BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg473061
Length=5394
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G28420.1 | Symbols: HB-1 | homeobox-1 | chr1:9979802-9987638... 8401 0.0
> AT1G28420.1 | Symbols: HB-1 | homeobox-1 | chr1:9979802-9987638
FORWARD LENGTH=5430
Length=5430
Score = 8401 bits (4549), Expect = 0.0
Identities = 5154/5437 (95%), Gaps = 77/5437 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTGGGATCAGGGTTTGTTTG-T---T-GAAAGCCCTAgtttttgtttttgtgttctttg 55
||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 28 TTTTGGATCAGGGTTTGTTTGTTCAATAGAAAGCCCTAGTTTTTGTTTTTGTGTTCTTTG 87
Query 56 a---ttcttgcggccgtttctgggtttcttcttcttcttctc-ttcCATGGAGATGGGTT 111
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 88 ATTCTTCTTGCGGCCGTTTCTGGGTTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTCCATGGAGATGGGTT 147
Query 112 CTGATGGAGATGAAGATC---AGATCAGGAGCGTTGGTGATGTTGGTGGTAATCATCTTA 168
|||| | | |||||||| |||||||||||| | || || || || ||||| | ||
Sbjct 148 CTGA-CG-G-TGAAGATCAGAAGATCAGGAGCG-TCGT--TGGTGATGCTAATCTTAATA 201
Query 169 ATAAGAAGAAGAAGATTG---ATAATTCCTCCTCCAAGGATGGTGGTCGTGTTAAGCCTA 225
|||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 202 ATAAGAAGAAGAAGATTGATAATAATTCCTCCTCTAAGGA---TGGTCGTGTCAAGCCTA 258
Query 226 AGCGTCAGATGAAAACTCCGTTTCAGCTTGAAACCTTGGAGAAAGTTTATTCAGAGGAGA 285
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 259 AACGTCAGATGAAAACTCCGTTTCAGCTTGAAACCTTGGAGAAAGTTTATTCAGAGGAGA 318
Query 286 CGTATCCTTCGGAGGCCACGAGGGCTGACTTGTCTGAGAAATTGGATTTGTCAGATCGAC 345
|||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 319 AGTATCCGTCGGAGGCGACGAGGGCTGAGTTATCTGAGAAATTGGATTTGTCAGATCGAC 378
Query 346 AATTACAGATGTGGTTTTGCCATAGACGCTTAAAGGACAAGAAGGATGGTCAGTCCAAGA 405
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 379 AATTACAGATGTGGTTTTGTCATAGACGGTTAAAGGACAAGAAGGATGGTCAGTCTAATA 438
Query 406 AACCCGCGAAATCAGCGGTTCAATCGTCTGCTT-TAGCGTCTTCCGTTCACGAGTTACC- 463
|||| | ||||||| ||||| | | | | || | || |||| ||| ||||||||||
Sbjct 439 AACCGGTGAAATCATCGGTT-GCT-G-C-GGTTCAATCGGCTTCGGTTAACGAGTTACCG 494
Query 464 GC--CTGCTGGATCGGTACCTGAGCAAGATTCCAGATCTGATTCGGGCTCTGAGTCAGGT 521
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 495 GCTGCTGCTGGATCGGTACCTGAGCAAGATTCCAGATCTGATTCGGGTTCTGAGTCTGGT 554
Query 522 TGCAGTCCTTATTCCAACTCAAGGAGGAATTTTGCTAGTGGTAGTAGTAGTTCTCGAGCT 581
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 555 TGCAGTCCTTATTCCAACTCTAGGAGGAATTTTGCTAGTGGTAGTAGTAGTTCTCGAGCT 614
Query 582 GAATTGGATGAATACGAGACAATGGGAAAGGCGAGTTATGAGTCACGGTTGTCGACAATG 641
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 615 GAATTGGATGAATATGAGACAATGGGAAAGCCGAGTTATGAGTCGCGGTTGTCGACAATG 674
Query 642 GTGCGTAGAGCTATTGTCTGCATTGAGGCACAGTTAGGTGAGCCATTGAGAGATGATGGA 701
