BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg473514
Length=4464
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G33410.1 | Symbols: SAR1, NUP160, ATNUP160 | SUPPRESSOR OF A... 4492 0.0
> AT1G33410.1 | Symbols: SAR1, NUP160, ATNUP160 | SUPPRESSOR OF
AUXIN RESISTANCE1 | chr1:12109590-12118850 REVERSE LENGTH=4716
Length=4716
Score = 4492 bits (2432), Expect = 0.0
Identities = 2651/2757 (96%), Gaps = 14/2757 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1409 AGTCAGATGTTATTGGTTTAGTTAGAAACAATTCTGTATCATTGTTTTTTAGATTGGAGA 1468
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1539 AGTCAGATGTTATTGGTTTAGTTAGAAATAATTCTGTATCACTGTTTTTTAGATTGGAGA 1598
Query 1469 ACGCTGAGCACAGCCTTGGAGGTTCTTCCTCCGAACACAGCAATCTGACAAGCTTAGGCT 1528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||
Sbjct 1599 ACGCTGAGCACAGCCTTGGAGGTTCTTCCTCCGAACACAGCAACCTGACGAGCTTAGACT 1658
Query 1529 TGGGTGTGTCTCACAATGAACATGAAATTCTGGCAGAGGTACTAAGATGTACTTCGAAGA 1588
|||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1659 TGGGCGTGTCTCACAGCGACCATGAAATTCTGGCAGAGGTACTAAGATGTACTTCGAAGA 1718
Query 1589 TCAGTAAACAGTGGGGTGGTGCTCCTTATGCCATGTATTATGAATCAATTACTGGAAAGC 1648
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 1719 TCAGTAAACAGTGGGGTGGTGCTCCTTATGCCATGTATTATGAATCAATTACCGGAAGGC 1778
Query 1649 CAGTTATCTCATCTGATGAAATTGTTCCTCGCTTAGTTAACATCCTTGAGTCGGGATATT 1708
|| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1779 CAATTATCTCATCGGATGAAATCGTTCCTCGCTTAGTTAACATCCTTGAGTCGGGATATT 1838
Query 1709 CTACAACCATAGGTCAGCGTACTTGGTCAGATCTTGGTGCTGATAGAGCATGGGAAAAAG 1768
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839 CTACGACCATAGGTCAACGTACTTGGTCAGATCTTGGTGCTGATAGAGCATGGGAAAAAG 1898
Query 1769 AGCTAGAAGCTCATAAAAATCTTAGAACATTCTCCATTGACATGCTATTGTCTCTCTCTG 1828
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1899 AGCTAGAAGCTCATAAAAATCTTAGAACATTCTCCATTGACATGCTGCTGTCTCTCTCTG 1958
Query 1829 CTCTATGTCAAAGGGCTGGATCTTGGGAAAAAGTTTTTACTATCATGGAGCACTATTTGC 1888
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1959 CTCTATGTCAAAGGGCTGGATCTTGGGAAAAAGTCTTTACTATCATGGAGCACTATTTGC 2018
Query 1889 AGTATTTGGTCCCTAAGAAATCTATGCAAG-AAAATGATGGTGAGGCATTATCTGATATC 1947
|||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2019 AGTATTTGGTCCCTAAAAAATCTATGC-AGAAAAATGATGGTGAGGCATTATCTGATATC 2077
Query 1948 TGTAGTTCTATCCTCGTCCAAGCAACTTCTCAGTTTGTAAAGGTGATGTTTGAGTCAGCA 2007
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2078 TGTAGTTCTATCCTCGTCCAAGCCACTTCTCAGTTTGTAAAGGTGATGTTTGAGTCGGCA 2137
Query 2008 TTTGACATCTTCCTACTGGTCAGCTATCTGCTTAACATTGCTGGACAGGTTAATATGTCA 2067
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 2138 TTTGACATCTTCCTACTCATCAGCTATCTGCTTAACATCGCTGGGCAGGTTAATATGTCA 2197
