BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg473200
Length=3883
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G29900.1 | Symbols: CARB | carbamoyl phosphate synthetase B ... 6126 0.0
> AT1G29900.1 | Symbols: CARB | carbamoyl phosphate synthetase
B | chr1:10468054-10472211 FORWARD LENGTH=3909
Length=3909
Score = 6126 bits (3317), Expect = 0.0
Identities = 3731/3924 (95%), Gaps = 56/3924 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGAAACCCTAAAACCctctctctcgtctctcactctcttctGCAGCAGTCTCCAGTTAC 60
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GAGAAACCCTAAAACCCTCTCTCTCGTGTCTCACTCTCTTCTGCAGCAGTCTCCAGTTAC 60
Query 61 AGAGCCG--ACAGACAAAACTT---------AGAAGAAGAAGCA--AAAAATGAGTAACC 107
||||||| |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||
Sbjct 61 AGAGCCGACACAGGCAAAACTTAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAAAAATGAGAAACC 120
Query 108 ATTGCTTAGAACTCTCCTCCAATTGTTCCTCCATTTTCGCTTCTTCCAAATCCAATCCTC 167
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ATTGCTTAGAACTCTCTTCCAATTGTTCCTCCATTTTCGCTTCTTCCAAATCCAATCCTC 180
Query 168 G-TT-TCT-C-T-C---CT-T-C--TTCCACTTTCTTCTCTCGCTCTGCCATCAATTACA 215
| || ||| | | | || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 181 GTTTCTCTCCTTCCAAGCTCTCCTATTCCACTTTCTTCTCTCGCTCTGCCATCTATTACA 240
Query 216 GAGCTAAATCAAAGCTAGCCTCTTCTTCCTCCTCTTTCTCCTCGTTCCTCCCATGTCTCA 275
|| | ||| |||| | |||||| ||||| || || |||||| | |||| |||||||||||
Sbjct 241 GATCAAAACCAAAACAAGCCTCGTCTTCTTCTTCCTTCTCCACTTTCCCCCCATGTCTCA 300
Query 276 ATCGGAAAAGCTCCCTCACACGA-GTTCTCAAACCCGTCTCAGAGCTCGCAGACACCACT 334
||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 301 ATCGGAAAAGCTCCCTCACGC-ATGTTCTCAAACCCGTCTCAGAGCTCGCCGACACCACT 359
Query 335 ACCAAGCCTTTTTCTCCGGAGATAGTCGGGAAAAGAACCGATCTGAAGAAGATTATGATT 394
||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 ACCAAGCCTTTTTCTCCGGAGATCGTCGGCAAGAGAACCGATCTGAAGAAGATTATGATT 419
Query 395 CTCGGTGCTGGTCCGATTGTGATTGGACAAGCTTGTGAGTTTGATTACTCTGGAACTCAA 454
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 420 CTCGGCGCTGGTCCGATTGTCATTGGACAAGCTTGTGAGTTTGATTACTCTGGTACTCAA 479
Query 455 GCTTGTAAAGCCTTAAGAGAAGAGGGTTATGAGGTTATCCTGATCAATTCGAATCCCGCT 514
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 480 GCTTGTAAAGCCTTAAGAGAAGAGGGCTATGAGGTTATCCTGATCAATTCGAATCCTGCC 539
Query 515 ACTATCATGACTGACCCGGAAACTGCTAATCGGACTTATATTGCTCCGATGACTCCTGAG 574
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 540 ACTATCATGACTGATCCGGAAACTGCTAATCGGACTTATATCGCTCCGATGACTCCTGAG 599
Query 575 CTTGTCGAGCAGGTTATTGAGAAAGAGAGGCCTGACGCTTTGTTACCTACCATGGGTGGT 634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 600 CTTGTCGAGCAGGTTATTGAGAAAGAGAGGCCTGACGCTTTGTTACCAACCATGGGTGGT 659
Query 635 CAAACCGCATTGAACCTTGCCGTTGCTCTTGCTGAGAGTGGTGCTCTGGAGAAATACGGT 694
