCTACTCGTGAGAGGGATAGTTTTGATAGAGACCCTTCTCAA 3254 Query 3222 CTTCTAGATGAAACAAAGCCCCTGGATGATCTTTCGAACAATCTTCATAAATCATCTGCT 3281 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3255 CTTCTAGATGAAACAAAGCCCCTGGAAGATCTTTCGAACGATCTTCATAAATCATCTGCT 3314 Query 3282 GAGAGAGCACTTATTAATCAGGATGCCAATATAAGTCAAGAAAATTGTTCTTCCCAACTT 3341 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | Sbjct 3315 GAGAGAGCACTTATTAATCAGGATGCCAATATAAGTCAAGAAAATT---------A--T- 3362 Query 3342 GGATATGCTTCAAAGAGATCACGCTCACAATTAAAATCATATATAGGCCACAAAGCAGAA 3401 | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3363 G------CTTCAAAGAGATCACGCTCCCAATTAAAGTCATATATAGGCCACAAAGCAGAA 3416 Query 3402 GAGGTGTATCCATACCGATCTTTGCCGCTTGGACAAGATCGGCGCCACAATCGTTACTGG 3461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3417 GAGGTGTATCCATACCGATCTTTGCCGCTTGGACAAGATCGGCGCCACAATCGTTACTGG 3476 Query 3462 CATTTTGCTGTATCAGTGTCTAAGAGTGATCCTTGCTCGGGGCTCTTATTTGTTGAGCTA 3521 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3477 CATTTTGCTGTATCAGTGTCTAAGAGTGATCCTTGTTCGAGGCTCTTATTTGTTGAGCTA 3536 Query 3522 CATGATGGCAAGTGGCTCCTCATTGATTCAGAAGAGGCTTTTGATATTCTGGTTGCATCA 3581 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3537 CATGATGGCAAGTGGCTCCTCATTGATTCAGAAGAGGCTTTTGATATTCTGGTTGCATCA 3596 Query 3582 TTGGATATGCGCGGGATCAGAGAGTCTCATTTACGCATAATGCTGCAGAAGATCGAGGGA 3641 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3597 TTGGATATGCGTGGGATCAGAGAGTCTCATTTACGCATAATGCTGCAGAAGATCGAGGGA 3656 Query 3642 TCATTCAAAGAGAATGCTTGTAAAAATATAAAGCTAGATAGAAACCCTTTCTTGAAGGAA 3701 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct 3657 TCATTCAAAGAGAATGCTTGTAAAGATATAAAGCTAGCTAGAAACCCTTTCTTGACGGAA 3716 Query 3702 AAGAGTATTGTGAATCATTCTCCTACAGATTCTGTGAGCCC---GTCCAGTGCTATATCA 3758 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3717 AAGAGTGTTGTGAATCATTCTCCTACAGATTCTGTGAGCCCATCGTCCAGTGCTATATCA 3776 Query 3759 GGGTCAAACTCTGATTCAATGGAAACTTCAACTTCAATTAGAGTTGAGTTAGGTAGAAAC 3818 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3777 GGGTCAAACTCTGATTCAATGGAAACTTCAACTTCAATTAGAGTTGATTTAGGTAGAAAT 3836 Query 3819 GACACCGAGAACAAGAATTTATCAAAACGATTCCATGATTTCCAGAGATGGATGTGGACC 3878 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3837 GACACCGAGAACAAGAATTTATCAAAACGGTTCCATGATTTCCAGAGATGGATGTGGACC 3896 Query 3879 GAGACGTACAGTTCACTACCTTCTTGTGCTAGAAAATATGGGAAGAAGAGATCTGAACTG 3938 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3897 GAGACGTACAGTTCACTACCTTCTTGTGCTAGAAAATATGGGAAGAAGAGATCTGAACTG 3956 Query 3939 TTAGCAACATGTGATGCGTGTGTTGCTTCTTATTTGTCTGAGTATACCCACTGCACTTCT 3998 |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| Sbjct 3957 TTAGCAACATGTGACGCGTGTGTTGCTTCCTATTTGTCTGAGTATACCTTCTGCTCTTCT 4016 Query 3999 TGTCACCAGAGACTGGACGTGGTTGATAGTTCAGAGATATTAGATTCAGGTTTGACTGTG 4058 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4017 TGTCACCAGAGATTGGACGTGGTTGATAGTTCAGAGATATTAGATTCAGGTTTGGCTGTG 4076 Query 4059 TCTCCTCTTCCTTTTGGAGTCAGGTTGCTCAAACCACTACTTGTTTTTCTCGAGGCATCT 4118 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4077 TCTCCTCTTCCTTTTGGAGTCAGGTTGCTCAAACCACTACTTGTTTTTCTCGAGGCATCT 4136 Query 4119 GTTCCAGATGAAGCTCTTGAATCATTTTGGACGGAGGACAAAAGAAAAATTTGGGGGTTT 4178 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct 4137 GTTCCAGATGAAGCTCTTGAATCATTTTGGACAGAGGACCAAAGAAAAAAATGGGGGTTT 4196 Query 4179 AGGTTGAATGCTTCATCATCACCTGAAGACCTTTTGCAGGTGTTGACTTCCTTAGAGAGT 4238 ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4197 AGGTTGAATACTTCATCATCACCTGGAGAACTTTTGCAGGTGTTGACTTCCTTAGAGAGT 4256 Query 4239 GCAATCAAGAAAGAATCTTTGTCATCCAATTTTATGTCGGCAAAGGAGCTTTTGGGAGCT 4298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4257 GCAATCAAGAAAGAATCTTTGTCATCCAATTTTATGTCGGCAAAGGAGCTTTTGGGAGCT 4316 Query 4299 GCTAATGCTGATGCTGATAATCTGGGATCAGTGGACGTTCTTCCATGGATACCAAAGACA 4358 ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4317 GCTAACGCTGAGGCTGATGATCAGGGATCAGTGGACGTTCTTCCATGGATACCAAAGACA 4376 Query 4359 GTATCAGCGGTTGCTTTGAGACTTTCAGAACTTGATGCATCCATTATTTATGTGAAGCCA 4418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4377 GTATCAGCGGTTGCTTTGAGACTTTCAGAACTTGATGCATCCATTATTTATGTGAAGCCA 4436 Query 4419 GAGAAACCTGAGCTGATCCCTGAAGATGAGAACGAGCAGATTAGCCTTTTCCCTGGAGAT 4478 |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4437 GAGAAACCTGAGGTCATCCCTGAAGATGAGAACGAGCAGATTAGCCTTTTCCCTAGAGAT 4496 Query 4479 TCCCCTTTCAAAGGCAAAGGACCCAGAGAGCAAGAAGATCAACATGAGGTTGTTCCAAAC 4538 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| Sbjct 4497 TCACCTTTCAAAGGCAAAGGACCCAGAGAGCAAGAAGATCAAGACGAGGTTGCTCCAAAC 4556 Query 4539 TCGGGTAACA-AACGTAATAAACGTGCACGAGTAAGCTTGGGATCTGGATCAAACAGAAA 4597 ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4557 CCGGGTAACAGAAA-TAAGAAACGTGCACGAGTAAGCTTGGGATCTGGATCAAACAGAAA 4615 Query 4598 GGTGAAGAGGAAGAAAGCGCAAAGCGGTCTTAACAAATTTGTCGTCGGTAGGAGAAATGT 4657 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 4616 GGTGAAGAGGAAGAAAGCGCAAAGCGGTCTTAACAAATTTGTCGTTGGTAGGAGAAATGT 4675 Query 4658 TGCAGTCAATAGTAACTTAATGACTGTTGAGTTGAACCACCAAGTCCCTGGAAAAGGAAA 4717 |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4676 TGCAGTCAATAGTAACTTAATGGCCGTTGAGTTGAACCACCAAGTCCCTGGAAAAGGAAA 