BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg473146
Length=2838
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G29350.1 | Symbols: | Kinase-related protein of unknown fun... 4252 0.0
AT1G29370.1 | Symbols: | Kinase-related protein of unknown fun... 4226 0.0
> AT1G29350.1 | Symbols: | Kinase-related protein of unknown function
(DUF1296) | chr1:10268469-10273788 REVERSE LENGTH=2963
Length=2963
Score = 4252 bits (2302), Expect = 0.0
Identities = 2691/2868 (94%), Gaps = 69/2868 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGAGATATATCTTCCCTTGTGCTTCCTTCTTCTTCGTCTTCTTCGTATTGTCGCGACTGA 60
||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || | || | | |||||||||||
Sbjct 33 AGAGATATATCTTCCCTTGAGCTTCCTTGGTGTTCTTCGTATT-G--TCGTCGCGACTGA 89
Query 61 GAGAA-GCCACAAAAGCTTCGTTTATTTCCTTCAGATCC-----A---AGAGATTGAGAG 111
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||
Sbjct 90 GAGAAGGCCACAAAAGCTTCGTTTATTTCCTTCAGATCCGATATAGTGAGAGAGAGAGAG 149
Query 112 AGAGAGGCAGCTTACGGCAGATTAATATGAGCAGCAAGGTCGGCGTTGTCGGCGGCGGAA 171
|||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | | | | || ||||
Sbjct 150 AGAGAGGCAGCTTACGGCGGATAAATATGAGCAGC-A-G-C-AAG--GT---CGGC---- 196
Query 172 GTGCCGGAGCAAGGAAGGCCAATAATGGAATTCAGGATATTCCGTCAGGGTCTAGAAAAA 231
| | |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 197 G-G-CGGAGC----AAGG---A-AA-GGAATTCAGGATATTCCGTCAGGGTCTAGAAAAA 245
Query 232 TAGTACAAAGCTTGAAGGAAATTGTAAACTCTCCCGAGGCTGAGATCTATGCTATGCTTA 291
||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 246 TAGTACAAAGCTTGACGGAAATTGTAAACTCTCCTGAGGCTGAGATCTATGCTATGCTTA 305
Query 292 AAGAGTGCAATATGGATCCTAACGAAACCGTTAATCGCCTCCTCTCTCAAGATCCGTTTC 351
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 306 AAGAGTGCAATATGGATCCTAACGAAACCGTTAGTCGCCTCCTCTCTCAAGATCCATTTC 365
Query 352 ATGAGGTaaagagcaagaaagaaaagaagaaagagaCTAGGGATATATCGGATTCCCGGC 411
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 366 ACGAGGTAAAGAGCAAGAAAGAAAAGAAGAAAGAGACTAGGGATATATCAGATTCTCGGC 425
Query 412 CGCGTGGTGCTAATAACACGTACAACCGTGGTGCTAGAGGTGGTTCTGATCGTTATGCCG 471
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 426 CGCGTGGTGCTAATAACACCTACAACCGTGGTGCTAGAGGTGGTTCTGCTCGTTACGCCG 485
Query 472 GACGAAGTGGATCTACCCATTTCAGCTCTACTGATTCTGGAAACTTCCAAGGAAAATCTG 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 486 GACGAAGTGGATCTACCCATTTCAGCTCTACTGATTCTGGAAACTTCCAGGGAAAATCTA 545
Query 532 CAAACAAGAAAGAAAGTGGAACGCAGGATTATTTGAGTTCTTGGTCTTCTGCTTCTGGAG 591
|||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 546 CAAATAAGAAAGAAAGTGGAACGCAGGGTTATACAAGTTCTTGGTCTTCTGCTTCTGGAG 605
Query 592 TGGCGAACACCTATCAAACACCACACAGTGAACCCGTTGCTACGGAAAATAAATTGCCTT 651
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||
Sbjct 606 TGGCGAACACCTATCAAACACCACACAGTGAACCCATTGCTATGGAAAACAAATTGCCTC 665
Query 652 CTGTTCCCTCGGGAGATGGAATATCATCATCACAGTCAGCTTCTGGACATCAAACTGCAT 711
