BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg473061

Length=5394
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT1G28420.1 | Symbols: HB-1 | homeobox-1 | chr1:9979802-9987638...  8401    0.0  


> AT1G28420.1 | Symbols: HB-1 | homeobox-1 | chr1:9979802-9987638 
FORWARD LENGTH=5430
Length=5430

 Score = 8401 bits (4549),  Expect = 0.0
 Identities = 5154/5437 (95%), Gaps = 77/5437 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     TTTGGGATCAGGGTTTGTTTG-T---T-GAAAGCCCTAgtttttgtttttgtgttctttg  55
             ||| ||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  28    TTTTGGATCAGGGTTTGTTTGTTCAATAGAAAGCCCTAGTTTTTGTTTTTGTGTTCTTTG  87

Query  56    a---ttcttgcggccgtttctgggtttcttcttcttcttctc-ttcCATGGAGATGGGTT  111
             |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  88    ATTCTTCTTGCGGCCGTTTCTGGGTTTCTTCTTCTTCTTCTCTTTCCATGGAGATGGGTT  147

Query  112   CTGATGGAGATGAAGATC---AGATCAGGAGCGTTGGTGATGTTGGTGGTAATCATCTTA  168
             ||||  | | ||||||||   |||||||||||| | ||  || || || ||||| |  ||
Sbjct  148   CTGA-CG-G-TGAAGATCAGAAGATCAGGAGCG-TCGT--TGGTGATGCTAATCTTAATA  201

Query  169   ATAAGAAGAAGAAGATTG---ATAATTCCTCCTCCAAGGATGGTGGTCGTGTTAAGCCTA  225
             ||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||||
Sbjct  202   ATAAGAAGAAGAAGATTGATAATAATTCCTCCTCTAAGGA---TGGTCGTGTCAAGCCTA  258

Query  226   AGCGTCAGATGAAAACTCCGTTTCAGCTTGAAACCTTGGAGAAAGTTTATTCAGAGGAGA  285
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  259   AACGTCAGATGAAAACTCCGTTTCAGCTTGAAACCTTGGAGAAAGTTTATTCAGAGGAGA  318

Query  286   CGTATCCTTCGGAGGCCACGAGGGCTGACTTGTCTGAGAAATTGGATTTGTCAGATCGAC  345
              |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  319   AGTATCCGTCGGAGGCGACGAGGGCTGAGTTATCTGAGAAATTGGATTTGTCAGATCGAC  378

Query  346   AATTACAGATGTGGTTTTGCCATAGACGCTTAAAGGACAAGAAGGATGGTCAGTCCAAGA  405
             ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct  379   AATTACAGATGTGGTTTTGTCATAGACGGTTAAAGGACAAGAAGGATGGTCAGTCTAATA  438

Query  406   AACCCGCGAAATCAGCGGTTCAATCGTCTGCTT-TAGCGTCTTCCGTTCACGAGTTACC-  463
             |||| | ||||||| |||||   | | | | ||  | || |||| ||| |||||||||| 
Sbjct  439   AACCGGTGAAATCATCGGTT-GCT-G-C-GGTTCAATCGGCTTCGGTTAACGAGTTACCG  494

Query  464   GC--CTGCTGGATCGGTACCTGAGCAAGATTCCAGATCTGATTCGGGCTCTGAGTCAGGT  521
             ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct  495   GCTGCTGCTGGATCGGTACCTGAGCAAGATTCCAGATCTGATTCGGGTTCTGAGTCTGGT  554

Query  522   TGCAGTCCTTATTCCAACTCAAGGAGGAATTTTGCTAGTGGTAGTAGTAGTTCTCGAGCT  581
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  555   TGCAGTCCTTATTCCAACTCTAGGAGGAATTTTGCTAGTGGTAGTAGTAGTTCTCGAGCT  614

Query  582   GAATTGGATGAATACGAGACAATGGGAAAGGCGAGTTATGAGTCACGGTTGTCGACAATG  641
             |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  615   GAATTGGATGAATATGAGACAATGGGAAAGCCGAGTTATGAGTCGCGGTTGTCGACAATG  674