4735 Query 4718 GAGGACGGTTAGAAAAAGACCAGAGAGGATCGATGAGGATAATGACCACCTAGTCAATAG 4777 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 4736 GAGGACGGTTAGAAAAAGACCAGAGAGGATCGATGAGGATAATTCCCACCTAGTCAATAG 4795 Query 4778 AATGGCTAATATTGTTAGGCCTAAAAGCGAAGAAGTTGAAGAAGATGAGGAAGAAGAAGA 4837 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4796 AATGGCTAATATTGTTAGGCCTAAAAGCGAAGAAGTTGAAGAAGATGAGGAAGAAGAAGA 4855 Query 4838 GCCAACATTCAGAGACATTGATGAAGACTGGGCAGCAGGTGAAACTCCTAGAGAGATGGA 4897 || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4856 GCAAACATTCAGAGACATTAATGAAGACTGGGCAGCAGGTGAAACTCCTAGAGAGATGGA 4915 Query 4898 CGAGGACTGGGCCAATGAAACACCAAACAGAATGATGACGCCGATGCAAGTGGATGATGA 4957 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4916 GGAGGACTGGGCCAATGAAACACCAAACAGAATGATGACGCCGATGCAAGTGGATGATGA 4975 Query 4958 AAGTGACAACAGTGTAGGAGTTGAATCAGAGGATGATGATGGTGGTGGTCAGTTTGTGGA 5017 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4976 AAGTGACAACAGTGTAGGAGTTGAATCAGAGGATGAAGATGGTGGTGGTCAGTTTGTGGA 5035 Query 5018 TTACAGTCAGAGAAACAAGTGGGGGTTAGATTGGAATAGTAACCCAAACGAGGCAAT-G- 5075 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| | Sbjct 5036 TTATAGTCAGAGAAACAAGTGGGGGTTAGATTGGAATAGTAACCTAAATGTGGCAATAGA 5095 Query 5076 G-A-G--GA--A-GAAG---TTGTTGGTGTTGGGAGGGTCGAAGGAGAAGATGACGCCGA 5125 | | | || | |||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct 5096 GGAAGACGAGGAAGAAGAAGTTGTGGGGGTTGGGCGGGTCGAAGGAGAAGATGACGCAGA 5155 Query 5126 GATGAGTGAGAGCTCTGAAGATGATGATG--C-T---AATAATGCAGCAAACAATTACGA 5179 |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| Sbjct 5156 AATGAGTGAGAGCTCTGAAGATGATGATGTACCTGCTAATAATGCAGCAAACAATTACGA 5215 Query 5180 CAGAGAATCAGAAGGTTACAGCAGCAGCGATTCATGAACTTAAGATCTAGTAGCTTGTGA 5239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct 5216 CAGAGAATCAGAAGGTTACAGCAGCAGCGATTCATGAAGTTGAGATCTAGTAGCTTGTGA 5275 Query 5240 AGAGGGAAGATTACATTCTTGTTGAAGatatatatatatatatttttatataGGAGAAAA 5299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| Sbjct 5276 AGAGGGAAGATTACATTCTTGTTGAAGATATATATATATAT-TTTT-ATGTAGGAGAAAA 5333 Query 5300 GAGAGATAGTATCAGAATAGGTTTTCACCTATAGAAGAAGAACATTTCTGATTAGTTTTG 5359 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5334 GAGAGATAGTAGCAGAATAGGTTTTCACCTATAGAAGAAGAACATTTCTGATTAGTTTTG 5393 Query 5360 GTGCAGTTA--AAAGCCAAGCCAAGGCATGTATTTAG 5394 |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 5394 GTGCAGTTGTTAAAGCCAAGCCAAGGCATATATTTAG 5430 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 269245983081 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5