|||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 GTGCATAGAGCTATTGTCTGTATTGAGGCTCAGTTAGGTGAGCCATTGAGAGATGATGGA 734
Query 702 CCTATTCTTGGTATGGAGTTTGATCCTTTGCCTCCTGGTGCATTCGGAACACCTATAGCG 761
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 735 CCTATTCTTGGCATGGAGTTTGATCCTTTGCCTCCTGGTGCGTTTGGAACACCTATAGCG 794
Query 762 ATGCAGAAACACCTAGTTCATCCGTATGAGAGCAATGTGTATGAGCGATATGATGCCCGA 821
||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 795 ATGCAGAAACACCTACTTCATCCCTATGAGAGCGATCTGTATGAGCGACATGATCCCCGA 854
Query 822 CCTCGAAGATCTCATGCTGCTGCCCGTTCTTTCCATGAGCAACAATCTCTGGATGATTCG 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 855 CCTCGAAGATCTCATGCTGCTGCCCGTTCTTTCCATGAGCAACAATCTCTGGATGATCCG 914
Query 882 TCTTCTTTTACACCTGAGATGTATGGACGATACTCTGAAAATCATGCACGTGGTATGGAC 941
||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 915 TCTTCTTTTACACCTAATATGTATGAACGATACTCTGAAAATCATGCACGTGGTATGGAC 974
Query 942 TATGAAATTGCACGTTCTAGGAGTTCATCATTTATGCACGCGAATGGGCCTTTACCAAGG 1001
|||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 975 TATGAAGTTGCACGTTCTAGAATTTCATCATTTATGCACGCGAATGGACCTGTACCAAGG 1034
Query 1002 TCCTATGTTACCCCTGGACATGTGTCTCGTAACTGTTCTACATCTCAACAAGACATGCCA 1061
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 TCCTATGTTACCCCTGGACATGCGTCTCGTAACTGTTCGACATCTCAACAAGACATGCCA 1094
Query 1062 ATCCCCATTGAATCAGCTCATCGTGGTGATAGATTCCTGCTGGAAAAGGATTCATCAGTC 1121
| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 1095 AGCCCCATTGAATCAGCGCATCATGGTGATAGATTCCTGCTGGAGAAGGACTCATCAGTC 1154
Query 1122 CTCGGTACAGAAGATCCATATTTGTTGCCTGATGGGGTGCGTAAGAGTAATGATGTGCAT 1181
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1155 CTTGGTACAGAAGATCCATATTTGTTACCTGATGGAGTGCGTAAGAGTAGTGATGTGCAT 1214
Query 1182 CGGAAGGGAAAGATTAACGATGATAGACTTGGAAGAGGAAGTGAAATCCGAGAGAATCAT 1241
| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 1215 AGAAAGGGAAAGATTAACGATGGTAGACTTGGAAGAGGGAGTGAAACCCGAGAGAATCAT 1274
Query 1242 GGACCAAAAGATCTTGAGAAGCTAGAAATTCAGAGGaaaaaaaaTGAAGAACGCATGAGA 1301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1275 GGACCAAAAGATCTTGAGAAGCTAGAAATTCAGAGGAAAAAGAATGAAGAACGCATGAGA 1334
Query 1302 AAAGAAATGGAAAAGAACGAACGTGAGAGGCGTAAGGAAGAAGAGAGGTTGATGCGTGAA 1361
||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1335 AAAGAGATGGAAAGGAACGAGCGTGAGAGGCGTAAGGAAGAAGAGAGGTTGATGCGTGAA 1394
Query 1362 AGAATAAAAGAAGAGGAGAGGTTACAGCGTGAGCAGCGTCGTgaaatagaaagaagagaa 1421
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1395 AGAATAAAAGAAGAGGAAAGGTTACAGCGTGAGCAGCGTCGTGAAGTAGAAAGAAGAGAA 1454
Query 1422 aagttcttacagagagaaaatgaaagggcggagaaaaagaagcaaaaagacgagattcgc 1481
|| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1455 AAATTCTTACAGAGAGAAAATGAAAGGGCTGAGAAAAAGAAGCAAAAAGACGAGATTCGT 1514
Query 1482 cgagagaaagaCGCTATTAGACGCAAGCTTGCCATTGAGAAGGCAACTGCACGTAGAATT 1541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1515 CGAGAGAAAGACGCTATTAGACGCAAGCTTGCCATTGAGAAGGCAACTGCACGTAGAATT 1574
Query 1542 GCCAAGGAGTCTATGGATCTTATTGAAGATGAGCAGCTAGAACTGATGGAATTGGCTGCT 1601
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1575 GCCAAGGAGTCTATGGATCTTATTGAAGATGAGCAGCTAGAACTAATGGAATTGGCTGCT 1634
Query 1602 ATTAGCAAAGGATTGCCCTCAGTATTACAGCTTGATCACGACACATTGCAAAATCTTGAA 1661
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1635 ATTAGCAAAGGATTACCCTCAGTATTACAGCTTGATCACGACACATTGCAGAATCTTGAG 1694
Query 1662 GTGTATAGAGATTCTCTGAGCACATTTCCACCAAAGTCTTTGCAACTAAAAATGCCGTTT 1721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1695 GTGTATAGAGATTCTCTGAGCACATTTCCACCAAAGTCTTTGCAACTAAAAATGCCGTTT 1754
Query 1722 GCCATTTCTCCATGGAAAGATTCTGATGAAACTGTTGGAAACCTTCTAATGGTTTGGAGA 1781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755 GCCATTTCTCCATGGAAAGATTCTGATGAAACTGTTGGAAACCTTCTAATGGTTTGGAGA 1814
Query 1782 TTCCTGATATCATTTTCTGATGTTCTTGACCTATGGCCTTTTACACTGGATGAGTTTATT 1841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1815 TTCCTGATATCATTTTCTGATGTTCTTGACCTATGGCCTTTTACACTGGATGAGTTTATT 1874
Query 1842 CAGGCTTTTCATGACTATGACTCAAGGTTGTTGGGGGAGATACATGTTACTCTTCTGAGA 1901
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1875 CAGGCTTTTCATGACTATGACTCAAGGTTGCTGGGGGAGATACATGTTACTCTTCTGAGA 1934
Query 1902 TCAATAATACGAGATATCGAAGATGTTGCTAGGACACCCTTTAGTGGAATTGGAAATAAC 1961
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1935 TCAATAATACGAGATGTCGAAGATGTTGCTAGAACACCCTTTAGTGGAATTGGAAATAAC 1994
Query 1962 CAATATACTACAGCCAATCCTGAGGGTGGACATCCGCAAATAGTTGAAGGGGCTTATGCA 2021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 CAATATACTACAGCCAATCCTGAGGGTGGACATCCGCAAATAGTTGAAGGGGCTTATGCA 2054
Query 2022 TGGGGCTTTGACATTCGTAGCTGGAAAAAGCATTTGAACCCACTAACATGGCCTGAAATA 2081
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2055 TGGGGTTTTGACATTCGTAGTTGGAAAAAGCATTTGAACCCACTAACATGGCCTGAAATA 2114
Query 2082 CTGCGACAATTGGCACTCTCTGCTGGATTTGGGCCTAGGCTGAAGAAAAAACATTCCCGA 2141
||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2115 CTGCGACAATTAGCGCTCTCTGCTGGATTTGGACCTAAGCTGAAGAAAAAACATTCCCGA 2174
Query 2142 TTGACCAATACTGGTGATAAGGATGAGGCTAAAGGTTGTGAAGATATCATTTCTACTATC 2201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2175 TTGACCAATACTGGTGATAAGGATGAGGCTAAAGGTTGTGAAGATGTCATTTCTACTATC 2234
Query 2202 CGAAATGGTTCAGCAGCTGAAAGTGCTTTTGCATCGATGCGGGAGAAAGGGTTACTCGCT 2261
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2235 CGAAATGGTACAGCAGCTGAAAGTGCTTTTGCATCGATGCGGGAGAAAGGGTTGCTCGCT 2294