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 660 CAAACCGCATTGAACCTCGCGGTTGCTCTTGCTGAGAGTGGTGCTTTGGAGAAATACGGT 719
Query 695 GTTGAATTGATTGGAGCTAAGCTTGGTGCGATTAAGAAAGCTGAAGATCGTGAGTTGTTC 754
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 GTTGAATTGATAGGAGCTAAGCTTGGTGCGATTAAGAAAGCTGAAGATCGTGAGTTGTTC 779
Query 755 AAGGAGGCCATGAAGAACATTGGACTAAAGACTCCACCTTCAGGGATTGGGAACACTCTT 814
||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 780 AAGGATGCGATGAAGAACATTGGGCTAAAGACTCCACCTTCAGGGATTGGGACCACTCTT 839
Query 815 GGTGAGTGTTTCGACATTGCTGAGAGAATTGGTGAGTTCCCTTTGATTATCTGTCCTGCG 874
| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 840 GATGAGTGTTTTGACATTGCTGAGAAAATTGGTGAGTTCCCTTTGATTATCCGTCCTGCG 899
Query 875 TTTACTTTAGGTGGTACTGGTGGTGGAATTGCGTATAACAAAGAGGAGTTTGAGTCCATT 934
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 900 TTTACTTTAGGTGGTACTGGTGGTGGAATTGCGTATAACAAAGAGGAGTTTGAGTCTATA 959
Query 935 TGTAAAGCGGGTTTGGCTGCGAGTGTGACAAGTCAAGTTCTTGTGGAGAAATCGTTGTTG 994
|||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 960 TGTAAATCGGGTTTGGCTGCGAGTGCGACAAGTCAAGTTCTTGTGGAGAAATCCTTGTTG 1019
Query 995 GGTTGGAAGGAATATGAACTTGAGGTGATGAGAGACTTAGCTGACAATGTTGTCATTATC 1054
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GGTTGGAAAGAATATGAGCTTGAGGTGATGAGAGACTTAGCTGACAATGTTGTCATTATC 1079
Query 1055 TGTTCCATTGAGAATATTGATCCTATGGGTGTGCACACTGGTGATTCCATCACTGTGGCA 1114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 TGTTCCATTGAGAATATTGATCCTATGGGTGTGCACACTGGTGATTCCATCACTGTGGCA 1139
Query 1115 CCTGCGCAGACTCTAACGGATAGAGAGTATCAGCGGCTTAGGGATTATTCCATTGCGATT 1174
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 CCTGCACAGACTCTAACGGATAGAGAGTACCAGCGGCTTAGGGATTATTCCATTGCGATT 1199
Query 1175 ATACGGGAGATTGGTGTTGAGTGTGGTGGATCTAACGTGCAGTTTGCTGTAAACCCGGTT 1234
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1200 ATACGGGAGATTGGTGTTGAGTGTGGTGGATCTAATGTGCAGTTTGCTGTCAACCCGGTT 1259
Query 1235 GATGGTGAAGTTATGATCATAGAGATGAACCCTAGGGTCTCGAGATCTTCTGCTCTTGCT 1294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1260 GATGGTGAAGTTATGATCATAGAGATGAACCCTAGGGTCTCAAGATCTTCTGCTCTTGCT 1319
Query 1295 TCCAAGGCTACAGGGTTTCCCATTGCTAAAATGGCTGCCAAGTTGTCTGTTGGGTATACC 1354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1320 TCCAAGGCTACAGGGTTTCCCATTGCTAAAATGGCTGCCAAGTTGTCTGTTGGCTATACC 1379
Query 1355 TTGGATCAGATTCCTAATGATATCACCAGGAAAACACCGGCTAGCTTCGAGCCCTCCATC 1414
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 TTGGATCAGATTCCTAATGATATCACGAGGAAAACACCGGCTAGCTTCGAGCCCTCCATC 1439
Query 1415 GATTATGTGGTCACTAAGATTCCTAGATTTGCATTTGAAAAGTTTCCAGGATCTCAGCCC 1474
||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 GATTATGTGGTGACTAAGATTCCTCGATTTGCATTTGAAAAGTTTCCAGGATCTCAGCCA 1499
Query 1475 TTGCTAACGACCCAGATGAAATCTGTCGGGGAGTCTATGGCTCTCGGTCGTACATTCCAA 1534