Query  642   GTGCGTAGAGCTATTGTCTGCATTGAGGCACAGTTAGGTGAGCCATTGAGAGATGATGGA  701
             |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  675   GTGCATAGAGCTATTGTCTGTATTGAGGCTCAGTTAGGTGAGCCATTGAGAGATGATGGA  734

Query  702   CCTATTCTTGGTATGGAGTTTGATCCTTTGCCTCCTGGTGCATTCGGAACACCTATAGCG  761
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct  735   CCTATTCTTGGCATGGAGTTTGATCCTTTGCCTCCTGGTGCGTTTGGAACACCTATAGCG  794

Query  762   ATGCAGAAACACCTAGTTCATCCGTATGAGAGCAATGTGTATGAGCGATATGATGCCCGA  821
             ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||
Sbjct  795   ATGCAGAAACACCTACTTCATCCCTATGAGAGCGATCTGTATGAGCGACATGATCCCCGA  854

Query  822   CCTCGAAGATCTCATGCTGCTGCCCGTTCTTTCCATGAGCAACAATCTCTGGATGATTCG  881
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  855   CCTCGAAGATCTCATGCTGCTGCCCGTTCTTTCCATGAGCAACAATCTCTGGATGATCCG  914

Query  882   TCTTCTTTTACACCTGAGATGTATGGACGATACTCTGAAAATCATGCACGTGGTATGGAC  941
             ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  915   TCTTCTTTTACACCTAATATGTATGAACGATACTCTGAAAATCATGCACGTGGTATGGAC  974

Query  942   TATGAAATTGCACGTTCTAGGAGTTCATCATTTATGCACGCGAATGGGCCTTTACCAAGG  1001
             |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct  975   TATGAAGTTGCACGTTCTAGAATTTCATCATTTATGCACGCGAATGGACCTGTACCAAGG  1034

Query  1002  TCCTATGTTACCCCTGGACATGTGTCTCGTAACTGTTCTACATCTCAACAAGACATGCCA  1061
             |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  1035  TCCTATGTTACCCCTGGACATGCGTCTCGTAACTGTTCGACATCTCAACAAGACATGCCA  1094

Query  1062  ATCCCCATTGAATCAGCTCATCGTGGTGATAGATTCCTGCTGGAAAAGGATTCATCAGTC  1121
             | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct  1095  AGCCCCATTGAATCAGCGCATCATGGTGATAGATTCCTGCTGGAGAAGGACTCATCAGTC  1154

Query  1122  CTCGGTACAGAAGATCCATATTTGTTGCCTGATGGGGTGCGTAAGAGTAATGATGTGCAT  1181
             || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  1155  CTTGGTACAGAAGATCCATATTTGTTACCTGATGGAGTGCGTAAGAGTAGTGATGTGCAT  1214

Query  1182  CGGAAGGGAAAGATTAACGATGATAGACTTGGAAGAGGAAGTGAAATCCGAGAGAATCAT  1241
              | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct  1215  AGAAAGGGAAAGATTAACGATGGTAGACTTGGAAGAGGGAGTGAAACCCGAGAGAATCAT  1274

Query  1242  GGACCAAAAGATCTTGAGAAGCTAGAAATTCAGAGGaaaaaaaaTGAAGAACGCATGAGA  1301
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1275  GGACCAAAAGATCTTGAGAAGCTAGAAATTCAGAGGAAAAAGAATGAAGAACGCATGAGA  1334

Query  1302  AAAGAAATGGAAAAGAACGAACGTGAGAGGCGTAAGGAAGAAGAGAGGTTGATGCGTGAA  1361
             ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1335  AAAGAGATGGAAAGGAACGAGCGTGAGAGGCGTAAGGAAGAAGAGAGGTTGATGCGTGAA  1394

Query  1362  AGAATAAAAGAAGAGGAGAGGTTACAGCGTGAGCAGCGTCGTgaaatagaaagaagagaa  1421
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1395  AGAATAAAAGAAGAGGAAAGGTTACAGCGTGAGCAGCGTCGTGAAGTAGAAAGAAGAGAA  1454

Query  1422  aagttcttacagagagaaaatgaaagggcggagaaaaagaagcaaaaagacgagattcgc  1481
             || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  1455  AAATTCTTACAGAGAGAAAATGAAAGGGCTGAGAAAAAGAAGCAAAAAGACGAGATTCGT  1514