Query 2262 CCTCGCAAGTCAAGGCACCGGTTGACACCTGGAACCGTCAAATTCGCAGCCTTTCATGTA 2321
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2295 CCTCGCAAGTCGAGGCACCGGTTGACACCTGGAACCGTCAAATTTGCAGCCTTTCATGTT 2354
Query 2322 CTATCTCTTGAGGGAAGCAAGGGACTGACAGTATTAGAACTTGCTGACAAGATTCAGAAA 2381
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2355 CTATCTCTTGAAGGAAGCAAGGGACTGACAGTATTAGAACTTGCTGACAAGATTCAGAAA 2414
Query 2382 TCTGGACTTCGGGACTTGACAACAAGCAAGACACCAGAGGCTTCTATTTCTGTTGCATTG 2441
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2415 TCTGGACTTCGGGACTTGACCACAAGCAAGACACCAGAGGCTTCTATTTCTGTTGCATTG 2474
Query 2442 ACAAGAGATGTGAAACTCTTCGAAAGAATAGCTCCTTCGACTTATTGTGTACGAGCTCCT 2501
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2475 ACAAGAGATGTGAAACTCTTTGAAAGAATAGCTCCTTCGACTTATTGTGTACGAGCTCCT 2534
Query 2502 TATGTGAAGGATCCTGCGGATGGAGAGGCAATACTCGCAGATGCCAGGAAGAAGATAAGG 2561
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2535 TATGTGAAGGATCCTAAGGATGGAGAGGCAATACTCGCAGATGCCAGGAAGAAGATACGG 2594
Query 2562 GCATTTGAAAATGGATTTACAGGTCCAGAAGATGTGAATGATCTTGAAAGGGATGAAGAA 2621
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2595 GCTTTTGAAAATGGATTTACAGGTCCAGAAGATGTGAATGATCTTGAAAGGGATGAAGAC 2654
Query 2622 TTTGAAATTGATATTGATGAGGATCCTGAGGTTGATGATTTAGCTACTCTGGCAAGTGCA 2681
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2655 TTCGAAATTGATATTGATGAGGATCCCGAGGTTGATGATTTAGCTACACTGGCAAGTGCA 2714
Query 2682 TCAAAAAGTGCCGTTCTAGGTGAAGCGAATGTTTTGTCAGGAAAGGGGGGAAATACTATG 2741
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||
Sbjct 2715 TCAAAAAGTGCCGTTCTTGGAGAAGCGAATGTTTTGTCAGGAAAGGGGGTAGATACAATG 2774
Query 2742 TTCTGTGATGTTAAAGCTGATGTAAAGAGTGAGCCTGAGAAGGAGTTTCCATCTCCTCCT 2801
||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2775 TTCTGTGATGTTAAAGCAGATGTAAAGAGTGAGCTTGAGAAGGAGTTTTCATCTCCTCCT 2834
Query 2802 CCAAGCAGTATGAAGAGCATTGTTCCACAACATAGTGAGCGGTTTAAAGATACAGTGGTT 2861
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 2835 CCAAGCACTATGAAGAGCATTGTTCCACAACATAGTGAGCGGCATAAAAATACAGTGGTT 2894
Query 2862 GGCTGCGTGGATACCGTGGTTGATGAAAGCAACCAGGGCCAATCATGGATTCAAGGTCTT 2921
||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2895 GGCGGCGTGGATGCCGTAATTGATGAAAGCAACCAGGGCCAATCATGGATTCAAGGTCTT 2954
Query 2922 ACGGAAGGGGATTACTGTCATCTAAGTGTTGAAGAGCGCCTTAATGCCCTTGTTGCTTTA 2981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2955 ACGGAAGGGGATTACTGTCATCTAAGTGTTGAAGAGCGCCTTAATGCCCTTGTTGCTTTA 3014
Query 2982 GTCGGCATTGCCAATGAAGGAAACTCCATCAGAGCTGGTCTTGAGGATCGTATGGAAGCA 3041
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3015 GTCGGCATTGCCAATGAAGGAAACTCCATCAGAACAGGTCTTGAGGATCGTATGGAAGCA 3074
Query 3042 GCAAATTCTCTTAAAAAGCAAATGTGGGCTGAAGCACAGTTAGATAACAGCTGTATGAGA 3101