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1500 TTGCTAACGACCCAGATGAAATCTGTTGGGGAATCTATGGCTCTCGGCCGTACATTCCAA 1559
Query 1535 GAATCTTTCCAGAAAGCTCTGAGGTCTCTGGAGTGTGGATTCTCGGGTTGGGGTTGTGCA 1594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 GAATCTTTCCAGAAAGCTCTGAGGTCTCTGGAGTGTGGATTCTCGGGTTGGGGTTGTGCA 1619
Query 1595 AAAATTAAAGAGCTAGATTGGGACTGGGATCAGCTGAAATACAGCCTTAGAGTCCCAAAT 1654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1620 AAAATTAAAGAGCTAGATTGGGACTGGGATCAGCTGAAATACAGCCTAAGAGTCCCAAAT 1679
Query 1655 CCGGACAGGATCCATGCGATATATGCTGCCATGAAAAAGGGTATGAAGATTGATGAAATC 1714
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1680 CCTGACAGGATCCATGCGATATATGCTGCCATGAAAAAGGGTATGAAAATTGATGAAATC 1739
Query 1715 TACGAGTTGAGCATGGTAGACAAGTGGTTTCTAACCCAGCTTAAGGAGCTCGTGGACGTG 1774
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1740 TACGAGTTGAGCATGGTGGACAAGTGGTTCCTAACCCAGCTTAAAGAGCTCGTGGACGTC 1799
Query 1775 GAACAGTATCTTATGTCCGGACCCTTGTCAGAGATTACAAAAGAAGACCTGTACGAAGTC 1834
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1800 GAACAGTATCTTATGTCCGGAACCTTGTCAGAGATTACAAAAGAAGACCTTTACGAAGTC 1859
Query 1835 AAAAAGCGGGGATTTAGTGACAAGCAAATCTCTTTTGCTACAAAGACAACCGAGGAAGAA 1894
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 AAAAAGCGGGGATTTAGTGACAAGCAAATCGCTTTTGCTACAAAGACAACCGAGGAAGAA 1919
Query 1895 GTCCGTACCAAGCGGATTTCTCTAGGAGTTGTTCCATCTTACAAGAGAGTGGATACATGT 1954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 GTCCGTACCAAGCGGATTTCTCTAGGAGTTGTTCCATCTTACAAGAGAGTGGATACATGT 1979
Query 1955 GCTGCAGAGTTTGAAGCACATACACCATACATGTACTCTTCATATGATTTTGAATGTGAA 2014
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1980 GCTGCAGAGTTCGAAGCGCATACACCATACATGTACTCTTCATATGATGTTGAATGTGAA 2039
Query 2015 TCAGCACCAAACAGCAAGAAGAAGGTTTTGATTTTGGGTGGAGGCCCAAACCGCATTGGT 2074
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2040 TCAGCTCCAAACAACAAGAAGAAGGTTTTGATTTTGGGTGGAGGGCCAAACCGCATTGGT 2099
Query 2075 CAAGGGATTGAATTTGATTACTGTTGTTGCCACACATCTTTCGCCTTGCAGGATGCTGGA 2134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2100 CAAGGGATTGAATTTGATTACTGTTGTTGCCACACATCTTTCGCCTTACAGGATGCTGGA 2159
Query 2135 TATGAGACCATAATGTTGAACTCAAATCCCGAAACAGTATCCACAGATTATGATACAAGC 2194
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 TATGAGACCATAATGTTGAACTCAAATCCTGAAACAGTATCCACAGATTATGATACAAGC 2219
Query 2195 GATAGGCTGTACTTTGAACCTCTCACAATCGAGGATGTTCTCAATGTTATCGACCTTGAG 2254
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 GATAGGCTCTATTTTGAACCTCTCACAATCGAGGATGTTCTCAATGTTATCGACCTTGAG 2279
Query 2255 AAACCTGATGGCATAATAGTGCAATTTGGTGGTCAAACTCCTCTGAAACTTGCTCTCCCG 2314
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2280 AAACCTGATGGCATAATAGTGCAATTTGGTGGTCAAACTCCTCTGAAACTTGCTCTGCCG 2339