Query  1482  cgagagaaagaCGCTATTAGACGCAAGCTTGCCATTGAGAAGGCAACTGCACGTAGAATT  1541
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1515  CGAGAGAAAGACGCTATTAGACGCAAGCTTGCCATTGAGAAGGCAACTGCACGTAGAATT  1574

Query  1542  GCCAAGGAGTCTATGGATCTTATTGAAGATGAGCAGCTAGAACTGATGGAATTGGCTGCT  1601
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1575  GCCAAGGAGTCTATGGATCTTATTGAAGATGAGCAGCTAGAACTAATGGAATTGGCTGCT  1634

Query  1602  ATTAGCAAAGGATTGCCCTCAGTATTACAGCTTGATCACGACACATTGCAAAATCTTGAA  1661
             |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| 
Sbjct  1635  ATTAGCAAAGGATTACCCTCAGTATTACAGCTTGATCACGACACATTGCAGAATCTTGAG  1694

Query  1662  GTGTATAGAGATTCTCTGAGCACATTTCCACCAAAGTCTTTGCAACTAAAAATGCCGTTT  1721
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1695  GTGTATAGAGATTCTCTGAGCACATTTCCACCAAAGTCTTTGCAACTAAAAATGCCGTTT  1754

Query  1722  GCCATTTCTCCATGGAAAGATTCTGATGAAACTGTTGGAAACCTTCTAATGGTTTGGAGA  1781
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1755  GCCATTTCTCCATGGAAAGATTCTGATGAAACTGTTGGAAACCTTCTAATGGTTTGGAGA  1814

Query  1782  TTCCTGATATCATTTTCTGATGTTCTTGACCTATGGCCTTTTACACTGGATGAGTTTATT  1841
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1815  TTCCTGATATCATTTTCTGATGTTCTTGACCTATGGCCTTTTACACTGGATGAGTTTATT  1874

Query  1842  CAGGCTTTTCATGACTATGACTCAAGGTTGTTGGGGGAGATACATGTTACTCTTCTGAGA  1901
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1875  CAGGCTTTTCATGACTATGACTCAAGGTTGCTGGGGGAGATACATGTTACTCTTCTGAGA  1934

Query  1902  TCAATAATACGAGATATCGAAGATGTTGCTAGGACACCCTTTAGTGGAATTGGAAATAAC  1961
             ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1935  TCAATAATACGAGATGTCGAAGATGTTGCTAGAACACCCTTTAGTGGAATTGGAAATAAC  1994

Query  1962  CAATATACTACAGCCAATCCTGAGGGTGGACATCCGCAAATAGTTGAAGGGGCTTATGCA  2021
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1995  CAATATACTACAGCCAATCCTGAGGGTGGACATCCGCAAATAGTTGAAGGGGCTTATGCA  2054

Query  2022  TGGGGCTTTGACATTCGTAGCTGGAAAAAGCATTTGAACCCACTAACATGGCCTGAAATA  2081
             ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2055  TGGGGTTTTGACATTCGTAGTTGGAAAAAGCATTTGAACCCACTAACATGGCCTGAAATA  2114

Query  2082  CTGCGACAATTGGCACTCTCTGCTGGATTTGGGCCTAGGCTGAAGAAAAAACATTCCCGA  2141
             ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  2115  CTGCGACAATTAGCGCTCTCTGCTGGATTTGGACCTAAGCTGAAGAAAAAACATTCCCGA  2174

Query  2142  TTGACCAATACTGGTGATAAGGATGAGGCTAAAGGTTGTGAAGATATCATTTCTACTATC  2201
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  2175  TTGACCAATACTGGTGATAAGGATGAGGCTAAAGGTTGTGAAGATGTCATTTCTACTATC  2234

Query  2202  CGAAATGGTTCAGCAGCTGAAAGTGCTTTTGCATCGATGCGGGAGAAAGGGTTACTCGCT  2261
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  2235  CGAAATGGTACAGCAGCTGAAAGTGCTTTTGCATCGATGCGGGAGAAAGGGTTGCTCGCT  2294