||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 CTGTTACCTTGGGAGATGGAATATCATCATCAAAGTCAGCTTCTGGACATCAAACTGCAT 725
Query 712 GGTTTGGAGCTCCAGGCCAAAGGTCCATGGCTG-AGATTGTGAAGATGGGTATACCACAG 770
||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||
Sbjct 726 GGTTTGGAGCTCCAGGCCAGAGGTCTATGGCTGAAG-TTGTGAAGATGGGTAGACCACAG 784
Query 771 AACAAGACAACGAGGCAAAATGTCAATATGCGTCCTGAGATAAATCATGAGCACGAAGTT 830
||||||||||| | ||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 785 AACAAGACAACAAAGCAAAATGTCAATGTGGGTTCTGAGATAAATCATGAACACGAAGTT 844
Query 831 AGTGCAAATCAGCAGGTCCCTGTTAGAGATGAATGGCCGTCGATTGAGAAGCCACTGGCT 890
| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 845 AATGCAAATCAGCAGGCCCCTGTTAAAGATGAATGGCCGTCGATTGAGAAGCCGCTGGCT 904
Query 891 CCTAGTACATCTTCTGTATCAGTAGCACCAGCAGAATCAGAAGTATGCAATGGTCCAGCT 950
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 905 CCTAGTACATCTTCTTTATCAGTAGCACCAGCAGAATCAGAAGTACGCAATGGTCTAGCT 964
Query 951 GATTTCCAATCCGATAGAGGAGATCAATATCTGAAGGACCGGTTAGAAAATATACATATA 1010
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 965 GATTTCCAATCCGATAGAGGAGATCAATATCTGAAGGACCGGTTAGAAAATATTCATATA 1024
Query 1011 GCAGAAAATGGCCCGTCTGAAAGTCGTGGAGTCGATCATGTGCAAGCCGACTCTGTTCAA 1070
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025 GCAGAAAGTGGCCCGTCTGAAAGTCGTGGGGTCGATCATGTGCAAGCCGACTCTGTTCAA 1084
Query 1071 GAAGATGAATCTGGAGTTTCGTCTGAAATTGATGATAATCCATATCAGACACAGAGCCAT 1130
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1085 GAAGATGAATCTGTAGTTTCGTCAGAAATTGATGATAATCCATATCAGACACAGAGCCAT 1144
Query 1131 CCAGTAGAGCACCACAAAGATGAAGATGATGTTTCATCTGGTTCAGCCAGTTTTCAACAA 1190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1145 CCAGTAGAGCACCACAAAGATGAAGATGATGTTTCATCTGGTTCAGCCAGTTTTCAACAA 1204
Query 1191 CTAGATAGTCATGATCAAGAAGTCTCACATGAAGAGGATAGACCTGCTGTTGTAATTCCA 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1205 CTAGATAGTCATGATCAAGAAGTCTCACATGAAGAGGATAGACCTGCTGTTGTAATTCCA 1264
Query 1251 AACCATTTGCTAATTCACACAGAAGAATGCTCGCAATTAAGTTTTGGAAGCTTTGGAGGT 1310
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1265 AACCATTTGCTAATTCACACAGAAGAATGCGCGCAATTAAGTTTTGGAAGCTTTGGAGGT 1324
Query 1311 TTTGGATCAAGGCCTTTGAGCAACAATGTAGAAGAGACTTCTGATGTAGCTCCACAGATC 1370
||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1325 TTTGGATCAAGGCCTTTGAGCAACAGCGTAGAAGCGACTTCTGATGTAGCTCCACAAATC 1384
Query 1371 GAACATTCAGATGCAAGAAATACTGAGTTTTATGGAGATGAACATCTTGGAAGTACAACC 1430
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1385 GAACATTCAGATGCAAGAAATACTGAGTTCTATGGAGATGAACATCTGGGAAGTACAACC 1444
Query 1431 AATGGAAATATGGTCCACACACCTGCTACTGGAAATTATGATGATTCTTTAGAATCTAGG 1490
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 1445 AATGGAAATATGGTCCACACACCTGCTACTGGAAATTATGATGATTCTTTAGAAACGAGG 1504
Query 1491 CGAGAGGTGTTGAAGCAAGAAAACTCTGAGGGCGCTCAGGAGCACCAGTACACATTTGCC 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1505 CGAGAGGTGTTGAAGCAAGAAAACTCTGAGGGCGCTCAGGAGCACCAGTACACATTTACC 1564
