BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg473512
Length=3805
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G33390.1 | Symbols: ATFAS4, FAS4 | RNA helicase family prote... 5853 0.0
> AT1G33390.1 | Symbols: ATFAS4, FAS4 | RNA helicase family protein
| chr1:12099482-12104601 REVERSE LENGTH=4066
Length=4066
Score = 5853 bits (3169), Expect = 0.0
Identities = 3619/3829 (95%), Gaps = 60/3829 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGAGTCTGATGGGAGATGATTGCAATTTAGATATAATGCCTCCAAGGAAGAAGAAG 60
||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 97 ATGGCAAGTGTGGTGGGAGATGATTGCAATTTAGATGTAATGCCTCCTAGGAAGAAGAAG 156
Query 61 AATAAGGGATCCAAT---A---AGGATAAGCTGAATTCAAATAACAACACGGTTTC-AAG 113
||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||
Sbjct 157 AATAAAGGATCCAATAAGATGCAGGATAAGCTGAATTCAAATAATAACACGGGATCGAAG 216
Query 114 TAGATCTCGGAAACGGAAACTGAATTCAAA--TAAGGACACGGTAGTGAGCAAATCTCAG 171
| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||
Sbjct 217 -AAATCTCGGAAACGGAAACTGAATTCAAATGTAA--ACACGGTAGCGTGCAAATCTCAG 273
Query 172 AAACGGAAGCTGAAGAAATTGGAGGAAGATAAGGAGAAAGAAATCATCTTTGCAAAAACC 231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 274 AAACGGAAGCTGAAGAAATTGGAGGAAGATAAGGAGAAAGAAATCCTCTTTTCAAAAACT 333
Query 232 GCCGAGTTGTTAGACACGTACAAAATATCTGAGGATGTATCATCGCTATTACAATCGTCA 291
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 334 GCCGAGTTGTTAGACAAGTACAAAATATCTGAGGATGTATCGTCGCTATTACAATCATCA 393
Query 292 AAAGTTATAGGAAGATCAGCCACTAAGCTGGAAAAACGAAGGAGAGCAATGCAACTTTCT 351
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 394 AAAGTTATAGGAAGATCAGCTACTAAGCTGGAAAAAAGAAGGAGAGCAATGCAACTTTCT 453
Query 352 AAAGCTGGTGTTGAGACTGAGCATTCTGACGAATCAGTCGAGCGAAATGAC---GATGAT 408
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 454 AAAGCTGGTGTTGAGACTGAGCATTCTGATGAATCAGTCGAGCAAAATGACAATGATGAT 513
Query 409 GATTCTTGTATGGACAAACCTACAACACCGGAACATGTTGAAATCGAAATC-CCAACTTT 467
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||
Sbjct 514 GATTCTTGTATGGATGAACCTACAACACCGGAACATGTTGAAATTGAAA-CTCCAACTTT 572
Query 468 TGTAACTTATTCTGAGCAACAACTGGTTCATGAGCATGAACTCGGTTCTGATCTAATGTT 527
||||||| |||||||||| ||||||| | | | | | | ||||||||||| |
Sbjct 573 TGTAACTGATTCTGAGCAGCAACTGG-T--T---C----A-T--G--CTGATCTAATGAT 617
Query 528 TTCTGCTGAAGAAACTAGTAGCAAGCTCGTGGTAGACGACAATGTGGATATGATCCTACA 587
|||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 618 TTCTGCTGAAGAAAGTAGTAGCAAGCTTGAGGTAGACGACACTGTGGATATGATCCCACT 677
Query 588 GACAACTTGTCGTGATGATGAAGAAGACTCACAAAGAATGGATGGGAC-CATTGAGAATG 646
||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||
Sbjct 678 GACAACTTGTCGTGATGATGATGAAGACT--C----AATGGATGGG-CTCATTGAGAATG 730