Query  2262  CCTCGCAAGTCAAGGCACCGGTTGACACCTGGAACCGTCAAATTCGCAGCCTTTCATGTA  2321
             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| 
Sbjct  2295  CCTCGCAAGTCGAGGCACCGGTTGACACCTGGAACCGTCAAATTTGCAGCCTTTCATGTT  2354

Query  2322  CTATCTCTTGAGGGAAGCAAGGGACTGACAGTATTAGAACTTGCTGACAAGATTCAGAAA  2381
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2355  CTATCTCTTGAAGGAAGCAAGGGACTGACAGTATTAGAACTTGCTGACAAGATTCAGAAA  2414

Query  2382  TCTGGACTTCGGGACTTGACAACAAGCAAGACACCAGAGGCTTCTATTTCTGTTGCATTG  2441
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2415  TCTGGACTTCGGGACTTGACCACAAGCAAGACACCAGAGGCTTCTATTTCTGTTGCATTG  2474

Query  2442  ACAAGAGATGTGAAACTCTTCGAAAGAATAGCTCCTTCGACTTATTGTGTACGAGCTCCT  2501
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2475  ACAAGAGATGTGAAACTCTTTGAAAGAATAGCTCCTTCGACTTATTGTGTACGAGCTCCT  2534

Query  2502  TATGTGAAGGATCCTGCGGATGGAGAGGCAATACTCGCAGATGCCAGGAAGAAGATAAGG  2561
             |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  2535  TATGTGAAGGATCCTAAGGATGGAGAGGCAATACTCGCAGATGCCAGGAAGAAGATACGG  2594

Query  2562  GCATTTGAAAATGGATTTACAGGTCCAGAAGATGTGAATGATCTTGAAAGGGATGAAGAA  2621
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  2595  GCTTTTGAAAATGGATTTACAGGTCCAGAAGATGTGAATGATCTTGAAAGGGATGAAGAC  2654

Query  2622  TTTGAAATTGATATTGATGAGGATCCTGAGGTTGATGATTTAGCTACTCTGGCAAGTGCA  2681
             || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  2655  TTCGAAATTGATATTGATGAGGATCCCGAGGTTGATGATTTAGCTACACTGGCAAGTGCA  2714

Query  2682  TCAAAAAGTGCCGTTCTAGGTGAAGCGAATGTTTTGTCAGGAAAGGGGGGAAATACTATG  2741
             ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||
Sbjct  2715  TCAAAAAGTGCCGTTCTTGGAGAAGCGAATGTTTTGTCAGGAAAGGGGGTAGATACAATG  2774

Query  2742  TTCTGTGATGTTAAAGCTGATGTAAAGAGTGAGCCTGAGAAGGAGTTTCCATCTCCTCCT  2801
             ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  2775  TTCTGTGATGTTAAAGCAGATGTAAAGAGTGAGCTTGAGAAGGAGTTTTCATCTCCTCCT  2834

Query  2802  CCAAGCAGTATGAAGAGCATTGTTCCACAACATAGTGAGCGGTTTAAAGATACAGTGGTT  2861
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||
Sbjct  2835  CCAAGCACTATGAAGAGCATTGTTCCACAACATAGTGAGCGGCATAAAAATACAGTGGTT  2894

Query  2862  GGCTGCGTGGATACCGTGGTTGATGAAAGCAACCAGGGCCAATCATGGATTCAAGGTCTT  2921
             ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2895  GGCGGCGTGGATGCCGTAATTGATGAAAGCAACCAGGGCCAATCATGGATTCAAGGTCTT  2954

Query  2922  ACGGAAGGGGATTACTGTCATCTAAGTGTTGAAGAGCGCCTTAATGCCCTTGTTGCTTTA  2981
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2955  ACGGAAGGGGATTACTGTCATCTAAGTGTTGAAGAGCGCCTTAATGCCCTTGTTGCTTTA  3014

Query  2982  GTCGGCATTGCCAATGAAGGAAACTCCATCAGAGCTGGTCTTGAGGATCGTATGGAAGCA  3041
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3015  GTCGGCATTGCCAATGAAGGAAACTCCATCAGAACAGGTCTTGAGGATCGTATGGAAGCA  3074