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3075 GCAAATGCTCTTAAAAAGCAAATGTGGGCTGAAGCACAGTTAGATAACAGCTGTATGAGA 3134
Query 3102 GATGTACTTAAGCTTGATTTTCAAAACCTAGCAAGCAGCAAAACCGAATCAACGATGGGT 3161
|||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 3135 GATGTACTTAAGCTTGATCTTCAAAACTTAGCAAGCAGCAAAACTGAATCAACGATAGGC 3194
Query 3162 CTACCAATCATCCAAAGCTCTACTCGTGAGAGGGATAGTTTCGATAGAGACCCTTCTCAA 3221
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3195 CTACCAATCATTCAAAGCTCTACTCGTGAGAGGGATAGTTTTGATAGAGACCCTTCTCAA 3254
Query 3222 CTTCTAGATGAAACAAAGCCCCTGGATGATCTTTCGAACAATCTTCATAAATCATCTGCT 3281
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3255 CTTCTAGATGAAACAAAGCCCCTGGAAGATCTTTCGAACGATCTTCATAAATCATCTGCT 3314
Query 3282 GAGAGAGCACTTATTAATCAGGATGCCAATATAAGTCAAGAAAATTGTTCTTCCCAACTT 3341
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 3315 GAGAGAGCACTTATTAATCAGGATGCCAATATAAGTCAAGAAAATT---------A--T- 3362
Query 3342 GGATATGCTTCAAAGAGATCACGCTCACAATTAAAATCATATATAGGCCACAAAGCAGAA 3401
| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3363 G------CTTCAAAGAGATCACGCTCCCAATTAAAGTCATATATAGGCCACAAAGCAGAA 3416
Query 3402 GAGGTGTATCCATACCGATCTTTGCCGCTTGGACAAGATCGGCGCCACAATCGTTACTGG 3461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3417 GAGGTGTATCCATACCGATCTTTGCCGCTTGGACAAGATCGGCGCCACAATCGTTACTGG 3476
Query 3462 CATTTTGCTGTATCAGTGTCTAAGAGTGATCCTTGCTCGGGGCTCTTATTTGTTGAGCTA 3521
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3477 CATTTTGCTGTATCAGTGTCTAAGAGTGATCCTTGTTCGAGGCTCTTATTTGTTGAGCTA 3536
Query 3522 CATGATGGCAAGTGGCTCCTCATTGATTCAGAAGAGGCTTTTGATATTCTGGTTGCATCA 3581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3537 CATGATGGCAAGTGGCTCCTCATTGATTCAGAAGAGGCTTTTGATATTCTGGTTGCATCA 3596
Query 3582 TTGGATATGCGCGGGATCAGAGAGTCTCATTTACGCATAATGCTGCAGAAGATCGAGGGA 3641
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3597 TTGGATATGCGTGGGATCAGAGAGTCTCATTTACGCATAATGCTGCAGAAGATCGAGGGA 3656
Query 3642 TCATTCAAAGAGAATGCTTGTAAAAATATAAAGCTAGATAGAAACCCTTTCTTGAAGGAA 3701
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3657 TCATTCAAAGAGAATGCTTGTAAAGATATAAAGCTAGCTAGAAACCCTTTCTTGACGGAA 3716
Query 3702 AAGAGTATTGTGAATCATTCTCCTACAGATTCTGTGAGCCC---GTCCAGTGCTATATCA 3758
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3717 AAGAGTGTTGTGAATCATTCTCCTACAGATTCTGTGAGCCCATCGTCCAGTGCTATATCA 3776
Query 3759 GGGTCAAACTCTGATTCAATGGAAACTTCAACTTCAATTAGAGTTGAGTTAGGTAGAAAC 3818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3777 GGGTCAAACTCTGATTCAATGGAAACTTCAACTTCAATTAGAGTTGATTTAGGTAGAAAT 3836
Query 3819 GACACCGAGAACAAGAATTTATCAAAACGATTCCATGATTTCCAGAGATGGATGTGGACC 3878
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3837 GACACCGAGAACAAGAATTTATCAAAACGGTTCCATGATTTCCAGAGATGGATGTGGACC 3896