Query 647 AAGATGTAACTGTACAAGGACCTCGTGTGCCCGCGTTTGTAGTTCATGTTTTGAGACCAG 706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 731 AAGATGTAACTGTACAAGGACCTCGTGTGCCCGCGTTTGTAGTTCATGTTTCAAGACCAG 790
Query 707 CCGAAGTTGAAGAGACGAGGAAGGATCTTCCGATAGTAATGATGGAGCAAGAGATAATGG 766
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 791 CCGAAGTTGAAGAGACGAGGAAGGATCTTCCAATAGTAATGATGGAGCAGGAGATAATGG 850
Query 767 AAGCTATTAATCGTCACCCCACAGTTATTATTTCAGGACAAACCGGGTGTGGTAAAACCA 826
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 851 AAGCTATTAATCGTCACCCTGCAGTTATTATTTCAGGACAAACTGGGTGTGGTAAAACCA 910
Query 827 CTCAAGTTCCTCAGTTCCTTTATGAAGCTGGTTTTGGTTCAAAGCAATTCAGTTCTCGAA 886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 911 CTCAAGTTCCTCAGTTCCTTTATGAAGCTGGTTTTGGTTCAAAGCAATTCAGTTCTCGAA 970
Query 887 GTGGGATTATAGGGATTACCCAACCACGCCGTGTCGCCGTCCTTGCCACTGCCAAGAGAG 946
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 971 GTGGGATTATCGGGATTACCCAACCACGCCGTGTCGCCGTTCTTGCCACTGCCAAGAGAG 1030
Query 947 TGGCATTTGAGCTTGGTGTTCGTCTTGGTAAAGAAGTCGGGTTTCAAGTTAGGTACGACA 1006
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031 TGGCATTTGAGCTTGGTGTTCGTCTTGGTAAAGAGGTTGGGTTTCAAGTTAGGTACGACA 1090
Query 1007 AAAAGATTGGCGAAAACTCCTCTATCAAGTTTATGACCGATGGGATTTTACTTCGTGAGA 1066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091 AAAAGATTGGCGAAAACTCCTCTATCAAGTTTATGACCGATGGGATTTTACTTCGTGAGA 1150
Query 1067 TACAGAATGACTTCTTATTGAGGCGTTACTCTGTGGTAATTCTCGATGAAGCCCATGAAA 1126
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151 TACAGAATGACTTCTTATTGAGGCGTTACTCTGTGATTATTCTCGATGAAGCCCATGAAA 1210
Query 1127 GAAGTTTGAACACAGACATTCTAATTGGGATGCTCACTCGAGTCATCAAAATCCGACAGG 1186
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211 GAAGCTTGAACACAGACATTCTAATTGGGATGCTCACTCGAGTCATCAAAATCCGACAGG 1270
Query 1187 AATACTACGAGGAACAACAAACGAGTCTTCAATCTGGAGGCACAGTAACCTCAGAATACC 1246
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1271 AATACTACGAGGAACAACAAAAGAGTCTTCAATCTGGAGGCACAGTAACCTCAGAATGCC 1330
Query 1247 AAATCACGCCACTTAAACTTATATTGATGAGTGCGACTTTGCGGGTGGAAGATTTTGTAT 1306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1331 AAATCACGCCACTTAAACTTATATTGATGAGTGCGACTTTGCGAGTGGAAGATTTTGTAT 1390
Query 1307 CAGGGAAAAGGTTATTCCCTAAGATACCTCCGCTTATAGAGGTTCCCACTCGACAGTATC 1366
| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391 CGGGGAAAAGGTTATTCCCTAATATACCTCCTCTTATAGAGGTTCCCACTCGACAGTATC 1450
Query 1367 CAGTAACTATACATTTCTCC-AGAAAGACTGAGATTGTTGATTATATCGGTCAAGCTTAT 1425
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 1451 CAGTAACTATACATTTCTCCAAG-AAGACTGAGATTGTTGATTATATAGGTGAAGCTTAT 1509
Query 1426 AAGAAAGTGATGTCAATTCACAAAAAGCTACCACAAGGAGGAATACTTGTTTTTGTGACT 1485