Query  3042  GCAAATTCTCTTAAAAAGCAAATGTGGGCTGAAGCACAGTTAGATAACAGCTGTATGAGA  3101
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3075  GCAAATGCTCTTAAAAAGCAAATGTGGGCTGAAGCACAGTTAGATAACAGCTGTATGAGA  3134

Query  3102  GATGTACTTAAGCTTGATTTTCAAAACCTAGCAAGCAGCAAAACCGAATCAACGATGGGT  3161
             |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || 
Sbjct  3135  GATGTACTTAAGCTTGATCTTCAAAACTTAGCAAGCAGCAAAACTGAATCAACGATAGGC  3194

Query  3162  CTACCAATCATCCAAAGCTCTACTCGTGAGAGGGATAGTTTCGATAGAGACCCTTCTCAA  3221
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  3195  CTACCAATCATTCAAAGCTCTACTCGTGAGAGGGATAGTTTTGATAGAGACCCTTCTCAA  3254

Query  3222  CTTCTAGATGAAACAAAGCCCCTGGATGATCTTTCGAACAATCTTCATAAATCATCTGCT  3281
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3255  CTTCTAGATGAAACAAAGCCCCTGGAAGATCTTTCGAACGATCTTCATAAATCATCTGCT  3314

Query  3282  GAGAGAGCACTTATTAATCAGGATGCCAATATAAGTCAAGAAAATTGTTCTTCCCAACTT  3341
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |  | 
Sbjct  3315  GAGAGAGCACTTATTAATCAGGATGCCAATATAAGTCAAGAAAATT---------A--T-  3362

Query  3342  GGATATGCTTCAAAGAGATCACGCTCACAATTAAAATCATATATAGGCCACAAAGCAGAA  3401
             |      ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3363  G------CTTCAAAGAGATCACGCTCCCAATTAAAGTCATATATAGGCCACAAAGCAGAA  3416

Query  3402  GAGGTGTATCCATACCGATCTTTGCCGCTTGGACAAGATCGGCGCCACAATCGTTACTGG  3461
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3417  GAGGTGTATCCATACCGATCTTTGCCGCTTGGACAAGATCGGCGCCACAATCGTTACTGG  3476

Query  3462  CATTTTGCTGTATCAGTGTCTAAGAGTGATCCTTGCTCGGGGCTCTTATTTGTTGAGCTA  3521
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3477  CATTTTGCTGTATCAGTGTCTAAGAGTGATCCTTGTTCGAGGCTCTTATTTGTTGAGCTA  3536

Query  3522  CATGATGGCAAGTGGCTCCTCATTGATTCAGAAGAGGCTTTTGATATTCTGGTTGCATCA  3581
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3537  CATGATGGCAAGTGGCTCCTCATTGATTCAGAAGAGGCTTTTGATATTCTGGTTGCATCA  3596

Query  3582  TTGGATATGCGCGGGATCAGAGAGTCTCATTTACGCATAATGCTGCAGAAGATCGAGGGA  3641
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3597  TTGGATATGCGTGGGATCAGAGAGTCTCATTTACGCATAATGCTGCAGAAGATCGAGGGA  3656

Query  3642  TCATTCAAAGAGAATGCTTGTAAAAATATAAAGCTAGATAGAAACCCTTTCTTGAAGGAA  3701
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct  3657  TCATTCAAAGAGAATGCTTGTAAAGATATAAAGCTAGCTAGAAACCCTTTCTTGACGGAA  3716

Query  3702  AAGAGTATTGTGAATCATTCTCCTACAGATTCTGTGAGCCC---GTCCAGTGCTATATCA  3758
             |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
Sbjct  3717  AAGAGTGTTGTGAATCATTCTCCTACAGATTCTGTGAGCCCATCGTCCAGTGCTATATCA  3776

Query  3759  GGGTCAAACTCTGATTCAATGGAAACTTCAACTTCAATTAGAGTTGAGTTAGGTAGAAAC  3818
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| 
Sbjct  3777  GGGTCAAACTCTGATTCAATGGAAACTTCAACTTCAATTAGAGTTGATTTAGGTAGAAAT  3836

Query  3819  GACACCGAGAACAAGAATTTATCAAAACGATTCCATGATTTCCAGAGATGGATGTGGACC  3878
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3837  GACACCGAGAACAAGAATTTATCAAAACGGTTCCATGATTTCCAGAGATGGATGTGGACC  3896