Query 2068 CAGCAAGACATGTGCAAGCTACGGCTTGAGTTGCTTCCGATGATCCAAGATATTGTCTCA 2127
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2198 CAGCAAGACATATGCAAGCTACGGCTTGAGTTGCTTCCAATGATCCAAGATATTGTCTCA 2257
Query 2128 GAGTGGCTCATTATCCTTTTCTTTGTTACCACTCCAGCTGAGTCAACTTCTATGGAAGAT 2187
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2258 GAGTGGCTCATCATCCTTTTCTTTGTTACCACTCCAGCTGAGTCAACTTCTATGGAAGAT 2317
Query 2188 TTCAGCTCGAAACTTTCATCTCTACAGATTGATAGCAGCATTGACAAAAGATCATGGAAC 2247
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2318 TTCAGCTTGAAACTTTCATCTCTACAGATTGATAGCAGCATTGACAAAAGATCATGGAAC 2377
Query 2248 GCAATGCTTGGGAAATGTGGTTTCTCATTGGCGTTTATTCTTCTCTTTAGTGACCGAAGT 2307
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2378 GCAATGCTAGGGAAATGTGGTTTCTCACTGGCGTTTATTCTTCTCTTTAGTGACCGAAGT 2437
Query 2308 TGCATTGTGGACGGCCGCTTTAACTTGAGATATCTTCCGAGTTCACAAATCATTACAAGT 2367
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2438 TGCATTGTGGATGGCCGCTTTAACTTGAGATATCTTCCGAGTTCACAAATCATTACAAGT 2497
Query 2368 TTGGTGCAAAACTTTATCAGCTGGATTCGTTATAGTAAAACAGGAGAGGAGTCTTCTTCA 2427
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 2498 TTGGTGCAAAACTTTATCAGCTGGATTCGGTATAGTAAAACAGGAGATGACTCTTCTTCA 2557
Query 2428 CTGCTAAGACGCTCCACTGAGCTTAGTCTTAGGTTGATTAGGAATGGACAATCTGATGCT 2487
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2558 CTGCTAAGACGCTCCACGGAACTTAGTCTTAGGTTGATTCGGAATGGACAATCTGATGCT 2617
Query 2488 GTTGAGCGAATCCTTGTGGTTGTGGAGGCAAGTTTACGTGGGGAGAAAACATTTGGATGT 2547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2618 GTTGAGCGAATCCTTGTGGTTGTGGAGGCAAGTTTACGTGGGGAGAAAACATTTGGATGT 2677
Query 2548 TCTCAAGATACTAGTGGGGATTGGTGTCTTCTTCAACATCTCCGTGGTTGTTGCCTTCTT 2607
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2678 TCTCAAGATACTAGTGGAGATTGGTGTCTTCTTCAACATCTCCGTGGTTGTTGCCTTCTT 2737
Query 2608 GATCAAGTACAACGTGGGGCATGCGGCATATTAAGAGAGAGGAAGATTATTGATGCCATC 2667
||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2738 GATCAAGTACAACGTGGTGCAAGTGGCATATTAAGAGAGAGAAAGATTATTGATGCCATC 2797
Query 2668 CGCTGTTTCTTCAGAGCTTCATCAGGTGAAGGATCTTGGAAGGCTTTACACAGCCTGTCT 2727
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 2798 CGCTGCTTCTTCAGAGCTTCATCAGGTGAAGGATCTTGGAAGGCTTTGCACAGCTTGTCT 2857
Query 2728 AAAGAAGCAGGATTTTCACCTGCGACAACGGGTCCCAGTATTTCAGATGGTTCTATGTCT 2787
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 2858 AAAGAAGCAGGATTTTCACCTGCCACAACGGGTCCAAGTATTTTAGATGGTTCTACGTCT 2917
Query 2788 TGTGCGA-CATGGAAACTTCAGTACT-TCGAGTGGGCTATGCAAATTTTTGAACGGTACA 2845
| ||| | ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2918 TCTGC-AGCATGGAAACTTCATTACTAT-GAGTGGGCTATGCAAATTTTTGAACGGTACA 2975