Query 1551 CAGTCTGAGCAAGGTTATGCGTATGAAAATGCTAAGCAGCAGCAGATGAATACTGCATAT 1610
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1565 CAGTCTGAGCAAGGGTATGCGTATGAAAATGCTAAGCAGCAGCAGATGAATTCTGCATAT 1624
Query 1611 GATGCCTCACACACAAATGCACAGAATCAGATGCATAATCTTGCTTCATTATCAAATGTG 1670
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1625 GATGCCTCACACACAAATTCACAGAATCAGATGCATAATCTTGATTCATTATCAAATGTG 1684
Query 1671 ATGCAGGGGTATTCACACTCAGTTCCCAACACTTTATTGGCACAAACAGCACAAAATGCG 1730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1685 ATGCAGGGGTATTCACACTCAGTTCCCAACACTTTATTGGCACAAACAGCACAAAATGCG 1744
Query 1731 AGGGAACTTGACTTCCAGTTTTTACCTTTCTCAGCTCAACAGTCTATGCAATCAAGAACT 1790
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1745 AGGGAACTTGACTTCCAGTATTCACCTTTCTCAGCTCAACAGTCTATGCAATCAAGAACT 1804
Query 1791 AGCAACAATGCCTCATCACTTGGTGGCCAAAGCATTTCAATGCCAGAGGCGCTCCGAGGC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1805 AGCAACAATGCCTCATCACTTGGTGGCCAAAGCATTTCAATGCCAGAGGCGCTCCGAGGC 1864
Query 1851 AGTGGAATTTCGGCAACACAGCCAACCCAGCAAACATTACCTGGTGCTAATATCGCTACT 1910
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1865 AGTGGAATTCCGGCAACACAGCCAACCCAGCAAACACTACCTGGTGCTAATATCGCTACT 1924
Query 1911 GGACCTGCTCTTCCTCAGCAGCTTCCAATGCATTACTCTCAACCCACATTGCCTCTAACA 1970
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1925 GGACCTGCTCTTCCTCAGCAGCTTCCAATGCATTACTCTCAACCCACATTACCTCTAACA 1984
Query 1971 CACTATGCAAACATGATCGGTTATCCTCTAATGCCTCAGAATTATCCATACATGCCATCT 2030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1985 CACTATGCAAACATGATCGGTTATCCTCTAATGCCTCAGAATTATCCATACATGCCATCT 2044
Query 2031 GCTTTCCAGCAAACATTTGCTGGTAACAACGCATACCACCAGCAACTAGCTGCATTGCTT 2090
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2045 GCTTTCCAGCAAACATTTGCTGGTAATAGTGCATACCACCAGCAACTAGCTGCATTGCTT 2104
Query 2091 CCGCAGTACAAAACCAATGTGTCTCCCGGTAATTTGCCTCAGTCTGCAACAGCGCCTACC 2150
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2105 CCGCAGTACAAAACCAATGTCTCTCCCGGTAATTTGCCTCAGTCTGCAACAGCGCCTGCC 2164
Query 2151 TCTGCTTATGGATTTGGAAACTCGACCAATGTTGGATCTGCCGGAAACTTCCCTCTTAAC 2210
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2165 TCTGCTTATGGATTTGGAAACTCGACCAATGTCGGATCTGCCGGAAACTTCCCTCTTAAC 2224
Query 2211 CAACAGTCTGCTCCTACCGGTACAACGCTTGGTTATGAAGAAGTTCTTAGTTCTCAATAC 2270
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2225 CAACAGTCTGCTACTACCGGTACAACGCTTGGTTATGAAGATGTTCTTAGTTCTCAATAC 2284
Query 2271 AAAGAGAATCATCTGTTGGCACTTcagcagcagcaacaacagcaacagcaacagcaacag 2330
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||
Sbjct 2285 AAAGAGAATCATCTGTTGGCACTTCAGCAGCAGCAGCAACA--A-CAGCAACATCAACA- 2340
Query 2331 caacagAACGAAAACTCGGCGATGTGGCATCATGGTCATGGTTCCAGAAACATGTCAGGT 2390
| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2341 -A-CAGAACGAAAACTCGGCGATGTGGCATCAGGGTCATGGTTCCAGAACCATGTCAGGT 2398
Query 2391 GTCCCGACTAATACGTATTacaacctccaagcacaacaacaactacaactacaacaacag 2450