Query  3879  GAGACGTACAGTTCACTACCTTCTTGTGCTAGAAAATATGGGAAGAAGAGATCTGAACTG  3938
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3897  GAGACGTACAGTTCACTACCTTCTTGTGCTAGAAAATATGGGAAGAAGAGATCTGAACTG  3956

Query  3939  TTAGCAACATGTGATGCGTGTGTTGCTTCTTATTTGTCTGAGTATACCCACTGCACTTCT  3998
             |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||
Sbjct  3957  TTAGCAACATGTGACGCGTGTGTTGCTTCCTATTTGTCTGAGTATACCTTCTGCTCTTCT  4016

Query  3999  TGTCACCAGAGACTGGACGTGGTTGATAGTTCAGAGATATTAGATTCAGGTTTGACTGTG  4058
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  4017  TGTCACCAGAGATTGGACGTGGTTGATAGTTCAGAGATATTAGATTCAGGTTTGGCTGTG  4076

Query  4059  TCTCCTCTTCCTTTTGGAGTCAGGTTGCTCAAACCACTACTTGTTTTTCTCGAGGCATCT  4118
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4077  TCTCCTCTTCCTTTTGGAGTCAGGTTGCTCAAACCACTACTTGTTTTTCTCGAGGCATCT  4136

Query  4119  GTTCCAGATGAAGCTCTTGAATCATTTTGGACGGAGGACAAAAGAAAAATTTGGGGGTTT  4178
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||
Sbjct  4137  GTTCCAGATGAAGCTCTTGAATCATTTTGGACAGAGGACCAAAGAAAAAAATGGGGGTTT  4196

Query  4179  AGGTTGAATGCTTCATCATCACCTGAAGACCTTTTGCAGGTGTTGACTTCCTTAGAGAGT  4238
             ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4197  AGGTTGAATACTTCATCATCACCTGGAGAACTTTTGCAGGTGTTGACTTCCTTAGAGAGT  4256

Query  4239  GCAATCAAGAAAGAATCTTTGTCATCCAATTTTATGTCGGCAAAGGAGCTTTTGGGAGCT  4298
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4257  GCAATCAAGAAAGAATCTTTGTCATCCAATTTTATGTCGGCAAAGGAGCTTTTGGGAGCT  4316

Query  4299  GCTAATGCTGATGCTGATAATCTGGGATCAGTGGACGTTCTTCCATGGATACCAAAGACA  4358
             ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4317  GCTAACGCTGAGGCTGATGATCAGGGATCAGTGGACGTTCTTCCATGGATACCAAAGACA  4376

Query  4359  GTATCAGCGGTTGCTTTGAGACTTTCAGAACTTGATGCATCCATTATTTATGTGAAGCCA  4418
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4377  GTATCAGCGGTTGCTTTGAGACTTTCAGAACTTGATGCATCCATTATTTATGTGAAGCCA  4436

Query  4419  GAGAAACCTGAGCTGATCCCTGAAGATGAGAACGAGCAGATTAGCCTTTTCCCTGGAGAT  4478
             |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  4437  GAGAAACCTGAGGTCATCCCTGAAGATGAGAACGAGCAGATTAGCCTTTTCCCTAGAGAT  4496

Query  4479  TCCCCTTTCAAAGGCAAAGGACCCAGAGAGCAAGAAGATCAACATGAGGTTGTTCCAAAC  4538
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||
Sbjct  4497  TCACCTTTCAAAGGCAAAGGACCCAGAGAGCAAGAAGATCAAGACGAGGTTGCTCCAAAC  4556

Query  4539  TCGGGTAACA-AACGTAATAAACGTGCACGAGTAAGCTTGGGATCTGGATCAAACAGAAA  4597
              ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4557  CCGGGTAACAGAAA-TAAGAAACGTGCACGAGTAAGCTTGGGATCTGGATCAAACAGAAA  4615

Query  4598  GGTGAAGAGGAAGAAAGCGCAAAGCGGTCTTAACAAATTTGTCGTCGGTAGGAGAAATGT  4657
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  4616  GGTGAAGAGGAAGAAAGCGCAAAGCGGTCTTAACAAATTTGTCGTTGGTAGGAGAAATGT  4675