Query 2846 ATATAAGTGAAGGAGCTTGTCAGTTTGCCTATGCAGCCCTTGAGCAAGTAGATGAGGCCT 2905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2976 ATATAAGTGAAGGAGCTTGTCAGTTTGCCTATGCAGCCCTTGAGCAAGTAGATGATGCCT 3035
Query 2906 ATGATTTCATAGAGAGGACTGAGGAATTCGATCTAACTAAAGCAGCCACCGACACTAGAG 2965
|| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3036 ATAATTTCATAGAGATGACTGAGGAATTCGATCCAACTAAAGCAGCCACCTACACTAGAG 3095
Query 2966 GACGACTGTGGGCAAATGTTTTCAAGTTCACCTTAGATCTGAATCTCTTGAACGACGCTT 3025
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |
Sbjct 3096 GACGACTGTGGGCAAATGTTTTCAAGTTCACCTTAGATCTCAATCTCTTGAATGATGCCT 3155
Query 3026 ACTGTGCTATAATTTCAAACCCTGATGAGGAGATTAAGCGCATCTGTTTGAGGCGCTTCA 3085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3156 ACTGTGCTATAATTTCAAACCCTGATGAGGAGATTAAGCGCATCTGTTTGAGGCGCTTCA 3215
Query 3086 TAATTGTTCTATTTGAATGTGGCAAAACAAAGATCCTCAGTGATGGACATCTACCTTTCA 3145
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3216 TAATAGTTCTATTTGAATGTGGCAAAACGAAGATCCTCAGTGATGGACATCTACCTTTCA 3275
Query 3146 TCGGTC-TAACAGAGAAGATCACCCAAGAGCTTTTCTGGAAGGCCGGACGTTCTGAAATA 3204
|||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3276 TCGG-CTTAACAGAGAAGATCACCCAAGAGCTTTTTTGGAAGGCCGGACGTTCTGATATA 3334
Query 3205 ATGATGAAGCCAAATCCATACAAGTTGCTTTATGCGTATGAGATGAGACGACACAATTGG 3264
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3335 ATGATGAAGCCAAATCCATACAAGCTGCTTTATGCTTATGAGATGAGACGACACAATTGG 3394
Query 3265 CGAATGGCGGCAAGTTACATGTATCAGTTTTCTGCCCGTTTGAGAAGCGAGGCTGCATGC 3324
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3395 CGAATGGCGGCAAGTTACATGTATCAGTTTTCTGCCCGTTTGAGAAGCGAGGGAGCATGC 3454
Query 3325 AAGGATTACAAACACATGTCCCTAGTTTTGCAAGAGAGGCTTAATGGACTTTCTGCTGCT 3384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3455 AAGGATTACAAACACATGTCCCTAGTTTTGCAAGAGAGGCTTAATGGACTTTCTGCTGCT 3514
Query 3385 ATTAATGCATTAGCCCTTGTTCATCCTGGGTATGCTTGGATTGATCCAGTACCAGAAGAA 3444
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3515 ATGAATGCATTAGCCCTTGTTCATCCTGGGTATGCTTGGATTGATCCAGTACCAGAAGAA 3574
Query 3445 TCCACACGTTATCCAGTTAAAAAGGCTAGAAGAGCAGAAGAAGAACAATTAAGGAGTAAT 3504
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3575 ACCACACGTTATCCGGTTAAAAAGGCTAGAAGAGCAGAAGAAGAACAATTAAGGAGTAAT 3634
Query 3505 G---A---CAAAGGGGAGCAGAGTTGCATTGATATCGAGAAACTTCAAAACGAGTTTGTT 3558
| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3635 GACCAGCCCAAAGGGGAGAAGAGTTGCATTGATATCGAGAAACTCCAAAACGAGTTTGTT 3694
Query 3559 TTTACTACTGCTGAATATATGCTTTCTCTGAAAAATTTCGGGTGGACATATTCAGGACTC 3618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3695 TTTACTACTGCTGAATATATGCTTTCTCTGAAAAATTTCGGGTGGACATATTCAGGACTC 3754