Query 3879 GAGACGTACAGTTCACTACCTTCTTGTGCTAGAAAATATGGGAAGAAGAGATCTGAACTG 3938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3897 GAGACGTACAGTTCACTACCTTCTTGTGCTAGAAAATATGGGAAGAAGAGATCTGAACTG 3956
Query 3939 TTAGCAACATGTGATGCGTGTGTTGCTTCTTATTTGTCTGAGTATACCCACTGCACTTCT 3998
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 3957 TTAGCAACATGTGACGCGTGTGTTGCTTCCTATTTGTCTGAGTATACCTTCTGCTCTTCT 4016
Query 3999 TGTCACCAGAGACTGGACGTGGTTGATAGTTCAGAGATATTAGATTCAGGTTTGACTGTG 4058
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4017 TGTCACCAGAGATTGGACGTGGTTGATAGTTCAGAGATATTAGATTCAGGTTTGGCTGTG 4076
Query 4059 TCTCCTCTTCCTTTTGGAGTCAGGTTGCTCAAACCACTACTTGTTTTTCTCGAGGCATCT 4118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4077 TCTCCTCTTCCTTTTGGAGTCAGGTTGCTCAAACCACTACTTGTTTTTCTCGAGGCATCT 4136
Query 4119 GTTCCAGATGAAGCTCTTGAATCATTTTGGACGGAGGACAAAAGAAAAATTTGGGGGTTT 4178
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 4137 GTTCCAGATGAAGCTCTTGAATCATTTTGGACAGAGGACCAAAGAAAAAAATGGGGGTTT 4196
Query 4179 AGGTTGAATGCTTCATCATCACCTGAAGACCTTTTGCAGGTGTTGACTTCCTTAGAGAGT 4238
||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4197 AGGTTGAATACTTCATCATCACCTGGAGAACTTTTGCAGGTGTTGACTTCCTTAGAGAGT 4256
Query 4239 GCAATCAAGAAAGAATCTTTGTCATCCAATTTTATGTCGGCAAAGGAGCTTTTGGGAGCT 4298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4257 GCAATCAAGAAAGAATCTTTGTCATCCAATTTTATGTCGGCAAAGGAGCTTTTGGGAGCT 4316
Query 4299 GCTAATGCTGATGCTGATAATCTGGGATCAGTGGACGTTCTTCCATGGATACCAAAGACA 4358
||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4317 GCTAACGCTGAGGCTGATGATCAGGGATCAGTGGACGTTCTTCCATGGATACCAAAGACA 4376
Query 4359 GTATCAGCGGTTGCTTTGAGACTTTCAGAACTTGATGCATCCATTATTTATGTGAAGCCA 4418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4377 GTATCAGCGGTTGCTTTGAGACTTTCAGAACTTGATGCATCCATTATTTATGTGAAGCCA 4436
Query 4419 GAGAAACCTGAGCTGATCCCTGAAGATGAGAACGAGCAGATTAGCCTTTTCCCTGGAGAT 4478
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4437 GAGAAACCTGAGGTCATCCCTGAAGATGAGAACGAGCAGATTAGCCTTTTCCCTAGAGAT 4496
Query 4479 TCCCCTTTCAAAGGCAAAGGACCCAGAGAGCAAGAAGATCAACATGAGGTTGTTCCAAAC 4538
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||
Sbjct 4497 TCACCTTTCAAAGGCAAAGGACCCAGAGAGCAAGAAGATCAAGACGAGGTTGCTCCAAAC 4556
Query 4539 TCGGGTAACA-AACGTAATAAACGTGCACGAGTAAGCTTGGGATCTGGATCAAACAGAAA 4597
||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4557 CCGGGTAACAGAAA-TAAGAAACGTGCACGAGTAAGCTTGGGATCTGGATCAAACAGAAA 4615
Query 4598 GGTGAAGAGGAAGAAAGCGCAAAGCGGTCTTAACAAATTTGTCGTCGGTAGGAGAAATGT 4657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4616 GGTGAAGAGGAAGAAAGCGCAAAGCGGTCTTAACAAATTTGTCGTTGGTAGGAGAAATGT 4675