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 2399 GTCCCGACTAACACGTATTACAACCTCCAAGCACAACAACAACTGCAACTACAACACCAG 2458
Query 2451 caacaacaacaG--G-CTCAGCAAGCAGCGGGAGGGTATCGCCAAGCTCAGCAACAACAG 2507
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2459 CAACAACAACAGCAGGCTCAGCAAGCAGCGGGAGGGTATCGCCAAGCTCAGCAACAACAG 2518
Query 2508 CATTACGGATCTCATGGCTACCCAAATTATTATCAGTCTCAAACTGAAATGTCACTGGAG 2567
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||
Sbjct 2519 CATTATGGATCTCATGGATACCCAAATTATTATCAGTCTCAGACCGAAATGTCACTCGAG 2578
Query 2568 CGCCAGCAGCAAAACCCTAGGGATGGTGGTACTGGGTCTCAGGCTGGTCAACCGTCGAAT 2627
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2579 CGCCAGCAGCAAAACCCTAGGGATGGTG---CTGGGTCTCAGGCTGGTCAACCGTCGAAT 2635
Query 2628 CAAACCCAGCAGCAGCTCTGGCAAAACTCTTACTAAATAAAGAAAGAGAGTGGGtttttt 2687
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2636 CAATCTCAGCAGCAGCTCTGGCAAAACTCTTACTAAATAAAGAAAGAGAGTGGGTTTTTT 2695
Query 2688 tCAGCTTCTTTCTTTCGGTTATAGAGGTTTGTGTGGGCGAGTCTGAAGAGGAAA-A---- 2742
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2696 -CAGCTTCTTTCTCTCGCTTATAGAGGTTTGTGTGG-CGAGTCTGAAGAGGAAATATGGT 2753
Query 2743 --------A---TGTAACTTATCATCATATTTTCTTTCCTCTGTTAACTTAGGGAA-ACG 2790
| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| | |
Sbjct 2754 CGTGTTCTAAAATGTAACTTATCATCATCTTTTGTCTCCTCTGTTAACTTAGGGAACATG 2813
Query 2791 CAACTCTGATTTCATCAATGCAACTTTAGAAATGAAACCttttttttt 2838
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 2814 CAACTCTGATTTCATCAATGCAACTTCAGAAATGAAACTTTTTTTTTT 2861
> AT1G29370.1 | Symbols: | Kinase-related protein of unknown function
(DUF1296) | chr1:10277890-10283198 REVERSE LENGTH=2860
Length=2860
Score = 4226 bits (2288), Expect = 0.0
Identities = 2689/2871 (94%), Gaps = 73/2871 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGAGATATATCTTCCCTTGTGCTTCCTTCTTCTTCGTCTTCTTCGTATTGTCGCGACTGA 60
||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || | || | | |||||||||||
Sbjct 30 AGAGATATATCTTCCCTTGAGCTTCCTTGGTGTTCTTCGTATT-G--TCGTCGCGACTGA 86
Query 61 GAGAA-GCCACAAAAGCTTCGTTTATTTCCTTCAGATCC---------A-AGAGATTGAG 109
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||
Sbjct 87 GAGAAGGCCACAAAAGCTTCGTTTATTTCCTTCAGATCCGATATAGTGAGAGAGAGAGAG 146
Query 110 AGAGAGAGGCAGCTTACGGCAGATTAATATGAGCAGCAAGGTCGGCGTTGTCGGCGGCGG 169
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | | | | || ||||
Sbjct 147 AGAGAGAGGCAGCTTACGGCGGATAAATATGAGCAGC-A-G-C-AAG--GT---CGGC-- 195
Query 170 AAGTGCCGGAGCAAGGAAGGCCAATAATGGAATTCAGGATATTCCGTCAGGGTCTAGAAA 229
| | |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 196 --G-G-CGGAGC----AAGG---A-AA-GGAATTCAGGATATTCCGTCAGGGTCTAGAAA 242
Query 230 AATAGTACAAAGCTTGAAGGAAATTGTAAACTCTCCCGAGGCTGAGATCTATGCTATGCT 289
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 243 AATAGTACAAAGCTTGACGGAAATTGTAAACTCTCCTGAGGCTGAGATCTATGCTATGCT 302