Query 3619 GAAAAGCCACCATCGGATTTGGTTGACCTTCTTGTCCAGGCAAACTTGTATGACATGGCA 3678
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3755 GAAAAGCCACCATCAGATTTGGTTGACCTTCTTGTCCAGGCAAACTTGTATGACATGGCA 3814
Query 3679 TTCACTGTTGTTTTAAAATTTTGGAGTGGCTCCGCTTTGAAAAGGGAGCTGGAGAAGATA 3738
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3815 TTCACTGTTGTTTTGAAATTTTGGAGGGGCTCCGCTTTGAAAAGGGAGCTGGAAAAGATA 3874
Query 3739 TTTGAGAATATGGCAATTAAATGTTGCCCTGCTAAAGGAGCGCTGTGGACATCGCCTAAT 3798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||
Sbjct 3875 TTTGAGAATATGGCAATTAAATGTTGCCCTGCTAAAGGAACTCTGTGGTCATCGCCTAAT 3934
Query 3799 CTTATGTTAATATCTAACGATGAAGAAGTTACTCATTCGCCTGATAGAAGCCCTGCTGTT 3858
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3935 CTTATGTTAACATCTAACGATGAAGAAGTTACTCATTCGCCTGATAGAAGCCCTGCTGAT 3994
Query 3859 CAGGGCTCTAAGTTGGCTGGTGACTGGGAAATTCTTGAGGTTTATCTGAAGAGGTACATA 3918
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3995 CAGGGCTCTAAGTTGGCTGGTGATTGGGAAATTCTTGAGGTTTATCTGAAGAGGTACATA 4054
Query 3919 GACATACACGCTAGACTACCGGTTTCTGTTGCTTCAACCCTTCTTCAAGCAGATTCTTGT 3978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4055 GACATACACGCTAGACTACCGGTTTCTGTTGCTTCAACCCTTCTTCAAGCAGATTCTTGT 4114
Query 3979 ATCGAATTGCCTCTCTGGCTGGTTCAAATGTTCAAGGACGGTCAGAAGGAAAAAGCTTTG 4038
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4115 ATCGAATTGCCTCTCTGGCTGATTCAAATGTTCAAGGATGGTCAGAAGGAAAAAGCTTTG 4174
Query 4039 GGAATGGCTGGGAAAGAAGCAAGTCCTGCTTCCTTGTTTCAGTTATATGTTGATTATGGG 4098
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4175 GGAATGGCTGGGCAAGAAGCAAGTCCTGCTTCCTTGTTTCAGTTATATGTTGATTATGGG 4234
Query 4099 CGTCTTACAGAGGCCACTAATTTGCTACTGGAGTACATGGAAGCATTTGCATCATCG 4155
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 4235 CGTCTTACAGAGGCAACTAATTTGCTACTTGAGTACATGGAATCATTTGCTTCATCG 4291
Score = 2172 bits (1176), Expect = 0.0
Identities = 1332/1410 (94%), Gaps = 0/1410 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAGGAGAATCGTCGGAATTCGTTTGCCGGTATGGAAGTTCCAATTGCCGGCGGCGGA 60
||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 23 ATGGAGGAGAATCGTCGGAATCCGTCGGCCGGTATGGAAGTTCCAGTTGCCGGCGGCGGA 82
Query 61 AATGTCGTTAAATGGATCGAGATATCTGTGCCTTCACCATCTGTTTCTTCTTCTAGTATC 120
|||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 83 AATGTCGTCAAATGGATTGAGATATCTGTTCCTTCACCTTCTGTTTCATCTTCTAGTATC 142
Query 121 GGTGCTAGTTCAAGTGAGGACAATGAATGTGTTCAGCTTCCTTCGTATGAAGATTACGCT 180
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||
Sbjct 143 GGTGCTAATTCAAGTGAGGACAATGAGTGTGTTCAGCTTCCTTTGTCTGAAGACTACGCT 202
Query 181 TCTAGCTCTGTAATTGGAGAACCTCCGATCTCTTTCGTTTGGACAATCAACAAGACGAGT 240