Query 2315 ATCAAACATTATTTGGATAAGCACATGCCCATGAGCTTGAGCGGAGCGGGACCTGTTCGC 2374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 ATCAAACATTATTTGGATAAGCACATGCCCATGAGCTTGAGCGGAGCGGGACCTGTTCGC 2399
Query 2375 ATCTGGGGTACATCACCTGACTCCATTGACGCTGCTGAAGACAGAGAGAGGTTCAATGCA 2434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2400 ATCTGGGGTACATCACCTGACTCCATTGACGCTGCTGAAGACAGAGAGAGGTTCAATGCA 2459
Query 2435 ATTCTCGACGAGCTGAAAATTGAGCAGCCCAAGGGAGGCATTGCAAAGAGCGAAGCTGAT 2494
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2460 ATTCTCGACGAGCTGAAGATTGAGCAGCCCAAGGGAGGCATTGCAAAGAGCGAAGCTGAT 2519
Query 2495 GCATTAGCCATAGCAAAGGAGGTAGGCTACCCAGTTGTGGTAAGACCTTCTTACGTTCTA 2554
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2520 GCATTAGCCATAGCAAAGGAGGTAGGGTACCCAGTTGTGGTAAGACCTTCTTATGTTCTA 2579
Query 2555 GGTGGACGAGCAATGGAGATCGTTTATGATGACAGTAGACTAATAACCTATTTGGAAAAT 2614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2580 GGTGGACGAGCAATGGAGATCGTTTATGATGACAGTAGACTAATAACCTATTTGGAAAAT 2639
Query 2615 GCGGTAGAAGTTGACCCAGAGAGACCTGTTTTGGTAGATAAATATCTCTCTGACGCCATT 2674
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 2640 GCGGTACAAGTTGACCCAGAGAGACCTGTTTTGGTAGATAAATATCTTTCTGATGCCATT 2699
Query 2675 GAGATCGACGTTGATACCCTTACTGATTCCTATGGAAATGTGGTGATTGGTGGAATAATG 2734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2700 GAGATCGACGTTGATACCCTTACTGATTCCTATGGAAATGTGGTGATTGGTGGAATAATG 2759
Query 2735 GAGCATATCGAACAAGCCGGTGTGCATTCTGGTGACTCAGCGTGTATCCTTCCAACACAA 2794
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 2760 GAGCATATCGAACAAGCTGGTGTGCATTCTGGTGACTCAGCTTGTATGCTTCCAACACAA 2819
Query 2795 ACCATCCCATCTTCTTGTTTGCAAACTATCCGG-CAATGGACCACTAAGCTGGCGAAGAA 2853
||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2820 ACCATCCCAGCTTCTTGTTTGCAAACTATTCGAACA-TGGACCACTAAGCTGGCGAAGAA 2878
Query 2854 GCTAAATGTATGTGGGCTGATGAACTGTCAGTACGCAATCACAACATCTGGGGATGTTTT 2913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2879 GCTAAATGTATGTGGGCTGATGAACTGTCAGTACGCAATCACAACATCTGGGGATGTTTT 2938
Query 2914 CTTGCTCGAAGCCAATCCCCGAGCTTCCCGTACTGTCCCTTTTGTCTCAAAAGCCATTGG 2973
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2939 TTTGCTGGAAGCCAATCCCCGAGCTTCCCGTACTGTCCCTTTTGTGTCAAAAGCCATTGG 2998
Query 2974 GCACCCTCTTGCCAAGTATGCAGCGCTGGTCATGTCGGGCAAATCTCTCAAAGATCTTAA 3033
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2999 ACACCCTCTTGCCAAGTATGCAGCGCTGGTCATGTCGGGCAAATCTCTCAAAGATCTTAA 3058
Query 3034 CTTTGAAAAAGAAGTCATCCCTAAACATGTCTCTGTGAAAGAAGCTGTTTTCCCGTTTGA 3093
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3059 CTTTGAAAAAGAAGTTATCCCTAAACATGTCTCTGTGAAAGAAGCTGTTTTCCCGTTTGA 3118
Query 3094 GAAGTTCCAAGGATGCGATGTGATACTCGGGCCAGAGATGAGAAGCACAGGAGAAGTGAT 3153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3119 GAAGTTCCAAGGATGCGATGTGATACTCGGGCCAGAGATGAGAAGCACAGGAGAAGTGAT 3178