Query  4658  TGCAGTCAATAGTAACTTAATGACTGTTGAGTTGAACCACCAAGTCCCTGGAAAAGGAAA  4717
             |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4676  TGCAGTCAATAGTAACTTAATGGCCGTTGAGTTGAACCACCAAGTCCCTGGAAAAGGAAA  4735

Query  4718  GAGGACGGTTAGAAAAAGACCAGAGAGGATCGATGAGGATAATGACCACCTAGTCAATAG  4777
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||
Sbjct  4736  GAGGACGGTTAGAAAAAGACCAGAGAGGATCGATGAGGATAATTCCCACCTAGTCAATAG  4795

Query  4778  AATGGCTAATATTGTTAGGCCTAAAAGCGAAGAAGTTGAAGAAGATGAGGAAGAAGAAGA  4837
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4796  AATGGCTAATATTGTTAGGCCTAAAAGCGAAGAAGTTGAAGAAGATGAGGAAGAAGAAGA  4855

Query  4838  GCCAACATTCAGAGACATTGATGAAGACTGGGCAGCAGGTGAAACTCCTAGAGAGATGGA  4897
             || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4856  GCAAACATTCAGAGACATTAATGAAGACTGGGCAGCAGGTGAAACTCCTAGAGAGATGGA  4915

Query  4898  CGAGGACTGGGCCAATGAAACACCAAACAGAATGATGACGCCGATGCAAGTGGATGATGA  4957
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4916  GGAGGACTGGGCCAATGAAACACCAAACAGAATGATGACGCCGATGCAAGTGGATGATGA  4975

Query  4958  AAGTGACAACAGTGTAGGAGTTGAATCAGAGGATGATGATGGTGGTGGTCAGTTTGTGGA  5017
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  4976  AAGTGACAACAGTGTAGGAGTTGAATCAGAGGATGAAGATGGTGGTGGTCAGTTTGTGGA  5035

Query  5018  TTACAGTCAGAGAAACAAGTGGGGGTTAGATTGGAATAGTAACCCAAACGAGGCAAT-G-  5075
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| | 
Sbjct  5036  TTATAGTCAGAGAAACAAGTGGGGGTTAGATTGGAATAGTAACCTAAATGTGGCAATAGA  5095

Query  5076  G-A-G--GA--A-GAAG---TTGTTGGTGTTGGGAGGGTCGAAGGAGAAGATGACGCCGA  5125
             | | |  ||  | ||||   |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  5096  GGAAGACGAGGAAGAAGAAGTTGTGGGGGTTGGGCGGGTCGAAGGAGAAGATGACGCAGA  5155

Query  5126  GATGAGTGAGAGCTCTGAAGATGATGATG--C-T---AATAATGCAGCAAACAATTACGA  5179
              ||||||||||||||||||||||||||||  | |   |||||||||||||||||||||||
Sbjct  5156  AATGAGTGAGAGCTCTGAAGATGATGATGTACCTGCTAATAATGCAGCAAACAATTACGA  5215

Query  5180  CAGAGAATCAGAAGGTTACAGCAGCAGCGATTCATGAACTTAAGATCTAGTAGCTTGTGA  5239
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct  5216  CAGAGAATCAGAAGGTTACAGCAGCAGCGATTCATGAAGTTGAGATCTAGTAGCTTGTGA  5275

Query  5240  AGAGGGAAGATTACATTCTTGTTGAAGatatatatatatatatttttatataGGAGAAAA  5299
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||
Sbjct  5276  AGAGGGAAGATTACATTCTTGTTGAAGATATATATATATAT-TTTT-ATGTAGGAGAAAA  5333

Query  5300  GAGAGATAGTATCAGAATAGGTTTTCACCTATAGAAGAAGAACATTTCTGATTAGTTTTG  5359
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5334  GAGAGATAGTAGCAGAATAGGTTTTCACCTATAGAAGAAGAACATTTCTGATTAGTTTTG  5393

Query  5360  GTGCAGTTA--AAAGCCAAGCCAAGGCATGTATTTAG  5394
             ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  5394  GTGCAGTTGTTAAAGCCAAGCCAAGGCATATATTTAG  5430



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 269245983081


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5