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 203 TCTAGCTCTGTAATTGGGGAACCTTCGATCTCTTTCGTTTGGAGAATCAACAAGACGAGT 262
Query 241 CCTAATGCTCTCGAGCTTCTTCAGCTCTCTGCTAAATCGGGATTCCCAATAACTGGGCTG 300
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||
Sbjct 263 CCAAATGCTCTCGAGCTTCTTCAGCTCTCAGCTAAGTCTGGATTTCCAATAACAGGACTG 322
Query 301 CGTTTCCTTTTTGCTCAGACTCTTTCTCCTTTTGCTTTTGTATACGCCGATAAGGGTAGT 360
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 323 CGTTTCGTCTTTGCTCAGACTCTTTCTCCTTTTGCTTTTGTATACGCCGATGAGGGTGGT 382
Query 361 GATAGTGGTCGTCTTGTCTACTTTCTTTACGCTCTCACGCCGTCTGGTGTTGTCTACGTT 420
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 383 GATAGTGGTCGTCTTGTCTACTTTCTTTACTCTCTCACGCCGTCTGGTGTTGTCTACGTT 442
Query 421 CTGAAACTATTGAATACGTCAGCCTATAAGTCTGGCTCAGTTTTCCCGGTTGATCATCTG 480
|| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||
Sbjct 443 CTTAAACTCTCGAATACGTTAGCATATAAGTCTGGTTCAGTCTTCCCGCTTGATCATTTG 502
Query 481 ATTCACTTGGATGTTCGACCTTACTTGAACGAGACTCGTGCTACTAGTGTTGCTGCATTG 540
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 503 ATTCACTTGGATGTTCGACCTTACTTGAACGAGAGTCGTGTTACTAGTGTTGCTGCATCG 562
Query 541 CCTGGTTTCATTTTTCTCGGGAGGTCTGATGGTTGTGTCTCTTGCTTCCAACCTGTTGTG 600
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 563 CCTGGTTTCATTTTTCTCGGGAGGTCCGATGGTTGTGTCTCTTGCTTCCAACCTATTGTG 622
Query 601 TATTTTCAGAAATCATCAGGATTCCACCAGGAGCTGCGTGATGATACTGGGTTTGGTCGT 660
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 623 TATTTTCAGAAATCTTCAGGTTTCCACCAGGAGCTGCGTGATGATACAGGATTTGGTCGT 682
Query 661 CTGGGGACAGTGGTTGCAGCCGTACAAGATTTATTTATATCAGAAGTTCATGGAAGAAAT 720
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 683 CTGGGGACAGTTGTTGCAGCCGTGCAAGATTTATTTATATCAGAAGTTCATGGAAGAAAT 742
Query 721 TATATATGTGTGCTTCATGCTGATGGGGCATTACGTGTTTGGGATATTTTGACTTATAGC 780
||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 743 TATCTATGTGTGCTTCATGCTGACGGGGCATTACGTGTCTGGGATATTTTGACTTATAGC 802
Query 781 AGGGTTTTATGTCAGAGTATAGCTGCTAAGAACCTTGAGGGGGTTATGTGTGTGAGGTTA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 803 AGGGTTTTATGTCAGAGTATAGCTGCTAAGAACCTTGAGGGGGTTATGTGTGTGAGGTTA 862
Query 841 TGGTTGGGCAAAGCTGATTACGATTCTGGAATCATTCCATTAGCCGTCTTGTATAGAAAG 900
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 863 TGGTTGGGCAAAGCTGATTACGATTCTGGCATCATTCCATTAGCTGTCTTGTATAGAAAG 922
Query 901 AGTATGGATGATAGCATGGACGTGATCACTGTATATGGTCTGCACTTTAGTTCTGGGGAG 960
|||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 923 AGTATGAATGACAGCATGGACGTGATCACTGTATATGGCCTGCACTTTAGTTCTGCGGAG 982
Query 961 GGGATAGCTTTGTCTCTAGATTCTGGATTACAGAATATTCCACTGGAAGAGGGGGAATTG 1020