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1510 AAGAAAGTGATGTCAATTCACAAAAAGTTACCACAAGGAGGAATACTTGTTTTTGTGACT 1569
Query 1486 GGGCAGAGAGAAGTTGACTATTTATGTGAGAAGTTACGTAAGTCTTCAAAGGAACTTGTT 1545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1570 GGGCAGAGAGAAGTTGACTATTTATGTGAGAAGTTACGTAAGTCTTCAAAGGAACTTGTT 1629
Query 1546 GTTCAAGCTGCTAAAAGAGATGCTTATGTGAAGAAGAAATGCGATGATGGTTCATTTGGT 1605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1630 GTTCAAGCTGCTAAAAGAGATGCTTATGTGAAGAAGAAATGCGATGATGGTTCATTTGGT 1689
Query 1606 GGTGTTGATATGAAGGAGATTGCTGAAGCATTTGATGATGGCTCCGACAATCAAAATTAC 1665
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
Sbjct 1690 GGTGTTGACATGAAGGAGATTGCTGAAGCATTTGATGATGACTCCAACAATCAAAATTCC 1749
Query 1666 AGGTTTAGCTCGCATGGAGAAGATCCTTCTGAAATTGGTGATGGTAACTATGATGATGAT 1725
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1750 AGGTTTAGCTCGCATGGAGAAGATCCTTCTGATATTGGTGATGGTAACTATGATGATGAT 1809
Query 1726 TTTGAAGAAGAAGACATGTATGAGTCTGATGAAGACAGGGACTGGGAAACTGTTGATGAC 1785
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1810 TTTGAAGAGGAAGACATGTATGAGTCTGATGAAGACAGGGACTGGGAAACTGTTGATGAC 1869
Query 1786 GGCTTTGCAAGTTCATTGGTAGAGGAAGGGAAGCTTGATGCTCTCCGAGCAGCGTTTAAT 1845
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1870 GGCTTTGCAAGTTCATTTGTAGAGGAAGGGAAGCTTGATGCTCTCCGAGCAGCGTTTAAT 1929
Query 1846 GGTTTGGCAAACGAAAATGGATCCGTATCTGCTGAGCCGACAAAGACCATTGCAGCAGAG 1905
| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1930 GCTTTGGCAGACAAAAATGGATCCGTATCTGCTGAGCCGGCAAAGTCCATTGCAGCAGAG 1989
Query 1906 AATCAAGAGGCTGAGCAGGTAAAAAACACA-TTTTCTCCAGGAAAATTACGTGTTCTTCC 1964
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1990 AATCAAGAGGCTGAGCAGGTAAAAAACA-AGTTTTCTCCAGGAAAATTACGTGTTCTTCC 2048
Query 1965 ACTTTATGCGATGCTATCTCCAGCTGCACAGCTCCGAGTGTTTGAGGAATTTGAGAAAGA 2024
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2049 ACTTTATGCTATGCTATCTCCAGCTGCACAGCTTCGAGTGTTTGAGGAAGTTGAGAAAGA 2108
Query 2025 AGAAAGACTTGTGGTTGTGGCGACTAATGTAGCGGAAACTTCTCTGACTATTCCCGGTAT 2084
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2109 AGAAAGACTTGTGGTTGTGGCGACTAATGTAGCGGAAACTTCTCTGACTATTCCTGGTAT 2168
Query 2085 AAAGTATGTGGTTGATACAGGTCGGGTTAAAGTGAAGAATTATGATTCTAAGACTGGTAT 2144
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2169 AAAGTATGTGGTTGATACAGGTCGGGTTAAAGTAAAGAATTATGATTCTAAGACTGGTAT 2228
Query 2145 GGAAAGTTATGAGGTAGATTGGATTAGTCAAGCTTAGGCTAGTCAACGAGCTGGAAGAGC 2204
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2229 GGAAAGTTATGAGGTAGATTGGATTAGCCAAGCTTCGGCTAGTCAACGAGCTGGAAGAGC 2288
Query 2205 TGGACGAACTGGACCTGGTCACTGTTATCGTCTCTATTCATCTGCGGTTTTTAGCAATAT 2264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2289 TGGACGAACTGGACCTGGTCACTGTTATCGTCTCTATTCATCTGCAGTTTTTAGCAATAT 2348