Query 290 TAAAGAGTGCAATATGGATCCTAACGAAACCGTTAATCGCCTCCTCTCTCAAGATCCGTT 349
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 303 TAAAGAGTGCAATATGGATCCTAACGAAACCGTTAGTCGCCTCCTCTCTCAAGATCCATT 362
Query 350 TCATGAGGTaaagagcaagaaagaaaagaagaaagagaCTAGGGATATATCGGATTCCCG 409
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 363 TCACGAGGTAAAGAGCAAGAAAGAAAAGAAGAAAGAGACTAGGGATATATCAGATTCTCG 422
Query 410 GCCGCGTGGTGCTAATAACACGTACAACCGTGGTGCTAGAGGTGGTTCTGATCGTTATGC 469
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||
Sbjct 423 GCCGCGTGGTGCTAATAACACCTACAACCGTGGTGCTAGAGGTGGTTCTGCTCGCTACGC 482
Query 470 CGGACGAAGTGGATCTACCCATTTCAGCTCTACTGATTCTGGAAACTTCCAAGGAAAATC 529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 483 CGGACGAAGTGGATCTACCCATTTCAGCTCTACTGATTCTGGAAACTTCCAGGGAAAATC 542
Query 530 TGCAAACAAGAAAGAAAGTGGAACGCAGGATTATTTGAGTTCTTGGTCTTCTGCTTCTGG 589
| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 543 TACAAATAAGAAAGAAAGTGGAACGCAGGGTTATACAAGTTCTTGGTCTTCTGCTTCTGG 602
Query 590 AGTGGCGAACACCTATCAAACACCACACAGTGAACCCGTTGCTACGGAAAATAAATTGCC 649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 603 AGTGGCGAACACCTATCAAACACCACACAGTGAACCCGTTGCTACGGAAAACAAATTGCC 662
Query 650 TTCTGTTCCCTCGGGAGATGGAATATCATCATCACAGTCAGCTTCTGGACATCAAACTGC 709
| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663 TCCTGTTACCTTGGGAGATGGAATATCATCATCACAGTCAGCTTCTGGACATCAAACTGC 722
Query 710 ATGGTTTGGAGCTCCAGGCCAAAGGTCCATGGCTG-AGATTGTGAAGATGGGTATACCAC 768
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||
Sbjct 723 ATGGTTTGGAGCTCCAGGCCAGAGGTCTATGGCTGAAG-TTGTGAAGATGGGTAGACCAC 781
Query 769 AGAACAAGACAACGAGGCAAAATGTCAATATGCGTCCTGAGATAAATCATGAGCACGAAG 828
||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 782 AGAACAAGACAACAAAGCAAAATGTCAATATGGGTTCTGAGATAAATCATGAACACAAAG 841
Query 829 TTAGTGCAAATCAGCAGGTCCCTGTTAGAGATGAATGGCCGTCGATTGAGAAGCCACTGG 888
||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 842 TTAGTGCAAATCATCAGGCCCCTGTTAAAGATGAATGGCCGTCGATTGAGAAGCCGCTGG 901
Query 889 CTCCTAGTACATCTTCTGTATCAGTAGCACCAGCAGAATCAGAAGTATGCAATGGTCCAG 948
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 902 CTCCTAGTACATCTTCTTTATCAGTAGCACCAGCAGAATCAGAAGTACGCAATGGTCCAG 961
Query 949 CTGATTTCCAATCCGATAGAGGAGATCAATATCTGAAGGACCGGTTAGAAAATATACATA 1008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 962 CTGATTTCCAATCCGATAGAGGAGATCAATATCTGAAGGACCGGTTAGAAAATATTCATA 1021
Query 1009 TAGCAGAAAATGGCCCGTCTGAAAGTCGTGGA-GTCGATCATGTGCAAGCCGACTCTGTT 1067
||||||||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022 TAGCAGAAAGTGGCCCTTCTGAAAGTCGT-AAGGTTGATCATGTGCAAGCCGACTCTGTT 1080
Query 1068 CAAGAAGATGAATCTGGAGTTTCGTCTGAAATTGATGATAATCCATATCAGACACAGAGC 1127
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 CAAGAAGATGAATCTGTAGTTTCGTCAGAAATTGATGATAATCCATATCAGACACAGAGC 1140
Query 1128 CATCCAGTAGAGCACCACAAAGATGAAGATGATGTTTCATCTGGTTCAGCCAGTTTTCAA 1187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 CATCCAGTAGAGCACCACAAAGATGAAGATGATGTTTCATCTGGTTCAGCCAGTTTTCAA 1200