Query 3154 GAGCATCAGTTCGGAATTCTCAAGTGCGTTTGCAATGGCTCAGATCGCTGCAGGTCAAAA 3213
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3179 GAGCATCAGTTCTGAATTCTCAAGTGCGTTTGCAATGGCTCAGATCGCTGCAGGTCAAAA 3238
Query 3214 GCTACCGT-TAACCGGCACAGTCTTCCTCAGCTTAAACGATATGACAAAACCTCACCTGG 3272
|||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 3239 GCTACC-TCTATCAGGCACAGTCTTCCTCAGCTTAAACGATATGACCAAACCGCACCTGG 3297
Query 3273 AGAAAATCGCGGTGTCTTTCCTCGAGCTCGGATTCAAAATCGTTGCCACCTCAGGTACAG 3332
|||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||
Sbjct 3298 AGAAAATCGCGGTGTCCTTCCTCGAGCTTGGGTTCAAAATAGTTGCCACCTCGGGAACAG 3357
Query 3333 CTCATTTCCTGGAACTGAAAGGCATTCCTGTAGAGAGAGTGCTGAAGCTGCACGAAGGAA 3392
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||| |||||||
Sbjct 3358 CTCATTTCCTGGAACTGAAAGGCATTCCAGTGGAGAGAGTGTTGAAGTTGCATGAAGGAA 3417
Query 3393 GACCACATGCTGCTGATATGGTGGCTAATGGCCAGATCCATTTGATGTTGATCACAAGCT 3452
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3418 GACCACATGCTGCTGATATGGTGGCGAATGGTCAGATCCATTTGATGTTGATCACAAGCT 3477
Query 3453 CGGGCGATGCTCTTGATCAGAAAGATGGGAGACAGCTCAGACAAATGGCTCTAGCCTACA 3512
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3478 CGGGTGATGCTCTTGATCAGAAAGATGGGAGACAGCTCAGACAAATGGCTCTAGCATACA 3537
Query 3513 AGGTCCCTGTTATAACCACTGTGGCTGGGGCATTGGCCACTGCTGAGGGAATCAAGAGCT 3572
|||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3538 AGGTACCTGTTATAACCACTGTTGCTGGTGCATTGGCCACTGCTGAGGGAATCAAGAGCT 3597
Query 3573 TGAAGTCAAGTGCCATTAAAATGACCGCTCTTCAGGACTTCTTTGAGGTAAAGAATGTAT 3632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3598 TGAAGTCAAGTGCCATTAAAATGACCGCTCTTCAGGACTTCTTTGAGGTAAAGAATGTAT 3657
Query 3633 CTTCTTTGCTCGTCTGAGATAGttttttttttttATGTGTTTGATCGTTTGTGTGGAACT 3692
|||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3658 CTTCTTTGCTCGTCTGAGTTAGTTTTTTTGTTGT--GTGTT-GATCGTTTGTGTGGAACT 3714
Query 3693 TTTTTACGATTTCGATTAAATTTTAACGGATTTTGTTTCCCATAAGCATTTCTATGAATA 3752
|||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3715 TTTTTACGAT----A--AA-TTTTAACGGATTTTGTTACCCATAAGCATTTCTATGAATA 3767
Query 3753 ATCTTCGAAAAATGCAGCAAACTTGTGACTTATCAGTCGGCGTTGTTCCTGTAATTCAGA 3812
||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 3768 ATCTTCGAAAA-TGCAGCAAACTTGTGATTTATCAATCGGCTTTGTTCCTTTAATTCAGA 3826
Query 3813 TATATACAGGTCTTTGATTGTATC----CAT-T---G---G-CTTAAACTCGAGTTATGT 3860
|||| ||| | ||||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||
Sbjct 3827 TATACACAAGCCTTTGATTGTATCAGGTCATGTAACGCTTGGCTTAAACTCGAGTTATGT 3886
Query 3861 TCTATAAAATTGCT-CAATTGTAG 3883
||||||| |||| | |||||||||
Sbjct 3887 TCTATAAGATTG-TGCAATTGTAG 3909
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 193443732208
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5