Query 2265 ATTTGAGGAATCTTCGCCTCCTGAAATCACGAAAGTTCCTGTTGATGGAGTTGTTCTTCT 2324
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2349 ATTTGAGGAATCTTCGCTTCCTGAAATCATGAAAGTTCCTGTTGATGGAGTCATTCTTCT 2408
Query 2325 CATGAAATCTATGAACATTCCAAAGGTTGAGAATTTCCCGTTTCCAACTCCGCCTGATCC 2384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2409 CATGAAATCTATGAACATTCCAAAGGTTGAGAATTTCCCGTTTCCAACTCCGCCTGAGCC 2468
Query 2385 ATCAGCTATTAGAGAAGCAGAACGATGCTTAAAAGCTTTAGAGGCTCTCGACAGCAACGG 2444
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2469 ATCAGCTATTAGAGAAGCAGAACGATGCCTAAAAGCTTTAGAGGCTCTAGACAGCAACGG 2528
Query 2445 AAGGTTAACACCATTAGGAAAAGCTATGTCTTACTATCCCATGAGTCCACGTCACTCAAG 2504
| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2529 AGGGTTAACACCATTAGGAAAGGCTATGTCTCACTATCCTATGAGTCCACGTCACTCAAG 2588
Query 2505 AATGCTTCTCACAGTCATCCAAATGCTAAAAGAGACCCGGAATTACTCACGCGCGAATCT 2564
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2589 AATGCTTCTAACAGTCATCCAAATGCTAAAAGAGACCCGGAATTACTCACGCGCGAATCT 2648
Query 2565 CGTCCTTGGATATGCGGTTGCAGCAGTAGCCGCGTTGAGCTTACCAAACCCTTTGATAAT 2624
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2649 CATCCTTGGATATGCGGTTGCAGCAGTAGCCGCGTTGAGCTTACCAAACCCTTTGATAAT 2708
Query 2625 GGAGTTTGAAGGAGAGAAGAAAAACGAGTCCAAAGATGCTGACAAAACCGTCAAGCAAGA 2684
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2709 GGAGTTTGAAGGAGAGAAGAAAAACGAGTCCAAAGATGCTGACAAAACCGTCAAACAAGA 2768
Query 2685 AGATAAACAACGGAGAAAGGATCGGAAAGAGAAGATCAAAGCTGCTCGGGACAGATTTTC 2744
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2769 AGATAAACAACGGAAAAAGGATCGGAAAGAGAAGATTAAAGCTGCTCGGGACAGATTTTC 2828
Query 2745 CAACCCGAGCAGCGATGCTTTGACTGTAGCTTATGCATTGCATTCTTTTGAGGTCTCAGA 2804
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2829 CAACCCGAGCAGCGATGCTTTGACTGTAGCTTACGCATTGCATTCCTTTGAGGTCTCGGA 2888
Query 2805 GAATGGCATGGGCTTCTGCGAGGCGAACGGTTTGCATTTAAAGACCATGGACGAGATGTC 2864
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2889 GAATGGCATGGGCTTCTGCGAGGCGAATGGGTTGCATTTGAAGACCATGGACGAGATGTC 2948
Query 2865 TAAGCTCAAAGATCAGCTTTTGAGACTTGTTTTCAGCTGTTGTAAGCCCTCCGAAACCGA 2924
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2949 TAAGCTCAAAGATCAGCTTTTGCGACTTGTTTTCAACTGTTGTAAGCCCTCCGAAACCGA 3008
Query 2925 CGACGG-TTTCTCATGGACTCATGGGACTATACAAGACGTAGAGAAGTCATGGAGAATCA 2983
||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3009 AGACAGCTTT-TCATGGACTCATGGGACTATACAAGACGTAGAGAAGTCATGGAGAATCA 3067
Query 2984 CCACATCGTCTTCCTCAAAATATCC-TCTTCTACAGAACGAAGAAGAACTGTTAGGAGAA 3042
|||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3068 CCACATCGACTTCCTCAAAA-ACCCCTCTTCTACAGAACGAAGAAGAACTGTTAGGAGAA 3126