Query 1188 CAACTAGATAGTCATGATCAAGAAGTCTCACATGAAGAGGATAGACCTGCTGTTGTAATT 1247
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 CAACTAGATAGTCATGATCAAGAAGTCTCACATGAAAAGGATAGACCTGCTGTTGTAATT 1260
Query 1248 CCAAACCATTTGCTAATTCACACAGAAGAATGCTCGCAATTAAGTTTTGGAAGCTTTGGA 1307
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 CCAAACCATTTGCTAATTCACACAGAAGAATGCGCGCAATTAAGTTTTGGAAGCTTTGGA 1320
Query 1308 GGTTTTGGATCAAGGCCTTTGAGCAACAATGTAGAAGAGACTTCTGATGTAGCTCCACAG 1367
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GGTTTTGGATCAAGGCCTTTGAGCAACAGCGTAGAAGCGACTTCTGATGTAGCTCCACAA 1380
Query 1368 ATCGAACATTCAGATGCAAGAAATACTGAGTTTTATGGAGATGAACATCTTGGAAGTACA 1427
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1381 ATCGAACATTCAGATGCAAGAAATACTGAGTTCTATGGAGATGAACATCTGGGAAGTACA 1440
Query 1428 ACCAATGGAAATATGGTCCACACACCTGCTACTGGAAATTATGATGATTCTTTAGAATCT 1487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1441 ACCAATGGAAATATGGTCCACACACCTGCTACTGGAAATTATGATGATTCTTTAGAAACG 1500
Query 1488 AGGCGAGAGGTGTTGAAGCAAGAAAACTCTGAGGGCGCTCAGGAGCACCAGTACACATTT 1547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 AGGCGAGAGGTGTTGAAGCAAGAAAACTCTGAGGGCGCTCAGGAGCACCAGTACACATTT 1560
Query 1548 GCCCAGTCTGAGCAAGGTTATGCGTATGAAAATGCTAAGCAGCAGCAGATGAATACTGCA 1607
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1561 ACCCAGTCTGAGCAAGGGTATGCGTATGAAAATGCTAAGCAGCAGCAGATGAATTCTGCA 1620
Query 1608 TATGATGCCTCACACACAAATGCACAGAATCAGATGCATAATCTTGCTTCATTATCAAAT 1667
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1621 TATGATGCCTCACACACAAATTCACAGAATCAGATGCATAATCTTGATTCATTATCAAAT 1680
Query 1668 GTGATGCAGGGGTATTCACACTCAGTTCCCAACACTTTATTGGCACAAACAGCACAAAAT 1727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 GTGATGCAGGGGTATTCACACTCAGTTCCCAACACTTTATTGGCACAAACAGCACAAAAT 1740
Query 1728 GCGAGGGAACTTGACTTCCAGTTTTTACCTTTCTCAGCTCAACAGTCTATGCAATCAAGA 1787
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GCGAGGGAACTTGACTTCCAGTATTCACCTTTCTCAGCTCAACAGTCTATGCAATCAAGA 1800
Query 1788 ACTAGCAACAATGCCTCATCACTTGGTGGCCAAAGCATTTCAATGCCAGAGGCGCTCCGA 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 ACTAGCAACAATGCCTCATCACTTGGTGGCCAAAGCATTTCAATGCCAGAGGCGCTCCGA 1860
Query 1848 GGCAGTGGAATTTCGGCAACACAGCCAACCCAGCAAACATTACCTGGTGCTAATATCGCT 1907
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 GGCAGTGGAATTCCGGCAACACAGCCAACCCAGCAAACACTACCTGGTGCTAATATCGCT 1920
Query 1908 ACTGGACCTGCTCTTCCTCAGCAGCTTCCAATGCATTACTCTCAACCCACATTGCCTCTA 1967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1921 ACTGGACCTGCTCTTCCTCAGCAGCTTCCAATGCATTACTCTCAACCCACATTACCTCTA 1980
Query 1968 ACACACTATGCAAACATGATCGGTTATCCTCTAATGCCTCAGAATTATCCATACATGCCA 2027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 ACACACTATGCAAACATGATCGGTTATCCTCTAATGCCTCAGAATTATCCATACATGCCA 2040
Query 2028 TCTGCTTTCCAGCAAACATTTGCTGGTAACAACGCATACCACCAGCAACTAGCTGCATTG 2087