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 983 GGGATAGCTTTGTCTCTAGATTCTGGATTACAGAATATACCACTGGAAGAGGGGGAATTG 1042
Query 1021 CGGGATGTCAGATTTACGTCCGACAAGATCTGGACTCTAAAGGCCGATGAATTGACATCT 1080
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 1043 CGGGATGTCAGATTTACATCCGACAAGATCTGGACTCTAAAGGCCAATGAATTAACATCT 1102
Query 1081 CACATGTTGTTCCAGAAATCTAGCACTATGGAAGCACAGTCTTACACTTTGCAGGAAGAC 1140
||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1103 TACATGTTGTGCCAGAAATCTAGCACCATGGAAGCGCAGTCTTACACGTTGCAGGAAGAC 1162
Query 1141 TACATTTCTGAACAGCTATTTCTAAGTTCTAGGAGCTCTTCACAGGATCTTCTTTTGACA 1200
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1163 TACATTTCTGAACAGCTATTTCTGAGTTCTAGGAGCTCTTCACATGATCTTCTTTTGACT 1222
Query 1201 ACTCATTCACTGTTTTCATCCGTAAAGGATCAAATTATGGGATTCATTTCGTCGATCTTC 1260
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1223 ACTCATTCACTGTTTTCATCCGCAAAGGATCAAATTATGGGATTCATTTCGTCAATCTTC 1282
Query 1261 TTACGCAGGCTTCTTTGTCCTGGAATTTTTCATAATGTTGCCTTGCGTCTAACTTTACTA 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1283 TTACGCAGGCTTCTTTGTCCTGGAATTTTTCACAATGTTGCCTTACGTCTAACTTTACTG 1342
Query 1321 GACCACAACAAACACTGGACTGATTCTGAGTTTCAGTCTTTAAGTCTTGATGAGCTTACA 1380
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1343 GACCACAACAAAAACTGGACTGATTCCGAGTTTCAATCTTTAAGTCTTGATGAGCTTACA 1402
Query 1381 AGCGAGATTCTTTTACTGGTTGAGCATGAG 1410
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403 AGCGAGATTCTTTTACTGGTTGAGCATGAG 1432
Score = 425 bits (230), Expect = 1e-117
Identities = 266/283 (94%), Gaps = 3/283 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 4156 AAACCAGCAGAGGTATTGAAGAGGAAAAAGGTATCAGGAGTTTGGTTTCCATACACAACA 4215
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4319 AAACCAGCAGAGGTATTGAAGAGGAAAAAGGTATCCGGAGTTTGGTTTCCGTACACAACA 4378
Query 4216 GTAGAAAGACTATGGTGGGAGCTAGAGAAAACGATGAACTCAGGACGGATGGTGGAGCAA 4275
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4379 GTAGAAAGACTATGGTGGGAGCTAGAGAAAACAATGAACTCAGGACGAATGGTGGAGCAA 4438
Query 4276 TGTCATAAGCTGAAGGAACAACTCCATCATGCATTACTCAATCACTTAAAACTGCTAAAG 4335
|| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4439 TGCCATAAGCTGAAGGAACAACTTCATCATGCATTACTCAATCACTTAAAACTGCTTAAG 4498
Query 4336 GTGGACTCAAATGATGCTGTGTCGTCTGCTACAGGTTAAAGAAAGTCTTGTTTGATCCGT 4395
|||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 4499 GTGGACTCAAATGATGCTGTATCCTCTGCAACCGGTTAAAGAAAGTCTTGATTGTTCCGT 4558
Query 4396 GTGAATATTAT-A-ATCTGTATGAAAAATCGTATCAGGCTTTT 4436
||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 4559 GTGAATATTATTATATCTGTATCAAAA-TCGTATCAGGCTTTT 4600
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 222590726091
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5