Query 3043 GCCATATGTGCGGGATGGGCAGACCGTGTAGCCAGAAAGACCAGAGCGACAGAATACCAA 3102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3127 GCCATATGTGCGGGATGGGCAGACCGTGTAGCCAGAAAGACCAGAGCGACAGAATACCAA 3186
Query 3103 GCTTGTGCGGTTCAAGAACCTGTTTTCTTGCACCGTTGGTCGTCTCTCATAAACACAGCT 3162
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3187 GCATGTGCGGTTCAAGAACCTGTTTTCTTGCACCGTTGGTCGTCTCTCATAAACTCAGCT 3246
Query 3163 CCGGAGTTATTGGTCTACAGCGAGCTCCTACTCACCAACAGACCATACATGCACGGAGCA 3222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3247 CCGGAGTTATTGGTCTACAGCGAGCTCCTACTCACCAACAGACCATACATGCACGGAGCG 3306
Query 3223 ACTCGAGTAAAGCCGGAATGGCTGGTGAAGCACGCTAAA-TCTCTCTGCGTGTTCTCCT- 3280
||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 3307 ACTCGGGTGAGGCCAGAATGGCTGGTGAAGCACGC-AAAGTCTCTCTGCGTGTTCTC-TG 3364
Query 3281 CACCACTCAAGGACCCGAAACCTTATTACTCGAGTGAGGAGGATAGAGTTTTGTGCTGGG 3340
|||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3365 CACCGCTCAAGGACCCGAAACCATATTACTCAAGTGAGGAGGATAGAGTTTTGTGCTGGG 3424
Query 3341 TCATTCCAAGTTTCGGTCCTCATAATTGGGAGCTTCCGGCTCACAGTGTGGCAATAACCG 3400
|| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3425 TCGTTCCGAGTTTCGGTCCTCATAATTGGGAACTTCCGGCTCACAGTGTGGCAATAACAG 3484
Query 3401 ATGATAGAGACCGAGCAGCAGCTTTCGGATGTGCTTTGCTTCAAGGAGAGGTATTACCTT 3460
| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3485 AGGATAGAGACCGAGCAGCGGCTTTCGGATGCGCTTTGCTTCAAGGAGAGGTATTAACTT 3544
Query 3461 GTTTGAAAAGCGTT-AGGACGTTGTTGGCTGGGAAACCTGAAACATTGTTGGAAAGAGAA 3519
||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3545 GTTTGAAAAGC-TTCAGGGCTTTGTTGGCTGGGAAACCTGAAACGTTGTTGGAAAGAGAA 3603
Query 3520 GCTTGGGGTTTAGAAAGAGTTGGGGGTTTGGTGATGGTTTTGACAGAGAAGAAGATTGAT 3579
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3604 GCTTGGGGTTTAGAAAGAGTTGGGAGTTTGGTGATGGTTTTGACAGAGAAGAAGATTGAT 3663
Query 3580 AGTTTAGAGAGTTTGAGAAAGAGTTGGGAGCAGAATCCGAATGTGCTTTACTCTGAGACT 3639
| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |
Sbjct 3664 ACTTTGGAGAGTTTGAGAAAGAATTGGGAACAGAATCCGAATGTGCTTTATTCAGAGATT 3723
Query 3640 GAAGTTTGGTTTCAGAAAAAGTTTCGTCATCGTGTCAAAGAGCTTTGGCAAACAATGCTA 3699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 3724 GAAGTTTGGTTTCAGAAAAAGTTTCGTCATCGTGTCAAAGACCTTTGGCAGACAATGCTA 3783
Query 3700 AAGGAGGCTAACGTTCAAAGAAGTCAGAGGAGGAGATAAGTGTCTTCAAAATTATTT-TT 3758
||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| | ||||||| || ||| || ||| ||
Sbjct 3784 AAGGAAGCTCACGTTCGAAGAAGTTAGAGGAG-A--TAAGTGTGTTTAAACTTTTTTATT 3840
Query 3759 A-ATTACGAA-GGAAATTTTGTTAGAAACTTAAATGTGTAACAGAGAAA 3805
||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3841 CTATTTTGAAAGGAAATTTTGTTAGAAACTTAAAAGTGTATCAGAGAAA 3889
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 189530710654
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5