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 TCTGCTTTCCAGCAAACATTTGCTGGTAATAGTGCATACCACCAGCAACTAGCTGCATTG 2100
Query 2088 CTTCCGCAGTACAAAACCAATGTGTCTCCCGGTAATTTGCCTCAGTCTGCAACAGCGCCT 2147
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2101 CTTCCGCAGTACAAAACCAATGTCTCTCCCGGTAATTTGCCTCAGTCTGCAACAGCGCCT 2160
Query 2148 ACCTCTGCTTATGGATTTGGAAACTCGACCAATGTTGGATCTGCCGGAAACTTCCCTCTT 2207
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161 GCCTCTGCTTATGGATTTGGAAACTCGACCAATGTCGGATCTGCCGGAAACTTCCCTCTT 2220
Query 2208 AACCAACAGTCTGCTCCTACCGGTACAACGCTTGGTTATGAAGAAGTTCTTAGTTCTCAA 2267
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 2221 AACCAACAGTCTGCTACTACCGGTACAACGCTTGGTTATGACGATGTTCTTAGTTCTCAA 2280
Query 2268 TACAAAGAGAATCATCTGTTGGCACTTcagcagcagcaacaacagcaacagcaacagcaa 2327
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||
Sbjct 2281 TACAAAGAGAATCATCTGTTGGCACTTCAGCAGCAGCAGCAACA--A-CAGCAACATCAA 2337
Query 2328 cagcaacagAACGAAAACTCGGCGATGTGGCATCATGGTCATGGTTCCAGAAACATGTCA 2387
|| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2338 CA--A-CAGAACGAAAACTCGGCGATGTGGCATCAGGGTCATGGTTCCAGAACCATGTCA 2394
Query 2388 GGTGTCCCGACTAATACGTATTacaacctccaagcacaacaacaactacaactacaacaa 2447
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2395 GGTGTCCCGACTAACACGTATTACAACCTCCAAGCACAACAACAACTGCAACTACAACAC 2454
Query 2448 cagcaacaacaacaG--G-CTCAGCAAGCAGCGGGAGGGTATCGCCAAGCTCAGCAACAA 2504
||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2455 CAGCAACAACAACAGCAGGCTCAGCAAGCAGCGGGAGGGTATCGCCAAGCTCAGCAACAA 2514
Query 2505 CAGCATTACGGATCTCATGGCTACCCAAATTATTATCAGTCTCAAACTGAAATGTCACTG 2564
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2515 CAGCATTATGGATCTCATGGATACCCAAATTATTATCAGTCTCAGACCGAAATGTCACTC 2574
Query 2565 GAGCGCCAGCAGCAAAACCCTAGGGATGGTGGTACTGGGTCTCAGGCTGGTCAACCGTCG 2624
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2575 GAGCGCCAGCAGCAAAACCCTAGGGATGGTG---CTGGGTCTCAGGCTGGTCAACCGTCG 2631
Query 2625 AATCAAACCCAGCAGCAGCTCTGGCAAAACTCTTACTAAATAAAGAAAGAGAGTGGGttt 2684
|||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2632 AATCAATCTCAGCAGCAGCTCTGGCAAAACTCTTACTAAATAAAGAAAGAGAGTGG-TTT 2690
Query 2685 ttttCAGCTTCTTTCTTTCGGTTATAGAGGTTTGTGTGGGCGAGTCTGAAGAGGAAA-A- 2742
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2691 TTTTCAGCTTCTTTCTCTCGCTTATAGAGGTTTGTGTGG-CGAGTCTGAAGAGGAAATAT 2749
Query 2743 -----------A---TGTAACTTATCATCATATTTTCTTTCCTCTGTTAACTTAGGGAA- 2787
| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 2750 GGTTGTGTTCTAAAATGTAACTTATCATCATCTTTTGTCTCCTCTGTTAACTTAGGGAAC 2809
Query 2788 ACGCAACTCTGATTTCATCAATGCAACTTTAGAAATGAAACCttttttttt 2838
| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 2810 ATGCAACTCTGATTTCATCAATGCAACTTCAGAAATGAAACTTTTTTTTTT 2860
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 141019276773
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5