Query 4658 TGCAGTCAATAGTAACTTAATGACTGTTGAGTTGAACCACCAAGTCCCTGGAAAAGGAAA 4717
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4676 TGCAGTCAATAGTAACTTAATGGCCGTTGAGTTGAACCACCAAGTCCCTGGAAAAGGAAA 4735
Query 4718 GAGGACGGTTAGAAAAAGACCAGAGAGGATCGATGAGGATAATGACCACCTAGTCAATAG 4777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4736 GAGGACGGTTAGAAAAAGACCAGAGAGGATCGATGAGGATAATTCCCACCTAGTCAATAG 4795
Query 4778 AATGGCTAATATTGTTAGGCCTAAAAGCGAAGAAGTTGAAGAAGATGAGGAAGAAGAAGA 4837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4796 AATGGCTAATATTGTTAGGCCTAAAAGCGAAGAAGTTGAAGAAGATGAGGAAGAAGAAGA 4855
Query 4838 GCCAACATTCAGAGACATTGATGAAGACTGGGCAGCAGGTGAAACTCCTAGAGAGATGGA 4897
|| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4856 GCAAACATTCAGAGACATTAATGAAGACTGGGCAGCAGGTGAAACTCCTAGAGAGATGGA 4915
Query 4898 CGAGGACTGGGCCAATGAAACACCAAACAGAATGATGACGCCGATGCAAGTGGATGATGA 4957
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4916 GGAGGACTGGGCCAATGAAACACCAAACAGAATGATGACGCCGATGCAAGTGGATGATGA 4975
Query 4958 AAGTGACAACAGTGTAGGAGTTGAATCAGAGGATGATGATGGTGGTGGTCAGTTTGTGGA 5017
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4976 AAGTGACAACAGTGTAGGAGTTGAATCAGAGGATGAAGATGGTGGTGGTCAGTTTGTGGA 5035
Query 5018 TTACAGTCAGAGAAACAAGTGGGGGTTAGATTGGAATAGTAACCCAAACGAGGCAAT-G- 5075
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |
Sbjct 5036 TTATAGTCAGAGAAACAAGTGGGGGTTAGATTGGAATAGTAACCTAAATGTGGCAATAGA 5095
Query 5076 G-A-G--GA--A-GAAG---TTGTTGGTGTTGGGAGGGTCGAAGGAGAAGATGACGCCGA 5125
| | | || | |||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5096 GGAAGACGAGGAAGAAGAAGTTGTGGGGGTTGGGCGGGTCGAAGGAGAAGATGACGCAGA 5155
Query 5126 GATGAGTGAGAGCTCTGAAGATGATGATG--C-T---AATAATGCAGCAAACAATTACGA 5179
|||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5156 AATGAGTGAGAGCTCTGAAGATGATGATGTACCTGCTAATAATGCAGCAAACAATTACGA 5215
Query 5180 CAGAGAATCAGAAGGTTACAGCAGCAGCGATTCATGAACTTAAGATCTAGTAGCTTGTGA 5239
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 5216 CAGAGAATCAGAAGGTTACAGCAGCAGCGATTCATGAAGTTGAGATCTAGTAGCTTGTGA 5275
Query 5240 AGAGGGAAGATTACATTCTTGTTGAAGatatatatatatatatttttatataGGAGAAAA 5299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||
Sbjct 5276 AGAGGGAAGATTACATTCTTGTTGAAGATATATATATATAT-TTTT-ATGTAGGAGAAAA 5333
Query 5300 GAGAGATAGTATCAGAATAGGTTTTCACCTATAGAAGAAGAACATTTCTGATTAGTTTTG 5359
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5334 GAGAGATAGTAGCAGAATAGGTTTTCACCTATAGAAGAAGAACATTTCTGATTAGTTTTG 5393
Query 5360 GTGCAGTTA--AAAGCCAAGCCAAGGCATGTATTTAG 5394
|||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5394 GTGCAGTTGTTAAAGCCAAGCCAAGGCATATATTTAG 5430
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 269245983081
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5